线虫的EMS诱变和突变体筛选2015

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线虫的EMS诱变和突变体筛选

摘要:秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans,C. elegans)是一种被广泛研究的模式生物,其性状容易辨别,突变型多且容易获得。本实验用EMS诱变剂对同步化后的N2型怀卵成虫线虫进行不定向诱变,筛选出一系列的突变体,再通过对亲代突变体的子代进行进一步的筛选,筛选出F1、F2、F3突变体,最后获得性状稳定的、能够稳定遗传的突变体,可以将突变体至于-80℃保存。本次试验涉及到的生物技术有:无菌操作技术,同步化技术,EMS诱变技术,显微操作技术等。将获得的突变体与野生型作对比,可以在显微镜下观察到性状明显的突变体,将突变体转移、传代、保留,最后获得稳定的突变体。

关键词:秀丽隐杆线虫同步化EMS诱变无菌操作技术突变体

1.引言

秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans,C. elegans)是一种以细菌为食,居住在土壤中,无毒无害、可以独立生存的线虫。它有如下几个特点:①其个体小,成体仅1mm长,雌雄同体全身共有959个细胞,雄性线虫全身共有1031个体细胞;②为雌雄同体:雄性个体仅占群体的0.2%,可自体受精或双性生殖;③染色体组简单:只有5对常染色体和1对性染色体;④基因组便于研究:基因组大小仅为100Mb,并且内含子少,基因密度高;⑤生活周期短且随温度变化:线虫整个的生命周期仅3天(25℃)。野生型线虫胚胎发育中细胞分裂和细胞系的形成具有高度的程序性,这样就便于对其发育进行遗传学分析。温度越高,生活周期越短;⑥有大量突变株;⑦繁殖能力强:成虫一生可产300个受精卵;⑧易于保存:可以用-80℃冰箱长期保存

线虫作为模式生物,与酵母、果蝇、斑马鱼、小鼠和拟南芥等一起,为生命科学的发展做出了极大的贡献。它与其他模式生物相比,有自身优势,如:①它只有消化系统和呼吸系统,并且肉眼可见,容易研究;②它是目前最适合大规模药物筛选的多细胞动物,③它的研究成本低:既提供了一个完整动物实验系统,又避免了小鼠模型的高价费时等。但也有其缺点,如:①线虫的神经元细胞对RNAi不敏感;②线虫没有心脏、获得性免疫系统、呼吸系统等,所以一些人类疾病无法在线虫中模拟;③鉴于线虫与人类种间距离太远,线虫的作用仍是在药物研发初期,快速粗筛,提供线索,需要再经过哺乳动物模型的“细筛”。

基于线虫的自身体积小并且结构简单的优势,国内外众多的科研机构都在以线虫作为研究材料,在RNAi、衰老、药物筛选、功能基因组学等领域进行研究。研究发现,线虫中大约有35%的基因是在人体中具有等同作用,并且有大量人类遗传疾病同源基因,只有大约58%是线虫特有的,所以,从理论上讲, 只要人类疾病的靶蛋白或调控途径是物种间保守的, 就可能利用模式生物来进行研究。

目前,已经有许多成功的线虫病理模型,如:溶酶体病,阿尔茨海默症(Alzheimer’s, AD),多囊肾病(polycystic kidney disease),Duchenne 肌营养不良症,过氧化物体生物合成缺陷等。

甲基磺酸乙酯,简称EMS,是一种重要的致癌物之一,生物学上可以用来创建突变体库。本实验就是将EMS作为诱变剂来获得线虫的突变体。线虫有单基因突变形成的表型,例如:运动不协调(uncoordianated,Unc)、短胖(dumpy,Dpy)、打卷(roller,Rol)等,造成这些表型的基因有很多个,分别分布于各条染色体上。这些易于观察的表型作为遗传标记,给线虫的经典遗传学实验带来了极大的便利。此外,线虫还有许多组织特异性标记的品系,如在线虫中负责协调前后运动的D型运动神经元。我们通过对排卵时期的线虫进行诱变,观察诱变后线虫突变体表形,对突变体后代进行筛选,探究影响突变型基因的显隐性,

最终获得能够稳定遗传的突变体。

2.材料和方法

2.1材料、试剂和器材

实验材料:N2型秀丽隐杆线虫。

实验试剂:NGM(Nematode Growth Media)固体培养基、LB液体培养基、M9线虫生理溶液。

实验器材:培养皿、报纸、锥形瓶(500ml、300ml、100ml)、15ml离心管、蓝枪尖、黄枪尖、Ep管、5ml的塑料试管、高压蒸汽灭菌锅、离心机、酒精灯、移液枪(1000ml、200ml)。

2.2方法

2.2.1仪器的洗涤、包装与灭菌,相关溶液的配制。

(1)仪器的洗涤与包装

①用自来水洗涤55mm培养皿(我们组一次性洗12个培养皿),晾干后用报纸包装好,以待灭菌。

②洗涤500ml锥形瓶,300ml锥形瓶,100ml锥形瓶,15ml离心管若干,锥形瓶装入液体后,用锡纸封口,15ml离心管用报纸包好,以待灭菌。

③将蓝枪尖和黄枪尖塞入枪尖盒,用报纸包装好以待灭菌。

④将Ep管和5ml的塑料试管管放入玻璃瓶中,用报纸封口,以待灭菌。

(2)相关溶液的配制

①NGM(Nematode Growth Media)固体培养基的配置

按表1配置NGM固体培养基

表1NGM固体培养基的配方

②LB液体培养基的配置

按表2配置LB液体培养基

表2LB液体培养基的配方

③M9

按表3配M9线虫生理溶液

表3 M9线虫生理溶液的配方

(3)

①打开高压蒸汽灭菌锅,设置灭菌温度120℃和灭菌时间10分钟,待压力上升到0.05MPa 时,打开放气阀,放出空气,待压力表指针归零后,再关闭放气阀,高压锅继续升温,自动灭菌。

②在压力降到0.5MPa,可缓慢放出蒸气。当压力降到零后,才能开盖,取出灭菌物品。

2.2.2倾倒NGM平板,摇菌与铺板

(1)倾倒NGM平板

①紫外灭菌无菌操作台5分钟。

②双手用酒精消毒之后,点燃酒精灯。

③待固体培养基冷却至60℃,在酒精灯附近逐一倾倒平板,保证每个平板有NGM固体培养基约10ml。

④在培养皿皿盖上做好标记(包括组名,日期),待NGM固体培养基冷却后,如果不用菌液铺板,就用封口膜封口后倒置于4℃冰箱保存,如果菌液已经活化,则可直接铺板。(2)菌种的活化与铺板

①紫外灭菌无菌操作台5分钟。

②双手用酒精消毒之后,点燃酒精灯。

③取出两管高压后的15ml离心管,用移液枪吸取液体配养基3ml,加入原始的OP50菌液300μl,过夜摇菌。

④取200~300μl活化的菌液均匀地铺在NGM固体培养基里,用手摇动晃匀菌液,封口膜封口后,平置于操作台上待菌液被吸收。

⑤等菌液被NGM固体培养基吸收后(一般20分钟),在37℃培养箱倒置培养,等细菌长出薄薄的一层(一般12-24hr)即可接线虫或倒置放在4℃冰箱保存。

⑥摇菌剩余的菌种可以与甘油1比1混合,颠倒摇匀,至于-20℃保存。

2.2.

3.怀卵成虫的同步化

(1)选择一个含有大量怀卵成虫的培养皿,用3mlM9洗下,放入5ml的塑料试管,加入0.8ml20%次氯酸钠,0.4ml0.5M的NaOH(事先配置次氯酸钠和NaOH各1ml)。10min后,虫体破裂,溶液变澄清。

(2)3000转离心1min,弃上清。

(3)4mlM9,混匀,3000rpm,离心1min,弃上清。

(4)重复步骤(3)2~3次以去除残留的裂解液。

(5)加入0.2ml M9,混匀。

(6)将液体接种于NGM上,20℃培养,约56hr达到L4或20℃培养24hr,转至25℃培养大约21-22hr达到L4。

2.2.4.EMS诱变和突变体筛选

(1)无菌条件下,将培养皿中处于L4早期的雌雄同体线虫用5ml M9悬浮,用移液器转移至无菌离心管中。

(2)1000rpm离心30s,去除上清,加入2mL M9。

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