琼脂糖凝胶电泳的操作步骤

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DNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和操作步骤

DNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和操作步骤

DNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和操作步骤DNA的琼脂糖凝胶电泳是一种常用的分子生物学技术,用于分析DNA 的大小和纯度,以及进行DNA分子的分离和纯化。

凝胶电泳实验可以帮助我们确定DNA样本的大小和获得纯化的DNA片段供进一步研究使用。

下面是DNA琼脂糖凝胶电泳实验的原理和操作步骤。

【原理】DNA琼脂糖凝胶电泳是根据DNA分子在电场中的不同迁移速率来分离大小不同的DNA片段。

琼脂糖凝胶是一种凝胶状物质,其孔隙大小能够将DNA分子限制在一定范围内,较大的DNA分子迁移速率较慢,而较小的DNA分子迁移速率较快。

琼脂糖凝胶通常是在平均浓度为1%至2%之间的范围内制备,以便在不同大小的DNA分子之间提供适当的分辨率。

实验中,DNA样品通过切割酶或PCR等方法获得,样品经过核酸电泳缓冲液稀释,并在琼脂糖凝胶板上进行电泳。

凝胶板两侧连接电源,DNA 的带电粒子将在电场的作用下从负极迁移到正极,迁移过程中形成DNA的“条带”,条带的位置和长度反映了DNA的大小。

通常,DNA条带由荧光染料或核酸染料标记,以便在电泳结束后进行可视化。

【操作步骤】以下是DNA琼脂糖凝胶电泳实验的一般操作步骤:1.制备琼脂糖凝胶板:a.准备琼脂糖粉末和核酸电泳缓冲液(通常为TAE或TBE缓冲液)。

b.按照说明书将琼脂糖粉末溶解于核酸电泳缓冲液中。

c.将溶液加热至沸腾并搅拌,使琼脂糖完全溶解。

d.将溶液倒入预先准备好的电泳仓中,插入梳子或制备好的孔板,使其凝固。

2.样品制备:a.提取DNA样品并测定其浓度。

b. 将DNA样品稀释到适当浓度,通常为10-50 ng/μL。

c. 添加适当的加载缓冲液,通常是一些染料和甘胺酸(glycine)或其他添加剂。

3.DNA加载和电泳:a.打开琼脂糖凝胶仓盖,将DNA样品负载于凝胶孔内。

b.将DNA负载区域和样品标注在电泳仓中,以便在电泳结束后可以准确识别DNA带。

c.关闭盖子,将电泳仓放入电泳设备中。

琼脂糖凝胶电泳流程

琼脂糖凝胶电泳流程

琼脂糖凝胶电泳流程
琼脂糖凝胶电泳是一种用于分离和分析DNA、RNA 或蛋白质等生物大分子的技术。

以下是一般的琼脂糖凝胶电泳流程:
1. 准备电泳缓冲液:根据需要选择适当的电泳缓冲液,如TAE (Tris-乙酸-EDTA)或TBE(Tris-硼酸-EDTA)缓冲液。

缓冲液用于维持电泳过程中的酸碱平衡和离子浓度。

2. 制备琼脂糖凝胶:将琼脂糖粉末加入电泳缓冲液中,按照一定的比例加热溶解,制备琼脂糖凝胶。

通常根据需要选择不同浓度的琼脂糖凝胶,如0.8%、1%或1.2%等。

3. 制备样本:将待分析的DNA、RNA 或蛋白质样本与适量的电泳缓冲液混合,使其溶解或悬浮。

4. 加载样本:将样本小心地加载到琼脂糖凝胶的孔中,可以使用移液器或微量注射器。

加载时要避免产生气泡。

5. 电泳:将加载好样本的琼脂糖凝胶放入电泳槽中,连接电源,进行电泳。

根据样本的性质和目的,选择适当的电泳条件,如电压、电流和电泳时间。

6. 观察和记录:电泳过程中,DNA、RNA 或蛋白质样本会根据其大小和电荷性质在凝胶中移动。

可以通过染色或荧光染料来观察和记录样本的迁移情况。

7. 分析结果:根据样本在凝胶中的迁移距离和位置,可以判断样本的大小、纯度和数量等信息。

还可以通过凝胶成像系统对电泳结果进行拍照或分析。

具体的琼脂糖凝胶电泳流程可能会根据实验目的和样本类型有所不同。

在进行实验前,建议仔细阅读相关的实验手册和操作指南,并根据实际情况进行适当的调整和优化。

琼脂糖凝胶电泳详细过程与步骤分析

琼脂糖凝胶电泳详细过程与步骤分析

琼脂糖凝胶电泳详细过程与步骤分析琼脂糖凝胶电泳(agarose gel electrophoresis)是一种常见的分离和鉴定DNA和RNA分子的实验技术。

它基于DNA和RNA分子在电场中对琼脂糖凝胶的移动速率的差异来进行分离。

以下是琼脂糖凝胶电泳的详细过程与步骤分析:1.准备琼脂糖凝胶:-准备琼脂糖溶液:按照规定比例在缓冲液中加入适量的琼脂糖并混匀。

-加热琼脂糖溶液:将琼脂糖溶液加热至完全溶解,通常在微波炉或水浴中进行。

-倒入模具:在凝胶电泳槽中设置模具,倒入热琼脂糖溶液并待其凝固。

2.准备样品:-提取DNA或RNA:采用适当的提取方法从待测样品中提取所需的DNA 或RNA。

-混合DNA或RNA与加载缓冲液:将提取的DNA或RNA与适量的加载缓冲液混合,以增加样品密度并提供电泳所需的离子浓度。

3.加载样品:-打开模具和样品孔:在琼脂糖凝胶上方打开模具,使用注射器或微量吸管在样品孔中加入适量的样品。

-加载DNA或RNA标记物:如果需要对DNA或RNA进行标记,则需要在样品中加入适量的荧光标记物,并在加载完样品后用紫外灯进行可视化检测。

4.进行电泳:-连接电极:将电泳槽连接到电源,将阳极和阴极电极分别插入缓冲液中的两端。

-调节电流:将所需电流值设置在电源上,并进行预运行电流以使电流通过样品和凝胶。

-进行电泳:打开电源,开始电泳过程,直到样品达到适当的分离位置。

5.可视化与分析结果:-停止电泳:当DNA或RNA样品达到预期位置时,关闭电源并断开电极。

-可视化:用染料(如乙溴橙)染色凝胶电泳的凝胶,或使用紫外灯照射凝胶以可视化DNA或RNA标记物的荧光。

-分析结果:使用图像捕捉设备(如凝胶图像系统)记录凝胶的图像,并根据DNA或RNA标记物的迁移距离和大小进行结果分析。

琼脂糖凝胶电泳步骤

琼脂糖凝胶电泳步骤

琼脂糖凝胶电泳步骤实验前准备及注意事项:将所要用到的制胶锥形瓶、胶槽、梳齿等物品清理干净,如有残胶,需将残胶尽量去除。

注意:所有用来跑核酸胶的物品,只要接触过核酸染料,一定要专门放置,专物专用,不要再将污染过的物品随意放置,以免污染其他物品。

接触过核酸染料的手套不要再碰非污染区的物品。

制胶和拿取核酸胶时佩戴一次性PE手套,再操作其他地方时将一次性手套丢弃。

实验步骤:1.按每100ml 1×TAE/TBE缓冲液中加入1g琼脂糖(1%的胶,根据核酸大小选择制胶的浓度,一般情况用1%-2%的胶)的比例,称取琼脂糖,加入专门制琼脂糖凝胶的250ml-500ml的锥形瓶中。

2.按比例量取适量的1×TAE/TBE缓冲液,加入到锥形瓶中的琼脂糖一起,适当摇晃锥形瓶初步混匀。

3.将混合液放入微波炉中,用中高火加热,加热总时间可根据制胶总量调整,一般40ml左右的胶量加热90s左右。

如果制胶量大,记得每加热1min左右将瓶从微波炉中取出,轻轻晃匀后,再继续加热,以免局部过热导致胶溢出。

注意:取出加热后的瓶时,记得垫上纸,防止烫手!4.待胶加热好,完全溶解后,稍晾凉至45-55℃左右(以基本不太烫手为宜)按照1:10000的比例加入核酸染料(如100ml胶加10ul染料),迅速摇匀。

5.将胶槽和梳齿准备好,梳齿可以预先插好,将上一步摇匀的胶倒入胶槽中,一般厚度以60mm左右为宜,具体要根据梳齿的厚度以及样品量来定。

6.待胶变白,基本表示胶已凝好,此时可以将梳齿拔出,一定要竖着往上拔梳齿,不要摇晃,以免样品孔被破坏。

7.在电泳槽中倒入1×TAE/TBE缓冲液,将制好的胶放入缓冲液,以缓冲液没过样品孔为宜。

8.点样:根据样品孔的大小决定上样量,每一排样品孔至少有一个孔用来点DNA Marker。

(上样前确定每个样品和Marker里都已经加了Loading buffer,Loading buffer 的终浓度为1×)9.确定样品孔的方向,核酸带负电,样品孔要在负极,通电后在胶孔中向正极移动。

琼脂糖凝胶电泳步骤

琼脂糖凝胶电泳步骤

琼脂糖凝胶电泳一、步骤:1、制胶(1%):将加入30ml 1×TAE缓冲液和0.6g琼脂糖的三角瓶在微波炉加热至沸腾,摇匀至无颗粒。

2、倒胶:先插梳子,再倒胶。

胶冷却至60℃左右(不烫手)加染料后(胶-GelRed:1ml-1ul或30ml胶+3ulGelRed)缓缓倒入电泳槽(先胶布封口,放好梳子),待胶凝固后取出梳子。

3、加样:1µl RNA + 2µl loading buffer混匀。

(点样孔置负极端即黑对黑,红对红)。

4、电泳:稳压条件下120V电泳,待溴酚蓝移动至接近胶前沿(约1cm)时停止电泳(约25min)。

5、观察结果:紫外分析仪上254nm观察,DNA存在处显亮绿色荧光条带,观察酶切后与未酶切质粒的DNA带位置,拍照。

二、注意事项:1、凝胶制备过程中,溶解的凝胶应及时倒入板中,避免倒入前凝固结块。

倒入板中的凝胶应避免出现气泡,影响电泳结果。

2、巨大的DNA链用普通电泳可能跑不出胶孔导致缺带。

高浓度的胶可能使分子大小相近的DNA带不易分辨,造成条带缺失现象。

3、电泳缓冲液多次使用后,离子强度降低,pH值上升,缓冲性能下降,可能使DNA电泳产生条带模糊和不规则的DNA带迁移的现象。

4、如果电泳时电压和温度过高,可能导致出现条带模糊和不规则的DNA带迁移的现象。

特别是电压太大可能导致小片段跑出胶而出现缺带现象。

5、变性的DNA样品可能导致条带模糊和缺失,也可能出现不规则的DNA条带迁移。

在上样前不要对DNA样品加热,用20mM NaCl缓冲液稀释可以防止DNA变性。

6、太多的DNA上样量可能导致DNA带型模糊,而太小的DNA上样量则导致带信号弱甚至缺失。

琼脂糖凝胶电泳

琼脂糖凝胶电泳

琼脂糖凝胶电泳
操作流程及步骤:
医大所学与医学院教受有所不同,以医大步骤作为整理。

1.配置电泳液:990ml水+10ml TAE。

2.根据基因组片段大小,配置相应浓度的琼脂糖凝胶。

0.9g琼脂糖+60ml 电泳液加
入带盖的广口瓶中。

3.配好胶放入微波炉中3min30s.。

取出最好凉至65℃,加入EB或者EB替代物。

4.取电泳槽内的有机玻璃内槽洗干净,晾干,放入制胶玻璃板形成模子。

将内槽置
于水平位置,并在固定位置放好梳子。

将琼脂糖凝胶液小心地倒入内槽玻璃板上,
使胶液缓慢展开,直到整个玻璃板表面形成均匀胶层。

室温下静置直至凝胶完全
凝固
5.垂直轻拔梳子,将凝胶及内槽放入电泳槽中,电泳缓冲液至没过胶板为止。

6.第一和最后一孔上maker,按照样品顺序依次上样10ul/孔,倒数第二孔加水对照,
倒数第三孔加公司提供阳性对照物[1]。

7.盖好盖子,插上变压器,打开开关,开始电泳。

8.电泳时间15-20min。

9.当跑到第二个虚线处停止。

10.扫膜看条带分析结果[2]。

心得体会及注意事项:
1、上样同蛋白电泳上样,持枪入孔可以用左手辅助持枪,防止手抖。


持稳、看清楚、慢入孔、全推出。

2、合格膜应加水孔没有条带,阳性参照必须出现条带,样品组,只出
下面一条带为纯合鼠,出两条带为杂合鼠,只出上面一条带为纯野生型。

血清脂蛋白琼脂糖凝胶电泳原理和操作

血清脂蛋白琼脂糖凝胶电泳原理和操作

血清脂蛋白琼脂糖凝胶电泳原理和操作血清脂蛋白琼脂糖凝胶电泳是一种常用的生化分离和分析技术,主要用于血清中脂蛋白的分析。

其原理是利用琼脂糖凝胶电泳的分离特性,将血清中的脂蛋白按照分子大小进行分离,从而获得脂蛋白的电泳图谱。

琼脂糖凝胶是由琼脂糖溶液制备而成的凝胶。

琼脂糖分子之间通过氢键结合,在溶液中形成网状结构,能够阻碍大分子的迁移,使分子在凝胶中按照分子大小逐渐分离。

根据琼脂糖凝胶的浓度和凝胶体积,可以调整分离脂蛋白的范围和分辨率。

血清脂蛋白琼脂糖凝胶电泳的操作步骤如下:1. 样品制备:将要分析的血清样品进行离心,将清除过量脂蛋白颗粒。

取适量样品于离心管中,加入适量凝胶缓冲液,混匀。

2. 制备凝胶:根据所需的凝胶浓度,称取相应质量的琼脂糖溶解于电泳缓冲液中,并加热至溶解。

待溶液温度降至室温后,加入凝胶稳定剂并混匀。

3. 填充凝胶孔:将凝胶溶液倒入电泳池,待凝胶凝固后,用专用的样品载体或者微量移液器将样品填充到凝胶孔中。

注意不要将样品液面超过凝胶表面。

4. 电泳分离:将电泳池连接电源,设定合适的电泳条件,如电压和电流。

在电泳过程中,离子在电场作用下沿着琼脂糖凝胶的移动方向迁移,分离出不同迁移速度的脂蛋白组分。

5. 染色和观察:电泳结束后,取出凝胶,进行染色和观察。

目前常用的染色方法有银染、共伴染色和乳化状胶体金染色等。

在染色后,可以使用分子影像仪或者专用的凝胶分析系统进行图像捕捉和分析。

血清脂蛋白琼脂糖凝胶电泳可以用于分析血清中各种脂蛋白的分布和比例,如低密度脂蛋白(LDL)、高密度脂蛋白(HDL)、极低密度脂蛋白(VLDL)等。

通过分析脂蛋白的电泳图谱,可以得到脂蛋白的相对含量和分子大小的分布情况,进一步了解脂质代谢的状态以及与某些疾病的关联。

总之,血清脂蛋白琼脂糖凝胶电泳是一种常用的生化分离和分析技术,主要用于血清脂蛋白的分离和分析。

通过其原理和操作步骤的了解,我们可以更好地利用该技术进行实验和数据解读,为脂质相关疾病的研究提供有力的支持。

琼脂糖凝胶电泳的关键操作

琼脂糖凝胶电泳的关键操作

琼脂糖凝胶电泳的关键操作
琼脂糖凝胶电泳是一种常用的生物分子分离和分析方法,其关键操作包括以下几个步骤:
1. 制备琼脂糖凝胶:将适量的琼脂糖粉末加入缓冲溶液中,充分溶解后通过加热使其完全溶解,然后倒入凝胶模具中,等待凝胶固化。

2. 样品准备与加载:将待测样品与一定量的负载缓冲溶液混合均匀,然后用微量移液管将混合液滴加到已经形成的琼脂糖凝胶槽中,确保不产生气泡。

3. 进行电泳:将琼脂糖凝胶槽放入电泳槽中,加入适量的电泳缓冲液,确保液位高过琼脂糖凝胶,然后连接电源,设定适当的电场强度和时间,进行电泳。

4. 染色与可视化:电泳结束后,将琼脂糖凝胶取出,用染色剂进行染色,例如利用乙溴蓝染色DNA,然后用透明胶纸或透明薄膜包裹琼脂糖凝胶,用紫外光透射或背光观察结果。

5. 结果分析:根据琼脂糖凝胶电泳结果,通过与已知标准品比较或使用图像分析软件,对待测样品中的生物分子进行定性和定量分析。

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琼脂糖凝胶电泳的操作步骤如下:1. 制备1%琼脂糖凝胶(大胶用70ml,小胶用50ml):称取0.7 g(0.5 g)琼脂糖置于锥形瓶中,加入70 ml(50ml)1×TAE,瓶口倒扣小烧杯.微波炉加热煮沸3次至琼脂糖全部融化,摇匀,即成1.0%琼脂糖凝胶液.2. 胶板制备:取电泳槽内的有机玻璃内槽(制胶槽)洗干净,晾干,放入制胶玻璃板.取透明胶带将玻璃板与内槽两端边缘封好,形成模子.将内槽置于水平位置,并在固定位置放好梳子.将冷却到65℃左右的琼脂糖凝胶液混匀小心地倒入内槽玻璃板上,使胶液缓慢展开,直到整个玻璃板表面形成均匀胶层.室温下静置直至凝胶完全凝固,垂直轻拔梳子,取下胶带,将凝胶及内槽放入电泳槽中.添加1×TAE电泳缓冲液至没过胶板为止.3. 加样:在点样板或parafilm上混合DNA样品和上样缓冲液,上样缓冲液的最终稀释倍数应不小于1X.用10 ul微量移液器分别将样品加入胶板的样品小槽内,每加完一个样品,应更换一个加样头,以防污染,加样时勿碰坏样品孔周围的凝胶面.(注意:加样前要先记下加样的顺序).4. 电泳:加样后的凝胶板立即通电进行电泳,电压60-100V,样品由负极(黑色)向正极(红色)方向移动.电压升高,琼脂糖凝胶的有效分离范围降低.当溴酚蓝移动到距离胶板下沿约1cm处时,停止电泳.(5)电泳完毕后,取出凝胶,用含有0.5 ug/ml的溴化乙锭1×TAE溶液染色约20 min,再用清水漂洗10 min.(6)观察照相:在紫外灯下观察,DNA存在则显示出红色荧光条带,采用凝胶成像系统拍照保存实验原理闭合环状质粒、线性质粒和开环质粒DNA由于构形不同,在加溴化乙锭的琼脂糖凝胶电泳上呈现不同的迁移率,因而在紫外灯下观察,能区别闭合环状质粒DNA(cccDNA)、线性质粒DNA(L-DNA)和开环质粒DNA(ocDNA)。

实验材料和试剂(一)实验样品质粒pUC118(二)试剂1.l DNA/HindIII分子量标准2.溴酚蓝指示剂点样缓冲液0.2% 溴酚蓝50% 蔗糖3.1mg/ml溴化乙锭溶液4.电泳缓冲液(TAE)40 mmol/L Tris-乙酸1 mol/L EDTA(配制方法:24.2克Tris碱,5.71ml冰乙酸,10ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0),定容至5000ml)5.0.7% 琼脂糖凝胶(配制方法:称取琼脂糖0.35克,加入50ml TAE电泳缓冲液)(三)仪器微量移液器电泳仪水平电泳槽透射紫外观察仪实验步骤1.选择合适的水平式电泳槽,调节电泳槽平面至水平。

检查稳压电源与正负极的线路。

2.选择孔径大小合适的点样梳子,垂直架在电泳胶模的一端,使点样梳子底部离电泳胶模底部的距离为1.0mm。

3.制备0.7%琼脂糖凝胶,100℃水浴加热至琼脂糖融化均匀。

4.用吸管取少量琼脂糖凝胶溶液将电泳胶模四周密封好,防止浇灌琼脂糖凝胶板时发生渗透。

待琼脂糖凝胶冷却至60℃左右时,加入一滴溴化乙锭,摇匀,轻轻倒入电泳胶模中,琼脂糖凝胶的厚度在3~5mm。

倒胶时要避免产生气泡,若有气泡可用吸管小心吸去。

5.琼脂糖凝胶凝固后,在室温放置20分钟,小心拔掉点样梳子和电泳胶模两端的挡板,保持点样孔的完好。

6.将电泳胶模放入电泳槽中,加入电泳缓冲液,使电泳缓冲液面高出琼脂糖凝胶表面1~2mm。

如点样孔内有气泡,用吸管小心吸出,以免影响加样。

7.将15ml DNA样品与1/5体积的溴酚蓝指示剂点样缓冲液混合。

上样缓冲液不仅可以提高样品的密度,使样品均匀沉到样品孔内,还可以使样品带颜色,便于上样和估计电泳时间和判断电泳的位置。

8.用微量移液器将样品小心加入加样孔内,记录样品点样秩序。

9.盖上电泳槽,开启电源开关,最高电压不超过5V/cm(100~150V恒压电泳),使DNA从负极向正极移动。

10.电泳时间随实验的具体要求而异。

电泳一般需1~3小时。

电泳完毕后关闭电源,戴一次性塑料手套取出凝胶,尽可能将所有的电泳缓冲液淋干,在254nm波长的透射紫外灯下观察。

【提示】(一)琼脂糖凝胶电泳1.琼脂糖凝胶的性质琼脂糖是从海藻中提取的一种直链多糖,它由D-半乳糖和3,6-脱水-L-半乳糖的残基交替排列组成的线型多聚糖。

当琼脂糖加热至90~100℃左右,即可形成清亮透明的液体。

浇在模板上冷却至40~45℃时,凝固形成凝胶。

琼脂糖带有亲水性,不含有带电荷的基团,不引起DNA变性,又不吸附被分离的物质,因此它是一种很好的凝胶剂。

琼脂糖凝胶可区分相差100bp的DNA片段。

2.DNA分子的迁移率DNA分子在电泳中的迁移率的因素是多方面的,除了决定于DNA分子大小与构型外,还有琼脂糖凝胶的浓度、电压大小、缓冲液pH值和电泳时的温度等。

(二)实验操作中注意的问题1.加热溶解琼脂糖时应不断地摇动容器,使附于壁上的颗粒也完全溶解。

2.溴化乙锭是一种强致癌剂,并有中度毒性,因此必须十分谨慎小心。

操作时一定要戴手套,用过的手套要及时将手套顺手翻过来,让污染有溴化乙锭的面朝里。

3.用254nm波长的紫外光进行观察的效果比366nm清晰,但产生的切口DNA量也较高。

紫外光对眼睛有害,观察时应戴上眼镜或防护面罩。

琼脂糖凝胶电泳实验技巧核酸分子是两性解离分子,在高于其等电点的电泳缓冲液(pH8.0-8.3)中,基其碱基不解离,而磷酸基团全部解离,核酸分子因而带负电荷,电泳时向正极迁移。

琼脂糖主要多海洋植物琼脂中提取而来并经糖基化修饰,为一种聚合链线性分了,使用琼脂糖凝胶作为电泳支持介质,发挥分子筛功能,使得大小和构象不同的核酸分子的迁移率出现较大差异,从而达到分离的目的。

琼脂糖凝胶电泳操作简单、快速、通过调整其使用浓度,使得分辨率达到大多实验的要求。

因此成为分离、鉴定、纯化核酸分子的常用方法。

一、操作过程中要注意以下一些问题。

1、凝胶制作1.1 凝胶浓度凝胶的浓度据实验需要而变,一般在1.8%-2.0%之间,没有用完的凝胶可以再次融化,但随着融化次数的增加,水分丢失也越多,凝胶浓度则会越来越高,导致实验结果不稳定。

补水办法:一是在容器上标记煮胶前的刻度,煮胶后补充水分到原刻度;二是在煮胶前称重,煮胶后补充水至原重量。

粗略一点的办法是通过多次较恒定的煮胶条件得出一个经验补水值,以保证凝胶浓度基本维持在原浓度。

如果条带要回收最好不要用回收胶。

1.2 梳板的选用一般每个制胶模具均配有多个齿型不同的梳板。

梳齿宽厚,形成的点样孔容积较大,用于DNA片段回收实验等;相反,梳齿窄而薄,形成的点样孔容积就较小,用于PCR产物、酶切产物鉴定等。

回收的话还可以将几个齿用透明胶带粘起来,形成一个窄而长的大孔以加大点样量提高回收率。

梳板的选择主要是看上样量的多少而定。

一般来说,上样量小时尽量选择薄的梳板制胶,此时电泳条带致密清晰,便于结果分析。

另外,每次制胶时都要注意梳齿与底板的距离至少要1mm,否则,拔梳板时易损坏凝胶孔底层,导致点样后样品渗漏。

当然,点样孔的破坏还与拔梳板的时间和方法有关,一般凝胶需冷却30min以上方可拔出梳板,应急的情况下可以将成型的凝胶块入4度冰箱中冷却15min左右,拔梳板的方法是将制胶槽放置在电泳槽中的电泳缓冲液中,然后垂直向上慢慢用力,因为有液体的润滑作用,梳板易拔出且不易损坏点样孔。

2、点样在样品加入上样缓冲液中含有甘油或蔗糖以增加密度,使样品沉入孔底;上样缓冲液中一般还含有两种指示剂,溴酚兰和二甲苯菁,用于指示样吕的迁移过程。

上样缓冲液储存液一般为6倍(10倍),表示其浓度为工作浓度的六倍。

使用时上样缓冲液应稀释到一倍浓度。

点样方法是将移液枪基本垂直对准点样孔,用另一只手帮助固定移液枪下端,移液枪的枪头尖端进入点样孔即可将样品注入孔内。

上样量的多少根据跑胶的目的而不同,一般直接跑DNA时量最少,跑一般的分子标记适中,回收时可以都加进去。

最后根据扩增条带的大小点上适合的DNA Maker。

3、电泳将电泳仪的正极与电泳槽的正极相连,负极与负极相连,每次电泳时都要检查一下电极方向,以免白干(新手来做时可能就有这样的情况发生)。

核酸带负电荷,从负极向正极移动。

电泳槽中电泳缓冲液与制胶用电泳缓冲液应相同,电泳缓冲液刚好浸过胶为好。

电泳缓冲液浓度太大则电流加大,凝胶发热,易使DNA降解。

电泳早所加电压一般不超过5v/cm(正负电极之间的距离,而不是凝胶的长度)。

电泳时间一般为30-60min,根据实验需要也可作适当调整。

电压增高,电泳时间缩短,核酸条带相对来说不够整齐,不够清晰;相反,电压降低,电泳时间较长,条带会相对的清晰。

另外,如果电泳后样品泳支很慢或者没移动可能是由于挡板没有拿开。

附EB作用原理:观察琼脂糖凝胶中DNA最常用的方法是利用荧光染料溴化乙锭进行染色,溴化乙锭含有一个可以嵌入DNA堆积碱基之间的一个三环平面基团。

它与DNA的结合几乎没有碱基序列特异性。

在高离子强度的饱和溶液中,大约每2.5个碱基插入一个溴化乙锭分子。

当染料分子插入后,其平面基团与螺旋的轴线垂直并通过范德华力与上下碱基相互作用。

这个基团的固定位置及其与碱基的密切接近,导致与DNA结合的染料呈现荧光,其荧光产率比游离溶液中染料有所增加。

DNA吸收254nm处的紫外辐射并传递给染料,而被结合的染料本身吸收302nm和366nm的光辐射。

这两种情况下,被吸收的能量在可见光谱红橙区的590nm处重新发射出来。

由于溴化乙锭-DNA复合物的荧光产率比没有结合DNA的染料高出20-30倍,所以当凝胶中含有游离的溴化乙锭(0.5ug/ml)时,可以检测到少至10ng的NDA条带。

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