免疫共沉淀(Immunoprecipitation, IP)解析
免疫共沉淀中的igg
免疫共沉淀中的igg免疫共沉淀（immunoprecipitation, IP）是一种广泛应用于生物医学研究中的实验技术，其主要用于检测和研究蛋白质与其他生物大分子（如蛋白质、核酸、多肽等）之间的相互作用关系。
在免疫共沉淀中，常使用的IgG（免疫球蛋白G）作为抗体，用于特异性地结合目标蛋白，并通过其特异性结合能力来选择性地沉淀出目标蛋白。
IgG是人体内最常见的免疫球蛋白，属于抗体的一种。
IgG具有多种重要生物功能，包括与抗原特异性结合，介导免疫应答、中和病原体等。
在免疫共沉淀中，IgG可以通过与目标蛋白特异性结合来充当“捕获工具”，实现目标蛋白的富集和分离。
下面将从IgG的原理、应用和优化方面进行介绍。
IgG的原理：IgG分子由两条轻链和两条重链组成，其Fc（结晶片段）区域通过与Fc受体的结合来实现对抗原的识别和中和。
而在免疫共沉淀中，IgG通过其抗原结合的Fab区域表现出良好的特异性，选择性地与目标蛋白结合。
当与蛋白质复合物形成后，通过添加沉淀剂（如蛋白A/G琼脂糖）的作用，目标蛋白与IgG会以沉淀形式从混合液中分离出来。
IgG的应用：免疫共沉淀是研究蛋白质相互作用的重要技术，在很多领域得到了广泛的应用。
常见的应用包括但不限于：1. 研究蛋白质-蛋白质相互作用：通过使用两种特异性的IgG，分别对目标蛋白和亚单位结合，可以在混合系统中选择性地沉淀出目标蛋白结合的亚单位，从而研究它们之间的相互作用。
2. 蛋白质修饰研究：通过特异性的IgG结合目标蛋白，可以选择性地富集不同修饰状态的蛋白质，如磷酸化、乙酰化等，以便进一步研究其功能和调控机制。
3. 蛋白质-核酸相互作用研究：通过将IgG与对应的抗体结合，可以选择性地沉淀出特定的蛋白质-核酸复合物，用于研究其相互作用机制和功能调控。
IgG的优化：在免疫共沉淀实验中，提高IgG的特异性和亲和力对于提高实验结果的准确性至关重要。
以下是一些常见的IgG优化策略：1. 选择合适的IgG亚型：IgG有不同的亚型，如IgG1、IgG2、IgG3和IgG4，在特异性和亲和力上有所差异。
免疫共沉淀原理及步骤
免疫共沉淀原理及步骤免疫沉淀(Immunoprecipitation, IP)原理IP是利用抗原蛋白质和抗体的特异性结合以及细菌蛋白质的“protein A/G"特异性地结合到抗体(免疫球蛋白)的FC片段的现象开发出来的方法。
目前多用protein A/G预先结合在argarose beads上，使之与含有抗原的溶液及抗体反应后，beads上的prorein A/G就能达到吸附抗原的目的。
通过低速离心，可以从含有目的抗原的溶液中将目的抗原与其它抗原分离。
免疫沉淀实验的操作步骤比较多，同时由于在非变性条件下进行实验，所以要得到一个完美的实验结果，不仅需要高质量的抗体，同时对免疫沉淀体系也需要有严格的控制指标。
免疫沉淀实验从：蛋白样品处理；抗体-agarose beads孵育；抗体-agarose beads复合物洗涤到最后的鉴定，每步都非常关键，需要严格控制实验流程中每个关键步骤的质量，才能最终达到你的实验目的。
IP实验步骤基本实验步骤(1)收获细胞，加入适量细胞IP裂解缓冲液(含蛋白酶抑制剂)，冰上或者4℃裂解30min， 12,000g 离心30 min后取上清；(2) 取少量裂解液以备Western blot分析，剩余裂解液将1μg相应的抗体和10-50 μl protein A/G-beads加入到细胞裂解液，4°C缓慢摇晃孵育过夜；(3)免疫沉淀反应后，在4°C 以3,000 g速度离心5 min，将protein A/G-beads离心至管底；将上清小心吸去，protein A/G-beads用1ml裂解缓冲液洗3－4次；最后加入15μl的2×SDS 加样缓冲液，沸水煮10分钟；(4)SDS-PAGE, Western blotting或进行质谱分析。
一、样品处理：免疫沉淀实验成功与否，第一步处理样品非常关键。
免疫沉淀实验本质上是处于天然构象状态的抗原和抗体之间的反应，而样品处理的质量决定了抗原抗体反应中的抗原的质量，浓度以及抗原是否处于天然构象状态。
免疫共沉淀质谱
免疫共沉淀质谱免疫共沉淀质谱（immunoprecipitation-massspectrometry，简称IP-MS）是一种常用的蛋白质相互作用分析技术。
该技术结合了免疫沉淀和质谱分析，能够鉴定蛋白质相互作用和识别蛋白质复合物的成员，广泛应用于生命科学、疾病诊断和治疗等领域。
一、IP-MS 的基本原理IP-MS 技术的基本原理是利用特异性抗体将目标蛋白质从混合物中沉淀下来，然后用质谱分析鉴定沉淀物中的蛋白质。
该技术主要包括以下步骤：1. 样品制备：将需要分析的生物样品（如细胞、组织、血清等）进行处理，如细胞裂解、组织切片等，得到蛋白质混合物。
2. 免疫沉淀：将特异性抗体与目标蛋白质结合，形成抗原抗体复合物。
然后将混合物与抗原抗体复合物一起孵育，使复合物形成。
接着用亲和树脂或磁珠等材料将复合物捕获下来，得到免疫沉淀物。
3. 洗涤：用缓冲液对免疫沉淀物进行多次洗涤，去除非特异性结合的蛋白质和杂质。
4. 质谱分析：将免疫沉淀物用电泳或染色分析等方法进行分离，然后用质谱分析仪器对分离后的蛋白质进行鉴定和定量。
二、IP-MS 的应用1. 鉴定蛋白质相互作用：利用 IP-MS 技术可以鉴定蛋白质相互作用，例如鉴定蛋白质与核酸、蛋白质与蛋白质、蛋白质与小分子等的相互作用。
这些相互作用对于细胞信号转导、代谢途径、基因表达等生命过程起着重要作用。
2. 识别蛋白质复合物的成员：许多生物过程涉及到蛋白质复合物的形成，如核糖体、酶复合物等。
利用 IP-MS 技术可以识别蛋白质复合物的成员，进而揭示其功能和调控机制。
3. 疾病诊断和治疗：许多疾病的发生和发展都与蛋白质相互作用和复合物形成有关。
利用 IP-MS 技术可以鉴定疾病相关的蛋白质相互作用和复合物，从而为疾病的诊断和治疗提供新的思路和方法。
三、IP-MS 的优缺点IP-MS 技术具有以下优点：1. 特异性高：利用特异性抗体进行免疫沉淀，可以选择性地捕获目标蛋白质。
免疫共沉淀(Immunoprecipitation, IP)解析
免疫共沉淀
(CO—immunoprecipitation)
用抗体将相应特定分子沉淀的同时，与该 分子特异性结合的其他分子也会被带着一 起沉淀出来的技术。这种技术常用于验证 蛋白质之间相互特异性结合。 免疫共沉淀可分为细胞内过表达蛋白、细 胞内源性蛋白、组织内蛋白的免疫共沉淀。
基本原理
细胞裂解物中加入抗体，这样可与已知抗 原形成特异的免疫复合物，若存在与已知 抗原相互作用的蛋白质，则免疫复合物中 还应包含这种蛋白质；经过洗脱，收集免 疫复合物，然后分离该蛋白质，对该蛋白 质进行N端氨基酸序列分析，推断出相应的 核苷酸序列。将中分离出cDNA克隆 。
实验流程
（1）转染后24-48 h 可收获细胞，加入适 量细胞裂解缓冲液（含蛋白 免疫共沉淀酶 抑制剂），冰上裂解30min, 细胞裂解液于 4°C， 最大转速离心30 min后取上清； （2）取少量裂解液以备Western blot分析， 剩余裂解液加1μ g相应的抗体加入到细胞裂解 液，4°C缓慢摇晃孵育过夜； （3）取10μ l protein A 琼脂糖珠，用适量 裂解缓冲液洗3 次，每次3,000 rpm离心3 min； （4）将预处理过的10μ l protein A 琼脂糖 珠加入到和抗体孵育过夜的细胞裂解液中 4°C缓慢摇晃孵育2-4h，使抗体与protein A琼 脂糖珠偶连； （5）免疫沉淀反应后，在4°C 以3,000 rpm 速度离心3 min，将琼脂糖珠离心至管底； 将上清小心吸去，琼脂糖珠用1ml裂解缓冲液 洗3－4次；最后加入15μ l的2×SDS 上样缓冲 液，沸水煮5分钟； （6）SDS-PAGE, Western blotting或质谱 仪分析。
免疫共沉淀原理及步骤
免疫共沉淀原理及步骤免疫沉淀(Immunoprecipitation, IP)原理IP是利用抗原蛋白质和抗体的特异性结合以及细菌蛋白质的“protein A/G"特异性地结合到抗体(免疫球蛋白)的FC片段的现象开发出来的方法。
目前多用protein A/G预先结合在argarose beads上，使之与含有抗原的溶液及抗体反应后，beads上的prorein A/G就能达到吸附抗原的目的。
通过低速离心，可以从含有目的抗原的溶液中将目的抗原与其它抗原分离。
免疫沉淀实验的操作步骤比较多，同时由于在非变性条件下进行实验，所以要得到一个完美的实验结果，不仅需要高质量的抗体，同时对免疫沉淀体系也需要有严格的控制指标。
免疫沉淀实验从：蛋白样品处理；抗体-agarose beads孵育；抗体-agarose beads复合物洗涤到最后的鉴定，每步都非常关键，需要严格控制实验流程中每个关键步骤的质量，才能最终达到你的实验目的。
IP实验步骤基本实验步骤(1)收获细胞，加入适量细胞IP裂解缓冲液(含蛋白酶抑制剂)，冰上或者4℃裂解30min， 12,000g 离心30 min后取上清；(2) 取少量裂解液以备Western blot分析，剩余裂解液将1μg相应的抗体和10-50 μl protein A/G-beads加入到细胞裂解液，4°C缓慢摇晃孵育过夜；(3)免疫沉淀反应后，在4°C 以3,000 g速度离心5 min，将protein A/G-beads离心至管底；将上清小心吸去，protein A/G-beads用1ml裂解缓冲液洗3－4次；最后加入15μl的2×SDS 加样缓冲液，沸水煮10分钟；(4)SDS-PAGE, Western blotting或进行质谱分析。
一、样品处理：免疫沉淀实验成功与否，第一步处理样品非常关键。
免疫沉淀实验本质上是处于天然构象状态的抗原和抗体之间的反应，而样品处理的质量决定了抗原抗体反应中的抗原的质量，浓度以及抗原是否处于天然构象状态。
免疫沉淀IP
免疫沉淀(Immunoprecipitation, IP)原理IP是利用抗原蛋白质和抗体的特异性结合以及细菌蛋白质的“protein A/G"特异性地结合到抗体(免疫球蛋白)的FC片段的现象开发出来的方法。
目前多用protein A/G预先结合在argarose beads上，使之与含有抗原的溶液及抗体反应后，beads上的prorein A/G就能达到吸附抗原的目的。
通过低速离心，可以从含有目的抗原的溶液中将目的抗原与其它抗原分离。
免疫沉淀实验的操作步骤比较多，同时由于在非变性条件下进行实验，所以要得到一个完美的实验结果，不仅需要高质量的抗体，同时对免疫沉淀体系也需要有严格的控制指标。
免疫沉淀实验从：蛋白样品处理；抗体-agarose beads孵育；抗体-agarose beads复合物洗涤到最后的鉴定，每步都非常关键，需要严格控制实验流程中每个关键步骤的质量，才能最终达到你的实验目的。
IP实验步骤基本实验步骤(1)收获细胞，加入适量细胞IP裂解缓冲液(含蛋白酶抑制剂)，冰上或者4℃裂解30min，12,000g离心30 min后取上清；(2) 取少量裂解液以备Western blot分析，剩余裂解液将1μg相应的抗体和10-50 μl protein A/G-beads加入到细胞裂解液，4°C缓慢摇晃孵育过夜；(3)免疫沉淀反应后，在4°C 以3,000 g速度离心5 min，将protein A/G-beads离心至管底；将上清小心吸去，protein A/G-beads用1ml裂解缓冲液洗3－4次；最后加入15μl 的2×SDS 加样缓冲液，沸水煮10分钟；(4)SDS-PAGE, Western blotting或进行质谱分析。
一、样品处理：免疫沉淀实验成功与否，第一步处理样品非常关键。
免疫沉淀实验本质上是处于天然构象状态的抗原和抗体之间的反应，而样品处理的质量决定了抗原抗体反应中的抗原的质量，浓度以及抗原是否处于天然构象状态。
实验入门之---免疫共沉淀（Co-IP）
实验入门之---免疫共沉淀（Co-IP）小编最近挺忙的，实验室各种事情要做，读研的都知道，就不多加唠叨了，研究做机制的，肯定会做到蛋白与蛋白之间的结合伴侣情况，转录激活功能等等，首先讲结合蛋白，就要涉及到免疫共测定实验。
好吧不多说了，上干货。
原理：免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation）是以抗体和抗原之间的专一性作用，为研究蛋白质相互作用的方法。
当细胞在非变性条件下被裂解时，完整细胞内存在的许多蛋白质－蛋白质间的相互作用被保留了下来。
如果用蛋白质X的抗体免疫沉淀X，那么与X在体内结合的蛋白质Y也能沉淀下来。
目前多用prorein A预先结合在argarose的beads上，使之与含有抗原的溶液及抗体反应后，beads上的prorein A就能吸附抗原达到精制的目的。
这种方法常用于测定两种目标蛋白质是否结合。
其优点为：（1）相互作用的蛋白质都是经翻译后修饰的，处于天然状态；（2）蛋白的相互作用是在自然状态下进行的，可以避免人为的影响；（3）可以分离得到天然状态的相互作用蛋白复合物。
缺点为：（1）可能检测不到低亲和力和瞬间的蛋白质－蛋白质相互作用；（2）两种蛋白质的结合可能不是直接结合，而可能有第三者在中间起桥梁作用；（3）必须在实验前预测目的蛋白是什么，以选择最后检测的抗体，所以，若预测不正确，实验就得不到结果，方法本身具有冒险性。
二、准备工作：1. 用预冷的PBS洗涤细胞两次，最后一次吸干PBS；2. 加入预冷的RIPA Buffer(1ml/107个细胞、10cm培养皿或150cm2培养瓶，0.5ml/5×106个细胞、6cm培养皿、75cm2培养瓶)3. 用预冷的细胞刮子将细胞从培养皿或培养瓶上刮下，把悬液转到1.5EP管中。
4. 4℃，12000g离心15-30min，立即将上清转移到新的离心管中。
5. 准备Protein A agarose，用PBS 洗3-4遍珠子，然后用PBS 配制成50%浓度。
免疫共沉淀
起桥梁作用；
如用western blot检验，必须在实验前预测目的蛋白是什么，
以选择最后检测的抗体，若预测不正确，实验就得不到结果，
实验本身具有冒险性。
1.
实验最需要注意点就是抗体的性质。抗体不同和抗原结合能力
也不同，免染能结合未必能用在IP反应。建议仔细检查抗体的说明 书。特别是多抗的特异性是问题。
INMAP 是一个在 有丝分裂中起重 要作用的蛋白， 保证了纺锤体和 端粒的完整性。 本 文 研 究 了 INMAP 通 过 P53/P21 途 径 起 作用。
结论？
一. 二. 三.
免疫沉淀（IP） 免疫共沉淀（CO-IP） 免疫共沉淀结果分析
免疫沉淀（immunoprecipitation IP）是利用抗 体特异性反应纯化富集目的蛋白的一种方法。利用抗 体可与抗原特异性结合的特性，将抗原（常为靶蛋白） 从混合体系沉淀下来。
免疫沉淀（immunoprecipitation IP）是利用抗原蛋 白质和抗体的特异性结合以及细菌蛋白质的“protein
Western blotting 或质谱分析，即样品处理（温度，裂解液成 分）；抗体-agarose beads孵育（选择合适的阴性对照）；抗体 -agarose beads复合物洗涤；鉴定
非变性条件下进行实验；
需要高质量的抗体；
免疫沉淀体系需要有严格的控制指标
基于最基本的免疫沉淀实验衍生出了许多免疫沉淀相 关实验手段：
定蛋白质的新的作用搭档。
（1） 蛋白样品准备：如果为细胞样品，需先裂解细胞；
（2） 抗原抗体结合反应； （3） Protein A/G 与抗原抗体复合物结合； （4） 免疫复合物与 protein A/G 解离： 一般采用 2% SDS 煮沸 5 分钟处理样品；
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实验流程
பைடு நூலகம்
（1）转染后24-48 h 可收获细胞，加入适 量细胞裂解缓冲液（含蛋白 免疫共沉淀酶 抑制剂），冰上裂解30min, 细胞裂解液于 4°C， 最大转速离心30 min后取上清； （2）取少量裂解液以备Western blot分析， 剩余裂解液加1μ g相应的抗体加入到细胞裂解 液，4°C缓慢摇晃孵育过夜； （3）取10μ l protein A 琼脂糖珠，用适量 裂解缓冲液洗3 次，每次3,000 rpm离心3 min； （4）将预处理过的10μ l protein A 琼脂糖 珠加入到和抗体孵育过夜的细胞裂解液中 4°C缓慢摇晃孵育2-4h，使抗体与protein A琼 脂糖珠偶连； （5）免疫沉淀反应后，在4°C 以3,000 rpm 速度离心3 min，将琼脂糖珠离心至管底； 将上清小心吸去，琼脂糖珠用1ml裂解缓冲液 洗3－4次；最后加入15μ l的2×SDS 上样缓冲 液，沸水煮5分钟； （6）SDS-PAGE, Western blotting或质谱 仪分析。
异丙醇： 优点：所需容积小且速度快，适用于浓度低， 而体积大DNA样品的沉淀。0.54~1.0倍体积的异丙醇可选 择性沉淀DNA和大分子rRNA和mRNA；但对5sRNA、 tRNA和多糖产物不产生沉淀，一般不需要在低温条件下 长时间放置。 缺点：易使盐类（如NaCl、蔗糖）与DNA共沉淀；在 DNA沉淀中异丙醇难以挥发除去，所以常规需要用70％的 乙醇漂洗DNA沉淀数次。 乙醇：沉淀DNA乙醇是首选的有机溶剂，对盐类沉淀少， DNA沉淀中所含的衡量乙醇易蒸发去处，不影响以后的实 验。在适当的盐浓度下，2倍样品容积的95％乙醇可有效 沉淀DNA，对于RNA则需要将乙醇量增加至2.5倍.
乙醇沉淀dna和异丙醇沉淀dna的区别
异丙醇和酒精都是有机溶剂，一般来讲，提取质粒的时候 一开始都要用异丙醇沉淀，因为异丙醇沉淀的效果要好一 些，但最后大多用酒精沉淀，因为酒精容易挥发，对下游 的实验影响小 。 异丙醇比较疏水，能很更好地沉淀核酸，用乙醇的目的是 去盐，它比异丙醇更亲水，所以能去掉一些盐离子。 有 时还用70%的乙醇洗样品也是为了增加盐的溶解度。 在 沉淀核酸时可用乙醇与异丙醇，乙醇的极性要强于异丙醇， 所以一般用2倍体积乙醇沉淀，但在多糖、蛋白含量高时， 用异丙醇沉淀可部分克服这种污染，尤其用异丙醇在室温 下沉淀对摆脱多糖、杂蛋白污染更为有效。 异丙醇沉淀核酸时，高浓度盐存在将使大量多糖存在在溶 液中，从而可达到去多糖的作用。但高浓度的盐存在会影 响核酸的进一步操作，因此必须用乙醇多次洗涤脱盐。
免疫共沉淀
(CO—immunoprecipitation)
用抗体将相应特定分子沉淀的同时，与该 分子特异性结合的其他分子也会被带着一 起沉淀出来的技术。这种技术常用于验证 蛋白质之间相互特异性结合。 免疫共沉淀可分为细胞内过表达蛋白、细 胞内源性蛋白、组织内蛋白的免疫共沉淀。
基本原理
细胞裂解物中加入抗体，这样可与已知抗 原形成特异的免疫复合物，若存在与已知 抗原相互作用的蛋白质，则免疫复合物中 还应包含这种蛋白质；经过洗脱，收集免 疫复合物，然后分离该蛋白质，对该蛋白 质进行N端氨基酸序列分析，推断出相应的 核苷酸序列。将中分离出cDNA克隆 。
局限性:
需要多克隆抗体或mAb，因而对大规模筛 选未知蛋白会遇到障碍。 免疫共沉淀同样不能保证沉淀的蛋白复合 物为直接相互作用的两种蛋白。 用于免疫共沉淀的抗体不总是与操作相合 适，与Western blotting或者ELISA相比容易出 现假阳性反应。 灵敏度不如亲和色谱高。 不适于检测构成巨大、不溶性的大分子结 构的蛋白质一蛋白质相互作用。
一、 二、 三、 四、
样品处理： 抗体-agarose beads孵育 抗体-agarose beads复合物洗涤： 鉴定
免疫共沉淀技术的应用
肿瘤 酶与病毒 信号传导 寄生虫
免疫共沉淀技术的优点与局限性
优点：
与蛋白质亲和层析一样，检测的产物 是蛋 白质的粗提物； 抗原与相互作用的蛋白以细胞中相类似的 浓度存在，避免了过量表达所造成的人为效 应； 蛋白质以翻译后被修饰的天然状态存在； 复合物以天然状态存在，蛋白的相互作用 可以在天然状态下进行，可以避免人为影响， 可以分离得到天然状态下相互作用的蛋白复 合体.