中国人群冠心病MMP3和LTA基因

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雌激素受体α基因多态性与冠心病病变程度的关系

雌激素受体α基因多态性与冠心病病变程度的关系

雌激素受体α基因多态性与冠心病病变程度的关系金莉子;肖宏凯;陈剑;林岫芳;陈筱潮【期刊名称】《中国动脉硬化杂志》【年(卷),期】2008(16)8【摘要】目的探讨中国南方汉族人群中雌激素受体α基因PvuⅡ酶切多态性与冠心病病变程度的关系。

方法应用聚合酶链反应限制片长多态性检测236例冠心病患者和117例对照者雌激素受体α基因型,并比较其与冠心病及其冠状动脉病变支数和冠状动脉积分的关系。

结果雌激素受体αPvuⅡ多态性中的PP、Pp、pp三种基因型在冠心病组和对照组中的频率分别为19.9%、44.5%和35.6%及9.4%、48.7%和41.9%,冠心病组PP基因型频率显著高于对照组(P<0.05);冠心病患者冠状动脉单支、双支、多支病变组之间雌激素受体αPvuⅡ基因型与等位基因频率差异无统计学意义;冠心病患者PP基因型冠状动脉病变程度积分显著高于Pp和pp 基因型(P<0.05)。

结论雌激素受体αPvuⅡ多态性与中国南方汉族人群冠心病的发生及冠状动脉病变程度存在相关性。

【总页数】4页(P647-650)【关键词】内科学;雌激素受体;冠心病;基因多态性【作者】金莉子;肖宏凯;陈剑;林岫芳;陈筱潮【作者单位】中山大学附属第五医院心血管内科【正文语种】中文【中图分类】R5【相关文献】1.PA PP-A 的表达及基因多态性与冠心病患者冠状动脉病变程度的关系 [J], 刘慧;李海剑;高传玉;毛绍芬;陶雅非;任东升2.血管紧张素转换酶基因多态性与冠心病及其冠状动脉粥样硬化病变程度的关系[J], 施育平;孟伟华;单江;傅国胜;徐耕3.外周血CYP2 C8基因rs7909236、rs1934953位点多态性与冠心病分型和病变程度的关系 [J], 冯茹;詹中群;蔡婕4.早发冠心病患者载脂蛋白E基因多态性及与冠脉病变严重程度的关系 [J], 于淼;高璐;李潞5.早发冠心病患者载脂蛋白E基因多态性及与冠脉病变严重程度的关系 [J], 于淼;高璐;李潞因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

国人载脂蛋白A1基因多态性与血脂水平及冠心病的关系

国人载脂蛋白A1基因多态性与血脂水平及冠心病的关系

国人载脂蛋白A1基因多态性与血脂水平及冠心病的关系邹阳春;胡大一;杨新春;贾兴元;王乐丰;刘晓惠;魏妤;高明明;顼志敏;崔亮【期刊名称】《中国动脉硬化杂志》【年(卷),期】2003(11)4【摘要】为探讨载脂蛋白A1基因 - 75bp +83bp位点多态性与血脂水平及冠心病发生之间的关系 ,采用生物化学方法分别测量经冠状动脉造影证实的 92例冠心病患者及 4 5例正常人空腹血脂水平 ,应用聚合酶链反应对载脂蛋白A1基因DNA 4 33bp的5’末端片段进行限制性片段长度多态性分析。

结果发现 ,冠心病组甘油三酯、总胆固醇、低密度脂蛋白、载脂蛋白B及脂蛋白 (a)水平均高于对照组(均P <0 .0 5 ) ,而高密度脂蛋白 (P <0 .0 0 5 )与载脂蛋白A1 (P <0 .0 5 )水平则低于对照组 ;冠心病组较对照组M1 -及M2 -基因型频率明显为低 (P <0 .0 0 5 ,P <0 .0 5 ) ;与M1 + +相比 ,M1 +- - -者血中高密度脂蛋白及载脂蛋白A1水平分别升高 1 8.0 9%和 1 5 .6 8% ,而M2 +- - -者血中高密度脂蛋白及载脂蛋白A1水平较M2 + +分别升高 6 .1 9%和 8.6 5 %。

以上结果表明 ,载脂蛋白A1基因- 75bp位点G被A取代及 +83bp位点C被T取代或G被A取代后个体血载脂蛋白A1及高密度脂蛋白水平升高 ;【总页数】4页(P345-348)【关键词】流行病学;载脂蛋白A1基因多态性与血脂及冠心病的关系;基因多态性;聚合酶链反应;MspI酶;高密度脂蛋白;冠心病【作者】邹阳春;胡大一;杨新春;贾兴元;王乐丰;刘晓惠;魏妤;高明明;顼志敏;崔亮【作者单位】北京朝阳医院心脏中心;北京大学人民医院心内科;北京朝阳医院基础医学中心【正文语种】中文【中图分类】R18【相关文献】1.载脂蛋白B基因多态性与血脂代谢及冠心病关系的研究 [J], 李飞雪;黄体钢2.ABCA1启动子区基因多态性与血脂水平及冠心病的关系 [J], 程爱娟;毛用敏;崔让庄;吴尚勤;孙姗3.载脂蛋白C3基因rs5128多态性与不同体质指数冠心病患者血脂水平及冠状动脉狭窄程度的相关性 [J], 张井潇;吕湛;王艳玫;杨阳;欧阳肖肖;宋永砚4.载脂蛋白A1/C3/A5基因多态性和单体型与血脂水平的关系 [J], 尹瑞兴;李依阳;赖超强;刘婉莹;龙兴江;吴锦珍5.载脂蛋白E基因多态性与血脂代谢及冠心病的关系 [J], 朱健华;潘闽;孙承龙;王惠民;刘志华因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

MEF2A基因多态性与重庆地区汉族人群冠心病的相关性

MEF2A基因多态性与重庆地区汉族人群冠心病的相关性

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30 10型( B 公 司 , 国) AI 美 。
1 3 方 法 Байду номын сангаас.
13 1 基 因组 D A抽提 .. N
用 ET D A抗凝 管真空采集
外周静脉血 5m , L 采用酚/ 氯仿方法抽提 D A, N 并调成 2 g m 置 4 冰箱 中保存 。 0n/ L,
13 2 引物设 计与合成 .. 根据美 国国立 图书馆人类
p i e e ntet og u s( 0 0 ) u h r o s nf a t o ea o a oe e e n ME 2 x n 1 A hs b t e r p P< . 5 .F r e ,n i ic n cr l i w sn t b t e F A eo C G m w h w o t g i r tn d w 1
表 1 两组患者临床资料 比较 i±s
美 国) 电泳 仪及 水平 电泳 槽 ( ; 北京 六 一仪器 厂 ) G l ;e D c0 凝胶成 像 仪 ( I o10 BO—R D公 司 , 国) 全 波长 A 美 , 分光 光 度 计 ( I —R D公 司 , 国 ) D A测 序 仪 BO A 美 ,N

血管紧张素原基因M235T变异与冠心病的关系

血管紧张素原基因M235T变异与冠心病的关系

血管紧张素原基因M235T变异与冠心病的关系
陈德;张眉
【期刊名称】《上海医科大学学报》
【年(卷),期】1998(025)002
【摘要】研究血管紧张素原基因M235T分子变异与中国人冠心病发生的关系。

方法采用多聚酶反应,限制性片段长度多态性分析,对76例CHD患者和76例无CHD语气的对照组进行AGT基因M235T等痊基因检测。

结论中国人AGT基因M235T分子变异与CHD显著相关,AGT基因235TT型可能是CHD的重要危险因素之一。

【总页数】4页(P83-86)
【作者】陈德;张眉
【作者单位】上海医科大学华山医院心内科;上海医科大学华山医院心内科
【正文语种】中文
【中图分类】R541.402
【相关文献】
1.血管紧张素原基因M235T分子变异与先兆子痫关系的研究 [J], 李克深;毛东伟;孙延芝;陈黎明;王孝铭
2.妊高征与血管紧张素原基因M235T分子变异的关系 [J], 杨岚;熊庆;彭芝兰;周容;张林
3.血管紧张素原基因M235T多态性rn与冠心病关系的研究 [J], 谢勇;张馥敏;马
文珠;杨笛;耿茜;贾永平;杨志健;张寄南
4.血管紧张素原基因M235T变异与HBV感染后肝硬化形成的关系 [J], 宋淑静;田敬华;赵辉;刘亚楠;郭杰;马小亮;王慧珠
5.血管紧张素转换酶基因、血管紧张素原基因M235T变异与高原肺水肿的关系[J], 格桑罗布;岑维浚;刘国仗;邱长春;陈勇;仁旦;庄兰萍;卓玛次仁;平措扎西;史丽华
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中国汉族人群载脂蛋白M基因-778T/C多态与2型糖尿病合并冠心病的关联研究

中国汉族人群载脂蛋白M基因-778T/C多态与2型糖尿病合并冠心病的关联研究

合并冠状动脉粥样硬化性 心脏病 ( 冠心病 ) 的相关 关系。方法 率 的分布情况 。结果
2 3 8 例糖尿病合并冠心病 的患者及 2 3 6例对照组进行检测 ,分析 A p o M基 因一 7 7 8 T / C多态 的基 因型和等位基 因频 A p o M基 因一 7 8 8 T / C多态三种基 因型 ( T T型 , T C型和 C C型 ) 在 2型糖尿病合并冠心病组分 布频率分别为 7 3 . 9 %、 2 4 _ 3 %和 1 . 7 %, 在对 照组分布频率分别 为 8 6 . O %、 1 3 . 1 %和 0 . 9 %; 两组 比较差异有统计学意义 ( P = 0 . 0 0 1 ) 。A p o M 基因一 7 8 8 T / C多态 T、 c等位 基 因的频率 在 2型糖尿病 合并 冠心病 组及对 照组 中分布 分别为
a n d t y p e 2 d i a b e t e s me l l i t u s w i t h c o r o n a r y h e a t r d i s e a s e i n Ch i n e s e Ha n p o p u l a t i o n .Me t h o d s A c a s e — c o n t r o l s t u d y wa s c o n d u c t e d i n 2 3 8 p a t i e n t s wi t h t y p e 2 d i a b e t e s me l l i t u s c o mp l i c a t e d w i t h c o r o n a y r h e a r t d i s e a s e a n d 2 3 6 c o n t r o l s . P o l y mo r p h i c g e n o t y p e s we r e d e t e r mi n e d b y p o l y me r a s e c h a i n r e a c t i o n — r e s t i r c t i o n f r a g me n t l e n g t h p o l y mo r p h i s m. Re s u l t s T h e g e n o t y p e f r e q u e n c i e s i n Ap o M g e n e- - 7 8 8 T / C p o l y mo r p h i s m c o n f o r me d we l l w i t h t h e Ha r d y - - We i n b e r g e q u i l i b i r u m i n b o t h c a s e a n d c o n t r o l g r o u p s .T h e g e n o t y p e f r e q u e n c i e s o f TI " , T C a n d C C o f Ap o M g e n e一 7 8 8 T / C p o l y mo r p h i s m w e r e 8 6 . 0 % .1 3 . 1 % a n d 0 . 9 % i n t h e c o n t r o l s ,7 3 . 9 % .2 4 . 3 % a n d 1 . 7 % i n p a t i e n t s w i t h t y p e 2 d i a b e t e s me l l i t u s w i t h c o r o n a r y

中国南北方冠心病患者TM1418位C/T多态性研究及对比分析

中国南北方冠心病患者TM1418位C/T多态性研究及对比分析

1 1 点 突变 产生 的 CC纯合 子 可能 是 引起 北 方冠 心 病 的一 个重 要 的遗 传 危 险 因素 。 4 8位 /
【 关键 词 】多态现 象 ; RM S法 ; A 血栓 调 节蛋 白 ; 冠心病 [ 图分 类 号] 5 14 中 R 4 . 【 文献 标 识码】A 【 文章 编 号1 6 4 4 2 ( 0 1 0 b 一 4 — 2 1 7 - 7 1 2 1 )9( ) 0 8 0
Ku mi g 6 0 31 Ch n ; . d c lGe ei s De a t n fZ e g h u Un v ri , e g h u 4 0 0 , i a n n 5 0 , i a 3 Me i a n t p rme to h n z o i e st Zh n z o 5 0 0 Ch n c y
U e h p l ainse ica pict n ss m ( tt n R )tc nlg od t tteT gn 4 8aCT p l— sdtea pi t pcf m l ai yt c o i i f o e muai sA MS e h oo t ee M e e 1 1 / o o y c h y
mo p im n 71 a e t o o a re y d s a e o n a n n n 1 0‘ a e t o o a r r ie s f r h s i c s s wi c r n r a r i e s f Yu n n Ku mi g a d 0 c s s wi c r n r a t y d s a e o h y t h y e
患者 的 T 基 因 1 1 M 4 8位 C I多 态 性 。结 果 : M 基 因 1 1 厂 ’ T 4 8位 ''rC型及 C C型 频 率 在 南 方 冠 心 病 组 中 分 别 为 II r 厂、/ / 1 .7 6 .7 2 .6 北 方冠 心病 组 分 别为 1 . % 、70 %、30 %。北方 冠 心病 组 T 基 因 1 1 1 %、 1 %、67 %, 2 9 00 0 3 .0 5 .0 M 4 8位 C C型 明显 高于 南 方冠 心病 组 ( < .5。 P 00 ) C等 位 基 因频 率在 南 方与 北 方冠 心 病组 中分 别 为 5 . %和 7 . % , 77 5 15 0 C等 位 基 因频率 北 方明 显高 于 南方 ( < .5 。结 论 : 栓 调节 蛋 白( M) 因 1 1 P 00 ) 血 T 基 4 8位 CT多态 性 与北 方 冠 心病 发 病密 切 相关 , M 基 因 / T

ACE基因、A型行为与冠心病的相关性

ACE基因、A型行为与冠心病的相关性

ACE基因、A型行为与冠心病的相关性
祁微微;杨庭树;王择青
【期刊名称】《老年医学与保健》
【年(卷),期】2001(007)002
【摘要】目的探讨中国北方健康人群及冠心病(CHD)人群中血管紧张素转换酶(ACE)基因多态性和A型行为(TABP)因子的分布特点.方法应用聚合酶链反应技术和TABP问卷对中国健康人群及CHD患者进行ACE基因和TABP的相关性研究.结果(1)中国健康人群DD、ID、Ⅱ基因型频率分别为11.25%、67.50%和
21.25%,I、D等位基因频率分别为55%和45%;(2)CHD组及其心肌梗死(MI)和心绞痛(AP)亚组的ACE基因型分布与正常人相比差异显著(P<0.001);(3)A与B型性格相比,发生AP和MI的危险性增高.结论ACE基因I/D多态性、TABP可能与CHD的发生和发展有关,DD基因型和敌意是CHD发生的主要易患因素.
【总页数】3页(P83-85)
【作者】祁微微;杨庭树;王择青
【作者单位】100853,北京市,解放军总医院心内科;100853,北京市,解放军总医院心内科;100853,北京市,解放军总医院心内科
【正文语种】中文
【中图分类】R5
【相关文献】
1.冠心病血瘀证血管病变数与ACE基因多态性的相关性研究 [J], 宋曙霞;李建军;刘颖;罗有文;黄利英
2.冠心病患者A型行为与冠脉病变程度的相关性研究 [J], 黄杰
3.老年冠心病患者A型行为与心理健康及社会支持的相关性 [J], 陈海苗;汤诚;杨金娜;曹肖肖;陈小涵;黄水平
4.A型行为与冠心病相关性研究 [J], 顼志兵;李国璜
5.冠心病与A型行为的相关性研究 [J], 张蓉
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血管紧张素原基因M235T多态性与高血压病合并脑梗塞的关系

血管紧张素原基因M235T多态性与高血压病合并脑梗塞的关系

血管紧张素原基因M235T多态性与高血压病合并脑梗塞的关系管立学;高颖;高丽;张爱娟;晋万强;逄迎春;宋保华【期刊名称】《潍坊医学院学报》【年(卷),期】2000(22)3【摘要】目的探讨血管紧张素原 (AGT)基因 M2 35 T多态性与中国人高血压病合并脑梗塞的关系。

方法应用聚合酶链反应 -限制性片段长度多性态分析结合DNA银染技术 ,对 83例正常人 ,83例高血压病无心脑血管合并症患者 ,5 5例高血压病合并脑梗塞患者进行 AGT基因 M2 35 T多态性分析。

结果 AGT基因 M2 35 T多态性与中国人高血压病无相关关系 ,但有高血压家族史的脑梗塞患者 AGT 基因 TT基因型频率 6 1 .8%和 T等位基因频率 76 .4%显著高于正常对照组的42 .7%和 6 5 .2 % (P<0 .0 5 ) ,以及高血压病无心脑血管合并症组的 44 .6 %和 6 8.1 % (P<0 .0 5 )。

结论有高血压家族史的 AGT基因 TT基因型携带者易患脑梗塞 ,这种基因型可能是中国人有高血压家族史的脑梗塞发病的重要遗传因素。

【总页数】3页(P171-173)【关键词】血管紧张素原;基因;脑梗塞;高血压;遗传学【作者】管立学;高颖;高丽;张爱娟;晋万强;逄迎春;宋保华【作者单位】潍坊医学院附属潍坊市人民医院【正文语种】中文【中图分类】R544.102;R743.330.2【相关文献】1.血管紧张素原M235T基因多态性及体重指数与原发性高血压的关系 [J], 周晓红;路方红;金世宽;刘振东;孙尚文;赵颖馨;王舒健;杨建民2.连锁分析血管紧张素转换酶基因插入/缺失多态性和血管紧张素原 M235T基因多态性与肥厚型心肌病的关系 [J], 杨荣;张馥敏;马文珠;谢勇;贾永平3.血管紧张素原M235T基因多态性与老年高血压及其合并糖尿病的相关性 [J], 浦剑虹;刘健;钱慧英;吴秀英4.血管紧张素原M235T基因多态性与重庆地区原发性高血压的关系 [J], 孙琦;柳青;雷寒;王曦5.蒙古族原发性高血压人群与血管紧张素转换酶ACE I/D基因及血管紧张素原AGT M235T基因多态性的关系 [J], 张春雨;赵世刚;牛广明;李宏芬;胡日乐;王智光;江名芳;呼日勒因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

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中国人群冠心病MMP3和LTA基因易感性的研究1 绪论1.1背景此课题来源于国家人类基因组南方研究中心遗传部承担的2003年上海市重大科研项目-中国人群心脑血管疾病及其相关临床症状的易感性研究。

随着人类基因组序列的绘制完成,我们已经获得了大量的基因组序列信息,但如何从已知的序列中了解各个基因的功能、表达调控,以及多个基因及其产物之间的相互作用和基因组和环境的相互作用?因此,目前国际上广泛通过分子水平对疾病进行研究,分析疾病发生的遗传基础,进而探索不同基因型在疾病过程中的作用和规律,从而揭示基因组功能的奥秘,建立疾病基因组学、尤其是多基因疾病研究的理论和技术体系。

动脉粥样硬化是一种常见的进行性发展性疾病,病变主要累及中等大小的肌层动脉,形成局限性斑块,严重时斑块破裂导致血栓、栓塞、出血,受累管腔部分或完全闭塞,临床表现为动脉粥样硬化血管并发症的发生,老年患者中最常见和最严重的血管并发症是冠心病(不稳定性心绞痛和心肌梗塞)和脑卒中。

目前全球动脉粥样硬化心脑血管并发症的发病率、患病率和死亡率已跃居首位,是老年人的头号杀手。

中国冠心病的发病率略低于国际平均水平,而脑卒中的发病率则高于国际平均水平,但均有上升的趋势。

动脉粥样硬化最棘手的问题是:起病隐匿,平时无明显症状,而临床一旦出现心脑血管并发症即很难逆转,长期以来医学界缺乏有效的预测和防治手段。

1.2实验目的构建中国人群冠心病、颅内动脉瘤等心脑血管疾病的样本资料库、基因组DNA 库;通过对候选基因进行多态性筛查建立心脑血管疾病的易感/相关基因的SNP 数据库和SNP单倍型数据库;筛选和鉴定冠心病、颅内动脉瘤的易感/相关基因,阐述心脑血管疾病发生的分子遗传学机制。

为疾病预防、诊断、治疗提供理论依据。

1.3基本原理方法概述1.3.1冠心病的发病机理正常的动脉内膜附有一层非常光滑的内皮细胞。

在动脉粥样硬化的早期可见到微隆起或不隆起于内膜表面的黄色点状或条状病变,其主要成分是沉积在细胞内外的脂质,此时我们称之为脂质条纹期。

在机体内外环境因素的影响下,脂质条纹可自然消退或发展扩大,增生的动脉平滑肌细胞和激活的巨噬细胞可吞噬大量脂质。

由于其细胞内部发生脂代谢紊乱,不能很好地代谢所吞噬的脂肪而演变成动脉粥样硬化斑块内特有的泡沫细胞。

纤维组织大量增生,脂质进一步沉积,可形成明显硬化的纤维斑块,即纤维斑块期。

纤维斑块的表面覆有纤维组织形成的纤维帽,深部是粥样物质的堆积(包括细胞外基质、坏死、变性的细胞、泡沫细胞及胆固醇结晶等)。

病变进一步发展,动脉粥样硬化斑块可出现溃疡、出血、血栓形成、钙化等。

目前一般认为,病变发展到此期已无法使其逆转。

有学者认为,冠状动脉粥样斑块的溃疡,出血可能是引起顽固性心绞痛的主要机制之一;而血栓形成则是导致急性心肌梗塞不可急视的因素。

1.3.2 SNP位点简介本实验是根据冠心病的发病机理,通过查文献找出与冠心病相关基因与其中的SNP位点,然后找出病人与正常人的这些SNP位点的相关性,如果成阳性证明这个位点的多态性与发病有关,成阴性则没有关系。

单核苷酸多态性(即SNPs)是在人类基因组中分布最为广泛的多态,根据最近的研究结果发现人类基因组中大约存在140万至310万个SNP,其平均密度为1kb(INSMWG,2001;IHGSC,2001).人类基因组中为SNP比较其他类别的序列变异(比如微卫星点)成为了在基因组分析中更为理想的标记;SNPs遍布于各个基因组(INSMWG,2001),通过SNP变异能够为每个基因组区域的进化历史提供线索,SNPs同时也可以用于观察人类基因组中的连锁不平衡水平(Lander and Schork,1994)。

连锁不平衡是一种用于衡量基因组序列中特异的等位基因组合(单倍型中,haplotypes)的方法,它们来自于在进化过程中被保留下来的共同原始祖先。

(Lander and Schork,1994)。

通过SNPs研究连锁不平衡,我们不仅能够解决人类进化中的疑问,同时还可以定位疾病相关的遗传位点。

(INSMWG,2001;Tischkoff SA,,etal,1996).1.3.3疾病基因的定位寻找与疾病表型相关的遗传位点并非是项容易的工作尤其是对于复杂性状疾病。

这些疾病都由多种易感因子积累其影响从而致病,其中包括遗传因素和环境因素。

与疾病表型相关的每一个单独的疾病易感位点和因素的确定都是非常富有挑战性的工作。

虽然定位克隆已经成功的被用于确定引起单基因疾病的遗传致疾位点。

(Jiminez-Sanchez etal,2001)。

但是遗传作图在复杂性状疾病的多位点分析中存在很大的局限性,尤其是位点对于疾病表型的贡献很小的时候问题就更为突出。

(Peltonen etal,2000)随着几百万个SNPs为发现已经使确定复杂性状这一严峻的挑战成为一种可能。

SNPs一般平均密度为 1.9kb 有63%的区域至少在5kb存在一个SNP (Chakravarthy,2001).SNP在人类基因组中的广泛分布使它成为了理想的候选标记。

虽然以往在我们感兴趣区域中发现多态性从而确定与性状相关的遗传位点能能起到一定的效果,但现在广泛分布为SNP为我们提供了更为有效的标记。

(Peltonen and Mcknsick,2001)2 实验器材与试剂2.1抽提DNA器材与试剂2.1.1器材(1)15ml,2ml离心管(2)试管架,吸水纸(3)laboratory centrifuges 4-15c(sigma)2.1.2试剂ACD抗凝剂(柠檬酸0.48克+柠檬酸钠1.32克,加双蒸水至94毫升,高压灭菌后,加6毫升25%葡萄糖针剂),DNA样本(从血液中提取)FG1(flexiGene lysis buffer)FG2(flexiGene denturation buffer)FG3(flexiGene hydration buffer)QIAGEN protease 7.5AU2.2 电泳及拍照器材试剂2.2.1器材EPS-300 稳压稳流电泳仪(Tanon®)电泳板(120ml,150ml,250ml),电泳槽和12孔和24孔6ul的电泳梳96-Well plate (ABgene)10ul移液枪,10ul枪头(eppendorf)150ml,250ml锥形瓶PB3002-S 电子天平(Mettler),称量纸FR-200紫外与可见分析装置(上海复日科技)2.2.2试剂(1)EB(溴化乙锭)由367ulEB原液加入5ml ddH2O配成(2)PCR 产物电泳上样缓冲液0.25%(w/v) 溴酚兰30%(v/v) 甘油70%(v/v) ddH2O(3)DNA 分子MarkerpUC19 MspI (HpaII) Marker (用于普通PCR 电泳) (上海生工)Lambda DNA/EcoRI+HindIII (用于长片段电泳) (上海生工)(4)琼脂糖(5)10*TBE缓冲液Tris 107.8克+硼酸55克+EDTA.Na2 8.2克,加双蒸水至1000毫升,混匀溶解。

2.3 TAQMAN器材与试剂2.3.1器材7900HT Seuence Detection System,96-Well plate (ABgene),384-Well plate (ABgene),移液枪,试剂盒(包括Taqman探针,一般扩增引物)2.3.2试剂试剂盒(包括Taqman探针,一般扩增引物),ddH2O3实验步骤3.1候选基因的查找查文献找出二个相关基因及5个SNP位点3.1.1 L TA基因的结构和功能3.1.1.1基因结构LTA基因别名为TNFSF1、TNFB、LT,它由414个腺嘌呤、735个胞嘧啶、495个鸟嘌呤、496个胸腺嘧啶组成。

位于六号染色体长臂2区1带上的第三亚带上,起结构为:图一 LTA基因结构3.1.1.2基因功能肿瘤坏死因子中的一种,1984年由Gray P.W 等人发现,它在炎性反应中扮演重要的角色,亦可促进次级淋巴器官的发生。

基因表达物为α-淋巴毒素(淋巴毒素A)、β-肿瘤坏死因子。

mRNA序列名:NM_000595PROTEIN:NP_000586Genomic: NT_0075923.1.2MMP3基因的结构和功能3.1.2.1MMP3基因结构基质金属蛋白酶(MMP)是一个大家族,目前已分离鉴别出20个成员,编号分别为MMP1~20。

它们是一组锌离子依赖性肽链内切酶,大小各异,底物不尽相同,能裂解维系蛋白结构的肽链,主要参与结缔组织的降解。

MMPs的家族成员具有相似的结构,一般由5个功能不同的结构域组成[2]:(1)疏水信号肽序列;(2)前肽区,主要作用是保持酶原的稳定。

当该区域被外源性酶切断后,MMPs酶原被激活;(3)催化活性区,有锌离子结合位点,对酶催化作用的发挥至关重要;(4)富含脯氨酸的铰链区;(5)羧基末端区,与酶的底物特异性有关。

其中酶催化活性区和前肽区具有高度保守性。

MMPs成员上述结构的基础上各有特点。

各种MMP间具有一定的底物特异性,但不是绝对的。

同一种MMP可降解多种细胞外基质成份,而某一种细胞外基质成分又可被多种MMP降解,但不同酶的降解效率可不同。

基因结构为:图二 MMP3基因结构mRNA序列名:NM_002422PROTEIN:NP_002413Genomic: NT_0338993.1.2.2MMP3基因的功能现有研究表明MMPs活性的表达受酶原合成、酶原活化和抑制剂抑制三个水平调控。

生长因子和细胞因子等活性介质如表皮生长因子是酶原合成阶段主要的调节因素,它们不仅能促进或抑制MMP mRNA的转录,而且能影响其半衰期;一些粘附分子(受体)、TPA等致癌剂以及细胞外环境等因素均对MMP的转录有调控作用。

此外,纤维蛋白溶解酶在调节MMP表达和活性中也起非常重要的作用。

MMPs的抑制可能在两个层次上,一是在基质转化为活性形态时,二是其活性被体内天然的组织金属蛋白酶抑制剂(tissue inhibitor ofmetalloproteinase,TIMPs)通过与活性形式结合的方式而抑制[4]。

MMPs和TIMPs之间的平衡是MMPs活性一个关键控制点,TIMPs抵抗MMP的确切机制,目前还不完全清楚。

TIMPs 在体内分布广泛,目前已发现了4种,可与活化的MMPs以1:1的比例结合,抑制其活性。

正常情况下MMPs与TIMPs在体内保持着相对的平衡状态,它们的平衡和相互影响决定着细胞基质是降解还是解聚,从而在组织的修复、重塑、胚胎的植入、肿瘤细胞的浸润与转移中具有重要的意义。

3.1.3SNP位点相关信息的收集3.1.3.1方法原理基因由外显子和内含子组成,外显子编码氨基酸序列,内含子不编码氨基酸,在不均一RNA(hnRNA)转化成RNA成被剪切掉,我们可以通过DNA和mRNA序列的对比来、确定DNA序列中SNP位点基因型所引起的可能对氨基酸的变化。

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