文献检索：PubMed
Pubmed文献检索
PubMed的特点
• 自动词语匹配 • 链接点多，部分在网上免费获得全文 • 也可以直接定购原文
二、检索规则
（一）Automatic Term Mapping 词汇自动转换
1、 直接输入关键词 MeSH Translation table 例如：Vitamin c 转换为
“ascorbic acid”[Mesh Terms] OR vitamin c[Text Word]
（二）短语检索
• 如果在短语上加双引号，将不执行转换功能 例如： “single cell” “oxygen free radicals”
（三）布尔逻辑运算：
• AND、OR、NOT必须大写。
E-coli AND hamburger；vitamin c OR zinc； trace element NOT zinc
• 例：输入bacter*，检出bacteria、bacterium等 备注：将不执行转换功能； 截词检索只限于单词，对词组无效，
三、检索途径与方法
• • • • 基本检索 - Basic Search 高级检索 - Advanced Search 限定检索 - Limits Search 期刊检索 – Journal Search
J Hand Surg[Am]输入格式为J Hand Surg Am
高级检索
点击
高级检索界面
检 索 历 史 预 览 检索
清 空
检索字段选择与检索 词填写
增加检索字段
高级检索界面下半部分
点击
限定检索
点击
与 高 级 检 索 下 半 部 分 类 似
限定检索下半部分
最后点击
检索“近2年有关细胞凋亡的综述文献”
pubmed文献检索方法
pubmed文献检索方法摘要：一、PubMed简介二、文献检索方法1.基本检索2.高级检索3.检索策略三、检索实例四、检索技巧1.关键词选择2.运用布尔操作符3.限制检索范围五、文献管理与分析工具六、总结与建议正文：一、PubMed简介PubMed是由美国国立卫生研究院（NIH）开发和维护的一个免费生物医学文献数据库，包含了大量的生物医学、生命科学、化学等领域的研究文献。
它为广大科研工作者、医生和药师等提供了便捷的文献查询途径。
二、文献检索方法1.基本检索在PubMed首页，可以通过输入关键词或输入文献的题名、作者、出版年份等进行基本检索。
基本检索的结果会按照相关性排序。
2.高级检索点击检索框下方的“高级检索”按钮，可以进入高级检索界面。
高级检索允许用户对检索词、检索范围、文献类型等进行更详细的设定，从而提高检索的准确性。
3.检索策略在检索过程中，可以采用一些策略提高检索效果。
例如，使用截词符（*）进行词干检索，或将关键词用引号括起来进行精确检索。
三、检索实例以下是的一个检索实例：假设我们想查找关于“新冠病毒”（SARS-CoV-2）的研究文献，可以在检索框中输入“SARS-CoV-2”或“新冠病毒”，然后点击检索按钮。
检索结果会包括与新冠病毒相关的文章，如病毒基因序列、疫苗研究、治疗方法等。
四、检索技巧1.关键词选择选择合适的关键词是提高检索效果的关键。
可以通过查阅相关领域的专业词典、综述文章等，了解研究领域的主要术语和概念。
2.运用布尔操作符布尔操作符（AND、OR、NOT）在检索过程中起到筛选和组合检索词的作用。
例如，输入“新冠病毒AND 疫苗”，可以检索到同时涉及新冠病毒和疫苗的文章。
3.限制检索范围在检索过程中，可以通过设置文献类型、发表年份、语言等限制条件，缩小检索范围，提高检索的针对性。
五、文献管理与分析工具PubMed提供了多种文献管理与分析工具，如引文导出、文献收藏、文献标签等。
PubMed检索方法
只对主题词进行加权检索
题录检索、期刊检索
题录检索
期刊检索
基本检索规则
作者姓名[字段标识符 ] Just[au]
刊名[字段标识符] science[ta]
截词检索 注意：检索词自动转换匹配功能关闭
词组检索 注意：检索词自动转换匹配功能关闭
检索式:common cold AND (vitamin c OR zinc)
禁用词表
注册
二、循证医学文献的查找
1.临床查询（Clinical Queries）
(1)Clinical Study Categories（临床研究类文献） (2)Systematic Reviews（系统评价） (3)Medical Genetics（医学遗传学）
2.MeSH: MeSH
Clinical Queries
5.Clinical Trials()
三、临床案例
一、PubMed概述
1.简介
PubMed是生物医学领域最重要和权威的数据库之一， 由美国国立医学图书馆(National Library of Medicine, NLM)下属美国生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information, NCBI)研制开发，可通过网络 免费访问()。
1113篇
Clinical Queries：
Therapy/Narrow[filter] AND (("stroke"[MeSH Terms] OR "stroke"[All Fields] OR
("cerebrovascular"[All Fields] AND "accident"[All Fields]) OR "cerebrovascular
医学文献检索(PubMed)
检索方法
基本检索 (search)：主界面默认的检索方法
自动词语匹配 （Automatic Terms Mapping） 精确检索 截词检索 字段限定检索 著者检索 期刊检索 逻辑组配检索
Part 2 检索方法 基本检索-自动语言匹配
对输入的有实际意义的检索词、短语，系统会自动进行词语 的匹配转换，并返回检索结果。 匹配原理 输入的检索词、短语依次在多个词表（MeSH转 换表、刊名转换表、著者转换表、著者索引表、合作者转换 表及合作者索引表）中进行搜索、比对，并自动转换为相应 的MeSH词、刊名或著者，再将短语、构成短语的单词分别 在所有字段中检索，输出检索结果。
美国医学文献数据库 PubMed
主要内容
Part 1 Part 2 Part 3 Part 4
了解 PubMed 检索方法
检索结果的解读与处理 同类推荐
Part 1
了解PubMed
P美国国立医学图书馆 NCBI 美国国立生物技术信息中心
检索出篇名中出现 糖尿病的综述文献
Part 2 检索方法 基本检索-著者检索
在检索框中输入著者姓名时，通过“自动词语匹配”，系统 会自动执行著者检索。
检索2002年前的论文时要求姓前名后，姓用全称，名用首字母缩写。 2002年以后的论文还可用姓和名的全称检索，且前后顺序不限。
使用著者字段进行限定检索可实现特殊的检索要求。如检索 某著者作为第一作者或排名最后的作者发表的论文时，即可 用字段限定检索来实现。
临床试验(Clinical Trials) 点击Clinical Trials进入Clinical 页面， 可检索来自全球178个国家的12万个实验信息。
临床查询(Clinical Queries) 专为医生设计的检索服务，输入疾病名称后， 可选择查询临床研究分类（Clinical Study Categories）、系统评价 （Systematic Reviews）和医学遗传学（Medical Genetics）三大类文献， 仍可再细分。
文献检索 第四课 Pubmed
温州医科大学图书馆
林薇
Contents
初识PubMed PubMed基本检索 PubMed高级检索 PubMed主题词检索 PubMed期刊检索 PubMed检索结果处理
初识 PubMed
标引质量高
更新速度快 使用方便
信息量大
选择PubMed的n个理由
/pubmed
Pubmed基本检索
一、Pubmed检索系统
（三）Pubmed基本检索 基本检索
Pubmed基本检索
一、 Pubmed的检索规则
1.
逻辑运算符: AND OR NOT
AND diabetes therapy NOT nifedipine
将检索出同时包含阿司匹林和糖尿病两个检索词的文献。
/美国国立卫生研究院
/美国国立医学图书馆
/国家生物技术信息中心
Entrez资源整合系统
NCBI资源整合系统，基于Web界面的综合生物信 息数据库，可实现跨库检索，包括
GenBank和Nucletide (2) Genoma (3) OMIM (4) Protein (5) Structure (6) Pubmed (7) PMC
(1)
初识Pubmed
一、Pubmed检索系统
（一）Pubmed收藏范围：
(1)
（P46）
Medline:标注为[Pubmed-indexed for Medline] (2) OldMedline:标注为[Pubmed-OldMedline] (3) In Progress Citations:标注为[Pubmed-in Process] (4) Publisher Supplied Citation:标注为[Pubmed-as supplied by Publisher]
pubmed(文献检索)
自动扩展检索 系统自动对主题词、副主题词进行扩展检 索 输入 “hypertension therapy（高血压治 疗）,系统自动检索高血压的药物治疗、饮 食疗法
2.著者检索(authors)：
著者姓名,姓在前,名首字母在后 限定加字段符 如: genbacev o[AU] smith ab [AU]
运算符
字段限定符：[] （教材86页） 例如：Stem [ti] AND neuroscience 截词符：”*”作为通配符进行截词检索。(教材89页) 例如：bacter * （系统会找到前一部分是bacter的单词， 如： bacteria、bacterium等） 强迫短语符：用双引号来强制系统进行短语检索。（教 材89页） 例如： “oxygen free radicals” （不再自动转换匹配和 扩 展检索）
PMC（Pubmed Center）
生命科学期刊资源中心（教材105页） 免费提供近200种期刊的10多万篇全文（不 包括PubMed动态免费全文）
PubChem
PubChem是免费的公共化合物结构信息网 络数据库，提供小分子生物活性的有关信 息，与化学密切相关。PubChem由 NCBI’s Entrez信息检索系统内三个相互链 接的数据库组成的，包括PubChem Substance、PubChem ComPound和 PubChem BioAssay。
检索限定：字段限制：著者、刊名、篇名、 滤过（filter原文收藏处）等 数据输入时间：默认检索可回溯到1950年， 限制选择30天-10年 文献类型限制 语种限制 子文档
Mesh主题词表
pubmed检索综述
pubmed检索综述PubMed是生命科学和医学领域的一种重要文献检索工具，被广泛用于学术研究、医学实践和科学进展。
本文将深入探讨如何在PubMed上进行综述检索，以帮助研究人员更有效地获取相关文献，了解领域的最新动态。
1. PubMed简介在讨论综述检索之前，我们首先要了解PubMed的基本情况。
1.1 PubMed的来源PubMed是由美国国立医学图书馆（NLM）提供的免费文献数据库，涵盖了生物医学、生命科学和相关领域的大量文献。
1.2 PubMed的特点PubMed具有广泛的学科覆盖范围，包括医学、生物学、生物化学、药学等，是医学和生命科学领域研究者获取信息的重要工具。
2. 关键词的选择与构建在进行PubMed检索时，选择和构建合适的关键词是获取准确结果的关键。
2.1 主题词与自由词利用PubMed的主题词（MeSH词）和自由词进行关键词选择，以确保检索结果的广泛性和准确性。
2.2 同义词与扩展词考虑使用相关的同义词和扩展词，以涵盖不同表达方式的文献，提高检索的全面性。
2.3 关键词的组合合理组合关键词，使用AND、OR、NOT等逻辑运算符，构建复杂而精确的检索式，以确保检索结果符合研究目的。
3. 高级检索与筛选PubMed提供了丰富的高级检索和筛选功能，帮助研究者更精准地定位所需文献。
3.1 时间范围的设定通过设定检索时间范围，可以获取最新的研究成果，同时限制检索结果的数量。
3.2 文献类型的筛选在高级检索中，可以选择特定的文献类型，如综述、临床研究、病例报告等，以便更有针对性地获取信息。
3.3 作者、期刊和机构的限定通过指定作者、期刊或机构，可以进一步缩小检索结果的范围，确保文献的质量和相关性。
4. 利用PubMed工具优化检索PubMed提供了多种工具和功能，帮助用户更方便、更快速地进行文献检索。
4.1 My NCBI账户的建立通过建立My NCBI账户，用户可以保存检索历史、创建自定义检索、设置提醒等，提高检索的效率和个性化。
pubmed高级检索方法
pubmed高级检索方法一、pubmed高级检索基础1.1 首先呢，pubmed是个超棒的医学文献宝库。
它的高级检索功能就像一把神奇的钥匙，能让你更精准地找到你想要的东西。
咱别小看这个功能，它就像一个隐藏的宝藏地图，要是会用，那可真是如鱼得水。
1.2 你得知道，pubmed高级检索界面有很多选项。
就好比一个大超市，每个货架都有不同的东西。
这里的选项就是那些货架，你得清楚每个货架放的是啥，才能快速找到你需要的“商品”，也就是文献啦。
二、检索字段的运用2.1 比如说作者字段。
这就像找人一样，你知道作者是谁，那就直接在作者字段里输入作者的名字。
这就好比你在人群里找一个熟人，直接喊他名字就好啦。
不过有时候作者名字可能有多种写法，你得像个侦探一样，把可能的写法都试试，可不能一根筋。
2.2 还有标题字段。
如果一个文献的标题里有你想要的关键词，那在标题字段检索就像瓮中捉鳖一样容易。
标题可是文献的招牌，往往包含了核心内容。
你要是想找关于某种疾病特定治疗方法的文献，在标题里搜这个治疗方法的名字，很可能就一击即中。
2.3 期刊字段也不能忽视。
你要是对某个期刊特别感兴趣，或者知道你要找的文献大概率发表在某个期刊上，那就在期刊字段里输入期刊名。
这就像你知道一个人住在某个小区，直接去那个小区找他就对了，省得满世界乱找。
三、布尔逻辑运算符的使用3.1 AND这个运算符啊，就像是交朋友里的“志同道合”。
你输入两个关键词，中间用AND连接，那搜索出来的文献就是同时包含这两个关键词的。
比如说你搜“糖尿病 AND 胰岛素”，那找出来的文献就是既和糖尿病有关，又提到胰岛素的，这样就把范围缩小得很精准了。
3.2 OR这个运算符呢，有点像广撒网。
当你输入两个关键词，中间用OR连接，搜索出来的文献只要包含其中一个关键词就会被显示。
比如“感冒 OR 流感”，那只要是关于感冒或者流感的文献都会出来。
这在你不确定具体用词或者想扩大搜索范围的时候很有用，就像你想找水果，苹果或者香蕉都可以满足你吃水果的愿望，这里的苹果和香蕉就相当于不同的关键词啦。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性，平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。
医学文献检索 医学文献检索
基本检索—逻辑组配检索
基本检索界面支持布尔逻辑运算组配检索，运算符为AND、
OR、NOT，大小写不限。
同时输入多个检索词，系统默认检索词之间是逻辑AND关系。 当检索式中存在多种逻辑关系时，先运算AND，再按从左到
右的顺序运算，加括号可改变运算的优先顺序。如：输入逻 辑检索式cancer and liver or lung or stomach和输入lung or
自动词语匹配 强制检索结果 的结果
实际执行的检索式 实际执行的检索式
13
医学文献检索 医学文献检索
基本检索—截词检索
使用无限通配符“*”，可实现截词检索。 PubMed会关闭自动词语匹配功能，在所有字段中执行检索。 各检索词间为逻辑OR关系。
在所有字段检索前缀为 acupunctur的检索词
批量引文匹配器(Batch Citation Matcher) 按指定格式将需要查找的记录信 息输入到下方的文本框中，检索结果可通过邮件发送或直接保存到文件中。
临床试验(Clinical Trials) 点击Clinical Trials进入Clinical 页面，可 检索来自全球178个国家的12万个实验信息。 临床查询(Clinical Queries) 专为医生设计的检索服务，输入疾病名称后，可 选择查询临床研究分类（Clinical Study Categories）、系统评价（Systematic Reviews）和医学遗传学（Medical Genetics）三大类文献，仍可再细分。 特定专题查询(Topic-Special Queries) 整合了 PubMed提供的其他专题检索功 能，包括对临床医生和健康服务人员查询、对不同学科子集及不同的期刊子 集的查询。
主题词对同一概念的不同表达方式进行了规范。
系统默认对主题词进行扩展检索（Explode），即同时检索该
主题词的下位主题词。
采用主题词检索能保证较好的查准率
可与专指的副主题词组配，限定检索主题词某方面的文献。
可将主题词限定为主要主题词（MAJR），从而使检索结果更准确。
28
医学文献检索 医学文献检索
使用著者字段进行限定检索可实现特殊的检索要求。如检索
某著者作为第一作者或排名最后的作者发表的论文时，即可 用字段限定检索来实现。
输入Huang w[1AU]，可检索出Huang w作为第一作者发表的文献； 输入Huang w[LASTAU]，可检索出Huang w作为排名最后的作者发
表的文献。
PubMed
医学文献检索
PubMed
PubMed（/pubmed/）是
由美国国立医学图书馆（NLM）下属的国家生物 技术信息中心（NCBI）研制开发的文摘型数据库。
收录1946年至今来自80多个国家60多个语种的生物
医学文献，最早可追溯至1848年，至2012年2月底 记录总量已超过2155万条。
主题词检索—注意事项
单独采用主题词检索可能会造成漏检，实际检索时应
结合其他检索方法。PubMed系统中只有MEDLINE数
据库中的记录进行了主题词标引，所以主题词检索只 对MEDLINE中的记录有效，而PubMed中其他来源的 记录不支持主题词检索。
主题词检索时需注意主题词的收录时间。如上例中
“stroke”是2000年收录为主题词的，故检索结果均是
2000年以后发表的文献，检索2000年之前的文献要结
合其他主题词或结合基本检索。
29
医学文献检索 医学文献检索
期刊检索—界面
可输入主题、刊名全称或缩写、ISSN
30
医学文献检索 医学文献检索
其他检索功能
单篇引文匹配器(Single Citation Matcher) 可通过输入已知的作者、期刊名 称(全称或标准缩写)、出版年月日、卷、期、起始页码或篇名中的任意词准 确查找到所需的单篇文献。
具有收录范围广、数据更新快、覆盖内容全、检索
途径多、检索方式灵活、检索体系完备、链接功能 强大及使用免费等特点。
2
医学文献检索 医学文献检索
PubMed
历史沿革
1879年《Index Medicus》（简称IM）创刊。
1960年起 IM由NLM编辑出版。
1964年 NLM开发了MEDLARS实现了IM的自动化编辑。 1971年 NLM建成MEDLINE（MEDLARS online）联机
精确检索
截词检索 字段限定检索 著者检索 期刊检索 逻辑组配检索
9
医学文献检索 医学文献检索
基本检索—自动词语匹配
对输入的有实际意义的检索词、短语，系统会自动进行
词语的匹配转换，并返回检索结果。
匹配原理 输入的检索词、短语依次在多个词表（MeSH
转换表、刊名转换表、著者转换表、著者索引表、合作 者转换表及合作者索引表）中进行搜索、比对，并自动 转换为相应的MeSH词、刊名或著者，再将短语、构成 短语的单词分别在所有字段中检索，输出检索结果。
含义 第一著者的单位、地址 可供检索的所有字段 著者 第一著者 主要主题词 副主题词 主题词 化学物质名称 药理作用
检索字段 PT SB FAU LASTAU TI TIAB VI IP PG
含义 文献类型 子集 著者全名 排名最后的著者 题名 题名/摘要 期刊卷号 期刊的期号 文献起始页码
7
医学文献检索 医学文献检索
基本检索 (search) 高级检索(Advanced search) 限定检索 (Limits) 主题检索 (MeSH Database) 期刊检索 (Journals Database) 其他检索功能
8
医学文献检索 医学文献检索
基本检索 (search)：主界面默认的检索方法
自动词语匹配 （Automatic Terms Mapping）
4
医学文献检索 医学文献检索
检索方法
主界面 常用检索途径 检索方法 检索结果显示和输出 检索实例
5
医学文献检索 医学文献检索
数据库选择
检索方式、帮助 检索输入框 检索、清除
检索区
主题检索 期刊检索
PubMed 功能服务区
6
NCBI 功能服务区 医学文献检索 医学文献检索
检索字段 AD ALL AU 1AU MAJR SH MH NM PA
16
医学文献检索 医学文献检索
基本检索—期刊检索
在检索框中输入刊名全称、标准的MEDLINE刊名
缩写或期刊的ISSN时，通过“自动词语匹配”，系 统会自动检索出该刊被PubMed收录的文献。
当刊名与MeSH词相同时，如Blood、Cell、Cancer
等，采用刊名字段限定检索，可避免自动词语匹配 造成的误检。如输入Blood[TA]，即可检索出期刊 Blood被PubMed收录的所有文献。
14
医学文献检索 医学文献检索
基本检索—字段限定检索
在检索词后输入检索字段标识可进行字段限定检索，以提高查准率。 输入格式为：检索词[字段标识]。如检索标题中含Diabetes（糖尿病）
的论文，可输入Diabetes [TI]；要检索综述文献可输入Review[PT]。
字段限定检索时，系统关闭自动词语匹配功能，只在限定的字段检索
10
医学文献检索 医学文献检索
基本检索—自动词语匹配
检索词
MeSH转换表(主题词、副主题词) 刊名转换表(全称、缩写、ISSN) 著者转换表(著者全名) 著者索引表(著者缩写) 合作者转换表(合作者全名) 合作者索引表(合作者缩写)
转换为相应的MeSH词、刊名或著者，再将检索词在所有字段中检索，输 出检索结果。
输入的检索词。
检索出篇名中出现 糖尿病的综述文献
15
医学文献检索 医学文献检索
基本检索—著者检索
在检索框中输入著者姓名时，通过“自动词语匹配”，系统
会自动执行著者检索。
检索2002年前的论文时要求姓前名后，姓用全称，名用首字母缩写。
2002以后的论文还可用姓和名的全称检索，且前后顺序不限。
数据库。
1983年 MEDLINE光盘版（MEDLINE on CD）发行。
1997年 NLM下属的NCBI开发了网络版MEDLINE，即
PubMed检索系统。
3
医学文献检索 医学文献检索
PubMed
MEDLINE 收录1946年至今出版的80多个国家39个语种的5600多种生物医
学期刊的文摘及题录数据，总数达1944多万条。每条记录都进行主题词、 特征词等规范化标引，记录末尾标有[PubMed-indexed for MEDLINE] 。 OldMEDLINE 存放1965年以前出版的、未进行标引的数据，这些记录中 没有MeSH字段和摘要字段，末尾标有[PubMed-OLDMEDLINE] PreMEDLINE 临时存放尚未标引MeSH主题词、文献类型的最新数据，待 数据完成标引后再转入MEDLINE，记录末尾标有[PubMed-in Process]。 Publisher-Supplied Citations 出版商提供的未被MEDLINE收录的非生物医 学专业的文献，记录末尾标有[PubMed - as supplied by publisher]。 NOTEDLINE NIH资助的研究人员的手稿、向PubMedCentral提交全文的 生命科学期刊论文、及接受NLM评审的文献，这些记录均不被MEDLINE 收录，末尾标注为[PubMed]。 注意：许多出版商通过电子期刊平台发布最新的文献信息，这些先于印刷 版期刊发表的电子期刊文献加标[Epub ahead of print]标识。
1 4
5
20
3
6