定量逆转录聚合酶链反应

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逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)

逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)
3.设定 PCR 程序。在适当的温度参数下扩增 28-32 个循环。为了保证实验结果的可靠与准确,可在 PCR 扩增目的基因时,加入一对内参(如 G3PD)的特异性引物,同时扩增内参 DNA,作为对照;
4.电泳鉴定:行琼脂糖凝胶电泳,紫外灯下观察结果;
5.密度扫描、结果分析:采用凝胶图像分析系统,对电泳条带进行密度扫描。
实验方法 原理
• RT-PCR 技术
逆转录-聚合酶链反应 (Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)的原理是: 提取组织或细胞中的总 RNA,以其中的 mRNA 作为模板,采用 Oligo(dT)或随机引物利用逆转录酶 反转录成 cDNA。再以 cDNA 为模板进行 PCR 扩增,而获得目的基因或检测基因表达。
展开
1.在实验过程中要防止 RNA 的降解,保持 RNA 的完整性。在总 RNA 的提取过程中,注意避免 mRNA 的断裂;
2. 为了防止非特异性扩增,必须设阴性对照;
3.内参的设定:主要为了用于靶 RNA 的定量。常用的内参有 G3PD(甘油醛-3-磷酸脱氢酶)、β-Actin (β-肌动蛋白)等。其目的在于避免 RNA 定量误差、加样误差以及各 PCR 反应体系中扩增效率不均 一各孔间的温度差等所造成的误差;
注意事项 其他
轻轻混匀,离心。42℃孵育 2-5 min;
4.加入 SuperscriptⅡ1 μl ,在 42℃水浴中孵育 50 min;
5. 于 70℃加热 15 min 以终止反应;
6.将管插入冰中,加入 RNase H 1 μl ,37℃孵育 20 min,降解残留的 RNA。-20℃保存备用。
三、PCR
1.取 0.5 ml PCR 管,依次加入下列试剂:第一链 cDNA 2 μl;上游引物(10 pM)2 μl;下游 引物(10 pM)2 μl;dNTP(2 mM) 4 μl;10×PCR buffer 5 μl;Taq 酶(2 u/μl)1 μl;

检测miRNA方法

检测miRNA方法

检测miRNA方法
检测miRNA的方法主要有以下几种:
1. Northern blotting(北方印迹法):通过RNA电泳分离和迁移,然后使用探针结合miRNA进行检测。

2. qRT-PCR(实时定量逆转录聚合酶链反应):利用逆转录将miRNA转录为cDNA,然后使用PCR进行定量检测。

3. Microarray技术(芯片技术):将已知的miRNA探针固定在芯片上,通过杂交检测待测miRNA。

4. Next-generation sequencing(下一代测序):利用高通量测序技术,将小RNA转录本进行测序,然后通过比对和统计分析来确定miRNA的存在和表达水平。

5. 免疫细胞化学染色:利用抗体和荧光标记来检测miRNA的表达和定位。

6. 探针法:通过使用与目标miRNA互补的标记探针来检测miRNA。

这些方法各有优缺点,选择合适的方法需根据实验目的、预算、样本量等因素综合考虑。

逆转录聚合酶链式反应名词解释

逆转录聚合酶链式反应名词解释

逆转录聚合酶链式反应名词解释嘿,朋友!你知道逆转录聚合酶链式反应吗?这名字听起来是不是
特别高大上,让人有点摸不着头脑?其实啊,它就像是一个神奇的魔
法工具,能帮我们解开好多生物谜题呢!
比如说,我们想知道某个病毒在人体内到底有多活跃,或者研究一
种特殊基因在细胞里的表达情况,这时候逆转录聚合酶链式反应就派
上大用场啦!
它到底是咋工作的呢?简单来说,就是先把 RNA 逆转录成 DNA ,这就好比把一本外文的书翻译成我们熟悉的中文。

然后再通过聚合酶
链式反应,像复制工厂一样大量复制这些 DNA 。

这不就跟我们复印文
件一样,一下子就能得到好多好多的“副本”嘛!
想象一下,我们身体里的细胞就像一个巨大的城市,基因就是城市
里的居民。

逆转录聚合酶链式反应就像是一个超级侦探,能够精确地
找到我们想要了解的“居民”,然后把关于他们的信息大量地收集起来。

再比如说,科学家们研究癌症的时候,通过这个反应就能清楚地知
道哪些基因出了问题,从而找到治疗的办法。

这难道不神奇吗?
总之,逆转录聚合酶链式反应就是生物研究领域里的一把利剑,帮
助我们不断探索生命的奥秘!我觉得它真的太重要啦,你说呢?。

qpcr和rt pcr

qpcr和rt pcr

qpcr和rt pcrqPCR(quantitative polymerase chain reaction,定量聚合酶链式反应)和RT-qPCR (reverse transcription quantitative polymerase chain reaction,逆转录定量聚合酶链式反应)是分子生物学中常用的实验技术,用于检测和量化DNA或RNA的存在和表达水平。

qPCRqPCR是一种基于聚合酶链式反应的技术,它可以在短时间内扩增DNA序列并实现定量检测。

在qPCR中,首先通过特定引物和荧光探针选择性地扩增目标序列。

引物是短的DNA片段,它们与目标序列的两个末端完全匹配,起始和结束位点确定了扩增的目标片段。

荧光探针是带有荧光染料和荧光猝灭剂的标记物,它们可以与扩增产物结合,并且当发生扩增时,染料释放出的荧光信号可以被检测到。

为了进行定量检测,qPCR使用标准曲线法或比较阈值循环数(Ct value)法。

标准曲线法通过制备一系列已知浓度的标准品,然后使用这些标准品的Ct value绘制标准曲线。

接下来,测量样品的Ct value,并通过标准曲线确定目标序列的初始浓度。

比较阈值循环数法则是根据样品的Ct value与内部参照物(如内参基因)的Ct value进行比较,计算其相对表达水平。

qPCR广泛应用于生物医学研究和临床诊断中,例如检测某个基因在不同组织或病理状态下的表达水平,分析病毒或细菌感染的程度,以及评估药物的疗效等。

RT-qPCRRT-qPCR是在qPCR的基础上结合了逆转录反应(reverse transcription)的技术,用于检测和分析RNA的表达水平。

在RT-qPCR中,首先需要通过逆转录反应将RNA转录为互补的DNA(cDNA)。

逆转录反应使用逆转录酶将RNA作为模板合成互补的cDNA,逆转录过程中还需要引物,这些引物称为随机引物或特异性引物,用于引导逆转录酶的合成。

逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)

逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)

1. 随机六聚体引物:当特定 mRNA 由于含有使反转录酶终止的序列而难于拷贝其全长 序列时,可采用随机六聚体引物这一丌特异的引物来拷贝全长 mRNA。用此种方法时,体 系中所有 RNA 分子全部充当了 cDNA 第一链模板,PCR 引物在扩增过程中赋予所需要的 特异性。通常用此引物合成的 cDNA 中 96%来源于 rRNA。 2. Oligo(dT):是一种对 mRNA 特异的方法。因绝大多数真核细胞 mRNA 具有 3’端 Poly(A+)尾,此引物不其配对,仅 mRNA 可被转录。由于 Poly(A+)RNA 仅占总 RNA 的 1-4%,故此种引物合成的 cDNA 比随机六聚体作为引物和得到的 cDNA 在数量和复杂性 方面均要小。 3. 特异性引物:最特异的引发方法是用含目标 RNA 的互补序列的寡核苷酸作为引物, 若 PCR 反应用二种特异性引物,第一条链的合成可由不 mRNA 3’端最靠近的配对引物起 始。用此类引物仅产生所需要的 cDNA,导致更为特异的 PCR 扩增。 三、 试剂准备 1.RMA 提取试剂 2.第一链 cDNA 合成试剂盒 3.dNTPmix:含 dATP、dCTP、dGTP、dTTP 各 2mM 4.Taq DNA 聚合酶 四、操作步骤 1. 总 RNA 的提取:见相关内容。 2. cDNA 第一链的合成:目前试剂公司有多种 cDNA 第一链试剂盒出售,其原理基本相同, 但 操 作 步 骤 丌 一 。 现 以 GIBICOL 公 司 提 供 的 SuperScriptTM Preamplification System for First Strand cDNA Synthesis 试剂盒为例。
详细 实验方法
逆转录-聚合酶链反应实验方法 实验材料
组织或细胞样品 试剂、试剂盒

实时荧光定量逆转录一聚合酶链反应(RT

实时荧光定量逆转录一聚合酶链反应(RT

‎‎‎‎实时荧光定‎量逆转录一‎聚合酶链反‎应 (RT‎姜红涛‎姚秀林抚顺‎市疾病预防‎控制中心,‎辽宁抚顺1‎13006‎目的比‎较实时荧光‎定量逆转录‎-聚合酶链‎反应(RT‎-PCR)‎法与细胞培‎养法检测流‎行性感冒病‎毒的差异。

‎方法采用‎实时荧光定‎量RT-P‎C R及经典‎的狗肾传代‎细胞病毒分‎离2种方法‎,同时对流‎感监测点送‎检的80份‎疑似流感标‎本检测流感‎病毒。

‎结果‎细胞培养‎病毒分离的‎阳性数为2‎6份,实时‎荧光定量R‎T-PCR‎的阳性数为‎36份,χ‎2=8.1‎, P 0‎.005。

‎‎结论通过‎该实验,验‎证了实时荧‎光定量RT‎-PCR的‎确快速敏感‎,适用于实‎验室快速诊‎断。

教关键‎词实时荧‎光定量逆转‎录-聚合酶‎链反应;细‎胞培养法;‎流感病毒‎R4 A ‎1674-‎0742(‎2015)‎03(b)‎-0192‎-02 姜‎红涛(19‎65-),‎女,天津人‎,本科,主‎管检验师,‎主要从事病‎毒检验工作‎。

2017‎年出现的流‎感病毒H7‎N9经自然‎重配,致病‎迅速,易变‎异,给人们‎带来极度恐‎慌,引起W‎H O 的高‎度重视,从‎而使流感病‎毒病原学的‎准确快速诊‎断显得尤为‎重要。

该实‎验室在20‎17年1月‎采用整群抽‎样法对抚顺‎市流感监测‎哨点医院的‎80份疑似‎流感样标本‎进行了实时‎荧光定量逆‎转录-聚合‎酶链反应(‎R T-PC‎R)法与细‎胞培养法进‎行了检测流‎行性感冒病‎毒的方法比‎较,现报道‎如下。

1资‎料与方法‎ 1.1‎一般资料2‎017年1‎月在抚顺市‎国家级流感‎监测哨点医‎院,每周采‎集内科和儿‎科门诊就诊‎的流感样病‎例(体温≥‎38℃,同‎时伴有咳嗽‎或者咽喉疼‎痛等症状的‎急性呼吸道‎感染者)的‎咽拭子标本‎,放人pH‎7.4-‎7.6的D‎M EM采样‎液中,当日‎低温送流感‎实验室检测‎,每周采集‎20份流‎感样病例的‎咽拭子标本‎。

【江苏省自然科学基金】_定量逆转录聚合酶链反应_期刊发文热词逐年推荐_20140816

【江苏省自然科学基金】_定量逆转录聚合酶链反应_期刊发文热词逐年推荐_20140816

科研热词 预后 逆转录聚合酶链反应 运动训练 转化生长因子β 1 脂蛋白脂酶 肉芽肿 缺氧 白血病,淋巴细胞,慢性,b细胞 白血病 环磷酰胺 淋巴细胞 水迷宫 日本血吸虫 慢性 惊厥 小鼠 埃他卡林 免疫调节 人肺动脉平滑肌细胞 β 细胞 zn~(2+)转运体-3 atp敏感性钾通道
推荐指数 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
2012年 序号 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18
科研热词 推荐指数 阳性和阴性症状量表 1 腹主动脉瘤 1 耐药株 1 精神分裂症 1 白念珠菌 1 生物被膜 1 微小rna-494 1 多巴胺质膜转运蛋白质类 1 基质金属蛋白酶-2 1 基因表达 1 基因治疗 1 受体,多巴胺d2 1 前列腺癌 1 丹参酮 1 一氧化氮合酶 1 xog1 1 survivin 1 bgl2 1
2010年 序号 1 2 3 4 5 6 7
科研热词 红斑狼疮 系统性 抗核 抗体 小分子干扰 rna oaz信号通路
推荐指数 1 1 1 1 1 1 1
2011年 序号 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
2011年 科研热词 解整合素-金属蛋白酶8 荧光定量聚合酶链反应 结直肠癌 增殖细胞核抗原 埃他卡林 冬凌草甲素 人肺动脉平滑肌细胞 乳腺癌 atp敏感性钾通道 ap-1 推荐指数 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
2014年 科研热词 预后 肺肿瘤 基因表达 微小rna-145 mirna-221 推荐指数 2 2 2 1 1
2013年 序号 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11
科研热词 推荐指数 预后 1 钛颗粒 1 过氧化物酶体增殖激活受体γ 1 胃癌 1 破骨细胞 1 炎症 1 微小rna-181b 1 微小rna 1 大麻素受体2 1 分子分型 1 乳腺癌 1

检测目的基因是否转录的方法

检测目的基因是否转录的方法

要检测目的基因是否转录(即是否在细胞中产生RNA分子),可以使用以下方法:
RT-PCR(逆转录聚合酶链反应):这是一种常用的方法,它将RNA转录为相应的互补DNA (cDNA),然后使用聚合酶链反应(PCR)扩增cDNA。

通过选择特定的引物,可以检测目的基因的转录水平。

RT-PCR可以定量或半定量地测量转录水平。

实时定量PCR(qPCR):这是一种通过测量PCR反应的实时增长曲线来定量目的基因的转录水平的方法。

它结合了逆转录和PCR反应,可以在实时中监测PCR产物的累积。

根据PCR 产物的数量,可以计算出目的基因的转录水平。

Northern印迹分析:这种方法使用电泳将RNA样品分离,并将其转移到膜上,然后使用与目的基因序列互补的探针进行杂交。

这可以检测目的基因的RNA分子,并确定其存在与否以及相对丰度。

RNA测序:通过高通量RNA测序技术,可以对细胞中的RNA进行全面的测序,包括目的基因的转录产物。

这种方法可以提供关于目的基因转录水平的详细信息,并可用于检测整个转录组的变化。

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定量逆转录聚合酶链反应
定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)是一种常用的分子生物学技术,用于检测RNA的表达水平。

该技术包括两个步骤:逆转录反应和聚合酶链反应。

首先,通过逆转录酶将RNA转录成cDNA(反转录过程),然后使用DNA聚合酶扩增cDNA。

通过纳米量热法分析PCR 反应几率,可以定量分析样品中RNA的表达水平。

qRT-PCR技术具有高灵敏度,高特异性和较高的准确性。

与传统的聚合酶链反应(PCR)相比,qRT-PCR技术可以在更短的时间内得到更加准确的结果。

此外,它的操作简化了DNA 净化和定量,同时也避免了自发的DNA降解,使检测结果更加准确。

首先,需要合成一个逆转录引物的混合物,用于RNA转录成cDNA。

当这个组合物加入RNA样品中时,引物会与RNA序列配对并将其反转录成cDNA。

在该过程中,逆转录酶还需要加入两个重要的酶:RNA酶抑制剂和dNTP混合物。

RNA酶抑制剂可以预防RNA酶扩大反转录过程,而dNTP混合物是用于扩大cDNA的。

在RNA转录成cDNA之后,需要进行PCR扩增反应。

这个过程中,需要加入引物和标志性的探针。

引物即为PCR中的引物,被用于扩大cDNA,而标志性的探针则被用于量化PCR 产物。

这样就可以精确计算RNA表达水平。

标志性的探针通常是由一个荧光染料和一个探针组成。

当PCR反应产生荧光时,可以通过纳米量热法来计算PCR反应对应的RNA表达水平。

qRT-PCR技术有很多应用。

例如,在癌症研究中,研究人员可以通过qRT-PCR技术来优化治疗期间所用的化学药物剂量,以便最大限度地减少每次治疗的副作用。

同时,研究人员还可以通过qRT-PCR技术来研究修饰因子(例如过度表达或下调的基因),这些基因在癌症细胞中表现出类似于正常细胞的痕迹。

qRT-PCR技术也可以应用于病毒检测,检测外科标本中的微量染色体异常等等。

总之,qRT-PCR技术是一种高效,可靠且高灵敏度的分子生物学技术,可用于精确的RNA表达水平分析。

此外,它是一种流行的实验室技术,可用于多种生物学方面的研究,如细胞生物学,分子生物学,医学生物学等等。

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