高通量筛选

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化学行业中的高通量筛选技术使用教程

化学行业中的高通量筛选技术使用教程

化学行业中的高通量筛选技术使用教程高通量筛选技术(HTS)是化学行业中一种重要的实验方法,它可以高效地筛选大量化合物,用于寻找新的药物、材料或化学品。

本文将为您介绍高通量筛选技术的原理、应用、操作步骤和注意事项,帮助您更好地理解和应用这一技术。

1. 高通量筛选技术的原理高通量筛选技术是指通过自动化系统对大量化合物进行筛选,以寻找具有特定活性的化合物。

其核心原理是将化合物与靶分子进行反应,并通过测量产生的信号来评估其活性。

这些信号可以是光谱、荧光、吸收、发射等,也可以是酶活性或细胞增殖等生物学响应。

2. 高通量筛选技术的应用高通量筛选技术广泛应用于药物研发、材料研究和农药开发等领域。

在药物研发中,它可以加速新药发现的过程,降低研发成本。

在材料研究中,它可以快速筛选出具有特殊性能的材料。

在农药开发中,它可以高效地评估候选农药的活性和安全性。

3. 高通量筛选技术的操作步骤(1)实验准备:准备待测试的样品、反应体系和相关设备。

(2)样品加载:将待测试的化合物加载到高通量筛选平台的微孔板中。

通常使用多通道移液器进行自动化操作,保证每个样品的准确性和一致性。

(3)靶分子反应:将待测化合物与靶分子进行反应。

可以使用多种反应方式,如酶活性测定、光谱测定等。

(4)信号检测:使用相关设备对反应后的样品进行测量,并记录下产生的信号。

这些设备通常包括光谱仪、荧光读数器、显微镜等。

(5)数据分析:对测得的数据进行分析和处理,评估样品的活性。

可以使用统计学方法、机器学习等技术进行数据处理和筛选结果的判定。

(6)筛选结果验证:对于通过高通量筛选技术筛选出的潜在活性化合物,进行进一步的验证和确认。

4. 高通量筛选技术的注意事项(1)实验条件的控制:在进行高通量筛选实验时,需要严格控制实验条件的一致性和稳定性,以保证得到可靠的结果。

例如,温度、反应时间、pH值等参数应保持一致。

(2)样品来源的选择:选择合适的样品来源非常重要,这可以是天然产物、合成化合物或已知活性化合物,以增加筛选成功的概率。

医药研发中的新药筛选方法

医药研发中的新药筛选方法

医药研发中的新药筛选方法近年来,随着生物技术和计算机技术的飞速发展,医药研发领域也得到了极大的推进。

新药的筛选方法作为新药研发的核心环节,一直备受研究人员的关注。

本文将介绍几种当前医药研发中常用的新药筛选方法,并探讨其优缺点与应用前景。

一、高通量筛选(HTS)高通量筛选是一种利用自动化设备对大量化合物进行快速筛选的方法,其核心技术是微孔板。

通过对大量化合物与特定靶标相互作用的测定,可以筛选出与靶标具有良好亲和力的化合物。

高通量筛选具有快速、高效、经济的特点,广泛应用于新药研发的早期阶段。

然而,由于高通量筛选较为简单,且无法精确评估化合物与体内环境的相互作用,因此需要结合其他筛选方法进行深入研究和验证。

二、计算机辅助药物设计(CADD)计算机辅助药物设计是一种基于计算机模拟技术对分子结构和性质进行预测和优化的方法。

通过建立和运用分子模型、分子图像处理、计算化学和药物信息学等技术手段,可以快速高效地筛选出具有潜在药效的化合物。

相较于传统实验室筛选,计算机辅助药物设计可以节省大量时间和资源,并且可以更准确地预测分子的生物活性和毒副作用。

然而,计算机辅助药物设计的可靠性受到计算模型和数据库的限制,需要不断优化和验证。

三、虚拟筛选(VS)虚拟筛选是一种通过计算机模拟和预测技术筛选潜在药物分子的方法。

与高通量筛选和计算机辅助药物设计不同,虚拟筛选不需要实际合成化合物,而是利用计算机模拟技术对已知化合物库进行筛选。

虚拟筛选具有高效、经济的特点,可以在计算上预测大量分子的潜在活性。

然而,虚拟筛选仅限于现有的化合物库,无法筛选出全新的化合物结构。

四、系统生物学方法系统生物学方法是一种研究生物系统整体特性和相互作用的方法,通过对基因组学、蛋白质组学和代谢组学等数据的整合和分析,可以筛选出具有潜在药效的化合物。

系统生物学方法结合了实验和计算的手段,可以全面、综合地了解生物体内各种分子的功能和相互关系,为新药筛选提供更精准、准确的依据。

高通量筛选原理

高通量筛选原理

高通量筛选原理
高通量筛选是一种用于快速筛选大量样本的方法,广泛应用于生物、药物和材料科学等领域。

其原理基于分析样品中的大量信息,并通过快速并行化的方法进行处理。

高通量筛选首先需要准备大量的样品,这些样品可以是生物样品、化合物或材料。

然后,通过各种方法建立一个高通量筛选平台,这个平台可以是液相色谱、质谱、光谱学、电化学等技术。

每个样品将被逐个地移动到筛选平台进行检测,同时记录相关的数据。

接下来,对获得的数据进行分析和处理。

这可能涉及到统计学方法、机器学习和数据挖掘等技术。

通过这些分析,可以从大量数据中提取出对研究对象有意义的信息。

最后,根据分析结果,可以确定出具有潜在生物活性、相对稳定性或其他关键特性的样品。

这些被筛选出来的样品可以进一步进行研究和开发,以满足具体的应用需求。

总的来说,高通量筛选利用大量样品和快速处理的方法,可以迅速获得对研究对象有意义的信息。

这种筛选技术在加速科学研究和药物发现等领域发挥了重要作用。

高通量筛选的名词解释

高通量筛选的名词解释

高通量筛选的名词解释高通量筛选(High-throughput screening,HTS)是一种快速筛选大量样品的方法,广泛应用于药物研发、生物学、化学和材料科学等领域。

高通量筛选的名词可以分解为两个部分:高通量和筛选,下面将对这两个词的含义进行解释。

一、高通量高通量意味着一种方法可以同时处理大量样品。

在高通量筛选中,样品通常以微孔板的形式排列,每个孔中含有不同的物质。

孔板的孔数可达数百至数万个,每个孔都可以进行单独测试。

这种并行处理的方法使得研究人员能够在短时间内对大量样品进行测试。

为了实现高通量筛选,研究人员通常会使用自动化设备来处理样品。

自动化仪器能够精确地向每个孔中添加不同的试剂,并进行测试和记录。

这些设备可以大大提高实验效率,减少人工操作的错误。

高通量筛选常用于探索新药物的发现。

药物研发中,有大量的化合物需要进行活性测试。

高通量筛选可以快速检测大量潜在的活性化合物,提供初步筛选结果。

这样,研究人员可以有针对性地选择有前景的候选化合物进行进一步研究和开发。

二、筛选筛选是高通量筛选的核心步骤,它是为了找到具有特定性质或活性的样品。

例如,在药物研发中,筛选目标可能是寻找对某种疾病具有治疗潜力的化合物。

在生物学研究中,筛选的目标可能是发现在特定生物过程中起关键作用的蛋白质。

高通量筛选可以通过多种方式进行。

其中一种常见的方法是生物活性筛选,通过检测化合物对特定生物标志物的影响,评估其是否具有活性。

这种方法可以发现与某种疾病相关的生物分子或药物靶点。

另一种常见的筛选方法是化学筛选,通过检验化合物的化学性质,筛选出具有特定结构的化合物。

化学筛选通常采用计算机辅助筛选(in silico screening)和高通量合成(combinatorial chemistry)来发现具有特定结构和功能的化合物。

除了生物活性和化学性质,筛选方法还可以根据所考虑的目标属性而有所不同。

例如,一些筛选可能关注组织选择性,即只选择对特定类型的细胞或组织具有活性的化合物。

高通量筛选的具体流程

高通量筛选的具体流程

高通量筛选的具体流程1.样品准备:将待筛选的样品制备成统一的格式并进行标记。

Sample preparation: Prepare the samples to be screened ina standardized format and label them.2.实验条件设定:确定筛选的实验条件,包括筛选方法、试剂浓度、反应时间等。

Experimental condition setting: Determine the experimental conditions for screening, including screening methods, reagent concentrations, reaction times, etc.3.高通量筛选:使用自动化设备进行高通量筛选,进行大量样品的快速筛选。

High-throughput screening: Use automated equipment for high-throughput screening to rapidly screen a large number of samples.4.数据记录和分析:记录筛选过程中的数据,并进行分析,筛选出有潜力的样品。

Data recording and analysis: Record the data during the screening process and analyze it to identify potential samples.5.优化筛选条件:根据初步筛选结果,对筛选条件进行优化,提高筛选效果和准确性。

Optimization of screening conditions: Based on theinitial screening results, optimize the screening conditions to improve screening effectiveness and accuracy.6.二次筛选:对初步筛选出的样品进行二次筛选,确认筛选结果的可靠性。

药物开发中的关键技术——高通量筛选技术解析

药物开发中的关键技术——高通量筛选技术解析

药物开发中的关键技术——高通量筛选技术解析随着生物技术和分子生物学的飞速发展,药物开发也在不断地拓展和创新。

为了更快速、准确、高效地开发新的药物,人们发明了许多高科技的药物开发技术。

其中,高通量筛选技术无疑是药物开发中不可或缺的关键技术之一。

一、高通量筛选技术简介高通量筛选技术(High-throughput screening,HTS)是一种整合了化学、生物学、计算机科学等多个学科的综合技术。

它可以快速筛选出数百万种化合物中具有药理作用的物质,并对这些物质进行初步的评估。

HTS技术的特点是速度快、效率高、可重复性好和自动化程度高。

HTS技术使药物开发过程更加快速和经济。

在这种技术的支持下,研究人员可以筛选出数以百万计的化合物,并快速识别具有治疗潜力的候选物。

这使得药物研发不仅具有更广泛的选择空间,而且从研发阶段到生产阶段需要的实验时间和成本也大大降低。

二、高通量筛选技术的特点1、高效性HTS技术的实施必须使用能够在短时间内处理大量样品的高通量技术,如自动化机器人和高通量显微镜。

HTS技术在处理大量的化合物时可以将数千万个化合物中筛选出几个具有治疗潜力的候选药物。

这种速度、效率和高通量性是传统的药物开发技术所无法达到的。

2、可重复性由于HTS技术集成了许多自动化仪器,因此在完成预定实验时,可以减少实验误差并大大提高实验的再现性。

这有助于药物开发人员在不同的环境中独立重复实验的并获得相似或相同的结果。

3、自动化高通量筛选的过程通常被机器人化或自动化,因此减少了使用技术上的误差。

自动化还可通过使用标准化媒介来消除化合物筛选过程中的变动和影响。

4、高通量HTS技术的实施必须使用能够在短时间内处理大量样品的高通量技术,如自动化机器人和高通量显微镜。

三、高通量筛选技术在药物开发中的应用1、候选化合物筛选通过HTS技术,可以轻松筛选数以百万计的化合物,在这些化合物中快速识别出具有生物活性的化合物,然后进行进一步的优化。

医药研发中的药物筛选方法

医药研发中的药物筛选方法

医药研发中的药物筛选方法在医药研发领域,药物筛选是一项至关重要的环节。

通过筛选能够找到具有潜在药效的化合物,为新药的研发打下基础。

本文将会介绍几种常见的药物筛选方法,并探讨它们的优缺点。

一、高通量筛选法高通量筛选法(High-Throughput Screening, HTS)是一种大规模进行药物筛选的方法。

这种方法利用自动化技术,可以在相对短的时间内对数以千计的化合物进行测试。

通常,高通量筛选法涉及到一系列的检测步骤,例如酶反应的检测、细胞增殖的检测等。

优点:高通量筛选法具有高效性和快速性的特点,可以在较短时间内快速筛选出具备潜在药效的化合物。

缺点:高通量筛选法的主要缺点是成本较高。

另外,它的结果也需要进一步验证,因为只有少部分通过筛选的化合物能够真正展现出治疗效果。

二、虚拟筛选法虚拟筛选法(Virtual Screening)是一种通过计算机模拟来进行药物筛选的方法。

通过使用分子建模和计算机算法,虚拟筛选法可以预测某个分子与靶点之间的结合情况,并推断其药效。

优点:虚拟筛选法具有速度快、成本低、无需实际化合物的优点。

同时,虚拟筛选能够产生全面的候选化合物,为下一步的实验设计提供指导。

缺点:虚拟筛选法的主要缺点是预测结果的准确性相对较低,需要进一步的实验验证。

三、化学结构筛选法化学结构筛选法(Chemical Structure Screening)是一种基于分子结构相似性的药物筛选方法。

通过比较已知药物与候选化合物之间的结构相似性,化学结构筛选法可以快速识别候选化合物的潜在活性。

优点:化学结构筛选法具有较高的可信度和相对快速的速度。

相对于其他方法,它对大规模化合物的筛选也更具优势。

缺点:化学结构筛选法存在一定的局限性,仅能识别与已知药物结构相似的候选化合物,并无法预测其药效。

四、靶点筛选法靶点筛选法(Target Screening)是一种通过筛选目标蛋白质与化合物相互作用的方法。

该筛选方法能够评估化合物与特定靶点之间的相互作用,进而判断其是否具有潜在的药效。

新药研发中的药物筛选与评价技术

新药研发中的药物筛选与评价技术

新药研发中的药物筛选与评价技术药物的研发对于改善人类健康和治疗疾病起着至关重要的作用。

然而,在数百上千种候选药物中,只有极少数能够最终成为可供患者使用的药物。

这就需要药物筛选与评价技术的应用,以帮助科学家确定哪些候选化合物具有潜力,并且值得进一步研发。

一、药物筛选技术药物筛选是筛选和鉴定化合物是否具备治疗潜力,以便在进一步研究和开发中投入资源。

以下是几种常见的药物筛选技术:1. 高通量筛选(HTS)高通量筛选是一种自动化的方法,可以快速测试大量化合物库中的候选化合物。

这种技术采用微孔板或晶片作为试验平台,通过液体处理系统将化合物和生物目标分子结合,然后通过测量生物信号的变化来判断化合物的活性。

高通量筛选可以同时测试上千个化合物,大大提高了筛选效率。

2. 虚拟筛选虚拟筛选是通过计算机模拟方法,预测化合物与目标蛋白之间的相互作用。

这种方法利用已知的蛋白结构和化合物数据库中的化学信息,通过计算和模拟来筛选具有潜力的候选化合物。

虚拟筛选在初步药物筛选中起到重要的作用,能够排除无活性或有毒性的化合物,节省时间和资源。

3. 细胞筛选细胞筛选是使用活细胞作为试验平台,通过测量化合物对细胞生理状态的影响来评估其活性。

这项技术可以帮助科学家确定候选化合物的细胞毒性、有效浓度和作用机制等信息。

细胞筛选是从体内过渡到体外研究的重要一步,为其他进一步实验提供了基础数据。

二、药物评价技术药物筛选后,需要对候选化合物进行评价,以进一步确定其潜力和可行性。

以下是几种常见的药物评价技术:1. 体外评价体外评价是在离体试验条件下,研究化合物对靶标蛋白的活性和亲和力等指标。

通过测量化合物与目标蛋白结合的强度和稳定性,可以初步评估其治疗潜力。

体外评价常用的方法包括酶活性测定、亲和力测定和结合动力学研究等。

2. 动物模型评价动物模型评价是将候选化合物在活体中进行测试,评估其对疾病模型的治疗效果和毒副作用。

在动物模型中进行的实验可以更全面地了解化合物的药理学特性、药代动力学和安全性。

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Time [sec]
BEAMS Lab
14C counts
Cross-sectional View of Interface (v. 1.0)
Combustion interface v. 2.0 1st Detection of 14C 1st SBIR grant to NSI 2nd Patent issues Combustion interface v. 1.0 Development of GC interface
1999 1994 2000 2002
Sample collection: Blood: Urine: Feces: 1, 2, 5, 8, 24 and 48 hours post dose 0-8, 8-24 and 24-48 hours post dose 0-8, 8-24 and 24-48 hours post dose
BEAMS Lab
Comparison of Methods Conventional AMS
Collect Fractions Chromatographed sample (LC, GC, CE effluent)
BEAMS Lab
Bulk sample (tissue, blood, urine, …) Oxidation to CO2 or H2O Online generation of CO2 or H2
Combustion interface v. 2.0 1st Detection of 14C 1st SBIR grant to NSI 2nd Patent issues Combustion interface v. 1.0 Development of GC interface
1999 1994 2000 2002
BEAMS Lab
Quantitative Analysis: Comparison of Instrument Types
Graphite
Method of quantitation Limits of quantitation Measurement period Sample throughput Isotope ratio:
2004 2005
Laser-induced combustion proof-of-principle Patent apps. filed
Gas ionization detector 1st Patent issues
BEAMS Lab
A Brief History of AMS at MIT
1400
0.21 dpm
Carbon-14 Count Rate (counts/sec)
1200
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800
0.084 dpm 0.042 dpm
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0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
Time (minute)
BEAMS Lab
HPLC-AMS with Laser-induced Combustion Interface
Reduction to Graphite or Titanium Hydride
Continuous-flow, Single Target, Multi-sample Ion Source
Solid Cathode, Multiple Target Ion Source
Higher Throughput
He in CuO bed Alumina cup
He + CO2 out
BEAMS Lab
Combustion Interface (v. 2.0) Sample Holder
BEAMS Lab
1000
1250
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2000
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Counts
250
500
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0 45.250 (9020.408) 167.250 (163.396) 200 386.750 (139.953) 400 480.000 (215.865) 580.500 (239.450) 600 688.000 (461.236) 800 793.250 (553.789) 1000 1200 1236.250 (9728.563) 1344.750 (10386.208) 1400 1464.750 (42402.176) 1021.607 (3263.763) 1126.547 (2691.743) 900.500 (15643.945) *C14 File (C:\DOCUME~1\ROSALI~1\MYDOCU~1\AMS\DATA\2005\ANALYSIS\PFIZER\CALIBR~1\FEB23\0223R010.CSV)
Plasma Clearance: Unbound APAP + Metabolites
200
APAP equivalents (µg/mL)
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10 µCi dose by LSC 10 nCi dose by AMS
10 5
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5
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Time after dose (hours)
BEAMS Lab
APAP Urinary metabolites
100
Percent of total metabolites
10 µCi dose by LSC 10 nCi dose by AMS 80
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40
20
0
Glucuronide Sulfate
APAP Mercapturate
BEAMS Lab
Validate analytical methods for low-level isotope detection at therapeutic doses Rat/Sprague-Dawley/males/250-300 g/ 2 Groups of N=4 All: Group 1: Group 2: 150 mg/kg + 10 µCi [14C]-Acetaminophen + 10 nCi [14C]-Acetaminopation Curves for Whole Plasma
60
50
Peak area ratio
40
30
20
10
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0
Actual 14C concentration (dpm/mL)
BEAMS Lab
Laser-induced heating of CuO causes sample combustion Resulting CO2 transported to AMS ion source
BEAMS Lab
Detection of [14C]-Acetaminophen with Laser-induced Sample Combustion
High Sample Throughput Approaches to Accelerator Mass Spectrometry
P. L. Skipper, R. G. Liberman, J. Flarakos, and S. R. Tannenbaum BEAMS Lab Biological Engineering Division Massachusetts Institute of Technology
1999 1994 2000 2002
2004 2005
Laser-induced combustion proof-of-principle Patent apps. filed
Gas ionization detector 1st Patent issues
BEAMS Lab
A Brief History of AMS at MIT
10 – 1 M 100 zmol Duration of CO2 pulse: 1 – 30 sec > 1 per min
BEAMS Lab
A Brief History of AMS at MIT
Combustion interface v. 2.0 1st Detection of 14C 1st SBIR grant to NSI 2nd Patent issues Combustion interface v. 1.0 Development of GC interface
– DNA damage
• Oxidants • Carcinogenic compounds
• Future directions
– GC-AMS: dual isotope measurements – Tritium AMS
BEAMS Lab
BEAMS Lab
BEAMS Lab
Sample Preparation and Analysis:
sample 14C sample 12C
MIT
Peak area ratio:
sample 14C ext.std. 14C
10-3 – 10-2 M 100 zmol To statistical precision: 1 sec – 30 min Limited by sample prep or
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