代谢组学：基于质谱的研究方法-张富昌
质谱技术在蛋白质组学和代谢组学中的研究应用
１ 质 谱 分 析 技 术
解 析电离 质谱得 到蛋 白质 酶解后 的肽指纹 图谱 （ ｐ ｅ ｐ ｔ ｉ ｄ ｅ ｍ ａ ｓ ｓ
质谱 （ ｍａ ｓ ｓ ｓ ｐ ｅ ｃ ｔ ｒ ｏ ｍ ｅ ｔ ｒ ｙ ， ＭＳ ） 是带 电原 子 、分子或分子碎 ｉ ｆ ｎ ｇ ｅ ｒ ｐ ｒ ｉ ｎ ｔ ， Ｐ ＭＦ ） 。或 者用 电喷雾 串联 质谱 （ Ｅ Ｓ Ｉ — ＭＳ ／ ＭＳ ） 中得 片按质 荷 比 （ ｒ ｎ ／ ｚ ） 的大小 顺序 排列 的图谱 。质谱仪 是一 类能 到肽片段的进一 步裂 解谱 图。最后 用生物信息学 软件 处理质 使 物质粒子转化成 离子并通过适 当的 电场 、磁 场将 它们按空 谱数 据 ， 主要 通过检索蛋 白质或基 因数 据库鉴定蛋 白质 。
间位置 、时间先后 或者轨道稳 定与否实 现质荷 比分离 ， 并检 测强 度后 进行 物 质分 析 的仪器 。质 谱技 术是 研究 、分 析 和 鉴定 生 物大 分子 的前 沿 方法 ， 有 力地 推动 了蛋 白质组 学 的
研 究 …。可 以获 得样 品 的相对 分子 质量 、分子 式 、分子 中
・
５ ４・
继续医学教育２ ０ １ ４ 年１ 月
Ｍ ｅ ｄ ｉ ｃ ａ ｌ Ｅ ｄ ｕ ｃ ｍ ｉ ｏ ｎ ， Ｊ ａ ｎ ２ ０ １ ４ ， Ｖ ｏ １ ． ２ ８ ， Ｎ ｏ ． １
质谱 技 术在 蛋 白质 组 学和代 谢 组学 中的研 究应 用
张文 亮
（ 天津市安定 医院 ，天津 ３ ０ ０ ２ ２ ２ ）
Ｒ ａ ｂ ３ ７亚型 ２ 、Ｈ Ｐ蛋 白 、锌 指结构 ２糖 蛋 白等 ； ９种蛋 白
质谱代谢组学
三、发现代谢组学
二、GC-MS和LC-MS
2、代谢组学中所用的分离技术
气相色谱(GC) GC 要求挥发性，要用化学衍生化的样品 液相色谱(LC) 不能完全解决代谢组中亲水组分的分离问题 毛细管电泳(CE) 所用的缓冲液却不能与质谱仪的离子源兼容
亲水相互作用色谱(HILIC)
二、GC-MS和LC-MS
3、代谢组学的挑战
三、发现代谢组学
5、LC/MS
在
在发现代谢组学中的应用
寻找特征 方面：
安捷伦的MassHunt er LC/MS 工作站软件包含获得专利的分 子特征提取算法，专为精确质量LC/MS 飞行时间数据而设计， 能够识别与单一化合物相关的协变离子。此外，它还能识别和 解析常见的电喷雾干扰离子，如钠加合离子或二聚体的形成。 对这些离子鉴别和分组可以改善统计分析所用的定量估算， 并从随后的分析中除去伪数据
三、发现代谢组学
2、代谢谱分析，寻找有统计学意义的代谢物
分析重现性对表达谱分析至关重要------分析变异越小， 所需的重复数就越少 代谢谱分析是经过复杂的特征提取，对已知代谢物进行 靶向代谢谱分析，以寻找意外的代谢物------代谢物以其分子 特征为标志表示，包括保留时间、质量或质谱图及丰度 在代谢谱分析过程中，并不一定要知道该化合物/ 代谢 物是什么。但为了在不同次的样品分析之间跟踪这些化合物， 必需要用到其物理性质
三、发现代谢组学
高效液相色谱联用质谱技术在代谢组学中的应用研究
高效液相色谱联用质谱技术在代谢组学中的应用研究随着生物类疾病的不断增多，人们对疾病的研究越来越深入。
而代谢组学是近年来应用广泛的一种研究手段。
代谢组学主要研究生物系统内代谢物质的变化及其与疾病的关联。
而高效液相色谱联用质谱技术是其中的一种核心技术，其应用范围也越来越广泛。
第一部分：高效液相色谱联用质谱技术简介高效液相色谱联用质谱技术（HPLC-MS）是一种分析化学技术，它通过将固相柱层析和质谱检测有机物的灵敏性和选择性结合在一起，提供了在复杂矩阵中检测并鉴定分子的有力手段。
HPLC提供了化学分离的能力，而质谱则提供了结构分析和分子组分确定的能力。
HPLC-MS技术可以分为两种类型：电喷雾质谱法（ESI），磁共振光离子化质谱法（MALDI）。
ESI质谱法是一种常见的离子源技术，可以将高速电子轰击下的分子离子分离成单独的离子种，以便进行质量分析和结构分析。
而MALDI质谱法主要用于生物大分子（如蛋白质）的分析。
这两种技术都可以与HPLC技术组合使用，用于检测生物样本中的各种代谢产物。
第二部分：HPLC-MS在代谢组学中的应用代谢组学的主要研究对象是代谢产物。
代谢产物是把生物大分子、生命体征和营养物质转化成生物体能量和构造材料的化学物质。
代谢组学可以通过研究代谢产物之间的相互作用，揭示疾病的发展过程。
HPLC-MS技术可用于分析生物体内的代谢产物，进而了解生物体质的生理和病理状态。
例如，HPLC-MS技术可以用于检测血液、尿液、唾液等生物样本中的代谢产物，通过指纹图谱的比较，可以获得分类鉴别信息，用于疾病的检测和诊断。
在代谢组学研究中，HPLC-MS技术的优势是高度的灵敏度和选择性。
HPLC-MS技术是一种高通量的分析方法，可以在短时间内检测出多种代谢产物，从而作为研究疾病的生物标志物，为临床诊断和治疗提供重要的支持。
第三部分：HPLC-MS在糖尿病代谢组学中的应用糖尿病是一种代谢性疾病，其主要特征是胰岛素分泌不合理或作用异常，导致体内代谢失调。
基于高通量定量质谱技术的代谢组学分析
基于高通量定量质谱技术的代谢组学分析代谢组学是一门研究生物体内代谢产物组成变化的学科，其主要研究对象是生物体内代谢物质的种类、数量和相对丰度的变化规律。
在这个领域，高通量定量质谱技术是一个广泛应用的工具。
在这篇文章中，我们将深入探讨基于高通量定量质谱技术的代谢组学分析的原理、应用和前景。
一、高通量定量质谱技术的基本原理高通量定量质谱技术是一种旨在快速准确地分析每种化学分子在样品中的含量的科学方法。
不同于定性分析技术，高通量定量技术可以定量地测定大量的代谢产物。
这些代谢产物可以从任何类型的样品（例如血液、组织样本、生物体培养基、土壤或水体等）中提取，并在代谢组学分析中得到进一步研究。
高通量定量质谱技术的基本原理是利用质谱（MS）的原理来实现。
质谱可通过将输入样品的某一化学分子分离出来，并对其进行量化分析，以确定该化学物质的质量。
通过将分离出的化学分子可进行碎片分析，再通过定量测量联合分析中每个碎片的相对丰度和数量，从而使高通量定量质谱技术具有高度精确、高通量的技术特点。
二、基于高通量定量质谱技术的代谢组学分析的应用领域基于高通量定量质谱技术的代谢组学分析广泛应用于生物医学研究、新药开发、生态环境和营养研究等多个领域。
生物医学研究：通过代谢组学分析技术，可以比较研究对象之间代谢产物的差异。
如糖尿病病人与非糖尿病病人之间代谢产物的差异；癌症病人与无癌症病人之间代谢产物的变化等。
这些应用都为临床治疗和疾病预防提供了重要线索。
新药开发：代谢组学分析技术可用于目标物理解、药效研究和代谢物筛选。
这对于药物开发和营销都至关重要，可以帮助研发人员快速评估目标化合物的药效和代谢产物。
生态环境：代谢组学分析技术可用于生物标志物研究和环境污染研究。
通过分析代谢产物的变化，可以发现环境中的污染物，以及其对生物的影响。
此外，代谢组学也可以被用来识别环境污染物暴露的生物标志物。
营养研究：代谢组学分析技术可用于研究人类和动物营养与代谢之间的关系。
质谱技术在代谢组学研究中的应用
质谱技术在代谢组学研究中的应用质谱技术是一种先进的分析技术，在生命科学领域得到广泛应用。
在代谢组学研究中，质谱技术可以帮助研究者更深入地了解生物体内代谢物的种类和含量，进而为疾病诊断和治疗提供基础数据。
本文将介绍质谱技术在代谢组学研究中的应用，以及其在生物发育、环境毒理学、药理学等多个领域的应用。
一、代谢组学研究中质谱技术的应用1. 代谢物种类、含量和结构的分析质谱技术可以对生物体内的代谢物进行快速、准确地鉴定和定量。
例如，通过多重反应监测（MRM）等技术，可以定量分析多种代谢物的含量，进而了解生物体内的代谢通路和代谢产物。
同时，质谱技术还可以用来鉴定和确定代谢物的结构，从而为代谢通路的解析提供基础数据。
2. 代谢物与生物发育的关系代谢组学研究也可以用来探究代谢物与生物发育的关系。
例如，研究者可以通过比较不同发育阶段的生物体内代谢物的含量变化，来了解代谢物在生物发育过程中的作用和调控机制。
同时，代谢组学研究也可以用来探究代谢异常与生物发育缺陷之间的关系。
3. 代谢物与环境毒理学的关系质谱技术在代谢组学研究中还可以用来探究代谢物与环境毒理学的关系。
例如，研究者可以通过监测生物体内代谢物的含量变化来了解环境因素对生物体内代谢通路的影响，或者通过比较正常和受到某种毒物污染的样本内代谢物的差异性，来确定这种毒物的毒性机制。
4. 代谢物与药理学的关系质谱技术在代谢组学研究中也可以用来探究代谢物与药理学的关系。
例如，研究者可以通过比较使用某种药物前后生物体内代谢物的变化情况，来确定这种药物对代谢通路的影响和调控机制。
同时，代谢组学研究还可以用来评估药物的药效和药物代谢动力学等方面的问题。
二、质谱技术在代谢组学研究中的发展和趋势随着代谢组学研究的不断深入和发展，质谱技术在代谢组学研究中的应用也不断增强和完善。
未来的发展趋势主要包括以下几个方面：1. 高通量、高分辨率的代谢组学分析技术随着高通量和高分辨率代谢组学分析技术的不断发展，质谱技术在代谢组学研究中的应用也会更加广泛和深入。
代谢组学质谱检测原理
代谢组学质谱检测原理代谢组学质谱检测原理引言代谢组学是研究在生物体内发生的化学反应和代谢产物的整体组成、结构和变化的学科领域。
它涉及到从生物样本中测量大量的小有机分子，并通过分析这些代谢物的组成和浓度变化来获得对生物体代谢状态的了解。
质谱（Mass Spectrometry, MS）是代谢组学中常用的技术手段之一。
本文将详细介绍质谱技术在代谢组学中的原理和应用。
一、质谱技术概述质谱技术是一种分析化学方法，它通过将化学物质转化为电离态，并利用质谱仪对质量-电荷比进行分析，从而确定分子的分子量、结构和组成。
质谱仪通常由四个主要部分组成：进样装置、电离源、质量分析器和检测器。
1.1 进样装置进样装置用于将待测样品引入到质谱仪中。
常见的进样方式包括固相微萃取（Solid Phase Microextraction, SPME）、气相色谱（Gas Chromatography, GC）-质谱联用、液相色谱（Liquid Chromatography, LC）-质谱联用等。
通过进样装置，待测样品被引入到电离源中。
1.2 电离源电离源是质谱仪中的核心部件，它用于将待测化合物转化为带电粒子，以便进行质量分析。
常见的电离方式包括电子轰击电离（Electron Impact, EI）、化学电离（Chemical Ionization, CI）和电喷雾电离（Electrospray Ionization, ESI）等。
其中，电喷雾电离是代谢组学质谱检测中最常用的电离方式之一。
1.3 质量分析器质谱仪中的质量分析器用于分离并测量不同离子的质量-电荷比。
常见的质量分析器包括飞行时间质量分析器（Time-of-flight Mass Analyzer, TOF）、质量分析滤波器（Quadrupole Mass Filter, QMF）和磁扇质谱仪（Magnetic Sector Mass Analyzer）等。
不同的质谱分析器有各自的特点和应用领域，在代谢组学中的选择需要根据具体实验的要求来确定。
代谢组学研究方法
代谢组学研究方法代谢组学是一种研究生物体在特定条件下代谢物组成和变化的科学方法。
它通过对生物体代谢产物的全面分析，来了解生物体在不同生理、病理状态下的代谢反应和变化规律，从而为疾病诊断、预测和治疗提供重要依据。
以下是几种常见的代谢组学研究方法。
1. 质谱法：质谱法是代谢组学最常用的研究手段之一。
它主要通过质谱仪来检测物质分子的相对分子质量（m/z）和相对丰度，并将其转化为代谢物的质谱图谱。
其中，质谱法可以分为核磁共振质谱（NMR）和质谱质谱（MS/MS）等多种技术。
2. 核磁共振法：核磁共振法是一种通过检测样品中氢、碳、氮等核的共振信号来确定代谢物结构和含量的方法。
它具有非破坏性、高分辨率和高灵敏度等优点，对于样品含量丰富的代谢物的分析效果较好。
3. 比色法和荧光法：比色法和荧光法是通过测量代谢物的吸收光谱和荧光光谱来定量和鉴定代谢物。
这种方法通常适用于含量较高的代谢物或者需要迅速分析的情况。
4. 气相色谱-质谱联用（GC-MS）：GC-MS是常用的代谢组学分析方法之一，它结合了气相色谱和质谱两种技术。
GC-MS 可以将混合物中的代谢物分离并鉴定，进而分析代谢物的相关信息。
5. 液相色谱-质谱联用（LC-MS）：LC-MS的原理与GC-MS类似，只是它将气相色谱替换为液相色谱。
LC-MS具有高灵敏度、高选择性和高分辨率等优点，适用于分析样品中极性和非极性的代谢物。
除了以上几种常见的代谢组学研究方法，还有基因芯片、生物传感器等其他技术也被应用于代谢组学研究中。
随着科学技术的不断进步，代谢组学研究方法也在不断更新和发展，相信将来会有更加高效和精确的方法出现，为生物医学研究提供更多的帮助。
代谢组学基于质谱的研究方法
代谢组学基于质谱的研究方法代谢组学是一种研究生物体内代谢物的高通量分析方法，通过对代谢物在生物体内的组成和变化进行定性和定量的分析，以揭示生物体在不同生理和病理状态下的代谢特征和变化规律。
质谱技术是代谢组学中最常用的分析方法之一，其具有高选择性、高灵敏度和多样化的分析能力。
本文将介绍基于质谱的代谢组学研究方法。
基于质谱的代谢组学研究方法主要包括样品前处理、代谢物的分离和鉴定以及数据分析三个步骤。
首先，样品前处理是整个代谢组学研究的重要环节。
在代谢组学研究中，样品多为复杂的生物体组织或生物体液，如血清、尿液和唾液等。
这些样品中的代谢物种类多样且浓度差异大，因此需要对样品进行前处理，以提取和富集代谢物。
常用的样品前处理方法包括蛋白质沉淀、固相萃取、超滤和溶剂萃取等。
这些方法可以去除样品中的干扰物，同时也使代谢物浓缩，提高检测的灵敏度。
其次，代谢物的分离和鉴定是基于质谱的代谢组学研究的核心。
代谢物的分离可以通过色谱技术实现，如气相色谱（GC）和液相色谱（LC）。
GC质谱联用（GC-MS）是常用的分析方法之一，适用于气相稳定的代谢物的研究，如有机酸、氨基酸和小分子醇等。
LC质谱联用（LC-MS）可用于水溶性代谢物的分析，如糖类、核苷酸和多肽等。
此外，质谱技术还包括离子迁移谱（IMS）、飞行时间质谱（TOF-MS）和串联质谱（MS/MS）等不同工作方式的仪器，可用于不同类型的代谢物分析。
最后，数据分析是基于质谱的代谢组学研究的重要环节。
质谱数据常为高维度、复杂且多变的数据，因此需要进行数据处理和统计分析才能提取有效信息。
常用的数据处理方法包括去噪、峰识别和对齐等，以消除数据中的噪声和对应不同实验之间的差异。
统计分析方法包括多变量分析和生物信息学分析等，可用于特征筛选和模式识别，以找出与不同生理状态相关的代谢标志物，并揭示其潜在的代谢途径和生物过程。
总的来说，基于质谱的代谢组学研究方法可用于揭示生物体代谢的多样性和复杂性。
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汇报人：张富昌 指导教师：田中民 西安交通大学 2014年4月13日
内容提要
一、代谢组学基本知识
二、 GC-MS和LC-MS
三、发现代谢组学
一、代谢组学基本知识
1、什么是代谢组学
代谢组学是通过比较对照组和实验组的代谢组 （metabolomes，某一生物的所有代谢物组分），以寻 找其它代谢谱差异的研究方法。这些差异可能与临床 生物标志物发现中研究的某些疾病相关，也可能与药 物研发毒理研究中候选药物摄入后的代谢改变有关。
1、典型的代谢组学实验需大量样品才能得到精确统计的结果 2、代谢组学研究通常需要多种技术；某种类型的样品往往比其 他样品更适合采用某种特定的分析技术 3、需要高度灵敏和精确的仪器
4、强大的软件工具对处理实验所产生的大量数据非常重要 处理GC/MS 和LC/MS 数据的色谱解卷积程序、寻找有意义 代谢物的一系列统计分析工具、帮助鉴定代谢物的代谢物数据库， 以及最终绘制分子间相互作用网络图的生物信息学软件等。
二、GC-MS和LC-MS
6、LC/MS 、GC/MS分析化合物的范围
三、发现代谢组学
1、发现代谢组学的概念
发现代谢组学主要是将对照组和实验组的代谢组（某一生物 体的全部代谢物）进行比对，以找出其代谢谱的差异。 发现代谢组学分析一般包括以下几个步骤： • 代谢谱分析（也称为差异表达分析），在一组实验和对照 样品中，寻找丰度改变有统计学意义的感兴趣代谢物 • 鉴定，进行代谢谱分析后，测定这些代谢物的化学结构 • 解释，研究流程的最后一步，解释所发现的代谢物与生物 过程或生物状态之间的关联
三、发现代谢组学
5、LC/MS 在发现代谢组学中的应用
在 解释 方面：
安捷伦Mass Prof iler 专业软件的通路分析功能，可以利用已 知的或独特的、用户基于已有数据设定的通路进行解释，大大 简化了生物通路过程
二、GC-MS和LC-MS
4、GC/MS 分析
气相色谱和质谱(GC/MS)是分析挥发性化学物质的有效组合。
气相色谱使用运载气推动分析物通过涂渍的熔融石英毛细管。
基于分析物在气相和毛细管内涂层之间的不同分配实现分离。
二、GC-MS和LC-MS
4、GC/MS 分析
电子轰击电离(EI)是GC/MS 最常用的电离技术，非常耐用
电喷雾(ESI) 和大气压化学电离(APCI)是LC/MS 最常用的两
种电离技术-----ESI 和APCI 都可能出现离子抑制，因此共洗脱 化合物可能被低估甚至检测不到
二、GC-MS和LC-MS
5、LC/MS 分析
目前没有可用于LC/MS 鉴定的谱库。但由于LC/MS 分析中 通常都有分子离子，其质量可以用代谢物数据库进行检索，如 METLIN 数据库 Q-TOF可以通过分子离子计算出经验式 LC/MS 最适合作为未知代谢物研究中的探索方法，或者在多 种目标代谢物由于挥发性问题不能用GC/MS 进行分析时采用
4、安捷伦GC/MS 在发现代谢组学中的应用
在 数据标准化和统计学分析 方面： 统计学分析软件需要具备以下功能： • 从大样本组和复杂的实验设计中，对数据（包括元数据）进 行轻松输入、标准化和对比 • 发现复杂的实验设计中数据间的联系—不局限于两两对比 • 鉴定后能够通过通路分析进行生物学解释 安捷伦的Mass Profiler 专业软件让您能够轻松输入、标准化、 比较并图形化显示大样本组的GC/MS 和LC/MS 数据，从而 快速发现代谢物标志物，并支持元数据分析。我们用的是 SIMCA-P
三、发现代谢组学
2、代谢谱分析，寻找有统计学意义的代谢物
分析重现性对表达谱分析至关重要------分析变异越小， 所需的重复数就越少 代谢谱分析是经过复杂的特征提取，对已知代谢物进行 靶向代谢谱分析，以寻找意外的代谢物------代谢物以其分子 特征为标志表示，包括保留时间、质量或质谱图及丰度 在代谢谱分析过程中，并不一定要知道该化合物/ 代谢 物是什么。但为了在不同次的样品分析之间跟踪这些化合物， 必需要用到其物理性质
二、GC-MS和LC-MS
2、代谢组学中所用的分离技术
气相色谱(GC) GC 要求挥发性，要用化学衍生化的样品 液相色谱(LC) 不能完全解决代谢组中亲水组分的分离问题 毛细管电泳(CE) 所用的缓冲液却不能与质谱仪的离子源兼容
亲水相互作用色谱(HILIC)
二、GC-MS和LC-MS
3、代谢组学的挑战
三、发现代谢组学
5、LC/MS
在
在发现代谢组学中的应用
寻找特征 方面：
安捷伦的MassHunt er LC/MS 工作站软件包含获得专利的分 子特征提取算法，专为精确质量LC/MS 飞行时间数据而设计， 能够识别与单一化合物相关的协变离子。此外，它还能识别和 解析常见的电喷雾干扰离子，如钠加合离子或二聚体的形成。 对这些离子鉴别和分组可以改善统计分析所用的定量估算， 并从随后的分析中除去伪数据
三、发现代谢组学
3、发现代谢组学有以下六个步骤
1、 分析，包括代谢物的分离和检测，一般采用GC/MS 或 LC/MS
2、 寻找特征，包括寻找样品中的所有代谢物。一个代谢 物检测不到，就意味着丧失了一次机会；因此尽可能多地检 测出样品中的代谢物至关重要
三、发现代谢组学
3、发现代谢组学有以下六个步骤
EI 电离经常会导致分子离子的丢失------找不到匹配
的EI谱------缺少的分子离子的质量信息将使可能的化合物的数 量变得非常庞大 因此，GC/MS最适合对已知的或预期的代谢物进行分析
二、GC-MS和LC-MS
5、LC/MS 分析
液相色谱可以分离无挥发性和未衍生化的代谢物。因此， LC/MS可以分析的化合物种类范围比GC/MS 更广
三、发现代谢组学
3、发现代谢组学有以下六个步骤
3、数据标准化，对保留时间和响应的漂移给予必要的校正
4、统计分析，用于发现样品组别之间的统计学差异
5、鉴定，GC/MS 所得的EI 图谱非常适合进行谱库检索 6、解释，一旦代谢物被鉴定出来，就需要通过解释实验结 果，推断其在代谢的生物通路中的地位
三、发现代谢组学
三、发现代谢组学
5、LC/MS 在发现代谢组学中的应用
在 鉴定 方面：
METLIN数据库：
安捷伦METLIN 个人代谢物数据库软件是目前最全面的代谢 物数据库 可以根据关键词、分子式、化合物名称，或K E G G 、C A S 、 HMP 或METLIN 编号进行信息查询
该数据库软件能够与MassHunt er Prof iler 专业软件无缝整合， 共同进行统计学处理和通路分析
一、代谢组学基本知识
2、代谢组学的一般流程
代谢组学
发现代谢组学
靶向代谢组学
一、代谢组学基本知识
3、发现代谢组学的一般流程
代谢谱分析（也称为差异表达分析），在一组实验和对 照样品中，寻找丰度改变有统计学意义的感兴趣代谢物
鉴定，进行代谢谱分析后，测定这些代谢 物的化学结构
解释，研究流程的最后一步，解释所发现的 代谢物与生物过程或生物状态之间的关联
4、安捷伦GC/MS 在发现代谢组学中的应用
在 分析 方面： • 良好的重现性，以便对大量样品进行比对和校正 • 卓越的可靠性，最大限度地延长正常运行时间，分析大量样品 • 高灵敏度，能够检测复杂样品中的低水平代谢物，动态范围 超过6 个数量
三、发现代谢组学
4、安捷伦GC/MS 在发现代谢组学中的应用
三、发现代谢组学
5、LC/MS 在要： • 良好的LC 和MS 重现性，以便对大量样品进行比对和校正 • 卓越的可靠性，最大限度地延长正常运行时间，分析大量样 品 • 高灵敏度，能够检测复杂样品中的低水平代谢物，动态范围 超过5 个数量级
在 寻找特征 方面： 安捷伦提供自动化质谱解卷积和鉴定软件(AMDIS) 进行解卷 积，该软件是NIST 谱库检索软件包的一部分。AMDIS 软件 包设计用于： • 发现相关的协变离子，用单组分色谱峰表示 • 从复杂的GC/MS 数据中提取出单纯组分质谱图 • 重建用于EI 谱库检索的质谱图
三、发现代谢组学
一、代谢组学基本知识
4、靶向代谢组学的一般流程
靶向代谢组学分析的重点是采用大量天然和生物变异 样本，验证预先确认的代谢物。需要用分析标准品进行 定量分析。
一、代谢组学基本知识
5、代谢组学的一般流程
二、GC-MS和LC-MS
1、质谱在代谢组学中的应用
质谱(MS)因具有广泛的动态范围、能进行可重现的定 量分析，而且能够分析非常复杂的生理体液，已被用于 代谢组学的研究中。由于这类样品的复杂性，为了尽可 能多地检测代谢物，在质谱分析之前常常还要进行分离 （气相色谱、液相色谱或毛细管电泳）
三、发现代谢组学
4、安捷伦GC/MS 在发现代谢组学中的应用
在 数据标准化和统计学分析 方面：
三、发现代谢组学
4、安捷伦GC/MS 在发现代谢组学中的应用
在 解释 方面：
安捷伦Mass Prof iler 专业软件的通路分析功能，可以利用 已知的或独特的、用户基于已有数据设定的通路进行解释，大 大简化了这一过程
而且重现性好，而且不会受离子抑制的影响
简单的鉴定方法只需要扣除了背景的EI 图谱，和一个通用 EI谱库检索，如NIST 谱库。更有效的鉴定方法是采用包含了 预期的化合物保留时间和EI 图谱的特定应用数据库同时对分 析物的色谱保留时间和质谱图进行检索
二、GC-MS和LC-MS
4、GC/MS 分析
EI源的缺点