PubMed数据库检索
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PubMed生物医学数据库检索方法与技巧
MH - Adrenergic beta-1 Receptor Antagonists/administration & dosage/adverse effects/pharmacokinetics MH - Biological Availability MH - *Bisoprolol/administration & dosage/adverse effects/pharmacokinetics MH - Comorbidity MH - *Coronary Disease/complications/drug therapy/physiopathology MH - *Drugs, Generic/economics/pharmacokinetics MH - *Heart Failure/complications/drug therapy/physiopathology MH - Humans MH - *Hypertension/complications/drug therapy/physiopathology MH - Perioperative Care/methods MH - Therapeutic Equivalency MH - Treatment Outcome
1997年6月开始向全球开放
特色：具有收录范围广、内容全、检索途径 多、检索体系完备等特点，部分文献还可在 网上直接免费获得全文。
2. PubMed数据来源
MEDLINE： [pubmed-indexed for medline] In Process Citations：每天收录，尚 未经规范处理的数据。[pubmed-in process] Publisher-Supplied Citations：由出 版商提供的电子文献，每条记录标有 [PubMed-as supplied by Publisher]。
cbm与pubmed的检索式
CBM（我国生物医学文献服务系统）和PubMed（美国国立医学图书馆）是两个常用的医学文献检索工具，它们分别服务于国内医学科研和国际医学科研领域。
在医学研究中，科研人员经常需要使用这两个检索工具来查找相关文献，以支撑自己的研究工作。
本文将就CBM和PubMed的检索式进行一定程度的比较与展示，以便读者更好地了解两者的特点和使用方法。
1. 检索式的含义CBM的检索式是指在CBM数据库上进行文献检索时使用的关键词组合的格式表达方式。
通过输入检索式，用户可以快速、准确地找到所需的文献信息。
CBM数据库具有丰富的中文医学文献资源，其检索式一般由若干个关键词组成，以逻辑运算符（如AND、OR、NOT）连接。
PubMed的检索式也是指在PubMed数据库上进行文献检索时使用的关键词组合的格式表达方式。
PubMed数据库覆盖了全球范围内的医学文献资源，其检索式通常由英文关键词组成，同样可以通过逻辑运算符连接来实现多个关键词的组合检索。
2. 检索式的构建在CBM数据库中，用户可以根据自己的研究需求构建相应的检索式。
一般来说，可以使用中文关键词进行检索，也可以使用中英文混合的关键词进行检索。
CBM还提供了预设的主题词和分类号来辅助用户构建检索式，让用户能够更加准确地定位到所需的文献信息。
在PubMed数据库中，用户可以使用英文关键词进行检索，同样也可以通过逻辑运算符来构建检索式。
PubMed还提供了MeSH术语（医学主题词）等辅助工具，帮助用户更精准地构建检索式、查找文献。
3. 检索式的优化CBM数据库对检索式的长度和复杂程度没有特别的限制，用户可以根据自己的需求和研究主题来构建相应的检索式。
但是，为了提高检索效果，用户需要不断优化检索式，尽量减少检索式中的冗余信息，以保证检索结果的准确性和全面性。
在PubMed数据库中，用户同样需要不断优化检索式，以提高检索效果。
尤其是针对复杂的研究主题，需要更加精准地构建检索式，利用MeSH术语等资源来帮助优化检索式，缩小检索范围，找到所需的文献。
Pubmed数据库的检索
检索<American Journal of Pathology>上的关于 mad cow disease的文献
1/5/2021
Pubmed数据库的检索
24
Pubmed 常用字段
tag
Field name Tag field name
AB
Abstract摘要 TI Title
AD
Affiliation 单位 MH MeSH Terms主题词
1948Update everyday (Tuesday - Saturday)
1/5/2021
Pubmed数据库的检索
5
Pubmed简介(cont’d) Attention!
摘要型(Abstract)的数据库, 提供文献的线索 免费检索，部分文献（约5%）提供免费全文；
提供Link， Linkout 指向Free source on the Net 或者自己的图书馆已经购买的电子期刊全 文数据库中的全文
1/5/2021
Pubmed数据库的检索
2
1/5/2021
Pubmed数据库的检索
3
NCBI 数据库系统
1/5/2021
Pubmed数据库的检索
4
Pubmed简介(cont’d)
检索全世界生物医学期刊论文的重要工具； 学科覆盖范围：
临床医学、基础医学、护理学、牙科学、兽 医学、药理学、环境和公共卫生。 收录文献的时间范围：
16
" Kidney allograft “
1/5/2021
Pubmed数据库的检索
17
Kidney allograft [All Fields]
1/5/2021
PubMed外文数据库检索
介绍如何快速掌握使用PubMed。 Full Text Articles：
大部分为英语语种的文献，其中我国大陆期刊80多
种。
二、MedLine数据库使用形式
MedLine CD-ROM 由出版商将数据库制成了光盘，然后邮寄给用户 。 不同出版商的数据库检索界面略有不同，我国主要 引进Ovid（原Silver Platter)公司产品。检索界面与 CBMdisc类似。
PubMed的主体部分，记录末尾标有[PubMed-indexed for MedLine]。 （2）PreMedline
临时性的医学数据库，收录最新出版的文献，缩短文献报 道时差。PreMedline中的记录每天有进有出，新进的记录标有 [PubMed-in process]，标引好主题词和文献类型等字段的记录 转入Medline。
检索区 主要功能区 辅助功能区
二、PubMed主页简介
1.检索区 位于主页上方，通过点击数据库栏列表中PubMed旁
边的下拉菜单，根据实际检索需要可以更改数据库（主 要用来检索的数据库有：all database、PubMed、 Protein、Nucleotide、GSS、EST、Structure、Genome 等），高级检索（Advanced ），点击Help可查看检索帮 助，在检索式输入框中输入检索式，点击“Search”按 钮，可执行检索操作。
PMID(PubMed Unique Identifier)号,用PMID号可快 速检索到该ID号对应的文献。
提纲
一．PubMed概述 二．PubMed主页简介 三．PubMed检索规则 四．PubMed的检索途径和方法 五．PubMed的检索结果处理
二、PubMed主页简介
PubMed主页面分为3部分 1. 检索区 2. 主要功能区 3. 辅助功能区
大部分为英语语种的文献，其中我国大陆期刊80多
种。
二、MedLine数据库使用形式
MedLine CD-ROM 由出版商将数据库制成了光盘，然后邮寄给用户 。 不同出版商的数据库检索界面略有不同，我国主要 引进Ovid（原Silver Platter)公司产品。检索界面与 CBMdisc类似。
PubMed的主体部分，记录末尾标有[PubMed-indexed for MedLine]。 （2）PreMedline
临时性的医学数据库，收录最新出版的文献，缩短文献报 道时差。PreMedline中的记录每天有进有出，新进的记录标有 [PubMed-in process]，标引好主题词和文献类型等字段的记录 转入Medline。
检索区 主要功能区 辅助功能区
二、PubMed主页简介
1.检索区 位于主页上方，通过点击数据库栏列表中PubMed旁
边的下拉菜单，根据实际检索需要可以更改数据库（主 要用来检索的数据库有：all database、PubMed、 Protein、Nucleotide、GSS、EST、Structure、Genome 等），高级检索（Advanced ），点击Help可查看检索帮 助，在检索式输入框中输入检索式，点击“Search”按 钮，可执行检索操作。
PMID(PubMed Unique Identifier)号,用PMID号可快 速检索到该ID号对应的文献。
提纲
一．PubMed概述 二．PubMed主页简介 三．PubMed检索规则 四．PubMed的检索途径和方法 五．PubMed的检索结果处理
二、PubMed主页简介
PubMed主页面分为3部分 1. 检索区 2. 主要功能区 3. 辅助功能区
pubmed文摘型数据库检索
（七）专题查询（Topic-Special Queries）
（八）其他工具与资源
• PubMed Mobile（移动PubMed） • Batch Citation Matcher（批量引文匹配器） • Clinical Trials（临床试验）
• LinkOut（外部链接）
三、检索结果的处理
基本检索页
Clinical nursing
检索结果页
高级检索入口
（二）高级检索（Advanced Search）
主题检索入口
（三 ）MeSH主题词检索
步骤一
（三 ）MeSH主题词检索
步骤二
（四）期刊数据库检索
期刊检索
相关期刊列表页
（五）单篇引文匹配器
（五）单篇引文匹配器
（六）临床查询（Clinical Queries）
1.PubMed的收录范围
•PubMed收录了全世界80多个国家5200多种生物医学期刊的
题录、文摘以及部分全文，绝大部分可回溯至1948年，部分
早期文献可回溯至1865年。 •PubMed已累积了2200多万条文献记录。 •内容涵盖了基础医学、临床医学、药学、预防医学、护理学 、口腔医学、兽医学、生物学、环境卫生、卫生管理以及信
一、数据库概述
PubMed是国际上最重要、最权威的生物医学文献数据库之 一，由美国国家医学图书馆（National Library of Medicine， NLM）下属的国家生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information，NCBI）研制开发。 其网址是/pubmed/ 或 /。
3．PubMed的主要字段
• PubMed的记录字段有60多个，可检索的字段
pubmed数据库检索ppt课件
Web of Science
学科覆盖面较广，不仅限于医学 领域，还涵盖了工程技术、物理 、化学、社会科学等众多领域， 提供引文追踪和分析功能；
Google Scholar
搜索引擎性质，可以搜索到各种 类型的文献，包括学术论文、专 利、会议论文等，覆盖面广泛。
06
PubMed数据库检索应用案 例
临床疾病研究检索案例
总结词
临床疾病研究检索案例
详细描述
PubMed数据库在临床疾病研究方面具有广泛的应用，例如检索关于糖尿病、心 血管疾病、癌症等领域的最新研究成果。通过关键词、主题词、作者等检索条件 ，研究人员可以快速获取相关文献，为临床实践和研究提供科学依据。
药物研发检索案例
总结词
药物研发检索案例
详细描述
在药物研发过程中，PubMed数据库也发挥了重要作用。研究人员可以利用PubMed数据库检索新药 研发相关的文献，了解药物的作用机制、药效学和药代动力学等方面的信息。这有助于加速药物研发 进程，提高新药的成功率和效益。
基础医学研究检索案例
总结词
基础医学研究检索案例
详细描述
基础医学研究是医学领域的重要组成部分，而PubMed数据库在基础医学研究检索方面 也有广泛应用。例如，研究人员可以利用PubMed数据库检索基因、蛋白质、细胞等方 面的最新研究成果，了解生命科学领域的最新进展，为进一步的基础医学研究提供思路
和方向。
提供多种检索方式，支持 关键词、作者、标题等字 段的检索，同时支持高级 检索和模糊检索。
数据库发展历程
01
02
03
04
1996年
美国国家医学图书馆（NLM） 建立PubMed数据库，最初只 收录MEDLINE数据库中的文献。
pubmed高级检索检索式
pubmed高级检索检索式
PubMed 高级检索检索式是一种用于检索 PubMed 数据库的检索工具，它允许用户通过组合多个检索条件来筛选符合条件的文献。
下面是一些常见的 PubMed 高级检索检索式:
- 作者检索式：使用 Author Search 功能，输入作者的名字、缩写或电子邮件地址，即可检索与该作者相关的文献。
- 期刊检索式：使用 Journal Search 功能，输入期刊的名称、缩写或出版商，即可检索在该期刊上发布的文献。
- 关键词检索式：使用 Subject Search 功能，输入与主题相关的关键词，即可检索与该主题相关的文献。
- 年代检索式：使用 Date Search 功能，输入日期范围，即可检索在该日期范围内发布的文献。
- 机构检索式：使用 Organization Search 功能，输入机构名称、缩写或电子邮件地址，即可检索在该机构发布的文献。
- 引用检索式：使用 References Search 功能，输入文献标题、作者、缩写或出版商，即可检索该文献被引用的文献。
需要注意的是，PubMed 高级检索检索式的具体使用方法和检索条件可能会因数据库的更新而有所不同，用户在使用检索式时需要根据实际情况进行选择和调整。
PUBMED数据库检索
PubMed - indexed for MEDLINE
提
纲
PubMed 概述 PubMed 的各种检索方法 PubMed 检索结果的处理 My NCBI
PubMed的基本检索界面
检索功能区
辅助功能区
检索途径与方法
基本检索 - Basic Search 高级检索 - Advanced Search 限定检索 - Limits Search 主题词检索 - MeSH Browser 特定文献查找- Citation Matcher 临床查询 – Clinical Queries
PUBMED具有自动词语匹配功能，系统将按顺 序自动使用如下3种索引，对检索词进行转 换后再进行检索。Mesh转换表、刊名转换表、 著者索引。如果在Mesh表找到相匹配的主题 词，系统用Mesh词和Text Word进行OR组配 检索。
Aspirin
强制检索
十年间发表的人类乙肝疫苗 临床试验研究的英文文献？
保存到剪贴板中的记录
My NCBI的注册与登录
保存到的检索式或记录
保存到NCBI中的记录
保存到NCBI中的记录
总
结
充分认识到PubMed在医学文献检索 中的重要作用 掌握PubMed的各种检索方法,包括基 本检索、限定检索、高级检索，重 点掌握主题词检索 掌握PubMed检索策略和检索记录的 存储 注册My NCBI帮助自己管理检索结果
PUBMED数据库检索
提
纲
PubMed 概述 PubMed 的各种检索方法 PubMed 检索结果的处理 My NCBI
PubMed数据库简介
PubMed是美国国立医学图书馆开发的生物医学信息 书目数据库MEDLINE的免费网络版 内容包括美国《 Index Medicus》、《 Index to Dental Literature》、《 International Nursing Index》和部分生命科学领域的期刊文献 内容涉及基础医学、临床医学、环境医学、营养卫 生、职业病学、卫生管理、医疗保健、微生物、药 学、社会医学等领域。 可检索1950年以来世界70多个国家和地区出版的 5,200余种生物医学期刊上发表的文献
提
纲
PubMed 概述 PubMed 的各种检索方法 PubMed 检索结果的处理 My NCBI
PubMed的基本检索界面
检索功能区
辅助功能区
检索途径与方法
基本检索 - Basic Search 高级检索 - Advanced Search 限定检索 - Limits Search 主题词检索 - MeSH Browser 特定文献查找- Citation Matcher 临床查询 – Clinical Queries
PUBMED具有自动词语匹配功能，系统将按顺 序自动使用如下3种索引，对检索词进行转 换后再进行检索。Mesh转换表、刊名转换表、 著者索引。如果在Mesh表找到相匹配的主题 词，系统用Mesh词和Text Word进行OR组配 检索。
Aspirin
强制检索
十年间发表的人类乙肝疫苗 临床试验研究的英文文献？
保存到剪贴板中的记录
My NCBI的注册与登录
保存到的检索式或记录
保存到NCBI中的记录
保存到NCBI中的记录
总
结
充分认识到PubMed在医学文献检索 中的重要作用 掌握PubMed的各种检索方法,包括基 本检索、限定检索、高级检索，重 点掌握主题词检索 掌握PubMed检索策略和检索记录的 存储 注册My NCBI帮助自己管理检索结果
PUBMED数据库检索
提
纲
PubMed 概述 PubMed 的各种检索方法 PubMed 检索结果的处理 My NCBI
PubMed数据库简介
PubMed是美国国立医学图书馆开发的生物医学信息 书目数据库MEDLINE的免费网络版 内容包括美国《 Index Medicus》、《 Index to Dental Literature》、《 International Nursing Index》和部分生命科学领域的期刊文献 内容涉及基础医学、临床医学、环境医学、营养卫 生、职业病学、卫生管理、医疗保健、微生物、药 学、社会医学等领域。 可检索1950年以来世界70多个国家和地区出版的 5,200余种生物医学期刊上发表的文献
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PubMed基本检索
自由词检索时 PubMed自动 将不规范的词 转换成规范的 词进行检索
自动词汇转换
PubMed基本检索
逻辑与（AND） --检出记录中同时含有检索词A和检索词B. 如：A AND B
A B 布尔逻辑组合 检索，常用的 逻辑关系词有 AND，OR， NOT等
逻辑或（OR） --检出记录中含有检索词A或检索词B或同时含有检索词A和B的文献。 如：A OR B A B
PubMed基本检索
hypertension[mh] AND 1995/01:1996/12[DP] AND review[pt]
检索 1995 年 到 1996 年出 版的关于高血 压方面的综述 性文献
PubMed基本检索
强制检索功能
PubMed允许使用双引号来强制系统进行短语检索。
如：在PubMed主页的检索提问框中键入“single cell”，并用 双引号引起来。点击“GO”按钮，系统会将其作为一个不可分 割的词组在数据库的全部字段中进行检索。 如果不使用双引号进行强制检索，系统就会将其分成2个词： single和cell检索，其检索表达式为：single AND cell. 很明显这 样的检索结果是不符合要求的。
PubMed基本检索
"cell"[ta]
期刊的标准检 索，是在期刊 名后面加字段 限定[TA]. 比 如:"cell"[ta]
PubMed基本检索
期刊数据库在 PubMed首页 导航栏的右下 角部分
期刊数据库
PubMed基本检索
截词检索 截词检索的作用：扩大检索范围，提高查全率。 截词符：用*表示，代表多个字符，将*加在检索词后可以表 示对所有以该词开头的词进行检索。 如：bacter*，可以检出bacter，bacteria， bacteriophage ， bacterium，等最多600个单词。
如果一个杂志名恰好是主题词或关键词，如：cancer， science，cell等，PubMed会首先将这些词转换成MeSH词表中的 主题词进行检索。因此，需要将检索请求进行标准化处理，即 在杂志名后面加[TA]。如："cell"[ta]
PubMed基本检索
Eur J Immunol
期刊的一般检 索，是在检索 输入框中键入 期刊名或期刊 的ISSN号
PubMed 数据库检索 石金
PubMed 数据库检索
• • • •
PubMed及NCBI相关数据库 认识PubMed PubMed检索方法 PubMed定题推送服务
PubMed 及相关数据库
• NCBI(National Center for Biotechnology Information，美国国立生物 技术信息中心)
逻辑非（NOT） --在含检索词A的记录中，去掉含检索词B的索
作者姓名检索 按照姓+名缩写（不用标点）的格式键入作者姓名，如： smith ja或jones k, 系统会自动在作者字段内进行检索。姓名第一 个字母可用大写也可用小写，姓前名后,姓用全称，名字一般用 缩写。 考虑到作者姓名的不同形式，PubMed采用自动转换功能进 行作者姓名检索，如：smith j将检索成smith ja, smith jb, smith jr 等。 精确检索：可以用双引号将作者名引起来，再加作者字段 限定[AU]，如："smith j"[au]，这样可避免PubMed自动转换，实 现精确查找。
PubMed基本检索 PubMed高级检索 PubMed主题检索 临床查询检索
PubMed 基本检索
• 在检索框中键入一个或多个英文单词（大写或小写均可），点击GO按钮， PubMed系统会自动在主题词表，期刊名表，短语表及作者索引中查询 与输入的词相匹配的形式，这就是它特有的“自动词汇匹配功能”。
• 提供生物医学的分析与计算工具，协助研究人员了解生物的语言--DNA在健 康与疾病中所扮演的角色 • 发展新技术协助了解调控健康与疾病的基本分子与遗传过程， 包括建立储 存与分析分子生物、生化与遗传学知识的自动系统；促进研究与医学社群使 用数据库与软件；协调生物技术信息的传递与管理；执行以计算机为基础的 进阶信息分析过程，用以分析生物重要分子的结构与功能。
PubMed基本检索
bacter*[TI]
截词检索可以 扩大检索范围 提高查全率。
PubMed基本检索
字段限制检索 采用字段限制方式进行检索，其规则是： 检索词1[字段标识] 逻辑运算符 检索词2[字段标识] 如：查找作者为crick在1993年发表的有关DNA方面的文献. DNA[mh] AND crick[au] AND 1993[dp]
/pubmed
认识PubMed
检索词输入框
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Summary
检索提示
作者AU 篇名TI 出处SO
文献类型(状态)
显示摘要
排序模式 显示数量
调整显示设置 可改变显示模 式，显示数量 及检索结果排 序
文献篇名 文献作者
作者地址
文献摘要
全文链接
在摘要显示模 式下可以看到 详细的文献信 息
英文文献
非英文的文献 篇名上有中括 号[ ]且注明 有语种
[ 篇名 ] 土耳其语 英文文献
电子优先
电子优先即最 新文献，一般 比印刷出版提 前三个月以上
2009年5月
2008年9月
PubMed 检索方法
• • • •
PubMed基本检索
字段限制检索 其规则是：检 索词+[字段 标识]
DNA[mh] AND crick[au] AND 1993[dp]
PubMed基本检索
常用检索字段描述和标识 Title[ti]：篇名字段 Abstract[ab]：摘要字段 Affiliation [ad]：著者地址字段。 Author name[au]：文章的作者，检索格式：姓+名。如："smith ja"[au] Journal title[ta]：期刊名称。如：cell[ta] Language[la]：论文出版语种。语种检索时可只输入前3个字母， 如：chi[la]=chinese[la]；English[lang]=eng[la] 比如：检索文章题目中含有高血压的中文文献 检索式:hypertension[ti] AND chi[la]
• 例如：检索肿瘤 (cancer)方面的文章。 • 在检索框中输入：“cancer”，再点击“Go”按钮。 PubMed将自动 地利用它的“自动词汇匹配”功能将重要的词语结合在一起，并将不规范 的词语转换成MeSH词表中规范的用词进行检索，比如，检索“cancer” 将自动转换为："neoplasms"[MeSH Terms] OR "neoplasms"[All Fields] OR "cancer"[All Fields]
PubMed基本检索
hypertension[ti] AND chi[la]
检索文章题目 中含有高血压 的中文文献
PubMed基本检索
常用检索字段描述和标识 Publication date[dp]: 出版日期。 日期检索的形式为：YYYY/MM/DD[DP] 检索一段时期内的文章，日期之间可以加冒号，如： 1993/01:1995/06[DP] Publication type[pt]: 出版类型。有综述，新闻，传记，临床试验等。 如：review[pt] MeSH terms[mh]：主题词字段。如：hypertension[mh] Subheadings[sh]: 副主题词。与主题词组配检索. 比如：检索1995年到1996年出版的关于高血压方面的综述性文献 hypertension[mh] AND 1995/01:1996/12[DP] AND review[pt]
可检索的数据库
• Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM)，人类遗传疾病相关文献数据库 • PopSet，族群演化分析相关研究资料 • Protein sequence database，蛋白质序列数据库（包含Swiss-Prot、PIR、PRF、PDB等数 据库与从GenBank、RefSeq核酸序列转译之蛋白质序列资料） • PubChem BioAssay，化学成分之生物活性筛选资料 • PubChem Compound，小分子化学物质结构 • PubChem Substance，具生物活性之化学物质筛选数据 • PubMed，科学文献报导数据库 • PubMed Central，科学文献数字全文数据库 • Site Search，可搜寻NCBI的网页与FTP • SNP，单点核酸多样性数据库(dbSNP) • Structure，分子模型数据(MMDB) • Taxonomy，以核酸或蛋白质为基础的分类学信息 • UniGene，人类unique基因序列数据库 • UniSTS，unique序列卷标地址数据库
可检索的数据库
• Books 出版社提供之数字生医图书与医生参考书籍数据库 • Cancer Chromosomes 美国国立癌症研究所的Mitelman Database of Chromosome Aberrations in Cancer数据库里已经整合好的cytogenetic、临床与文献相关数据 • Conserved Domain Database（CDD），蛋白质功能区块保留序列数据库 • 3D Domains，蛋白质功能区块立体结构数据 • Gene，包含许多物种的基因数据库 • Genome，包含超过800种物种的基因组数据库 • GENSAT，小鼠中枢神经系统基因表现图谱 • GEO Datasets，基因表现实验与生物芯片数值结果数据 • GEO Profiles，基因表现图谱 • HomoloGene，同源基因批注数据库 • Journals，期刊文献（包含PubMed） • MeSH，医学主题词数据库 • NCBI Web Site，所有NCBI网页 • NLM Catalog，美国国立医学图书馆馆藏书目、期刊、视听数据目录 • Nucleotide sequence database，核酸序列数据库（包含GenBank、RefSeq和PDB等三大序列 数据库）