PubMed文献检索
cbm与pubmed的检索式
CBM（我国生物医学文献服务系统）和PubMed（美国国立医学图书馆）是两个常用的医学文献检索工具，它们分别服务于国内医学科研和国际医学科研领域。
在医学研究中，科研人员经常需要使用这两个检索工具来查找相关文献，以支撑自己的研究工作。
本文将就CBM和PubMed的检索式进行一定程度的比较与展示，以便读者更好地了解两者的特点和使用方法。
1. 检索式的含义CBM的检索式是指在CBM数据库上进行文献检索时使用的关键词组合的格式表达方式。
通过输入检索式，用户可以快速、准确地找到所需的文献信息。
CBM数据库具有丰富的中文医学文献资源，其检索式一般由若干个关键词组成，以逻辑运算符（如AND、OR、NOT）连接。
PubMed的检索式也是指在PubMed数据库上进行文献检索时使用的关键词组合的格式表达方式。
PubMed数据库覆盖了全球范围内的医学文献资源，其检索式通常由英文关键词组成，同样可以通过逻辑运算符连接来实现多个关键词的组合检索。
2. 检索式的构建在CBM数据库中，用户可以根据自己的研究需求构建相应的检索式。
一般来说，可以使用中文关键词进行检索，也可以使用中英文混合的关键词进行检索。
CBM还提供了预设的主题词和分类号来辅助用户构建检索式，让用户能够更加准确地定位到所需的文献信息。
在PubMed数据库中，用户可以使用英文关键词进行检索，同样也可以通过逻辑运算符来构建检索式。
PubMed还提供了MeSH术语（医学主题词）等辅助工具，帮助用户更精准地构建检索式、查找文献。
3. 检索式的优化CBM数据库对检索式的长度和复杂程度没有特别的限制，用户可以根据自己的需求和研究主题来构建相应的检索式。
但是，为了提高检索效果，用户需要不断优化检索式，尽量减少检索式中的冗余信息，以保证检索结果的准确性和全面性。
在PubMed数据库中，用户同样需要不断优化检索式，以提高检索效果。
尤其是针对复杂的研究主题，需要更加精准地构建检索式，利用MeSH术语等资源来帮助优化检索式，缩小检索范围，找到所需的文献。
Pubmed文献检索
PubMed的特点
• 自动词语匹配 • 链接点多，部分在网上免费获得全文 • 也可以直接定购原文
二、检索规则
（一）Automatic Term Mapping 词汇自动转换
1、 直接输入关键词 MeSH Translation table 例如：Vitamin c 转换为
“ascorbic acid”[Mesh Terms] OR vitamin c[Text Word]
（二）短语检索
• 如果在短语上加双引号，将不执行转换功能 例如： “single cell” “oxygen free radicals”
（三）布尔逻辑运算：
• AND、OR、NOT必须大写。
E-coli AND hamburger；vitamin c OR zinc； trace element NOT zinc
• 例：输入bacter*，检出bacteria、bacterium等 备注：将不执行转换功能； 截词检索只限于单词，对词组无效，
三、检索途径与方法
• • • • 基本检索 - Basic Search 高级检索 - Advanced Search 限定检索 - Limits Search 期刊检索 – Journal Search
J Hand Surg[Am]输入格式为J Hand Surg Am
高级检索
点击
高级检索界面
检 索 历 史 预 览 检索
清 空
检索字段选择与检索 词填写
增加检索字段
高级检索界面下半部分
点击
限定检索
点击
与 高 级 检 索 下 半 部 分 类 似
限定检索下半部分
最后点击
检索“近2年有关细胞凋亡的综述文献”
pubmed(文献检索)
自动扩展检索 系统自动对主题词、副主题词进行扩展检 索 输入 “hypertension therapy（高血压治 疗）,系统自动检索高血压的药物治疗、饮 食疗法
2.著者检索(authors)：
著者姓名,姓在前,名首字母在后 限定加字段符 如: genbacev o[AU] smith ab [AU]
运算符
字段限定符：[] （教材86页） 例如：Stem [ti] AND neuroscience 截词符：”*”作为通配符进行截词检索。(教材89页) 例如：bacter * （系统会找到前一部分是bacter的单词， 如： bacteria、bacterium等） 强迫短语符：用双引号来强制系统进行短语检索。（教 材89页） 例如： “oxygen free radicals” （不再自动转换匹配和 扩 展检索）
PMC（Pubmed Center）
生命科学期刊资源中心（教材105页） 免费提供近200种期刊的10多万篇全文（不 包括PubMed动态免费全文）
PubChem
PubChem是免费的公共化合物结构信息网 络数据库，提供小分子生物活性的有关信 息，与化学密切相关。PubChem由 NCBI’s Entrez信息检索系统内三个相互链 接的数据库组成的，包括PubChem Substance、PubChem ComPound和 PubChem BioAssay。
检索限定：字段限制：著者、刊名、篇名、 滤过（filter原文收藏处）等 数据输入时间：默认检索可回溯到1950年， 限制选择30天-10年 文献类型限制 语种限制 子文档
Mesh主题词表
pubmed 文献调研 组合检索
pubmed 文献调研组合检索Pubmed是一个由美国国立卫生研究院（NIH）开发的生物医学文献数据库，收录了全球范围内的生物医学文献，包括医学、生物学、生物化学、生理学、药学等领域的文献。
在进行文献调研时，组合检索是一种常用的方法，可以帮助我们更快速、准确地找到所需的文献。
组合检索是指将多个关键词或者检索词组合在一起进行检索，以缩小检索结果的范围，提高检索的准确性。
在使用Pubmed进行文献检索时，我们可以使用以下几种组合检索的方法：1. AND检索：将多个关键词用AND连接起来，表示同时包含这些关键词的文献。
例如，我们想要查找关于“心脏病”和“高血压”的文献，可以使用“heart disease AND hypertension”进行检索。
2. OR检索：将多个关键词用OR连接起来，表示包含其中任意一个关键词的文献。
例如，我们想要查找关于“心脏病”或“高血压”的文献，可以使用“heart disease OR hypertension”进行检索。
3. NOT检索：将一个关键词用NOT连接起来，表示不包含该关键词的文献。
例如，我们想要查找关于“心脏病”的文献，但是不想包含“高血压”的文献，可以使用“heart disease NOT hypertension”进行检索。
4. 括号检索：使用括号可以改变检索词的优先级，使得检索结果更加准确。
例如，我们想要查找关于“心脏病”和（“高血压”或“糖尿病”）的文献，可以使用“heart disease AND (hypertension OR diabetes)”进行检索。
除了以上几种组合检索的方法，我们还可以使用通配符、引号、限定词等方式进行检索，以更加精确地找到所需的文献。
在使用Pubmed进行文献检索时，我们需要注意以下几点：1. 关键词的选择：选择合适的关键词可以帮助我们更快速地找到所需的文献。
关键词应该具有代表性、准确性和广泛性。
2. 检索词的组合：合理地组合检索词可以缩小检索结果的范围，提高检索的准确性。
pubmed高级检索检索式
pubmed高级检索检索式
PubMed 高级检索检索式是一种用于检索 PubMed 数据库的检索工具，它允许用户通过组合多个检索条件来筛选符合条件的文献。
下面是一些常见的 PubMed 高级检索检索式:
- 作者检索式：使用 Author Search 功能，输入作者的名字、缩写或电子邮件地址，即可检索与该作者相关的文献。
- 期刊检索式：使用 Journal Search 功能，输入期刊的名称、缩写或出版商，即可检索在该期刊上发布的文献。
- 关键词检索式：使用 Subject Search 功能，输入与主题相关的关键词，即可检索与该主题相关的文献。
- 年代检索式：使用 Date Search 功能，输入日期范围，即可检索在该日期范围内发布的文献。
- 机构检索式：使用 Organization Search 功能，输入机构名称、缩写或电子邮件地址，即可检索在该机构发布的文献。
- 引用检索式：使用 References Search 功能，输入文献标题、作者、缩写或出版商，即可检索该文献被引用的文献。
需要注意的是，PubMed 高级检索检索式的具体使用方法和检索条件可能会因数据库的更新而有所不同，用户在使用检索式时需要根据实际情况进行选择和调整。
pubmed检索综述
pubmed检索综述PubMed是生命科学和医学领域的一种重要文献检索工具，被广泛用于学术研究、医学实践和科学进展。
本文将深入探讨如何在PubMed上进行综述检索，以帮助研究人员更有效地获取相关文献，了解领域的最新动态。
1. PubMed简介在讨论综述检索之前，我们首先要了解PubMed的基本情况。
1.1 PubMed的来源PubMed是由美国国立医学图书馆（NLM）提供的免费文献数据库，涵盖了生物医学、生命科学和相关领域的大量文献。
1.2 PubMed的特点PubMed具有广泛的学科覆盖范围，包括医学、生物学、生物化学、药学等，是医学和生命科学领域研究者获取信息的重要工具。
2. 关键词的选择与构建在进行PubMed检索时，选择和构建合适的关键词是获取准确结果的关键。
2.1 主题词与自由词利用PubMed的主题词（MeSH词）和自由词进行关键词选择，以确保检索结果的广泛性和准确性。
2.2 同义词与扩展词考虑使用相关的同义词和扩展词，以涵盖不同表达方式的文献，提高检索的全面性。
2.3 关键词的组合合理组合关键词，使用AND、OR、NOT等逻辑运算符，构建复杂而精确的检索式，以确保检索结果符合研究目的。
3. 高级检索与筛选PubMed提供了丰富的高级检索和筛选功能，帮助研究者更精准地定位所需文献。
3.1 时间范围的设定通过设定检索时间范围，可以获取最新的研究成果，同时限制检索结果的数量。
3.2 文献类型的筛选在高级检索中，可以选择特定的文献类型，如综述、临床研究、病例报告等，以便更有针对性地获取信息。
3.3 作者、期刊和机构的限定通过指定作者、期刊或机构，可以进一步缩小检索结果的范围，确保文献的质量和相关性。
4. 利用PubMed工具优化检索PubMed提供了多种工具和功能，帮助用户更方便、更快速地进行文献检索。
4.1 My NCBI账户的建立通过建立My NCBI账户，用户可以保存检索历史、创建自定义检索、设置提醒等，提高检索的效率和个性化。
pubmed检索英文文献的步骤
pubmed检索英文文献的步骤要进行PubMed检索英文文献，可以按照以下步骤进行：1. 访问PubMed网站，打开浏览器，输入"/pubmed"，进入PubMed网站的首页。
2. 定义研究主题，明确你感兴趣的研究主题，可以是某个特定的疾病、医学领域或者其他相关主题。
3. 使用关键词进行检索，在PubMed首页的搜索框中输入与你的研究主题相关的关键词。
关键词应该是具体而明确的，以便缩小搜索范围。
4. 高级搜索选项，如果你想进一步精确搜索结果，可以使用高级搜索选项。
点击搜索框旁边的"Advanced"按钮，可以在更多的搜索字段中输入关键词，如作者、期刊、出版日期等。
5. 筛选搜索结果，当你点击搜索按钮后，PubMed将会显示与你关键词相关的文献列表。
可以根据自己的需要使用筛选选项来缩小搜索结果的范围，如出版日期、文章类型、文献来源等。
6. 阅读摘要和全文，在搜索结果中，你可以点击文章标题或摘要以获取更多信息。
摘要通常提供了文章的简要概述，帮助你判断是否与你的研究主题相关。
有些文章可能提供免费全文，可以直接阅读，而有些文章可能需要付费或订阅才能获取全文。
7. 下载文献，如果你找到了感兴趣的文献，可以选择下载或保存文献的选项。
这样你就可以在离线状态下阅读或打印文献。
8. 引用和相关文献，在每篇文献的页面上，你可以找到该文献的引用和相关文献。
这些引用和相关文献可能对你的研究有帮助，可以进一步扩展你的文献检索范围。
9. 检索历史和搜索提醒，PubMed还提供了检索历史和搜索提醒的功能。
检索历史可以帮助你回顾之前的搜索记录，搜索提醒可以让你及时获取最新的相关文献。
总结起来，PubMed检索英文文献的步骤包括访问PubMed网站、定义研究主题、使用关键词进行检索、使用高级搜索选项、筛选搜索结果、阅读摘要和全文、下载文献、查找引用和相关文献，以及利用检索历史和搜索提醒功能。
如何使用pubmed进行 文献检索
一、PubMed简介
1983年：随着光盘技术的发展， MEDLINE光盘数据库建成，并得到了广 泛的应用。
1997年9月26日， MEDLINE网络版开通， 取名PubMed，并向全球免费开放。
一、PubMed简介
很多医务工作者宁可在每次检索时都 花上成倍的时间，却不愿花上几个小时去 认真研究一下PubMed。"君欲善其事，必先 利其器"，PubMed就好像一把功能强大的枪， 你决不能仅仅满足于知道扣动扳机就可以 发射子弹，更重要的是，你要知道如何利 用准星瞄准，如何把这把枪的功能发挥到 及至。
PubMed文献检索
天津医科大学图书馆 刘娟 libliujuan@
教学内容
一、PubMed简介 二、检索规则与常用检索技术 三、检索方式与途径 四、检索结果处理 五、注册 六、练习题
一、PubMed简介
1.PubMed基本情况 2.PubMed的由来 3.PubMed的特点 4.PubMed的数据收录范围 5.PubMed主页
回溯年代：1948年至今 每条记录标有[indexed for MEDLIEN]标记
MEDLINE数据库简介
学科范围：
基础生命科学 生物科学 组织学 心理学 农业 医技工业学
临床生命科学 解剖学 化学与药物 社会医学 医技设备学 医学信息学
使用词表：MeSH（医学主题词表）
4.2 PreMEDLINE
是一种由正在加工处理中的文献记录组成
的数据库，这些新记录还未被标引，暂时 存放在PreMEDLINE数据库中。每天更新， 经过标引（增加主题词、文献类型、数据 库存取号等字段）以后转入Medline，一旦 记录被转入到Medline数据库，就被从 PreMEDLINE数据库中删除。每条记录标
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检索方法的制定
• 了解检索系统的特征和功能，熟悉数据库的标引规则 、词表结构，掌握必要的检索技能和技巧，了解所检 课题的专业知识。
• 进行主题检索时，系统还会自动显示与该词相关的副主题词供 选择副主题词是对主题词的进一步限定，用来检索更为专指的 文献。M中共有82个副主题词，每个副主题词有特定的含义和 使用范围，分别与不同主题词组配，其个数因主题词的不同而 变化。
• 例如：胰腺癌的治疗 • 在用主题词进行检索时，副主题可自动跳出“drug therapy,
• 主题词：取自于主题词表、叙词表、分类词表等，是经过 规范化的。
• 自由词：取自于文献篇名、文摘、正文，是没有规范化的 自然语言。
• 选择合适的检索词，将检索词进行合理的组配，才能得到 满意的结果。
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自由词检索
• 自由词即我们通常所说的关键词，是未经规范化的术 语。在进行自由词检索时系统会将在任何字段中出现 的该单词自动检出，而文献内容不一定关于该主题。
• PubMed也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接， 来自第三方的生物学数据，序列中心的数据等等。
• PubMed提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务 ，这个数据库归NCBI所有，其内容包括：DNA与蛋白质 序列，基因图数据、3D蛋白构象，人类孟德尔遗传在线。
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PubMed
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检索域标签
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检索策略
• 从 PubMed的自由词检索、主题检索两种方式不难看 出，用Mesh Browser进行主题检索，准确、规范， 检索效率高。显然，主题检索是文献检索首选CLC
NbiSpCoLlaCr
NSCLC
„gemcitabine AND NSCLC‟ 1,607
„gemcitabine OR NSCLC‟ 30,744
„gemcitabine NOT NSCLC‟ 5,323
检索词
• 检索词：是检索要求中的基本单元 • 检索词可分为两种：主题词、自由词。
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谢谢！
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• 检索需求的概念分析要正确、全面，把待检课题的主 题内容转换成检索系统采用的检索标识和检索词，并 准备若干自由词备用。
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• 首选主题词检索，以提高检索效率
• 通过标引，主题词包含了它的同义词、近义词，用主题词检索， 保证了查全率；主题词可以与副主题词组配，对该主题词下的文 献进行进一步的限定，确保了查准率。
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PubMed — 文献检索
PubMed (/PubMed)
• PubMed 是由美国国立医学图书馆（NLM）的国家生物技 术信息中心（NCBI）开发的基于网络的检索系统。它是 NCBI的宏大的检索系统Entrez的一部分。
• PubMed 是提供免费的MEDLINE、PREMEDLINE与其他 相关数据库接入服务。
• 其次才选自由词；当没有合适的主题词时，也应考虑 用自由词检索。
• 要注意自由词的不同表达形式：近义词、同义词、缩写、全称等 ，以防漏检。
提高查全率的主要方法及存在问题
• 遗漏下位词，造成漏检 • 对副主题词的适用范围不够了解，造成漏检。 • 自由词检索时，未使用同义词，造成漏检
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diet therapy, surgery, therapy”你可以根据你需要选择相应的 副主题词来进行限定。
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Eli Lilly and Company
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• 文献量达1千1百万条记录，并回溯到1966年。
• [indexed for MEDLIEN]
文献标题
作者 期刊缩写
出版时间
卷/期 页码
无摘要
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• In process citation（PreMEDLINE） • 提供MEDLINE尚未经规范处理的数据。 • 获MeSH词后，再加入MEDLINE。 • 记录中[in process]的标记。语言
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辅助检索
• 辅助检索有以下几个功能键，即Limits、 Preview/Index、 History 、Clipboard 4个按钮，其 中以 Limits最为常用。
• 相当于高级检索，可对年龄、性别、人或动物、语种 、文献类型、出版年份、子集数据库的限定。
• 检索词的转换 • 在检索词方面，使用者所输入的检索词都将自动被转换对映至
MeSH，但系统会同时以MeSH及All Fields方式进行检索，例 如检索 vitamin h，系统将以Biotin[MeSH] OR “biotin”[All Fields] OR “vitamin h”[All Fields]进行检索。 • 如果需要找词条，可在词条间加入引号，如：“single cell ”。 • 在期刊名方面，使用者输入刊名全称、缩写或是ISSN号码时， 系统将对映至刊名检索，例如输入：new England journal of medicine，将被转换成"N Engl J Med"[Journal] OR "new england journal of medicine"[All Fields]
主题词检索(MeSH)
• 该检索方式能指引检索者实用规范的术语进行有效检索。每个 M词对应一个概念，即用主题词可检出同一主题的不同词形， 拼写，单复数和缩写。例：liver cancer 在进行主题词检索时 ，会将所有关于肿瘤的表达方式检出。“liver neoplasms, liver tumor , liver carcinoma‟
Eli Lilly and Company
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Eli Lilly and Company
相关文献
检索建议
标题符合
免费全文
Eli Lilly and Company
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检索策略
Eli Lilly and Company
Eli Lilly and Company
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免费全文
• Publisher Supplied Citations 出版商直接向PubMed提供电子记录 包括MEDLINE未收录的部分记录
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布尔逻辑运算符 - Boolean Operators
• AND OR NOT
gemcitabine
goelmanczitaapbininee
提高查准率的主要方法及问题
• 提高检索词的专指度，选专指度较强的规范词或自由 词。
• 增加AND连接，进一步限定主题概念。 • 把主题词限定在主要字段，如标题字段、主题词字段
等 • 缩短检索年限，或限定某些刊物。
Eli Lilly and Company
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• 切截 • 如英美文字的拼法或是词尾的变化而需要模糊查询时
，可使用*作为切截符号，如：flavor*，可找到以 flavor开头的字，如：flavored、flavorful……，最 多可显示150个以此字开头的资料。但是*是以单字词 为主要使用对象，如查询：infection*可以找到 infections，但无法找到 infection control。
• 数据类型：期刊论文、综述、以及与其他数据资 源链接。
• 特点： 1.免费提供题录和文摘 2.可与提供原文的网址链接
(部分免费获取） 3.提供检索词自动转换匹配 4.操作简便、快捷
数据收录
• MEDLINE
• 4300余种生物医学期刊，内容涉及医学、护理、牙 科、兽医、健康保健系统、前临床医学等学科。这些 期刊来源于美国和世界上70多个国家和地区。