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标准终点RTPCR

标准终点RTPCR

标准终点RTPCR实时荧光定量PCR(real-time PCR)是一种高灵敏度、高特异性的核酸检测技术,广泛应用于基因表达分析、病原微生物检测、遗传疾病诊断等领域。

在实时荧光定量PCR技术中,终点PCR是一种常用的PCR方法,它可以通过检测PCR反应终点的荧光信号来定量目标DNA或RNA的含量。

本文将介绍标准终点RTPCR的原理、方法和应用。

1. 原理。

标准终点RTPCR是一种半定量PCR技术,其原理是利用DNA或RNA模板,在PCR反应体系中进行多轮扩增,通过检测PCR反应终点的荧光信号来定量目标DNA或RNA的含量。

在PCR反应中,每一轮循环都会产生指数级增加的DNA或RNA产物,同时伴随着荧光信号的累积。

当PCR反应达到饱和时,荧光信号会呈指数级增加,最终趋于平稳。

通过检测PCR反应终点的荧光信号强度,可以确定起始模板的含量,从而实现对目标DNA或RNA的定量分析。

2. 方法。

标准终点RTPCR的方法包括PCR反应体系的准备、PCR程序的设置、荧光信号的检测和数据分析等步骤。

首先,需要准备PCR反应体系,包括模板DNA或RNA、引物、荧光探针、聚合酶等。

然后,设置PCR程序,包括预变性、PCR扩增和荧光信号采集等步骤。

在PCR扩增过程中,荧光信号会随着PCR产物的累积而增加,直至达到饱和。

最后,通过荧光检测仪器采集PCR反应终点的荧光信号,并进行数据分析,得出目标DNA或RNA的定量结果。

3. 应用。

标准终点RTPCR技术在科学研究和临床诊断中具有广泛的应用价值。

在基因表达分析中,可以利用标准终点RTPCR技术对特定基因的表达水平进行定量分析,从而揭示基因调控网络和信号转导通路。

在病原微生物检测中,可以利用标准终点RTPCR技术对病原微生物的核酸进行定量检测,实现对病原微生物的快速、准确的诊断。

在遗传疾病诊断中,可以利用标准终点RTPCR技术对患者的遗传物质进行定量分析,为临床诊断和治疗提供依据。

rtpcr原理

rtpcr原理

rtpcr原理RT-PCR原理。

RT-PCR全称为逆转录聚合酶链式反应,是一种用于检测RNA的技术。

它结合了逆转录和聚合酶链式反应的步骤,可以将RNA转录成cDNA,然后进行扩增和检测。

这种技术在分子生物学和医学诊断中得到了广泛的应用,尤其在病毒检测和基因表达分析方面有着重要的作用。

RT-PCR的原理主要分为三个步骤,逆转录、PCR扩增和检测。

首先是逆转录,即将RNA转录成cDNA。

这一步骤需要逆转录酶和引物,逆转录酶能够将RNA模板转录成cDNA,引物则是用来引导逆转录酶的合成。

在逆转录的过程中,引物将与RNA模板结合,逆转录酶将在引物的引导下合成cDNA链。

这样就得到了cDNA模板,为后续的PCR扩增提供了基础。

接下来是PCR扩增,即利用聚合酶链式反应对cDNA进行扩增。

在PCR反应中,需要两种引物,分别是前向引物和反向引物。

这两种引物将在PCR反应中与cDNA模板配对,聚合酶将在引物的引导下合成新的DNA链。

通过多轮的PCR反应,可以将目标DNA序列扩增到可检测的水平。

PCR扩增是RT-PCR技术的关键步骤,它能够快速、高效地扩增目标DNA序列,为后续的检测提供了充分的材料。

最后是检测,即对扩增后的DNA进行检测分析。

常用的检测方法包括凝胶电泳、实时荧光定量PCR和测序等。

凝胶电泳是一种常规的检测方法,通过电泳将扩增后的DNA分离并观察。

实时荧光定量PCR则是一种高灵敏度和高特异性的检测方法,可以实时监测PCR反应过程中的荧光信号,从而定量分析目标DNA的含量。

而测序则是一种直接测定DNA序列的方法,可以准确地确定目标DNA的碱基序列。

这些检测方法可以根据实际需求进行选择,以满足不同的研究和临床应用。

总的来说,RT-PCR技术通过逆转录、PCR扩增和检测三个步骤,实现了对RNA的检测和分析。

它具有高灵敏度、高特异性和高效性的特点,可以广泛应用于基因表达分析、病毒检测、肿瘤诊断等领域。

随着生物技术的不断发展,RT-PCR技术也在不断完善和改进,为科研和临床诊断提供了强大的工具和支持。

RT-PCR

RT-PCR

RT-PCR原理:
提取组织或细胞中的总RNA,以其中的 mRNA作为模板,采用OligodT或随机引物 利用逆转录酶反转录成cDNA。
再以cDNA为模板进行PCR扩增,而获得目 的基因或检测基因表达。
RT-PCR实验步骤
1,RNA提取;
2,RT;RNA-DNA
3,PCR
1.RNA的提取
RNA的提取其实原理很简单:通过变性剂破碎 细胞或者组织,然后经过氯仿等有机溶剂抽提 RNA,再经过沉淀,洗涤,晾干,最后溶解。
逆转录-聚合酶链反应
Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR
RT-PCR简介
RT-PCR是将RNA的反转录(RT)和cDNA的聚合酶 链式扩增(PCR)相结合的技术。 首先经反转录酶的作用从RNA合成 cDNA,再以cDNA 为模板,扩增合成目的片段。作为模板的RNA可以是 总RNA、mRNA或体外转录的RNA产物。
RT-PCR用途
RT-PCR技术灵敏而且用途广泛,
检测细胞中基因表达水平; 直接克隆特定基因的cDNA序列; 分析基因的转录产物; 获取目的基因; 合成cDNA探针。
真核生物的基因组是DNA,为什么不直接从 DNA PCR得到我们需要的基因呢?
因为真核生物的基因含有大量的非编码区,称为 内含子 (intron),真正编码蛋白的区段是被这些内含子隔开的, 这些编码区叫做外显子(exon)。 真核生物的DNA转录成为RNA之后,经过剪切和拼接, 去掉这些非编码区,才形成成熟的mRNA,由mRNA再 翻译成蛋白质。
Figure. DNA Contamination in RNA.
适用于具有PolyA尾巴的mRNA。(原核生物的RNA、 真核生物的 rRNA和tRNA不具有PolyA尾巴。)由于 Oligo dT Oligo dT要结合到PolyA 尾巴上,所以对RNA样品的 质量要求较高。

rt pcr原理

rt pcr原理

rt pcr原理RT-PCR原理RT-PCR是一种广泛应用于分子生物学和医学诊断领域的实验技术,其全称为反转录聚合酶链式反应(Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction)。

本文将详细介绍RT-PCR的原理。

一、反转录(Reverse Transcription)1. 反转录的概念反转录是指将RNA模板上的信息逆向转录成为DNA序列。

在RT-PCR中,反转录是制备cDNA(complementary DNA)模板的关键步骤。

cDNA是由RNA模板逆向合成的双链DNA,它可以作为PCR 扩增的模板。

2. 反转录过程反转录过程由三个主要部分组成:RNA逆向转录、RNA降解、cDNA 合成。

首先,需要使用反转录酶将RNA模板逆向转录为单链cDNA;然后通过碱基切除和填充,将单链cDNA变为双链cDNA;最后使用RNase H或其他酶降解RNA模板,得到纯净的cDNA。

二、聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction)1. PCR的概念聚合酶链式反应是一种体外扩增核酸序列的技术。

它可以在短时间内从微量样品中扩增出大量特定的DNA序列。

2. PCR过程PCR过程由三个主要步骤组成:变性、退火、延伸。

首先,将DNA 双链分离为两条单链,即变性;然后引入引物(primers),使其与目标序列的两端互相补合,形成一个模板-引物复合体;最后,使用DNA聚合酶在引物的作用下延伸新链。

三、RT-PCR原理1. RT-PCR的概念RT-PCR是一种结合反转录和聚合酶链式反应技术的方法,用于从RNA模板中扩增特定的DNA序列。

它可以将RNA转录为cDNA,并通过PCR扩增cDNA。

2. RT-PCR过程RT-PCR过程由四个主要步骤组成:反转录、初步扩增、二次扩增、检测。

首先进行反转录反应,将RNA逆向转录为cDNA;然后进行初步扩增,使用特定引物扩增目标序列;接着进行二次扩增,使用内部引物对初步扩增产物进行进一步扩增;最后进行检测,确定是否存在目标序列。

RT-PCR百度百科

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概念RT-PCR 为反转录RCR(reverse transcription PCR)和实时PCR(real time PCR)共同的缩写。

逆转录PCR,或者称反转录PCR(reverse transcription-PCR, RT-PCR),是聚合酶链式反应(PCR)的一种广泛应用的变形。

在RT-PCR中,一条RNA链被逆转录成为互补DNA,再以此为模板通过PCR进行DNA扩增。

由一条RNA单链转录为互补DNA(cDNA)称作“逆转录”,由依赖RNA的DNA聚合酶(逆转录酶)来完成。

随后,DNA的另一条链通过脱氧核苷酸引物和依赖RNA 的DNA聚合酶完成,随每个循环倍增,即通常的PCR。

原先的RNA模板被RNA酶H降解,留下互补DNA。

RT-PCR的指数扩增是一种很灵敏的技术,可以检测很低拷贝数的RNA。

RT-P CR广泛应用于遗传病的诊断,并且可以用于定量监测某种RNA的含量。

(检测基因表达的方法,参见Northern Blot法。

)RT-PCR有时候也会指代实时PCR(real-time PCR)。

为了与逆转录PCR相区别,通常被写作“定量PCR”(quantitative PCR)或者RTQ-PCR(real-time quantitative P CR)。

实时PCR(real-time PCR),属于定量PCR(Q-PCR)的一种,以一定时间内D NA的增幅量为基础进行DNA的定量分析。

real time PCR 的定量使用萤光色素,目前有二种方法。

一种是在ds DNA中插入特异的萤光色素;另一种使用一种能与增幅DNA序列中特定寡核酸序列相结合的一种萤光探针(probe)。

real time PCR 与reverse transcription PCR 相结合,能用微量的RNA来找出特定时间、细胞、组织内的特别表达的遗传基因。

这两种RT PCR的组合又被称之为“定量RT-PCR(quantitative RT-PCR)”[编辑本段]PCR技术相关试剂A液:变性液B液:醋酸钠溶液C液:酚/氯仿/异戊醇混合液(50:49:1)D液:异丙醇E液:75%乙醇F液:DEPC处理的灭菌去离子水G液:RNA酶抑制剂H液:反转录反应液I液:反转录酶J液:PCR反应液K液:Taq DNA聚合酶(0.5u/µl)L液:矿物油M液:50倍TAE电泳缓冲液N液:溴化乙锭溶液0液:上样缓冲液[编辑本段]PCR各步骤的目的(一)预变性:破坏DNA中可能存在的较难破坏的二级结构。

real-time pcr名词解释

real-time pcr名词解释

real-time pcr名词解释
外文名【Real-time Quantitative polymerase chain reaction】
中文名【实时荧光定量多聚核苷酸链式反应】
中文简称【实时荧光定量PCR】
外文简称【RT PCR】
【实时荧光定量PCR技术】,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。

实时荧光定量PCR (Quantitative Real-time PCR)是一种在DNA扩增反应中,以荧光化学物质测每次聚合酶链式反应(PCR)循环后产物总量的方法。

通过内参或者外参法对待测样品中的特定DNA序列进行定量分析的方法。

·
Real-timePCR是在PCR扩增过程中,通过荧光信号,对PCR进程进行实时检测。

由于在PCR扩增的指数时期,模板的Ct值和该模板的起始拷贝数存在线性关系,所以成为定量的依据。

【技术原理】
将标记有荧光素的Taqman探针与模板DNA混合后,完成高温变性,低温复性,适温延伸的热循环,并遵守聚合酶链反应规律,与模板DNA互补配对的Taqman 探针被切断,荧光素游离于反应体系中,在特定光激发下发出荧光,随着循环次数的增加,被扩增的目的基因片段呈指数规律增长,通过实时检测与之对应的随扩增而变化荧光信号强度,求得Ct值,同时利用数个已知模板浓度的标准品作对照,即可得出待测标本目的基因的拷贝数。

RT-PCR技术(ZYR)

RT-PCR技术(ZYR)


3、确认RNA的质量
检测RNA溶液的吸光度: OD260/OD280=1.8-2.0 RNA的电泳图谱: 28S和18S条带明亮、清晰、指条带 边缘清晰,并且28S的亮度在18S条 带的两倍以上。

二、反转录

单管一步法
反转录和PCR反应在一个管子中完成 , 得到的全部cDNA产物都一起经PCR扩 增 ,灵敏度更高,但是容易相互干扰 。
一、抽提RNA

1、防止RNA酶污染
180℃的高温下干烤6hr以上; 0.1% DEPC水浸泡或用氯仿冲洗; 去污剂洗涤,双蒸水冲洗; 溶液皆用0.1% DEPC水配置,试剂 应为新开封或RNA专用; 操作人员戴手套; 器械专用。


2、材料的准备
组织及细胞最好为新鲜的,或者在 -RT-PCR技术
简介

RT- PCR即逆转录PCR,是将RNA的 逆转录(RT)和cDNA的聚合酶链式 扩增反应(PCR)相结合的技术。首 先经反转录酶的作用从RNA合成 cDNA,再以cDNA为模板,扩增合成 目的片段。RT-PCR技术灵敏而且用 途广泛,可用于检测细胞中基因表达 水平,细胞中RNA病毒的含量和直接 克隆 特定基因的cDNA序列。

两步法
反转录和P CR分开做,PCR取反转录 反应产物的1/10进行,更为灵活而且 严谨,但是灵敏度不如前者高。
三、PCR

1、参照基因 PCR
参照基因一般选择看家基因(长表达、高表 达量 的基因),常用18S、β-actin、 bubulin、GAPDH,其中ACTIN最为普遍; 参照基因与目的基因在同一个管子内进行 PCR反应的情况下,称之为内参; 参照基因与目的基因在不同管子内反应成为 外参; 由于内参可能与目的基因竞争模板及酶,或 造成其它干扰,外参的应用较为普遍。

rt-pcr 探针原理

rt-pcr 探针原理

rt-pcr 探针原理
RT-PCR(逆转录聚合酶链式反应)探针原理是一种基于实时荧光检测的核酸扩增技术,用于定量分析目标RNA分子。

其原理如下:
1. 首先,从目标组织或细胞中提取总RNA,然后通过逆转录酶将RNA 转化为cDNA。

2. 采用特定引物和探针进行PCR扩增。

探针是一种荧光标记的DNA 分子,能够与目标cDNA序列特异性地结合。

3. 在PCR反应过程中,荧光探针与目标cDNA结合,随着扩增产物的形成,探针的荧光强度逐渐增强。

4. 通过实时监测扩增过程中荧光信号的变化,可以计算出目标分子的拷贝数。

荧光信号的强度与目标RNA分子的数量成正比,从而实现对RNA分子的定量分析。

5. 利用特定的软件和数据分析,可以得到目标RNA分子的相对表达量,从而分析不同样本之间基因表达的差异。

RT-PCR探针原理具有高度敏感性和特异性,广泛应用于基因表达研
究、病毒载量检测、突变检测等领域。

需要注意的是,RT-PCR实验过程中需要严格控制实验条件,以确保结果的准确性和可重复性。

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概念
RT-PCR 为反转录RCR(reverse transcription PCR)和实时PCR(real time PCR)共同的缩写。

逆转录PCR,或者称反转录PCR(reverse transcription-PCR, RT-PCR),是聚合酶链式反应(PCR)的一种广泛应用的变形。

在RT-PCR中,一条RNA链被逆转录成为互补DNA,再以此为模板通过PCR进行DNA扩增。

由一条RNA单链转录为互补DNA(cDNA)称作“逆转录”,由依赖RNA的DNA聚合酶(逆转录酶)来完成。

随后,DNA的另一条链通过脱氧核苷酸引物和依赖RNA 的DNA聚合酶完成,随每个循环倍增,即通常的PCR。

原先的RNA模板被RNA酶H降解,留下互补DNA。

RT-PCR的指数扩增是一种很灵敏的技术,可以检测很低拷贝数的RNA。

RT-P CR广泛应用于遗传病的诊断,并且可以用于定量监测某种RNA的含量。

(检测基因表达的方法,参见Northern Blot法。


RT-PCR有时候也会指代实时PCR(real-time PCR)。

为了与逆转录PCR相区别,通常被写作“定量PCR”(quantitative PCR)或者RTQ-PCR(real-time quantitative P CR)。

实时PCR(real-time PCR),属于定量PCR(Q-PCR)的一种,以一定时间内D NA的增幅量为基础进行DNA的定量分析。

real time PCR 的定量使用萤光色素,目前有二种方法。

一种是在ds DNA中插入特异的萤光色素;另一种使用一种能与增幅DNA序列中特定寡核酸序列相结合的一种萤光探针(probe)。

real time PCR 与reverse transcription PCR 相结合,能用微量的RNA来找出特定时间、细胞、组织内的特别表达的遗传基因。

这两种RT PCR的组合又被称之为“定量RT-PCR(quantitative RT-PCR)”
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PCR技术相关试剂
A液:变性液
B液:醋酸钠溶液
C液:酚/氯仿/异戊醇混合液(50:49:1)
D液:异丙醇
E液:75%乙醇
F液:DEPC处理的灭菌去离子水
G液:RNA酶抑制剂
H液:反转录反应液
I液:反转录酶
J液:PCR反应液
K液:Taq DNA聚合酶(0.5u/µl)
L液:矿物油
M液:50倍TAE电泳缓冲液
N液:溴化乙锭溶液
0液:上样缓冲液
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PCR各步骤的目的
(一)预变性:
破坏DNA中可能存在的较难破坏的二级结构。

使DNA充分变性,减少DNA 复杂结构对扩增的影响,以利于引物更好的和模板结合,特别是对于基因组来源的D NA模板,最好不要吝啬这个步骤。

此外,在一些使用热启动Taq酶的反应中,还可激活Taq酶,从而使PCR反应得以顺利进行。

(二)变性--退火--延伸循环:
①模板DNA的变性:模板DNA经加热至93℃左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备;
②模板DNA与引物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降至5 5℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合;
③引物的延伸:DNA模板--引物结合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP
为反应原料,靶序列为模板,按碱基配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板D NA 链互补的半保留复制链。

(三)用PCR仪扩增时,(变性.退火,延伸)循环完成后,继续72度延伸了10分钟的原因:
1.延伸时间取决于待扩增DNA片段的长度。

(当然是在反应体系一定的条件下)例如,使用taqDNA聚合酶,72度时的碱基掺入率为35-100bp/s,因此延伸速率为1kb/min。

2.根据延伸速率推得,扩增1kb以内的dna片段1min即可,而3-4kb则需要3-4min,依次照推。

通常在最后一轮要适当的将延伸时间延长至4-10min,这样做是使pcr反应完全以提高扩增产量。

3.继续72度延伸了10分钟除了可以使pcr反应完全以提高扩增产量外,还有一个作用是:在用普通taq酶进行PCR扩增时在产物末端加A尾的作用,可以直接用于TA克隆的进行。

扩展阅读:
1./question/52500058.html?si=3
2./blog/bio/guohui/1061.htm
3./blog/bio/pinus/1136.htm
4./wiki/%E3%83%AA%E3%82%A2%E3%83%AB%E3%8 2%BF%E3%82%A4%E3%83%A0PCR。

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