临床分子诊断与个体化治疗

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无特殊设备、价廉 不能定量、不能确定特殊突变
无特殊设备、简便、 快捷、灵敏
准确,可以检测质量 的样本
可以检测所有突变
不能对突变精确定位 测序长度短、易污染 复杂,操作繁琐
灵敏度高,周期短
需要特殊探针,每次只能检 测一种突变
批准的遗传检测试剂或设备
试剂设备
生产厂家
罗氏公司
批准时间
检测样本类型及 检测方法 基因
包括提取过程中的检测系统包括两种质控物质,其中之一可以检出提取过程的错误。 ( () ()())
每一扩增过程,包括两种质控材料,如果反应的抑制是假阴性结果的重要来源一个质控材 料能够检出该抑制作用。 ( ( )()())
国际相关机构的计划
美国病理家协会 美国疾病预防控制中心(基因检测质量控制物计划) 分子诊断的质量控制 欧洲分子遗传实验质控网 欧洲重要病毒性疾病诊断网 西班牙室间质评计划 欧盟质量控制一致行动(现在被称作分子诊断的质量控制 ) 意大利肿瘤标志物质量保证网 英国国家质量保证计划
人类染色体区,第位外显子的缺失、、、、、、 第位外显子的插入等,以前两者居多,占所有突 变的
突变
结果判断
野生型治疗效果 较好 突变型治疗效果 差
野生型治疗效果 较差 突变型治疗效果 好
乳腺癌
核赛叮
表达
(, 曲妥珠
单抗)
表达 者效果较好
基因多肽性与药物治疗
基因
药物
伏立康唑、奥美拉唑、 泮托拉唑、艾美拉唑、雷贝拉唑、地西洋、那非那韦
组织样本中个基因的表达水平。 调整用药剂量的检测:指导华法林剂量的基因检测基因(编码细
胞色素)和(编码维生素环氧化物还原酶复合物亚单位)的多态 性。
病理说明:.包括“尸体病理学诊断”、“细胞病理学检查 与诊断”、“组织病理学检查与诊断”、“分子病理学技 术与诊断”、“特染和免疫组织化学染色与诊断”、“电 子显微镜技术与诊断”和“其他”项目七个部分,共计项。
检验说明:.包括“临床血液学检验”、“临床体液检验”、 “临床化学检验”、“临床免疫学检验”、“临床微生物 与寄生虫学检验”和“临床分子生物学检验”项目六个部 分,共计项。.组织器官移植所需的各项检验(如检查等) 列入“临床血液学检验”类的“血型、输血及人类组织相 关性抗原检验”类中。.”实验室诊断”中的项目不含静脉 采血,需单独收费,但微量采血管(指尖采血、耳垂采血) 包含在各检验项目中,不得单独收费。
脑”[严格的培训] 出现问题,即分析问题产生的原因,采取措施加以
改进 质理管理的习惯养成需要时间。
几个策略比较
家族病史研究与基因研究相比较 说法不一,孰优孰劣?各有所长。 肿瘤早期诊断带来的真正收益有没有我们所
希望的那么大?
国家自然科学基金委医学部主任、国家肝癌科学中心主任—王红阳院士,
个体化医学
分析方法
)基因组规模微阵列基因分型平台,确定和插入缺失和拷 贝数变异区域( )
)比较基因组杂交芯片( )检测染色体拷贝数变化 )转录水平的基因表达平台(检测表达水平) )大型数据集分析软件
常用的基因突变检测方法优缺点比较
检测方法 直接测序法
焦磷酸测序法
优点
缺点
可以检测所有突变 不灵敏,操作繁琐,易污染
临床分子诊断与个体化治疗
分子诊断
狭义分子诊断:应用分子生物学方法检测患者体内 遗传物质的结构或表达水平的变化而做出诊断的技 术,称为分子诊断,包括肿瘤分子诊断、传染病分 子诊断、产前诊断等。
广义分子诊断:指应用分子生物学方法,对受检者 体内各类生物分子(包括、、蛋白质等)进行定性 和定量分析,确定其结构或表达水平,从而为个性 化预防、治疗提供依据的一种诊断技术,包括肿瘤 分子诊断、传染病分子诊断、产前诊断、单基因诊 断、易感基因检测以及天赋基因检测等。
临床基因扩增实验室的质量控制(二)
样本接收和拒收标准:抗凝剂,采集时间量,病史。 接收标本必须有专用的登记表,并核对样本登记表中的所
有信息,人复核和签字。 每批样本核酸提取的过程中加入质控标本以保证标本处理
的过程中的正确性,同时建立用于不同技术平台的标准化 的浓度范围。 定量检测的操作过程包括个不同浓度的对照物,以及阴性 和阳性对照。 样本的保存和存储(℃和 ℃ 冰箱)
影响检测性能。
实验室必须确定使用检测物质的数量、类型和频率,如果适用,由实验室验证或建立性能 规范( ())
如果实验室引进了未经认可或批准的检测系统——包括自主研制的方法——在报告病人检 测据结果前,必须建立检测系统的性能规范,如果适用,包括下面的性能特征:准确性, 精密度,分析灵敏性,分析特异性,包括干扰物质。检测系统对检测结果的可报告区间, 参考区间(正常值),和检测性能要求的其他性能特征。 ( ()())
一些常见的认识误区
临床实验室检验科 基因(遗传携带、突变等)与病原体核酸检
测完全不同 临床检验在病理科、药剂科或肿瘤科做,不
属于临床检验管理? 必须达成一点共识:实验不管在哪做,都属
于检验管理,必须有严格的质量控制。
问题与思考
问题: 应用 实验室分区 质量管理:分析前,分析中,分析后 人员:(医生、实验室技术人员):均需“洗
塞来考替,华法林
阿托西丁、文拉法辛、利哌利酮、塞托溴胺、他莫普芬、 噻吗洛尔、氟西叮、奥氮平、西维美林、托特罗定、特 比萘酚、曲马多、啊立哌唑、美托洛尔、卡维地洛、普 罗帕酮、硫利达嗪、普罗替林,可待因
卡培他滨、氟尿嘧啶乳膏外用液
拉布立酶、氨苯矾、伯氨喹、氯喹 利福平、异烟肼、吡嗪酰胺 硫唑嘌呤、硫鸟嘌呤、巯基嘌呤 华法林
分析的有效性
准确性 与参考方法比较 设定值的方法 精密度再现性 重复性:利用分子检测方法和同一个仪器对单个样本进行重复性研究。 再现性:再现性研究评估天与天、操作与操作间的精密度、如果使用多
个仪器,要评估仪器与仪器之间的再现性;如果在多个实验室开展检测, 也要评估不同实验室间的再现性。 靠近临床和整个分析检测区间内的性能 分析的线性、回收率和高剂量钩子效应 检出限值和定量限值(在高和低的范围内) 分析特异性(交叉反应,干扰) 基质效应 影响分析结果的分析前因素 分析输出(读数区间或阴阳性)




华南肿瘤国家重点实验室,中山大学肿瘤防治中心钱朝南教授
中国肿瘤治疗现状
治愈率<, 五年生存率。低于欧美国家、,低 于日本和
主要原因: )早期诊断低 )缺乏规范化治疗 )经济状况差
较早期诊断(Ⅰ和Ⅱ)提高治愈率和五年生 存率,
分子诊断为肿瘤早期诊断提供技术支撑!
的基因以及这些基因和环境因素相互作用 仅通过基因检测盒基因表达谱的检测有很大
局限性
:分子检测有关的主要质控要求
对于每一个检测系统,实验室由此又控制程序的责任——监控整个分析过程的准确性和精 密度。( ())控制程序必须是:
检出即时误差——由检测系统故障、不利于环境和操作者能力导致( ()()) 监控检测性能的准确性和精密度——检测系统能和环境的改变以及操作者的能力都可能会
个体差异与个体化医疗
个体差异:基础 个体化医疗( )
这个名词最早由提出,其意义是家庭医生独 立行医的意思。现代意义的个体化医学概念 于年由和在《》杂志上首次提出,其意义是 根据病人的遗传学背景,结合生物信息学和 高端成像技术进行诊断,从而合理选择药物 进行治疗。
个体化医学的发展趋势
“”
年月日:(<第一期全国临床基因扩增实验技 术人员培训班>在北京卫生部临床检验中心 举办.
年月日:卫生部下发<临床基国扩增检验实验 室管理暂行办法>(卫医发[]号)
年:
《医疗机构临床基因扩增检验实验室管理办法》 (卫办医政发【】号)
《医疗机构临床基因扩增检验室工作导则》 (卫办医政发【】号)
位于基因下游处,用于预测Ⅰ型应用治疗效果,其中为保护 性基因型,和为非保护性基因,但对感染、型病毒患者无预 测价值。 基因型患者治疗前低密度脂蛋白胆固醇>、 <,预期 治愈率可能大于
个性化检测的局限性
一些疾病是由一个或多个基因突变引起 基因检测方法确实能对这些疾病的患病风险、
确诊和治疗起指导作用 大多数疾病发生、发展及预后可能涉及更多
图像定量分析。
组织部细胞原位脱氧核糖核酸()多聚酶链式反应检查诊断 原位反应,亲和物结合,显色, 复染,观察,诊断。
组织部细胞原位核糖核酸()多聚酶链式反应检查诊断 原位逆转录反应,亲和物结合,显 色,复染,观察,诊断。
截止到年月,全国按照所制定的标准通过验 收的临床基因扩增检验实验室共余家。采用 所编写的培训教材和培训模式共举办了培训 班多期,培训实验室技术人员多人。涉及全 国个省、直辖市和自治区。
目前国内临床分子诊断现状
绝大部分用于病原体核酸检测 较少部分用于遗传病的产前诊断 个体化用药的分子诊断正在兴起
临床基因扩增实验室质量控制(三)
室内质控标本的来源:包括参加国内和国际质 控标本,细胞株和已知实验结果的样本。
在每批实验中和每个技术平台上均加入了质控 样本,从样本抽提,基因扩增,杂交和测序已 知跟踪到整个实验结果,每次实验结果分析后 有专门的质控报告。
实验室的技术人员每一个月,在每一个技术平 台上都有一次盲样样本的质控实验,并以此评 价技术人员的实验技能。
(四)分子病理学技术与诊断
组织部细胞原位杂交检查诊断 石蜡包埋组织,新鲜冷冻组织,细胞涂片,组织切片机切片, 进行二甲苯脱蜡,系列乙醇水化,微波炉、高压锅及蛋白酶处理,标记探针杂交反应,洗涤, 酶或亲和物结合反应,显色,判读结果,含上述过程中所产生的废液、废物的处理。
组织部细胞荧光原位杂交检查诊断 荧光素标记探针杂交反应(一种探针)。 组织部细胞多色荧光原位杂交检查诊断 荧光素标记探针杂交反应(二种或以上探针). 组织部细胞荧光原位杂交技术计量分析诊断 荧光素标记探针杂交反应(二种或以上探针),
国内回顾
年技术在国内开始用于临床检测 年代中期:假阴性假阳性?,引发思考 年:卫生部科研课题 年月日:临床实验室管理专家咨询会 年月日:卫生部下发<关于暂停临床基因扩增
()检验的通知(卫医发[]第号)>
国内回顾
年月日:<基因扩增技术临床应用专家研讨会 >,针对临床开展检验的问题,达成八点意见.
临床基因扩增实验室的质量控制(一)
实验室各种常规工作的规章制度 实验室技术人员的生物安全制度和保护措施 防止实验室交叉污染的实验(每月一次) 实验室的清洁和消毒制度(每周次) 实验室的原始数据、报告单的归档和信息保密制度 实验室专业人员的培训和考核制度 实验室结果差错的记录和纠正措施 计算机的系统维护和管理制度
临床有效性和临床有用性
临床有效性:检测特性(敏感性、特异性、预测值和拟然比) 临床有用性:利用检测结果可以获得有效治疗或其他具体的临床
获益 筛选有症状个体的检测:基因突变帕金森症。 用于诊断和监控的检测:由 研制的实验室自制检测。该检测用于
确认活动性丙肝病毒()感染、监控治疗反应和确认感染的消退。 确定预后和指导治疗的检测: 利用实时荧光定量检测乳腺癌肿瘤
基因多态性与丙型肝炎治疗 及预后
基因多态性
结果判断
邻近基因,位于编码基因上游处,是目前已知的与感染者的 持续病毒应答()相关,其中与相关联,和与非病毒应答() 相关。基因型也与应用治疗引起的初相病毒载量的下降显著 关联,但仅与型慢性患者的二相病毒载量下降有关。
位于基因下游,与非病毒学应答相关,其中为保护性基因型, 与为非保护性基因型。等位基因与乙肝病毒相关的肝细胞损 伤密切相关,能提高基因型的非病毒学应答预测价值

基因芯片
相关药物
,, ,
三浪技术公司
公司
罗氏公司 雅培公司
组织 血, 外周血 组织, 组织, 组织,
组织,
()
平台
, ,
免疫荧光
()
() ()
()
基因突变和表达与肿瘤靶向治疗
肿瘤 结直肠癌
非小细胞肺癌
治疗药物
西妥腊单抗 () 帕尼单抗 ()
古Biblioteka Baidu替尼
特罗氨 ()
检测位点
号染色体基因号外显子的密码子和密码子、号外 显子的号密码子,其中有个突变热 点:、、、、、、占到基因突变的以上
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