琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒大比对

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胶回收QC操作标准

胶回收QC操作标准

琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒(离心柱型)QC标准操作流程1. 实验试剂和耗材1.2 实验试剂1.3 耗材2. 实验操作流程胶回收试剂盒的检测须进行两个实验验证,第一个实验为GelRed染色法,第二个实验为EB染色法。

2.1 GelRed染色法2.1.1 1.5%琼脂糖凝胶的制备(1)准确称取1.5g琼脂糖置于250ml三角锥形瓶中,添加125ml 1×TAE溶液。

(2)轻微混匀后将其置于微波炉中,高火加热6min至溶液沸腾,取出锥形瓶放置室温2min。

(3)添加1×TAE溶液至110ml,再次于微波炉中高火加热3min至溶液沸腾。

(4)室温放置10min后将溶液倒入插有梳子的胶槽内,待胶块凝固后使用。

2.1.2 胶回收实验(1)取6个2ml离心管,依次编号为1-6号,使用分析天平准确称取空离心管的重量。

(2)用干净锋利的手术刀片切下不含核酸染料的1.5%琼脂糖凝胶胶块,放入已称重的2ml离心管中,称取胶块与离心管总重,计算凝胶块的重量。

要求胶块重量不超过200mg 为宜。

(3)添加溶胶液Binding Solution B,要求1、2号管中每100mg琼脂糖凝胶加入200ul Binding Solution B,3、4号管中每100mg琼脂糖凝胶加入300ul Binding Solution B,5、6号管中每100mg琼脂糖凝胶加入400ul Binding Solution B.(4)每管中添加50ul DL2502,混匀后置于60℃水浴5min,期间间断混合,直至凝胶块完全融化。

【注意事项】观察各管内溶胶液溶解胶块的快慢程度。

(5)将上述混合液转移至套放于2ml收集管的GenClean柱中,室温放置2min,10000rpm 室温离心1min,取出GenClean 柱,并倒掉收集管中废液。

(6)将GenClean 柱重新放回收集管中,加入500ul Wash Solution,于12000rpm,室温离心1min,倒掉收集管中废液。

DNA凝胶回收(试剂盒)

DNA凝胶回收(试剂盒)

DNA凝胶回收(试剂盒)
1.在紫外灯下切下含有目的DNA的琼脂糖凝胶,用纸巾吸净凝胶表面液体并切碎。

计算凝胶重量。

该重量作为一个凝胶体积。

(提前记录1.5ml离心管重量,100mg等于100ul体积)
2.加入3个凝胶体积的Buffer DE-A,混合均匀后于75℃加热(低熔点琼脂糖凝胶于40℃加
热),间断混匀(每2-3Min),直到凝胶块完全融化。

(约6-8Min)
注意:buffer DE-A为红色。

帮助观察凝胶是否完全融化。

3.加0.5个buffer DE-A体积的Buffer DE-B,混匀。

(当分离的DNA片段小于400bp时,需再加入一个凝胶体积的异丙醇)
注意:加入buffer DE-B 为黄色
4.吸取3中混合液,转移到DNA制备管中(2ml试剂盒内提供的离心管)中,12000g离心1Min,室温放置2Min。

弃滤液。

5.将制备管置于2ml 离心管中,加500ul buffer W1,放置2Min,12000g离心30s 弃滤液。

6.将制备管置于2ml 离心管中,加700ul buffer W2,放置2Min,12000g离心30s 弃滤液。

重复一次,不过时间为1Min。

7.将制备管置于2ml 离心管中,12000g再离心1Min。

8.将制备管置于洁净的1.5ml的离心管中(试剂盒内提供),在制备膜中央加入25-30ul Eluent,室温静置1min,12000g 离心1min 洗脱DNA.可暂放-20冰箱中。

爱思进胶回收说明书

爱思进胶回收说明书

爱思进胶回收说明书
爱思进胶回收试剂盒的使用说明书如下:
1. 制备琼脂糖凝胶电泳:将PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳,根据Marker 判断PCR产物的大小是否符合要求。

2. 切胶:切下包含目的片段的凝胶,尽量切去上下两端的凝胶,以减少非特异性产物的影响。

3. 胶的融化:将切下的凝胶放入一个离心管中,加入适量的胶融化液,使凝胶完全溶解。

4. 洗涤:将凝胶溶液加入一个离心柱中,离心柱的管底会有一个膜,可以吸附凝胶中的DNA片段。

然后加入洗涤液,将离心柱离心,去除残留的胶融化液。

5. 洗脱:加入适量的洗脱液,离心柱离心,将DNA从膜上洗脱下来。

6. 检测:取洗脱液进行电泳检测,观察电泳结果是否包含目的片段。

以上是爱思进胶回收试剂盒的使用说明书的大致步骤,由于不同版本的产品可能存在差异,因此建议在使用前仔细阅读说明书或咨询专业人士。

DNA凝胶回收试剂盒产品说明书

DNA凝胶回收试剂盒产品说明书

北京四正柏生物科技有限公司网站: 客服热线:400-7060-959技术支持:DNA 凝胶回收试剂盒产品编号规格MDN3066-5050次MDN3066-100100次保存条件及效期:常温运输和保存,保质期一年。

产品描述:本试剂盒用于从琼脂糖凝胶中或DNA 反应体系中(如PCR 反应)回收DNA 片段。

试剂盒采用可以高效、专一结合DNA 的硅胶膜和独特的溶胶体系,或DNA 反应体系中回收的单链、双链及环状DNA ,回收效率可达50-90%(跟片段大小相关)。

得到的DNA 可直接用于连接、转化、酶切、测序、杂交等分子生物学实验。

产品组分:使用方法:1.凝胶回收:切取含DNA 片段的琼脂糖凝胶(100mg 左右,尽可能多地把多余的胶切除,否则会影响回收效率),放入一干净的1.5ml 塑料离心管(自备)中,用移液枪头捣碎,按重量比为1:3到1:5的比例加入通用溶胶液(100mg 琼脂糖凝胶需要加入300μl-500μl 通用溶胶液)。

PCR 产物回收:直接在PCR 反应管中加3-5倍体积的通用溶胶液,混匀,然后跳过第2步、直接从第3步做起。

如果PCR 反应中使用了石蜡,需要预先去除。

2.50℃保温使胶完全溶化(一般需要5分钟),其间可以振荡数次以促进琼脂糖凝胶的溶化。

如果片段长度在300bp 成份50次包装100次包装通用溶胶液25ml 50ml 吸附柱活化液25ml 50ml 通用洗柱液50ml 100ml 离心吸附柱50套100套DNA 洗脱液10ml 10ml 说明书1份1份以下,建议不要加热,以免DNA变性,影响回收率。

3.在等待期间,活化离心吸附柱。

在离心吸附柱中加入0.5mL吸附柱活化液,套上收集管后室温放置2分钟,然后12,000rpm离心2分钟,倒弃穿透液,再将吸附柱套上收集管后待用。

活化后的离心吸附柱必须在当天使用。

4.在上柱前,在溶化的胶中加入相当于胶块体积1/2的异丙醇(对100mg胶块,加50uL),快速振荡10秒混匀。

实验十 DNA 片段从凝胶中回收

实验十 DNA 片段从凝胶中回收
探针制备反应完毕后,加蒸馏水至100ul(最后 体积)。 加入300ul碘化钠溶液,混匀。 以下步骤与“从琼脂糖凝胶中分离纯化DNA片段” 中步骤d到j相同。
DNA浓缩,去盐及去除杂质 浓缩, 浓缩
加入3倍量的碘化钠溶液于样品DNA溶液中(若 DNA为固态,则先将之溶于适量水或TE中,再加 3倍体积的碘化钠溶液)。 加20ul或更多的“基因纯”试剂(每ul该试剂可 20ul ul 吸附0.3ugDNA,操作者可根据这一指标自行决 定“基因纯”试剂的用量,但不应少于10ul)。 以下步骤与“从琼脂糖凝胶中分离纯化DNA片段” 中步骤d到j相同。
从凝胶中分离回收DNA的方法
现在常用的技术有: 电洗脱法 低熔点琼脂糖凝胶法 DEAE滤膜插片法等 其中电洗脱法,经济节省,操作方便, 对D NA的回收效果好。
低熔点琼脂糖凝胶法
65oC琼脂糖凝胶熔点 低熔点琼脂糖凝胶 37oC 液体
DEAE滤膜插片法
High efficient DNA high quality for microinjection <5kb fragment 100ng DNA fragment 10mmol/L EDTA(pH8.0) 5 minutes 0.5 mol/L NaOH 5 minutes 低盐缓冲液50mM/LTris .Cl 0.15M/L NaCl 10mM/L EDTA(pH8.0) 高盐缓冲液50mM/LTris .Cl 1M/L NaCl 10mM/L EDTA(pH8.0)
13.12000g,4℃下离心10分钟,得DNA沉 淀。 14.弃上清,加入70%乙醇洗涤2次后弃干乙 醇。 15.加入50µl TE溶解DNA。 16.取10µl DNA溶液加入2µl Loading buffer 于0.8%琼脂糖上, 40伏电泳,3小时。 17.在紫外透射仪上观察结果。 18.测定DNA溶液OD260,OD280值。

琼脂糖凝胶DNA片段回收中的常见问题

琼脂糖凝胶DNA片段回收中的常见问题
3、后续无法进行连接等实验操作
原因:洗脱液中含有乙醇
建议:洗脱前,确保柱子中乙醇已无残留乙醇。
琼脂糖凝胶DNA片段回收中的常见问来自 1、未回收到DNA片段或回收效率很低
A、原因:胶块未完全溶解
建议:为加快凝胶的溶解,应将凝胶置于55度水浴中溶解,期间不断上下颠倒,待确定凝胶完全溶解后再进行后续操作。每100 mg凝胶应加入100uL溶胶液,如果胶块过大,应将胶块切成小块,以便于凝胶溶解。
D、原因:洗脱缓冲液不合适
建议:洗脱液的pH值在7.0~8.5时,洗脱效率最高,洗脱液pH超出此范围,将会显著影响收获率,请使用试剂盒配套的Elution Buffer(pH 8.5,10mM Tris-HCl),或者使用使用pH值在此范围的ddH2O。
E、原因:洗脱缓冲液未加到离心柱中间
建议:因为在洗脱时使用较少的洗脱缓冲液,洗脱缓冲液应加在中间位置,并室温放置1~2分钟,然后再离心洗脱。另外,采用65度预热的洗脱Buffer将显著提高回收效率。
F、原因:起始回收量太少
建议:如果起始回收量很好的样品,应富集,最好使用不少于1ug的样品。对于PCR产物,应事先电泳检测产量,在进行回收操作。
2、电泳时,产物漂出点样孔
原因:洗脱时,柱子中残留乙醇
建议:在进行洗脱前,如果柱子上残留乙醇,将会影响洗脱效率,在洗脱前应再次离心,或者空气中放置几分钟,再进行洗脱。
B、原因:加入溶胶液过少
建议:对于PCR产物,或者酶切产物,应加入2倍体积的溶胶液。对于凝胶回收,每100 mg凝胶应加入不少于100uL溶胶液。对小于200bp的片段应加入5倍体积的溶胶液。
C、原因:DNA Wash Buffer 中未加入无水乙醇

从琼脂糖凝胶中回收DNA

从琼脂糖凝胶中回收DNA

五、实验结果与讨论
1. 实验结果 2. 讨论
附I: TaKaRa Agrose Gel DNA Purification Kit Ver2.0回收DNA 的操作步骤
1. 使用TAE或TBE缓冲液制作琼脂糖 凝胶,然后对目的DNA进行琼脂糖 凝胶电泳。 2. 在紫外灯下切出含有目的DNA的琼 脂糖凝胶。应注意尽量切除不含目 的DNA部分的凝胶,尽量减少凝胶 体积,提高DNA回收率。 注: 切胶时不要将DNA长时间暴露 于紫外灯下,以防DNA损失。
五、注意事项
切胶时不要将DNA长时间暴露于紫外灯下, 以防DNA损失。 胶块一定要充分融化,否则会严重影响 DNA的回收率。 混合振荡操作不要过于剧烈。 灭菌蒸馏水或Elution Buffer加热至60゜C 使用时有利于提高洗脱效率。 DNA需长期保存时,建议使用Elution Buffer。 纯化的DNA用于序列分析时,最好使用灭 菌的双蒸水进行DNA的洗脱。
四、百泰克DNA回收试剂盒 回收DNA的操作步骤
1. UV下切下DNA条带,尽量切除不含 DNA的凝胶; 2. 将切下的胶块放入1.5ml EP 管中,称 重; 3. 加2倍体积的溶胶/结合液DB(如凝胶重 0.1g,加200μl DB溶胶液); 4. 56℃水浴4-6 min 至胶完全溶解,每2 min涡旋震荡一次帮助加速溶解 ; (每100mg最初的凝胶重量加150ul的异 丙醇,震荡混匀)
3. 切碎胶块,可加快步骤6的胶块 融化时间,提高DNA回收率。
4. 称量胶块重量,计算胶块体积。 以1mg=1µ L进行计算。
5. 向胶块(1%)中加入3个凝胶体 积量的胶块融化液DR-1 Buffer。 6. 混合均匀后75゜C加热融化胶块。 并间断振荡混合,使胶块充分融 化(约6-10分钟)。

实验七 琼脂糖凝胶中dna片段的回收

实验七 琼脂糖凝胶中dna片段的回收

实验七琼脂糖凝胶中DNA片段的回收一.原理从琼脂糖凝胶中回收DNA片段.可得到大小一致的DNA片段。

有多种方法可用于琼脂糖凝胶中DNA片段的回收。

例如低融点琼脂糖法、洗脱法等。

本实验方法是先使凝胶被NaI溶解,然后DNA与玻璃粉结合,再从玻璃粉中洗脱出DNA片段。

二.方法1.在琼脂糖凝胶小电泳分离DNA片段,当DNA片段完全分开后,停止电泳。

2.在长波长紫外灯下观察凝胶,切下含所需的琼脂糖部分。

将胶放人预称重的微离心管中。

3.称含凝胶的离心管重量,每0.1g凝胶加200μl NaI溶液。

4.于50℃温育微离心管,每5min颠倒几次离心管混匀离心管,直到琼脂糖完全融解。

5. 每μg DNA加入5μl玻璃粉悬液。

轻轻颠倒使之混匀,于冰上放置10min,使DNA结合在玻璃粉上。

6.于室温离心5秒,收集结合有DNA的玻璃粉。

7.倒掉上清。

加700μl -20℃预冷的清洗缓冲液,轻轻地抽吸,使玻璃粉重悬浮。

冰上放置5min。

8.重复第6与7步两次,于室温离心10秒,使玻璃粉沉淀下来。

倒掉上清,重复离心,小心除去全部残存液体。

9.加入30~50μ1 TE,轻轻吹打使玻璃粉重悬浮。

于50℃温育10min,将DNA洗脱下来。

10.于室温离心l0秒,使玻璃粉沉淀下来。

将上清转移到另一管中。

小心,不要吸人玻璃粉,因为它可抑制许多酶的活性。

三.试剂1.玻璃粉(1)取30g玻璃粉(Sigma 325目二氧化硅)悬于200ml蒸馏水的烧杯中。

搅拌混匀后,静置9min。

(2)将上清转移到离心管中.于6000⨯g离心10min,沉淀玻璃粉。

(3)倒掉上清,将玻璃粉重悬于50ml 25%硝酸中,室温放置过夜。

(4)于6000⨯g沉淀玻璃,用无菌双蒸水洗涤,沉淀玻璃粉4一6次,直到pH值至中性。

(5)用无菌水重悬沉淀,配成10%的浆液。

(6)将此浆液分装成0.1ml一管.贮存于-70℃。

待用的样品呵贮存于-20℃或4⨯。

2.NaI溶液NaI 90.8gNa2SO3 15gddH2O至 100ml3.乙醇清洗液成分为:100mmol/L NaCIlmmol/L DETA,pH8.O10mmol/L Tris—HLc,pH7.550%乙醇四.说明1.本方法琼脂糖凝胶电泳缓冲液只能使用TAE,回收的DNA片段应在0.8~6kb之中。

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3. 评估方法 • 使用Nanodrop 2000测量OD值
图: 取2ul纯化的质粒DNA上样于1.0%琼脂糖凝胶电泳 分析结果。M: DL5000 DNA Marker. 结果表明,Magen的HiPure Plasmid Micro Kit与其它品 牌对应的产品效果相当,质粒条带完整,超螺旋质粒含量 高。
2. 琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒大比对
1. 选择品牌: • Qiagen, QIAquick Gel Extraction Kit , 28704 • Tiagen, 超薄琼脂糖凝胶回收试剂盒,DP208 4. 电泳结果
• Omega, E.Z.N.A. Gel Extraction Kit, D2500-02
1. 选择品牌: • Qiagen, QIAamp DNA Blood Mini Kit, D51104 • Tiagen, 血液基因组提取试剂盒(DP318) 4. 电泳结果
试剂盒回收DNA,然后电泳检测DNA回收效率。结果表明,
Magen的HiPure Gel Pure DNA Micro Kit在小片段和大片段上 有更高的回收率,其余片段则相差不大。
3. 评估方法

用1琼脂糖电泳分析DNA回收效率
Magen HiPure Gel Pure DNA Micro Kit(D2110)的优势:
3. 评估方法

用1琼脂糖电泳分析DNA回收效率
Magen HiPure PCR Pure DNA Micro Kit(D2120)的优势: 1. 高效去除引物二聚体。 2. 低洗脱体积,可低至7-10ul洗脱。 3. 长时间稳定的结合柱,无需平衡液处理 4. 更高的回收率
4.பைடு நூலகம்柱法血液DNA提取试剂盒大比对
1. 溶胶液体积耐受性好。1-3倍体积的溶胶液都可以获得同样的效果。 (实际用量只需1倍体积。) 2. 更高的回收率。对小片段DNA有更高的回收率。 3. 多种用途:凝胶回收,PCR产物回收,基因组DNA精制等 4. 低洗脱体积,可低至7-10ul洗脱。
3. PCR回收试剂盒大比对
1. 选择品牌: • Qiagen, QIAquick PCR Purification Kit , 28104 • Tiagen, 超薄产物纯化试剂盒, DP203 4. 电泳结果
• Omega, E.Z.N.A. Cycle Pure Kit, D6492-02
• Axygen, AxyPrep PCR 清洁试剂盒, AP-PCR-50 • Magen, HiPure PCR Pure DNA Micro Kit, D2120-02
2. DNA片段
图: 各种片段大小的DNA电泳后,分别用不同品牌的PCR产物
• 用1.0% 琼脂糖电泳分析质粒的图谱
• 使用ABI3730测序检测质粒的质量
1. 质粒小量提取试剂盒大对比
5. OD Reading和产量
Sample ID 260/2 80 1.89 2ml PCDNA3. 1 1.90 1.89 1.88 1.81 2ml pET28b 1.79 1.80 1.82 1.89 2ml PEGF-N1 1.90 1.9 1.88 260/23 0 2.20 2.20 2.10 2.21 1.95 1.84 1.81 1.95 2.20 2.20 2.2 2.21 Yield(u g) 25 23 24 25 7 5 5 6 25 23 24 25 Compan y Magen axygen Qiagen Tiagen Magen axygen Qiagen Tiagen Magen axygen Qiagen Tiagen
• Axygen, AxyPrep DNA凝胶回收试剂盒, AP-GX-50 • Magen, HiPure Gel Pure DNA Micro Kit, D2110-02
2. DNA片段
图: 各种片段大小的DNA电泳后,分别用不同品牌的胶回收
• 大片段:基因组DNA, 10KB DNA片段
• 中片段:1KB, 5KB的DNA片段 • 小片段:150bp和300bp DNA片段
6. 操作步骤比对
6.1. 柱子是否需要平衡液处理 需要:Tiagen, Omega 不需要:Magen, Axygen, Qiagen 6.2. 中和后离心时间(获得上清液) 10分钟离心:qiagen, Tiagen, Axygen 1分钟离心:Magen 6.3. 基因组/蛋白沉淀物去除效果 上清易有颗粒残留:qiagen, Tiagen, Axygen 上清澄清,沉淀贴壁紧:Magen
• Axygen, Axyprep Plasmid Mini Kit, AP-MN-P-50 • Magen, HiPure Plasmid Micro Kit, P1001-01
2. 使用菌液和菌种:
• 3ml培养过夜的菌液,OD600=3.0。
• 载体类型:pCDNA3.1, pEGF-N1, pET-28b.
• 大片段:基因组DNA, 10KB DNA片段
• 小中片段:300bp, 5KB的DNA片段 • 引物二聚体严重的PCR产物
回收试剂盒回收DNA,然后电泳检测DNA回收效率。结果表明,
Magen的HiPure PCR Pure DNA Micro Kit与其它品牌的产品有 着同样的回收率,但可更高效去除引物二聚体。
Magen与其它品牌大比拼
1. 质粒小量提取试剂盒大对比
1. 选择品牌: • Qiagen, Qiaprep Spin Miniprep Kit, 27104 • Tiagen, 质粒小量提取试剂盒,DP103
4. 电泳结果
• Omega, E.Z.N.A. Plasmid Mini Kit, D6943-02
Magen公司HiPure Plasmid Micro Kit优势: 1. 新型的碱裂解法,只需2分钟离心即可获得上清液。 2. 基因组DNA/蛋白质沉淀离心更彻底,上清更澄清。
结果表明,Magen 的HiPure Plasmid Micro Kit与其它品牌对 应的产品的产量和纯度都相当。
3. 长时间稳定的结合柱,无需平衡液处理
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