种质资源DNA指纹图谱库
基于SCoT_分子标记的61_份加工型黄瓜种质资源遗传多样性分析及DNA_指纹图谱构建

中国瓜菜2024,37(4):36-45DOI:10.16861/ki.zggc.202423.0760基于SCoT分子标记的61份加工型黄瓜种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建王宏利1,赵久成1,赖淼1,卢家仕2,凌启昌1,肖锦华3,张华4,付鑫锋1(1.广西农业科学院钦州分院·钦州市农业科学研究所广西钦州535000;2.广西农业科学院花卉研究所南宁530007;3.钦州市钦南区那彭镇农业农村服务中心广西钦州535015;4.钦州市浦北县北通镇农业农村服务中心广西浦北535321)摘要:为探明加工型黄瓜种质资源的亲缘关系及遗传多样性,为新品种选育提供理论依据,采用目标起始密码子多态性标记(SCoT)技术,以61份加工型黄瓜种质资源为试验材料,进行遗传多样性分析并构建DNA指纹图谱。
结果表明,从100条SCoT引物中筛选出8条扩增条带清晰、多态性高且重复性好的引物;利用筛选出的引物对61份黄瓜种质基因组DNA进行PCR扩增,共扩增出238个位点信息,其中多态性位点227个,平均多态性位点百分比为95.38%;采用NTSYS-pc2.1软件计算得出供试的61份材料间的遗传相似系数分布在0.588~0.920之间,遗传相似系数最小的材料分别是34号与55号,二者在瓜色、叶片形状及果实形状方面存在较大差异,说明两者亲缘关系最远。
基于遗传相似系数对其进行UPGMA聚类分析和树状图绘制,在相似系数0.735处,可将其划分为7个类群,说明61份黄瓜种质材料背景存在差异,但多数地域来源相近、生境相似地区的种质被聚在同一类群。
利用2对特异性较大的引物SCoT12和SCoT83构建的DNA指纹图谱可单独鉴别出61份黄瓜种质资源,该图谱可为黄瓜分类与鉴定提供科学依据。
关键词:黄瓜;SCoT分子标记;亲缘关系;遗传多样性;DNA指纹图谱中图分类号:S642.2文献标志码:A文章编号:1673-2871(2024)04-036-10Genetic diversity analysis and DNA fingerprinting construction of61pro-cessed cucumber germplasm resources based on SCoT markersWANG Hongli1,ZHAO Jiucheng1,LAI Miao1,LU Jiashi2,LING Qichang1,XIAO Jinhua3,ZHANG Hua4,FU Xinfeng1(1.Qinzhou Branch of Guangxi Academy of Agricultural Sciences/Qinzhou Institute of Agricultural Sciences,Qinzhou535000,Guangxi, China;2.Institute of Flowers,Guangxi Academy of Agricultural Sciences,Nanning530007,Guangxi,China;3.Agricultural and Rural Service Center of Napeng Town,Qinnan District,Qinzhou535015,Guangxi,China;4.Agriculture and Rural Service Center of Beitong Town,Pubei County,Pubei535321,Guangxi,China)Abstract:In order to find out the genetic diversity of germplasm resources of processed cucumber and provide theoretical basis for the breeding of new varieties.the genetic diversity of61processed cucumber germplasm resources was analyzed and DNA fingerprinting was constructed using SCoT technique.The results showed that8primers with clear amplifica-tion bands,high polymorphism and good repeatability were selected from100SCoT primers.A total of238loci of61cu-cumber germplasm genomic DNA were amplified by PCR using the selected primers,of which227were polymorphic lo-ci,and the average percentage of polymorphic loci was95.38%.NTSYS-pc2.1software was used to calculate the distri-bution of genetic similarity coefficients among the61tested materials between0.588and0.920,and the material with the smallest genetic similarity coefficients was34and55,respectively.There were great differences in melon color,leaf shape and fruit shape,indicating that the two were most loosely related.Based on the genetic similarity coefficient,UPG-MA cluster analysis and tree diagram were performed.At the similarity coefficient0.735,they could be divided into7 groups.The results indicated that61cucumber germplasm material backgrounds were different,but most of the germ-收稿日期:2023-12-07;修回日期:2023-12-22基金项目:广西壮族自治区科技先锋队“强农富民”“六个一”专项行动项目(桂农科盟20230505)作者简介:王宏利,男,农艺师,研究方向为黄瓜、百香果栽培及育种。
上海地区水稻已知品种SSR指纹图谱库构建

上海地区水稻已知品种SSR指纹图谱库构建邓姗;褚云霞;黄志城;杨华;顾可飞;陈海荣【期刊名称】《中国农学通报》【年(卷),期】2015(31)3【摘要】用24对引物构建上海地区53份水稻品种的DNA指纹图谱,为当地水稻新品种保护、遗传资源评价及亲缘关系分析提供理论依据和技术支持。
结果显示,试验中共检测出109条多态性片段,变幅2~9条,平均每对引物4.5417条多态性片段,有效等位基因数为70.8187,平均每个标记2.9508个;Shannon多样性指数(Ⅰ)平均值为1.1296,变幅0.4949~1.8402;多态性信息含量(PIC)平均值为0.5415,变幅0.2656~0.8001。
用24个标记建立53份材料的DNA指纹图谱,这些字符串就构成了这53份材料的"身份证号码",本试验中,各材料的分子身份证号码是唯一的;聚类分析表明,在遗传相似系数0.21处可以将53份材料分为2个类群,分别为粳稻组和籼稻组,但是组内遗传距离较近。
由此可见,上海地区水稻品种的遗传多样性相对狭窄。
【总页数】9页(P7-15)【关键词】DNA指纹图谱;SSR分子标记;水稻;上海【作者】邓姗;褚云霞;黄志城;杨华;顾可飞;陈海荣【作者单位】上海市农业科学院农产品质量标准与检测技术研究所;农业部植物新品种测试(上海)分中心;上海市农业生物基因中心【正文语种】中文【中图分类】S511【相关文献】1.基于SSR标记的福建省若干水稻品种DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析 [J], 马红勃;许旭明;韦新宇;杨旺兴;邹文广2.辽宁地区绿豆品种SSR指纹图谱构建及品种鉴定 [J], 赵雅楠;王颖;张东杰3.贵州地方水稻品种"禾"的SSR指纹图谱构建 [J], 马琳;余显权;赵福胜4.利用SSR分子标记构建水稻品种DNA指纹图谱的研究进展 [J], 李茂柏;王慧;白建江;朴钟泽5.SSR标记在宁波地区水稻品种DNA指纹图谱构建及纯度鉴定中的应用 [J], 王明湖; 张孝天; 吴国林; 蒋琪; 施勇烽因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
玉米育种中分子标记的研究进展与应用

玉米育种中分子标记的研究进展与应用作者:蔡春荣许海涛来源:《现代农业科技》2008年第18期摘要分子标记技术的开发利用使玉米育种家有可能直接根据基因型而不是表现型进行选择,在玉米育种工作中起着越来越重要的作用。
综述了玉米育种中主要的分子标记和近年来分子标记技术在玉米遗传图谱构建、目标基因的标记与定位、遗传多样性研究、品种真实性鉴定、杂种优势预测以及分子标记辅助选择中的应用。
关键词玉米育种;分子标记;应用中图分类号 S513.035.3文献标识码A文章编号1007-5739(2008)18-0168-02分子标记是20世纪80年代随着分子生物学的发展开发的一类以DNA多态性为基础的遗传标记,它能够反映植物在遗传物质DNA水平下产量差异,是生物遗传物质变化的外在反映,信息量极为丰富,而且不受外部环境的影响[1]。
在植物的不同发育阶段、不同环境条件下、不同组织中都可以进行检测,使得对基因型的早期选择成为可能,而且在后代中表现显性、共显性遗传。
不仅有利于对隐性基因控制的农艺性状进行选择,而且可以利用与目标基因紧密连锁的分子标记对育种后代材料进行相关选择,提高选择的准确性,缩短育种年限,减少工作量,提高育种效率。
分子标记技术的迅猛发展,促进了玉米育种研究各个领域的发展。
1玉米育种中的主要分子标记1.1RFLPRFLP即限制性片段多态性。
其基本原理是检测DNA在限制性内切酶酶切后形成的特定DNA片段的大小,包括基因组DNA限制性酶切、电泳分离、southern转移、特异性探针杂交检测等步骤。
1.2RAPDRAPD即随机扩增多态性,是由Williams(1990)和Welsh(1990)领导的2个研究小组同时发现的一种新的DNA分子标记。
它是以PCR为基础,利用人工合成的随机序列寡核苷酸作引物,以生物的基因组DNA作为模板进行PCR扩增反应,产生不连续的DNA产物,通过琼脂糖凝胶电泳来检测DNA序列的多态性。
50份无花果种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建

50份无花果种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建卢立媛;阮树安;杨伟聪;刘晗琪;刘振盼;张永华;孙阳【期刊名称】《中国果树》【年(卷),期】2024()1【摘要】为探究国内外无花果遗传多样性并对种质资源进行鉴定,利用15对SSR 分子标记引物对50份无花果种质资源从DNA水平上进行遗传多样性分析,并构建DNA指纹图谱。
结果表明,15对SSR引物在50份无花果种质资源中共扩增出67个等位基因,等位基因数范围为2~8个,观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)平均值分别为0.5947和0.5703,Shannon’s多态性信息指数(I)平均值为1.0452,多态性信息含量指数(PIC)变化范围为0.2411~0.7353,平均为0.5101,表明无花果种质资源具有丰富的遗传多样性。
50份无花果种质资源之间的遗传距离为0~0.68,平均为0.39,与其他种质资源遗传距离最大的为哈代。
基于SSR分子标记结果,利用UPGMA方法对50份无花果种质资源进行聚类分析,根据遗传距离可将50份无花果种质资源分为四大类,第Ⅰ类为哈代,第Ⅱ类为斯特拉,第Ⅲ类为梦幻甜蜜,其余无花果种质资源划归为第Ⅳ类。
构建了26份无花果种质资源的SSR指纹图谱,可用于品种鉴定,以期为无花果分子辅助育种提供科学依据。
【总页数】7页(P45-51)【作者】卢立媛;阮树安;杨伟聪;刘晗琪;刘振盼;张永华;孙阳【作者单位】辽宁省经济林研究所【正文语种】中文【中图分类】S663.3【相关文献】1.睡莲种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建2.基于iPBS标记的石斛兰种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建3.基于cpSSR标记的山药种质资源DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析4.木奶果种质资源的遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建5.基于SSR标记的100份国内外小麦种质遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
农业生产发展项目实施方案

农业生产发展项目实施方案本批次农业生产发展项目资金重点支持畜牧业生产监测预警、畜牧关键技术示范推广应用、农业科技创新驱动等有关内容。
一、畜牧业生产监测预警(一)建设内容依托各级畜牧技术推广部门及村级防疫员队伍,在全省建立市、县、村、场(户)四级畜牧产业信息监测组织机构体系,对我省生猪、肉牛、肉羊、奶牛、奶山羊、蛋鸡、肉鸡等畜禽生产,以及畜产品、饲料价格进行动态监测预警。
(二)补助标准、对象及环节实施范围:承担生猪、肉牛、肉羊、奶牛、奶山羊、蛋鸡、肉鸡等畜禽生产,以及畜产品、饲料价格监测任务的市、县畜牧兽医技术部门。
补助标准:每个畜种补助1-2万元;仅承担畜产品及饲料价格监测工作的县区,每个县补助2万元。
补助环节:主要用于信息员培训、数据核查、宣传推广、更新设备等。
二、畜牧关键技术示范推广应用(一)建设内容1.畜禽遗传资源生产性能测定。
按照第三次畜禽遗传资源生产性能测定工作要求,对秦川牛、关中驴、同羊、关中黑猪、略阳鸡等24个畜禽地方品种、培育品种的生产性能进行测定,完善畜禽遗传资源数据库。
2.畜禽种质资源DNA分子指纹图谱库和特征库建设。
依托省内科研院校,对秦川牛、关中驴、关中奶山羊、陕北白绒山羊、陕南白山羊、略阳鸡和中华蜜蜂等7个列入省级地方畜禽品种保护名录的畜禽品种进行基因测序,构建畜禽种质资源DNA分子指纹图谱库和特征库。
3.畜禽新品种(系)培育。
依托杨凌示范区科技资源优势,开展畜禽种业基础性、前沿性、创新性研究,运用基因编辑、分子设计育种等现代化育种手段,加快猪、羊(包括肉羊、抗病羊、奶绵羊等3个育种方向)、鸡等3个畜种、5个育种方向的畜禽新品种(系)培育及示范推广工作。
4.养殖投入品及动物产品质量安全监管。
支持畜牧业重点市(区)开展养殖投入品、动物产品日常监管以及散养户自配饲料监管试点,严厉打击非法添加、扰乱市场秩序等行为。
5.畜牧兽医关键技术示范推广。
发挥杨凌示范区科研优势,依托科研院校,促进“产学研用”一体化发展,聚焦畜牧全产业链发展技术需求,联合开展高新技术试验示范,推广应用节本增效技术,提高标准化养殖水平,增加农民养殖收益。
贵州省农作物种子条例(2024年修正)

贵州省农作物种子条例(2024年修正)文章属性•【制定机关】贵州省人大及其常委会•【公布日期】2024.09.25•【字号】•【施行日期】2024.10.01•【效力等级】省级地方性法规•【时效性】现行有效•【主题分类】种植业正文贵州省农作物种子条例(2019年9月27日贵州省第十三届人民代表大会常务委员会第十二次会议通过2022年12月1日贵州省第十三届人民代表大会常务委员会第三十六次会议修订根据2024年9月25日贵州省第十四届人民代表大会常务委员会第十二次会议通过的《贵州省人民代表大会常务委员会关于修改〈贵州省保健用品管理条例〉等地方性法规部分条款的决定》修正)目录第一章总则第二章种质资源保护与利用第三章品种选育、审定、登记、认定第四章生产经营第五章监督管理第六章扶持与服务第七章法律责任第八章附则第一章总则第一条为了保护和合理利用农作物种质资源,规范品种选育、种子生产经营和管理行为,加强种业科学技术研究,鼓励育种创新,保护植物新品种权,维护农作物品种选育者、种子生产经营者和使用者的合法权益,提高种子质量,促进现代种业高质量发展,保障粮食安全和重要农产品有效供给,根据《中华人民共和国种子法》和有关法律、法规的规定,结合本省实际,制定本条例。
第二条在本省行政区域内从事农作物种质资源保护与利用、品种选育、种子生产经营和监督管理等活动,适用本条例。
本条例所称种子,是指农作物的种植材料或者繁殖材料,包括籽粒、果实、苗和根、茎、芽、叶、花等。
第三条县级以上人民政府应当加强农作物种子工作的组织领导,加强种子管理队伍建设。
县级以上人民政府农业农村主管部门主管本行政区域内的农作物种子工作,其所属种子管理机构依法开展具体监督、管理和服务工作。
县级以上人民政府有关部门按照各自职责,协同做好农作物种子监督、管理与服务工作。
各级人民政府及其有关部门应当采取措施,加强种子执法和监督,依法保护种业知识产权,惩处侵害农民权益的种子违法行为。
DNA指纹图谱在农作物品种鉴定中的应用

DNA(脱氧核糖核酸)是细胞染色体中的遗传基因,其分子各个片段就代表各个遗传信息。
由于DNA指纹图谱直接反映DNA水平上的差异,它成为当今最先进的遗传标记系统。
DNA指纹图谱技术主要有:限制性片段长度多态性(Restriction fragment length polym or2 phism,简称RF LP)、随机扩增多态性(Random am plified polym orphic DNA,简称RAPD)、小卫星DNA (Mini2satellite DNA)、微卫星DNA (Microsatellite DNA)、内部简单重复序列(ISSR)、扩增片段长度多态性(Am plified fragment length polym or2 phism,简称AF LP)等等。
一、DNA指纹图谱的方法11RF LP方法RF LP方法是G rodzicker等人于1974年发明的。
它是一种利用限制性酶切片段长度差异来检测生物个体之间差异的分子标记技术。
RF LP方法于上个世纪80年代开始应用于植物,在水稻、小麦、玉米、蕃茄和马铃薯等作物上的研究都已有报道。
但RF LP的多态信息含量是相对而言的,在一些作物上RF LP探针可进行品种间及种间的鉴别,而在小麦、马铃薯、大豆等作物上的多态性较低。
特别是小麦,它是严格的自花授粉作物,基因组较大,多态性很低(即使在相当分散的品种间也是如此)。
因而,RF LP方法在指纹图谱中的应用受到限制。
21RAPD方法RAPD方法是Willams等人于1990年发明的。
它是利用扩增DNA片段长度差异来检测生物个体的分子标记技术。
它可在对物种没有任何分子生物学研究的情况下,对其进行基因组指纹图谱的构建。
其相对于RF LP方法较简便,DNA用量也较少,且省去了使用放射性同位素,受到了许多学者的重视。
Welth1991年曾用RAPD分析玉米杂交种的品种纯度,He等人1992年曾用RAPD识别小麦品种,在花生、小麦、水稻等作物上也曾进行过深入研究。
安溪铁观音茶叶知识快速入门

铁观音茶叶知识秘笈茶多网秘笈1、茶多网的网址是2、茶多网引入了中国茶叶价格指导服务中心的在线品鉴服务。
3、茶多网的服务热线是400-188-0595。
4、茶多网的宣传口号是上茶多网,买放心茶。
5、茶多网的大本营位于福建省泉州市安溪县。
6、茶多网是由商务部中国国际电子商务中心、中国茶叶流通协会和中国茶都集团三个机构联合打造的。
7、茶多网采用的电子商务模式是F2C。
8、茶多网使用的等值于人民币的虚拟货币是茶金币。
9、2011年7月,在泉州APEC数字经济电子商务产业发展论坛上,茶多网被商务部副部长蒋耀平盛赞为是茶叶界的官方“淘宝网”。
10、茶多网是中国茶叶官方电子商务平台。
茶政策题秘笈1、安溪县积极推进生态茶园建设,其主要作用包括:可以保护县域的大生态;形成生态多样性,繁衍有益生物,减轻病虫害;提高土壤肥力,减少肥料的使用,节约茶叶生产成本;营造良好的茶树生长环境,提高茶叶质量。
2、乌龙茶的初制技术是安溪人民在明朝末期发明创造的。
3、250多年前安溪人就开始在东南亚形成了初具规模的茶叶销售网络。
4、茶产业既是安溪的民生之本、经济支撑,还是安溪的特色名片、对外形象。
5、国家工商总局依法认定的全国首枚茶叶“中国驰名商标”的茶叶品牌是安溪铁观音。
7、2009-2010年安溪连续两年被评为“全国重点产茶县”第一位。
8、为降低农民用药成本,安溪县通过“四比”组织招标农药,然后实行全县统一零售价。
其中,“四比”是指比资质、比服务、比质量、比价格。
9、安溪县政府实施“三个大师培育工程”,是指培养制茶、拼配、烘焙三个大师。
10、安溪铁观音神州行是安溪县委、县政府领衔的一个活动,始于2005年,历时多年,分别对国内16个安溪铁观音主销城市进行考察交流采风,举办不同主题的茶事宣传活动。
11、安溪铁观音同业公会旗下5家安溪铁观音代表性茶企,抱团进军欧洲市场,在法国巴黎的繁华街头成立首个欧洲营销中心。
12、为扶持企业上市,政府对在安溪注册的第一家茶叶上市企业,给予1000万元奖励。
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“种质资源DNA指纹图谱库”科研计划启动铁观音可做“亲子鉴定”
发布时间:2011-10-20 8:31:07 稿件来源:泉州网-泉州晚报
“市面上销售的安溪铁观音是否原产于安溪,做了‘亲子鉴定’就知道。
”近日,记者获悉,针对漳州华安、浙江海宁等地茶园冒用铁观音品牌的情况,安溪本地茶企举起科技大旗,以DNA指纹图谱鉴定方式鉴别茶叶的原产地。
抢搭品牌便车
安溪铁观音、西湖龙井、祁门红茶、武夷岩茶……纵观中国十大名茶,每一个茶叶品种之前都要冠上特定的地名,可以说,只有特定的水土和气候条件才能够产出举世闻名的好茶。
安溪西坪铁观音茶叶研究所所长魏火连告诉记者,作为中国十大名茶之一,安溪铁观音以其独具的“香、韵”风靡全国,这让不少外地的茶企动起了“品牌”搭便车的念头。
据悉,漳州华安县本以盛产“清香型五季茶”闻名,可是近年来部分茶企频频使用铁观音对产品进行包装宣传;三明大田县部分茶企则将当地种植的茶叶冠以“安溪铁观音”之名进行销售;此外,福建漳平、贵州黎平等县、市也大量种植铁观音,其部分成品没有标明原产地,而是冠以“安溪铁观音”之名进行销售。
冲击本地茶企
“制茶是一件天时地利人和的事情,要有合适的气候和水土,更要有人工炒茶的技艺和经验。
”国家级非物质文化遗产乌龙茶(铁观音)制作技艺代表性传承人魏月德告诉记者,安溪有将近三百年的铁观音制茶经验,这是外地无法复制的。
因此,无论华安还是大田,即使两者有安溪相似的地理自然条件,但要做出和安溪一样品质的铁观音,实属不易。
“最怕的是,客商买到冒充安溪铁观音的茶叶后,认为安溪铁观音品质下降,不仅影响来年订单量,还损坏了安溪铁观音的品牌美誉度。
”中国茶都茶叶交易市场的茶商吴女士告诉记者,大量外地茶叶的冲击还会导致安溪铁观音价格下跌,这对安溪本地的茶企来讲,是个不容忽视的危险信号。
查图谱辨真伪
“安溪铁观音品牌维权的难题在于如何鉴定茶叶是否原产于安溪。
”魏火连告诉记者,铁观音茶产业让安溪近百万人口走上了致富的道路,经30年高速发展,如何保持茶产业的可持续发展,保护好安溪铁观音的品牌价值显得尤为重要。
针对这一情况,福建魏荫名茶有限公司联合福建农林大学茶学系设立了博士后工作站,启动了“铁观音种质资源DNA指纹图谱库”科研计划。
据福建农林大学茶学系主任孙威江教授介绍,利用DNA指纹图谱库检测相当于给茶叶做亲子鉴定,它能分辨安溪产和安溪以外产地生产的铁观音,甚至可分辨出“内安溪”和“外安溪”茶叶。
随着图谱信息的完善,查出某批茶叶产自安溪哪个厂商的技术也将成为现实。
安溪县工商局相关科室的负责人告诉记者,该图谱库的研究与建立有利于安溪铁观音的原产地保
护,可以凭此鉴定市场上流通的铁观音茶叶到底是产自安溪还是别的地方,对规范茶叶市场大有好处。
□本报记者吕斯达陈云青通讯员张江龙。