生物文献汇报
生物文献汇报ppt课件
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Experimental investigation of the gene of interest §Overexpression § Antisense inhibition § Germline knockout or gene replacement § Heterokaryon analysis § Somatic knockout or gene replacement (phenotypic assortment) § Gene ‘knock-in’ § Inducible promoter
Ｐｕｒｐｏｓｅ
The purpose of this article is to showcase the tools that are available for functional genomic analysis in Tetrahymena, and to illustrate how different approaches can be harnessed to address a wide range of biological problems. At the heart of these approaches is a variety of methods for efficient DNA mediated cell transformation. An appreciation of the spectrum of possibilities requires a brief review of the unusual genetic organization of this orgathis complexity, the presence of features that are characteristic of metazoans but that are absent or less easily studied in other simple eukaryotic systems, that makes Tetrahymena so well suited for a wide range of fundamental problems including germline or somatic differentiation, programmed DNA rearrangements, distribution of mitotic chromosomes, histone modifications, microtubule diversity and tubulin modifications, basal body duplication, phagocytosis, function of rRNA, and regulated polypeptide secretion. These biological features and the functional genomics tools described in this article will greatly enhance the value of the genome sequencing project, currently under
微生物文献总结
一、【沉默基因】是指在自然条件下存在于菌体中，处于不表达或者极低的表达水平，但在特定条件下可以被激活而表达活性产物的DNA序列。
早在1980年提出了通过基因克隆、诱变处理、菌株或种间自然结合及原生质体融合等方式激活沉默基因，现有的激活沉默基因的方法很多，根据它们设计的思路不同，本文将现有的方法分成遗传学方法、生态学方法和化学方法3类。
遗传学方法主要利用基因工程技术，通过在非同源宿主中表达完整的基因簇或者改变细胞间转录条件或者改变蛋白质合成机制等方式实现。
因此提高次级代谢产物的合成量可以通过改变调控、核糖体功能、蛋白修饰和染色体修饰等实现。
基于许多次生代谢生物合成基因簇具有的共同特点，即包含一个或者多个具有编码转录因子进而转录所有基因。
在生物体内，遵从分子遗传操作诱导型启动子可以替代转录因子的启动子。
通过对转录因子的合成能够实现反应从自然控制到实验者控制的转变。
从而实现转录因子的高表达，最终使得基因簇中所有的基因被激活表达出活性产物。
这一方法的优点是靶基因能够立刻产生代谢产物并且能提供大量的潜在产物。
但这种方法不适用于那些没有转录因子的基因。
除了利用基因簇特定的转录因子之外，还有利用次生代谢基因表达的最普通的调节因子。
1.核糖体工程，通过靶向核蛋白S12或RNA聚合酶（RNAP）来提供抗生素的产量。
理论依据是改变转录和转录机制可以大量增加细菌基因的表达。
不少抗生素（如链霉素），靶向核糖体后，会产生抗生素抗性的突变核糖体并可经简单的突变选择挑选出来。
在生物体中，这样的核糖体工程方法可以激活一个或一些沉默基因，而不是所有的生物合成基因簇，因而也不会激活特定的生物合成基因簇。
2.干扰蛋白质降解系统，大多数核蛋白和细胞质蛋白包括一些转录激活因子都会经蛋白酶途径降解，这一过程需要泛素标记的靶蛋白。
多蛋白COP90信号复合物（CSN）对控制这一过程起着关键作用。
CSN的第五个亚基CSN5/Csn E具有酶催化活性，可以将泛素类蛋白Nedd8从卡林E3泛素连接酶上分离下来。
生物文献汇报
Fig. 3. Phenotypic assortment illustrated during two cell cycles. The top circle represents a heterozygous G1 macronucleus (mac) generated either after a cross or after DNA-mediated transformation followed by integrative recombination. For clarity, the mac shows four allele copies (instead of 45): three are wild type and the fourth is mutant; for example, a knockout allele where the gene is disrupted by insertion of a neomycin-resistance cassette (red). The fused ovals represent macs undergoing division after DNA replication. Note that allele copies are partitioned randomly at each mac division. If neither allele has selective advantage, assortants pure for either allele are ultimately generated. In the presence of neomycin, vegetative descendants that acquire (by chance alone) a higher fraction of mac copies with the disrupted allele will be selected for; if the disrupted gene is essential, both alleles will be maintained by balanced selection.
几篇生物类文献介绍
几篇生物类文献介绍1.本篇文献主要讲述了RECK功能作为一个肿瘤抑制通过抑制迁移,入侵,和血管生成。
然而,是否RECK可以调整茎状的肿瘤细胞表型是未知的。
在本研究中,我们表明,RECK 是在胃癌细胞和下调是在CD133-positive进一步降低癌症茎状细胞。
异位表达下调的RECK的表达的诱导干细胞的基因包括Sox2,Oct4、Nanog和肿瘤干细胞标志物CD133。
DAPT(γ-secretase抑制剂)或 TAPI-2 (一个hydroxamate-based抑制剂的MMPs,肿瘤坏死因子α转换酶和ADAM17)减少Notch1脱落和激活导致干细胞基因和CD133衰减。
我们的数据表明,ADAM10和ADAM17是公司把下降RECK建议物理之间的相互作用对细胞表面有关系和亚当斯。
此外,RECK抑制球形成和球体的大小CD133-positive胃癌细胞。
Hong, Kun‐Jing, et al. "RECK Inhibits Stemness Gene Expression and Tumorigenicity of Gastric Cancer Cells by Suppressing ADAM‐Mediated Notch1 Activation." Journal of cellular physiology 229.2 (2014): 191-201.2.这篇文章的主要内容是：基因表达的标签是应用于临床预测的工具一样确定个人患有局部乳房肿瘤远处转移的发展的风险。
我们缺乏一个清晰的理解,荷兰国际集团,然而,这些相关的生物标记物是否链接到一个常见的生物网络,调节转移。
我们发现肿瘤蛋白调节的协调表达的13种不同的“可怜的结果“癌症标签。
此外,功能失活的在人类乳腺癌细胞在远距离的转移定位中可能是非常重要的。
Wolfer, Anita, et al. "MYC regulation of a “poor-prognosis” metastatic cancer cell state." Proceedings of the National Academy of Sciences107.8 (2010): 3698-3703.3.本文和病理性血管生成的机制有关，HYP OXIA在肿瘤的侵袭和转移仍然是难以捉摸的。
九篇生物研究性报告的范文
九篇生物研究性报告的范文英文回答：Introduction.Scientific research plays a pivotal role in advancing our understanding of the natural world and unlocking new discoveries. Biological research, in particular, investigates the complexities of living organisms, aiming to unravel the mysteries of life's processes, origins, and evolution. This collection of nine research reports showcases a diverse range of biological studies, each offering valuable insights into specific aspects of life science.Report 1: The Role of Genetics in Plant Adaptation.Explored the genetic variations responsible for drought tolerance in wheat plants.Identified key genes and pathways involved in theplant's response to water stress.Findings provide potential targets for genetic engineering to enhance crop resilience.Report 2: Immunomodulatory Effects of Green Tea Catechins.Investigated the anti-inflammatory and immune-boosting properties of green tea compounds.Assessed the effects of catechins on immune cell signaling and cytokine production.Results suggest that green tea may have therapeutic applications for immune disorders.Report 3: Neuroprotective Mechanisms of Resveratrol.Examined the neuroprotective effects of resveratrol, a natural plant compound.Evaluated its ability to mitigate oxidative stress and neuronal damage.Findings support the potential of resveratrol as a treatment for neurodegenerative diseases.Report 4: Diversity and Distribution of Marine Invertebrates.Surveyed the marine invertebrate communities in a coastal ecosystem.Identified and characterized various species of mollusks, crustaceans, and echinoderms.Data provides insights into ecosystem health and biodiversity conservation.Report 5: Biodegradation of Microplastics by Aquatic Fungi.Investigated the potential of aquatic fungi to break down microplastics in marine environments.Tested the ability of different fungal species to degrade plastic types.Findings suggest that fungi may play a role in mitigating plastic pollution.Report 6: Behavioral Ecology of Social Insects.Examined the social behavior and communication patterns of ant colonies.Observed ant interactions, nest construction, and foraging strategies.Findings provide insights into the organization and cooperation within insect societies.Report 7: Evolutionary History of Primates.Studied the evolutionary relationships among primates using comparative anatomy and genetic analysis.Reconstructed the branching patterns of the primate family tree.Findings shed light on the origins and diversification of our closest relatives.Report 8: Antimicrobial Properties of Plant Essential Oils.Evaluated the antibacterial and antifungal activities of essential oils from various plant species.Tested the effectiveness of oils against pathogenic microorganisms.Results indicate that plant essential oils may offer potential as natural antimicrobial agents.Report 9: Role of Microorganisms in Soil Fertility.Explored the relationship between soil microbes and nutrient cycling in agricultural systems.Examined the effects of microbial diversity on soil fertility and crop growth.Findings highlight the importance of microbial communities for sustainable agriculture.Conclusion.These nine biological research reports provide a glimpse into the diverse range of topics that fall under the umbrella of life science. From plant genetics to marine ecology, from immune function to social behavior, these studies expand our knowledge of living organisms and their interactions with the environment. As we continue to unravel the complexities of the natural world, biological research will play an ever more critical role in shaping our understanding of life and informing our decisions for the future.中文回答：绪论。
生物文献汇报总结范文
摘要：随着科学技术的不断发展，细胞衰老与免疫监视成为生物医学研究的热点。
本文通过对相关文献的汇报，总结细胞衰老的机制、衰老细胞与免疫监视的关系，以及p21在免疫监视中的重要作用，以期为相关研究提供参考。
一、细胞衰老的机制细胞衰老是生物体内细胞生命活动的一种自然现象，其机制主要包括以下几个方面：1. 线粒体功能障碍：线粒体是细胞能量代谢的中心，线粒体功能障碍会导致细胞能量供应不足，进而引发细胞衰老。
2. 氧化应激：细胞在代谢过程中产生大量自由基，自由基攻击细胞内分子，导致细胞损伤和衰老。
3. DNA损伤与修复：DNA损伤是细胞衰老的重要原因之一，细胞内DNA损伤修复机制失灵，会导致细胞衰老。
4. 细胞周期调控异常：细胞周期调控异常会导致细胞增殖失控，从而引发细胞衰老。
二、衰老细胞与免疫监视的关系免疫监视是机体清除异常细胞、维持内环境稳定的重要机制。
衰老细胞作为潜在的肿瘤细胞，需要被免疫系统识别和清除。
以下为衰老细胞与免疫监视的关系：1. 衰老细胞产生衰老相关分泌表型（SASP）：衰老细胞会产生SASP，其中包括免疫调节细胞因子、趋化因子、基质重塑酶和生长因子等，有助于免疫系统识别衰老细胞。
2. 免疫细胞识别衰老细胞：免疫细胞通过识别衰老细胞表面的特定分子，如SASP中的分子，将其清除。
3. 免疫细胞调控衰老细胞死亡：免疫细胞通过释放细胞因子，调控衰老细胞的死亡，如细胞凋亡和自噬。
三、p21在免疫监视中的重要作用p21是一种细胞周期抑制剂，具有抑制细胞增殖、促进细胞衰老的作用。
近期研究表明，p21在免疫监视中发挥重要作用：1. p21促进衰老细胞产生SASP：p21可以促进衰老细胞产生SASP，有助于免疫系统识别衰老细胞。
2. p21增强免疫细胞对衰老细胞的识别：p21可以增强免疫细胞对衰老细胞的识别，提高免疫清除衰老细胞的能力。
3. p21调控免疫细胞活性：p21可以调控免疫细胞活性，促进免疫细胞清除衰老细胞。
学科生物文献汇报
学科生物文献汇报学科生物文献汇报应由本人根据自身实际情况书写，以下仅供参考，请您根据自身实际情况撰写。
学科生物文献汇报一、引言生物学是一门研究生物体及其生命活动规律的学科，其研究领域广泛，包括细胞、分子、基因、生态等多个方面。
在生物学研究中，文献综述是必不可少的一部分，通过对相关文献的梳理和分析，可以更好地了解研究领域的发展现状和趋势，为后续的研究提供参考和借鉴。
二、文献综述的目的和意义文献综述的目的是对某一研究领域的已有文献进行系统性的梳理和分析，总结出该领域的研究现状、研究问题和未来发展方向。
通过文献综述，可以了解该领域的研究进展和研究成果，发现研究的不足之处和需要进一步研究的问题，为后续的研究提供指导和启示。
三、文献综述的方法和步骤文献综述的方法和步骤包括以下几个方面：1. 确定研究领域和主题：根据研究需要，确定需要综述的领域和主题。
2. 收集文献：通过各种途径收集相关文献，包括学术期刊、会议论文、学位论文等。
3. 筛选文献：根据研究主题和目的，筛选出与主题相关的文献。
4. 整理文献：对筛选出的文献进行分类整理，按照不同的分类标准进行归纳和总结。
5. 分析文献：对整理好的文献进行分析，总结出研究现状、研究问题和未来发展方向。
6. 撰写综述：将分析结果撰写成综述文章，注意逻辑性和条理性。
四、学科生物文献综述的重点和难点学科生物文献综述的重点和难点包括以下几个方面：1. 确定研究领域和主题：生物学是一个非常广泛的领域，涉及多个学科方向，因此需要明确研究领域和主题，避免综述过于宽泛或过于狭窄。
2. 收集文献：生物学领域的文献数量庞大，需要采用多种途径进行收集，并注意文献的质量和相关性。
3. 筛选文献：需要对收集到的文献进行筛选，排除与主题不相关的文献，选择具有代表性的文献进行分析。
关于生物的研究报告(共9篇)
关于生物的研究报告第一篇：生物多样性的重要性生物多样性是指地球上生物种类的丰富程度和生物之间的遗传差异。
它是地球生态系统的重要组成部分，对人类的生活和生存有着深远的影响。
生物多样性不仅提供了丰富的食物、药物和原材料，还有助于维持生态平衡、控制疾病传播和调节气候。
生物多样性的丧失是一个全球性的问题，主要原因是人类活动导致的栖息地破坏、过度捕捞、污染和气候变化。
为了保护生物多样性，我们需要采取一系列措施，如建立自然保护区、推广可持续农业和渔业、减少污染和碳排放等。
第二篇：基因编辑技术及其在生物研究中的应用基因编辑技术是一种可以精确修改生物体基因组的技术，它在生物研究中有着广泛的应用。
通过基因编辑技术，科学家可以研究基因的功能、了解疾病的机制、开发新的治疗方法等。
目前，CRISPRCas9是最常用的基因编辑技术之一。
它利用一种名为Cas9的酶来切割DNA，并利用一种称为引导RNA的分子来定位需要修改的基因。
CRISPRCas9技术具有高效、准确和低成本等优点，因此被广泛应用于各种生物研究中。
第三篇：微生物在生物地球化学循环中的作用微生物是地球上最古老的生物之一，它们在生物地球化学循环中发挥着重要的作用。
微生物通过分解有机物质、固氮、甲烷产生等过程，将碳、氮、硫等元素循环回环境中。
微生物在生物地球化学循环中的作用对地球生态系统的稳定性和功能有着重要的影响。
例如，固氮微生物可以将大气中的氮气转化为植物可以利用的氮肥，从而促进植物的生长。
甲烷产生微生物则可以将有机物质转化为甲烷，影响全球气候。
第四篇：生物钟与生物节律的研究进展生物钟是生物体内的一种内在时间控制系统，它调节着生物体的生理和行为节律，如睡眠、觉醒、进食和繁殖等。
生物钟的节律通常与地球的自转和公转周期相匹配，形成24小时昼夜节律。
近年来，科学家们对生物钟的研究取得了显著的进展。
他们发现，生物钟的节律是由一组基因和蛋白质组成的分子机制所控制，这些基因和蛋白质相互调控，形成了一个复杂的反馈回路。
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Over 95% of up- or downregulated genes bound by Lin28A were also bound by Tet1 on promoters or intra-genic regions
结果
说明：冷探针（cold probe），没有生物素（Biotin）标记的DNA，实验中不显色
实验
• Step 2：Lin28A Is Primarily Associated with Transcribed Genes in mESCs
图6：Lin28A敲低 （ lentivirus-mediated shRNA ）再进行RNA-seq。 用qPCR证明敲低操作是成功的。有许多基因是和DNA在ChIP实验中 是结合的，证实Lin28A确实调控基因表达（区别于直接作用RNA）。
背景[1]
生理影响 核心功能介绍
实验
• Step 1：Lin28A Binds to Specific Genomic Loci in Mouse ESCs and Directly Binds DNA
图1：ChIP集中TSS
图2：ChIP得到Lin28A结合motif 图3：EMSA证实motif与Lin28A结合
图7：Tet1与Lin28A各自DNA结合 区有5632个相同基因位点
实验
• Step 3：Lin28A Forms a Complex with Tet1 to Recruit Tet1 to Their Genomic Co-targets
图8：无论敲低Lin28A还是Tet1都会导致另外一个蛋白质富集DNA能力下降
图9：Pol II酶抑制剂（Triptolide简写tri）使得Lin28A结合DNA能力下降
考虑到Lin28A与Pol II酶有相似的DNA结合区。暗示着DNA先结合Pol II，再结合 Lin28A。 Co-immunoprecipitation (co-IP) analysis免疫共沉淀
实验
(co-IP)
实验
• Step 3：Lin28A Forms a Complex with Tet1 to Recruit Tet1 to Their Genomic Co-targets
图9：Bub bubble DNA更优结合Lin28A，GST（谷胱甘肽巯基转移酶）为对照组
考虑到Lin28A拥有结合DNA和RNA的能力、结合空腔，设计不同类型DNA， 得到Bub bubble DNA结合能力最优。
Lin28A KD(敲低) decreased Tet1 enrichment on common targetsby30%–60%. 研究Lin28A和Tet1和DNA的结合关系，发现二者有密切联系。但敲低Tet1 不影响Lin28A与DNA结合能力
实验
• Step 3：Lin28A Forms a Complex with Tet1 to Recruit Tet1 to Their Genomic Co-targets
实验
• Step 4：Lin28A Coordinates with Tet1 to Regulate Cytosine Modification Dynamics and Gene Expression
图10：Lin28A和Tet1密切联系
图11：证实Lin28A征募Tet1达到 5-methylcytosine (5mC) to 5-hydroxymethylcytosine (5hmC)效果
Lin28A Binds Active Promoters and Recruits Tet1 to Regulate Gene Expression
报告人：倪瑞栋
Molecular Cell, 61(1), 153-160. IF: 13.958
摘要 背景
实验
总结 个人观点
背景[1]
核心功能介绍
生理影响
1.Shyhchang , et al. Cell Stem Cell, 2013. 12(4), 395.
背景
• One study in C. elegans also suggested binding of Lin28A to the let-7 genomic locus.[2] • Structurally, Lin28A is composed of two classical nucleic acid binding domains. Notably, CSD domains in other molecules have been shown to bind DNA[3] • Ten-eleven translocation (Tet) family proteins can sequentially convert 5-methylcytosine (5mC ) to 5hydroxymethylcytosine (5hmC), leading to DNA demethylation [4]
2.Van Wynsberghe P M, et al. Nature Structural & Molecular Biology, 2011, 18(3):302. 3.Hudson, W.H., and Ortlund, E.A. Nat. Rev. Mol. Cell Biol, 2014,15, 749–760. 4. Yao, B , et al. Hum. Mol. Genet, 2014, 23, 1095–1107.
实验
• Step 2：Lin28A Is Primarily Ass mESCs
图4：Lin28A与Pol II ChIP结果有重合
图5：组蛋白分析得到Lin28A结合的位点
实验
• Step 3：Lin28A Forms a Complex with Tet1 to Recruit Tet1 to Their Genomic Co-targets We compared genome-wide Lin28A distribution with published databases. Interestingly, more than half (49.1%–71.5%) of Lin28A binding sites were shared by Tet1 in mESCs.