分子生物学常用基本词汇表
A
英文名词中文名词解释
A （ Adenine）腺嘌呤作为碱基的两种嘌呤中的一种。active site活化位点蛋白质三维表面催化作用发生的区域。
alignment比对为了确定两个同源核酸或蛋白质序列的累计差异而进行的配对称为比对。
alignment of
比对的比对即比对的对象不是简单的序列，而是序列
alignments的比对。alleles等位基因一个基因的不同版本。
alpha carbonα 碳在氨基酸中与侧链（ R- 基团）相连的中
心碳原子。
alternative
可变剪接从一个单独的 hnRNA 生成两个或多个
splicing mRNA分子的过程。
amino terminus
氨基端（ N 端）在一个多肽中，具有自由氨基的分子端，
(N-terminal)对应于基因的 5'-端。
表示相反的方向；在双链 DNA中，这意味anti-parallel反向平行着如果一条链是 5'到 3'的，则其互补
链方向是3'到 5'的。
B
（ 1）在双链 DNA中嘌呤和嘧啶之间的
相
base pair碱基对互作用（特别指 A 和 T 之间， G和 C之间）；（2）双链 DNA序列长度的基本单
位。
在反向平行的β 折叠片中，当β 链反
beta turnsβ 转角转方向的时候蛋白质内部形成的 U 型结
构
Bioinformatics生物信息学应用信息科学的理论、方法和技术，管理、分析和利用生物分子数据。
Biocomputing生物计算本书中特指用计算机技术分析和处理生
物分子数据。
Basic Local
基本的局部比对搜
Alignment Search一种常用的序列数据库搜索工具。
索工具（ Blast）
Tool ( Blast)
blotting and
将分子（通常是核酸分子）从凝胶转移印迹和杂交到膜上，接着用绑定有特定感兴趣的分
hybridization
子的标记探针进行洗脱的过程。bootstrap test自举检验对置信程度进行量化的检验。
branch and bound
分支约束法一种空间搜索方法，通过约束条件减少
method搜索空间，提高搜索效率。
branches分支
在系统发生树中，通过分支连接两个节
点。
C
C ( Cytosine)胞嘧啶
CAAT box CAAT盒
carboxy terminus羧基端
cDNA
cDNA ( 互补（ Complementary
DNA)
DNA）
作为碱基的两种嘧啶中的一种。
大多数真核启动子具有的一段短序列，其片
段模式为 C-A-A-T ，通常出现在转录起始
位点上游 80 个核苷酸的地方。许多
因子可以与 CAAT盒结合。
在多肽链中，含有羧酸基团(—COOH)的分子端，对应于基因的3' -端。
通过逆转录酶从RNA 模板合成的 DNA 。
cDNA library cDNA 文库从 mRNA 序列中产生的所有 DNA 序列的集合。这种类型的文库只包含编码蛋白质
的 DNA （基因）。
central dogma中心法则从基因的核酸序列中提取信息并以此合成
蛋白质的过程（ DNA? RNA? protein ）。
character特征在系统发生树中，具有有限状态数的特
征。
charged amino acid带电氨基酸在一定的生物 pH 值下，带有正电或负电
的氨基酸。
chromatin
在真核生物细胞核内部由大量 DNA 以及染色质与此相关的组蛋白组成的近似均匀混合
物。
在原核生物，包含一个细胞基因组的 DNA
chromosome染色体分子称为染色体。在真核生物中，与蛋白质复合在一起、包含大量遗传信息的线型
DNA分子。
clone克隆无性繁殖，如生物体克隆、基因克隆等。
在类染色体载体中插入特定的 DNA 一段，cloning克隆使得它们可以在活细胞中得以保存并复
制。
Coding sequence编码序列DNA序列中为蛋白质编码的部分。
Codon密码子基因编码部分的三核苷酸组合，对应于一
个特定的氨基酸。
（ 1 ）通过氢键连接的核苷酸对（ G 和
Complementary互补的C;A 和T;A 和U ）；（2 ）核苷酸
链的反向平行对。
Computational计算分子生物主要研究分子生物学数据的分析方法，开Molecular Biology学发分析工具。
conformation构象蛋白质的空间构象。
consensus sequence一致序列在两个或多个同源序列的每一个位置上多数出现的核苷酸或氨基酸组成的序列
conserved sequence保守序列在进化过程中基本保持不变的核酸与蛋白质序列，它们往往与特定的功能相对应。
Contig连续交叠群基因组测序过程中将许多短的序列片段链
接成很长的连续片段。
指相似基因型或表型性状的独立进化。例
convergent
趋同进化如，眼睛在各种生物体（如哺乳动物、
evolution软体动物以及昆虫）中独立进化，结
构各异。
core fold核心折叠构成蛋白质空间形状的基本模式。
在哺乳类动物基因组中的一个 500bp 到
3000bp 的区域，该区域中的二核苷酸CpG island CpG 岛CpG 的含量比其他区域的正常水平要高。
通常，与此相关的是真核生物管家基因的
启动子区域。
crystal晶体由分子的规则排列组成的固体结构。
D
degeneracy简并性指某些氨基酸可以被一个以上的三联密码子编码的特性。
指蛋白质因为受热作用或者去污剂或
denatured protein变性蛋白质尿素等化学作用而失去了正常的三级
结构和四级结构的结果。deoxyribonucleic脱氧核糖核酸由相连的核苷酸组成的双链生物二聚
acid (DNA)（DNA）体，其核苷酸含有脱氧糖基。 DNA 是
遗传的分子基础。dipeptide二肽由一个肽键连成的两个氨基酸。
disulfide bond二硫键二硫键是蛋白质中两个半胱氨酸侧链之间形成的化学键。
DNA DNA参见脱氧核糖核酸。
domain域（结构域）指蛋白质结构中相对独立的、具有特定
功能的空间区域。
对两条序列进行图形化比较的方法。图
dot plot点阵图形中的一系列的斜线对应于序列相似
的区域。
一种可以有效地探求一定复杂问题的
dynamic programming动态规划
各种可能的解决方案的程序；它将一个问题合理分解成一些小的子问题，然后利用部分计算解得到最终答案。
E
enhancer
可以与真核转录因子特异性结合的DNA 序增强子列片段。增强子序列可以在任何一个方向上
起到逐渐增加转录水平的作用。
一种生物催化剂（通常是蛋白质），能通
enzyme酶过降低活化能使特定的化学反应可以更快
地进行。
EST （ Expressed EST 表达序列标从 cDNA 的 5' 或 3' 端获取的短的 DNA sequence tags ）签片段。
euchromatin常染色质
指真核生物中组蛋白高度甲基化（乙酰化？）并且 DNA 低度甲基化的开放染色质。
exhaustive search穷举搜索对问题所有可能的解进行评估。
exon外显子一个 hnRNA 分子的各个部分，它们被剪接后连在一起形成 mRNA。
expression表达谱基因在不同时空的表达模式。profile
F
family家族在整个长度范围内有多于50％的氨基酸
序列相同的蛋白质称为一个家族。
通常和术语“结构模体”有近似的含义，但fold折叠是特别暗示在两个或更多的蛋白质中具有相似二
级结构的大区域。
指那些改变一个核苷酸为任何其它三个中fourfold
四重简并位点的一个都对核糖体将氨基酸插入到蛋白质degenerate site
没有影响的密码子位点。
G
G （ Guanine ）G （鸟嘌呤）两种嘌呤中的一种。
gap penalty空位罚分为了减少序列比对中出现的空位，对空位
进行减分的操作。
在两个具有共同祖先序列的比对中，为了
gaps空位反映插入或删除所引入的一个或一些破折
号。
GC content GC 含量在 DNA 序列中，核苷酸 G 、C 的组成相
对于A、T 的比例。
gel
指在电场的作用下，使带电分子穿过聚丙凝胶电泳烯酰胺、淀粉或者琼脂糖凝胶，从而根据
electrophoresis
其大小和带电性进行分离的过程。
DNA或 RNA 中，代表特定功能的某一段核gene基因苷酸序列；一种遗传的功能单元，它控制
着一个或多个性状的传递和表达。
gene content基因内容一个基因组所包含的所有基因称为该基因
组的基因内容。
gene expression基因表达利用存储在 DNA 中的信息来合成 RNA 分子，进而生成相应蛋白质的过程。
gene
基因识别利用各种方法识别基因组中的基因序列。identification
关于基因和蛋白质知识的标准词汇，是今
gene ontology基因本体论后实现各种与基因相关数据的统一、进行
数据转换、开展数据挖掘的基础。
gene order基因次序基因在染色体上的排列顺序。
gene tree基因树基于同源基因分析得到的系统发生树。
genetic map遗传图谱以具有多态性的遗传标记为“路标”，以遗传学距离为图距的基因组图谱。
genome基因组一个生物体全部遗传物质的总和。
genomics基因组学研究基因组序列，研究序列与功能的关系，研究基因组中所包含的遗传信息。
genomic library基因文库包含有基因组 DNA 插入的克隆片段集合。
genotype基因型一个个体或群体全部或部分的基因组成。
global alignment全局比对在全局范围内对两条序列进行比对打分的
方法。
这是一条与真核生物蛋白质编码基因相关
的规则，说的是 RNA 内含子序列 5'端
GU-AG rule GU － AG 规则的起始两个核苷酸总是 5'-GU-3' ，并且
其 3' 端的最后两个核苷酸总是
5'-AG-3' 。
H
hairpin turn发夹环
在 RNA 链中自身反转允许形成分子内碱基配对的位置。
一种数据结构，可以存储多个数值；
Hash table Hash 表不像矩阵要用整型索引获取存在其中的数， hash 表可以用任何类型的值（包括字符串）作为索引。
Hidden Markov Models隐马尔柯夫模型
在序列分析中常用的一种数学模型。
(HMM)（ HMM）
指转录停滞、紧密包裹着的染色质；
heterochromatin异染色质和高度 DNA 甲基化以及低度的组蛋
白乙酰化有关。
heuristic methods启发式方法反复试验，利用经验解决问题的一
种方法。
homologs同源序列具有公共祖先的序列。
基因从一个物种传递到另一个物种的
horizontal gene
基因水平转移过程。虽然病原体和转座子通常被疑
transfer似为导致它的原因，但是基因这种运
动的机制仍然未知。
HumanGenomeProject,
人类基因组计划通过全球合作，绘制人类基因组的全
HGP部序列图谱。
housekeeping gene管家基因发育过程中在任何时间、在任何器官都高度表达的基因。
H-P
H-P （疏水极性）以固定半径的单个原子表示蛋白质中(hydrophobic-polar)
模型的一个氨基酸残基的简单网格模型。
model
由于极性共价键的作用，使得电荷作hydrogen bonding氢键用发生轻微分离而形成的分子相互作
用。
hydrophilic亲水的很容易在水性溶剂中溶解；字面上理解，就是和水易处的。
hydrophobic疏水的难以和水分子相互作用，字面上就是
厌水的。
hydrophobic amino
含有一个全部由碳和氢组成的 R 基疏水氨基酸团的氨基酸；它不可能和水分子形成
acid
氢键
将一个多肽链折叠成一个压缩的构
hydrophobic collapse疏水折叠
象，从而使疏水残基远离溶剂的过程，简单的说，是由疏水作用而引起的肽
链折叠。
I
indel插入或删除插入或删除。
inferred ancestor
推断祖先通过系统发生树推断而得到的祖先。
25
inferred tree推断树对三个或三个以上的同源序列的系统发生关系的描述，是它们真正关系的一个近似。
informative 有信息（位在简约性分析中的提供有用信息位点；与点）此对应的是无信息位点。
ingroup 内群（或内部物一个物种或一个分歧不大的物种系列；与此种）相对应的是外群。
Inhibitor抑制剂任何可以降低酶促反应速度的物质。
initiation
一系列自身相互作用的转录因子形成复合
起始复合物体，作用与一个基因的启动子区域，从
complex
而促进基因的转录启动。
initiator (Inr)
真核基因中与转录起始位点密切相关的核起始序列苷酸；在人类中，该一致序列是
sequence
5'-YYCARR-3' 。
insertion
指除了自身转座需要外不再包含有任何信息
插入序列的转座子元件；当被插入到一个基因中，
sequence
它将破坏其正常的结构以及基因的功能。
在一棵系统发生树中，不对应真正数据的internal node内部节点节点，这样的节点代表两个或多个独立家
系的公共祖先。
intrinsic
在原核生物中终止转录的特殊信号；指在固有终止子新转录的 RNA 中可以形成二级结构的核苷
terminator
酸序列，其后跟随一串尿嘧啶。
在剪切时被切除的内部序列；出现在真核基intron内含子因的初级转录物 (hnRNAs) 中，而不是在
mRNA中。
isochores等值区在真核基因组中具有相似碱基比例的区域。
J
junk DNA垃圾 DNA 没有意义的 DNA 序列；也指那些目前还不知
道其作用的序列。
K
DNA 序列的长度单位，1000个碱基为
kilobase(kb)千碱基
1kb 。
L
lead compound先导化合物指在药物设计中一个可行的候选分子。
LINE LINE长散布（核）元件。
linkage map连锁图谱见“遗传图谱”。
local alignment局部比对一种寻找匹配子序列的序列比对方法。
lock and key
锁- 钥方法两个对接分子的构象被固定的对接方法。
approach
log odds matrix对数几率矩阵矩阵元素是每一个字符替换概率的对数的
矩阵。
M
match score匹配得分序列比较算法对相同字符匹配设置的得
分。
指在一系列的序列比对中，考虑每一个字
maximum likelihood
最大似然法符被替代的概率的一种系统发生学方法；
approach也是一种基于纯统计的系统发生重建方
法。
methylation甲基化一个甲基 ( —CH 3 ) 附着在一个核苷酸的含氮碱基或者蛋白质上。
microarray微阵列在一个固体基片上的已知位置固定了 DNA
探针的有序阵列。
在基因组中很多非常短的核酸序列出现的
microsatellite微卫星区域，例如串接出现 5'-CA-3'的重复序
列；通常在个体间变化很大。MIAME(the minimum
information about a 微阵列实验的最为了实现微阵列数据共享和交流而制定的microarray小信息数据存储标准。
experiment)
指在基因组中长度从 5 个碱基对到几十个minisatellite小卫星碱基对重复序列串连出现的区域；在个体
间变化可能很大。
mismatch score失配打分在一个比对算法中，对于不相同的字符被比对时所赋予的罚分。
这是一个有争议性的假设，指对于所有的
molecular clock分子钟进化谱系，任何一段给定的 DNA 序列以相
同的速率突变。
指一段 DNA 序列的多数相同拷贝，一般地molecular clones分子克隆在例如质粒或病毒等载体中进行，使得
它们可以在细菌培养物中生存并传播。
分子图形学是进行分子模型化的一项重要
molecular graphics分子图形学技术，由于分子图形学和其它计算化学方法的相互结合，使得分子模型化方法取得
成功。
molecular modeling分子模型化分子模型化是利用计算机模拟分子结构、研究分子之间相互作用的一种技术。
Monte Carlo Monte Carlo算一种尝试复杂问题的各种可能解的方法，algorithm法例如将能量最小作为评价一般解的方法。
motif序列模式指核酸或者蛋白质序列中具有保守性的序
列片段。
multiple sequence
多重序列比对三个或更多条序列的比对。
alignment
mutation
由于 DNA 复制或者修复错误导致核苷酸突变序列发生的变化；严格地讲，通过选择性
过滤在物种代间发生的变化。
N
native structure天然结构在一个活细胞内，特定的蛋白质通常折叠
成的唯一结构。
natural selection
个体间由于适应性的差异而形成的基因自然选择传给子代的差异现象；导致等位基因频
(selection)
率改变的进化。
nearest neighbor
最近邻分类法一种根据物体特征相似性对它们进行分
classifier类的一种统计学方法。negative regulation负调控可以阻止基因转录发生的调控
neighbor-joining
一种聚类方法，在聚类之前，所有对象邻近归并法以单个节点表示，然后逐步合并相邻节
method
点。
nucleotide核苷酸核酸分子的基本单位，其组成方式为碱基
- 戊糖- 磷酸。
一种可以通过学习来仿效一些神经元的
neural network神经网络功能计算机程序；能够用来根据统计相似
性预测数据集的特定属性。neutral mutation中性突变不影响生物适应性的突变。
NMR NMR核磁共振用于解析蛋白质结构的技术。
nodes节点在一棵系统发生树中，以节点代表一个分类单元（物种、序列）。
nondegenerate site非简并位点突变总是导致蛋白质氨基酸序列发生替
换的密码子位置。
nonsynonymous
异义替换可以使氨基酸发生变化的密码子中核苷
substitution酸的替换。
O
open reading开放阅读框一段由密码子组成的核苷酸序列，在相frame (ORF)（ORF）同阅读框中没有终止密码子出现。
operator sequence操纵子序列原核生物调控蛋白结合的与基因启动子相关的一段核苷酸序列。
operon操纵子包含有结构基因和调控元件、在转录中产生 mRNA分子的一组相关的基因。
origination
起始罚分用来评估一系列新空位的罚分；序列比对
penalty中空位罚分的一部分。
直向（直系）同源那些具有相似性的序列，由于物种形成
orthologs事件而使得它们从一个祖先序列独立进
物
化。
outgroup 外群（外部参考物指与一组生物体很少相关的一个物种或种）一组物种。
P
一种进化单位；特别地，指被观察的对
PAM unit PAM单位象中每 100 个残基发生一个替换所需
要的平均进化时间。
对两条序列进行编辑操作，通过字符匹
Pairwise Sequence
序列两两比对配和替换，或者插入和删除字符，使得
Alignment两条序列达到一样的长度，并使两条序
列中相同的字符尽可能地一一对应。
paralogs 共生（旁系）同源那些具有相似性的序列，它们都是被物复制的祖先基因的后裔。
指只需少量突变事件激发就可以使一
parsimony简约性条进化路径比其他路径更有优先权的
过程
pattern
是一种统计方法，主要根据观察到的一discrimination模式判别分析
个或多个序列模式来对序列进行分类。
analysis
关于基因组中特异性序列排列和间距
physical map物理图谱的信息，建立物理图谱实际上是为全基因组测序建立“路标”，是测序的前一
步工作。
peptide肽一条含有多个氨基酸的链。
peptide bond肽键在肽连接中碳氮之间的共价键。
一门利用个体的遗传信息获取最好的pharmacogenomics药物基因组学药物疗效，同时具有最小副作用的研
究领域
phenotype表型生物体由于和其基因型和环境相互作用而产生的可见属性。
phosphodiester bond磷酸二酯键连接一个核苷酸的磷酸基团和另外一个的脱氧核糖的共价键。
phylogenetic tree系统发生树对三个或三个以上基因或生物体之间的进化关系的图形化表示。
point accepted点接受突变
指被自然选择接受的突变。mutation (PAM)（ PAM）
polar amino acid极性氨基酸通常指侧链上包含氧和（或）氮并且很容易和水形成氢键的氨基酸。
polar bond极性键在一个带全正电的分子和另一个带全负电的分子之间发生的相互作用。指用一个基因核苷酸序列中不被读出
polyadenylation多聚腺苷酸化的一段长约 250 个碱基 A 组成的序
列替代真核 hnRNA3' 端的过程。polycistronic多顺反子包含多个基因的遗传信息（顺反子）。
一种在体外快速、大量地合成给定 DNA
polymerase chain
聚合酶链反应片段的技术，首先将双链 DNA分离成两
reaction个互补的单链，再用 DNA聚合酶将每一
个单链合成双链，如此重复下去。
Polynucleotide多核苷酸一条核苷酸的聚合链； DNA 或 RNA
分子。
polypeptide多肽一条氨基酸的聚合链；蛋白质。
position-specific位置特异性打分一个矩阵，矩阵中的每一个数表示某个特定的氨基酸占据多序列比对中某个
scoring matrix矩阵
位置的频率。
positive regulation正调控一个调控蛋白的结合使得 RNA 聚合酶更容易启动转录的情况。
primary structure一级结构组装成蛋白质的氨基酸序列。
是一种掌握事物主要矛盾的统计分析
Principal Component
主成分分析方法，它可以从多元事物中解析出主要
Analysis ， PCA影响因素，揭示事物的本质，简化复杂
的问题。
一块被标记的可以特异性和感兴趣的probe探针分子发生相互作用的 DNA （或 RNA 或
抗体）。
promoter sequence启动子序列指和一个基因相关联的可以被 RNA 聚
合酶识别的序列。
protein backbone蛋白质骨架多肽链中的非侧链原子。
protein
蛋白质电泳根据蛋白质的基本特征（如大小、带电
electrophoresis性）在电场下分离并比较蛋白质的方法
对给定蛋白质的氨基酸进行测序的过protein sequencing蛋白质测序程；通常根据 Edman 方法，每次从多
肽的羧基端移走一个氨基酸。
首先假设多肽的构象，然后根据得到的
蛋白质结构预测结构计算出其能量的方法。通过计算各
protein threading种已知结构的能量，可以得出与给定蛋
线索法
白质序列最符合的构象。因为该结构是
假设的而不是计算出来的，所以线索法
有时指的就是“反向蛋白质折叠”。proteome蛋白质组一个生物体的所有蛋白质总和。
Proteomics蛋白质组学蛋白质组学是研究细胞内所有蛋白质及其动态变化规律的科学。
pseudogene伪基因发生突变之后失去功能以及转录活性
的基因。
当环内的碱基和环外的碱基形成配对
pseudoknot伪结的时候就是一个假结体； RNA结构中最
难预测的类型。
purine嘌呤碱基具有双环结构的核苷酸；通常指鸟
嘌呤和腺嘌呤。
pyrimidine嘧啶
碱基具有单环结构的核苷酸；通常指胞嘧啶、胸腺嘧啶和尿嘧啶。
Q
当若干个多肽相互结合时分子内部发生的
quaternary
四级结构相互作用；相互作用的蛋白质形成的整体structure
结构。
R
在蛋白质编码基因中，以起始密码子开reading frame阅读框始、终止密码子结束的一段线性密码子
序列。
regulatory调控在特定的条件下允许或阻止一个基因的表达；对应于结构蛋白。
residue残基作为多肽链一部分的氨基酸；在关于蛋白质或肽的语境中，残基通常指氨基酸
restriction enzymes
限制性（内指在它们遇到特定的核苷酸序列的时候切）酶在 DNA 分子中引入双链缺口的蛋白质
用两个或多个限制性酶进行同步消化来
restriction mapping限制性酶切图谱决定 DNA 分子中的限制性酶识别序列
的相对位置。
restriction site
限制性（酶被限制性酶识别的核苷酸序列；限制切）位点性酶识别位点。
retroposon逆转录转座子一个被 RNA 媒介传输的转座元件。retrotransposition逆转录转座包含一个 RNA 媒介的转座。
reverse
逆转录酶一种用来将 RNA 变成 DNA 的特殊的
transcriptase酶。
ribosome核糖体指负责催化翻译过程的蛋白质和 rRNA
的复合体。
ribozyme核酶指可以加速特定化学反应（例如自切
割）的RNA分子。
RNA （ Ribonucleic
核糖核酸RNA是单链的核酸分子。
Acid ）
RNA polymerase RNA聚合酶负责转录的酶；将 DNA 分子中的信息转
移到 RNA 分子中。
含有一个被认为是公共祖先的节点、并
rooted tree有根树且该节点到其他节点只存在唯一路径的
一棵系统发生树。
S
satellite DNA卫星 DNA
scaled tree标度树
scoring matrix打分矩阵secondary structure二级结构
Self-Organizing自组织映射神经
Map ， SOM网络
semiglobal
准全局比对alignment
sequence序列
sequencing测序serial analysis of基因表达的系列gene expression分析 (SAGE)指相对于其他的基因组数据而言，重复性很大、存储的信息量很少的真核 DNA
片段。
指分支长度和相邻节点对之间的差异成
比例的系统发生树。
在序列比对中，用来对每一个非空位
置进行打分的矩阵。
指源自蛋白质一级结构的α 螺旋、β
折叠等局部结构特征。
自组织特征映射是类似大脑思维的一种
人工神经网络模型，它是一种竞争学习
算法。
指出现在序列头尾的空位不影响比对
得分的序列比对。
（ 1 ） DNA 或 RNA 分子核苷酸的线性排列或者蛋白质中氨基酸的排列；（ 2 ）对分子中的核苷酸或者氨基酸的线性排
列进行定序的操作。
测定生物分子序列的过程称为测序。
用来评估基因表达水平的实验方法。
(SAGE)
side chain侧链附着在氨基酸中心碳原子的短链或者原
子基团。
silencer沉默子通过沉默子可以抑制基因的表达，或对基因进行有选择性的表达。
SINE SINE短散布（核）元件。
SNPs （ Single
SNPs 对人类遗传学研究和医学应用具SNPs（单核苷酸有重要的意义，如人类种群遗传学的研
nucleotide
多态性）究，疾病易感性分析，药物基因组研究，polymorphisms ）
个体化医疗。
SOM(Self自组织映射神经一种无监督学习方法，可以完成对物体organization map)网络的聚类。
species tree物种树表示物种之间关系的系统发生树。spliceosomes剪接体真核生物中负责剪接的酶复合体。
指剪掉真核 hnRNA 内部序列（内含子）splicing剪接再将与之相邻的外显子连接起来的过
start codon
stem
stop codon structural protein
STS （ sequence
tagged site ）
substitution
Sum-of-Pairs
（SP ）
superfamily
super-secondary
structure
support vector machine ， SVM
程。
起始密码子
引导原核和真核生物核糖体开始翻译
mRNA的三联密码子（特别是 AUG ）。
茎干一个 RNA 分子内部碱基配对的区域。
不再使核糖体插入氨基酸而使 mRNA翻终止密码子译终止的密码子（特别是 UGA, UAG 和
UAA）。
通常指可以维持细胞或组织形状的蛋白结构蛋白质，它们可以为骨骼或连接组织提供支
撑的硬骨架。
序列标记位点
这些位点所对应的序列在基因组中可以
作为特定的标记。
替换在一定水平上通过选择过滤的突变。
逐对加和（ SP ）是一种多重序列比对的评价模型。
超家族
在一定程度上具有序列相似性，可以反
映远古进化关系的蛋白质家族的集合。
若干二级结构可能以特殊的几何组合出超二级结构现在蛋白质结构中，这些组合起来的结
构单元称为超二级结构。
支持向量机
是一种从少量样本中提取分类信息的机
器学习方法。
synonymous
同义替换指在编码序列水平上不影响蛋白质氨基
substitution酸序列发生改变的核苷酸替换。
Systems biology系统生物学
在系统水平研究生物学过程和网络，例如遗传和代谢路径。
T
T （ Thymine ）T （胸腺嘧啶）在 DNA 分子中作为碱基的一种嘧啶。
target
靶标识别一个特定的病原体寻找赖以生存和繁衍
identification的生物分子的过程。
terminal node外部（叶）节点指系统发生树中在分支的末端代表分类
单元的节点。
tertiary structure三级结构折叠多肽链的整体三维形状。
topology拓扑结构一个分子的拓扑特征，即它的构型。
transcription转录基因表达的第一步，即基因的 RNA 拷贝。
transcriptome转录组生物体 RNA 序列的全部集合。
Transformed
距离变换法一种基于距离的系统发生学重建的方法，
distance method它可以考虑不同谱系中的不同进化率
一种嘌呤（ A 或 G ）代替另一种嘌呤，transition转换或者一种嘧啶（ C 或 T ）代替另一种嘧
啶。
translation翻译将 RNA 核苷酸序列中的信息转化为蛋白质氨基酸序列的过程。
transversion颠换用嘌呤（G 或A ）代替嘧啶（C 或T ）的突变，反之亦然。
triplet code三联密码
在核糖体进行翻译的过程中用来产生一
个氨基酸的三核苷酸组。
密码子位置，在这一点上，两种不同的核
twofold degenerate
双重简并位点苷酸翻译成同一种氨基酸，但是如果替换
site成另外两个核苷酸，则会导致翻译成不同
的氨基酸。
U
在简约性分析中，序列比对中的一个uninformative非信息（位点）位点所对应的树在这个点上引起的突
变数目都相同，则称此位点是无信息
的，与此对应的是“信息（位点）”。
一类指定了节点之间的相互关系，但unrooted tree无根树没有指明进化发生方向的系统发生
树。
一类指明了叶结点的相对的亲缘关unscaled tree非标度树系，但是没有表达分离他们的相对变
化次数的系统发生树。unweighted-pair-group
非加权分组平均系统发生树重建中的一种方法，它采method with arithmetic
法（ UPGMA)用连续聚类算法逐步建立树。
mean (UPGMA)
upstream promoter
与蛋白质而不是 RNA 聚合酶相结合上游启动子元件的真核基因启动子相关的核苷酸序
element
列。
V
Vector Alignment
向量比对搜索工
Search Tool一种结构比较搜索工具。
具 (VAST）
（VAST）
W
在序列搜索中，一段固定长度的序列称为一
word单词个单词。一些数据库搜索算法将一段查询序列分成几段固定长度的单词，然后根据这些单词在序列数据库中进行搜索。
分子生物学词汇(S)
分子生物学词汇(S) 分子生物学词汇(S)分子生物学词汇(S)saccharomyces cerevisiae 酿酒酵母 saccharopine 酵母氨酸 saccluse [高尔基体]扁平膜囊 safranine 番红 safrole 黄樟素 sagamicin 相模霉素 saikoside 柴胡皂苷 sakaguchi reaction 坂口反应 salicin 水杨苷 salicylate 水杨酸盐 salinomycin 盐霉素 salmin 鲑精蛋白 salmonella 沙门氏菌属 salmonella typhi 伤寒（沙门氏）杆菌 saltatory conduction 跳跃传导 salvelin 鲑精蛋白 sapogenin 皂（角）苷配基，皂（角）苷元 saran wrap [商]saran包装膜，莎伦包装膜，偏氯伦包装膜，
[dow chemical公司商标，是用强韧而易弯曲的热敏塑料制成的包装用薄膜] sarcina 八叠球菌 sarcodina 肉足总纲 sarcomere 肌（原纤维）节 sarcomycin 肉瘤霉素 sarcoplasmic 肌质 sarcosinate 肌氨酸盐 sarcosine 肌氨酸 sarcosyl 十二烷基肌氨酸钠 sarcotubule 肌小管 sarin 萨林 satellite dna 卫星dna[真核细胞染色体dna经氯化铯密度梯度离心，其高度重复序列因组成不同而在主带旁自成一条或数条条带] satellitism 卫星现象[可特指一种微生物在另一种微生物菌落附近才能旺盛地生长繁殖的现象] satiety center 饱中枢 saturation hybridization 饱和杂交[一种组分大大过量而使另一组分的互补序列全部掺入双链中] saturation mutagenesis 饱和诱变[对基因的某一小区域内碱基进行多种形式的置换]
常用分子生物学工具汇总【最新版】
常用分子生物学工具汇总 书目资料库管理系统 1、ReferenceManager v11.0 【说明】ReferenceManager是一个专门设计来管理书目参考文献的资料库程序。任何需要收集参考文献做研究之用或需要制作书目的人都可以使用Reference Manager更轻易地管理资料。Reference Manager受到全球学术机构以及商业、研究机构的研究人员、图书馆员和学生广泛地使用。 【功能】 a、快速地从草稿中准备格式化的内文引用文献和参考书目 b、建立并维护部门的研究资料库 c、追踪再版馆藏 d、为研究人员或图书馆赞助者管理新知通报服务 e、从不同的参考文献来源(如:联机、光碟、网际网络资料服务)收集参考文献 f、为学生建立指定阅读清单 g、建立教职员出版品清单 h、编目特殊馆藏 2、Endnote7.0
【说明】Endnote由ThomsonCorporation下属的Thomson ResearchSoft开发，是SCI的官方软件，具备直接连接上千个数据库、边书写论文边插入参考文献、管理数十万条参考文献等的功能。其所占系统资源容量小，基本不会发生因Endnote数据库过大而电脑死机的现象。 【功能】 a、在线搜索文献:直接从网络搜索相关文献并导入到Endnote的文献库内 b、建立文献库和图片库:收藏，管理和搜索个人文献和图片、表格 c、定制文稿:直接在Word中格式化引文和图形，利用文稿模板直接书写合乎杂志社要求的文章。 d、引文编排:可以自动帮助我们编辑参考文献的格式 序列获得和同源性比对
1、NCBI-Genbank 【说明】GenBank是美国国家生物技术信息中心(NCBI)建立的DNA序列数据库，从公共资源中获取序列数据，主要是科研人员直接提供或来源于大规模基因组测序计划( Benson等，1998)。为保证数据尽可能的完全，GenBank 与EMBL(欧洲分子生物学实验室)、DDBJ建立了相互交换数据的合作关系。 【功能】 a、Entrez检索:将核酸、蛋白质序列和基因图谱、蛋白质结构数据库整合在一起。 b、Blast检索:通过已知序列检索其同源序列(序列类型为核酸或核苷酸)。 c、序列分类检索:高通量基因组序列(HTG)、表达序列标记(EST)、序列标记位点(STS)和基因组概览序列(GSS)。序列文件的基本单位是序列条目，包括核甘酸碱基排列顺序和注释两部分。
分子生物学常见名词解释
分子生物学常见名词解释 1、分子生物学：是一门从分子水平研究生命现象、生命本质、生命活动及其规律的科学。 2、医学分子生物学：是分子生物学的一个重要分支，又是一门新兴交叉学科。它是从分子水平上研究人体在正常和疾病状态下的生命活动及其规律，从分子水平开展人类疾病的预防、诊断和治疗研究的一门科学。 3、酶工程：过去主要是通过生物化学方法从各种材料中提取、制备酶制剂。现在主要应用基因工程技术制取酶制剂。 4、蛋白质工程：过去主要是采用化学方法对纯化的蛋白质进行结构改造，制备出有特定功能的蛋白质。现在主要应用基因工程技术，从改造目的基因的结构入手，在受体细胞中表达不同结构的蛋白质。 5、微生物工程：又称发酵工程是利用微生物特定性状，使微生物产生有用物质或直接用于工业化生产的技术。 6、DNA的甲基化：DNA的一级结构中，有一些碱基可以通过加上一个甲基而被修饰，称为DNA的甲基化。 7、CG岛：在整个基因组中存在一些成簇、稳定的非甲基化CG，这类CG称为CG岛。 8 、信使RNA：从DNA分子转录的RNA分子中，有一类可作为蛋白质生物合成的模板，称为信使RNA。 9、顺反子：由结构基因转录生成的RNA序列亦称为顺反子。 10、帽子结构：5端第1个核苷酸是甲基化鸟嘌呤核苷酸，它以5端三磷酸酯键与第2个核苷酸的5端相连，而不是通常的3、5磷酸二酯键。 11 、核酶：在没有任何蛋白质（酶）存在的条件下，某些RNA分子也能催化其自身或其它RNA分子进行化学反应，即某些RNA具有酶样的催化活性，这类具有催化活力的RNA被命名为核酶。 12、蛋白质的变性：蛋白质分子爱到物理化学因素（如加热、紫外线、高压、有机溶剂、酸、碱等）的影响时，可使维持空间结构的次级键断裂，性质改变，生物活性丧失，称为蛋白质的变性。 13、蛋白质的复性：导致蛋白质变性的因素除去后，某些蛋白质又可重新回复天然构象，表现出天然蛋白质的生物活性，称为蛋白质的复性。 14、基因：是核酸分子中贮存遗传信息的遗传单位，是指贮存有功能的蛋白质多肽链或RNA序列信息及表达这些信息所必需的全部核苷酸序列。
分子生物学词汇(E1)
分子生物学词汇(E1) 分子生物学词汇(E1)分子生物学词汇(E1)e rosette e（玫瑰）花结[e表示红细胞erythrocyte] e rosette test e（玫瑰）花结试验 ea rossette ea（玫瑰）花结[e表示红细胞erythrocyte,a表示抗体antibody] eac rossette eac（玫瑰）花结[e表示红细胞erythrocyte,a表示抗体antibody，c表示补体complement] eadie plot eadie图 eadie plotting eadie作图法[用于酶促反应动力学] early gene 早期基因[可特指病毒] early hypersensitivity 早发型超敏反应 early phage 早期[有时特指病毒复制的早期] early promoter 早期启动子[有时特指病毒] early protein 早期蛋白[有时特指病毒] early transcription 早期转录[有时特指病毒] eburicoic acid 齿孔酸 ecdysis 蜕皮 ecdyson 蜕皮激素[见于昆虫等节肢动物] ecdyson response element 蜕皮激素效应元件
ecdysteroid hormone 蜕皮类固醇激素[见于血吸虫] echinomycin 棘霉素 echinonectin 海胆粘连蛋白 echiststin 锯鳞（蝮蝰）血抑（环）肽[可抑制血小板凝集] echo virus echo病毒，艾柯病毒 eclipse period [细胞生长的]隐蔽期 eclipsed conformation 重叠构象 eclosion hormone 蜕壳激素[见于昆虫] ecological isolation 生态隔离 ecology 生态学 ecosphere 生态圈 ecotropic retrovirus 亲嗜性逆转录病毒[只能在原始宿主细胞引起产毒性感染] ecotype 生态型 ecteinascidin 海鞘素 ectendomycorrhiza 内外生菌根 ectoderm 外胚层 ectodesma 胞外连丝 ectodesmata （复）胞外连丝 ectodomain 胞外（结构）域 ectoenzyme 胞外酶 ectomycorrhiza 外生菌根
分子生物学名词解释最全
第一章名词解释 1.基因（gene）是贮存遗传信息的核酸（DNA或RNA）片段，包括编码RNA和蛋白质的结构基因以及转录调控序列两部分。 2. 结构基因（structural gene）指基因中编码RNA和蛋白质的核苷酸序列。它们在原核生物中连续排列，在真核生物中则间断排列。 3.断裂基因（split gene真核生物的结构基因中，编码区与非编码区间隔排列。 4. 外显子（exon）指在真核生物的断裂基因及其成熟RNA中都存在的核酸序列。 5.内含子（intron）指在真核生物的断裂基因及其初级转录产物中出现，但在成熟RNA中被剪接除去的核酸序列。 6.多顺反子RNA（polycistronic/multicistronic RNA）一个RNA分子上包含几个结构基因的转录产物。原核生物的绝大多数基因和真核生物的个别基因可转录生成多顺反子RNA。 7.单顺反子RNA（monocistronic RNA）一个RNA分子上只包含一个结构基因的转录产物。真核生物的绝大多数基因和原核生物的个别基因可转录生成单顺反子RNA。 8. 核不均一RNA（heterogeneous nuclear RNA, hnRNA）是真核生物细胞核内的转录初始产物，含有外显子和内含子转录的序列，分子量大小不均一，经一系列转录后加工变为成熟mRNA。 9. 开放阅读框（open reading frame, ORF）mRNA分子上从起始密码子到终止密码子之间的核苷酸（碱基）序列，编码一个特定的多肽链。 10.密码子（codon） mRNA分子的开放读框内从5' 到3' 方向每3个相邻的核苷酸（碱基）为一组，编码多肽链中的20种氨基酸残基，或者代表翻译起始以及翻译终止信息。
附录1常用基本词汇表
附录1 常用基本词汇表 英文名词中文名词解释 A（Adenine）腺嘌呤作为碱基的两种嘌呤中的一种。 active site活化位点蛋白质三维表面催化作用发生的区域。 alignment比对为了确定两个同源核酸或蛋白质序列的累计差 异而进行的配对称为比对。 alignment of alignments比对的比对即比对的对象不是简单的序列，而是序列的比 对。 alleles等位基因一个基因的不同版本。 alpha carbonα碳在氨基酸中与侧链（R-基团）相连的中心碳原子。 alternative splicing可变剪接从一个单独的hnRNA生成两个或多个mRNA 分子的过程。 amino terminus (N-terminal)氨基端（N端）在一个多肽中，具有自由氨基的分子端，对应 于基因的5’-端。 anti-parallel反向平行表示相反的方向；在双链DNA中，这意味着如果 一条链是5' 到3'的，则其互补链方向是3' 到 5'的。 backbone (of an amino acid) （氨基酸的）骨架包含一个氨基，一个α碳和一个羧酸或羧基。base pair 碱基对（1）在双链DNA中嘌呤和嘧啶之间的相互作用 （特别指A和T之间，G和C之间）；（2）双链 DNA序列长度的基本单位。 beta turnsβ转角在反向平行的β折叠片中，当β链反转方向的时 候蛋白质内部形成的U型结构。 Bioinformatics 生物信息学应用信息科学的理论、方法和技术，管理、分析 和利用生物分子数据。 Biocomputing生物计算本书中特指用计算机技术分析和处理生物分子 数据。
分子生物学词汇(I)
分子生物学词汇(I) 分子生物学词汇(I)分子生物学词汇(I)ibotenic acid 鹅膏蕈氨酸iceberg structure 冰山结构 ichthulin 鱼卵磷蛋白 ichthylepidin 鱼鳞硬蛋白 ichthyltoxin 鱼卵毒素 ichthyoacanthotoxin 鱼刺毒素 ichthyocholaotoxin 鱼胆毒素 icosahedral capsid 二十面体外壳 idiochromosome 性染色体 idiogamy 自身受精[见于原生动物] idiogram 核型模式图 idioplasm 种质 idiotope 独特位 idiotroph 特需营养要求型[一类合成抗生素的微生物变异株，只有存在前体时才合成该抗生素] idiotype 独特型 idling reaction 空载反应[未负载trna位于a部位时，核糖体产生pppgpp和ppgpp，触发严紧型反应]
ilamycin 岛霉素 ilarvirus 等轴不稳定环斑病毒组 illegitimate recombination 非常规重组 imago 成虫 imbibant 吸涨体 imbibition 吸涨（作用） imipramine 丙咪唑 immediate early gene 立即早期基因[有时特指病毒] immobiline [商]固定化电解质[pharmacia公司商标，为丙烯酰胺衍生物，带有官能团，可在凝胶上自动形成固定的ph梯度] immortalization 无限增殖化，永生化[使细胞长期不断维持增殖状态] immunoadhesin 免疫粘附素 immunoadjuvant 免疫佐剂 immunoadsorbent 免疫吸附剂 immunoadsorption 免疫吸附 immunoassay 免疫测定 immunobiology 免疫生物学 immunoblot 免疫印迹 immunoblotting 免疫印迹（法） immunocapture 免疫捕捉，免疫捕获 immunochemiluminescence 免疫化学发光
常用分子生物学软件简介
常用分子生物学软件简 介 公司内部编号：（GOOD-TMMT-MMUT-UUPTY-UUYY-DTTI-
常用分子生物学软件 一、基因芯片： 1、基因芯片综合分析软件。 ArrayVision 一种功能强大的商业版基因芯片分析软件，不仅可以进行图像分析，还可以进行数据处理，方便protocol的管理功能强大，商业版正式版：6900美元。Arraypro Media Cybernetics公司的产品，该公司的gelpro, imagepro一直以精确成为同类产品中的佼佼者，相信arraypro也不会差。 phoretix? Array Nonlinear Dynamics公司的基因片综合分析软件。 J-express 挪威Bergen大学编写，是一个用JAVA语言写的应用程序，界面清晰漂亮，用来分析微矩阵（microarray）实验获得的基因表达数据，需要下载安装JAVA运行环境后后，才能运行。 2、基因芯片阅读图像分析软件 ScanAlyze ，斯坦福的基因芯片基因芯片阅读软件，进行微矩阵荧光图像分析，包括半自动定义格栅与像素点分析。输出为分隔的文本格式，可很容易地转化为任何数据库。 3、基因芯片数据分析软件 Cluster
斯坦福的对大量微矩阵数据组进行各种簇（Cluster)分析与其它各种处理的软件。 SAM Significance Analysis of Microarrays 的缩写，微矩阵显着性分析软件，EXCEL软件的插件，由Stanford大学编制。 4．基因芯片聚类图形显示 TreeView 斯坦福开发的用来显示Cluster软件分析的图形化结果。现已和Cluster成为了基因芯片处理的标准软件。 FreeView 是基于JAVA语言的系统树生成软件，接收Cluster生成的数据，比Treeview增强了某些功能。 5．基因芯片引物设计 Array Designer DNA微矩阵（microarray）软件，批量设计DNA和寡核苷酸引物工具 二、RNA二级结构。 RNA Structure RNA Sturcture 根据最小自由能原理，将Zuker的根据RNA一级序列预测RNA二级结构的算法在软件上实现。预测所用的热力学数据是最近由Turner实验室获得。提供了一些模块以扩展Zuker算法的能力，使之为一个界面友好的RNA折叠程序。允许你同时打开多个数据处理窗口。主窗口的工具条提供一些基本功能：打开文件、导入文件、关闭文件、设置程序参数、重排窗口、以及即时帮助和退
分子生物学名词解释
重要名词：（下划线的尤其重要） 1.常染色质：细胞间期核内染色质折叠压缩程度较低，碱性染料着色浅而均匀的区域， 是染色质的主体部分。DNA主要是单拷贝和中度重复序列，是基因活跃表达部分。2.异染色质：细胞间期核内染色质压缩程度较高，碱性染料着色较深的区域。着丝粒、端 粒、次缢痕，DNA主要是高度重复序列，没有基因活性。 3.核小体：核小体是染色体的基本组成单位，它是由DNA和组蛋白构成的，组蛋白H3、 H4、H2B、H2A各两份，组成了蛋白质八聚体的核心结构，大约200bp的DNA盘绕在蛋白质八聚体的外面，相邻两个核小体之间结合了1分子的H1组蛋白。 4.组蛋白：是染色体的结构蛋白，其与DNA组成核小体。根据其凝胶电泳性质可将其分 为H1、H2A、H2B、H3及H4。 5.转座子：是在基因组中可以移动和自主复制的一段DNA序列。 6.基因：原核、真核生物以及病毒的DNA和RNA分子中具有遗传效应的核苷酸序列，是 遗传的基本单位。它包括结构蛋白和调控蛋白。 7.基因组：每个物种单倍体染色体的数目及其所携带的全部基因称为该物种的基因组。 8.顺反子：由顺/反测验定义的遗传单位，与基因等同，都是代表一个蛋白质的DNA 单 位组成。一个顺反子所包括的一段DNA与一个多肽链的合成相对应。 9.单顺反子和多顺反子： 真核基因转录的产物是单顺反子mRNA，即一个基因一条多肽链，每个基因转录都有各自的调控原件。 多顺反子是指原核生物一个mRNA分别编码多条多肽链，而这些多肽链对应的DNA片段位于一个转录单位内，享用同一对起点和终点。 10.转录单位：即转录时，DNA上从启动子到终止子的一段序列。原核生物的转录单位往 往可以包括一个以上的基因，基因之间为间隔区，转录之后形成多顺反子mRNA，可以编码不同的多肽链。真核生物的转录单位一般只有一个基因，转录产物为单顺反子RNA，只编码一条多肽链。 11.重叠基因：是指两个或两个以上的基因共有一段DNA序列重叠基因有多种重叠方式， 比如说大基因内包含小基因，几个基因重叠等等。 12.断裂基因：在真核生物基因组中，基因是不连续的，在基因的编码区域内部含有大量的 不编码序列，从而隔断了对应于蛋白质的氨基酸序列。这种不连续的基因又称断裂基因或割裂基因 13.限制性内切酶：限制性内切酶是一类能够识别双链DNA分子中的某种特定核苷酸序列， 并在相关位置切割DNA双链结构的核酸内切酶。 14.超螺旋：如果固定DNA分子的两端，或者本身是共价闭合环状DNA或与蛋白质结合 的DNA分子，DNA分子两条链不能自由转动，额外的张力不能释放，DNA分子就会发生扭曲，用以抵消张力。这种扭曲称为超螺旋(supercoil)，是双螺旋的螺旋。 15.拓扑异构酶：通过切断DNA的一条或两条链中的磷酸二酯键，然后重新缠绕和封口来 改变DNA连环数的酶。拓扑异构酶I主要消除负超螺旋，作用一次超螺旋交叉数变化+1；拓扑异构酶II主要引入负超螺旋，作用一次L变化-2。TOPO I催化DNA的单链
2015考研英语大纲附录1、2后缀常用词汇.doc
常用的前缀和后缀，部分国家（或地区）、语言、国民及国籍表，洲名及常见缩写词 一、常用的前缀和后缀 1、常用前缀 aero-：concerning the air of aircraft plane-aeroplane 飞机 space-aerospace 航空空间 anti-：against；opposite of nuclear-antinuclear 反对核武器的 matter-antimatter反物质 war-antiwar反战的 auto-：of or by oneself biography传记–autobiography自传 criticism批评-autocriticism自我反省 be-：to treat as the stated thing friend-befriend以朋友的方式对待；照顾 little-belittle使显得微小，轻视、贬低 bi-：two；twice；double lingual-bilingual 双语的；人 cycle-bicycle bio-：concerning living things chemistry-biochemistry生化 sphere-biosphere 生物圈 by-，bye-：less important produce-by-produce way-byway偏僻小路；学科的次要领域，冷门 centi-：hundredth part grade-centigrade ?摄氏meter-centimeter 厘米 co-：together，with author-coauthor合著者，合著 exist-coexist 同时共存、和平共处 col-：( used before l ) together，with location-collocation排列，配置，词的搭配 com-：( used before b，m，p ) together，with passion-compassion 怜悯、同情 con-：together，with centric-concentric同一中心的、同轴 federation-confederation结盟同盟，联邦 contra-：opposite diction-contradiction 矛盾、否定反驳 natural-contranatural违背自然的 cor-：( used before r ) together，with relate-correlate 有相关性 respond-correspond 相符合相一致，相当类似通信counter-：opposite act-counteract 对抗、抵消 attack-counterattack 反攻、反击 cross-：across；going between the stated things and joining them country-crosscountry越野的 breed-crossbreed杂种，使杂交de-：showing an opposite；to remove；to reduce code-decode 译码、解码、分析电子信号 value-devalue 贬值，贬低 dis-：not；the opposite of advantage-disadvantage 不利、劣势、短处 agree-disagree不同意、不一致、不适合 honest-dishonest 不诚实、不老实 em-：( used before b，m，p ) to cause to become body-embody 表现、象征；包括、包含 power-empower 授权、准许 en-：to cause to become；to make danger-endanger 危及、使遭受危险 large-enlarge 扩大、扩充放大 ex-：former ( and still living ) minister-ex-minister v辅助; 服侍,部长 wife-ex-wife 前妻 extra-：outside；beyond curricular-extracurricular 学校课程以外的 ordinary-extraordinary 奇怪；特别；额外，临时fore-：in advance，before；in or at the front arm-forearm前臂，预先武装 warn-forewarn 预先警告；事先告知 il-：( used before l ) not legal-illegal 非法literate-illiterate 目不识丁、文盲的im-：( used before b，m，p ) not moral-immoral 不道德、邪恶；放荡的 possible-impossible 不可能、办不到的；很难接受 in-：not direct-indirect 间接地，婉转的 sensitive-insensitive 感觉迟钝，不友好的；麻木infra-：below in a range；beyond red-infrared 红外线的 structure—infrastructure 基础设施，基础结构 inter-：between；among change—interchange 互换、互易；交替变换national—international 国际的 intra-：inside，within；into city—intracity市内的 department--intra-department ir-：（used before r）not regular—irregular 不对称、不规则的；不定期的responsible—irresponsible 不负责 kilo-：thousand gram—kilogram千克meter--kilometer千米macro-：large，esp. concerning a whole system rather than particular parts of economics—macroeconomics 宏观经济学structure—macrostructure宏观结构 mal-：bad or badly function—malfunction 故障，障碍 treat—maltreat 虐待、滥用
分子生物学常见名词解释完全版
分子生物学常见名词解释完全版(中英文对照) A Abundance (mRNA 丰度)：指每个细胞中mRNA 分子的数目。 Abundant mRNA(高丰度mRNA)：由少量不同种类mRNA组成，每一种在细胞中出现大量 拷贝。 Acceptor splicing site (受体剪切位点)：内含子右末端和相邻外显子左末端的边界。Acentric fragment(无着丝粒片段)：(由打断产生的)染色体无着丝粒片段缺少中心粒，从而 在细胞分化中被丢失。 Active site(活性位点)：蛋白质上一个底物结合的有限区域。 Allele(等位基因)：在染色体上占据给定位点基因的不同形式。 Allelic exclusion(等位基因排斥)：形容在特殊淋巴细胞中只有一个等位基因来表达编码的 免疫球蛋白质。 Allosteric control(别构调控)：指蛋白质一个位点上的反应能够影响另一个位点活性的能力。Alu-equivalent family(Alu 相当序列基因)：哺乳动物基因组上一组序列，它们与人类Alu 家族相关。 Alu family (Alu家族)：人类基因组中一系列分散的相关序列，每个约300bp长。每个成员 其两端有Alu 切割位点(名字的由来)。 α-Amanitin(鹅膏覃碱)：是来自毒蘑菇Amanita phalloides 二环八肽，能抑制真核RNA聚 合酶，特别是聚合酶II 转录。 Amber codon (琥珀密码子)：核苷酸三联体UAG，引起蛋白质合成终止的三个密码子之一。Amber mutation (琥珀突变)：指代表蛋白质中氨基酸密码子占据的位点上突变成琥珀密码 子的任何DNA 改变。 Amber suppressors (琥珀抑制子)：编码tRNA的基因突变使其反密码子被改变，从而能识 别UAG 密码子和之前的密码子。 Aminoacyl-tRNA (氨酰-tRNA)：是携带氨基酸的转运RNA，共价连接位在氨基酸的NH2 基团和tRNA 终止碱基的3￠或者2￠－OH 基团上。 Aminoacyl-tRNA synthetases (氨酰-tRNA 合成酶)：催化氨基酸与tRNA 3￠或者2￠－OH基团共价连接的酶。 Amphipathic structure(两亲结构)：具有两个表面，一个亲水，一个疏水。脂类是两亲结构，一个蛋白质结构域能够形成两亲螺旋，拥有一个带电的表面和中性表面。 Amplification (扩增)：指产生一个染色体序列额外拷贝，以染色体内或者染色体外DNA形 式簇存在。 Anchorage dependence (贴壁依赖)：指正常的真核细胞需要吸附表面才能在培养基上生长。Aneuploid (非整倍体)：组成与通常的多倍体结构不同，染色体或者染色体片段或成倍丢失。Annealing (退火)：两条互补单链配对形成双螺旋结构。 Anterograde (顺式转运)：蛋白质质从内质网沿着高尔基体向质膜转运。 Antibody (抗体)：由B 淋巴细胞产生的蛋白质(免疫球蛋白质)，它能识别特殊的外源“抗 2 原”，从而引起免疫应答。 Anticoding strand (反编码链)：DNA 双链中作为膜板指导与之互补的RNA 合成的链。Antigen (抗原)：进入基体后能引起抗体(免疫球蛋白质)合成的分子。 Antiparallel (反式平行)：DNA双螺旋以相反的方向组织，因此一条链的5￠端与另一条链的3￠端相连。
分子生物学名词解释
分子生物学：从广义来讲，分子生物学是从分子水平阐明生命现象和生物学规律的一门新兴的边缘学科。它主要对蛋白质及核酸等生物大分子结构和功能以及遗传信息的传递过程进行研究。 DNA重组技术:DNA重组技术（又称基因工程）是将DNA片段或基因在体外经人工剪接后，按照人们的设计与克隆用载体定向连接起来，转入特定的受体细胞中与载体同时复制并得到表达，产生影响受体细胞的新的遗传性状。 信号转导:是指外部信号通过细胞膜上的受体蛋白传到细胞内部，并激发诸如离子通透性、细胞形状或其它细胞功能方面的应答过程。 转录因子:是指一群能与基因5′端上游特定序列专一结合，从而保证目的基因以特定强度在特定时间和空间表达的蛋白质分子。 功能基因组：又称后基因组，是在基因组计划的基础上建立起来的，它主要研究基因及其所编码蛋白质的结构和功能，指导人们充分准确地利用这些基因的产物。 结构分子生物学:就是研究生物大分子特定空间结构及结构的运动变化与其生物学功能关系的科学。 生物信息学：是生物科学和信息科学重大交叉的前沿学科，它依靠计算机对所获得数据进行快速高效计算、统计分类以及生物大分子结构功能的预测。 染色体：是指存在于细胞核中的棒状可染色结构，由染色质构成。染色质是由DNA、RNA和蛋白质形成的复合体。染色体是一种动态结构，在细胞周期的不同阶段明显不同。 C-值（C-value）:一种生物单位体基因组DNA的总量。 C-值矛盾（C-value paradox）：基因组大小与机体的遗传复杂性缺乏相关性。 核心DNA（core DNA）：结合在核心颗粒而不被降解的DNA。 连接DNA（linker DNA）：重复单位中除核心DNA以外的其它DNA。 DNA多态性：指DNA序列中发生变异而导致的个体间核苷酸序列的差异，主要包括单核苷酸多态性和串联重复序列多态性两类。 DNA的一级结构：是指4种核苷酸的排列顺序，表示了该DNA分子的化学组成。又由于4种核苷酸的差异仅仅是碱基的不同，因此又是指碱基的排列顺序。 DNA的二级结构：是指两条多核苷酸链反向平行盘绕所生成的双螺旋结构。 DNA的高级结构：是指DNA双螺旋进一步扭曲盘绕所形成的特定空间结构。 DNA骨架：核苷酸的磷酸基团与脱氧核糖在外侧，通过磷酸二酯键相连接而构成DNA分子的骨架 正超螺旋：由于双链紧缠而引起的超螺旋。 负超螺旋：由于双链松缠而引起的超螺旋。 半保留复制：每个子代分子的一条链来自亲代DNA,另一条则是新合成的，这种复制方式称为DNA的半保留复制。 复制原点:DNA分子复制的特定起点。 复制叉:正在进行复制的复制起点呈现叉子的形式，称为复制叉。
附录一：同词根单词列表
1．有能力的adj. ______________ 能力n. ______________ 使能够v. ______________ 2．行动v. ______________ 男演员n. ______________ 女演员n. ______________ 积极的adj. ______________ 活动n. ______________ 3．增加加v. ______________ 增加n. ______________ 4．优势n. ______________ 缺点n. ______________ 5．活着的adj.______________ 生活v.______________ 生命n. ______________ 6．娱乐n. ______________ 引起乐趣的adj. ______________ 7．美国n. ______________ 美国人，美国的n./adj. ______________ 10. 生气的adj. ______________ 生气地a dv. ______________ 11. 出现v. ______________ 消失v. ______________ 12. 艺术v.______________ 艺术家n. ______________ 13. 吸引v. ______________ 有吸引力的adj. ______________ 景点n. ______________ 14. 澳大利亚n. ______________ 澳大利亚人；澳大利亚的n./adj. _____ 18. 开始v.______________ 开端n. ______________ 19. 好的；好地adj./adv. ______________ 更好adj. ______________ 最好adj. ______________22. 英国n. ______________ 英国人；英国的n./adj. ______________ 23. 建造v. ______________ 大楼n. ______________ 重建v. ______________ 24. 忙碌的a. ______________ 生意n. ______________ 商人n______________ 女商人n.. ______________ 25. 加拿大n. ______________ 加拿大人；加拿大的n./adj. __________ 26. 关心；照料n./v. ______________ 小心的；仔细的adj. ______________ 小心地；仔细地adv. ______________ 27. 变化；改变n./v. ______________ 多变的adj. ______________ 交换v. ______________ 28. 化学物质n./adj. ______________ 化学的n. ______________ 29. 孩子n. ______________ 童年n. ______________ 30. 中国n.______________ 中国人；汉语；中国的n./adj. _______ 31. 选择n. ______________ 选择v. ______________ 32. 城市n. ______________ 公民n. ______________ 35. 云n.______________ 多云的adj. ______________ 36. 收集v. ______________ 收集n. ______________ 37. 完成；完全的v./adj______________ 完全地；完整地adv. ______________ 39. 穿过v. ______________ 穿过prep. ______________ 40. 危险n.______________ 危险地adj. ______________
分子生物学词汇(N)
分子生物学词汇(N) 分子生物学词汇(N)分子生物学词汇(N)n nucleotide n核苷酸[见于免疫球蛋白和t细胞受体的重链基因，系重排过程中随机插入] n orientation 正向（插入），同向（插入）[插入片段与载体同向] n region n区[见于免疫球蛋白和t细胞受体，系重排过程中所插入] nalidixic acid 萘啶酮酸 naloxone 纳洛酮[阿片样肽拮抗剂] naphthol 萘酚 narcotic 麻醉药 narrow groove [dna双螺旋的]窄沟 narrow heribatility 狭义遗传率[加性遗传方差在总表型方差中所占的比例] nasopharyngeal carcinoma 鼻咽癌 nastic movement 感性运动[见于植物] nasty 感性 natamycin 游霉素 native gel 非变性凝胶 natriuretic hormone 利尿钠激素[血浆量增多时，体内生成的
一类能抑制钠泵功能和促进尿钠排出的物质] natriuretic peptide 钠尿肽，利尿钠肽 nebramycin 暗霉素 nebularin 水粉蕈素 nebulin 伴肌动蛋白[骨骼肌的一种肌节基质蛋白，与肌动蛋白等长，可作用于细肌丝] nebulization 雾化 necroparasite 致坏死寄生物[藉分泌物杀死寄生组织后在死组织上生存] necrosis virus 坏死病毒 necrovirus 坏死病毒组[一组植物病毒，模式成员是烟草坏死病毒] nectar 花蜜 nectary 蜜腺 negative interference 负干涉[染色体上一处发生重组，使同一染色体另一处重组率升高] neighborhood correlation 相邻相关（效应），邻位相关（效应）[残基在一级结构上的距离与其三维结构中的距离相关] neisseria 奈瑟菌属 neisseria gonorrhoeae 淋球菌 neisseria meningitidis 脑膜炎球菌 nematoda 线虫纲
分子生物学名词解释全
1. 半保留复制（semiconservative replication）：DNA复制时，以亲代DNA的每一股做模板，以碱基互补配对原则，合成完全相同的两个双链子代DNA，每个子代DNA中都含有一股亲代DNA链，这种现象称为半保留复制。 2.复制子replicon：由一个复制起始点构成的DNA复制单位。 57. 复制起始点(Ori C)DNA在复制时，需在特定的位点起始，这是一些具有特定核苷酸序列顺序的片段，即复制起始点。 24.（35）复制叉（replication fork）是DNA复制时在DNA链上通过解旋、解链和SSB蛋白的结合等过程形成的Y字型结构称为复制叉。 3. Klenow 片段klenow fragment：DNApol I（DNA聚合酶I）被酶蛋白切开得到的大片段。 4. 外显子exon、extron：真核细胞基因DNA中的编码序列，这部分可转录为RNA，并翻译成蛋白质，也称表达序列。 5.（56）核心启动子core promoter：指保证RNA聚合酶Ⅱ转录正常起始所必需的、最少的DNA序列，包括转录起始位点及转录起始位点上游TATA区。（Hogness区） 6. 转录（transcription）：是在DNA的指导下的RNA聚合酶的催化下，按照硷基配对的原则，以四种核苷酸为原料合成一条与模板DNA互补的RNA 的过程。 7. 核酶（ribozyme）：是具有催化功能的RNA分子，是生物催化剂，可降解特异的mRNA序列。 8.（59）信号肽signal peptide：常指新合成多肽链中用于指导蛋白质的跨膜转移（定位）的N-末端的氨基酸序列（有时不一定在N端）。 9.顺式作用元件（cis-acting element）：真核生物DNA中与转录调控有关的核苷酸序列，包括增强子、沉默子等。 10.错配修复（mismatch repair，MMR）：在含有错配碱基的DNA分子中，使正常核苷酸序列恢复的修复方式；主要用来纠正DNA双螺旋上错配的碱基对，还能修复一些因复制打滑而产生的小于4nt的核苷酸插入或缺失。修复的过程是：识别出正确的链，切除掉不正确的部分，然后通过DNA聚合酶III和DNA连接酶的作用，合成正确配对的双链DNA。 直接修复direct repair：是将被损伤碱基恢复到正常状态的修复。有三种修复方式：1光复活修复2、O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶修复3单链断裂修复。
分子生物学词汇(C2)
分子生物学词汇(C2) 分子生物学词汇(C2)分子生物学词汇(C2)chair conformation 椅型构象 chalaza 合点 chalazogamy 合点受精 chalcone 查耳酮，芳烯苯酰芳烃,苯丙烯酰苯 challenge 攻击 chalone 抑素 chamber 室，槽 channel 通道 channel blocker 通道封阻剂，通道阻断剂 channel intrinsic protein 通道内在蛋白[如见于红细胞，与水的运输及渗透调解有关] channel protein 通道蛋白（质） chaotrope 离液剂 chaotropic 离液序列高的 chaotropic agent 离液剂 chaotropic anion 离液序列高的阴离子 chaotropic salt 离液序列高的盐，离液盐[如硫氰酸钾] chaperone 陪伴分子，伴侣蛋白[原意为未婚女性的社交伴侣]
chaperone cohort 伴侣伴蛋白，伴侣蛋白协同物[可提高伴侣效率并促进伴侣蛋白的再循环] chaperone machanism 陪伴机理 chaperone machine 陪伴机[通过陪伴蛋白的结合保证肽链折叠、寡聚化和转运的机制] chaperone protein 伴侣蛋白质[可与新生、未折叠、错折叠或聚合的多肽相结合] chaperonin 伴侣蛋白 chaperoning 陪伴 character 性状，特性，特征 character divergence 性状趋异 characteristic 特性，特征；特有的特征性的 characterization 鉴定 charcoal 炭；活性炭 charge 电荷 charge balance 电荷平衡 charge density 电贺密度 charge distribution 电荷分布 charge neutralization 电荷中和 charge relay network 电荷中继网 charge relay system 电荷中继系统[如丝氨酸蛋白酶中由asp/his/ser组成的质子传递网]