放线菌分类-完整
放线菌简介
放线菌是一类呈菌丝状生长，主要以孢子繁殖，革兰染色为阳性的单细胞原核微生物，是细菌中的一种特殊类型。
放线菌与人类的生产和生活关系极为密切，目前广泛应用的抗生素约70%是各种放线菌所产生。
一些种类的放线菌还能产生各种酶制剂（蛋白酶、淀粉酶、和纤维素酶等）、维生素（B12）和有机酸等。
弗兰克菌属（Frankia）为非豆科木本植物根瘤中有固氮能力的内共生菌。
此外，放线菌还可用于甾体转化、烃类发酵、石油脱蜡和污水处理等方面。
少数放线菌也会对人类构成危害，引起人和动植物病害。
因此，放线菌与人类关系密切，在医药工业上有重要意义。
放线菌在自然界分布广泛，主要以孢子或菌丝状态存在于土壤、空气和水中，尤其是含水量低、有机物丰富、呈中性或微碱性的土壤中数量最多。
土壤特有的泥腥味，主要是放线菌的代谢产物所致。
放线菌在微生物中的分类地位放线菌在形态上分化为菌丝和孢子，在培养特征上与真菌相似。
然而，用近代分子生物学手段研究的结果表明，放线菌是属于一类具有分支状菌丝体的细菌，革兰染色为阳性。
主要依据为：①同属原核微生物：细胞核无核膜、核仁和真正的染色体；细胞质中缺乏线粒体、内质网等细胞器；核糖体为70S；②细胞结构和化学组成相似：细胞具细胞壁，主要成分为肽聚糖，并含有DPA；放线菌菌丝直径与细菌直径基本相同；③最适生长PH范围与细菌基本相同，一般呈微碱性；④都对溶菌酶和抗生素敏感，对抗真菌药物不敏感；⑤繁殖方式为无性繁殖，遗传特性与细菌相似。
放线菌的形态与结构放线菌的种类很多，多数放线菌具有发育良好的分支状菌丝体，少数为杆状或原始丝状的简单形态。
这里以与人类关系最密切、分布最广、种类最多、形态最典型的链霉菌属为例。
链霉菌主要由菌丝（mycelium）和孢子（spore）两部分结构组成。
（一）菌丝</strong></p>链霉菌的细胞呈丝状分支，不同发育阶段的菌丝分化程度不同，根据菌丝的着生部位、形态和功能可分为基内菌丝、气生菌丝、和孢子丝。
微生物,放线菌分类
3 基于核酸结构的分析
(1) 16S rRNA / rDNA基因序列的分析
该技术目前在放线菌分类中常被用于放线菌种属的 初步鉴定, 但是值得注意的是仅根据该指标并不能 确定菌株的种属, 必须结合其他的分类指标。
(2)16S-23S rRNA 转录间区序列的分析
16S-23S rRNA转录间区序列( 16S-23S rRNA）的进 化速率比16S rRNA大10倍, 其序列大小比16S r RNA更具直接测序优势, 可鉴别防线菌属与种。但 是16S-23S rRNA的不同拷贝之间大小比较相近且不 易区分。
经典分类学：按微生物 表型特征分类
表型特征：形态学、生理生化学、生 态学等，推断微生物的系统发育。 表型特征结合分子水平上的基因型特 征（如16S rRNA)，探讨微生物进化地 位、系统发育关系并进行分类鉴定。
微生物系统学： 按亲缘关系和进 化规律分类
★微生物分类学的三个任务：分类、鉴定及命名 ☆分类是根据微生物的相似性和亲缘关系，将微生物归入不同的分类类群。 ☆鉴定是确定一个新的分离物属于已经确认的哪个分类类群的过程。 ☆命名是根据国际命名法规给每一微生物类群及种类以科学的名称。
5 多相分类系统
由于微生物生理生化学的迅速发展，加速了这趋势 并逐渐打破了原来经典的描述分类，建立了如数值 分类、化学分类、分子分类以至于现在的多相分类 新的标准，大大推进了分类学的发展。多相分类是 将表型、基因型以及系统进化分析数据综合起来作 为分类和进化分析的依据。
3 放线菌的应用
在植物病害防治中的应用 放线菌是人们最早应用到生产中的生防微生 物，但是已投入使用的微生物源杀虫活性物质中 多数是来自真菌，有部分来自细菌如昆虫的病原 菌苏云金杆菌，放线菌来源的较少，从放线菌中 发现的活性物质中，80%是来自链霉菌属。
放线菌(1)
配方二 面粉琼脂培养基
面粉 60克 琼脂 20克
水 1000毫升
把面粉用水调成糊状，加水到500毫升，放在文火上煮30分 钟。另取500毫升水，放入琼脂，加热煮沸到溶解后，把两液调 匀，补充水分，调整pH值到7.4，分装，灭菌，备用。
与人类的关系
放线菌常以孢子或菌丝状态极其广泛地存在于自然界，土壤 中最多，其代谢产物使土壤具有特殊的泥腥味。
核酸类抗生素：这类抗生素含有核酸类 似物的衍生物，作用于病原菌的去氧核 糖核酸合成系统，抑制其前驱物或酵素 的合成，如保米霉素。 大环内酯类抗生素：它是由 12 个以上的 碳原子组成，且形成环状结构，通常可 和细菌的 50 核糖体亚基结合，以阻断蛋 白质的合成，如红霉素。
多烯类抗生素：由 25 ~ 37 个碳原子组成 的大环内酯类抗生素，含有 3 ~ 7 个相邻 的双键，可与病原真菌细胞膜上的类固
4、孢子的鞭毛同细菌鞭毛 5、核糖体为70s
放线菌
光学显微镜下的放线菌
放线菌在固体培养基上形成 与细菌不同的菌落特征，放 线菌菌丝相互交错缠绕形成 质地致密的小菌落，干燥、 不透明、难以挑取，当大量 孢子覆盖于菌落表面时，就 形成表面为粉末状或颗粒状 的典型放线菌菌落，由于基 内菌丝和孢子常有颜色，使 得菌落的正反面呈现出不同 A：诺尔斯氏链霉菌； 的色泽。 B：皮疽诺卡氏菌； C：酒红指孢囊菌； D：游动放线菌； E：小单胞菌； F：皱双孢马杜拉放线菌
放线菌的基本形态
2. 气生菌丝(aerial hyphae):
• 由营养菌丝长出培养 基外，伸向空间的菌丝。 略粗于基丝0.5-1.2μm， 也有色素产生。 • 功能：气生菌丝生长 到一定阶段可分化出繁殖 结构，即孢子丝。
3. 孢子丝
海洋放线菌的分类鉴定
海洋放线菌的分类鉴定一、放线菌㈠、放线菌的分布放线菌常以孢子或菌丝状态极其广泛地存在于自然界。
不论数量和种类，以土壤中最多。
河流和湖泊中，放线菌数量不多，大多为小单孢菌、游动放线菌和孢囊链霉菌，还有少数链霉菌。
海洋中的放线菌多半来自土壤或生存在漂浮海面的藻体上。
海水中还存在耐盐放线菌。
放线菌有一种土霉味，使水和食物变味，有的放线菌也能和霉菌一样使棉毛制品或纸张霉变。
放线菌主要能促使土壤中的动物和植物遗骸腐烂，最主要的致病放线菌是结核分枝杆菌和麻风分枝杆菌，可导致人类的结核病和麻风病。
放线菌最重要的作用是可以产生、提炼抗生素，目前世界上已经发现的2000多中抗生素中，大约有56%是由放线菌（主要是放线菌属）产生的，如链霉素、土霉素、四环素、庆大霉素等都是由放线菌产生的。
此外有些植物用的农用抗生素和维生素等也是由放线菌中提炼的。
㈡、放线菌的形态与结构放线菌菌体为单细胞，大多由分枝发达的菌丝组成，最简单的为杆状或具原始菌丝。
放线菌是一种革兰氏阳性菌。
放线菌菌丝细胞的结构与细菌基本相同。
根据菌丝形态和功能可分为营养菌丝、气生丝和孢子丝三种。
⑴营养菌丝匍匐生长于培养基内，主要生理功能是吸收营养物，故亦称基内菌丝。
营养菌丝一般无隔膜；直径0.2-0.8微米，但长度差别很大，短的小于100微米，长的可达600微米以上；有的无色素，有的产生黄、橙、红、紫、蓝、绿、褐、黑等不同色素，若是水溶性的色素，还可透入培养基内，将培养基染上相应的颜色，如果是非水溶性色素，则使菌落吨呈现相应的颜色。
色素是鉴定菌种的重要依据。
⑵气生菌丝长出培养基外并伸向空间的菌丝为气生菌丝。
它叠生于营养菌丝上，以至可覆盖整个菌落表面。
在光学显微镜下，颜色较深，直径比营养菌丝粗，约1-1.4微米，其长度则更悬殊。
直形或弯曲而分枝，有的产生色素。
⑶孢子丝气生菌丝上分化出可形成孢子的菌丝即孢子丝。
孢子丝的形状和在气生菌丝上的排列方式，随菌种而异。
孢子丝的形状有直形、波曲和螺旋形。
放线菌属的分类及描述
放线菌手册汇编放线菌科概述Actinomycetaceae描述：放线菌科是由Buchanan 在1918年创立的该科的一般特征是：革兰氏染色阳性，分支，偏直条状，大多数成员是属于球杆状或者类球形。
细胞长度一般小于0.5μm,平均长度在1.7μm 到2,9μm 之间。
群落可能形成丝状体形成类似菌丝体的外形，但是大多数菌落不分枝，而且主要是白色或者灰色，有一些特殊的菌落会形成深红色、淡红色、棕色、粉色、淡粉或淡黄色。
现在该科根据16s RNA 的核酸序列划分出包括五个不同的属：Actinomyces,Actionobaculum,Arcanobacterium,Aobiluncus,Aaribaculum.放线霉菌属Actinomyces该属包括的种有A. bovisA. bowdeniiA. canisA. cardiffensisA. catuliA. coleocanisA. dentalisA. denticolensA. europaeusFigure 1Scanning electron micrograph ofActinomyces israeliiA. funkeiA. georgiaeA. gerencseriaeA. graevenitziiA. hongkongensisA. hordeovulnerisA. howelliiA. humiferusA. hyovaginalisA. israeliiA. marimammaliumA. meyeriA. naeslundiiA. nasicolaA. neuiiA. odontolyticusA. oricolaA. radicidentisA. radingaeA. slackiiA. streptomyciniA. suimastitidisA. suisA. turicensisA. urogenitalisA. vaccimaxillaeA. viscosus一、Actinomyces bovisActinomyces bovis is a gram-positive, rod-shaped bacterium of the genus Actinomyces. It is the causative agent of Lumpy jaw in cattle, and occasionally causes infections in humansHistoryActinomyces bovis was first described in 1877 by C. O. Harz, as a microbe within the jaw tissue of cows with lumpy jaw. It was thought to be identical to Actinomyces israelii until 1940, when D. Erikson showed these to be two separate organisms.Figure 2Bovine actinomycosis. Granules (sulfa granules), consisting of colonies of bacteria (Actinomyces bovis) and club-shaped（球棒状的）reaction product, are within a purulent exudate.（脓性渗出物）二、Actinomyces georgiaeActinomyces georgiae is a species in the genus of Actinomyces. It isa part of the human periodontal flora（牙周菌群）.三、Actinomyces gerencseriaeActinomyces gerencseriae (Johnson et al. 1990) used to be known asActinomyces israelii serovar II.Actinomyces gerencseriae was named for the bacteriologist, Mary Ann Gerencser.Figure 3蜘蛛状高度分支的微菌落，26h在36°下培养（1500倍放大）Figure 4培养于BHIA上的微菌落，显示了一条带有分支的长丝（24h在36°条件下）四、Actinomyces israeliiActinomyces israelii is a species of Gram-positive, rod-shaped bacteria within the Actinomyces. Known to live commensally on and within humans, A. israelii is an opportunistic pathogen and a cause of actinomycosis. Many physiologically diverse strains of the species are known to exist, though all are strict anaerobes.Actinomycosis is most frequently caused by A. israelii. It is a normal colonizer of the vagina, colon, and mouth. Infection isestablished first by a breach of the mucosal barrier during various procedures (dental, gastrointestinal), aspiration, or pathologies such as diverticulitis. The chronic phase of this disease is also known the "classic phase" because the acute, early phase is often missed by health care providers. This is characterized by slow, contiguous growth that ignores tissue planes and forms a sinus(窦) tract that can spontaneously heal and recur, leading to a densely fibrotic lesion(纤维性病变). This lesion is often characterized as "wooden". Sulfur granules(瘤状颗粒) form in a central purulence（脓）surrounded by neutrophils（嗜中性粒细胞）. This conglomeration of organisms is virtually diagnostic of A. israelii.来源：Historically speaking the first written appearance of Actinomyces was made in 1877 when pathologist Otto Bollinger described their presence in cattle. Shortly after that James Israel discovered another specie of actinomyces or actinomycetes that are living in humans and in his honour these actinomyces have name actinomyces israelii. 概念性解释：Anaerobic organism represents any organism that doesn't require oxygen for its growth and in the presence of oxygen it may even die, while facultative anaerobic organism is usually a bacteria that creates adenosine triphosphate (ATP) that is one of the most used enzymes or cabalists or it can turn to the process of fermentation if it is exposed to the oxygen. Gram positive bacteria are those that according to Gram staining are dark blue or violet in colour. If a bacterium is Gram negative it will not be able to retain the violet strain of crystal.There is one difference between Actinomyces and other bacteria and that is that Actinomyces don't form endospores and they form branched networks of hyphae that looks like fungus while otherbacteria are in a shape of rod and they don't make branched networks. In fungi hyphae are the main mode of vegetative growth and their collective name is mycelium.五、Actinomyces naeslundiiActinomyces naeslundii is a Gram-positive, rod-shapedbacterium found in the mouth of humans. The species has beenimplicated in periodontal disease, as well as various tooth cavities.In other cases, A. naeslundii is associated with good oral health. It isone of the first bacteria to occupy the oral cavity and colonize thetooth's surface. It has also been isolated from women with bacterialvaginosis.Any species of the genus Actinomyces, including A. naeslundii, cause a chronic disease called actinomycosis, which is characterized by swelling and formation of an abscess （脓肿） which may exude pus.This can beaccompaniedby tissue fibrosis.六、Actinomyces radicidentisActinomyces radicidentis is a species in the genus of Actinomyces, first isolated from infected root canals of teeth. ITs type strain is CCUG 36733. Once characterized, it has since been found to be present in failed root canal treatments. Its pathogenicity has been suggested to be due to an ability to form cell aggregates, held together by embedding in an extracellular matrix in host tissues. Like other pathogenic Actinomyces, by collectively finding itself in Figure 5Histopathological changes due to en:Actinomycesnaeslundii bacteria. en:Silver stain, brain abscess. Obtained fromthe CDC Public Health Image Library.a protected biofilm（生物膜）environment can evade elimination by host defenses, including phagocytosis.Figure 6 Scanning (a-d) and transmission electron micrographs (e-g) of A radicidentis, strain CCUG 36733. Cells grown on Brucella blood agar exhibit coccoid shape (a), similar to cells grown in serum-supplemented Tryptic soy broth, where fimbriae-like bundles can be seen (b). When cells were grown in RPMI-1640 broth with serum (c, d), they were rod-shaped with intertwining bundles of fimbriae-like cell appendices in a netlike arrangement. In thin section (e), bundle of fimbriae can be observed emerging from cell surface; demarcated area in (e) is magnified in (f). Further thin section (g) shows radially placed fimbriae emerging from fuzzy-coated cell surface. Bars = 1 µm.七、Actinomyces viscosusActinomyces viscosus is a human and animalpathogen/pathobiont which colonizes the mouths of most adult humans.It is Gram-negative, anaerobic, rod-shaped, and filamentous.It causes periodontal disease（牙周病）in animals, and has been isolated from human dental calculus（牙结石）and root surface caries, as well as the oral cavity hamsters and actinomycotic lesions in swine, cats, and dogs. Furthermore, it has been shown to cause endocarditis（心内膜炎）.Actinomyces viscosus is aGram-positive, anaerobic,filamentous bacterium that ispart of the human oral flora.This rod shaped filamentousbacteria occur around the teeth,gums（牙龈）and throat inhealthy humans. Species of this bacterium can cause actinomycosis - a granulomatous infection with the formation of abscesses in the mouth, lungs, or the gastrointestinal tract. Oral actinomycosis may occur due to trauma such as a tooth extraction or bleeding gums. Abdominal actinomycosis may follow appendicitis. Treatment is with antibiotics. Actinomyces spp.normally are soil or aquatic fungi feeding off decaying matter (saprophytes，sapro,spoiled). They resemble fungi and form fungi-like mats (mycelia)关于gram-staining:染色效果：Figure 7A Gram stain of mixed Staphylococcus aureus (S. aureus ATCC 25923, gram-positive cocci, in purple) and Escherichia coli (E. coli ATCC 11775, gram-negative bacilli, in red), the most common Gram stain reference bacteria.Gram-positive bacteria havea thick mesh-like cell wallmade of peptidoglycan(50–90% of cell envelope), andas a result are stainedPurple by crystal violet, whereasGram-negative bacteriahave a thinner layer(10% of cell envelope), so donot retain the purple stainand are counter-stained pink by safranin.八、Actinomyces odontolyticusActinomyces odontolyticus is an anaerobic, facultativecapnophilic, gram-positive, nonsporulating, non–acid fast(不耐酸的),non-motile, irregularly staining bacterium. Sometimesshort or medium-sized rods resembling diphtheroids（白喉）areseen. Shorter rods resembling propionibacteria are frequentlyseen with A. odontolyticus and may be arranged inpalisades（栅栏）as well as other diphtheroidal arrangements. Onblood agar, the bacteria develop as small, irregular, whitishcolonies that are smooth to slightly granular and show adark red pigment when mature (2–14 days). This pigmentationis most obvious when the cultures are left standing inair at room temperature after primary anaerobic isolation.The organism also grows well on CNA and Brucella agar. Definitive identification is madeby negative catalaseand oxidasetests, the reduction of nitrate（硝酸盐）to nitrite（亚硝酸盐）,filamentationof microcolonies,and absence of growth at pH5.5.Generally, the fermentation（发酵）reactions are variable.。
放线菌分类2
对营养的要求相当弹性，能降解一些杀虫剂和除草剂
嗜皮菌属(Dermatophilus)
寄生于哺乳动物，导致刚果嗜皮菌病的皮肤感染
链霉菌亚目
目前该亚目只有链霉菌科，该科目前有三个属，即 链霉菌属、北里孢菌属和嗜酸链霉菌属。
该科成员均为革兰氏阳性菌好氧菌，产生发育良好、 不易断裂的分支状基内菌丝，大多数产生分支状气
模式种：白色链霉菌
北里孢菌属
该属特征为：基内菌丝发达，类似链霉菌，基内和 气生菌丝上着生常超过20个孢子的长孢子链。基内 菌丝不断裂，无孢囊。细胞壁含甘氨酸、半乳糖，
全细胞水解液含半乳糖，但不含阿拉伯糖、马杜拉
糖和木糖。磷酸类脂类型为P2型， DHA的（G+C） mol%含量范围为66-67
微球菌亚目
包括十四个科，典型科为微球菌科，该科的典型属为微球菌
微球菌属(Micrococcus)
广泛存 在于土壤中，水中和哺乳动物皮肤上，后者更为 常 见，但并无致病性
节杆菌属(Arthrobacter)
杆菌一球菌的生长循环：对数期时，细菌呈不规则，分支
的杆状，以断裂繁殖。当它们进入稳定期，细胞变成球状
பைடு நூலகம்
鱼孢菌科及主要属
该科典型属是鱼孢菌属 鱼孢菌属：菌丝和孢子革兰氏阳性，不抗酸，细胞壁化 学组分Ⅲ型。无基内菌丝。气生菌丝一般短，(0.5～
1.2)×(10～25)微米，少分枝；基部细胞下面形成球冠状
固着器,用以将气生菌丝固定在固体培养基的表面;气生菌 丝断裂成表面光滑的孢子，孢子球形或杆状，有时呈长 达6微米的鱼形,本科因此得名。孢子有颈饰痕迹和1～3 根端生鞭毛,能游动;革兰氏染色不定；细胞壁Ⅰ型。本属 现只发现多形鱼孢菌1种。
临床微生物与检验 第18章 放线菌
❖ 5.牛心脑浸液琼脂平板 直径0.03～0.06mm，蛛网状微 菌落。——有助于鉴定放线菌。
❖ 6.牛放线菌在牛心脑浸液琼脂培养基上 扁平、光滑、
边缘整，呈颗粒状微小菌落
菌落增大。
衣氏放线菌在厌氧血平板上粗糙型菌落a 衣氏放线菌在厌氧血平板上粗糙型菌落b 衣氏放线菌硫磺颗粒及压片
生化反应
衣氏放线菌与牛放线的生化特征
2.巴西诺卡菌—菌由外伤侵入皮下组织产 生慢性化脓性肉芽组织 。
诊断与治疗
１.标本：采集组织渗出液、痰、脊髓液或其他病理材料， 查找黄红或黑色颗粒 .
２.检验方法：
(1)
(2)
❖ 在患者病灶组织和脓样物质中可见黄色 小颗粒——硫磺颗粒（sulfur granule)， 是放线菌在组织中形成的菌落。将硫磺
衣氏放线菌（革兰染色）
培养特点
❖ 1.培养比较困难。厌氧或微需氧;初分离需CO2
❖ 2.葡萄糖肉汤
培养基底部形成灰白色球形小颗粒沉
淀物。
❖ 3.硫乙醇酸钠肉汤 下层形成白色或灰白色雪花样生长
❖ 4.血平板→灰白色/淡黄色粗糙而不规则的菌落，不溶血。
多次移种可形成光滑、柔软、白色、有光泽易于钩取的菌 落。
能使蔗糖变成胶状葡聚糖，附着于齿面、形成齿斑。 乳酸杆菌则在齿斑上进一步发酵蔗糖或其他食品中 的糖类产生乳酸。溶解齿质及法朗质中的磷酸钙， 使之脱钙，使其他细菌经牙质小管侵入牙髓，造成 牙根端脓肿等。最后形成龋齿
免疫性
放线菌病患者血清中可检 测到多种特异性抗体，但这种 抗体无诊断意义．机体对放线 菌的免疫主要靠细胞免疫．
❖ 短链诺卡菌(N.brevicatena)
❖ 鼻疽诺卡菌(N.farcinica)
❖ 肉色诺卡菌(N.carnea)
第二节放线菌
它叠生在营养菌丝上，以至可覆盖整个菌落表 面。
3、孢子丝：孢子丝是由气生菌丝发育到一定阶段，
其上可分化出形成孢子的菌丝。
有垂直、波曲、螺旋、轮生等形状。
链霉菌的各种孢子丝形态
（二）、孢子形态
灰色链霉菌直链形孢 子，孢子表面光滑
• 3、生产多种酶抑制剂 • （1）淀粉酶抑制剂：抑制淀粉酶，治疗糖尿病、肥胖症、 高血脂症等(淀粉酶链霉菌、黄色产色链霉菌等) • （2）亮肽酶抑制剂：抑制胰酶、浆胞素等，用于肌肉营养 失调症(玫瑰产色链霉菌、银样链霉菌) • （3）唾液酸酶抑制剂：抗流感病毒(玫瑰色链霉菌、龟裂链 霉菌) • （4）其他酶类抑制剂 • 糜蛋白酶抑制剂、弹性蛋白酶抑制剂、碱性磷酸酶抑制剂 （癌的免疫疗法） • 4、生产维生素 • B12（橄榄色链霉菌、灰色链霉菌）、胡萝卜素（克雷斯托 链霉菌）
§2 放线菌
有机肥料
用途广
耳聋
大多腐生、异养 有一定危害性
放线菌病
马铃薯疮痂病 脱发
一、放线菌的形态与结构
n 单细胞，大多由分枝发达的菌丝组成，最简 单的为杆状或具原始菌丝。 n 菌丝直径大约1um。 n 细胞壁化学组成中含胞壁酸和二氨基庚二酸， 不含几丁质或纤维素。 n 大多革兰氏染色阳性，极少数阴性。
• (2) 以小双孢菌属菌、小四孢菌属属为代表：在基内菌丝 上不形成孢子而仅在气生菌丝顶端分别形成2个和4个孢子。 • 1) 营养菌丝：有。 • 2) 气生菌丝：有。 • 3) 孢子丝：无。 • 4) 孢子：在气生菌丝顶端分别形成2个和4个孢子。
小双孢菌
小四孢菌
• 2、菌丝顶端形成少量孢子的放线菌 • (3) 以小多孢菌属为代表：既在气生菌丝又在基 内菌丝顶端形成2－10个孢子。 • 1) 营养菌丝：有。 • 2) 气生菌丝：有。 • 3) 孢子丝：无。 • 4) 孢子：既在气生菌丝又在基内菌丝顶端形成 2 －10个孢子。
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一、酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)1 酸微菌目(Acidimicrobiales)酸微菌亚目(Acidimicrobineae)酸微菌科(Acidimicrobiaceae)酸微菌属(Acidimicrobium)典型种：氧化亚铁微酸菌（Acdimicrobium ferrooxidans）二、红色杆菌亚纲(Rubrobacteridae)1 红色杆菌目(Rubrobacterales)红色杆菌亚目(Rubrobacterineae)红色杆菌科(Rubrobacteraceae)红色杆菌属(Rubrobacter)2 土壤红杆菌目（Solirubrobacterales）土壤红杆菌科（Solirubrobacteraceae）扩展杆菌科（Patulibacteraceae）康奈斯氏杆菌科（Conexibacteraceae）康奈斯氏杆菌属(Conexibacter)3 嗜热油菌目（Thermoleophilales）嗜热油菌科（Thermoleophilacceae）嗜热油菌属（Thermoleophilum）三、红蝽杆菌亚纲（Coriobacteride）1 红蝽杆菌目（Coriobacteriales）红蝽杆菌科（Coriobacteriaceae）红蝽杆菌属（Coriobacterium）阿托波菌属（Atopobium）扣林氏菌属（Collinsella）神秘杆菌属(Cryptobacterium)反硝化杆菌属(Denitrobacterium)伊格尔兹氏菌属(Eggerthella)欧陆森氏菌属(Olsenella)斯莱克氏菌属(Slackia)非消化糖杆菌属(Asccharobacter）肠杆菌属（Enterorhabdus）戈登氏杆菌属（Gordonibacter）类伊格尔兹氏菌属（Paraeggerthella）四、腈基降解菌亚纲（Nitriliruptoride）1 腈基降解菌目（Nitriliruptorales）腈基降解菌科（Nitriliruptoraceae）腈基降解菌属（Nitriliruptor）2尤泽比氏菌目（Euzebyales）尤泽比氏菌科（Euzebyaceae）尤泽比氏菌属（Euzebya）五、放线菌亚纲(Actinobacteridae)1 放线菌目(Actinobacterales)放线菌亚目(Actinomycineae)放线菌科(Actinomycetaceae)放线菌属(Actinomyces)放线杆菌属(Actinobaculum)隐秘杆菌属(Arcanobacterium)动弯杆菌属(Mobiluncus)弯曲短杆菌属(Varibaculum)链霉菌亚目(Streptomycineae)链霉菌科(Sterptomycetaceae)链霉菌属(Streptomyces)北里孢菌属(Kitasatospora)链嗜酸菌属（Streptacidiphilus）链孢囊菌亚目(Streptosporangineae)链孢囊菌科(Streptosporangiaceae)链孢囊菌属(Streptosporangium)小双孢菌属（Microbispora）小四孢菌属(Microtetraspora)野野村氏菌属(Nonomuraea)游动单孢菌属(Planomonospora)游动双孢菌属(Planobispora)草孢菌属(Herbidospora)游动四孢菌属(Planotetraspora)高温多孢菌属（Thermopolyspora）果实包囊菌属（Acrocarpospora）球状包囊菌属（Sphaerisporangium）拟诺卡氏菌科(Nocardiopsaceae)拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)高温双岐菌属(Thermobifida)链单孢菌属(Streptomonospora)盐放线孢菌属（Haloactinospora）海洋放线孢菌属（Marinactinospora）高温单孢菌科(Thermomonosporaceae)高温单孢菌属(Thermomonospora)马杜拉放线菌属(Actinomadura)螺孢菌属（Spirillospora）珊瑚放线菌属（Actinocorallia）高温双孢菌属（Thermobispora）小单孢菌亚目(Micromonosporineae)小单孢菌科(Micromonosporaceae)小单孢菌属(Micromonospora)游动放线菌属(Actinoplanes)指孢囊菌属(Dactylosporangium)发仙菌属(Pilimelia)短链孢菌属(Catellatospora)短链游动菌属(Catenuloplanes)库奇游动菌属(Couchiolanes)螺旋游动菌属(Spirilliplanes)疣孢菌属(Verrucosispora)杆状孢囊菌属(Virgisporangium)长孢菌属（Longispora）阿森诺氏菌属（Asanoa）盐孢菌属（Salinispora）放线短链孢菌属（Actinocatenispora）多形态孢菌属（Polymorphospora）克拉西利尼科夫菌属（Krasilnikovia）卢得曼氏菌属（Luedemannella）假孢囊菌属（Pseudosporangium）游动孢囊菌属（Planosporangium）短链球孢囊菌（Catelliglobosispora）滨田氏菌属（Hamadaea）植物放线孢囊菌（Plantactinospora）皱纹单孢菌属（Rugosimonospora）植物栖居菌属（Phytohabitans）放线橘橙孢菌属（Actinaurispora）异短链球孢菌属（Allocatelliglobosispora）糖霉菌亚目（Glycomycineae）糖霉菌科（Glycomycetaceae）糖霉菌属（Glycomyces）斯塔堪布瑞德氏菌属（Stackebrandtia）盐糖霉菌属（Haloglycomyces）细链孢菌亚目（Catenulisporineae）细链孢菌科（Catenulisporaceae）细链孢菌属（Catenulispora）丛生放线菌科（Actinospicaceae）丛生放线菌属（Actinospica）放线多孢菌亚目（Actinopolysporineae）放线多孢菌科（Actinopolysporaceae）放线多孢菌属（Actinopolyspora）动球菌亚目（KIneococcineae）动球菌科（KIneococcaceae）动球菌属（KIneococcus）动孢菌属（Kineosporia）四折叠球菌属（Quadrisphaera）假诺卡氏亚目(Pseudonocardineae)假诺卡氏菌科(Pseudonocardiaceae)假诺卡氏菌属(Pseudonocardia)异壁放线菌菌属(Actinoalloteichus)拟无枝酸菌属(Amycolatopsis)克洛斯氏菌属(Crossiella)拟孢囊菌属(Kibdelosporangium)库兹涅尔氏菌属(Kutzneria)古德飞罗氏菌属（Goodfellowia）普劳斯氏菌属(Prauserella)糖单孢菌属(Saccharomonospora)糖多孢菌属(Saccharopolyspora)异壁链霉菌属(Streptoalloteichus)放线孢菌属（Actinomycetospora）异库兹涅尔氏菌属（Allokutzneria）南海海洋所菌属（Sciscionella）束丝放线菌科（Actinosynnemataceae）束丝放线菌属（Actinosynnema）列舍瓦列氏菌属（Lechevalier）伦兹氏菌属（Lentzea）糖丝菌属（Saccharothrix）动孢放线菌属（Actinokineospora）梅泽宾夫氏菌属（Umezawaea）弗兰克氏菌亚目(Frankineae)弗兰克氏菌科(Frankiaceae)弗兰克氏菌属(Frankia)热酸菌属（Acidothermus）隐孢囊菌科（Cryptosporangiaceae）隐孢囊菌属（Cryptosporangium）矿生菌属（Fodinicola）地嗜皮菌科（Geodermatophilaceae）地嗜皮菌(Geodermatophilus)芽生球菌属（Blastococcus）贫养杆菌属（Modestobacter）中村氏菌科（Nakamurellaceae）潮湿球菌属（Humicoccus）鱼孢菌科（Sporichthyaceae）鱼孢菌属（Sporichthya）棒杆菌亚目(Corynebacterineae)棒杆菌科(Corynebacteriaceae)棒杆菌属(Corynebacterium)黎世菌属（Turicella）迪茨氏菌科（Dietziaceae）分枝杆菌科（Mycobacteriaceae）分枝杆菌属（Mycobacterium）诺卡氏菌科（Nocardiaceae）诺卡氏菌属(Nocardia)戈登氏菌属（Gordonia）红球菌属(Rhodococcus)斯科曼氏菌属（Skermania）威廉姆斯氏菌属（Williamsia）米利斯氏菌属（Millisia）慢反应脂肪酸菌科（Segniliparaceae）慢反应脂肪酸菌属（Segniliparus）冢村氏菌科（Tsukamurellaceae）冢村氏菌属（Tsukamurella）微球菌亚目(Micrococcineae)微球菌科(Micrococcaceae)微球菌属(Micrococcus)螨共生菌属（Acaricomes）节杆菌属(Arthrobacter)柠檬球菌属Citricoccus)考克氏菌属(Kocuria)涅斯捷连科氏(Nesterenkonia)肾杆菌属(Renibacterium)罗氏菌属(Rothia)志恒菌属（zhihengliuella）中国单孢菌属（Sinomonas）口腔球菌属(Stomatococcus)布登堡菌属（Beutenbergia）乔治菌属（Georgenia）萨勒河菌属（Salana）博戈里亚湖菌科（Bogoriellaceae）博戈里亚湖菌属（Bogoriella）短杆菌科（Brevibacteriaceae）短杆菌属（Brevibacterium）纤维单孢菌科（Cellulomonadaceae）纤维单孢菌属（Cellulomonas）光柱菌属（Actinotalea）去甲基醌菌属（Demequina）厄氏菌属（Oerskovia）吸收不良菌属（Tropheryma）皮杆菌科（Dermabacteraceae）皮杆菌属（Dermabacter）短状杆菌属（Brachybacterium）皮生球菌科（Dermacoccaceae）皮生球菌属（Dermacoccus）肥沃菌属（Demetria）皮革球菌属（Kytococus）嗜皮菌科（Dermatophilaceae）嗜皮菌属（Dermatophilus）动球菌属（Kineosphaera）间孢囊菌科（Intrasporangiaceae）间孢囊菌属（Intrasporangium）砒酸球菌属（Arsenicicoccus）两面神菌属（Janibacter）诺尔士菌属（Knoellia）鸟氨酸球菌属（Ornithinicoccus）鸟氨酸微球菌（Ornithinimicrobium）稻田土壤菌属（Oryzihumus）丝氨酸球菌属（Serinicoccus）地杆菌属（Terrabacter）土壤球菌属（Terracoccus）四球菌属（Tetrasphaera）潮湿芽孢杆菌属（Humibacillus）国生工所菌属（Kribbia）矿杆菌属（Fordinibacter）小石球菌属（Lapillicoccus）海藻球菌属（Phycicoccus）海居菌属（Marihabitans）潮湿居菌属（Humihabitans）琼斯菌科(Jonesiaceae)琼斯菌属（Jonesia）微杆菌科（Microbacteriaceae）微杆菌属（Microbacterium）阿格雷氏菌属（Agreia）壤球菌属（Agrococcus）壤霉菌属（Agromyces）棍状杆菌属（Clavibacter）喜冷杆菌属（Cryobaterium）短小杆菌属（Curtobacterium）冷杆菌属（Frigoribacterium）叶居菌属（Frondihabitans）喜珍品杆菌属（Gulosibacter）拉贝达氏菌属（Labedella）利夫森氏菌属（Leifsonia）无色杆菌属（Leucobacter）微孢菌属（Microcella）小土居菌属（Microterricola）栖霉菌属（Mycetocola）奥卡河杆菌属（Okibacterium）盐水杆菌属（Salinibacterium）栖地下菌属（Subtercola）假棍状杆菌属（Pseudoclavibactet）植物杆菌属（Plantibacter）拉氏杆菌属（Rathayibacter）赤球菌属（Rhodoglobus）朴勇河氏菌属（Yonghaparkia）舒曼氏菌属（Schumannella）海藻菌属（Phycicola）克鲁格氏菌属（Klugiella）潮湿杆菌属（Humibacter）冰伽杆菌属（Glaciibacter）齐默曼氏菌属（Zimmermannella）原小单孢菌科（Promicromonospore）原小单孢菌属（Promicromonospora）纤维微菌属（Cellulosimicrobium）栖白蚁菌属（Isoptericola）产丝菌属（Myceligenerans）解木聚糖杆菌属（Xylanibacterium）解木聚糖微菌属（Xylanimicrobium）解木聚糖单孢菌属（Xylanimonas）稀有杆菌科（Rarobacteraceae）稀有杆菌属（Rarobacter）血杆菌科（Sanguibacteraceae）血杆菌属（Sanguibacter）阎氏菌科（Yaniellaceae）阎氏菌属（Yaniella）阮氏菌科（Ruaniaceae）阮氏菌属（Ruania）嗜盐放线杆菌属（Haloactinobacterium）丙酸杆菌亚目（Propionibacterineae）丙酸杆菌科（Propionibacteriaceae）丙酸杆菌属（Propionibacterium）黄球菌属（Luteococcus）小月菌属（Microlunatus）产丙酸菌属（Propioniferax）产丙酸微球菌（Propionimicrobium）四圆形菌属（Tessaracoccus）弗莱德门氏菌属（Friedmanniella）微白霜菌属（Micropruina）产丙酸单孢菌属（Propionicimonas）潮汐滩菌属（Aestuariimicrobium）布克劳氏菌属（Brooklawnia）颗粒球菌属（Granulicoccus）产丙酸细胞菌属（Propionicicella）类诺卡氏菌科（Nocardioidaceae）类诺卡氏菌属（Nocardioides）多形态放线菌属（Actinopolymorpha）气微菌属（Aeromicrobium）氏菌属（Jiangella）国生工菌属（Kribbella）石雕菌属（Marmoricola）2 双栖杆菌目（Bifidobacteriales）双栖杆菌科（Bifidobacteriaceae）双栖杆菌属（Bifidobacterium）加德纳氏菌属（Gardnerella）斯卡多维亚氏菌属（Scardovia）类斯卡多维亚氏菌属（Parascardovia）卡多维亚氏菌属（Aeriscardovia）异斯卡多维亚菌属（Alloscardovia）另类斯卡多维亚氏菌属（Metascardovia）高温放线菌高温放线菌科（Thermoactinomycetaceae）高温放线菌属（Thermoactinomyces）来斯氏菌属（Laceyella）高温黄色微菌属（Thermoflavimicrobium）清野氏菌属（Seinonella）直丝菌属（Planifilum）皂硫-洛克菌属（Mechercharimyces）岛津氏菌属（Schimazuella）。