【遗传学】第七章 数量性状遗传
数量性状遗传

数量性状遗传
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加性-显性-上位性遗传模型
❖ 对于一些性状, 不一样基因座位上基因 还可能存在互作效应, 即上位性效应。
❖ 基因型值包含加性效应、显性效应和上 位性效应
❖
G=A+D+I
❖
P=A+D+I+E
数量性状遗传
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现以 P G E 表示三者平均数, 则各项方差能够推 算以下.
P P2
2
G E
GE
G G E E 2
G G2 2G GE E E E2
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• 表型离均差平方和
• 基因型离均差平方和
• 环境影响造成离均差平 方和
• 基因型与环境条件互作 效应
P P2
G G2
E E2
G GE E
数量性状遗传
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• 若基因型与环 境之间没有互 作,即 :
G GE E 0
• 则表型离差平 方和等于基因 型离差平方和 加环境引发离 差平方和
数量性状遗传
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上式两边都除以n或n-1:
P P2 G G2 E E2
n
n
n
P P2
VP
n
G G 2
VG
n
E E 2
VE
n
VP VG VE
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VP VG VE
❖ 回交(back cross)是F1与亲本之一杂交。 ❖ F1与两个亲本回交得到群体记为B1.B2。
❖ B1表示F1与纯合亲本AA回交子代群体,
❖ F1 Aa ×P1 AA ,遗传组成是 1/2AA+1/2Aa
数量性状的遗传机制多基因假说

(一)、普通小麦籽粒色的遗传
1. 籽粒色的遗传控制。
红色×白色 ↓ F1(中间类型) ↓ F2(红色:白色) 15:1 63:1 两对基因 三对基因
3:1 一对基因
在一对基因F2的红粒中:1/3与红粒亲本一致、 2/3与F1一致,表现为不完全显性; 在二对、三对基因时:红色基因表现为重叠作 用,但是R基因同时表现累加效应——F2红粒 中表现为一系列颜色梯度,每增加一个R基因 籽粒颜色更深一些。
当环境与遗传独立时, VEG为0。
不分离世代(P1, P2, F1)个体间无基因型差异,即:VG=0, 因此:VP = VE 可用不分离世代表型方差估计环境方差; 分离世代(如F2)中,VP = VG + VE 。
2.遗传方差分量
由于群体遗传变异有三种类型,其遗传方差也可 进而分解为三种方差分量:
由于基因分离与组合,F2群体内个体间基因存在很大差 异,称为分离世代;
F2群体的穗长变异包含遗传因素引起的遗传变异(genetic variation)和环境因素引起的环境变异。
二、影响数量性状分布的因素
综合上述两例可知:影响数量性状分布,使之呈 连续分布,并进而呈正态分布的因素主要有两 个——基因对数增加(遗传变异)、环境因素(环 境变异)。
-2σ -σ
x=μ
σ
2σ
μ±σ占整个群体的68.26%; μ±2σ占整个群体的95.46%; μ±3σ占整个群体的99.74%。
超亲遗传(transgressive inheritance)
超亲遗传现象:植物杂交时,杂种后代的性状表现可 能超出双亲表型的范围。 例如:小麦籽粒颜色遗传;
数量性状的遗传名词解释

数量性状的遗传名词解释数量性状,是指在自然界或人工条件下产生的各种特征以数量的方式表现出来的遗传性状。
它指的是通过对种群中大量个体进行测量或计量,将结果以数量化的形式呈现出来的遗传特征。
数量性状通常具有连续变异的特征,即在一个种群中存在着一系列不同的表现形式,而不是像离散性状那样只有几个确定的表型。
在数量性状的研究中,有一些重要的遗传名词需要加以解释。
其中包括基因型、表型、遗传方差、环境方差、遗传相关等。
基因型是指个体在基因水平上的遗传组成。
它决定了个体对特定数量性状的表现。
每个数量性状通常由多个基因共同决定,因此基因型的组合将决定这些基因在个体上的表现形式。
表型是指个体在外部表现上的特征。
它受到基因型和环境的共同影响。
数量性状的表型通常呈现连续性变化,这是因为数量性状通常受到多种基因的共同作用,以及环境因素的影响。
例如,人体身高就是一种典型的数量性状,它受到多基因的影响,同时还受到营养、运动等环境因素的调节。
遗传方差是指数量性状中由基因所引起的表型变异程度。
它可以通过研究个体间的表型差异以及表型与基因型之间的关系来估计。
遗传方差的大小反映了数量性状中遗传因素的重要程度。
如果遗传方差较大,说明遗传因素在数量性状的表达中起到了重要作用,反之则说明环境因素的贡献较大。
环境方差是指数量性状中由环境因素所引起的表型变异程度。
环境方差通常通过比较同一种群中不同个体之间的差异来估计。
环境方差的大小表示了环境对数量性状的影响程度。
如果环境方差较大,说明环境因素在数量性状的表达中起到了重要作用,反之则说明遗传因素的贡献较大。
遗传相关是指在同一种群中不同数量性状之间的遗传联系。
它反映了一种或多种数量性状随着基因型的变化而变化的程度。
通过研究数量性状之间的遗传相关,可以了解不同数量性状之间的遗传关系及其对进化和适应的影响。
例如,身高和体重之间的遗传相关可以帮助我们理解这两个数量性状在人类进化中是如何相互影响的。
以上介绍了数量性状的遗传名词解释,包括基因型、表型、遗传方差、环境方差和遗传相关等概念。
数量性状遗传分析报告

总结: 红色素合成的深浅是基因剂量控制,即由R或C的
数目决定,每增加一个大写基因籽粒颜色更深一些.
R或C,红色增效基因(贡献等位基因) . R或C的效应可以累加. R的等位基因为r, r为减效基因(非贡献 等位基因).
红粒 × 白粒 ↓
F1 浅红粒 ↓
F2 红:白= 15:1
1/16深红;4/16大红;6/16中红;4/16淡红;(1/16 白)
深红 大红 中红 浅红 白色
表型比 1 : 4 : 6 : 4 : 1
R或C数目 4 3
210
• 实验结果的表型比例1:4:6:4:1和(a+b)4的 各项系数相同.
性状由n对独立基因决定时
则F2的表现型频率为:
( ½ R+ ½ r)2n
n = 2时 ( ½ R+ ½ r)2×2 =1/16+4/16+6/16+4/16+1/16 4R 3R 2R 1R 0R
n = 3时 ( ½ R+ ½ r)2×3 =1/64+6/64+15/64+20/64+15/64+6/64+1/64 6R 5R 4R 3R 2R 1R 0R
所以, H2=(VF2-VE)/VF2×100% = { VF2-1/3(VP1+VP2+VF1) }/VF2
例:玉米穗长遗传率 H2
• VF2=5.072 VF1=2.307 VP1=0.666 VP2=3.561 • VE=1/3(0.666+3.561+2.307)=2.088
=1/4×0.666+2/4×2.307+1/4×3.561=2.075 H2% =(VF2-VE)/VF2×
数量性状的遗传—数量性状基因定位(遗传学课件)

利用分子标记定位QTL(Qi),实质就是分析分子 标记与数量性状基因座Qi的连锁关系,即利用已知座位 的分子标记来定位未知座位的Qi,通过分子标记与Qi之 间的重组率,来确定Qi的具体位置。
注意把QTL与具体的群体相联系。 QTL有统计学特征 统计分析确定的QTL的位置也并
非物理上的位置。所以QTL位置与效应均有概率上的 含意。
型3种带型,这3种带型即代表某一分子标记的3种基因 型。如果将含有P1带型的个体赋值为1,P2带型的赋值 为3,杂合体赋值为2,即可得到数据化的分子标记图。
三、QTL作图一般步骤
(三)检测分离世代群体中每一个体的标记基因型
21 113 22
三、QTL作图一般步骤
(四)测量数量性状 测定作图群体的每个个体(系)数量性状值。如: 株高 百粒重 蛋白质含量 ……
四、基于混合线性模型的复合区间作图法 (MCIM)
朱军提出了用随机效应的预测方法获得基因型效 应及基因型与环境互作效应,然后再用区间作图法进 行遗传主效应及基因型与环境互作效应的QTL分析。
四、基于混合线性模型的复合区间作图法 (MCIM)
该模型可以扩展到分析具有加×加、加×显、显× 显上位性的各项遗传主效应及其与环境互作效应的QTL。
缺点:无法检测上位性效应和基因型与环境的互作; 当相邻QTL相距较近时,QTL间相互干扰使QTL的
位置和效应估计出现偏差; 每次检验仅用两个标记,其他标记的信息未加利用。
三、复合区间定位法(CIM)
Kao 和Zeng等(1999)提出了多重区间作图法进 行基因定位,这种方法也是以极大似然法估算遗传参 数,突破了回归方法的局限性,可同时在多个区间上 检测多个QTL,使QTL作图的精确度和有效性得到了改 进。
动物遗传学-数量遗传学基础

3 数量性状表型值的剖分
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由于D和I带有一定的随机性,一般将它们与环境偏 差合并,统称为剩余效应。
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第二节 通径理论
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1. 概念
自然界任何两个或多个事物之间的关系不外乎两种情况:一 种是平行关系;另一种是因果关系。 所谓平行关系是指事物间不分因果,只是互为因果或两者具 有共同原因以致相互关联。 例如:猪的瘦肉率部分决定于臀肉率,部分决定于腰肉率。 臀肉率与腰肉率有一定关系,但在它们之间很难确定哪个是 “因”,哪个是“果”。
2 同一个纯系,甚至是同一个植株所结种子,重量差异更大,变 化范围20-70mg,但这种差异在相继世代是不能遗传的,纯系 内的差异是由于环境条件造成的,在纯系内选择是无效的。
例如,在他的第15个纯系中选出重量为20mg和60mg的种子种植, 其后代平均种子重量分别为46.9mg和45.6mg,均接近该纯系群体 的平均种子重量45.0mg。
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将控制一个数量性状的所有基因座上基因的 加性效应总和称为基因的加性效应值,它可以 通过育种改良稳定改进。个体加性效应值的高 低反映了它在育种上的贡献大小,因此也将这 部分效应称为育种值。
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一、遗传力
数量性状的表现既受到个体遗传基础的控制, 同时又受到所处环境条件的影响,而且这两种不同 的效应又可以作进一步的剖分。应该如何从量的角 度来推断出影响一个数量性状表现的遗传效应有多 大?环境效应有多大?
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3.控制数量性状的微效基因(Minor effect polygenes)与控制质 量性状的宏效基因(Major gene)都处于细胞核的染色体上, 多基因的遗传行为同样符合遗传基本规律,具有复制、分离和 重组、连锁和交换的特性。
4.由于微效基因的效应微小,多基因(Polygenes)并不能予以 个别辨认,只能按性状的表现在一起研究,对所涉及的基因对 数做粗略的估计。
遗传学-数量性状的遗传分析

三、微效基因表型值的推算
累加作用(每个显性基因的作用以一定的数值与纯隐性亲本 的表型值相加) 纯显性亲本表型值=每个显性基因表型值X纯显性亲本基因数+ 纯隐性亲本表型值 如短穗玉米x=6.6,长穗玉米x=16.8,F2中长、短穗各占群体 的1/16 4n=16,n=2 控制长穗玉米穗长的显性基因为2对(4个). 每个显性基因表型值=纯显亲本表型值-纯隐亲本表型值/纯显 亲本基因数=16.8-6.6/4=2.55 所以,含一个显性基因的玉米穗长:6.6+2.55=9.15cm 含2个显性基因的玉米穗长:6.6+(2×2.55)=11.7cm 依此类推。
狭义遗传率
计算基因的相加效应的方差VA在总的表型方差中所占的百分率。
Aa同AA回交的子代个体为B1,同aa回交的子代个体为B2。 B1的遗传方差的计算 f x fx fx2 AA 1/2 a 1/2a 1/2a2 Aa 1/2 d 1/2d 1/2d2 合计 1 1/2(a+d) 1/2(a2+d2) B1的遗传方差:VB1=1/2(a2+d2) -1/4(a+d)2=1/4(a-d)2 B2的遗传方差的计算 f x fx fx2 Aa 1/2 d 1/2d 1/2d2 aa 1/2 -a -1/2a 1/2a2 合计 1 1/2(d-a) 1/2(a2+d2) B2的遗传方差:VB2=1/2(a2+d2)- 1/4(d-a)2=1/4(a+d)2
例如小麦籽粒颜色两对基因控制的遗传动态 P 红R1R1R2R2 白r1r1r2r2 R1r1R2r2 红 1 4 6 4
F1
F2
1
4R
深红
3R
中深红
第七章数量遗传学基础

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多基因假说的实验依据
在对小麦和燕麦子粒颜色的遗传研究中发现,在若干个红粒与白粒的 杂交组合中有如下几种情况:
A
B
C
P1
红粒×白粒
↓
红粒×白粒 ↓
红粒×白粒 ↓
F1
红粒
↓
粉红粒 ↓
x1
x1 y
( y y)(x1 x1) x1 (x1 x1)2 y
(
x1
x1 )
(x2 (x1
x2 x1 ) 2
)
(
x1
x1 )
x1 y
(x1 x1)2 x1 x1
(x1 x1)2 y y
动物的经济性状(Economic trait)大多是数量性状 数量性状的特点: 变异的连续性 对环境的敏感性 分布的正态性 多基因作用的微效性
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对数量性状遗传变异研究的特点
对性状必须进行度量而不是进行简单的区分 必须应用生物统计的方法进行分析归纳,方 能了解数量性状遗传变异的动态 必须以群体为研究对象
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1.质量性状
能够从表型明显区别的性状,如毛色,角的有无 由一对或少数几对基因控制 不易受环境条件的影响 表型变异是间断的、呈不连续的性状 相对性状间大多有显隐性的区别,它的遗传表现 完全服从于三大遗传定律
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2.数量性状
是指那些在类型间没有明显界限,具有连续性变异的 性状,如产奶量,生长速度,体重,羊毛的粗细等
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精品文档 1 第九章 数量性状遗传 本章重点: 1. 数量性状的特征及与质量性状的区别; 2. 遗传率和在育种上的应用; 3. 近亲繁殖和回交的遗传效应; 4. 纯系学说和意义; 5. 杂种优势。 前述的遗传现象是基于一个共同的遗传本质,即生物体的遗传表现直接由其基因型所决定→可根据遗传群体的表现变异推测群体的基因型变异或基因的差异。 质量性状(qualitative trait)的特点:表现型和基因型的变异不连续(discontinuous),在杂种后代的分离群体中→可以采用经典遗传学分析方法研究其遗传动态。 生物界中还存在另一类遗传性状,其表现型变异是连续的(continuous) →数量性状(quantitative trait)。例如,人高、动物体重、植株生育期、果实大小,产量高低等。表现型变异分析→ 推断群体的遗传变异→借助数量统计的分析方法→分析数量性状的遗传规律。 数量性状的类别: ①严格的连续变异(Continuous variation) :如人身高;株高、粒重、产量;棉花纤维长度、细度、强度等; ②准连续变异(Quasi continuous variation):如分蘖数(穗数)、产蛋量、每穗粒数等,但测量其值时,每个数值均可能出现,不出现有小数点数字。 但有的性状即有质量亦有数量性状的特点质量-数量性状。 第一节 数量性状的遗传学分析 数量遗传学是在孟德尔经典遗传学的基础上发展而成的一门学科,但与孟德尔遗传学有明显的区别。 1918年,费希尔(Fisher R.A.) 发表“根据孟德尔遗传假设对亲子间相关性 的研究”论文→统计方法与遗传分析方法结合→创立数量遗传学。 1925年著《研究工作者统计方法》一书(Statistical Methods for Research Workers),为数量遗传学的研究提供了有效的分析方法。 首次提出方差分析(ANOVA)方法, 为数量遗传学发展奠定了基础。 精品文档 2
一、数量性状的多基因假说 根据多基因假说(multiple factor hypothesis),每一个数量性状是由许多基因共同作用的结果,其中每一个基因的单独作用较小,与环境影响所造成的表型差异差不多大小,因此,各种基因型所表现的表型差异就成为连续的数量了 (一)多基因假说的实验依据 A P 红粒 × 白粒 ↓ F1 红粒 ↓ F2 3/4红粒 : 1/4白粒 B P 红粒 × 白粒 ↓ F1 粉红粒 ↓ F2 15/16红粒 : 1/16白粒
C P 红粒 × 白粒 ↓ F1 粉红粒 ↓ F2 63/64红粒 : 1/64白粒 在A中,1/4红粒:2/4中等红:1/4白粒 在B中,1/16深红:4/16次深红:6/16中等红:4/16淡红:1/16白色 在C中,1/64极深红:4/64深红:15/64次深红:20/64中等红:15/64中淡红:6/64淡红:1/64白色 种皮颜色深浅程度与基因数目有关。 AABB × aabb ↓ F1 AaBb ↓ 精品文档 3
F2分为5类: (1)一个大写字母也没有,占1/16,其表型应该与玉米短穗的亲代植株一样; (2)一个大写字母,占4/16; (3)两个大写字母,占6/16,其表型应与子一代植株一样,即两个亲本的平均; (4)三个大写字母,占4/16; (5)四个大写字母,占1/16,其表型应与玉米穗较长的亲本一样。 表型分布比例为1:4:6:4:1 得出(1:2:1)n或(1/4+2/4+1/4)n,n为基因对数。 子一代植株虽然基因型彼此全都相同,但由于环境的影响,也呈表型差异,玉米穗的长度也是连续的,也是两头多少,中间多。 子一代与子二代不同,除了环境差异之外,还有基因型差异;所以虽然子二代的平均数与子一代一样,并且也是两头少,中间多,但总的变异范围要比子一代大。 玉米短穗品系,穗长5~8厘米,长穗品系,穗长13~21厘米,它们进行杂交,实验结果证实了:两个亲本品系和子一代的变异范围都比较小,子一代的平均数在两个亲本平均数的中间,;子二代的平均数差不多与子一代的平均数一样,但变异范围大得多,最短的与短穗玉米亲本近似,最长的与长穗玉米亲本相近。 许多数量性状是由很多基因控制的,每个基因间的相互作用在数量方面的表现,可以是相加的,可以是相乘的,也可能有更复杂的相互作用形式。 (二)多基因假说的要点 1、数量性状是许多对微效基因或多基因的联合效应所造成的。 2、多基因中的每一对基因对性状表型的表现所产生的效应是微小的。多基因不能予以个别辨认,只能按性状的表现一道研究。 3、微效基因的效应是相等而且相加的,故又可称多基因为累加基因。 (三)研究方法的特点 1、因为在杂交后代中,性状的数量差异并不显示孟德尔比例,所以个别或少数后裔所能提供的信息量很少,研究的单位必须从个体或个别世系扩大到群体和许多世系才可能获得对其遗传规律和动态的认识。 2、研究的性状差异不能仅仅用分组的方法将各个体按类别分组,而必须对个体的性状进行测量或称重,在阈性状方面则予以计数。 3、必须利用生物统计学的方法,计算性状的表型参数:平均、方差、协方差、相关、精品文档 4
回归等。在此基础上进而计算遗传参数:遗传率、遗传相关等。 4、微效基因之间往往缺乏显性。有时用大写字母表示增效,小写字母表示减效。 5、微效基因对环境敏感,因而数量性状的表现容易受环境因素的影响而发生变化。微效基因的作用常常被整个基因型和环境的影响所遮盖,难以识别个别基因的作用。 6、多基因往往有多效性,多基因一方面对于某一个数量起微效基因的作用,同时在其他性状上可以作为修饰基因而起作用,使之成为其他基因表现的遗传背景。 7、多基因与主效基因一样都处于细胞核的染色体上,并且具有分离、重组、连锁等性质。 二、影响数量性状的多基因也在染色体上 多基因也和其它基因一样,是在染色体上的,它们的传递法则(如分离、连锁等)也与一般基因大致一样的。 菜豆种皮紫色的种子较大,种皮白色的种子较小。杂交后,在子二代中,紫色:白色=3:1,子三代中1/3不分离,2/3作3:1的分离。白色和紫色是一对基因控制的,PP(紫色):Pp(紫色杂合体):pp(白色)=1;2:1。 但种子大小呈连续变化,其中PP、 Pp、pp三类中,每一类种子的平均大小是不同的。 可见控制种子重量的多基因中,有一部分与P和p基因连锁。 三、数量性状与质量性状的关系 遗传性状的分布有连续的和不连续的:表现不连续分布的性状称为质量性状;表现连续分布的性状称为数量性状。 1、由于区分性状的方法不同 在区分性状时,采用非红即白的方法,就表现为质量性状,如测定性状时采用定量的方法,就表现为数量性状。 2、由于用于杂交的亲本间相差基因对数的不同 虽然性状本身由多对基因决定的,应表现为数量性状,但如果用于交配的两亲本就这一性状而言只有一对基因的差别,这样就表现为质量性状了。 3、由于观察的层次不同 虽然基本物质的含量呈连续分布,是由多基因控制的,但性状的改变仅发生于基本物质达到或超过某一阈值时,所以多基因控制的性状,外观上也可以表现为非此即彼,全或无的性状。 精品文档 5
四、数量性状和选择 性状的连续变异是遗传变异和非遗传变异共同作用的结果,但在一个自花授粉植物的单粒种子后代——纯系——内,基因型是一致的,是高度纯合的,变异只是环境影响的结果,是不遗传的,所以在纯系内进行选择是无效的。 不过,即使是自交植物,在基因型完全一致还是少有的,因而进行选择,除能品种的原有优良特性外,有时可有所改进。 如果性状的差异主要是由于基因的差异所造成,那么选择肯定是有效的。 一般讲,两个品系杂交,子二代中出现的不同基因型种类是极为众多的,所以,在杂种后代中进行选择是很有效的。 第二节 分析数量性状的基本统计方法 数量遗传学→研究数量性状在群体内的遗传传递规律→ 将总表现型变异分解为遗传和非遗传部分→提供相关信息。 ∴在研究数量性状的遗传变异规律时,需采用数理统计的方法。 统计参数(Parameter): 1、平均数(mean):表示一组资料的集中性,是某一性状全部观察数(表现型值)的平均。 μˆ 表示平均数、x 表示资料中各个观察数、n 为观察的总个数、k 为组数、f 为频率, 表示从1至n的累加。 2、方差(variance,V)和标准差(standard devation,S):表示资料的分散程度,是全部观察数偏离平均数的重要参数。 V 和S 越大,该资料变异程度越大,则平均数的代表性越小。 分母用n只限于平均数是由理论假定的时候。假使平均数是从实际观察数计算出来的,那么就要除以(n-1)了。 方差一定是正的。如果观察数与平均数的偏差大,方差就大;如果观察数与平均数的偏差小,方差就小。 方差是就样本中个体的观察数来说的,是表明各个观察数与平均数的偏差程度,方差大,表明分布范围广,方差小,表示各观察值比较接近。平均数也可看作是从很多平均数中取得的一个样本,所以也有它自己的方差,平均数的方差要比个体观察数的方差小。 一般:育种上要求标准差大,则差异大,有利于单株的选择;