基因定点突变技术
4、大引物诱变法
首先用正向突变引物(M) 和反向引物(R1),扩增模板 DNA产生双链大引物(PCR1), 与野生型DNA分子混合后退火并 使之复性,第二轮PCR中加入正 向引物(F2),与PCR1中产生 的一条互补链配对,扩增产生带 有突变的双链DNA。由于F2中的 退火温度显著高于第一轮PCR所 使用的引物M和R1,因此,可忽 略引物M和R1在本轮反应中所造 成的干扰。
将待突变的目的基因
插入M13噬菌体载体 上,制备单链DNA
将合成的寡核酸片段
与单链模板退火,在 DNA聚合酶的作用下 合成互补的双链DNA 将双链DNA转化大肠 杆菌,获得突变基因
突变体的筛选:寡核
酸探针杂交筛选法
3、重叠延伸介导的定点诱变
首先将模板DNA分别分别与 引物对1(正向诱变引物FM和 反向引物R2)和2(正向引物 F2和反向诱变引物RM)退火, 通过PCR1和2反应扩增出两种 靶基因片段。FMR2和RMF2片段 在重叠区发生退火,用DNA聚 合酶补平缺口,形成全长双链 DNA,进行PCR3扩增。最后, 用引物F2和R2扩增出带有突变 位点的全长DNA片段(PCR4)。
PCR介导的定点突变的优势
1、突变体回收率高,有时不需要进行突变体筛选;
2、能用双链DNA作为模板,可以在任何位所有反应; 4、快速简便,无需再噬菌体M13载体上进行分子克隆。
三、基因定点突变应用
近年来,由于突变技术使得人们可以按照自 己的意愿改造基因或蛋白质的产物,从而取得改 变后的产物,使其造福于人类。因此突变技术已 广泛应用在各个领域,具有着广阔的应用前景。 分为: 1、突变技术在蛋白质工程中的应用 2、DNA缺失改造
2、DNA缺失改造
心钠素(ANP)和干扰素(IFN)在临床上 有着非常诱人的应用前景。这两产物在大肠杆菌和酵 母系统中都能以融合蛋白的形式表达出来。但由于在 克隆过程中不可避免地引进了一些没有用的核苷酸序 列,这样表达出来的产物就与天然产物存在着一定的 差异。为了使克隆表达的产物与天然的产物一样,人 们便采用寡核苷酸指导的定点突变技术,成功地对这 些多余的核苷酸进行了缺失改造,以期得到正确的产 物。
1、寡核苷酸盒式诱变
(Cassette mutagenesis)
利用一段人工合成的具有突变 序列的寡核苷酸片段,即寡核苷酸 盒,取代野生型基因中的相应序列。
2、寡核苷酸引物诱变
使用化学合成的含有突变碱基的寡 核苷酸片段作为引物,启动单链DNA 分子进行复制,随后这段寡核苷酸引 物便成为了新合成DNA子链的一个组 成部分,因此所产生出来的新链便具 有已发生突变的碱基序列
在酶工业方面:
一般通过定点突变技术获得突变的酶的稳定性效果不 显著,因为酶的稳定性与活性有关。从酶的稳定性与影响 酶活性的条件相关性我们可以得出:蛋白的变性是由高温、 极端pH、有机溶剂或去污剂的存在诱导而产生的。基于 这些理论,有利于人们选择高稳定性的突变体来改变酶的 结构和功能。
在医药方面:
通过在蛋白质工程中使用定点突变技术,筛选影响抗 生素耐性增强的突变子,对于研发更高效的抗生素具有非 常重要的指导意义。
四、展望
定点突变技术可以高效地应用于DNA缺失改造、 蛋白质工程和酶等多个研究领域。它不仅加深人们对 蛋白质、酶等物质的了解,而且也为进一步研究这些 物质提供技术支持。另外,突变技术可以对某一特性 相关位点同时进行突变,这就极大地提高了获取突变 子的效率,避免了高强度的筛选工作,同时也节约了 大量的时间和资金。突变技术在蛋白质工程研究将会 继续保持迅猛势头,且在医学、农业科学、肿瘤研究、 基因表达与调控等领域,突变技术的应用也越来越广 阔。因此,我们有理由相信突变技术在未来会有光明 的应用前景。
定点突变技术通过寡核苷酸盒式诱变、寡 核苷酸引物介导、重叠延伸介导和大引物诱变 法介导(PCR介导)等途径来实现。盒式突变 是利用一段人工合成的含基因突变序列的寡核 苷酸片段,取代野生型基因中的相应序列,该 法虽简单易行,但成本较高。寡核苷酸引物介 导是利用含有突变碱基的寡核苷酸片段作引物, 在聚合酶的作用下启动对DNA分子的复制, 该方法虽被广泛应用于基因调控、蛋白质功能 与结构之间的相互关系的研究中,但存在突变 效率低的问题;重叠延伸和大引物诱变法介导 的定点突变技术为基因修饰、改造也提供了另 一条方便的途径。但该方法后续工作比较复杂, 且易发生其他突变;
1、突变技术在蛋白质工程中的应用
突变技术在蛋白质工程中的应用 非常广泛和成功。此技术不仅是蛋白 质定向改造的强有力工具,而且也是 研究蛋白质结构和功能关系的重要方 法。
在农业方面:
利用基因某一位点的改变进而来改变蛋白质的一级结 构,以此来改良或改造毒蛋白的活性。同时,还可以利用 突变技术改变结构域中的氨基酸残基,使突变毒蛋白与新 的昆虫受体相结合来扩大杀虫的范围,可以取代具有有机 磷污染 民用杀虫剂。
基因定点突变技术
目录
一、定点突变简介
二、基因定点诱变 三、基因定点突变应用
四、展望
一、定点突变简介
定点突变(site-directed mutagenesis) 技术可以有目的性地在已知DNA 序列中 取代、插入或缺失一定的核苷酸片段,可以 有目的或针对性的改变DNA序列中的碱基 次序;它不仅可以用来阐明基因的调控机理, 也可以用来研究蛋白质结构与功能之间的关 系。
定点突变技术的原理和步骤
定点突变技术的原理和步骤嘿,咱今儿来聊聊定点突变技术呀!这玩意儿可神奇了呢!你想啊,就好像是一个特别厉害的魔法,能让基因按照我们的想法来变一变。
那定点突变技术的原理是啥呢?简单来说,就是要精准地在基因的特定位置上搞点小改动。
这就好比是在一个庞大的基因拼图里,准确地找到那一块我们想要动的小拼图,然后给它换个模样。
这可不是随随便便就能做到的哦,得有非常精细的操作和技巧才行呢。
那具体咋操作呢?这步骤可不能马虎。
首先呢,得设计好要突变的那个点,这就像是给要走的路先规划好方向,可不能瞎走。
然后,要准备好各种工具和材料,这就跟出门得带好钥匙、钱包一样重要。
接下来,就是真正开始动手啦!就像一个精巧的工匠,小心翼翼地对基因进行操作。
把原来的那块小拼图取出来,再把我们准备好的新的放进去。
这过程可得特别仔细,不能有一点差错,不然可就前功尽弃啦!做完这些还不算完哦,还得检查检查,看看变的对不对,效果好不好。
这就像我们做完作业得检查一遍一样,可不能马马虎虎的。
你说这定点突变技术是不是很神奇?它能让我们对基因进行精确的改造,为很多领域带来了巨大的帮助。
比如说在医学上,能帮助我们研究疾病的发生机制,找到更好的治疗方法。
在农业上呢,能让农作物变得更优秀,产量更高,品质更好。
想象一下,如果没有定点突变技术,我们对基因的了解和利用会少多少啊!那得是多大的损失呀!所以说,这项技术真的是太重要啦!总之呢,定点突变技术就是这样一个既有趣又有用的东西。
它让我们对基因的操控变得更加精准和有效。
我们要好好利用它,让它为我们的生活带来更多的好处和惊喜。
你说是不是呀?。
pcr定点突变技术原理
pcr定点突变技术原理
PCR定点突变技术是指基于聚合酶链反应技术和脱氧核糖核酸(DNA)技术,通过检测特定位点的特定DNA序列,以及该特定位点在
基因突变中发生变化的方法。
该技术通过引入多个PCR扩增特定序列,并在PCR产物中检测突变位点。
整个PCR定点突变分析流程包括:DNA
提取、PCR扩增、筛选、突变检测、数据分析等步骤。
第一步,先从患
者的脱氧核糖核酸(DNA)样本中取出要检测特定位点的特定DNA序列;第二步,涉及倍性引物的PCR扩增得到的DNA复制物,称为弧菌状病
毒(HCV);第三步,以线性化步骤将弧菌状病毒和分子材料分离出来,生成紫外可见化质粒,只保留差异片段;第四步,读取所有特征模式,以获得有效的特征模式,以及发现相关的突变和多态性;第五步,通
过对所有样本进行数据挖掘来识别单项显著突变,以确定检测突变位
点的实验结果。
PCR定点突变技术是一种快速、准确的技术,使得迅速检测基因变
异和检测新发现的个体基因变异变得可能,完成病原菌或其他物质的
突变检测,为基因治疗、基因疾病的诊断和治疗,基因改造有重要的
应用前景。
定点突变的步骤
定点突变的步骤定点突变是一种在基因研究中超级酷的技术呢。
咱就先来说说最开始要做的事儿吧。
得先确定好你要突变的那个基因序列。
这就像是在一大串密码里,找到你想搞点小把戏的那一小段密码一样。
这个基因序列的选择可不能马虎,得是对整个研究或者实验有重要意义的部分哦。
接着呀,就得设计突变引物啦。
这引物就像是一把特殊的小钥匙,能精准地找到你想要突变的地方。
设计引物的时候可讲究了,要考虑好多因素,什么碱基互补啦,长度合适啦之类的。
就像你搭配衣服,得考虑颜色搭不搭,款式合不合适一样。
有了引物之后呢,就是进行PCR反应啦。
这PCR反应就像是一个小小的基因复印机,不过呢,它可是按照你设计的引物来工作的。
它会把包含你要突变位置的那一段基因大量地复制出来,而且在这个过程中,因为有引物的引导,就会在复制的时候产生你想要的突变。
这个过程就像是一场小小的基因魔法秀,在分子的小世界里悄悄地改变着基因的模样。
PCR反应完了之后,还得对产物进行验证呢。
这就好比做完了一件艺术品,你得检查检查有没有瑕疵。
验证的方法有不少,像是测序之类的。
测序就像是给基因拍个高清照片,然后仔细看看每个碱基是不是都在正确的位置,有没有按照我们想要的突变发生了改变。
要是验证通过了,那就可以把这个突变后的基因放到细胞或者生物体里啦。
这就像是把一个新的小零件装到一个大机器里,然后看看这个新零件会给大机器带来什么样的变化。
也许会产生一些意想不到的效果,也许会按照我们预想的那样改变细胞或者生物体的某些特性。
定点突变虽然听起来很复杂,但就像做一道超级复杂的菜一样。
只要一步一步按照正确的步骤来,精心准备每一个材料,用心操作每一个步骤,最后就能做出一道让自己满意的“基因大餐”啦。
这过程中虽然可能会遇到不少小麻烦,就像做菜的时候盐放多了或者火候没掌握好,但只要不断调整,总会得到想要的结果的。
而且每一次成功的定点突变,都像是打开了一扇通往新知识新发现的小窗户,让人特别有成就感呢。
基因定点突变全攻略
基因定点突变全攻略一、定点突变得目得把目得基因上面得一个碱基换成另外一个碱基.二、定点突变得原理定点突变就是指通过聚合酶链式反应(PCR)等方法向目得DNA片段(可以就是基因组,也可以就是质粒)中引入所需变化(通常就是表征有利方向得变化),包括碱基得添加、删除、点突变等。
定点突变能迅速、高效得提高DNA所表达得目得蛋白得性状及表征,就是基因研究工作中一种非常有用得手段。
体外定点突变技术就是研究蛋白质结构与功能之间得复杂关系得有力工具,也就是实验室中改造/优化基因常用得手段。
蛋白质得结构决定其功能,二者之间得关系就是蛋白质组研究得重点之一。
对某个已知基因得特定碱基进行定点改变、缺失或者插入,可以改变对应得氨基酸序列与蛋白质结构,对突变基因得表达产物进行研究有助于人类了解蛋白质结构与功能得关系,探讨蛋白质得结构/结构域。
而利用定点突变技术改造基因:比如野生型得绿色荧光蛋白(wtGFP)就是在紫外光激发下能够发出微弱得绿色荧光,经过对其发光结构域得特定氨基酸定点改造,现在得GFP能在可见光得波长范围被激发(吸收区红移),而且发光强度比原来强上百倍,甚至还出现了黄色荧光蛋白,蓝色荧光蛋白等等。
定点突变技术得潜在应用领域很广,比如研究蛋白质相互作用位点得结构、改造酶得不同活性或者动力学特性,改造启动子或者DNA作用元件,提高蛋白得抗原性或者就是稳定性、活性、研究蛋白得晶体结构,以及药物研发、基因治疗等等方面.通过设计引物,并利用PCR将模板扩增出来,然后去掉模板,剩下来得就就是我们得PCR 产物,在PCR产物上就已经把这个点变过来了,然后再转化,筛选阳性克隆,再测序确定就行了.三、引物设计原则引物设计得一般原则不再重复.突变引物设计得特殊原则:(1)通常引物长度为25~45 bp,我们建议引物长度为30~35 bp。
一般都就是以要突变得碱基为中心,加上两边得一段序列,两边长度至少为11—12 bp。
若两边引物太短了,很可能会造成突变实验失败,因为引物至少要11-12个bp才能与模板搭上,而这种突变PCR要求两边都能与引物搭上,所以两边最好各设至少12个bp,并且合成多一条反向互补得引物。
基因定点突变全攻略
基因定点突变全攻略一、定点突变得目得把目得基因上面得一个碱基换成另外一个碱基.二、定点突变得原理定点突变就是指通过聚合酶链式反应(PCR)等方法向目得DNA片段(可以就是基因组,也可以就是质粒)中引入所需变化(通常就是表征有利方向得变化),包括碱基得添加、删除、点突变等。
定点突变能迅速、高效得提高DNA所表达得目得蛋白得性状及表征,就是基因研究工作中一种非常有用得手段。
体外定点突变技术就是研究蛋白质结构与功能之间得复杂关系得有力工具,也就是实验室中改造/优化基因常用得手段。
蛋白质得结构决定其功能,二者之间得关系就是蛋白质组研究得重点之一。
对某个已知基因得特定碱基进行定点改变、缺失或者插入,可以改变对应得氨基酸序列与蛋白质结构,对突变基因得表达产物进行研究有助于人类了解蛋白质结构与功能得关系,探讨蛋白质得结构/结构域。
而利用定点突变技术改造基因:比如野生型得绿色荧光蛋白(wtGFP)就是在紫外光激发下能够发出微弱得绿色荧光,经过对其发光结构域得特定氨基酸定点改造,现在得GFP能在可见光得波长范围被激发(吸收区红移),而且发光强度比原来强上百倍,甚至还出现了黄色荧光蛋白,蓝色荧光蛋白等等。
定点突变技术得潜在应用领域很广,比如研究蛋白质相互作用位点得结构、改造酶得不同活性或者动力学特性,改造启动子或者DNA作用元件,提高蛋白得抗原性或者就是稳定性、活性、研究蛋白得晶体结构,以及药物研发、基因治疗等等方面.通过设计引物,并利用PCR将模板扩增出来,然后去掉模板,剩下来得就就是我们得PCR 产物,在PCR产物上就已经把这个点变过来了,然后再转化,筛选阳性克隆,再测序确定就行了.三、引物设计原则引物设计得一般原则不再重复.突变引物设计得特殊原则:(1)通常引物长度为25~45 bp,我们建议引物长度为30~35 bp。
一般都就是以要突变得碱基为中心,加上两边得一段序列,两边长度至少为11—12 bp。
若两边引物太短了,很可能会造成突变实验失败,因为引物至少要11-12个bp才能与模板搭上,而这种突变PCR要求两边都能与引物搭上,所以两边最好各设至少12个bp,并且合成多一条反向互补得引物。
基因的定点突变的原理
基因的定点突变的原理基因的定点突变是指在DNA序列中的特定位置发生的突变,即碱基序列的改变。
这种突变发生在特定的位置,通常是基因编码区域,会引起氨基酸序列的改变,从而对蛋白质的功能产生影响。
定点突变的原理主要涉及以下几个方面:1. 突变的起源:定点突变可以是自发发生的,也可以是由外部因素引起的。
自发突变通常是由DNA复制过程中的错误引起的,包括碱基替换、插入或缺失等变异。
而外部因素如辐射、化学物质等也可能引起DNA损伤并导致定点突变。
2. 碱基替代:定点突变最常见的形式是碱基替代,即一个碱基被另一个碱基替代。
这种替代可能是同义突变,即替代后的密码子依然编码相同的氨基酸。
也可能是错义突变,即替代后的密码子编码不同的氨基酸,从而改变蛋白质的结构和功能。
3. 密码子的改变:在定点突变时,被替代的碱基往往位于密码子序列中的特定位置。
这种替代可能导致密码子的改变,从而改变蛋白质的翻译过程。
例如,突变可能导致起始密码子的改变,影响蛋白质的翻译起始,或者导致终止密码子的改变,影响蛋白质的翻译终止。
4. 功能影响:定点突变引起的氨基酸序列的改变可能会影响蛋白质的结构和功能。
如果突变发生在蛋白质的活性位点或功能域内,可能会影响蛋白质的结合能力、催化能力或信号转导等功能。
这种影响可能是有益的,例如产生对环境更有优势的适应性变异,也可能是有害的,例如导致疾病的发生。
总之,定点突变是指DNA序列特定位置发生的突变,可能是自发发生的或由外部因素引起的。
突变可以是碱基替代,导致密码子的改变,进而影响蛋白质的结构和功能。
这些突变的结果可能是有益的适应性变异,也可能是有害的疾病突变。
quikchange定点突变原理
quikchange定点突变原理QuikChange定点突变原理QuikChange定点突变技术是一种高效、快速、准确的DNA突变技术,它可以在不改变目标基因的其他部分的情况下,精确地改变目标基因的一个或多个碱基。
这种技术在基因工程、生物医学研究、农业生产等领域有着广泛的应用。
QuikChange定点突变技术的原理是利用PCR技术,在目标DNA 序列中引入点突变。
首先,设计一对包含突变位点的引物,其中一个引物包含突变位点的突变核苷酸,另一个引物与目标序列互补。
然后,在PCR反应中,这两个引物结合在目标DNA序列上,形成一个带有突变位点的DNA片段。
最后,通过PCR扩增和酶切等步骤,将突变片段插入到目标载体中,完成目标基因的定点突变。
QuikChange定点突变技术具有以下优点:1. 高效性:QuikChange定点突变技术可以在短时间内完成目标基因的定点突变,大大提高了实验效率。
2. 精确性:QuikChange定点突变技术可以精确地改变目标基因的一个或多个碱基,不会影响目标基因的其他部分。
3. 灵活性:QuikChange定点突变技术可以根据需要设计不同的引物,实现不同的突变类型,具有很高的灵活性。
4. 可靠性:QuikChange定点突变技术的结果可靠,突变率高达100%。
QuikChange定点突变技术在基因工程、生物医学研究、农业生产等领域有着广泛的应用。
例如,在基因工程中,QuikChange定点突变技术可以用于改变目标基因的功能,实现基因的定向进化;在生物医学研究中,QuikChange定点突变技术可以用于研究基因与疾病之间的关系;在农业生产中,QuikChange定点突变技术可以用于改良作物品种,提高作物的产量和品质。
QuikChange定点突变技术是一种高效、快速、准确的DNA突变技术,具有广泛的应用前景。
定点突变技术
操作:设计引物,分别PCR,前两次PCR 反应产物经琼脂糖凝胶电泳鉴定后无需 纯化,直接将胶条切下置于EP管中, 80℃冷冻10min,然后将胶条离心后分 别取上清液作为模板进行第三次PCR,以 获得全长的突变目的基因
PCR介导的定点突变法其优点是操作较简 单,突变的成功率可达100%。但它亦 有两个缺点:①后续工作较复杂,PCR扩 增产物通常需要连接到载体分子上,然
寡核有酸引物介导的定点突变 法其优点是保真度比PCR突变法 高,经过改进后使该方法突变少 成功率大大提高,缺点是操作过 程环节复杂制。
盒式突变法具有简单易行、突变效率高 等优点,还可以在一对限制酶切位点内 一次突变多个位点。缺点是合成多条引 物的成本较高。另外,在一般情况下, 在靶DNA片段的两侧往往难以满足存在 一对限制性酶切位点的要求,限 制了该 方法的广泛应用。然而一旦具备了这样 的条件该方法则为首选。
定点突变技术
刘微
基因的定点突变技术
点突变的技术有很多种,常见的有: ㈠寡核苷酸介导的定点突变技术
(M13噬菌体法) ㈡ 盒式诱变 ㈢PCR点突变技术
1.引物PCR定点诱变法 2.重组PCR定点诱变法 3.重叠延伸PCR技术
寡核苷酸引物诱变技术 (M13噬菌体)
噬菌体M13的生活周期有二个阶段,在噬菌体 粒子中其基因组为单链,侵入宿主细胞以后, 通过复制以双链形式存在。将待研究的基因 插入载体M13,制得单链模板,人工合成一 段寡核苷酸(其中含一个或几个非配对碱基) 作为引物,合成相应的互补链,用T4连接酶 连接成闭环双链分子。经转染大肠杆菌,双 链分子在胞内分别复制,因此就得到两种类 型的噬菌斑,含错配碱基的就为突变型。
重组PCR定点诱变2
操作:设计引物,分别PCR, 从两个PCR反 应管中各取出3μl PCR反应产物,混匀后用 CaCl2转化法转化至感受态大肠杆菌中。涂 平板后,从转化的细菌菌落中随机挑选若干,筛 选。
定点突变和饱和突变
定点突变和饱和突变是两种常用的蛋白质工程技术,它们都可以改变目标基因的序列,从而影响蛋白质的结构和功能。
但是,这两种技术也有很大的不同,主要体现在以下几个方面:突变的范围定点突变是指在目标基因的特定位点上,引入预先设计好的碱基替换、插入或缺失,从而产生特定的氨基酸替换、添加或删除的突变体。
定点突变的目的是根据已有的关于蛋白质结构、功能、催化机理等信息,有目的地改变蛋白质性能或特异性。
饱和突变是指在目标基因的某一位点或某几个位点上,将原来的碱基替换成所有可能的其他碱基,从而产生所有可能的氨基酸替换的突变体。
饱和突变的目的是探索蛋白质功能和结构之间的关系,以及寻找具有改善或新颖性能的蛋白质突变体。
因此,定点突变是一种有选择性的突变技术,它只改变目标基因中感兴趣的部分;而饱和突变是一种无选择性的突变技术,它改变目标基因中所有可能的部分。
突变的方法定点突变通常采用PCR方法来实现,即利用合成的含有突变碱基的引物来扩增目标基因片段,并将其克隆到载体中。
这种方法虽然能够在特定位点引入特定碱基突变,但一次只能引入一种突变碱基,若进行饱和突变需要合成多条突变引物。
这样做既费时又费力,而且容易出错。
饱和突变则采用其他更高效和简便的方法来实现,比如使用简并密码子、随机引物、DNA重组等技术。
简并密码子是指可以编码多种氨基酸的密码子,比如NNK或NNS(N表示任意碱基,K表示G或T,S表示G或C),它们可以编码20种氨基酸中的19种(除了色氨酸)。
随机引物是指含有随机碱基序列的引物,它们可以产生各种不同组合的密码子。
DNA重组是指利用限制性内切酶、连接酶等酶来切割和连接不同来源或不同位置的DNA片段,从而产生新型DNA序列。
这些方法都可以在目标基因上产生大量不同类型和位置的突变,并且操作简单快速。
突变的效果定点突变和饱和突变对蛋白质性能和稳定性的影响也不尽相同。
定点突变通常是根据已知信息进行设计和预测的,因此它们往往能够达到预期的效果,比如增强或减弱蛋白质活性、改善或降低蛋白质亲和力、增加或减少蛋白质稳定性等。
基因定点突变
基因定点突变一、定点突变的目的把目的基因上面的一个碱基换成另外一个碱基。
二、定点突变的原理通过设计引物,并利用PCR将模板扩增出来,然后去掉模板,剩下来的就是我们的PCR 产物,在PCR产物上就已经把这个点变过来了,然后再转化,筛选阳性克隆,再测序确定就行了。
三、引物设计原则引物设计的一般原则不再重复。
突变引物设计的特殊原则:(1)通常引物长度为25~45 bp,我们建议引物长度为30~35 bp。
一般都是以要突变的碱基为中心,加上两边的一段序列,两边长度至少为11-12 bp。
若两边引物太短了,很可能会造成突变实验失败,因为引物至少要11-12个bp才能与模板搭上,而这种突变PCR要求两边都能与引物搭上,所以两边最好各设至少12个bp,并且合成多一条反向互补的引物。
(2)如果设定的引物长度为30 bp,接下来需要计算引物的Tm值,看是否达到78℃(GC含量应大于40%)。
(3)如果Tm值低于78℃,则适当改变引物的长度以使其Tm值达到78℃(GC含量应大于40%)。
(4)设计上下游引物时确保突变点在引物的中央位置。
(5)最好使用经过纯化的引物。
Tm值计算公式:Tm=0.41×(% of GC)–675/L+81.5注:L:引物碱基数;% of GC:引物GC含量。
四、引物设计实例以G CG→A CG为例:5’-CCTCCTTCAGTATGTAG G CGACTTACTTATTGCGG-3’(1)首先设计30 bp长的上下游引物,并将A (T)设计在引物的中央位置。
Primer #1: 5’-CCTTCAGTATGTAG A CGACTTACTTATTGC-3’Primer #2: 5’-GCAATAAGTAAGTCG T CTACATACTGAAGG-3’(2)引物GC含量为40%,L为30,将这两个数值带入Tm值计算公式,得到其Tm=75.5(Tm=0.41×40-675/30+81.5)。
