诺禾致源高分文章集锦-植物转录组
复杂基因组组装软件——NOVOheter系列(高杂合基因组、高重复基因组、超大基因组)
图1 NOVOheter1.0 组装流程图图2 NOVOheter2.0 组装流程图表1 诺禾致源部分高复杂基因组项目组装结果表4 BUSCO 评估结果统计首页 科技服务 医学检测 科学与技术 市场与支持 加入我们 关于我们提供领先的基因组学解决方案Providing Advanced Genomic Solutions随着高通量测序技术的发展，越来越多的物种被测序，组装质量也因组装技术水平的提高而不断攀升，但复杂基因组组装仍像一道高耸入云的峻岭横亘在科研工作者面前。
为了支持物种复杂基因组的组装，挑战学术研究和产业发展的最前沿，诺禾致源开发出 NOVOheter 系列软件，并基于 NOVOheter 建立起一整套针对复杂基因组组装的解决方案，解决了以往复杂基因组项目周期长、费用高的问题，组装指标及质量均获国际学术界高度认可。
Species某植物Genome size4.25 GbBUSCO notation assessment resultsC:95%[D:16%],F:1.8%,M:2.1%,n:956高杂合基因组组装——NOVOheter1.0杂合率大于0.5%的二倍体或多倍体属于复杂基因组，涵盖大部分林木类植物、水产类动物以及昆虫等，部分物种杂合率高达1%，甚至2%～3%，高杂合的基因组组装给基因组测序研究带来了较大挑战。
诺禾致源团队开发的 NOVOheter1.0 软件，专门针对高杂合基因组组装，让高杂合不再成为组装难题（具体流程如图1所示）。
表1是使用 NOVOheter1.0 软件完成的高杂合基因组组装结果。
项目经验结果 2 BUSCO 评估BUSCO（Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs）评估，利用单拷贝直系同源基因，评估基因组完整性。
[2]由结果可知，956个直系同源单拷贝基因，组装出来了95%的完整单拷贝基因，说明组装结果完整。
转录组学在植物响应干旱胁迫中的研究进展
转录组学在植物响应干旱胁迫中的研究进展张军赖铭陈佳刘宏宇王斌宋丰萍*（西藏农牧学院，西藏林芝860000）摘要干旱胁迫是植物生长周期中极易遭受的非生物胁迫之一。
了解植物如何响应干旱逆境及其调控途径，成为一个热点问题。
随着转录组技术的广泛应用，人们可以从基因层面了解在干旱胁迫下，植物体内的信号转导及其相关的网络调控机制。
本文综述了近年来RNA-Sep技术在植物干旱胁迫方面的研究进展，包括干旱胁迫信号感受、内源激素基因表达及其信号转导、转录因子调控、功能蛋白调控，展望了未来转录组学在植物响应干旱胁迫中的发展方向。
关键词干旱胁迫；转录组；转录调控中图分类号S188文献标识码A文章编号1007-5739（2023）12-0014-09DOI：10.3969/j.issn.1007-5739.2023.12.003开放科学（资源服务）标识码（OSID）：Research Progress of Transcriptomics in Plant Response to Drought Stress ZHANG Jun LAI Ming CHEN Jia LIU Hongyu WANG Bin SONG Fengping*(Tibet Agriculture and Animal Husbandry University,Nyingchi Tibet860000) Abstract Drought stress is one of the most vulnerable abiotic stresses in the growth cycle of plants. Understanding how plants respond to drought stress and its regulatory pathways has become a hot issue.With the wide application of transcriptome technology,people can understand the signal transduction and related network regulation mechanism in plants under drought stress from the gene level.In this paper,the research progress of RNA-Sep technology in plant drought stress in recent years was reviewed,including drought stress signal perception,endogenous hormone gene expression and signal transduction,transcription factor regulation,and functional protein regulation,and the future development direction of transcriptomics in plant response to drought stress were prospected.Keywords drought stress;transcriptome;transcriptional regulation近年来，随着全球气候变暖趋势的加快和部分地区降雨量逐年减少，植物受到干旱胁迫的程度逐渐加剧。
文心兰侧花瓣转录组分析与调控唇瓣化变异相关转录因子的挖掘
文心兰侧花瓣转录组分析与调控唇瓣化变异相关转录因子的挖掘作者：曾思娴余让才范燕萍来源：《热带作物学报》2024年第05期关键词：文心兰；唇瓣化；转录组测序；差异表达基因中图分类号：S432.1 文献标志码：A兰科植物因其独特的花型倍受人们喜爱，MADS-box 转录因子是花的起始和发育过程中的关键调控成分，在参与花器官的发育、开花时间的调节等过程中均起着重要作用[1]。
ABCDE 模型由MADS-box 基因家族中的五类同源基因组成，这些基因通过相互作用共同决定花器官身份[2]。
因此，大多数关于兰花花器官发育的研究都集中在这些ABCDE 基因上，而关于调控兰花唇瓣发育的其他转录因子及下游相关调控网络仍不清晰，因此，探究其他相关调控机制对兰花植物分子育种具有重要意义。
文心兰是兰科文心兰属植物，因其独特的花型和艳丽的颜色是世界上具有较高观赏价值的切花品种[3]。
在长期的文心兰生长进化过程中，极易产生花型多样性，这种花型多样性主要体现在唇瓣的变化上，使其具有更高的观赏价值和生物学价值[4]。
因此揭示文心兰唇瓣多样性形成机制显得极其重要。
“花被密码模型”是目前被广泛接受的兰花花器官发育模型，该模型中，不同MADS-box 基因分别组成唇瓣复合物和萼片/花瓣复合物，这2 种蛋白复合物相互竞争决定兰花花器官身份形成[5]，而文心兰花瓣形态结构多样化的其他调控网络研究仍鲜有报道。
本研究以柠檬绿文心兰（Oncidium. flexuosum‘Honey Angel’）和其侧花瓣唇瓣化变异种（突变体）为材料，对2 种侧花瓣进行RNA 转录组测序，通过MADS-box 及其他转录因子的差异表达挖掘调控文心兰唇瓣化变异关键转录因子，为建立文心兰唇瓣化变异调控关系网络，培育花型独特兰花新品种奠定基础。
1 材料与方法1.1 材料供試材料为种植在华南农业大学花卉研究中心种质资源圃中生长健壮的柠檬绿文心兰侧花瓣发生唇瓣化变异种（突变体），对照为柠檬绿文心兰（图1）。
诺禾致源高分文章集锦-植物基因组
陆地棉基因组测序揭示四倍体棉进化与纤维发育机制Sequencing of allotetraploid cotton (Gossypium hirsutum L. acc. TM-1) provides a resource for fiber improvement研究对象：陆地棉遗传标准系TM-1期刊：Nature Biotechnology影响因子：41.514合作单位：南京农业大学发表时间：2015年4月摘 要Upland cotton is a model for polyploid crop domestication and transgenic improvement. Here we sequenced the allotetraploid Gossypium hirsutum L. acc. TM-1 genome by integrating whole-genome shotgun reads, bacterial artificial chromosome (BAC)-end sequences and genotype-by-sequencing genetic maps. We assembled and annotated 32,032 A-subgenome genes and 34,402 D-subgenome genes. Structural rearrangements, gene loss, disrupted genes and sequence divergence were more common in the A subgenome than in the D subgenome, suggesting asymmetric evolution. However, no genome-wide expression dominance was found between the subgenomes. Genomic signatures of selection and domestication are associated with positively selected genes (PSGs) for fiber improvement in the A subgenome and for stress tolerance in the D subgenome. This draft genome sequence provides a resource for engineering superior cotton lines.关键词陆地棉；de novo；四倍体研究背景陆地棉（Gossypium hirsutum L.）隶属锦葵目（Malvales），锦葵科（Malvaceae），棉属（Gossypium），因最早在美洲大陆种植而得名，是世界上最重要的棉花栽培品种，占全球棉花种植面积的90%以上。
诺禾致源资料
CONTENTS
目录
建库测序
06 建库测序服务
基因组测序
08 动植物基因组测序 10 基因组特征评估 11 基因组de novo测序 14 泛基因组测序（pan-genome） 17 动植物重测序 18 变异检测（基于全基因组重测序） 20 变异检测（基于简化基因组测序） 22 单个性状定位 25 遗传图谱（基于全基因组重测序） 27 遗传图谱（基于RAD-seq简化基因组技术） 29 遗传图谱（基于GBS简化基因组技术） 31 群体进化（基于全基因组重测序） 33 群体进化（基于简化基因组测序）
测序策略
每台仪器数据产出
最低测序量
Q30
项目周期
建
PE300
13Gb data / 1 Run 13Gb data (1 Run)
微生物
55 16S/18S/ITS等扩增子测序 58 宏基因组测序 61 细菌基因组测序 64 真菌基因组测序 67 小基因组测序
1
诺禾致源 北京诺禾致源生物信息科技有限公司于2011年3月15日在北京中关村生命科学 园注册成立，以基因组学研究与应用开发为发展方向，致力于成为全球领先的基因组学研究解决方案提供者。专 注于开拓生物学、计算机科学和信息技术在动植物研究以及人类健康领域的应用。
[4] Li M, Tian S, Jin L, et al. Genomic analyses identify distinct patterns of selection in domesticated pigs and Tibetan wild boars[J]. Nature genetics, 2013, 45(12): 1431-1438.
诺禾致源有参转录组分析流程
Phred分值
10 20 30 40
不正确的碱基识别
1/10 1/100 1/1000 1/10000
碱基正确识别率
90% 99% 99.9% 99.99%
Q-sorce
Q10 Q20 Q30 Q40
测序错误率与碱基质量有关，受测序仪本身、测序试剂、样品等多个因素共同影响。对于RNA-seq技术，测序错误率分布具有两个特点： (1)测序错误率会随着测序序列(Sequenced Reads)长度的增加而升高，这是由于测序过程中化学试剂的消耗导致的，并且为illumina高通量测序平台都具有的特征。 (2)前6个碱基的位置也会发生较高的测序错误率，而这个长度也正好等于在RNA-seq建库过程中反转录所需要的随机引物的长度。所以前6个碱基测序错误率较高的原 因为随机引物和RNA模版的不完全结合(Jiang et al.)。
图1 测序错误率分布图 横坐标为reads的碱基位置，纵坐标为单碱基错误率
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北京诺禾致源生物信息科技有限公司 2.2 A/T/G/C 含量分布检查
GC含量分布检查用于检测有无AT、GC 分离现象，而这种现象可能是测序或者建库所带来的，并且会影响后续的定量分析。 在illumina测序平台的转录组测序中，反转录成cDNA时所用的6bp 的随机引物会引起前几个位置的核苷酸组成存在一定的偏好性。而这种偏好性与测序的物种和 实验室环境无关，但会影响转录组测序的均一性程度(Hanse上应分别相等，且整个测 序过程稳定不变，呈水平线，而对于链特异性建库会出现GC分离的现象。对于DGE测序来说，由于随机引物扩增偏差等原因，常常会导致在测序得到的每个read前67个碱基有较大的波动，这种波动属于正常情况。
诺禾致源高分文章集锦-微生物功能研究
1、研究共鉴定出已注释 ORFs 中 48.4% 的 TSS 位点。作者发现同许多原核生物不同，嗜冷甲烷叶菌有 约 51% 的 mRNA 具有较长 5' UTR（>50nt），约 24% 的 mRNA 5' UTR 大于 150nt（图 1）。
2、14% 的基因拥有多重 TSSs（图 2），此外还有 84 个基因拥有低温响应的 gTSS 和启动子，在不 同的温度下会转录形成含有不同剪切形式 5' UTR 的转录本，这种转录后水平的调控协同转录中调控来影响 mRNA 的表达水平与稳定性，从而控制古菌的低温r(VI) 降低了细菌和潜在的反硝化微生物的多样性；在含 Cr(VI) 污水处理器中，Thauera 属占主导地位。当废水中不含 Cr(VI) 时，处理器中检测不到 Thauera 的存在，当处理含 120 mg/L Cr(VI) 废 水时，Thauera 相对丰度可达 18.18%（图 1）。
研究对象：含 Cr(VI) 废水处理反应器污泥 期刊：Water Research 影响因子：5.528 合作单位：南京大学 发表时间：2015 年 3 月
摘要
In this study, a lab-scale expanded granular sludge bed reactor was continuously operated to treat high-nitrate wastewater containing different concentrations of hexavalent chromium (Cr(VI)). Nearly complete nitrate removal was achieved even at 120 mg/L influent Cr(VI). Pyrosequencing of 16S rRNA gene showed that Cr(VI) decreased the biodiversity of the bacterial community and potential denitrifiers. Proteobacteria dominated in the bioreactor, and Betaproteobacteria had increased abundance after Cr(VI) feeding. Thauera and Halomonas were the two predominant genera in the bioreactor fed with Cr(VI), demonstrating opposite responses to the Cr(VI) stress. Metagenomic analysis indicated that Cr(VI) feeding posed no obvious effect on the overall function of the bacterial community, but altered the abundance of specific denitrifying genes, which was evidenced by quantitative real time PCR. This study revealed that Halomonas mainly contributed to the denitrification under no or low Cr(VI) stress, while Thauera played a more important roleunder high Cr(VI) stress.
动植物全基因组测序
2013.072013.102014.092014.112015.04图1 异源多倍体棉花基因组共线性分析与非对称进化分析图2 MYB基因家族表达模式分析, Jiang W, et al. Sequencing of allotetraploid cotton (Gossypium hirsutum L. acc. TM-1) provides a resource for fiber improvement [J]. Nature Biotechnology, 2015, 33(5): 531-537.图3 金丝猴植食性机制的分析图4 金丝猴有效群体大小分析参考文献Zhou X, Wang B, Pan Q, Li R, Li M. Whole-genome sequencing of the nub-nosed monkey provides insights into folivory and evolutionary history [J]. Nature Genetics, 2014, 46(12):1303-1310.图5 藏猪及其它猪种的群体遗传结构分析参考文献Li M, Tian S, Jin L, et al. Genomic analyses identify distinct patterns of selection in domesticated pigs and Tibetan wild boars [J]. Nature genetics, 2013, 45(12): 1431-1438.图6 进化分析结果图7 脂肪酸能量代谢途径蓝色表示正选择基因；红色表示特异性基因参考文献Qu Y, Zhao H, Han N, et al. Ground tit genome reveals avian adaptation to living at high altitudes in the Tibetan plateau [J]. Nature communications, 2013, 4.图1 7株野生大豆共有和特有基因集图2 野生大豆开花时间调控基因SNP和InDel变异参考文献Li Y, Zhou G, Ma J, Jiang W, Li R#, et al. De novo assembly of soybean wild relatives for pan-genome analysis of diversity and agronomic traits [J]. Nature biotechnology, 2014.32(10):1045-1052.图3 部分novel sequence在世界人群中的分布参考文献Li R, Li Y, Zheng H, et al. Building the sequence map of the human pan-genome [J]. Nature biotechnology, 2010, 28(1): 57-63.。
转录组学在作物育种中的应用前景
转录组学在作物育种中的应用前景转录组学作为现代生物学的一个重要分支，其在作物育种中的应用前景非常广阔。
以下是一篇关于转录组学在作物育种中应用前景的文章，分为三个部分进行阐述。
一、转录组学概述转录组学是研究细胞中所有RNA分子的种类、数量、结构和功能等信息的科学。
它涉及到基因表达的调控，是了解生物体如何响应环境变化、发育过程以及遗传变异的关键。
转录组学的发展得益于高通量测序技术的进步，使得科学家能够对整个转录组进行深入分析。
1.1 转录组学的核心概念转录组学的核心概念包括基因表达、转录调控、非编码RNA等。
基因表达是指基因信息转化为蛋白质或RNA的过程，是生物学功能实现的基础。
转录调控则涉及到基因表达的精细调控机制，包括转录因子、启动子、增强子等元件的作用。
非编码RNA，如miRNA和lncRNA，虽然不编码蛋白质，但在调控基因表达中起着至关重要的作用。
1.2 转录组学的技术平台转录组学的技术平台主要包括高通量测序技术、微阵列技术、Northern blot等。
高通量测序技术，如RNA-Seq，能够提供全面、定量的基因表达信息。
微阵列技术则通过特定的探针检测特定基因的表达水平。
Northern blot是一种传统的技术，用于检测特定RNA分子的存在和大小。
二、转录组学在作物育种中的应用转录组学在作物育种中的应用主要集中在提高作物的产量、品质、抗性和适应性等方面。
通过分析作物在不同环境条件下的转录组变化，育种家可以识别关键基因和调控元件，进而设计育种策略。
2.1 提高作物产量作物产量的提高是育种的主要目标之一。
转录组学可以帮助科学家识别与产量相关的基因和调控网络，如光合作用、营养吸收、生长发育等过程的关键基因。
通过基因编辑或传统育种手段，可以改良这些基因，提高作物的产量。
2.2 改善作物品质作物品质包括营养价值、口感、外观等。
转录组学分析可以帮助识别影响这些品质性状的基因，如影响淀粉、蛋白质合成的基因，以及影响果实颜色、形状的基因。
【文章知识点】深度解析长末端重复反转录转座子（LTR-RTs）
【⽂章知识点】深度解析长末端重复反转录转座⼦（LTR-RTs）提起 LTR，相信很多⼈和我之前⼀样都是熟悉⼜陌⽣的感觉，听过或者接触过却未深⼊了解过。
若您对 LTR 分析有兴趣，却苦于⽆从下⼿时，愿本⽂作为⼀个叩门砖，为您敲开 LTR 分析的⼤门。
本篇从 LTR 的定义、分类、⽣物学意义、结构特征、鉴定⽅法等⽅⾯层层递进，带您⾛进神奇的 LTR 世界。
1. LTR 与重复序列、转座⼦的关系LTR-RTs 是 Long terminal repeat-retrotransposons 的缩写，中⽂名是长末端重复反转座⼦。
LTR-RTs 名字中既有重复、⼜有转座⼦，那么它和重复序列、转座⼦是什么关系呢？图1 为您解答。
图1 重复序列主要分类重复序列：根据重复区域是否连续可分为串联重复序列和散在重复序列（⼜名转座⼦、转座元件）两⼤类，前者相连，后者不相连。
转座元件(transposable elements, TEs) ⼜称转座⼦：指在基因组中能够移动或复制，并可以整合到基因组新位点的⼀段 DNA 序列。
根据转座过程是否形成 RNA 中间体，转座⼦可分为 DNA 转座⼦和反转录转座⼦。
反转录转座⼦是以 RNA 为媒介，伴有反转录过程，以复制-粘贴的⽅式在基因组的新位置产⽣⼀个新的拷贝。
DNA 转座⼦的转座机制则是剪切-粘贴的形式。
LTR-RTs :是反转座⼦中的⼀种，因其两侧存在长的末端重复⽽得名。
不含长末端重复的反转座⼦统称 non-LTR-RTs，主要包含短散在重复(SINE)和长散在重复(LINE)。
2. LTR的分类动植物基因组中存在⼤量转座⼦，尤其是植物基因组中。
LTR 因其数量多且 LTR 长度巨⼤，在植物转座⼦中具有较⾼的基因组含量。
在⽟⽶基因组中 LTR 占基因组含量⾼达 75% ，⼭苍⼦基因组中 LTR 占⽐⾼达 47%，所以基因组 LTR 的鉴定尤为重要。
反转录转座⼦根据转座元件结构的完整性和转座特点可分为⾃主元件（编码转座酶）和⾮⾃主元件（⾃⾝不编码转座酶）。
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温带和热带莲根状茎形成过程中的转录组分析Transcriptomic Analysis of the Regulation of Rhizome Formation in Temperate andTropical Lotus (Nelumbo nucifera )研究对象：莲根状茎期刊：Scientific Reports影响因子：5.578合作单位：中国科学院武汉植物园发表时间：2015年7月摘 要Rhizome is the storage organ of lotus derived from modified stems. The development of rhizome is a complex process and depends on the balanced expression of the genes that is controlled by environmental and endogenous factors. However, little is known about the mechanism that regulates rhizome girth enlargement. In this study, using RNA-seq, transcriptomic analyses were performed at three rhizome developmental stages—the stolon, middle swelling and later swelling stage —in the cultivars ‘ZO’ (temperate lotus with enlarged rhizome) and ‘RL’ (tropical lotus with stolon). About 348 million high-quality reads were generated, and 88.5% of the data were mapped to the reference genome. Of 26783 genes identified, 24069 genes were previously predicted in the reference, and 2714 genes were novel transcripts. Moreover, 8821 genes were differentially expressed between the cultivars at the three stages. Functional analysis identified that these genes were significantly enriched in pathways carbohydrate metabolism and plant hormone signal transduction. Twenty-two genes involved in photoperiod pathway, starch metabolism and hormone signal transduction were candidate genes inducing rhizome girth enlargement. Comparative transcriptomic analysis detected several differentially expressed genes and potential candidate genes required for rhizome girth enlargement, which lay a foundation for future studies on molecular mechanisms underlying rhizome Formation.关键词根状茎；变态发育； DGE 研究背景莲根状茎，即莲藕，作为一种变态茎，是莲的贮藏器官。
根状茎的发育是一个复杂的过程，受到与环境及内源因素调控的基因平衡表达的影响。
关于根状茎膨大的调控机制很少为人所知。
植物3、对差异基因进行GO 和KEGG 富集，大多数差异基因显著富集到4个GO term 中。
多数差异基因被富集到次级代谢，蔗糖代谢，碳代谢等代谢通路中。
4、发现已报道的根状茎生长相关的光周期基因PHYB,CO,GI,FT 的同源基因在温带及热带莲根状茎中存在不同表达模式；已报道的与淀粉合成相关酶SUS,UGPase,AGPase,GBSS,SSS 等的同源基因在温带及热带莲根状茎中存在差异表达；大量的激素信号转导、激素合成、激素响应蛋白以及激素转运蛋白如GA,ABA,CTK,JA 等被鉴定出在不同的类别中存在差异表达。
研究结果1、所有文库的reads 比对参考基因组后，发现2714个新转录本，其中1186个基因被成功注释到GO 生物学过程中的9个亚类中。
2、比较热带莲三个发育阶段的根状茎，分别发现1688，4208，4795个差异基因；比较温带莲三个发育阶段的根状茎，分别发现3206，6360，5535个差异基因。
比较三个发育阶段中温带和热带两种莲，共发现10299个差异基因。
对所有差异基因进行聚类，共聚为8类（图1）。
图1 差异表达基因维恩图及聚类图图2 与淀粉合成相关基因的表达模式热图，与激素信号转导相关基因的表达模式热图参考文献Mei Yang, Lingping Zhu, Cheng Pan, et al. Transcriptomic Analysis of the Regulation of RhizomeFormation in Temperate and Tropical Lotus (Nelumbo nucifera). Sci Rep, 2015, 513059.提升CO2的浓度可增强小球藻的碳代谢从而提高脂质堆积Elevated CO2 improves lipid accumulation by increasing carbon metabolism in Chlorella sorokiniana 研究对象：小球藻期刊：Plant Biotechnology journal影响因子：5.752合作单位：江苏省农科院发表时间：2015年5月摘 要Supplying microalgae with extra CO2 is a promising means for improving lipid production. The molecular mechanisms involved in lipid accumulation under conditions of elevated CO2, however, remain to be fully elucidated. To understand how elevated CO2 improves lipid production, we performed sequencing of Chlorella sorokiniana LS-2 cellular transcripts during growth and compared transcriptional dynamics of genes involved in carbon flow from CO2 to triacylglycerol. These analyses identified the majority genes of carbohydrate metabolism and lipid biosynthesis pathways in C. sorokiniana LS-2. Under high doses of CO2, despite down-regulation of most de novo fatty acid biosynthesis genes, genes involved in carbohydrate metabolic pathways including carbon fixation, chloroplastic glycolysis, components of the pyruvate dehydrogenase complex (PDHC) and chloroplastic membrane transporters were upexpressed at the prolonged lipid accumulation phase. The data indicate that lipid production is largely independent of de novo fatty acid synthesis. Elevated CO2 might push cells to channel photosynthetic carbon precursors into fatty acid synthesis pathways, resulting in an increase of overall triacylglycerol generation. In support of this notion, genes involved in triacylglycerol biosynthesis were substantially up-regulated. Thus, elevated CO2 may influence regulatory dynamics and result in increased carbon flow to triacylglycerol, thereby providing a feasible approach to increase lipid production in microalgae.关键词小球藻LS-2；碳水化合物代谢研究背景给微藻提供额外的CO2是一种提高脂质产量的有效途径。
但是在CO2升高时脂质堆积的分子机制并不清楚。
本文通过对小球藻LS-2进行转录组测序研究了从CO2到甘油三酯碳流过程中基因的动态变化揭示了CO2升高过程中脂质堆积的分子机制。
方法流程植物研究结果1、通过RNA-seq的手段，对高剂量CO2和正常空气下培养的小球藻进行转录组测序，通过转录本拼接共得到22,432个unigene，N50长度1,680 bp，并通过基因功能注释鉴定出了很多与糖代谢和脂质合成途径相关的基因（图1）。