计算化学半经验方法
半经验方法简介

对于复杂的大分子的计算,目前由于受到计算机条件的限制,从头算还有困难,故往往采用各种近似方法.在半经验方法的计算中,从电子结构的一些试验资料估计最难以计算的一些积分.当使用模型法计算分子电子结构时,不再从原始的完正Hamilton量出发,而是从最简单的模型Hamilton量出发.这种Hamiltom 量只是粗略地考虑了分子中相互作用,通常包含一些待定的参数.
半经验法引入的化简极大地简化了必须的计算工作量,并且可能计算一些更复杂分子的电子结构.这种计算所得到的资料带有定性的和半定量的特性.实际上,如果该方法用于一些它力所能及的问题.计算结果的精确度通常足以说明所研究分子的性质,肯定或否定某中物理化学假定.
尽管在半经验方法中依据试验值对一些计算所进行的参数化补偿了计算方案的不足.但是,却不能苛求半经验方法面面俱到,使分子的各种电子性质的计算都有同样好的结果.因此,通常保证分子的某些电子结构性质好的计算方案对于另外一些电子结构性质有可能导出不适当的结果.于是,对于每种半经验方法,可以因各类具体参数化方案的不同而变的多样化.
在相当大程度上,每类参数化都是局限于分子的一些性质或一定种类分子的计算.因此,半经验方法不是以描述分子的全部特性为基本内容,而是着眼于比较同系物的某些性质.当足以正确地引入参数时,可以得到复杂化合物电子结构的定性或定量的资料,同系物分子的某些特性的变化规律,以及建立他们同试验观测的物理与化学性质的联系,显然,这些问题都是现代化学关注的中心.。
计算化学学习指南

计算化学学习指南计算化学学习基本要求:在学习了化学系列基础课程之后,通过本课程的学习,掌握化学中常用的数值计算方法,并能利用计算方法来解决化学中和部分工程实践中的实际问题,学习中坚持理论与实践相结合,才能更深刻的理解与运用理论,并在解决实际问题中,掌握理论和方法,培养学习能力、实践能力和创新能力。
计算化学学习的难点:学生学习计算化学时由于受原有化学、数学、计算机基础的制约,感到课程涉及知识面广,入门较慢。
尤其是对各种化学、化工知识的综合应用及编程需要有一个熟悉的过程。
计算化学的研究方法:传统意义上的计算化学要完成的任务一般包括以下几个方面:1.量子结构计算,分子从头计算(Schrodinger方程的精确解)、半经验计算(Schrodinger方程的估计解)和分子力学计算(根据分子参数计算),属于量子化学和结构化学范畴;2.物理化学参数的计算,包括反应焓、偶极矩、振动频率、反应自由能、反应速率等的理论计算,一般属于统计热力学范畴;3.化学过程模拟和化工过程计算等。
但是随着科学的发展,要界定计算化学的范围是很困难的,因为它是化学学科现代化过程中新的生长点,它与迅速崛起的高科技关系密切,深受当今计算机及其网络技术飞速发展的影响,正处在迅速发展和不断演变之中,研究的侧重点也因研究者及其所处的学术环境、原有基础和人员的知识背景而异。
在今后的一段时期内,计算机辅助结构解析、分子设计和合成路线设计将是计算化学的主题。
尽管实际上计算化学覆盖的面还要广得多,比较公认的研究领域至少有:1.化学数据挖掘(Data mining);2.化学结构与化学反应的计算机处理技术;3.计算机辅助分子设计;4.计算机辅助合成路线设计;5.计算机辅助化学过程综合与开发;6.化学中的人工智能方法等。
无论计算化学涉及的内容多么广泛,其核心依然是数值计算问题。
本课程主要学习利用用计算机解化学中的数值计算问题,一般包括以下几个步骤:1.对所要解决的问题进行分析,将化学问题转变为数学模型,选择所需的计算方法;问题分析是完成计算任务的基础,包括对问题所含物理化学意义的清楚认识。
计算化学5-半经验量子化学计算方法

计算化学5-半经验量子化学计算方法
且字数要求1500字以上。
半经验量子化学计算方法是指将理论计算中所使用的物理模型参数,
如原子核和电子结构模型,由实验定义的拟合参数改写,以改进理论计算
结果的方法。
在改写参数时,并不重新做精确的量子化学及密度泛函理论
计算。
而是将经验数据拟合后,用一组比较简单的系数来表示,从而节约
计算时间。
半经验量子化学计算方法一般分为两类:
1、基于解析模型(AM):AM是指根据经验数据构造出一种解析模型,用以表示原子核和电子结构模型参数。
其中,AM既可以是经典势模型(Classical potential models)形式,如Morse势模型,又可以是量子
势模型(Quantum potential models)的形式,如Boys势模型、
Hartree-Fock势模型等。
2、基于数据库(DDB):DDB是指根据经验数据构建一种具体的数据库,以存储各种原子核和电子结构模型参数。
与AM不同,DDB不构建具
体的模型,而是将所有原子核和电子结构模型参数都存储在数据库中,并
通过的方式获取这些参数,从而减少计算时间。
computational_chemistry-6 半经验分子轨道方法简介 (2) 计算化学理论和应用 教学课件

1993 Dewar,Jie,Yu
结构计算结果
键长,键角
1991 Stewart 包含Al,Si,P,S的分子
总结:对于周期表第二行的元素,PM3计算结果更好一些
二面角
对于小环分子有系统误差,偏“平”
其他:
1,杂原子间键长估计过短 O-O:0.018Å; N-N:0.7Å 2,H…H间相互作用势估计太高 OH间倾向于产生H…H相互作用,而非正常的氢键 3,对于氢键结构,PM3方法能很好的得到氢键的线性结构X…H-Y, 但是键长偏短0.2Å;AM1方法得到的水分子二聚体结构如下:
1
4
e2 gA
Hcore
S AB(I
e2 gB
2
1/ 2
Iv)
ΙΝDΟ
MΙΝDΟ/3
VAB ZAZB AB e2 / RAB AB exp(ABRAB)
MINDO/3相对于CNDO,INDO的改进:
1,STO函数的指数可调节 2,使用了生成热,分子几何构型的参数
H C
H
CC
reality
电多极矩的计算
分子a,Z方向外加均匀电场F,静电势为V=-Fz
U es F ea raz F
a
若外加电场不均匀
U es eaV A ra
a
可以将电势作Taylor展开
1
V A ra V ( A) ra (V ) A 2 ra ra ( V ) A
i1
11
qixi2 qiyixi
qizixi
qixi yi qiyi2 qiziyi
qixi qiyi
zi zi
qizi2
分子中电子密度
N/2
(r) 2 |i(r)|2
(完整版)化学毕业论文范文

(完整版)化学毕业论文范文中文摘要:乙酰甲喹是一种广谱,高效,低毒的兽药,受到人们的广泛应用。
其在动物体内的主要代谢产物为和,这是一对同分异构体。
为了更加透彻的了解乙酰甲喹在动物体内的代谢作用情况,我们就要研究其主要代谢产物。
在合成1-单氧乙酰甲喹和4-单氧乙酰甲喹后,得到RF 值不同的两个代谢产物,由于其是同分异构体,难以区分。
本文就以为理论基础,利用根据Balandina (Tetrahedron Letters 45 (2004) 4003–4007)及Timmons (J. Org. Chem. 2008, 73, 9168–9170)等人的研究,应用化学软件计算1-单氧乙酰甲喹和4-单氧乙酰甲喹的核磁数据,并与实验值进行比较分析,得到区分这一对单氧乙酰甲喹的方法。
关键字:1-单氧乙酰甲喹4-单氧乙酰甲喹同分异构体计算化学Gaussian 03 核磁英文摘要:Mequindox is a broad spectrum, vivo and the major metabolite, which is a pair of isomers. For more thorough understanding of Mequindox metabolism in vivo situation, we will study the major metabolite. In the synthesis of 1 - desoxymaquindox and 4 - desoxymaquindox, got two different RF values of metabolites, because of its isomers is difficult to distinguish. In this paper, that the theoretical basis for the studies of Balandina (Tetrahedron Letters 45 (2004)) and Timmons (J. Org. Chem. 2008, 73,), application of chemical software to the calculate 1 - desoxymaquindox and 4 - desoxymaquindox NMR data, and compared with experimental data analysis, to assigned the approach that distinguish this couple of desoxymaquindoxes.目录中文摘要(Ⅰ)英文摘要(Ⅱ)目录……………………………………………………………Ⅲ前言 (1)1.乙酰甲喹药物用途1.1理化性质1.2抗菌作用及其机理1.3临床应用2.计算化学2.1计算化学的产生2.2计算化学的发展2.3 计算化学的现状2.4计算方法3.应用软件——Gaussian 033.1 Gaussian 03的应用3.2基组的选择4.核磁4.1NMR理论计算研究方法概述4.2化学位移概述4.3计算方法及细节5合成与计算5.1试剂与仪器5.2合成步骤5.3计算方法分析与结论参考文献 (115)致谢……………………………………………………………118 附录…………………………………………………………………前言1.乙酰甲喹药物用途1.1理化性质乙酰甲喹,化学名为3-甲基-2-乙酰基喹噁啉-N-1,4-二氧化物。
半经验分子轨道法

半经验分子轨道法半经验分子轨道(Semiempirical Molecular Orbital,简称SEMO)法是在原子轨道(atomic orbital, AO)和无穷维经验势(infinite-dimensional empirical potential, IDEMPOT)法基础上发展起来的一类数值分子力场方法,是一种广泛应用的理论计算化学方法。
SEMO法利用内在分子结构表述分子潜在能,这一表述也就是所谓的偶合参量(parametrized MO coefficients)。
该法通过建立分子能算局和能算局来模拟分子吸引力场效应,该过程通过基反应性理论(basis reaction theory)的形式来处理,从而有效地计算出原子之间的协同能(conjugate energy),即所谓的Koopmans条件。
偶合参量不仅仅只用于构建分子能算局,还能够有效的模拟能量。
实际上,它们可以用来提出分子中基态的能量影响程度,从而为其他分子计算方法提供了一种基础。
SEMO方法允许以简便而准确的方式来研究复杂的分子系统。
该方法也被用来模拟与分子特性有关的实验数据。
在微观考虑上,在分子中受之力一般限制在500 米的范围内,而SEMO方法几乎可以做到不到100 米的精度。
另外,这种方法可以以一定精度用元素来代替原子,以减少理论计算的复杂性。
此外,SEMO也使得分子运动变得更加有效,如偶极矩(dipole moment )和加权模型(weight matrix)可以得到更完美的描述。
SEMO方法的缺点也是比较明显的,比如对对多原子分子系统量子化学计算无法达到满意的精度;而格点法(grid method)和量子点函数(quantum dot)自然可以处理更复杂的问题,比如电荷的分布,以及能量差的机理。
综上所述,半经验分子轨道法(SEMO)以其有效的模拟能量,高效的计算过程,可以有效的模拟密度的分布,以及本征态的稳定能,成为当今理论化学中不可缺少的一部分。
化学计算的基本方法和技巧

化学计算的基本方法和技巧[考点点拨] 高考考试说明中明确要求:化学计算应占试卷总分的15%左右,与有机化学、元素化合物具有同等的比例。
化学计算涉及的面很广,知识点也很多,是化学基础知识的重要组成部分。
化学计算是从量的方面来理解物质及其变化规律,加深对化学基本概念和基本理论的理解,并获得化学计算的技能、技巧,同时借助于化学计算的形式培养分析、推理、综合归纳等逻辑思维能力及解决实际问题的能力。
(一)化学计算的高考要求:1、掌握有关相对原子质量、相对分子质量及确定化学式的计算;2、掌握有关物质的量的计算;3、掌握有关气体摩尔体积的计算;4、掌握有关物质溶解度的计算;5、掌握有关溶液浓度(溶液中溶质的质量分数和物质的量浓度)的计算;6、掌握有关溶液pH与氢离子浓度、氢氧根离子浓度的简单计算;7、掌握有关燃烧热的计算;8、掌握利用化学方程式的计算;9、以上化学基本概念和基本理论、常见元素的单质及其重要化合物、有机化学基础、化学实验等知识内容中,具有计算因素的各类问题的综合应用。
(二)化学计算在高考试题中的两大类题型:1、选择型计算题;2、综合型计算题.因为选择型计算题的命题意图是以考查考生的计算能力为主,强调基本概念和基本原理的灵活运用,通过合理的巧妙的方法,不需要经过复杂的计算过程。
选择型计算题常见的解题方法有概念解析法、原理解析法、巧解法(如十字交叉法、差量法、守恒法、极值法、估算法等)。
主要考查学生思维的敏捷性和发散性。
命题趋势,继续保持技巧性强、智能要求高的题型。
[智能整合]解题特点:“不要过程,只要结果,解题入口宽,方法多。
”解题时应运用题干给的条件,备选答案给出的提示,采用灵活的方法进行巧解妙算,实施速解策略,则可事半功倍。
解题方法:要注意从题干上抓信息,从备选答案中找启示,从定量关系上作判断,从限制条件中寻答案,从例题分析中学方法,要能自觉运用估算、极限法、守恒法、差值法、平均值法、十字交叉法等去巧解速算。
初中化学计算方法归纳总结

初中化学计算方法归纳总结学习化学是少不了计算的,所以化学有很多的计算方法,把化学的计算方法总结起来还是很有必要的。
以下是店铺分享给大家的初中化学计算方法归纳,希望可以帮到你!初中化学计算方法归纳守恒法利用反应体系中变化前后,某些物理量在始、终态时不发生变化的规律列式计算。
主要有:(1)质量守恒;(2)原子个数守恒;(3)电荷守恒;(4)电子守恒;(5)浓度守恒(如饱和溶液中);(6)体积守恒;(7)溶质守恒;(8)能量守恒。
差量法根据物质发生化学反应的方程式,找出反应物与生成物中某化学量从始态到终态的差量(标准差)和实际发生化学反应差值(实际差)进行计算。
主要有:(1)质量差;(2)气体体积差;(3)物质的量差;(4)溶解度差……实际计算中灵活选用不同的差量来建立计算式,会使计算过程简约化。
平均值法这是处理混合物中常用的一种方法。
当两种或两种以上的物质混合时,不论以何种比例混合,总存在某些方面的一个平均值,其平均值必定介于相关的最大值和最小值之间。
只要抓住这个特征,就可使计算过程简洁化。
主要有:(1)平均相对分子质量法;(2)平均体积法;(3)平均质量分数法;(4)平均分子组成法;(5)平均摩尔电子质量法;(6)平均密度法;(7)平均浓度法……关系式法对于多步反应体系,可找出起始物质和最终求解物质之间的定量关系,直接列出比例式进行计算,可避开繁琐的中间计算过程。
具体有:(1)多步反应关系法:对没有副反应的多步连续反应,可利用开始与最后某一元素来变建立关系式解题。
(2)循环反应关系法:可将几个循环反应加和,消去其中某些中间产物,建立一个总的化学方程式,据此总的化学方程式列关系式解题。
十字交叉法实际上是一种数学方法的演变,即为a1x1+a2x2=a 平×(x1+x2)的变式,也可以转化为线段法进行分析。
(1)浓度十字交叉法;(2)相对分子质量十字交叉法等。
极值法当两种或多种物质混合无法确定其成分及其含量时,可对数据推向极端进行计算或分析,假设混合物质量全部为其中的某一成分,虽然极端往往不可能存在,但能使问题单一化,起到了出奇制胜的效果。
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由于表达式的比例系数中含有,因而称为方
法。此后Johnson对此进行了发展并实现了程序 化。
方法主要用于原子簇和配合物的计算。是计
算大分子、含重原子的大分子及研究催化剂、催 化反应、材料科学、固态物理和表面化学等的重 要工具。
2. 独立电子近似:共轭分子中,每个π电子是各 自独立地在分子实的势场中运动,用LCAO作 为π分子轨道的近似。
3. 用变分法解HFR方程中又作了一些近似:
相同原子轨道重叠积分为1,即: 1
不同原子轨道重叠积分近似为零,即:
0
单电子哈密顿实的对角元为:
非对角元,i,j若为相邻,令:
(j=i+1 )
Woodward和Hoffmann利用EHMO等方法作出 了合理解释,并提出了分子轨道对称性守恒原理。 1981年Hoffmann因此获诺贝尔化学奖。
方法
方法1951年由Slater提出。从Schrödinger 方程
出发,波函数用单Slater行列式表示,应用变分法 得到相应的HFR方程:
式中,动能h和库仑作用能的非交换部分Vc可用量 子化学方法严格计算,但库仑作用能的交换部分计 算很困难,采用Thomas-Fermi模型的统计平均方法 求解:
到这里为止和严格从头计算是一样的,但为了简化计算可 以在此计算公式基础上,根据已有化学知识开始考虑可能 的近似。
(一)价电子近似
由于在原子形成分子过程中,原子中的内层 电子变化很小,因此可以把原子中电子看成 二组,内层电子(原子实core电子)和价电子 ,然后把内层电子和价电子分开处理,这种 近似称为价电子近似。
半经验的近似计算法
由于从头计算对较大的分子体系计算时,随着体 系增大,相同基组下基函数数目增大,而要增加 的积分数目是与 N4(N是电子数)成正比,所以 要花大量时间去计算多中心积分。
半经验计算方法是求解HF方程时采用各种近似, 或者直接使用拟合的经验参数来近似求解自洽场 分子轨道方程 1.波函数 2.Hamilton算符 3.积分
完全忽略电子之间的相互作用,没有双电子积 分项,不能提供电子的激发能。
但就单电子项的效应在许多化学问题中处于支 配地位这一点来说,已经证实了该方法是一个 很有、越先进的 方法最恰当,而应该是对解决问题的程度来衡量。
例如:Woodward在合成维生素B12时发现,共 轭己三烯的衍生物环化时,并不产生预期的多种 异构体,而是具有明显的立体专一性。
EHMO方法于在六、七十年代国际上有相当多的 人应用。由于Fock矩阵数据主要来自实验(电离 势),若参数k调节得好一些,可以得到相当好 的定性结果。
尽管70年代开始出现从头算程序,但对于生物大 分子、稀土重原子等体系,在从头算仍然很困难 的情况下,EHMO仍有许多用武之地。
EHMO的主要弱点:
i,j若不相邻,则:
0(ji+1 )
双电子矩阵元忽略不记
、是实验值,一般近似地取原子轨道能量, 对共轭体系, 取双键所增加能量的二分之一。
HMO对hii和hij所作的假定是有别于其他理论的 特殊基本假定,它是考虑了分子中相互作用的最 主要因素,忽略了次要因素。
Hückel用HMO处理了比H2大得多的共轭分子体 系,成功地讨论了共轭分子的稳定性和电子结 构,预言了烯烃的加氢或环合的可能性。许多 定性结果令人满意。
HMO在实际应用中得到了4N+2规则,前线轨道 理论等重要规律性结论。
可以说HMO理论对于定性规律性结论仍然能发 挥作用,故HMO方法仍是大学教科书的内容。
EHMO方法(Extended Hückel Molecular Orbital )
20世纪50年代,计算机的出现为量子化学提供 了强有力的工具。1963年,Hoffman在HMO方 法基础上提出EHMO方法,在预见相对构象能 和有利的反应途径方面很成功。
EHMO是对HMO的扩展,在以下方面作了改 进:
1. 可用于非共轭体系。方程中要考虑全部价电子,在 LACO中应包括所有的价轨道。
2. 对所有重叠积分都要进行计算,计算时原子轨道一般取 Slater函数;
3. Fock矩阵元 只计算第一项单电子积分,双电子积分全部忽略不记。 考虑到所有原子之间的相互作用,所以单电子交换积分 不是简单地取、或0,而用
Roothaan Equation: FC = SCE
单电子作用 矩阵元
双电子作用 矩阵元
是双电子积分的一般表达式
若i,j,k,l来自四个不同原子的基函数,则称为双电子四中心 积分,同样若属二个原子,则是双中心积分,同样若属一 个原子,则是单中心积分;而hij是单电子积分,可能属单 中心,也可能是双中心积分。
几种主要的半经验 方法简介
HMO方法
早在20世纪30年代, Hückel运用原子轨道线性 组合的分子轨道,经过某些近似,成功地处理了 有机共轭分子。
将共轭分子的C-C 键骨架近似固定,只讨论在 骨架上移动的π电子。
HMO方法在三个基本近似的基础上又引入了许 多近似:
1. π电子近似: π电子可以从各原子实和内层电 子和电子所构成的分子骨架中分离出来,单独 处理,也叫Hückel近似。实践证明:在平面共 轭分子中,π电子近似是合理和可用的。
在各种近似的基础上形成了三类半经验计算方法:
1. 单电子近似 :完全不考虑双电子作用而挑选 的等效Hamilton算符,如EHMO方法
2. 用统计平均模型计算交换位能的X方法 3. 以零微分重叠(ZDO)近似为基础的计算方法:
如CNDO/2,INDO,NDDO,改进的MINDO, MNDO以及AM1,PM3等
代替。式中hii和hjj近似地取i和j原子轨道的能量,常数K取 1.75-2.0之间的值(要计算重叠积分)
即对Fock矩阵的设定:
对角元Fii一般取i原子轨道电离势的负值。 非对角元Fij是两个相应对角元平均值乘以重叠积 分和比例系数k:
Fij= k F—ii+—Fjj Sij 2
计算采用解HFR本征方程FC = SCE。从实验数 据获得一个初始Fock矩阵,经过一系列数学处 理,可解出本征值E和本征矢系数C,然后进入 下一轮跌代,反复此过程直至自恰。