克隆载体与表达载体

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克隆载体与表达载体

克隆载体与表达载体

克隆载体:大多是高拷贝的载体,一般是原核细菌,将需要克隆的基因与克隆载体的质粒相连接,再导入原核细菌内,质粒会在原核细菌内大量复制,形成大量的基因克隆,被克隆的基因不一定会表达,但一定被大量复制。

克隆载体只是为了保存基因片段,这样细胞内不会有很多表达的蛋白质而影响别的工作。

克隆载体(Cloning vector ):携带插入外源片段的质粒或噬菌体,从而产生更多物质或蛋白质产物。

(这是为携带”感兴趣的外源DNA实现外源DNA勺无性繁殖或表达有意义的蛋白质所采用的一些DNA分子。

)其中,为使插入的外源 DNA序列可转录、进而翻译成多肽链而设计的克隆载体又称表达载体。

是否含有表达系统元件,即启动子 -- 核糖体结合位点 -- 克隆位点 -- 转录终止信号,这是用来区别克隆载体和表达载体的标志。

表达载体:有的是高拷贝的,有的是低拷贝的,各有各的用处,是一些用于工程生产的细菌,被导入的目标基因会在此类细菌中得到表达,生产出我们需要的产物,导入的基因是由克隆载体产出的。

表达载体具有较高的蛋白质表达效率,一般因为具有强的启动子。

表达载体( Expression vectors )就是在克隆载体基本骨架的基础上增加表达元件(如启动子、RBS、终止子等),是目的基因能够表达的载体。

如表达载体 pKK223-3 是一个具有典型表达结构的大肠杆菌表达载体。

其基本骨架为来自pBR322和pUC的质粒复制起点和氨苄青霉素抗性基因。

在表达元件中,有一个杂合tac强启动子和终止子,在启动子下游有RBS位点(如果利用这个位点,要求与ATG之间间隔5-13bp),其后的多克隆位点可装载要表达的目标基因。

(RBS位点:1974年Shine和Dalgarno首先发现,原核生物,在 mRNAk有核糖体的结合位点,它们是起始密码子AUG和一段位于AUG上游3〜10 bp处的由3 —9bp组成的序列。

这段序列富含嘌吟核苷酸,刚好与16S rRNA 3,末端的富含嘧啶的序列互补,是核糖体 RNA的识另U与结合位点。

第四章 基因工程的质粒载体

第四章 基因工程的质粒载体
(a)表示位于F-细胞中的ColE1质粒的状,它的mob基因进行了转录,其产物 使bom位点发生单链断裂而出现缺口,于是ColE1 DNA 便从超盘旋的的结构 转变成为缺口环状的构型。但ColE1质粒缺乏形成性须的能力,无力进行结合 配对,所以它的DNA也就不能从一个细胞转移到另一个细胞。正是由于不能 够发生转移,这种从超盘旋到缺口环状的构型转变过程,就有可能被回复, 所以就出现这两种构型之间的平衡状态。
SC
2 质粒DNA的转移
(1)质粒的类型:在大肠杆菌中的质粒,可 以分为:
接合型质粒:能自我转移
具有自主复制的基因,控制细菌配对和质粒接合转 移的基因。
非接合型质粒 不能自我转移
按接合转移功 能分类
非接合型质粒
主要基因
自主复制基因,产生大肠杆菌素基因
按抗性记号 分类
Col质粒
接合型质粒
自主复制基因,抗菌素抗性基 因
第二代 酵母表达 穿梭质粒 体系
第三代 哺乳类细 病毒、脂质体 胞表达体系
第四代 基因直接 DNA本身 导入
细菌 酵母 培养动物细胞 生殖细胞、 体细胞、个体
(三)基因工程载体必须具备的条件:
※(1)有复制起点 ※(2)具有若干个限制性内切酶的单一识别位点 ※(3)具备合适的筛选标记 ※(4)具备合适的拷贝数目
(c)所示,F质粒无力帮助mob-突变体进行转移,其中F性须和转移装置虽已 形成,但ColE1 DNA并没有发生缺口。
(d)表示另一种具mob+表型并带有一个顺式显性突变的ColE1突变体,它缺 失了bom位点。在这样的寄主细胞中,虽然能够合成mob蛋白质,但由于不 能发生缺口,因此仍然不能够转移。
3.若质粒DNA经过适当的核酸内切 限制酶切割之后,发生双链断裂形成 线性分子(IDNA),通称L构型

最新为什么要先构建克隆载体再用表达载体备课讲稿

最新为什么要先构建克隆载体再用表达载体备课讲稿

最新为什么要先构建克隆载体再⽤表达载体备课讲稿为什么要先构建克隆载体再⽤表达载体构建克隆载体是⼤量扩增DNA⽚段,⽤以测序、酶切和改造等对DNA实施的后续操作,构建表达载体是⼤量得到翻译产物——蛋⽩质。

为什么要先构建克隆载体,再⽤表达载体,我猜是因为:①得到⼤量的DNA,虽然PCR也可以,但PCR扩增有出错率、但你每做⼀次常规的PCR,⽽且每次都要重新提DNA和RNA才⾏,⽽且,PCR反应的试剂盒⼜不便宜,⽤PCR来制备⼤量DNA有点得不偿失。

尽管构建克隆载体也存在操作复杂(相对于PCR),成功率不是极⾼,⽽且还要筛选,但⼀旦你重组成功并转⼊了⼤肠杆菌,你就可以保存了,你想什么时候⽤,摇个菌,就可以制备到⼤量的DNA。

②测序需要。

你想转表达,你⾸先得确定你扩增的⽬的⽚段是不是你要的,不要以为你设计了个特异性引物,然后跟你mark 的长度就可以确定了,这也只是推测,在科学上不严谨。

扩增出的基因⽚段保险起见或者经费允许,要拿去测序,⽽⼀般送测的序列都是构建到载体上的序列,克隆载体上⼀般也都带有测序引物,已确定这就是你要的那条序列。

你要写论⽂必须要给⼈真凭实据。

先构建克隆载体再构建表达载体并不是⼀个必须的选择,如果你的扩增PCR⽬的条带很亮,⽽且单⼀性很好,我建议你可以直接克隆进⼊表达载体。

很多⼈选择先构建克隆载体,是因为在扩增基因时⽬的条带模糊,特异性不好,这样将基因连接到克隆载体上就可以便于挑去单克隆进⾏测序,增加测序的准确度,从⽽确认⾃⼰克隆基因序列的正确性。

单纯的PCR产物往往是⼀些各种PCR⽚段的混合物,直接送过去测序,往往导致测序信号峰很杂,有时候并不能测出想要的信号序列。

同时保存的PCR⽚段⽐较容易降解,⽽构建好克隆载体后形成的质粒是很容易扩增和保存的。

先构建克隆载体,⼀是为了便于测序,确认克隆序列正确,⼆是为了便于基因PCR⽚段的保存。

怎么构建克隆载体和表达载体?⾸先根据你的实验需要选择相应的载体。

基因克隆载体有什么用途

基因克隆载体有什么用途

基因克隆载体有什么用途
1.基因表达载体:基因克隆载体被用来将感兴趣的基因克隆到表达主
机中。

通过将基因与适当的调控序列结合,如启动子、增强子和终止子等,可以实现对基因的调控和表达。

这种表达基因的载体在生物制药、蛋白质
生产以及基因治疗等领域有广泛的应用。

2.基因敲除载体:基因克隆载体可以用于基因敲除研究,即通过将目
标基因的编码序列替换或删除,实现对基因功能的研究和破坏。

这种方法
可以用来揭示基因在生物发育、生理过程和疾病发生中的作用和机制。

4. RNAi载体:基因克隆载体还可用于RNA干扰(RNA interference,RNAi)技术研究。

通过将特定的RNA序列克隆到载体中,可以实现对目标
基因的特异性抑制,进而揭示基因功能和信号传导途径。

5.DNA库构建:基因克隆载体也可以用于构建DNA库,即将一组基因(如全基因组)克隆到载体中形成文库。

这种文库可以用来筛选和分析目
标基因,加快新基因发现和功能研究的进程。

此外,基因克隆载体还可以用于分子标记和荧光报告基因的构建,以
及基因转导、基因传递和转基因生物的制备等方面。

总的来说,基因克隆
载体是基因工程研究中的重要工具,可以实现对基因的调控、研究和应用,对生物学研究、生物技术开发和医学治疗等领域具有重要的推动作用。

(整理)克隆载体与表达载体

(整理)克隆载体与表达载体

一部分:概念解析二部分:问题解答克隆载体:大多是高拷贝的载体,一般是原核细菌,将需要克隆的基因与克隆载体的质粒相连接,再导入原核细菌内,质粒会在原核细菌内大量复制,形成大量的基因克隆,被克隆的基因不一定会表达,但一定被大量复制。

克隆载体只是为了保存基因片段,这样细胞内不会有很多表达的蛋白质而影响别的工作。

克隆载体(Cloning vector ):携带插入外源片段的质粒或噬菌体,从而产生更多物质或蛋白质产物。

(这是为“携带”感兴趣的外源DNA、实现外源DNA的无性繁殖或表达有意义的蛋白质所采用的一些DNA分子。

) 其中,为使插入的外源DNA序列可转录、进而翻译成多肽链而设计的克隆载体又称表达载体。

是否含有表达系统元件,即启动子--核糖体结合位点--克隆位点--转录终止信号,这是用来区别克隆载体和表达载体的标志。

表达载体:有的是高拷贝的,有的是低拷贝的,各有各的用处,是一些用于工程生产的细菌,被导入的目标基因会在此类细菌中得到表达,生产出我们需要的产物,导入的基因是由克隆载体产出的。

表达载体具有较高的蛋白质表达效率,一般因为具有强的启动子。

表达载体(Expression vectors)就是在克隆载体基本骨架的基础上增加表达元件(如启动子、RBS、终止子等),是目的基因能够表达的载体。

如表达载体pKK223-3是一个具有典型表达结构的大肠杆菌表达载体。

其基本骨架为来自pBR322和pUC的质粒复制起点和氨苄青霉素抗性基因。

在表达元件中,有一个杂合tac强启动子和终止子,在启动子下游有RBS位点(如果利用这个位点,要求与ATG之间间隔5-13bp),其后的多克隆位点可装载要表达的目标基因。

(RBS位点:1974年Shine和Dalgarno首先发现,原核生物,在mRNA上有核糖体的结合位点,它们是起始密码子AUG和一段位于AUG上游3~10 bp处的由3—9bp组成的序列。

这段序列富含嘌呤核苷酸,刚好与16S rRNA 3,末端的富含嘧啶的序列互补,是核糖体RNA的识别与结合位点。

克隆载体与表达载体

克隆载体与表达载体

克隆载体与表达载体
1. T载体是克隆载体,你的基因通过TA克隆法插入载体,这一步的目的是扩增基因,得到大量你要的目的基因片段,以便进行下一步表达载体的构建;DH5α是克隆菌株,不能用来做表达;
2. 欲在大肠杆菌中表达外源基因,需要首先构建原核表达载体,如可将构建至T 载体的目的通过双酶切切下来然后连接到表达载体上,如PET系列的载体等,构建成原核表达载体后,可将此载体转化表达菌株,如BL21(DE3,)等,如果你的目的基因含有稀有密码子,也可以转化Rosetta系列的表达菌株。

最后将构建成功的基因工程菌进行诱导表达。

1、T载体常用于克隆,一般来讲都会再把目的基因亚克隆到表达载体上。

但是并非T载体不能用来表达。

常见的pMD18-T,含有lacZ操纵子,可以IPTG诱导表达。

pGEM-T则含有T7和SP6启动子。

2、为了能够顺利地使用T7系统来表达蛋白,在如BL21(DE3)一类的大肠杆菌菌株中,编码T7RNA聚合酶的基因被整合到其染色体上,并位于lacUV5启动子的下游,受乳糖操纵子调控。

而目标蛋白的编码序列则被构建到含T7启动子序列的质粒上,并受T7RNA聚合酶调控转录。

3、构建质粒、基因表达看似比较成熟,也比较简单。

其实这里面大有学问。

学会看菌株和质粒的相关文档,答案就在其中。

克隆载体与表达载体

克隆载体与表达载体

克隆载体:大多是高拷贝的载体,一般是原核细菌,将需要克隆的基因与克隆载体的质粒相连接,再导入原核细菌内,质粒会在原核细菌内大量复制,形成大量的基因克隆,被克隆的基因不一定会表达,但一定被大量复制。

克隆载体只是为了保存基因片段,这样细胞内不会有很多表达的蛋白质而影响别的工作。

克隆载体(Cloning vector ):携带插入外源片段的质粒或噬菌体,从而产生更多物质或蛋白质产物。

(这是为“携带”感兴趣的外源DNA、实现外源DNA的无性繁殖或表达有意义的蛋白质所采用的一些DNA 分子。

)其中,为使插入的外源DNA序列可转录、进而翻译成多肽链而设计的克隆载体又称表达载体。

是否含有表达系统元件,即启动子--核糖体结合位点--克隆位点--转录终止信号,这是用来区别克隆载体和表达载体的标志。

表达载体:有的是高拷贝的,有的是低拷贝的,各有各的用处,是一些用于工程生产的细菌,被导入的目标基因会在此类细菌中得到表达,生产出我们需要的产物,导入的基因是由克隆载体产出的。

表达载体具有较高的蛋白质表达效率,一般因为具有强的启动子。

表达载体(Expression vectors)就是在克隆载体基本骨架的基础上增加表达元件(如启动子、RBS、终止子等),是目的基因能够表达的载体。

如表达载体pKK223-3是一个具有典型表达结构的大肠杆菌表达载体。

其基本骨架为来自pBR322和pUC的质粒复制起点和氨苄青霉素抗性基因。

在表达元件中,有一个杂合tac强启动子和终止子,在启动子下游有RBS位点(如果利用这个位点,要求与ATG之间间隔5-13bp),其后的多克隆位点可装载要表达的目标基因。

(RBS位点:1974年Shine和Dalgarno首先发现,原核生物,在mRNA上有核糖体的结合位点,它们是起始密码子AUG和一段位于AUG上游3~10 bp处的由3—9bp组成的序列。

这段序列富含嘌呤核苷酸,刚好与16S rRNA 3,末端的富含嘧啶的序列互补,是核糖体RNA的识别与结合位点。

酵母基因克隆与表达载体

酵母基因克隆与表达载体

Gal4蛋白有一个非常突出的特性,它的二个结构域在其适当的连接区被打断后仍具有各自的功能,而且这两个不同的结构域可以重建继续发挥转录激活作用。这一特性使得研究者可以构建两个载体来研究蛋白质与蛋白质之间的相互作用。具体方法是:将A基因与DB融合构建一个表达质粒(通常带Trp标志基因,以下简称Trp质粒)在酵母中表达Gal4-BD-A,将B基因与AD融合构建另一个表达质粒(通常带Leu标志基因)表达Gal4-AD-B,然后将者两个质粒转化酵母,在泛基诺SD/-Trp-Leu双缺培养基上筛选转化克隆(备注:两个质粒共转化的效率一般很低,也可先后逐个转化,即先转化Trp质粒,在泛基诺SD/-Trp的培养平皿中筛选阳性克隆后再转化Leu质粒。如果A蛋白和B蛋白之间存在相互作用,那么Gal4-BD和Gal4-AD通过A和B的桥接作用被聚集在一起而重建转录因子的活性,启动下游报告基因的转录。早期的报告基因选用LacZ,后来为减少非特异性激活而产生的假阳性,增加了双报告基因和三报告基因(LacZ,His3,Ade2)。
此类质粒在细胞内以附加体的形式高度复制, 每个细胞高达200-400个拷贝贝
用途: 用于外源基因的表达
(二). 表达载体
1、GAL1启动子表达载体-----半乳糖诱导的表达载体
(1).Trp筛选标志 (2).Ura筛选标志 (3).Leu筛选标志 (4).His筛选标志 (5).G418筛选标志
此类质粒在细胞内可自主复制,且由于含有中心粒复制序列,因此每个细胞近乎只有一个拷贝。
用途: 由于每个细胞平均只有一个拷贝,避免了目的基因的盈余表达,因而特别适用于基因功能的研究
3、酵母附加体质粒(Yeast episomal plasmid, YEP)
(1).Trp筛选标志 (2).Ura筛选标志 (3).Leu筛选标志 (4).His筛选标志 (5).G418筛选标志
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克隆载体:大多是高拷贝的载体,一般是原核细菌,将需要克隆的基因与克隆载体的质粒相连接,再导入原核细菌内,质粒会在原核细菌内大量复制,形成大量的基因克隆,被克隆的基因不一定会表达,但一定被大量复制。

克隆载体只是为了保存基因片段,这样细胞内不会有很多表达的蛋白质而影响别的工作。

克隆载体(Cloning vector ):携带插入外源片段的质粒或噬菌体,从而产生更多物质或蛋白质产物。

(这是为“携带”感兴趣的外源DNA、实现外源DNA的无性繁殖或表达有意义的蛋白质所采用的一些DNA分子。

) 其中,为使插入的外源DNA序列可转录、进而翻译成多肽链而设计的克隆载体又称表达载体。

是否含有表达系统元件,即启动子--核糖体结合位点--克隆位点--转录终止信号,这是用来区别克隆载体和表达载体的标志。

表达载体:有的是高拷贝的,有的是低拷贝的,各有各的用处,是一些用于工程生产的细菌,被导入的目标基因会在此类细菌中得到表达,生产出我们需要的产物,导入的基因是由克隆载体产出的。

表达载体具有较高的蛋白质表达效率,一般因为具有强的启动子。

表达载体(Expression vectors)就是在克隆载体基本骨架的基础上增加表达元件(如启动子、RBS、终止子等),是目的基因能够表达的载体。

如表达载体pKK223-3是一个具有典型表达结构的大肠杆菌表
达载体。

其基本骨架为来自pBR322和pUC的质粒复制起点和氨苄青霉素抗性基因。

在表达元件中,有一
个杂合tac强启动子和终止子,在启动子下游有RBS位点(如果利用这个位点,要求与ATG之间间隔5-13bp),其后的多克隆位点可装载要表达的目标基因。

(RBS位点:1974年Shine和Dalgarno首先发现,原核生物,在mRNA上有核糖体的结合位点,它们
是起始密码子AUG和一段位于AUG上游3~10 bp处的由 3—9bp组成的序列。

这段序列富含嘌呤核苷酸,刚好与16S rRNA 3,末端的富含嘧啶的序列互补,是核糖体RNA的识别与结合位点。

根据发现者的名字,命名为Shine-Dalgarno序列,简称S-D序列。

由于它正好与30S小亚基中的16s rRNA3’端一部分序列互补,因此S-D序列也叫做核糖体结合序列。

真核生物存在于真核生物mRNA的一段序列,其在翻译的起始中有重要作用。

加Kozark
sequence(GCCACC), Kozak sequence是用来增强真核基因的翻译效率的。

是最优化的ATG环境,避免ribosome出现leaky scan)
克隆载体目的在于复制足够多的目标质粒,所以常带有较强的自我复制元件,如复制起始位点等,往往
在菌体内存在多拷贝,所以抽质粒会抽出一大堆。

但不具备表达元件。

而表达质粒有复杂的构成,为的是控制目标蛋白的表达,如各种启动子(T7),调节子(LacZ)等,而且以pET为代表的表达载体在菌体内都是低拷贝的,防止渗漏表达。

克隆载体只是把你要的基因片段拿到就可以了,不管读码框什么的,但是表达载体是不但要你的目的基因连在上面,而且要表达蛋白,所以就要求你的读码框不能乱了,否则就不能得到你想到的表达产物。

1.载体即要把一个有用的基因(目的基因——研究或应用基因)通过基因工程手段送到生物细胞(受体细胞),需要运载工具(交通工具)携带外源基因进入受体细胞,这种运载工具就叫做载体(vector)。

2. 载体的分类
按功能分成:(1)克隆载体: 都有一个松弛的复制子,能带动外源基因,在宿主细胞中复制扩增。

它是
用来克隆和扩增DNA片段(基因)的载体。

(2)表达载体 :具有克隆载体的基本元件(ori,Ampr,Mcs等)还具有转录/翻译所必需的DNA顺序的载体。

按进入受体细胞类型分:(1)原核载体(2)真核载体(3)穿梭载体(sbuttle vector)指在两种宿主生物体内复制的载体分子,因而可以运载目的基因(穿梭往返两种生物之间).
克隆载体顾名思义就是质粒拷贝数比较高,在做上游克隆时比较方便, 其重点在于质粒的复制.
问题:
基因工程中有克隆载体和表达载体,克隆载体可以在受体菌中大量复制,表达载体用于表达目的蛋白,那么实际应用中,我们的最终目的是要得到目的蛋白,克隆载体不能完成表达,有何用呢?还是说利用克隆载体实现目的基因的大量复制后,再将其转移到表达载体中实现表达?它是否有何缺陷不能整合克隆载体的功能?构建兼有克隆和表达双重功能的载体有何困难?
1.克隆的目的比较单一,就是将你感兴趣的DNA片段,重组进入载体,然后于宿主细胞中大量繁殖,主要用于各种文库的建立,比如人类基因组计划;同时由于载体所能容纳的目的片段的长度是有限的,而克隆载体没有表达所需的各种片段,所以可以容纳更长的目的片段,即可以克隆足够长的基因,效率更高。

2.重组DNA需要使用限制性内切酶,因此待克隆的目的片段两端必需有其识别位点,现在的T/A克隆载体可以直接克隆PCR产物,省去了两端加装识别位点的设计,PCR效率就更高。

3.表达载体的目的是多样化的,为了实现实际工作中的需要,不同的目的就要设计不同的载体,用表达载体克隆基因不是不可以,实际工作中要考虑更多,因此更复杂。

4.细菌摄取能量的能力是一定的,如果用来合成大量蛋白质,合成核酸就会少。

5.细菌承受的工作负荷也是有限的,给它的工作太多,效率必然低下,这和我们日常生活是一个道理。

原因很简单,不是不能,是完全可以,但是效率会低很多。

所以我们一般的策略是,将目的片段克隆于非常简单的克隆载体上,按照需要再亚克隆于可以满足各种要求的表达载体上。

回答的不是很系统,如有问题可以继续来信讨论,希望对你有所帮助。

1)“T/A克隆载体可以直接克隆PCR产物,省去了两端加装识别位点的设计,PCR效率就
更高。

”是什么意思?
T/A克隆载体是PUC载体的线性化后两端加了T,而Taq酶有在PCR产物后随机加A的特性,所以PCR产物直接可以接入T载体。

而经典的克隆PCR产物需要限制性内切酶切割后接入载体,所以在设计PCR引物时两端要加酶的识别位点,而加装的序列与模板不配对,因此PCR效率会低很多。

2)克隆载体只是为了得到大量的目的基因,而现在多用PCR就可以达到这个目的。

那这
个目的基因的主要用途是什么?只用来测序吗?表达载体应该兼有克隆与表达的功能的吧?
嗯,基本是这个意思。

就测序不克隆也可以进行,克隆到载体的CMS中就在基因两端有了可供你选择的很多限制性酶切位点,方便亚克隆到各种表达载体上。

当然表达载体可以克隆,但是效率低于克隆载体。

一是因为表达载体不能直接克隆PCR产物,必须加装限制性酶切识别序列,上面已经讲过。

二是表达载体的选择相对克隆载体是更加严谨型的质粒,就是每个细菌里的拷贝数较低,能量守恒,细菌摄取能量的能力是一定的,用来合成蛋白质,核酸的合成必然受一定得限制。

3)我要构建一个基因的载体,
1.我可以将目的基因(1.3kb左右)和表达载体分别作酶切后连接吗?这几天将目的基
因做了一个T载体连接,可是不知道下一步怎么利用?
2.设计引物的时候用了sac1和hind111,做pcr的时候可以用pfu酶吗?pfu酶是必
须的吗?
3.我选择的表达载体上sac1和hind111的酶切位点只是相差两个碱基,做双酶切的时
候能切开吗?
1.如果你的目的基因已经在T载体上,当然可以分别酶切后连接,但是要注意方向。

2.如果是T载体连接PCR的引物可以不设计酶切位点。

T载体可以直接连接PCR产物源
于其末端错加的A,所以不能使用高保真的PFU。

但是你的扩增片段较长,如果用一般的TAQ酶,合成中可能会出错,用PFU准确度高,需要设计酶切位点。

如果PCR产物设计了酶切位点就可以直接克隆进需要的载体,不必借助T载体。

文献上有报道,按1:1的比例混合使用PFU和TAQ效果更好。

3.应该能切开,因为设计引物时保护碱基也就2到3个,但是最好稍微距离远一点。

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