PubMed统计分析
泉方本地PubMed检索平台简介
图形化显示
检索结果的图形化显示，如同一张画卷， 将文献根据出版时间和影响因子，显示在坐标 系中，方便查看各种文献。
知识图谱按钮:
知识图谱可以帮助用户分析某个研究领域内，各个研究方向从最早的一篇报道开始，到每年 关于这个研究方向的篇数等，系统把年份作为X轴坐标，篇数作为Y轴坐标，然后用线条在二维图 中连接起来形成一条曲线，从而辅助判断其研究的趋势。
系统推荐的期刊名单：
推荐度指的是用户输入的拟投稿论文的关键词在该刊的出现次数，根据文献计量学的原理，出 现的次数越多，说明该方面是该刊刊载的重点，比较适合作为拟投稿量学， 并提供期刊的科目、分区、影响因子以及中国人 发表的论文等。
循证医学临床参考数据库
本数据库是在PubMed的基础上，参考美 国国立医学图书馆运用PICO设计的检索模式开 发而成，支持PICO以及自然语言检索。
本地PubMed检索界面
继承PubMed检索语法，检索界面及检索结果 与PubMed基本一致，完全不改变用户使用PubMed 的习惯。每篇文献下面增加9个功能按钮，检索结果 右侧增加7项过滤和13项数据分析。
SCI查收按钮
SCI查收功能来源于各单位用户使用ESI 学科分析加载的数据、各单位的SCI论文榜以 及用户完善的数据等，仅供参考。
知识图谱设置按钮
主题词分类：将检索结果按学科分类，勾选某一学科，可以查看检索结果中关于某一学科的内容； 副主题词分类：副主题词是对主题词的修饰和限定，比如勾选“Therapeutic use”可以查看关于某种疾病的所有药物。 年份过滤：只显示勾选的年份的文献； 频次突变设置：突变就是突然变化，比如某个研究方向，在2005年时，发表了10篇，在2006年时发表了100篇，或 者在2010年时发表了100篇，在2011年时发表了10篇，对于这种突然暴增或暴减的情况，系统引入了突变率的设置， 用于方便的发现研究的暴发点。 高频词过滤：部分高频词，在研究中是众所周知的，勾选后可以忽略。
pubmed数据库
注：如果在上述4个表或索引中仍找不到相匹配的词时，PubMed就将短语
五、PubMed基本检索规则
如： single cell 系统会自动将其分成两个词：single和 cell检索，其检索表达式为：“single AND cell ”。
五、PubMed基本检索规则
强制检索功能
• 强迫短语检索，在检索词上加双引号，将不执行自 动转换匹配和扩展检索.
收录PubMed中未经标引的最新记录。经过主题 词、文献类型、基因库存取号等加工索引后，添加到 Medline数据库中，并从PreMedline库中删除。
[PubMed-in process]
Publisher-Supplied Citations
出版商直接提供的文献，每条记录都标有 [PubMed-as supplied by publisher]。
二、Entrez资源整合系统
Entrez是NCBI为广大生物研究人员提供的一个 基于文本的集成检索系统。通过该平台可以检 索到NCBI提供的28个数据库，这些数据库包括 文献数据库、DNA和蛋白质序列数据库、三维 蛋白质结构数据库、种群研究库、表达库、完 全人类基因组库、分类信息等。
二、Entrez资源整合系统
主题检索
• 《医学主题词表》是对生物医学文献进行主题分析、 标引和检索的权威性词表，它的作用是使医学文献的 主题标引和检索达到统一和一致，并指导用户高质量 地检索医学文献。它可以指导用户从同义词发现主题 词，告诉用户主题词如何使用，显示主题词之间的相 互关系。
基本概念
• 主题词表：PubMed采用的主题词表是美国国立 医学图书馆的医学主题词表(Medical Subject Headings，简称MeSH) 。 • MeSH ：是美国国立医学图书馆编制的权威性主题 词表。它是一部规范化的可扩充的动态性叙词表。 美国国立医学图书馆以它作为生物医学标引的依据， 编制《医学索引》（Index Medicus）及建立计算 机文献联机检索系统MEDLINE数据库。《MeSH》汇 集约24，357多个医学主题词(2007年)。
PubMed
２ ． １ 按上述镇 痛效果 的评价标 准分 别对两组患 者术后镇痛效果进行评分 ，并
比较无痛及轻度痛病例数 （ 见表 １ ） 。
％、 表 １ 两组术后镇痛效果 比较ｆ ｎ ． ，
等阿片类药物为主 ， 镇痛作用强 ， 但头晕 、 恶心 、呕吐及排尿 困难 等不良反应发 生率高 ， 尤其是易于发生过度镇痛和呼吸抑制 。 疼痛 是影响胸外科 术后 患者舒适 度的主要因素… 。疼痛不仅 可以导致 患者 心动过速 、心律失常 、恶心等，还可 引 起机体蛋 白质合成缓慢 ，分解加速 ，不利于伤 口愈合 。采用硬膜外 导管泵持续 镇痛不但镇痛效果好 ， 还可有效减少各种并发症 的发生 。 硬膜外 自控镇痛（ Ｐ Ｃ Ｅ Ａ ） 技术是现代镇痛治疗的最佳方式 ，也是临床疼痛治疗的主要手段之一 ，与肌 肉 注射镇痛药相 比， Ｐ Ｃ Ｅ Ａ具有镇痛效果可靠 、使用方法简便 ， 对 全身影响相对 较 小的特点 ， 还可根据身体对止痛 的不 同需求而灵活用药 。 近年来 Ｐ Ｃ Ｅ Ａ在国内Ｊ 临 床上使用较广泛并且取得了理想的镇痛效果。 术后应用 Ｐ Ｃ Ｅ Ａ泵 可以使病人减 轻疼痛 ， 有助于术后康复 ， 维持生理功能平 稳 ，降低并发症的发生率 ，具有较好的优越性 ，但必 须在医护人 员的监护下使 用 ，做到正确使用 、观察准确 、护理到位 、处理及时 ，把不安全因素降到最低 ， 提高安全性和有效性 ， 从而保证病人真正无痛苦康复 。 应 注意 以下方 面的护理 ： （ １ ） 术前 护理。术前 患者多具有焦虑 和恐惧情绪 。焦 虑使患者 意志力下降 ，疼 痛 阈值降低 ，因此 ，术前应耐心 向患者解释 ，术后应用 Ｐ Ｃ Ｅ Ａ的优点及重要性 ， 消除患者的焦虑 、 恐惧 心理， 以更好地配合使用 Ｐ Ｃ Ｅ Ａ治疗 。（ ２ ） 术 中护理。 保持手术室 内的温度适宜 ， 热情接待 ， 尽量消除其 紧张 、 恐惧心理 。术中保证 患 者 的体位舒适 ， 并时常询 问患者舒适与否并及时调整 。 （ ３ ） 术后护理 。加强各 种 连接管道 的定时检查 ， 妥善 固定引流管 ，防止 因管道牵拉 、 移 动引起 的疼痛 。确 保Ｐ Ｃ Ｅ Ａ泵连接正确及畅通 ， 防止各种原因致药物不能泵人导致 疼痛 控制不稳 定 的发生 。 嘱咐患者翻身 、 更衣、下床等时要小心保 护连接管道及 接 口， 将Ｐ Ｃ Ｅ Ａ 泵夹在衣服上 ，防止连接管道滑脱或扭曲 。 我们通过观察食管癌术后采用 Ｐ Ｃ Ｅ Ａ泵的镇痛效果 、 肺部感染 、 肠道功能恢 复 时间及平均住 院时 间与对照组进行 比较 ， 从而探讨 Ｐ Ｃ Ｅ Ａ在食管癌术后镇痛护 理 中的应用价值 。 通过以上临床观察对比发现 ， 食管癌术后应用 Ｐ Ｃ Ｅ Ａ泵能显著 提 高镇 痛效果 （ Ｐ ＜ Ｏ ． ０ １ ） ，降低肺部感染 的发生率 （ Ｐ ＜ Ｏ ． Ｏ １ ） ， 利 于患者康 复，缩短患 者住 院时间（ Ｐ ＜ ０ ． ０ ５ ） 。此外 ，应用 Ｐ Ｃ Ｅ Ａ泵的患者术后初次肛门排气时间与未用 Ｐ Ｃ Ｅ Ａ 泵患者相 比并无 显著性差 异 （ Ｐ ＞ ０ ． ０ ５ ） 。因此 ，Ｐ Ｃ Ｅ Ａ 泵用于食管癌术后 的镇 痛护理是安全 、有效 的，值得 临床广泛推广 。
6.数据库检索外文 Pubmed医学专业研究生必看
3、关键词与主题词检索
Pubmed的关键词检 索有何特别？ 有了Pubmed的特色 功能还要主题词检索 作什么？
为什么还要强调主 题词检索？
2
3 4
只要用主题词 检索就足够了 吗？
1
(1)为什么还要强调主题词检索？
• 主题词是在关键词的基础上经过规范化处理的，就是在文 献存储时，对文献中的同义词、近义词、多义词等进行严 格的控制与规范，使得同一主题概论的文献相对集中在一 个主题词之下。
• Publisher-Supplied
出版商提供的电子文献题录，每条记录标有:
[PubMed-as supplied by publisher]，分为两类： – MEDLINE 收录，逐步转为In Process, Indexed状态。 – Not MEDLINE：PubMed 收录，MEDLINE不收录， 一直标注[PubMed-as supplied by publisher]或 [PubMed]
检索键
只查重点论述的文献
系统自动扩展检索下位词， 勾选后不检索下位词
(4)只要用主题词检索就足够了吗
• 不是每个词都有对应的主题词 • 没有主题标引的文献不可以用主题词检索 ----如何识别主题标引的文献 策略：根据实际需求选择，最好的是使用主 题词与关键词相结合
4、值得推荐的功能与资源
1. 2.
特点
• • • • • • • • 资源免费 收录广泛 更新迅速 数据权威 检索方便 检索结果精准 个性化定制功能丰富 外部分析工具功能强大
是目前使用最广泛、影响力最大的生物医学信息资源检索系统。
• MEDLINE Indexed
1966 to prensent的MEDLINE已标引数据， 有MeSH字段和摘要，每条记录标有： [PubMed-indexed for MEDLINE]
倾向匹配(PSM)分析：观察性研究的统计学利器 - 预防医学讨论版 -丁香园论坛
rinyxa科室保密何为PSM分析呢？这个问题需要先从临床研究的类型说起。
众所周知，临床研究分为干预性研究和观察性研究。
干预性研究的论证强度是高于观察性研究的，原因就在于干预性研究可以通过“随机分配”的方式平衡混杂因素。
比如研究一种药物治疗抑郁症的疗效，研究者在招募了一些抑郁症患者后，将其随机分为实验组和对照组，实验组接受药物治疗，对照组接受安慰剂治疗。
经过治疗一段时间后，如果两组患者的预后不同，则我们可以认为这种“预后”上的差异完全是有治疗措施的差异引起的（实际上，我认为这句话值得商榷！），因为从理论上讲，实验组和对照组的临床特征是相同的，或者说具有可比性的。
正因我的丁香客精品栏目找人随便看看更多版内搜索此时，如果贫血组和非贫血组患者在三年缺血时间发生风险上存在差异，则就可以将原因归结为贫血，因为两组患者其他特征都是相同的。
关于PSM的统计学原理，笔者在此以JTD这篇文章为例进行一简要介绍。
其基本流程为：首先将患者分为贫血患者非贫血患者，然后采用logistic回归，以贫血与否作为应变量（Y），以其他所有已知的临床特征（比如BMI、NYHA分级、高血压等）作为自变量（X），计算出每个患者的“贫血概率”。
这个贫血概率实际上就是PSM最核心的内容之一。
然后，根据贫血概率，将实验组和对照组进行匹配。
比如，贫血组一个患者的贫血概率为0.361，那么就在非贫血患者sunnymilanhuang入门站友黄春雨入门站友htelyon 入门站友影灯麻醉科李珂薇ake 入门站友。
肿瘤学研究常用实验技术及方法
精心整理肿瘤学研究常用实验技术及方法复习题1.表观遗传的科学内涵三个特点？a)基因功能完全、稳定地丧失，有遗传性；b)细胞外环境长期作用的结果，有可逆性；c)分析方法灵敏，可检出少数细胞的变化2.DHPLC3.i.ii.梯度中iii.SDS-iv.1.丙烯酰胺有神经毒性，可经皮肤、呼吸道等吸收，故操作时一定要注意防护。
2.制备聚丙烯酰胺凝胶时，小心防止凝胶渗漏。
3.蛋白加样量要合适，加样量太小，条带不清晰，加样量太大，则泳道超载，条带过宽而重叠，甚至覆盖至相邻泳道。
4.对多种蛋白质而言，电流大则电泳条带清晰，但电流过大，玻璃板会因受热而破裂，故适合的电流为玻璃板微热。
5.胶转膜后应在膜上标记好正反面及电泳方向。
6.电转移时应注意勿将滤膜和胶的位置放反，而且滤纸、滤膜和胶应等大，以免短路。
4.组织培养/基因的克隆、转化与表达i.请列举至少3种流式细胞仪的用途?1.定量检测细胞膜、细胞质和细胞核中的各种细胞成分2.研究细胞的各种功能状态(细胞增殖，细胞凋亡、细胞分化、酶活性、细胞膜通透性、氧化还原状态、吞噬性等)。
3.定量检测血清中的各种可溶性生物分子成分临床中应用：1.白血病和淋巴瘤的免疫分型1.2.3.细胞磷酸酶（phosphatase）激酶（Kinase）连接酶（Ligase）5.生物质谱简介生物质谱在蛋白组学中的应用？1.ProteinsMWmeasurements；2.ProteinIdentification；(ID)3.Peptideandproteinprofiling；4.ImagingMS；5.ProteinPTMs；5.ProteinQuantification6.《常用电泳技术基本原理及应用》课程复习题i.简述形成不连续PAGE电泳的样品浓缩效应的4个不连续性。
1.凝胶的不连续性-浓缩胶4%大孔径，分离胶-20%小孔径2.缓冲离子的不连续性-浓缩胶αCl->α蛋>αGly;mclαCl->m蛋α蛋>mGlyαGly；分离胶αCl->αGly>α蛋;mclαCl->mGlyαGly>m蛋α蛋3.PH的不连续性电极缓冲液PH8.3;浓缩胶PH6.7；分离胶PH8.94.电位梯度的不连续性浓缩胶-较高的电位梯度；分离胶-均一电位梯度ii.双向电泳的定义并简述以细胞为样本做双向电泳的实验步骤。
文献检索 第四课 Pubmed
温州医科大学图书馆
林薇
Contents
初识PubMed PubMed基本检索 PubMed高级检索 PubMed主题词检索 PubMed期刊检索 PubMed检索结果处理
初识 PubMed
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/pubmed
Pubmed基本检索
一、Pubmed检索系统
（三）Pubmed基本检索 基本检索
Pubmed基本检索
一、 Pubmed的检索规则
1.
逻辑运算符: AND OR NOT
AND diabetes therapy NOT nifedipine
将检索出同时包含阿司匹林和糖尿病两个检索词的文献。
/美国国立卫生研究院
/美国国立医学图书馆
/国家生物技术信息中心
Entrez资源整合系统
NCBI资源整合系统，基于Web界面的综合生物信 息数据库，可实现跨库检索，包括
GenBank和Nucletide (2) Genoma (3) OMIM (4) Protein (5) Structure (6) Pubmed (7) PMC
(1)
初识Pubmed
一、Pubmed检索系统
（一）Pubmed收藏范围：
(1)
（P46）
Medline:标注为[Pubmed-indexed for Medline] (2) OldMedline:标注为[Pubmed-OldMedline] (3) In Progress Citations:标注为[Pubmed-in Process] (4) Publisher Supplied Citation:标注为[Pubmed-as supplied by Publisher]
PubMedPlus全面检索与聚类系统
二、Pubmedplus之课题辅助分析
年份聚类： ---文献发表的年代分布 ---为分析趋势提供依据
机构聚类：发现高产出机构，利于机构合作
机构聚类： ---发现该领域高产出的研究机构 ---有利于机构间的合作 ---发现深造的研究机构
期刊聚类：查找该领域的核心期刊
期刊聚类： ---发现该领域的核心期刊 ---为文献投稿选择合适期刊提供 依据
非小细胞肺癌对酪氨酸激酶治疗耐药后的进一步治疗方案
非小细胞肺癌对酪氨酸激酶治疗耐药后的进一步治疗方案
非小细胞肺癌对酪氨酸激酶治疗耐药后的进一步治疗方案
非小细胞肺癌对酪氨酸激酶治疗耐药后的进一步治疗方案
非小细胞肺癌对酪氨酸激酶治疗耐药后的进一步治疗方案
各个关键词再组配上相应的主题，最后的检索式 ("tyrosine kinase inhibitor"[tiab] OR "tyrosine kinase inhibitors"[tiab] OR "gefitinib"[tiab] OR "protein tyrosine kinase inhibitor"[tiab] OR "erlotinib"[tiab]) AND ("non small cell lung cancer"[tiab] OR "nsclc"[tiab] OR "squamous cell carcinoma"[tiab] OR "non small cell lung carcinoma"[tiab] OR "adenocarcinomas"[tiab] OR "lung adenocarcinoma"[tiab] OR "squamous cell carcinomas"[tiab]) AND ("drug resistance"[mesh]) AND (treatment[tiab] OR "methods"[tiab])