Pubmed数据库

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注:如果在上述4个表或索引中仍找不到相匹配的词时,PubMed就将短语
五、PubMed基本检索规则
如: single cell 系统会自动将其分成两个词:single和 cell检索,其检索表达式为:“single AND cell ”。
五、PubMed基本检索规则
强制检索功能
• 强迫短语检索,在检索词上加双引号,将不执行自 动转换匹配和扩展检索.
收录PubMed中未经标引的最新记录。经过主题 词、文献类型、基因库存取号等加工索引后,添加到 Medline数据库中,并从PreMedline库中删除。
[PubMed-in process]
Publisher-Supplied Citations
出版商直接提供的文献,每条记录都标有 [PubMed-as supplied by publisher]。
二、Entrez资源整合系统
Entrez是NCBI为广大生物研究人员提供的一个 基于文本的集成检索系统。通过该平台可以检 索到NCBI提供的28个数据库,这些数据库包括 文献数据库、DNA和蛋白质序列数据库、三维 蛋白质结构数据库、种群研究库、表达库、完 全人类基因组库、分类信息等。
二、Entrez资源整合系统
主题检索
• 《医学主题词表》是对生物医学文献进行主题分析、 标引和检索的权威性词表,它的作用是使医学文献的 主题标引和检索达到统一和一致,并指导用户高质量 地检索医学文献。它可以指导用户从同义词发现主题 词,告诉用户主题词如何使用,显示主题词之间的相 互关系。
基本概念
• 主题词表:PubMed采用的主题词表是美国国立 医学图书馆的医学主题词表(Medical Subject Headings,简称MeSH) 。 • MeSH :是美国国立医学图书馆编制的权威性主题 词表。它是一部规范化的可扩充的动态性叙词表。 美国国立医学图书馆以它作为生物医学标引的依据, 编制《医学索引》(Index Medicus)及建立计算 机文献联机检索系统MEDLINE数据库。《MeSH》汇 集约24,357多个医学主题词(2007年)。

一PubMed数据库简介

一PubMed数据库简介
?clinicalalerts公布nih资助重要临床研究结果?clinicaltrials对公众提供临床科研的当前信息?pubmedcentral可免费提供全文生命科学文献服务功能pubmedpubmed在检索框中键入一到多个检索词按go键即显示检索结果
一、PubMed数据库简介
PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)下属 的 国 家 生 物 技 术 信 息 中 心 (NCBI) 开 发 的 、 基 于WWW的医学数据库查询系统。
图1
其它库 NCBI其它数据库的相关记录:
PubMed建立了与NCBI其他数 据库之间联系。它们是双向网 络互连的关系(见下页图)。
NCBI中通过Entrez可互查的数据库
三、PubMed页面的结构
登录 PubMed主页
/entrez/query.fcgi /PubMed/
PubMed的网址: /pubmed
特点:收录范围广、内容全、检索途径多、 检索体系完备,可少部分获取原文。
P75
二、通过PubMed可检索 到如下的信息
MEDLINE PreMedline 出版商提供的书目信息 NCBI其它数据库的相关记录
MEDLINE:是美国国立医学ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ书馆
检索Common Cold AND Vitamin C
preview1
五、 PubMed辅助检索工具(三)
3. History:
保留所有的检索策略和结果,只有在执行了一次检索后, History才能有记录。 显示检索序号、检索词、检索时间以及检索结果数量。 可在检索序号之间添加逻辑运算符进行检索,如#2 AND #6 单击记录条数超级链接可以重新显示检索结果。 点击Clear History按键可以清除History和Preiew/Index中的 信息。 最多存贮检索式数为100个,检索式的存贮时间为1小时。

pubmed数据库及获取文献小技巧

pubmed数据库及获取文献小技巧

检索字段及标识符
AD(Address): 第一作者所属单位和地址 ALL(All Fields): 全部字段 AU(Author): 作者姓名 DP(Publication Date): 出版时间 EDAT(Entrez Date): 录入时间 1AU(First Author Name): 第一作者姓名 FAU(Full Author Name): 作者姓名全称(02年以后) LASTAU(Last Author) 最后一个作者(通讯作者) IP(Issue): 期号、部分号、增刊号 IS(ISSN): 国际标准刊号 LA(Language): 原文语种

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河北省图书馆 代理中国


河北省图书馆
获取全文小技巧

图书馆资源
河北省图书馆 代理中国


science
Science[ta]
single cell
Pubmed检索
高级检索
nature
Searching by a specific field
chronic proctitis
Pubmed检索
主题检索
《医学主题词表》:
Gastric Neoplasms Gastric Cancer Stomach Cancer Stomach Neoplasms
收录2400多万条题录信息,周 二~周六每日更新,更新2000 ~ 4000条信息。

Pubmed数据库概况
PUBMED收录的文献主要来自三个数据库: 1. Medline 2. In Process Citations 3. Publisher-Supplied Citations
Pubmed数据库
Pubmed数据库

pubmed的文章类型review

pubmed的文章类型review

从上世纪60年代至今,Pubmed数据库已经收录了大量的医学相关的文献,其中包括了大量的review文章。

review文章在医学领域中扮演着非常重要的角色,它们可以帮助医生、研究人员和学生们及时地了解最新的研究进展和临床应用。

本文将就Pubmed数据库中的review文章类型进行详细的介绍,并分析其在医学领域中的重要性。

一、Pubmed数据库概述Pubmed是由美国国家医学图书馆(NLM)维护的一个免费的医学文献数据库,其中包括了生物医学领域的文献索引。

它涵盖了生物医学的各个子领域,如临床医学、基础医学、生物化学等。

Pubmed提供了对于数以百万计的医学文献的检索和查阅服务,使得医学工作者可以方便地获取最新的研究成果和临床实践。

二、Pubmed中的review文章类型在Pubmed数据库中,review文章类型是一种非常常见的文献类型。

review文章是对某一特定主题进行综合性总结和回顾的文献,通常由专业领域的权威人士或者研究团队撰写。

这类文章不仅可以总结该领域的最新进展,还可以对领域中的争议性问题进行梳理和讨论。

在Pubmed中,review文章通常被归类到专门的review文章类型下,便于用户进行查找和阅读。

三、review文章的重要性review文章在医学领域中具有非常重要的地位和作用。

它们可以帮助医学工作者及时了解某一领域的最新研究成果。

由于医学研究的进展非常迅速,一些研究成果可能会在短时间内产生影响。

而review文章可以将这些研究成果进行总结和梳理,便于医学工作者快速获取信息。

对于一些复杂的疾病或者治疗方案,review文章可以对领域内的各种观点和研究成果进行梳理和综合,帮助医学工作者更好地制定临床治疗方案。

对于医学学生和研究生来说,review文章是他们了解某一领域研究历史和现状的重要参考资料。

四、如何利用Pubmed查找review文章在Pubmed中查找review文章非常简单。

2网上医学数据库(pubmed)

2网上医学数据库(pubmed)

PubMed页面的结构
检索提问区相关数据库链接、 检索提问框 、辅助检索工具
辅 助 功 能 区
Entrez简介、 PubMed服务、 特有检索、相 关资源
检索提示区
对各项检索功能的简单描述
PUBMED中常用的字段
Tag Name Tag Name AB Abstract AD Affiliation AU Author TI Title CN Corporate Author DPPublication Date EDAT Entrez Date FAU Full Author Name GS Gene Symbol IP Issue IS ISSN JID NLM Unique ID LA Language UID Unique Identifier PMID PMID MH MeSH Terms MHDA MeSH Date PG Pagination PL Place of Publication PMID PubMed Unique Identifier PT Publication Type RF Number of References RN EC/RN Number SO Source TA Journal Title Abbreviation VI Volume
sore各种显示方式的Fra bibliotek要内容1、Summary 2、Brief 3、Abstract 4、Citation 5、MEDLINE
各种显示方式的主要内容
6、ASN.1 7、Text 8、Protein links——可显示链接到蛋白质数据库 相关蛋白质的超链。 9、Nucleotide links——可显示链接到核苷酸数 据库相关基因的超链。 10、Structure links——可显示链接到结构数据 库中相关结构的超链。 11、Genome links——链接到相关基因组。

PubMed数据库

PubMed数据库
自动转换匹配 在检索框中键入一个或多个英文单词(大写或小写 均 可),点击Search按钮,PubMed系统会自动在主题 词表,期刊名表,短语表及作者索引中查询与输入的词 相匹配的形式,这就是它特有的“自动词汇匹配功能”。 例如:检索肿瘤 (cancer)方面的文章。 在检索框中输入:“cancer”,再点击“Search” 按钮。 PubMed将自动地利用它的“自动词汇匹 配”功能将重要的词语结合在一起,并将不规范的词语 转换成MeSH词表中规范的用词进行检索,比如,检索 “cancer” 将自动转换为:"neoplasms"[MeSH Terms] OR "neoplasms"[All Fields] OR "cancer"[All Fields]
PubMed数据库
生物工程122班
李菊秋、鞠文君、梁金姬、宋德涵
PubMed数据库
PubMed简介 PubMed数据范围 认识新版PubMed PubMed检索方法 检索结果保存

一、PubMed简介
PubMed是美国国立医学图书馆(NLM)
的国家生物技术信息中心 (NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统。 收录1966年以来的包含医学、护理、牙科、兽医、健康保健系统 及前临床科学的文献。这些数据来源于70多个国家和地区的4000 多种生物医学期刊。 NCBI的任务: 利用计算机信息处理技术,建立分子生物学、生物化学、遗 传学知识的自动存储和分析系统,并开展相关先进方法的研 究。 提供基因数据库、文献数据库、分子结构数据库、基因组等 30多个数据库检索。
比如:检索文章题目中含有高血压的中文文献 检索式:hypertension[ti] AND chi[la]

PUBMED数据库检索

PUBMED数据库检索
PubMed - indexed for MEDLINE



PubMed 概述 PubMed 的各种检索方法 PubMed 检索结果的处理 My NCBI
PubMed的基本检索界面
检索功能区
辅助功能区
检索途径与方法

基本检索 - Basic Search 高级检索 - Advanced Search 限定检索 - Limits Search 主题词检索 - MeSH Browser 特定文献查找- Citation Matcher 临床查询 – Clinical Queries

PUBMED具有自动词语匹配功能,系统将按顺 序自动使用如下3种索引,对检索词进行转 换后再进行检索。Mesh转换表、刊名转换表、 著者索引。如果在Mesh表找到相匹配的主题 词,系统用Mesh词和Text Word进行OR组配 检索。
Aspirin
强制检索
十年间发表的人类乙肝疫苗 临床试验研究的英文文献?
保存到剪贴板中的记录
My NCBI的注册与登录
保存到的检索式或记录
保存到NCBI中的记录
保存到NCBI中的记录


充分认识到PubMed在医学文献检索 中的重要作用 掌握PubMed的各种检索方法,包括基 本检索、限定检索、高级检索,重 点掌握主题词检索 掌握PubMed检索策略和检索记录的 存储 注册My NCBI帮助自己管理检索结果
PUBMED数据库检索



PubMed 概述 PubMed 的各种检索方法 PubMed 检索结果的处理 My NCBI
PubMed数据库简介
PubMed是美国国立医学图书馆开发的生物医学信息 书目数据库MEDLINE的免费网络版 内容包括美国《 Index Medicus》、《 Index to Dental Literature》、《 International Nursing Index》和部分生命科学领域的期刊文献 内容涉及基础医学、临床医学、环境医学、营养卫 生、职业病学、卫生管理、医疗保健、微生物、药 学、社会医学等领域。 可检索1950年以来世界70多个国家和地区出版的 5,200余种生物医学期刊上发表的文献

pubmed数据库入口ncbi

pubmed数据库入口ncbi

PubMed数据库入口:NCBI简介PubMed 是一种由美国国家图书馆(National Library of Medicine,NLM)所提供的生物医学文献数据库,是全球最大的生物医学文献存储库之一。

作为生物医学研究领域的重要工具,PubMed 提供了大量的生物医学文献信息,覆盖了基础医学、临床医学、生物技术等多个研究领域。

PubMed 的数据库入口是由美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)负责维护的。

NCBI 是一个提供了一系列生物技术信息资源和工具的综合性生物技术数据库,帮助研究人员获取和分析生物技术相关的数据。

在本文中,我们将重点介绍 PubMed 数据库的入口,即 NCBI 网站的功能和特点。

NCBI 网站NCBI 网站(https:/// )是一个免费提供生物医学信息服务的网站,具有丰富全面的生物医学数据库资源。

在 NCBI 网站上,用户可以访问PubMed 数据库以及其他诸如 GenBank、BLAST、PubChem 等数据库。

NCBI 网站提供了直观友好的用户界面,让用户可以轻松访问并获取所需的生物医学文献信息。

下面我们将介绍 PubMed 数据库的一些主要功能和特点。

PubMed 数据库功能文献搜索作为一个重要的生物医学文献数据库,PubMed 提供了强大的搜索功能,帮助用户快速准确地检索感兴趣的文献。

用户可以根据关键词、作者、期刊等信息进行搜索,也可以通过高级搜索来进一步精确检索。

文献浏览用户搜索到感兴趣的文献后,可以通过 PubMed 的文献浏览功能查看摘要和全文。

摘要提供了文章的主要内容和结论,方便用户了解文献的核心内容。

全文则提供了更详细的信息,包括方法、结果和讨论等。

文献收藏用户在浏览文献时,可以将感兴趣的文献添加到自己的收藏夹中。

这样,用户可以方便地管理和访问自己收藏的文献,随时查阅。

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  3. 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。

MEDLINE数据库的标记码
(3)出版商提供的电子文献---[PubMed - as supplied by publisher]
(4)NCBI其它数据库的相关记录
Medline数据库
由出版商提供的检索记录
Premedline数据库
Pubmed identifier 本条数据在数据库中的 唯一标识号
所属的美国生物技术信息中心(NCBI
for Biotechnology Information)开发研制的网络文献 检索系统。由许多期刊出版商参与共建
PubMed特点: 1、资源丰富 2、强大的链接功能(LinkOut)可链接许多免费的全 文期刊可根据检中的二次文献直接在网上订购原文。 3、提供多种检索方式 4、提供多种显示格式 5、报道速度比MEDLINE更快,更新。
网络版——PubMed检索系统
美国《医学索引》印刷版
Index Medicus 简称IM,是美国国立医学图书馆 编辑出版的、世界上最负盛名的医学文献检索工具。 包括题录,文摘及部分全文。 美国《医学索引》内容包括: 基础医学、 职业卫生、 卫生管理、 营养卫生、 环境医学、 药理和药剂学、 临床医学、 护理学、 卫生保健、 齿科学、 情报学 兽医学
点击 精确查找
所检索的词本身不是主题词,但此页列 出了所有与其内容相关的主题词---《主题词字顺表》,可以从中选择自己 需要的主题词
Sugar diabetes
点击 精确查找
说明sugar diabetes这个 词组没被收入 主题词数据库
Diabetes mellitus
点击 精确查找
Diabetes mellitus
通过树状结构表的方法来确定主题词主要考察两点:
1、要辨识英文词的意思; 2、通过专业知识来确定检索内容的归类所属。
主题词 Influenza vaccines
只有主题词才会 有这样的说明性 的界面,所以出 现这样的界面就 是主题词。
确定主题词方法 2---主题词字顺表
在字顺表检索框里 直接输入检索词 Influenza Vaccines
Pubmed 数据来源与收录范围
(1)Medline数据库 ---[PubMed - indexed for MEDLINE] (2)Premedline数据库 --- [PubMed - in process] 正在加工处理中的文献,这些数据经规范处理后,每星期 转入MEDLINE数据库一次,并从本数据库中被删除,并标上
PubMed Central 要经常浏览这里, 获取免费资源
NCBI
子数据库群缩写
All Databases
在检索框空 白的状态下 点击Search
进入了完整 的数据库群 平台
生物医学文献数据库 •NLM有关生物医学和生命科学杂志的免费电子文档。
在线生物医学图书
孟德尔人类遗传数据库
核酸序列数据库 蛋白质序列数据库
Medline格式字段说明 此为数据库中第 1985条题录,下面 是这条题录的全 部字段
字段缩写
字 段 的 全 称
医学主题词字 段MH或MeSH
医学主题词
MH 或 MeSH

(Medical
Subject
Headings)
用于描述生物医学概念的标准术语

把所有的医学主题词组织起来形成了<MeSH主题表> 在计算机检索系统为<MeSH主题词数据库>
检索区
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专项数据库
检索功能介绍
aids
aids
点击
显示格式选择,其默认格式为
Summary格式
结果总数
篇名字段 作者字段 刊 名 字 段
刊期字段
条目识别 号PMID (PubMed Identifier)
检索结果 界面
格式显示 选择
每页显示 结果数
结果排序方式
Hypertension
点击
33173条数据
结果页面
组合式主题词检索
表达两个(或更多)概念的词都是主题词,没有副主题词, 不用主题词数据库进行组配,确定主题词后,由诸主题词 直接组合检索式,在PubMed数据库中进行检索。
文摘(BA)、美国化学文摘(CA)
3、引文索引数据库
揭示文献之间的引用关系 如:美 国《科学引文索引》SCI 中国《科学引文索引数据库》CSCD
4、全文数据库
是原始文献信息的集合,查到文献的线索后可直接 获取电子版的全文信息。 如:中文全文数据库 CNKI中的“中国期刊全文数据库” 维普的“中ProQuest Medical Library

实际就是主题索引
主题词的意义:
保障文献的‘检全率’和‘检准率’
主题词的实质: 把用任何‘字样’表达的同一概念的所有文献,都归结到 ‘主题词’下,比如有一篇关于糖尿病的文章,哪怕通篇没
有一个糖尿病的‘字样’,它也被归到糖尿病的主题词下,
因为文章的主题是关于糖尿病的,要按主题归类,而不是按 字样归类.
1、题录(书目)数据库
检索的结果是找到获取文献原文的线索。提供文献 的特征,如篇名、作者、摘要、刊登在哪里、收藏 在何地等。如PubMed数据库(它也包括文摘和全文)
2、文摘数据库
检索结果是获取文献的摘要,通过阅读摘要来确定是 否需要进一步获取全文文献。如中国生物医学文献数
据库(CBMdisc)、荷兰医学文摘(EMBase)、美国生物学
美国《医学索引》的光盘版 MEDLINE数据库 是当前国际上最具权威性的生物医学文献数据库。 特点: 1、报道的文献量大、质量高 国家: 70多个 语种: 40多种 期刊: 4700多种 文献: 年报道量40多万篇 英文发表量: 88% 英文文摘量: 75% 我国被收期刊: 50多种 可检索年限为: 1966年至今
7、事实数据库
提供问题答案的数据库,如: 医学术语、疾病的诊断方法、药物的用法和不良 反应、化合物的结构和化学反应等。 电子版的词典、百科全书、年鉴、手册、名录、 指南等都属于事实数据库。
8、多媒体数据库 用文字、声音、图像同时表达信息的数据库, 如:视频文献等。 9、知识数据库 以专门学科的知识点为收藏对象的数据库,如: 中医药知识库;称为基因百科全书的GenGard数据库等
有的数据库有网络版,可以在网上直接使用, 有的是光盘版,要由使用单位购买后将光盘 安装在自己局域网的服务器上使用。各个数 据库的使用方法略有不同,可以通过数据库 界面上的使用帮助来进行了解。
美国《医学索引》
美国《医学索引》 的三种版本
印刷版——Index Medicus 简称(IM) 光盘版——MEDLINE数据库
Summary (text) 格式
Abstract格式
检索结果包括文摘、全文链接图标、及作者单位、邮箱
Abstract
比Summary格式多了文摘和全文图标和
作者单位字段
作者单位字段
全文链接图标
文摘字段
含有全文的网页
作者邮箱
Medline格式
含有主题词MH
字段缩写
此格式的特点是: 字段分解的特别详细,检索 标识丰富,每个字段都是一 个信息点。
包含任一字词
确定主题词方法1---主题词树状结构表 例:确定 流行感冒疫苗‘Influenza Vaccines’是否为主题词
用树状结构表查找
解剖学 有机体
疾病
化学药品\药
目录树
化学药品\药
化合物
化合物
生物制品
生物制品
疫苗
疫苗
病毒疫苗
化合物
生物制品
疫苗
病毒疫苗
流行感冒疫苗 点击进入主题词 说明页面
点击 精确查找
主题词 Influenza Vaccines
同样进入与之同 概念的主题词说 明页面
入口词 LAIV vaccine
对于一个概念有多个词表达的情况,要逐个输入各个词进行主题词的确定。
如:糖尿病--diabetes、diabetes mellitus、sugar diabetes
diabetes
如何确定主题词
MeSH Database 主题词数据库
在此点击进入
MeSH
主题词浏览器
主题词检索界面 专门用来找主题 词的
‘主题词’查找方法
1、 在‘主题词’树状结构表中查找 2 、在‘主题词’字顺表中查找
1、在主题词树状结构表查找 2、用主题词字顺表查找
包含完整字句 即精确查找
包含全部字词
Main Headings 主题词选项
点击 精确查找
Influenza Vaccines
进入主题词说明 界面,第一行出 现的词即为主题 词
LAIV vaccine
页面的 下半部
入口词 (主题词的同义词)用 入口词检索,系统会 自动转入主题词。
将入口词LAIV vaccine 输入检索框
主题词选项
完整的基因组数据 结构数据库或称分子模型数据库 生物学门类数据库 单核苷酸多肽性数据库 Entrez Structure 中特定功能域的三维结构 标记物和图示数据 人口研究数据集
基因表达和微阵列数据集
跨库检 索
Virus 病毒
点击数字可进入 相应的数据库结 果页面
PubMed主页介绍
pubmed 点击 Search
Pubmed数Hale Waihona Puke 库用法介绍NCBI首页
此网页是美国国立医学图书馆 (National Library of Medicine ,NLM)下属的 美国国家生物技术信息中心 (National Center for Biotechnology Information ,NCBI)开发研制的网络数据库的首页。 包含: 蛋白质、基因组、孟德尔人类遗传学、主题词、 医学文献等20多个数据库。 Pubmed是其中的一个子数据库
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