数学模型在生物学中的应用
生物学中的数学建模及其应用

生物学中的数学建模及其应用生物学是一门研究生命科学的学科,最早来自于生命科学的古代哲学,逐渐发展成为现代化的学科。
在现代科学中,生物学的研究涉及到了众多的领域,其中有一项重要的技术就是数学建模。
数学建模是指数学家运用其专业知识和技能,将现实生活中广泛存在的问题转化为数学方程,进行数学计算、分析和研究的过程。
而在生物学中,数学建模主要应用于生态、医学、环境保护等方面,为生命科学研究提供了重要的手段和途径。
一、数学建模在生态学中的应用生态学是研究生物学和环境之间相互作用的学科,它不仅仅是生物学和地理学的交叉学科,而且包含了多方面的知识,如统计学、环境科学和计算机科学等。
数学建模在生态学中的应用十分广泛,例如,研究物种丰度、种群密度的统计模型、气候与珊瑚礁生长模型、生物化学反应动力学模型等等。
例如,人类可能会对某种物种进行大量捕捞,导致其种群数量迅速减少,当捕捞量过大时,该物种可能会面临灭绝的风险。
为了预测这种情况的发生,可以利用数学建模,根据样本数据构建数学模型,用以预测未来种群数量、种群密度变化等。
二、数学建模在医学中的应用医学研究是通过许多实验和调查获得数据,这些数据的数值往往不具有直观意义,如何利用这些数据进行生物医学研究是一大难题。
数学建模可以将这些数据转化为可供计算机模拟的数学方程,对疾病、药物的治疗、诊断等进行量化分析。
举一个例子,我们常常听说医疗数据中出现了“假阳性”和“假阴性”等概念,这是医学诊断不能避免的一种误差。
但是通过建立一种统计模型,在对疾病进行诊断时,可以有效减少这种误诊率的情况,提高医疗质量、降低失败率。
三、数学建模在环境科学中的应用在环境保护领域,数学建模被广泛用于污染物传输、水域与实验环境监测、物质流动和能量转换等方面的研究。
通过建立模型,环境科学家可以有效评估环境质量和环境健康状况。
例如,我们可以通过建立水体模型,对污染物在水体中的传输与扩散进行模拟。
此外,我们还可以使用数学建模方法,建立气候变化模型,了解气候变化的原因、趋势、影响范围和持续程度,为未来应对气候变化提供科学依据。
数学模型在生物学中的应用

数学模型在生物学中的应用生物学是自然科学的一个分支,旨在研究生命现象及其各种形式。
生物学的研究早已不再局限于对生命自身的描述和分类,而是以各种方式来解释和预测现象。
数学模型作为生物学中重要的理论工具,可以较好地解释和预测许多自然现象和生命现象。
1. 数学模型在动物行为学中的应用动物行为学是研究动物行为的科学,它探讨的问题包括动物如何获取食物、寻找伴侣、逃避捕食等。
在这个研究领域中,数学模型可以帮助研究人员定量化动物的行为,并创建“行为规则”,以反映他们在不同情境下的行为。
例如,一些研究人员使用数学模型研究了在危险丛林中的动物,推测出了动物之间的掠夺关系,并预测了这些动物未来如何适应环境变化。
2. 数学模型在群体动力学中的应用群体动力学研究的是一个群体中使个体运动的动力和规则。
这个研究领域可以在物理学、工程学、生物学中找到应用。
在生物学中,研究人员可以使用数学模型来描述群体中个体的行为模式和规律。
例如,在研究鸟群迁徙时,数学模型可以帮助研究人员预测整个鸟群的行为。
3. 数学模型在遗传学中的应用遗传学是研究遗传信息的科学。
这个研究领域邀请人员使用数学模型来预测基因转移、分子遗传学、基因排序等。
例如,研究人员使用数学模型研究了医生和寄生虫之间的博弈过程。
他们致力于研究决定致病性寄生虫传播速度的遗传机制。
4. 数学模型在细胞生物学中的应用细胞生物学是研究细胞的科学。
在这个研究领域中,使用数学模型可以帮助我们理解和预测细胞内某些过程,如细胞生长、分裂。
例如,一些研究人员使用数学模型预测了细胞分裂的过程,并发现微管是决定细胞分裂位置的关键元素。
总的来说,生物学和数学模型的结合可以帮助我们更好地理解各种生命现象。
虽然这种结合的研究需要大量的数学和生物学知识,但它的应用具有广泛的前景,将继续为我们提供更大、更好、更快的了解和解释自然现象的能力。
数学模型在生物科学中的应用

数学模型在生物科学中的应用随着现代科技的发展,人们对于生物科学的认识也越来越深入,而在这个过程中,数学模型的应用起到了非常重要的作用。
生物科学作为一门基础科学,向来以实验验证为主要方法,但是,随着研究深入,我们发现只靠实验并不能解释所有的现象,尤其是涉及到系统较为复杂的生物过程。
因此,引入数学模型成为了一种必要的手段。
本文将从生物学中几个重要的领域出发,探讨数学模型在其中的应用。
一、生物神经网络建模领域神经网络是生物体内一个重要的系统,它的功能是处理各种信息并产生响应。
而生物神经网络建模领域,就是尝试使用数学模型来描述和解析生物神经网络的运行机制。
在这个领域中,主要使用的数学模型是非线性动力学,一个重要的应用就是针对脑电图和神经元信号的处理和分析。
例如在某些临床研究中,我们需要使用脑电图来检测一些疾病的状态,而这由于信号噪声等干扰因素导致往往需要进行复杂的处理和分析,这时就需要利用非线性动力学模型来对信号进行分离和降噪。
二、动态系统领域在生物科学的研究中,很多过程都可以使用动态系统的方法来进行模拟和分析。
比如在细胞内部,在某些时候就需要一种严密的控制机制来保证其正常运行,这时我们需要使用动态系统模型来模拟这个机制的行为。
另外,动态系统模型在合成生物学研究中也起到了重要作用。
比如合成生物学中的细胞计算机系统,需要使用动态系统模型来描述和分析细胞内的反应过程等。
三、进化论领域在生物进化论研究中,模型也是不可或缺的一部分。
通过建立进化模型,科学家可以更好地理解生物体系内的演化过程。
在进化模型的研究中,数值模拟和复杂网络模型是重要的工具。
例如,我们使用数值模拟研究了不同的进化机制对生物体系稳定性的影响,发现某些机制的消失会导致生物竞争和适应性下降。
四、癌症研究领域癌症是目前医学上一个极为重要的研究领域,而其中的数学建模也是不可避免的。
在癌症生长和扩散的研究中,生物化学模型和计算机模型是非常重要的工具。
通过建立这些模型,我们可以更好地理解癌症细胞的转化、成长和扩散机制,并为治疗、防治癌症提供理论基础。
数学模型在生物医学工程中的应用与优化

数学模型在生物医学工程中的应用与优化生物医学工程是通过应用工程学及数学模型的原理和方法,来解决医学和生物领域的问题,改善人类的健康与生活质量。
数学模型在生物医学工程中扮演着重要的角色,它能够帮助研究人员理解和预测生物系统的行为,优化医疗设备设计,以及提供指导制定治疗方案的依据。
一、数学模型在生物系统建模中的应用1. 生物传输过程建模数学模型可以用于描述生物系统中的传输过程,例如药物在组织中的扩散、血流中的输运等。
通过建立合适的微分方程模型,可以预测物质在生物体内的分布情况,从而指导药物治疗的用量和频次。
2. 生物电信号建模生物体内的电信号对于生命活动具有重要的影响。
数学模型可以用于描述生物电信号的传导和处理过程,例如心电图的分析与诊断、脑电信号的解读等。
基于这些模型,可以发展各种生物电信号处理的算法,帮助医生做出准确的诊断。
3. 生物机械行为建模生物体内的各种组织和器官都具有一定的力学特性。
数学模型可以用于描述生物机械行为,如力学性能、形状变化等。
这些模型在生物力学研究和生物医学工程中的应用十分广泛,例如人工心脏瓣膜的设计与优化、人工骨骼的仿真与优化等。
二、数学模型在生物医学工程中的优化1. 医疗设备的设计与优化数学模型可以用于优化医疗设备的设计,如人工关节、听力辅助设备等。
通过建立合适的模型,可以分析设备的性能和效果,并进行参数的优化,以提高设备的治疗效果和适应性。
2. 药物治疗方案的优化数学模型可以用于优化药物治疗方案,如药物的给药途径、用药剂量和用药时间等。
通过建立相应的药物动力学模型,可以预测不同方案下的药物浓度和疗效,从而找到最佳的治疗方案,提高治疗效果。
3. 生物系统的仿真与优化数学模型可以用于对生物系统进行仿真和优化。
通过建立生物系统的数学模型,可以模拟和预测生物系统的行为,如细胞生长、组织发育等。
基于模型的仿真与优化,可以指导研究人员对生物系统进行进一步的研究与探索。
三、数学模型在生物医学工程中的挑战与展望数学模型在生物医学工程中的应用与优化仍面临着一些挑战。
数学模型在生物医学中的应用

数学模型在生物医学中的应用随着科技的发展和计算机技术的进步,数学模型在生物医学中的应用越来越广泛。
数学模型通过对复杂生物系统的理解和描述,可帮助我们更好地理解生物系统的行为和生理过程,对疾病的预防和治疗起到了重要的作用。
一、数学模型的应用在生物医学领域中,数学模型被广泛应用于多个领域,例如药代动力学、病毒扩散的预测、人体运动分析、神经科学、心脏病学等等,促进了不同领域的合作与交叉,给医学和生态学的发展带来了新的突破。
二、数学模型的实践药代动力学是数学模型在生物医学中的一项研究。
药代动力学旨在研究药物在人体内的吸收、分布、代谢和排泄过程。
数学模型通过考虑多种因素(如药物剂量、给药途径等)对药物在生物系统内的转移进行建模。
通过计算和模拟这些过程,我们可以了解药物到达目标组织的时间、血药浓度,从而设计出合理的用药方案,减轻副作用并提高疗效。
在病毒扩散预测领域,数学模型可用于预测疾病的传播趋势,有助于疾病控制和预防。
例如,在2014年西非爆发的埃博拉病毒疫情中,美国疾病控制和预防中心(CDC)使用数学模型来研究病毒的扩散趋势和控制方法。
这项工作在病情的控制中起到了至关重要的作用。
人体运动分析是数学模型在生物医学中的另一个重要领域。
研究人体运动过程可以帮助医学工作者更好地了解不同运动疾病的发生原因。
数学模型可用于对肌肉、骨骼与其他生理系统的机制进行建模,从而评估运动员或病人的运动能力,减少运动损伤,并制定合适的康复计划等。
神经科学和心脏病学也是数学模型应用的重要领域。
神经科学通过对大脑和神经系统的建模,研究人体行为和意识状态。
数学模型可用于模拟神经元的活动过程,进而帮助了解不同神经元病变的原因。
心脏病学方面,数学模型可用于研究心脏的生理过程和心脏疾病的治疗方法。
例如,心脏起搏的数学模型可以帮助医生更好地了解心脏的本质,从而为病人选择最优的起搏器治疗方案。
三、数学模型的未来随着计算机技术的不断进步,数学建模在生物医学中的应用将更加广泛。
数学在生物学中的应用

数学在生物学中的应用数学和生物学是两个看似截然不同的学科,数学偏重于抽象的符号和逻辑推理,而生物学关注的是生命和生态系统的特性和变化。
然而,数学在生物学中的应用却是不可忽视的。
数学提供了一种理论和方法,能够帮助生物学家解决许多生物问题,并提供深入的理解。
本文将探讨数学在生物学中的一些常见应用。
一、模型建立和预测在生物学研究中,我们常常需要建立数学模型来解释和预测生物现象。
例如,物种数量的增长可以用生物学方程式来表示,并通过数学模拟来预测未来的趋势。
数学模型也可以用来研究癌症细胞的扩散和治疗方法,从而提供更有效的癌症治疗方案。
二、基因分析和序列比对数学在生物学中的另一个重要应用是基因分析和序列比对。
基因组学领域的研究依赖于数学算法和模型,帮助科学家分析和解释人类基因组中的各种变异和突变。
通过使用数学方法,科学家能够比较不同物种间的基因序列,从而揭示物种之间的亲缘关系和进化历史。
三、生物网络和调控机制现代生物学认识到生物体内的许多生物学过程是由复杂的生物网络和调控机制来控制的。
数学工具,如图论和网络分析,可以帮助我们理解这些复杂的生物网络,并揭示其结构和功能。
这些数学模型可以帮助我们预测细胞信号传导的方式,从而为新药物的研发和治疗提供指导。
四、生物传染和种群动力学数学在描述和预测生物传染和种群动力学方面发挥着重要作用。
生物传染模型,如SIR模型,用数学方程描述了疾病在人群中的传播方式。
这些模型可用于预测和控制传染疾病的蔓延,并帮助制定公共卫生策略以保护人群健康。
五、图像处理和计算生物学图像处理和计算生物学是数学在生物学中的另一个重要应用领域。
通过数学模型和算法,科学家可以对生物图像进行分析和处理,以了解细胞结构和功能。
这些方法可以帮助科学家观察和探索微观世界,从而提高我们对生命的理解。
综上所述,数学在生物学中的应用是不可忽视的。
它帮助我们解决了许多生物学问题,提供了生物学研究的理论基础和工具。
数学和生物学的结合为我们揭示生命的奥秘和解决生物学上的挑战提供了智慧和方法。
数学在生物学研究中的应用

数学在生物学研究中的应用数学和生物学两个看似毫无关联的学科,如今却在科学研究中有了越来越紧密的联系。
随着科技的不断进步,研究生物学的方法也愈发复杂,传统的实验方法无法满足对于生物系统的完整描述和解释。
因此,数学作为一种优秀的工具,逐渐在生物学研究中发挥着巨大的作用。
1. 数学模型在生物学中的应用生物系统的复杂性使得研究者不能直接从实验数据中全面地解释它们的现象。
因此,他们使用数学模型来更好地理解生物系统如何工作,并预测不同情况下的行为。
生物学和数学的融合,产生了诸如生态学、遗传学、生物化学、微生物学等多个跨学科领域。
以生态学为例,数学模型被广泛地用于解释群体动态,特别是生态学上的许多理论模型,如:罗特卡-沃尔特拉斯(Lotka-Volterra)模型和白蚁的寻食行为模型等。
罗特卡-沃尔特拉斯模型是用于描述食物链中各物种之间的相互作用方式的数学模型,这种模型可以预测在特定条件下不同物种的数量变化情况。
白蚁的寻食行为模型的建立则可以通过数学模拟探究白蚁的寻路方式,预测白蚁在不同情况下的行为。
2. 水平结构和垂直结构的数学描述生物学中,除了数学模型,还有许多数学方法被用来描述生物系统的水平和垂直结构。
其中水平结构用于描述不同生物群体之间的相互关系,而垂直结构则用于描述生物群体内部的基因和无机物质之间的关系。
以水平结构为例,基于种群动态理论(Population Dynamics Theory),动态模型将生物群体看作是个体的集合,通过预测各个个体之间的关系变化研究其动态和环境之间的相互作用。
如生物交互关系中博弈论的应用,能够更好地解释生物间相互影响的规律。
而在垂直结构方面,基因表达分析中往往用到信号处理的方法,通过将生物分子(DNA、RNA和蛋白质)看作是波动信号,然后利用傅立叶变换将这些信号从时间域转换到频率域,更好的理解基因转录后修饰对于蛋白质结构和功能的影响。
3. 数学方法在生物大数据分析中的应用生物技术领域正面临着大数据瓶颈问题。
数学模型在生物领域的应用

数学模型在生物领域的应用生物学是生命科学中的一个重要分支,研究物种的结构、功能、发展和演化等方面。
生物领域涉及的研究内容非常广泛,不同学科的交叉与融合正在成为未来研究的趋势。
而作为一门基础学科,数学在生物领域的应用也越来越重要。
数学是一种抽象的语言,它能够准确地描述自然界中的现象和规律。
通过建立数学模型,我们可以揭示生物系统的内在机制和运行规律,并用数学语言描述和量化这些规律,以便更好地理解和预测生物现象。
在生物学的研究中,数学模型可以被广泛应用于生物进化、生物统计、生态系统、传染病传播和基因表达调控等方面。
1. 生物进化模型生物进化是指物种在时间和空间维度上的变化和演化。
要想理解生物进化过程中所涉及的变化和演化规律,需要借助数学方法建立相应的演化模型。
最常用的生物进化模型是树状图模型(Phylogenetic Tree Model),它通过树状图描述不同物种之间的进化关系。
通过树状图模型,我们可以了解到属于同一类的生命在演化过程中的变化数据和进化路线,并可以推导出不同物种之间的距离关系。
例如,通过遗传信息统计分析,研究者可以根据DNA序列分析,建立出物种间的演化树,这对于物种的分类和进化过程的研究十分关键。
2. 生态系统模型生态学是研究生物与物理、化学环境相互作用关系的学科。
在生态学研究中,数学模型可以被应用于对不同生物种群调节互动关系的分析、控制分析和环境影响的分析。
一个生态系统模型包括环境、生物种群和物种的作用模板,用于模拟物种在空间上的分布与变化、种群的增长和被捕食等生态作用。
例如,Lotka-Volterra方程是一个经典的捕食-被捕食者交互模型,可以用来描述食物链中的捕食者和被捕食者之间的相互作用。
3. 传染病传播模型传染病是一种以接触、空气传播或污染的方式,在人群中迅速传播的疾病。
为了更好地控制和预测疾病的传播,人们需要建立精心设计的数学模型。
SIR模型(Susceptible-Infected-Recovered Model)是一种常见的传染病传播模型,它以易感者、感染者和康复者状态为变量,通过微分方程将人员在不同状态之间的流动建模。
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数学模型在生物学中的应用摘要数学模型是研究生命发展规律,发现和分析生命现状的工具。
建立可靠的本文从生物数学的发展、分支了解生物数学的历史,紧接着又在数学模型在生物数学的地位中了解数学模型的地位,最后在数学模型的应用中知道了微分方程模型、差分方程模型以及稳定性模型.这将有助于在生物数学的研究中,依据数学模型的基础,建立符合规律的数学模型,在生命进程中验证新的规律、新的发现,使在研究生物学时更清晰、更明了.关键词:数学模型;生物学;应用Application of mathematical model in BiologyAbstract: Mathematical models in biology such as a microscope can be found in biological mysteries, biological research through with the establishment of the mathematical rules of the law of development of life, which launched a new discovery, new rules and in biology established reliable model of the biological status of classified analysis and forecasting.The from the history of mathematical biology development, the branch of the understanding of mathematical biology, followed by another in the mathematical model in Mathematical Biology status in understanding the status of mathematical model. Finally, in the application of mathematical model know differential equation model, the differential equation model and the stability of the model.This will help in mathematical biology research, on the basis of the mathematical model, established in accordance with the law of the mathematical model, in the process of life to verify new rules, new found in biological research clearer, more clear.Keywords: mathematical mode;biology;application目录1 引言……………………………………………………………………………………2 文献综述………………………………………………………………………………2.1 国内外研究现状………………………………………………………………………2.3 提出问题………………………………………………………………………………错误!未定义书签。
3 生物数学的发展………………………………………………………………………3.1 生物数学发展历史……………………………………………………………………3.2 生物数学的分支………………………………………………………………………3.2.1 生物信息学……………………………………………………………………………3.2.2 生物统计………………………………………………………………………………3.2.3 数量遗传学……………………………………………………………………………3.2.4 数学生态学……………………………………………………………………………3.2.5 数理医药学……………………………………………………………………………3.3 数学模型在生物数学中的地位………………………………………………………4 数学模型在生物学中应用……………………………………………………………4.1 微分方程模型…………………………………………………………………………4.2 差分方程模型 (9)4.3 稳定性模型…………………………………………………………………………5 结论…………………………………………………………………………………5.1 主要发现……………………………………………………………………………5.2启示…………………………………………………………………………………5.3 局限性………………………………………………………………………………5.4努力方向……………………………………………………………………………参考文献……………………………………………………………………………1 引言数学是所有自然学科的基础,生物却是偏文科性质的自然学科,把两者有机的的结合在一起就构成了生物数学.但在生物学中应用数学最多的还是数学模型的应用,解决生物中各种种群增长问题,种群扩散问题,环境污染问题等.虽然有生物数学这样的学科产生,但真正让数学与应用数学的学生了解数学在生物中的应用,仍需要很大的努力.同时,许多人会觉得数学的知识只能应用在生物中,而生物知识却不能应用在数学问题解决中,但是有些实际问题却不得不提醒我们,在解决一部分实际问题时,我必须得先了解生物上的一些知识,才能解决.但同时我们也得先了解生物数学这门学科,以及生物数学的的分支,我们才能知道生物与数学的联系,方便我们在解决一些实际问题时,全面的考虑问题,分析问题.生物数学是数学的边沿学科,使数学模型得以更好的建立的根本,不仅是一个学科的分支,更是学习应用数学的一个工具.了解生物数学的发展,知道生物数学的产生,并知道生物数学的分支,方便更好的学习数学模型,然后才能把数学模型更好应用在生物学中,数学模型是应用数学中最直观应用于数学的东西,但数学模型中很大一部分模型和生物相关联,所以才会出现生物数学.特别地,生物数学在整个数学建模中起了很重要的作用.2 文献综述2.1 国内外研究现状现查阅到的参考文献中,分别就数学模型做了介绍,并且对模型的应用也做了介绍.在文献[1-4]中详细的讲解了生物数学的起源、发展、分支等方面,还阐述了生物数学在其他方面的应用,其中穿插的讲解了数学模型在生物数学中地位以及生物数学的未来发展趋势.在文献[5]中主要是利用数学模型在生物序列结构比较中的研究及其应用进行了介绍,且主要研究了数学模型在DNA、蛋白质结构分析中的应用.在文献[6]中主要综述了生物数学这一门学科的大概,介绍了生物数学各分支的具体内容,还讲解了生物数学模型的实例.在文献[7]中强调了数学在生物学中的地位,从不同的角度诠释数学在生物学中的应用,以及数学模型的方法.在文献[8]中从建立数学模型的步骤、初等模型、优化模型、微分方程模型、差分方程模型等方面进行了介绍,详细的讲解了数学模型在不同方面的应用.在文献[9]中运用马尔萨斯模型、logistic模型、人口统计模型三种方法对江苏省人口总数进行了预测,并且对三种模型的精确度作了分析.在文献[10]中依据文献[8]中的课后习题进行了解答,更好理解了数学模型的应用.在文献[11]中对人口增长的原因进行了分析,并且运用不同的方法对人口增长过快的控制进行了描述,还运用偏微分方程、差分方程分别描述了人口状态的连续模型和离散模型.在文献[12]中介绍了差分方程在经济领域、动力系统和生态系统等多方面的应用,强调了运用差分方程模型建立数学模型解决实际问题的重要性.在文献[13]中通过化学、物理、生物、交通、经济管理和工程技术中众多数学模型的实例,建立了各种现实问题数学模型的主要方法和基本规律.在文献[14]中找到了种群生长的数学模型,依据差分方程理论,建立了描述种群生长的非线性差分方程模型,并分析了该模型的可靠性和稳定性.在文献[15]中主要从两个方面阐述了植物昆虫种群模型的分类、通用表达式的表达,并针对各类型的植物种群动态模型进行了特殊说明.2.2 国内外研究现状评价文献[1-15]中分别就生物数学的起源、发展、分支分别进行了阐述以及差分方程模型在生物学中的应用等方面作了说明.但文献中没有对生物数学深入进行研究,以及没有对与差分方程模型相关的的微分方程模型以及稳定性模型在生物学中应用进行研究.2.3 提出问题现有文献中只是对生物数学发展、起源、分支的各方面单独的进行了研究,以及数学模型在生物学中的应用只是进行了一方面的介绍.因此本文就以上问题把生物数学的发展、起源、分支的各方面综合进行了分析,并且对数学模型在生物学中的应用中的差分方程模型进行了全方面的研究.3 生物数学的发展生物数学顾名思义便是生物与数学的结合,是生物与数学的边沿学科,运用数学方法研究和解决生物学问题,并对与生物有关的数学方法进行理论研究的学科.粗略地说,它包括生物数学与数学生物学两部分内容,前者看重数学,后者看重生物学[1].如果把生物学的分支领域看作一个集合,数学的分支范围看作另一个集合,生物数学便是两个集合导出的乘积空间.因而生物数学的分支内容十分丰富,从研究使用的数学方法区分,生物数学可分为生物统计学、生物信息论、生物系统论、生物控制论和生物方程等的分支.另外,由于生命现象极为复杂,从生物学中提出的数学问题往往也十分复杂,需要进行大量计算工作,因此计算机是解决生物数学问题的重要工具[2].3.1生物数学发展历史生物数学的最早起源于中国北宋科学家沈括,于1088年推出的“胎育之理”的数学模型,并说明了出生婴儿性别大致相等的规律,建立了种群动态模型.到1202年,意大利数学家斐波那契在《计算书》第12章的第七节中,关于家兔繁殖的问题,建立了家兔增长的动态模型.12+++=n n n F F F ,2≥n ;110==F F .后来,法国数学家棣莫弗于1730年的《分析集锦》中第一次给出了斐波那契数列的通项公式⎥⎥⎦⎤⎢⎢⎣⎡⎪⎪⎭⎫ ⎝⎛--⎪⎪⎭⎫ ⎝⎛+=++1125125151n n n S . 1963年,一些美国数学家成立了斐波那契协会,并且发行了一份专门研究他的季刊---《斐波那契季刊》,这标志着对斐波那契家兔增长的动态模型的性质及应用进入了一个新的发展阶段.1604年,中国明朝的着名科学家徐光启在其着作《农政全书》中用数学的概率方法估计过和平时期人口的增长,说“头三十年为一世”这是最早的人口增长模型.1662年,英国经济学家、人口统计学家格朗特,在他的专着《生命表的自然和政治观察》中,研究了伦敦市人口的出生率、死亡率等指数与人口增长的关系,并且通过计算得出伦敦的人口大概每64年将增加一倍.且发现人口的出生率与死亡率相对稳定,提出“大数恒静定律”.1693年,英国数学家、天文学家哈雷按年龄分类,以德国布雷斯劳市1687-1691年间市民的死亡统计数据为基础,精确地表示了每年的死亡率.从而改进了格朗特的生命表,并定义了死亡率的含义,制订了世界上第一份最完整、最科学的生命表.1748年,欧拉在其出版的《无穷分析引论》的第六章“指数与对数”中,所举的例子中:假设人口数量n p 关于年份n 满足方程()n n p x p +=+11(其中n 为整数,增长率x 为正实数),若初值为0p ,则n p 关于n 的表达式可以改写为()01p x p nn +=,此模型被称为人口几何增长动态数学模型.1760年,瑞士数学家、医学家、物理学家丹尼尔·伯努利对天花病毒进行了分析,且建立了天花病毒动态数学模型()()qxpe p x p x p -+-=1',其中,x 为人口的年龄,p 为人口因感染上天花而死亡的概率,()x p '表示感染天花病毒后痊愈的年龄为x 的人口数量,q 为每人每年感染上天花的概率.伯努利在天花病毒动态数学模型中所作感染上天花的概率与因感染上天花的概率,关于x 相互独立的理想假设存在一定的局限性.1761年,法国物理学家、数学家达兰贝尔改进了伯努利的模型,得到了更符合实际情况的动态数学模型:()()()⎪⎭⎫ ⎝⎛=⎰dy y x p x p x 0'exp ν,其中()y ν为因感染天花而死亡的人数.1798年,英国统计学家马尔萨斯在《人口原理》中,根据百余年的人口统计显示,针对人口增长规律,提出人口种群模型的基本假设:在人口自然增长的过程中,净相对增长率的常数r ,从对人口增长和食品过去增长的分析中导出了微分方程模型:已知初始时刻0t 时种群数量为()00N t N =,设t 时刻的种群数量为()t N N =.经过t ∆后,在t t ∆+时刻,种群的数量变为()t t N ∆+.由上述基本假设,在t ∆时间内,种群数量的增加量与当时的种群数量()t N 成比例,比例系数为r ,则在t ∆内,种群的增量可写为()()()t t rN t N t t N ∆=-∆+.再将上式两边同时除以t ∆,得到()()()t rN tt N t t N =∆-∆+,当0→∆t 时,()t N 满足:rN dt dN =或r dtdN =.上述微分方程模型为马尔萨斯模型[3]. 3.2 生物数学的分支伴随着生物数学的快速发展,生物数学研究的内容已经形成一个巨大的体系,总 共包含了14个分支学科 [4].这些学科是按下列两种分类方法来划分的.第一种是按所涉及的数学方法来分类,分为生物统计、生物动力系统和生物控制 论、统计医药学、人口统计学等;生物动力系统又分为种群动力学,细胞动力学、人口动力学等.第二种是按研究生命科学中的分支学科的不同分类,有数学生态、数量生理、数 量分类、数量遗传、传染病动力学、数量生物经济学、数理医药学、神经科学的数学 模型、分子动力学、细胞动力学、人口动力学等分支学科.其中数学生态学又可分为种群生态学、统计生态学、系统生态学等分支学科.3.2.1 生物信息学从生物信息学研究的具体内容上说,主要有3个部分:新算法与统计学方法研究、各类数据的分析和解释以及管理数据和研制有效利用的新工具.生物信息学是由分子生物学与信息技术的组成,它的研究材料和结果是由各种生物学与信息技术的组成,它的研究材料和结果是各种生物学数据,研究的方法主要有对生物学数据的搜索、收集、筛选、处理(编辑、整理、管理和显示)以及利用(计算和模拟).生物信息学是现在生命科学和自然科学的重大前沿领域之一,并且也将是21世纪自然科学的核心领域之一.随着基因组测序计划的展开和分子结构测定技术的突破以及网络的普及,生物学数据库逐渐成熟起来.伴随着生物研究中数学模型和算法的不断完善,拥有许多强有力的生物信息分析工具,如进化分析、聚类分析等的产生.部分有效的分析工具极大地依赖于生物序列和结构的比较.序列和结构的比较是最重要和最常用的原始操作,是许多其它复杂操作的基础 [5].3.2.2 生物统计生物统计是生物数学的一个重要分支,在生物界一直受到普遍重视.它在医学界成为了卫生统计的主要内容,目前主要从事统计检验的应用和改进有关logistic回归模型方面的研究和应用生存分析以及研究人的寿命表的人口统计等方面.其中运用多元统计分析来研究生物现象,成为生物统计发展的一个方向.3.2.3 数量遗传学数量遗传学的分析方法,在动物遗传育种方面,提供有价值的育种参数;在作物育种方面,对主要作物的一些基本数量性状的遗传规律进行分析,现在趋向于分析一些地区性作物的一些特定的性状;在试验设计上更加接近于信息量较大的双列杂交设计,并且也是林木遗传育种的一个分析手段.3.2.4 数学生态学数学生态学不仅是生物数学的分支,也是生态学的一部分.从使用的数学工具来分有理论生态学, 统计生态学与系统生态学. 理论生态学主要是使用随机微分方程,差分方程, 线性代数,常微分方程和随机过程等数学工具来设计与实际相近的数学模型;系统生态学是采用运筹学与系统分析理论等数学工具来研究生态系统;统计生态学主要是数理生态学与统计学的相结合,其中包括空间分布型,抽样技术与多元分析等;如果就研究的对象来分,分为动物数学生态学, 昆虫数学生态学与植物数学生态学.3.2.5 数理医药学数理医药学是研究生物细胞的化学作用建立数学模型来研究,是生命科学的围观研究,例如:在毒理生态学中利用宏观和微观数学模型来研究环境污染对生物种群的影响.数理医药学主要利用数学模型研究传染病的方式、发展和传染过程,已成为生物数学的分支.例如:对现有的传染病模型作改进,使其更随机化,更符合实际,并且建立了带有年龄结构的种群的长期和非长期免疫型的传染病模型.3.3 数学模型在生物数学中的地位在数学的发展史中,数学一直都有着自己的理论体系.第一是基础数学,第二是应用数学,第三是计算数学.生命是数字的游戏,随着近代生物学的高速发展,数学在生命科学的作用愈发突出,无论是微观方向的发展,还是宏观方向的研究,都必须有精密的数学计算作为推动其前进的不懈动力[6].数学模型:为了研究的目的而建立并能够表现和描述真实世界某些现象、特征和状况的数学问题.数学模型能定量地描述生命物质运动的过程,一个复杂的生物学问题借助数学模型能转变成一个数学问题,通过对数学模型的逻辑推理、求解和运算,就能够获得客观事物的有关结论,达到对生命现象进行研究的目的[7].4 数学模型在生物学中的应用数学模型中有初等模型、简单优化模型、数学规划模型、微分方程模型、差分方程模型、稳定性模型等,在生物学中应用较广泛的是微分方程模型、差分方程模型、稳定性模型,并应用于种群增长、疾病预测与控制、种群竞争、种群依存等方面.4.1 微分方程模型 微分方程是描述未知函数与自变量之间的关系的方程,形如x dxdy .在数学模型中需要描述实际对象的某些特性随时间或空间的演变的过程,分析它的变化规律、预测它的未来形态、研究它的控制手段时,就需要建立的对象的动态模型[8].微分方程模型应用于经济、战争、医学等方面,在生物学中的应用十分广泛,可以用于传染病的控制与防范,人口的控制和预测,种群增长的预测,细胞增长速率等方面.下面介绍人口的预测和控制:指数增长模型由英国人口学家马尔萨斯提出的,记时刻t 的人口为()t x ,且视()t x 为连续,可微的函数,并令初始时刻的人口为0x ,人口增长率为常数r ,即单位时间内()t x 的增量dtdx ,得微分方程 dtdx =rx ,()00x x = (1) 则得:()rt e x t x 0= (2) 阻滞增长模型---Logistic 模型:人口增长到一定数量后会下降,主要是受到环境条件、自然资源等因素的影响的阻滞作用,并且随着人口的增长,阻滞作用越大,阻滞作用主要体现在对人口增长率r 的影响上,使得r 随着人口数量x 的增加而下降.将r 表示为x 的函数()x r ,方程写作 ()()00,x x x x r dtdx == (3) 假设()x r 为x 的线性函数,即()sx r x r -=()0,>s r (4) 其中m x r s =,m x 为为自然资源和环境条件所容纳的最大人口数量,将(4)式代入(3)得 ()⎪⎪⎭⎫ ⎝⎛-=m x x x r dt dx 1 (5) 其中等式右边rx 体现人口自身的增长趋势,⎪⎪⎭⎫ ⎝⎛-m x x 1体现环境和资源对人口增长的阻滞作用.例1 江苏省是全国主要的经济发展中心,其发展变化将带动整个国民经济的发展变化,土地面积仅占全国的1.06%,人口却占全国的5.72%,依据江苏省1978-2004年的总人口表,分析江苏省1978-2000年的数据及预测江苏省规划期内的总人口数[9].江苏省1978-2004年历年总人口表(万人)年份 总人口数 年份 总人口数 年份 总人口数1978 5834.33 1987 6348.00 1996 7110.161979 5892.55 1988 6438.27 1997 7147.86表1 江苏省1978-2004年历年人口表模型分析:江苏省总人口从1978年的5834.33万人到2004年的7432.5万人,增加了1598.17万人,平均年增长率为9.4%.江苏省1978年至2004年主要表现为:总人口数逐年增长;各年之间的人口增长相对平稳.1978年-1989年,年平均增长率9.4%;1990年,年平均增长率为35.4%;1991-2003年,年平均增长率为6.7%;2..1-2..4年人口年增长率为3.8%、3.5%、3.4%、3.6%,四年平均增长率为3.6%. 马尔萨斯人口模型建立: 模型假设:1.人口增长率是常数;2.随着时间的增加,人口按指数规律无线增长.模型构成:把1978年-2000年作为统计数据,2001-2004年的数据作为验证.江苏省1978-2000年的年平均人口增长率为7.65%,2004-2010年人口增长率为5.00%,2010-2020年人口增长率为2.35%.则代入马尔萨斯人口模型(2)()rt e x t x 0= (2)则 ()533.747713.72132001036.0==e x表2 马尔萨斯模型对江苏省2001-2020年人口预测值图1马尔萨斯模型对江苏省2001-2020年人口预测值由马尔萨斯模型算出的江苏省2001-2020年各年的人口数在上表和图表中显示出来.1980 5938.19 19896535.85 1998 7182.46 1981 6010.241990 6766.90 1999 7213.13 1982 6088.941991 6843.70 2000 7327.24 1983 6134.99 1992 6911.20 2001 7354.92 1984 6171.431993 6967.27 2002 7382.97 1985 6213.481994 7020.54 2003 7405.82 1986 6269.90 1995 7066.02 2004 7432.50江苏省2001-2020年人口预测值年份 人口总数 年份 人口总数2001 7477.533 2011 10759.25 2002 7751.628 2012 11015.09 2003 8035.771 2013 11277.01 2004 7785.525 2014 11545.16 2005 8184.697 2015 11819.68 2006 8604.335 2016 12100.73 2007 9045.489 2017 12388.47 2008 9509.261 2018 12683.05 2009 9996.811 2019 12984.63 2010 10509.36 202013293.38Logistic 人口阻滞模型: 模型构成:将微分方程模型(5) 化为:()bxa me x t x ++=1 (6)将江苏省人口数据代入得出a 、b 两参数,则得如下方程 ()()x et x 05.073.018400+-+= (7) 代入值:经过计算得表3和图2的结果表3 logistic 模型对江苏省2001-2020年人口预测图2 logistic 模型对江苏省2001-2020年人口预测值由此可以看出Logistic 阻滞模型精确点,所以江苏省2020年预测人口为7953.53万人(数学模型在人口预测中的应用---以江苏省为例).4.2 差分方程模型差分方程又称递推关系式,是含有位置函数及其差分,但不含有导数的方程,且满足该方程的函数称为差分方程,差分方程是微分方程的离散化.在实际问题中,遇到变量是离散的,就得考虑差分方程模型,在种群的控制与预测中,用到的就是差分方程模型,因为其中的时间和年龄均为离散量[10].江苏省2001-2020年人口预测值 年份 人口总数 年份 人口总数 2001 7335.30 2011 7720.33 2002 7380.92 2012 7750.91 2003 7424.85 2013 7780.23 2004 7467.13 2014 7808. 2005 7507.79 2015 7835.25 2006 7546.89 2016 7861.02 2007 7584.46 2017 7885.70 2008 7620.54 2018 7909.32 2009 7618.36 2019 7931.92 20107688.43 2020 7953.53差分方程模型应用于医学CT 、市场经济分析、产品的投入与产出等方面,同微分方程模型一样在生物学中的应用十分广泛,可以用于按年龄分组的人口模型、种群的增长变化等方面[11].下面介绍差分方程模型当中比较典型的按年龄分组的种群模型---leslie 模型: 将种群按年龄大小等间隔分成n 个年龄组,记时段k 第i 个年龄组的种群数量为()k x i , ,2,1=k ,n i ,,2,1,0 =.模型假设:1.假设种群的繁殖率和死亡率不随时段k 变化,只与年龄组有关;2.第i 年龄组的繁殖率为i b ,即每个个体在1个时段内繁殖的数量;3.第i 年龄组的死亡率为i d ,即1个时段内死亡数量的比例;4.记i i d s -=1为存活率.模型构成:时段1+k 第1+i 年龄组(1,,2,1-=n i )的数量是时段k 第i 年龄组存活下来的数量.得:()()∑==+ni i i k x b k x 111, ,2,1,0=k (1)()()k x s k x i i i =++11, ,2,1,0=k ,1,,2,1-=n i(2)记种群数量在时段k 按年龄组的分布向量为:()()()()[] ,2,1,0,,,,21==k k x k x k x k x Tn (3)由繁殖率i b 和存活率i s 构成的矩阵⎥⎥⎥⎥⎥⎥⎦⎤⎢⎢⎢⎢⎢⎢⎣⎡=--000000000121121n n n s s s b b b b L (4)则将(1),(2),(4)综合为()()k Lx k x =+1, ,2,1,0=k (5) 当L 和()0x 已知是,可以预测种群数量在k 时段按年龄组的分布为()() ,2,1,0,0==k x L k x k (6) Leslie 模型的稳定状态分析:(1)L 矩阵存在正单特征根λ,n k k ,,3,2,1 =≤λλ特征向量Tn n s s s s s s x ⎥⎦⎤⎢⎣⎡=--11121212111*,,,,1λλλ(2)若L 矩阵存在0,1>+i i b b 则n k k ,,3,2,1 =≤λλ,且()*1limcx k x kk =→λ,c 是由i b ,i s ,)(o x 决定的常数.因为()()0x L k x k =,L 对角化,[]121),,,(-=p diag p L n λλλ ,则()()()*110,,0,1limcx x p pdiag k x k k ==-∞→ λ.当k 充分大使,种群的年龄结构和数量()k x 做如下分析:1)()*x c k x k λ≈,种群按年龄组的分布趋向稳定,*x 称稳定分布,与初始分布无关. 2)()()k x k x λ≈+1,()()k x k x i i λ≈+1,各年龄组种群数量按同一倍数增减,λ称固有增长率.3)1=λ时,()()*1cx k x k x ≈≈+,[]Tn s s s s s s x 121211*,,,,1-= ,各年龄组种群数量不变.4)()*x c k x k λ≈,[]Tn s s s s s s x 121211*,,,,1-= ,()()1,,2,1,1-=≈+n i k x s k x i i i ,存活率is 是同一时段的1+i x 与i x 之比.例2 设一群动物最高年龄为15岁,每5岁一组,分成3个年龄组,各组的繁殖率为01=b ,42=b ,33=b ,存活率为211=s ,412=s ,开始时3组各有1000只,求15年后各组分别有多少只,以及时间充分长以后种群的增长率和按年龄组的分布.解:先求L 矩阵则()()[]T x L x 875,1375,143751000100010008321008316883100010001000041000213400333=⎥⎥⎥⎦⎤⎢⎢⎢⎣⎡⎥⎥⎥⎥⎥⎥⎦⎤⎢⎢⎢⎢⎢⎢⎣⎡=⎥⎥⎥⎦⎤⎢⎢⎢⎣⎡⎥⎥⎥⎥⎥⎥⎦⎤⎢⎢⎢⎢⎢⎢⎣⎡== 则固有增长率按年龄组的分布为:各组15年后分别有14735只、1375只、875只.固有增长率为1.5,稳定的按年龄组的分布为⎪⎭⎫⎝⎛181,31,1.4.3 稳定性模型用微分方程建立的动态模型来描述动态过程的变化规律,但是对于某些问题,并不需要研究动态过程的每个瞬时的动态,而仅仅是要求研究某种状态下的特征,特别是足够长的时间内动态过程的变化趋势.稳定性方程模型应用于捕鱼业、军事竞争、经济增长稳定等方面,在生物学中的应用于种群的相互竞争、种群的相互依存、食饵与捕食者等方面[12].在建模的开始先了解二阶微分方程的平衡点和稳定点的求解过程.的实根011x x =,022x x =为方程的平衡点,记作()02010,x x p . 如果存在某个领域,使方程的解为()t x 1,()t x 2.从这个领域内的某点()()()0,021x x 出发,满足()011lim x t x t =∞→,()022lim x t x t =∞→则称平衡点0p 是稳定的,否则是不稳定的.用直接法求平衡点的稳定性 系数矩阵为在平衡点()0,00p 的稳定性,假定A 的行列式 的根λ决定,则可以写成若0,0>>q p ,则平衡点稳定;若0<p 或0<q ,则平衡点不稳定.依据差分方程模型求稳定性的方法建立种群竞争模型:两个种群见存在着相互竞争、依存、捕食关系,当两个种群为了争夺优先的资源而进行生产斗争,其结局是竞争力较弱的种群灭绝,竞争力较强的种群达到环境容许的最大数量[15].模型假设:1.两个种群独自生存在一个自然环境中;2.两个种群的数量演变遵循Logistic 规律.模型构成:记()t x 1,()t x 2分别为两个种群的数量,1r ,2r 是他们的固有增长率,1N ,2N是他们的最大容量,则种群一()⎪⎪⎭⎫⎝⎛-=⋅111111N x x r t x (1)(1)式表示种群一在原有资源下,无种群二的种群数量.当种群二出现时,要考虑种群二消耗同一种有限资源对甲的增长产生的影响.于是得种群二的增长方程()⎪⎪⎭⎫ ⎝⎛--=⋅221111111N x N x x r t x σ (2) 其中1σ的意义是:单位数量的种群二(相对2N )消耗的供给种群一的食物量为单位数量(相对1N )消耗的供给种群一的食物量的1σ.则种群二的方程为()⎪⎪⎭⎫⎝⎛--=⋅221122221N x N x x r t x σ (3) 2σ和1σ的意义相对应.稳定性分析:将(2),(3)解代数方程组()⎪⎪⎭⎫ ⎝⎛--≡2211222211,N x N x x r x x g σ (5) 得4个平衡点只有当平衡点位于第一象限时才有实际意义,因此对于3p 而言,只有1σ,2σ同时大于1,或者同时小于1才满足.按照差分方程判断平衡点和稳定性的方法,计算 得下表4表4 种群竞争模型的平衡点及稳定性。