计算copy数
质粒拷贝数的测定方法

生物技术通讯LETTERS IN BIOTECHNOLOGY1999年 第10卷 第1期 Vol 10 No.1 1999质粒拷贝数的测定方法周 涛摘要 在研究生物工程重组蛋白产量的过程中,质粒的拷贝数是一个需要重点考虑的参数,对它进行精确定量至关重要。
本文概述了几种主要的测定方法的原理和特点。
关键词 质粒拷贝数;测定方法Determination methods of plasmid copy numberZhou Tao(Institute of Biotechnology, Beijing,100071)Abstract Plasmid copy number, the number of expression vectors in each cell, is a key parameter in the study of productivity of recombinantmicroorganisms. Recognition of the importance of this parameter has givenrise to a number of methods for its determination. this article focuses on the principles and charactistics of these methods.Key words plasmid copy number; determination method细菌质粒是双链、闭环的DNA分子,是独立于细菌染色体之外进行复制和遗传的辅助性遗传单位。
质粒在一般情况下对宿主细胞的生存不是必需的,但质粒含有某些基因,可以补充细菌基因的不足,有利于细菌的生存。
质粒DNA的复制要由复制细菌染色体的多种酶共同完成,在宿主中复制的程度差异很大。
质粒拷贝数指的是每个细胞中所含的质粒的个数。
低拷贝数的质粒DNA在宿主细胞分裂前只能复制1~2次,而多拷贝数质粒可以在细胞分裂前复制成10~200拷贝。
线粒体拷贝数 计算公式

线粒体拷贝数计算公式全文共四篇示例,供读者参考第一篇示例:线粒体是细胞中的一个重要细胞器,主要功能是产生细胞所需的能量。
线粒体内含有自己的DNA,与细胞核的DNA不同。
线粒体的DNA含有一些特殊的序列,可以用来计算细胞内线粒体的拷贝数。
线粒体拷贝数的计算可以帮助我们更好地了解细胞的代谢状态,以及细胞的功能活动。
在本文中,我们将介绍线粒体拷贝数的计算公式及其应用。
线粒体拷贝数的计算公式是基于线粒体DNA(mtDNA)的拷贝数和细胞总DNA的拷贝数之间的比值。
线粒体DNA的拷贝数通常通过PCR(聚合酶链反应)或实时荧光定量PCR来测量,而细胞总DNA的拷贝数则可以通过组织检测或细胞计数来确定。
线粒体拷贝数的计算公式如下:线粒体拷贝数= mtDNA拷贝数÷ 细胞总DNA拷贝数线粒体拷贝数的计算既可以用于单个细胞的研究,也可以用于整个组织或器官的研究。
通过测量线粒体拷贝数,我们可以了解细胞内线粒体的数量变化,预测细胞的代谢活动及能量需求。
线粒体拷贝数的变化与许多疾病的发生和发展有密切关系,如糖尿病、心脏病等。
线粒体拷贝数的计算对于研究疾病的发病机制及治疗方法具有重要的意义。
线粒体拷贝数的计算还可以用于研究不同细胞类型之间的线粒体数量差异。
在心肌细胞中线粒体拷贝数往往较高,因其需要大量能量来维持心肌的收缩功能。
而在肝细胞中,线粒体拷贝数也相对较高,因为肝细胞负责代谢和解毒。
不同细胞类型之间的线粒体拷贝数差异反映了细胞的功能特异性和代谢活动。
除了在生理学和疾病研究中的应用,线粒体拷贝数的计算还可以用于评估环境压力对生物体的影响。
环境因素如UV辐射、氧化压力等都可以影响线粒体的数量和功能,导致细胞代谢紊乱和细胞损伤。
通过测量线粒体拷贝数的变化,我们可以评估环境因素对细胞的影响,为环境保护和生物安全提供科学依据。
第二篇示例:线粒体是细胞内的一种细胞器,其主要功能是产生能量。
线粒体内含有自己的DNA,与细胞核DNA不同。
DNA拷贝数的计算方法

DNA拷贝数的计算方法1 A260 吸光度值= ds DNA 50 ug/ml= ss DNA 33 ug/ml= ss RNA 40 ug/ml核酸浓度=(OD260)×(dilution factor)×(33/40/50)= ng/ul平均分子量(MW)代表克/摩尔,单位道尔顿(dolton),即1dolton=1g/mol1摩尔=6.02×1023平均分子量(MW):dsDNA=(碱基数) x (660 道尔顿/碱基)ssDNA=(碱基数) x (330 道尔顿/碱基)ssRNA=(碱基数) x (340 道尔顿/碱基)拷贝数计算公式:(6.02 x 1023次拷贝数/摩尔) x (浓度g/ml) / (MW g/mol) = copies/ml.(6.02 x 1023次拷贝数/摩尔) x (浓度g/ml) / (DNA长度×660) = copies/ml.(6.02 x 1023次拷贝数/摩尔) x (ng/ul×10-9) / (DNA长度×660) = copies/ul.例:3000 碱基质粒,浓度100 ng/ml ,MW = 3000 bp x 660 dalton/bp = 1.98 x 106 daltons,1 mol = 1.98 x 106g.(6.02 x 10的23次拷贝数/摩尔) x (1x10的-7次克/微升) / (1.98 x 10的6次克/摩尔) = 3 x 1010次copies/ml.梯度配制方法:低浓度使用胎盘DNA 20ng/ul;高浓度使用灭菌水配制,20ng 基因组DNA所包含的拷贝数:6.02×3 x 1023 x20ng/2.91 x109 x660=6289个拷贝数。
拷贝数换算

拷贝数换算小鼠基因组大小约为6×109Bp,则相对分子质量(MW)=6×109 Bp×660 Dalton1拷贝小鼠基因组的质量=MW/阿伏伽德罗常数≈6.6×10-12 g 取400 ng野生型基因组DNA,按照以下公式计算对应的1细胞1拷贝质粒DNA的量,将两者混合作为PCR模板:W=[400×10-9/(6.6×10-12 g)]×[L×660/阿伏伽德罗常数]W:质量,g; L:质粒大小,bpC0500 的大小为5.9 Kb,取400 ng野生型基因组DNA做模板,对应的1细胞0.2拷贝的C0500质粒模板量为0.078 pg对应的1细胞1拷贝的C0500质粒模板量为0.392 pg对应的1细胞5拷贝的C0500质粒模板量为1.96 pg对应的1细胞25拷贝的C0500质粒模板量为9.80 pgC0560的大小为6 Kb,取400 ng野生型基因组DNA做模板,对应的1细胞0.2拷贝的C0560质粒模板量为0.08 pg对应的1细胞1拷贝的C0560质粒模板量为0.399 pg对应的1细胞5拷贝的C0560质粒模板量为1.995 pg对应的1细胞25拷贝的C0560质粒模板量为9.975 pgC0618的大小为9.3 Kb,取400 ng野生型基因组DNA做模板,对应的1细胞0.2拷贝的C0618质粒模板量为0.124 pg对应的1细胞1拷贝的C0618质粒模板量为0.618 pg对应的1细胞5拷贝的C0618质粒模板量为3.09pg对应的1细胞25拷贝的C0618质粒模板量为15.45 pgC0637的大小为7Kb,取400 ng野生型基因组DNA做模板,对应的1细胞0.2拷贝的C0637质粒模板量为0.093pg对应的1细胞1拷贝的C0637质粒模板量为0.465pg对应的1细胞5拷贝的C0637质粒模板量为2.325pg对应的1细胞25拷贝的C0637质粒模板量为11.625pgC0710的大小为3.8 Kb, 取400 ng野生型基因组DNA做模板,对应的1细胞0.2拷贝的C0710质粒模板量为0.05pg对应的1细胞1拷贝的C0710质粒模板量为0.252pg对应的1细胞5拷贝的C0710质粒模板量为1.26pg对应的1细胞25拷贝的C0710质粒模板量为6.3pgC0500 的大小为5.9 Kb,取100 ng野生型基因组DNA做模板,对应的1细胞0.2拷贝的C0500质粒模板量为0.0195pg对应的1细胞1拷贝的C0500质粒模板量为0.0975 pg对应的1细胞5拷贝的C0500质粒模板量为0.4875pg对应的1细胞25拷贝的C0500质粒模板量为2.4375 pgC0560的大小为6 Kb,取100 ng野生型基因组DNA做模板,对应的1细胞0.2拷贝的C0560质粒模板量为0.02 pg对应的1细胞1拷贝的C0560质粒模板量为0.1 pg对应的1细胞5拷贝的C0560质粒模板量为0.5 pg对应的1细胞25拷贝的C0560质粒模板量为2.5 pgC0618的大小为9.3 Kb,取100 ng野生型基因组DNA做模板,对应的1细胞0.2拷贝的C0618质粒模板量为0.031pg对应的1细胞1拷贝的C0618质粒模板量为0.155 pg对应的1细胞5拷贝的C0618质粒模板量为0.775pg对应的1细胞25拷贝的C0618质粒模板量为3.875pgC0637的大小为7Kb,取100 ng野生型基因组DNA做模板,对应的1细胞0.2拷贝的C0637质粒模板量为0.023pg对应的1细胞1拷贝的C0637质粒模板量为0.116pg对应的1细胞5拷贝的C0637质粒模板量为0.581pg对应的1细胞25拷贝的C0637质粒模板量为2.91pgC0710的大小为3.8 Kb, 取100 ng野生型基因组DNA做模板,对应的1细胞0.2拷贝的C0710质粒模板量为0.0125pg 对应的1细胞1拷贝的C0710质粒模板量为0.0625pg对应的1细胞5拷贝的C0710质粒模板量为0.3125pg对应的1细胞25拷贝的C0710质粒模板量为1.5625pgC0720的大小为4.8Kb,取400 ng野生型基因组DNA做模板,对应的1细胞0.2拷贝的C0720质粒模板量为0.0638pg 对应的1细胞1拷贝的C0720质粒模板量为0.319pg 对应的1细胞5拷贝的C0720质粒模板量为1.595pg 对应的1细胞25拷贝的C0720质粒模板量为7.97pg。
copy的用法

copy的⽤法copy的⽤法copy分为深copy和浅copy1 浅copy⽰例data = {"name":"alex","age":18,"scores":{"语⽂":130,"数学":60,"英语":98,}}d2 = data.copy()data["age"] = 20data["scores"]["数学"] = 77print(d2)print(data)输出{'name': 'alex', 'age': 18, 'scores': {'语⽂': 130, '数学': 77, '英语': 98}}{'name': 'alex', 'age': 20, 'scores': {'语⽂': 130, '数学': 77, '英语': 98}}分析发现d2(复制项)输出age与原函数相等,并没有执⾏data["age"] = 20d2(复制项)与data(原项)均输出'数学': 77,表明均执⾏data["scores"]["数学"] = 77原因.copy()只复制了"scores"以上部分,在"scores"⾥仍与原函数相同(同改变)结论浅copy会仅复制dict的第⼀层数据,更深层的scores下⾯的值依然是共享⼀份2 深copy⽰例import copydata = {"name":"alex","age":18,"scores":{"语⽂":130,"数学":60,"英语":98,}}d2 = copy.deepcopy(data)data["age"] = 20data["scores"]["数学"] = 77print(d2)print(data)输出{'name': 'alex', 'age': 18, 'scores': {'语⽂': 130, '数学': 60, '英语': 98}}{'name': 'alex', 'age': 20, 'scores': {'语⽂': 130, '数学': 77, '英语': 98}}结论深copy需要调⽤copy类深copy可以复制所有的数据调⽤格式import copyd2 = copy.deepcopy(data)。
书脊计算公式

书脊计算公式书脊指书的厚度,最准确的计算方法是:A、(P数÷2)×0.001346 ×纸张克数= 书脊P数:指同种纸张总页数,通常一张A4纸为2P,设计公司计算P数是按210mmX285mm,计算,即大度16开计算。
无论多大开度的书,计算书脊时P数就是计算同种纸共多少页,如有不同纸,再计算其他纸的厚度,最后相加得书总厚度。
如:一本书:内页80g书写纸共240P,中间有16P157g双铜,求书脊?书写纸厚度:240÷2×0.001346×80=12.92mm铜榜纸厚度:16÷2×0.001346×157=1.69mm书总厚度(书脊):12.92mm+1.69mm=14.61mmB、(P数÷2)×内页所用纸的厚度=书脊内页所用纸的厚度即是通常所说的128g、157g等。
C、0.135 X 克数/ 100 X 页数=书脊厚度此公式适用于低克重的(128g以下)如果想要精确计算书脊,可以用纸张厚度X页数我们公司采用的是比较合理的公式:克重除以1800再乘以总页码数然后再加上1.5mm就可以了!!书的页数除100再乘参数参数50克:3.5 60克:3.8 70克:4.0印刷厂专业书脊计算公式0.135 X 克数/ 100 X 页数(特别注意:是页数不是码数)= 书脊厚度(单位是MM)补充一下:克数就是纸张的重量,如128g铜版、157g铜版、60g胶版,其中的数字就是克数以下是各种常用纸张的厚度:200g/m2 1号白卡纸0.250230g/m2 1号白卡纸0.288250g/m2 1号白卡纸0.313200g/m2 2号白卡纸0.267230g/m2 2号白卡纸0.307250g/m2 2号白卡纸0.333200g/m2 特号白卡纸0.235230g/m2 特号白卡纸0.271250g/m2 特号白卡纸0.29490g/m2 (单双面胶)特号铜版纸0.072100g/m2 (单双面胶)特号铜版纸0.080120g/m2 (单双面胶)特号铜版纸0.096150g/m2 (单双面胶)特号铜版纸0.120180g/m2 (单双面胶)特号铜版纸0.144250g/m2 (单双面胶)特号铜版纸0.20090g/m2 (单双面胶)1号铜版纸0.069100g/m2 (单双面胶)1号铜版纸0.077120g/m2 (单双面胶)1号铜版纸0.092150g/m2 (单双面胶)1号铜版纸0.115180g/m2 (单双面胶)1号铜版纸0.138250g/m2 (单双面胶)1号铜版纸0.19290g/m2 (单双面胶)2号铜版纸0.067100g/m2 (单双面胶)2号铜版纸0.074120g/m2 (单双面胶)2号铜版纸0.089150g/m2 (单双面胶)2号铜版纸0.11190g/m2 (单双面胶)特号铜版纸0.075100g/m2 (单双面胶)特号铜版纸0.083120g/m2 (单双面胶)特号铜版纸0.100150g/m2 (单双面胶)特号铜版纸0.125180g/m2 (单双面胶)特号铜版纸0.150250g/m2 (单双面胶)特号铜版纸0.20890g/m2 (单双面胶)1号铜版纸0.074100g/m2 (单双面胶)1号铜版纸0.082120g/m2 (单双面胶)1号铜版纸0.098150g/m2 (单双面胶)1号铜版纸0.123180g/m2 (单双面胶)1号铜版纸0.148250g/m2 (单双面胶)1号铜版纸0.20590g/m2 (单双面胶)2号铜版纸0.072100g/m2 (单双面胶)2号铜版纸0.080120g/m2 (单双面胶)2号铜版纸0.096150g/m2 (单双面胶)2号铜版纸0.120以下是在网上看到的:1.胶装书脊位书脊位=(内页P数/2)*内页所用纸张厚度2.精装书脊位书脊位=书心厚度+(纸板厚度*2)3.护封的计算护封的计算=精装书脊位+(勒口*2)+(书宽*2)+(出血*2)4.精装书壳皮壳面料的计算长= 书心(长度)*2+压槽位(11MM*2)+飘口(3MM*2)+(板纸厚度*2)+(色边位(最少15MM*2)+精装书脊位高= 书心(高度)+色边位(最少15MM*2)+(板纸厚度*2)+飘口(3MM*2)精装(飘口3MM)里边7MM 包口20MM-30MM 出血6MM二胶版纸系数:1.2~1.35~1.4轻型纸系数:1.7~1.75书脊厚度=页码/2×纸系数×纸克重(80g:0.08)(以下来自相关同行朋友的算法总结)有脊(扒圆,起脊)D=[130°×π×(书厚+2纸板厚)/2]/180°无脊(只扒圆,不起脊)D=(130°×π×书厚/2)/180°书脊指书的厚度,最准确的计算方法是:P数除以2乘以0.001346乘以纸张克数=书脊P数:指同种纸张总页数,通常一张A4纸为2P,设计公司计算P数是按210mmX285mm,计算,即大度16开计算。
copy方法参数

copy方法参数Copy方法参数解析与使用一、概述在编程中,我们经常会使用到copy方法来实现数据的复制。
copy 方法是一种常用的数据复制技术,它能够将一个变量的值复制给另一个变量,从而实现数据的拷贝。
本篇文章将从不同的角度解析copy方法的使用,以帮助读者更好地理解和运用该方法。
二、浅拷贝与深拷贝copy方法有两种常见的使用方式,即浅拷贝和深拷贝。
浅拷贝是指当我们拷贝一个变量时,只拷贝了变量的引用而不是实际的值。
这意味着,如果原变量的值发生改变,拷贝后的变量也会随之改变。
深拷贝则是指变量的值被完全复制,拷贝后的变量与原变量互不影响。
在使用copy方法时,我们可以根据具体需求选择浅拷贝或深拷贝。
三、copy方法的基本语法copy方法的基本语法如下:```new_variable = old_variable.copy()```其中,new_variable是我们要创建的新变量,old_variable是我们要拷贝的原变量。
在使用copy方法时,我们需要注意,只有可变对象才能进行拷贝,不可变对象无法进行拷贝操作。
四、copy方法的实际应用1. 列表拷贝列表是一种常见的可变对象,使用copy方法可以方便地实现列表的拷贝。
例如,我们有一个列表a,我们想要将其拷贝给列表b,可以使用以下代码:```a = [1, 2, 3]b = a.copy()```这样,b就成为了a的一个副本,对b的修改不会影响到a。
2. 字典拷贝字典也是一种常见的可变对象,使用copy方法可以实现字典的拷贝。
例如,我们有一个字典dict_a,我们想要将其拷贝给字典dict_b,可以使用以下代码:```dict_a = {'name': 'Tom', 'age': 18}dict_b = dict_a.copy()```这样,dict_b就成为了dict_a的一个副本,对dict_b的修改不会影响到dict_a。
copy 函数

copy 函数Copy函数是一种在编程中常用的函数,它的作用是将一个变量的值复制到另一个变量中。
在本文中,我们将详细介绍Copy函数的使用方法和注意事项。
一、Copy函数的基本语法在大多数编程语言中,Copy函数的基本语法如下:Copy(目标变量, 源变量)其中,目标变量是要复制到的变量,源变量是要复制的变量。
通过这个语法,我们可以将源变量的值复制到目标变量中。
二、Copy函数的使用场景Copy函数在编程中有多种使用场景,其中最常见的是在处理字符串时。
比如,我们可以使用Copy函数将一个字符串复制到另一个字符串变量中,方便后续对复制的字符串进行操作。
Copy函数还可以用于复制整数、浮点数、布尔值等基本数据类型的变量。
通过Copy函数,我们可以在不改变源变量的情况下,创建一个新的变量,从而方便地进行一些计算和处理。
三、Copy函数的注意事项1. 在使用Copy函数时,需要注意目标变量和源变量的数据类型应该一致。
如果数据类型不一致,可能会导致复制失败或产生错误的结果。
2. 在复制字符串时,需要确保目标变量有足够的空间来存储复制的字符串。
如果目标变量空间不足,可能会导致复制失败或截断字符串。
3. 在某些编程语言中,Copy函数可能会有性能上的影响。
因此,在需要频繁复制变量的情况下,应该考虑使用其他更高效的方法。
四、Copy函数的实例演示下面我们通过一个实例来演示Copy函数的使用方法。
假设我们有两个字符串变量,分别为source和target,我们想要将source复制到target中。
代码如下所示:```pythonsource = "Hello, World!"target = ""Copy(target, source)print(target)```运行上述代码,我们可以得到输出结果为"Hello, World!",即成功将source复制到了target中。
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做 qRT-PCR 的时候经常需要计算 DNA 拷贝数(Copy Number),比较烦,用下面的方法这就方便多了。
其实计算方法是相通的,只不过一个是带有分步推理过程,一个是直接计算而已!
一、分步推理如何计算核酸拷贝数
1A260吸光度值=dsDNA 50ug/ml=ssDNA 33ug/ml=ssRNA 40ug/ml
核酸浓度=(OD260)×稀释倍数×(33 或 40 或 50)=ng/ul
MW 代表克/摩尔,单位 dolton :1dolton 即表示 1g/mol 1 摩尔=6.02×1023摩尔分子(拷贝数)
平均分子量(MW):dsDNA=碱基数×660 道尔顿/碱基
ssDNA=碱基数×330 道尔顿/碱基
ssRNA=碱基数×340 道尔顿/碱基
得到拷贝数计算公式:
mL
mol g MW mL g mol mol copies /copies //)/copies 1002.6)/(1002.62323=⨯
⨯=⨯⨯)
()浓度((摩尔数 即(6.02×1023)×(g/ml)/(DNA length×660)=copies/ml.
或(6.02×1023)×(ng/ul×10-9)/(DNA length×660)=copies/ul.
例:3000 碱基质粒,浓度 100 ng/ul
MW=3000bp×660dalton/bp=1.98×106daltonS=1.98×106g/mol ,即
1mol=(100ng×10-9)g/1.98×106=摩尔数
copy 数=摩尔数×6.02×1023=3×1010copies/ul.。