第二章蛋白质结构与功能

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蛋白质的结构与功能

蛋白质的结构与功能

三、氨基酸的理化性质:
1.两性解离及等电点: (1) 氨基酸在晶体和水溶液中主要以兼性离子形式存在 ①晶体溶点高 → 离子晶格,不是分子晶格。 ②不溶于非极性溶剂 →极性分子 ③介电常数高→ 水溶液中的氨基酸是极性分子。 (2) 氨基酸的两性解离和酸碱滴定曲线 HA → A- + H+ pH=pKa/ +Log[A-]/[HA] pKa/ 就是HA50%解离([碱] = [酸])时溶液的pH值, Ka/就是此时溶液的[H+] 当HA50%解离时,溶液的pH值等于pKa/ pH = pKa/ 时,[碱] = [酸](50%解离) pH > pKa/ 时,[碱] > [酸](>50%解离) pH < pKa/ 时, [酸] > [碱](<50%解离)
蛋白质的二级结构是指蛋白质多肽链主链
原子局部的空间结构,但不包括与其他肽
段的相互关系及侧链构象的内容。维系蛋
白质二级结构的主要化学键是氢键。
酰胺平面(肽平面) 1. 由于C=O双键中的π 电子云与N原子上 的未共用电子对发生“电子共振”,使肽 键具有部分双键的性质,不能自由旋转。 2. 与肽键相连的六个原子构成刚性平面 结构,称为肽单元或肽键平面。但由于 α - 碳原子与其他原子之间均形成单键, 因此两相邻的肽键平面可以作相对旋转。
氨基酸的光吸收性 Tyr、Phe、Trp的 R基含有共轭双键, 在220-300nm近紫外 区有吸收。 λ(nm) ε Tyr 275 1.4×103 Phe 257 2.0×102 Trp 280 5.6×103
3.氨基酸的化学反应
(1)氨基参与的反应
与亚硝酸反应(Van Slyke 法测定氨基酸) Sanger 反应 :2.4一二硝基氟苯(DNFB) Edman反应:苯异硫氰酸酯,PITC 生成西佛碱的反应(Schiff):西佛碱是某 些酶促反应的中间产物(如转氨基反应的中 间产物)。 甲醛反应

第二章 蛋白质的结构与功能(中职护理 《生物化学》)

第二章 蛋白质的结构与功能(中职护理 《生物化学》)
HN O H2 N CH C CH2 OH
氨基酸的结构
亚氨基酸
脯氨酸 Proline
H N C OH O
2,根据R侧链的极性分类
非极性疏水性氨基酸 极性中性氨基酸 酸性氨基酸 碱性氨基酸
1,非极性疏水性氨基酸
特点:含有非极性的侧链,具有疏水性(在中性水 溶液中的溶解度较小),共7种。
甘氨酸 丙氨酸 缬氨酸 亮氨酸 异亮氨酸 苯丙氨酸 脯氨酸
3, β-转角
定义: 在肽链进行180° 回折时的转角上,通 常由四个氨基酸残基 构成,其中第二个残 基常为脯氨酸。
作用力:氢键
4,无规卷曲
定义: 是指多肽链中没有确定规 律性的那部分肽链构像。
(二)三级结构
定义:
蛋白质的多肽链在各种二级结构的基础上再 进一步盘曲或折叠形成具有一定规律的三维空间 结构,称为蛋白质的三级结构。
含硫氨基酸
O H2N CH C CH2 SH OH
氨基酸的结构
天冬氨酸 Aspartate
酸性氨基酸
O H2 N CH C CH2 C OH O OH
氨基酸的结构
天冬氨酸 Aspartate
谷氨酸 Glutamate
酸性氨基酸
O H2N CH C CH2 CH2 C OH O OH
氨基酸的结构
证明:氨基酸是蛋白质的基本组成单位
۶ 组成人体蛋白质的20种氨基酸均 属于L--氨基酸
• 存在自然界中的氨基酸有300余种, 但组成人体蛋白质的氨基酸仅有20种, 且均属 L-氨基酸(甘氨酸除外)。
۶ 组成蛋白质的氨基酸
(一)氨基酸的结构
1、结构通式
侧链基团
氨基 羧基
2、结构特点:
① 每种氨基酸分子中至少都含有一个氨基和一个羧 基,并且连接在同一个碳原子上,故称α -氨基酸 (脯氨酸除外:亚氨基——NH2+)。 ②除甘氨酸的R为H外,其他氨基酸的Cα 是不对称 碳原子,因此具有L型与D型两种不同的构型,组成 人体的都是L型。 ③不同氨基酸的R侧链各异,它 们的分子量、解离程度和化学反 应性质也不相同。

第二章蛋白质的结构和生理功能

第二章蛋白质的结构和生理功能

二、氨基酸的性质和生理特点 (一)性质 1.物理性质 无味、无色晶体物质; 熔点200-300oC之间,会分解成胺和CO2; 具有较高的介电常数; 一般可溶于水,其水溶液为无色透明液体, 溶解度各不相同; 一般不溶于有机溶剂; 均溶于稀酸或稀碱。
2.氨基酸的晶体存在形式
氨基酸晶体是以离子晶格组成的,维系晶 格中质点的作用力是较强的静电吸引力,因而 熔点高,而一般的有机化合物晶体是由分子晶 格组成,其维系力为较弱的范德华力,此类物 质熔点较低。
蛋白质功能的多样性
• 具有储藏氨基酸的功能。用作有机体及其胚胎 或幼体生长发育的原料。如蛋类中的卵清蛋白、 乳中的酪蛋白、小麦种子中的麦醇蛋白。 • 运输功能。脊椎动物红细胞里的血红蛋白、无 脊椎动物中的血蓝蛋白在呼吸过程中起着输送 氧气的作用;血液中的脂蛋白随血流输送脂质; 生物氧化过程中的某些色素蛋白如细胞色素C 等起电子传递体的作用。
• • • • 氨基酸排列随机性 周期性的重复未发现 二硫键的数目和位置也没有明显的规律 每种蛋白质化学结构的独特性 在同源蛋白质氨基酸顺序中有许多位置的氨基 酸对所有种属来说是相同的(不变残基),但 其他位置的氨基酸却不同(可变残基)。这种 相似性被称为顺序同源现象。
蛋白质一级结构的重要性
氨基酸组成及顺序不同会导致蛋 白质生物功能的改变(病态现象)。如 镰刀形细胞贫血病就是血红蛋白(4个 亚基,582个氨基酸组成)中的一个谷 氨酸变为缬氨酸导致的。 一级结构是立体结构的基础。
在研究蛋白质氨基酸组成时一般先用完全 水解的方法,将蛋白质水解成各种氨基酸的 混合物,然后采用高效液相色谱等方法进行 定量测定。通常采用的水解方法有酸水解、 碱水解和酶水解。
酸水解
用硫酸(6 mol/L)或盐酸(4 mol/L)煮沸回流20小时。

第二章--蛋白质的结构和功能

第二章--蛋白质的结构和功能

COOH
COO-
H2N C H 或 H3N+ C H
R
R
R代表氨基酸侧链
1.组成蛋白质的氨基酸都是α-氨基酸 (脯氨酸为α-亚氨基酸)。
α -碳原子,即与-COOH相邻碳原子。 氨基均连在α -碳原子上,故为α-氨基 酸。
2.组成人体蛋白质的氨基酸都是 L 型,即 L-α-氨基酸。
不同的氨基酸其侧链不同,除甘氨酸外,其余 氨基酸的α-碳原子分别连接 4 个不同原子或基团, 是手性碳原子,有两种不同的构型,即L型和D型。
(一)氨基酸的命名
1.系统命名法 以 羧基为母体,碳原子的 位次以阿拉伯数字或希 腊字母标示。
2.俗称
H3C CH COOH NH2
α -氨基丙酸(丙氨酸)
(二)氨基酸的结构特点
自然界存在的氨基酸有300多种,但组成人体 蛋白质氨基酸仅有20种,且都有特异的遗传密码, 为编码氨基酸。
氨基酸的结构通式可用下式表示:
COOH
H2N C H R
L-α -氨基酸
COOH
H C NH2 R
D-α -氨基酸
(三)氨基酸的分类
(三)氨基酸的分类
基本氨基酸的分类方法一: 按侧链结构分类
脂肪族氨基酸(15种) 芳香族氨基酸(3种) 杂环氨基酸(2种)
(三)氨基酸的分类
基本氨基酸的分类方法二: 按侧链R基团极性分类 非极性(疏水)氨基酸(9种) 极性不带电荷氨基酸(6种) 极性带正电荷氨基酸(碱性氨基酸)(3种) 极性带负电荷氨基酸(酸性氨基酸)(2种)
蛋白质是由许多氨基酸单位通过肽键连接形成 的具有特定分子结构的高分子化合物。
蛋白质的分子结构可分为一级、二级、三级和 四级。一级结构是蛋白质的基本结构,二级、 三级、四级结构称为高级或空间构象。

第2章蛋白质的结构与功能

第2章蛋白质的结构与功能

O
O
NH2-CH-C-N-CH-C
H H H OH
肽键
甘氨酰甘氨酸
* 肽是由氨基酸通过肽键缩合而形成的化 合物。
* 两分子氨基酸缩合形成二肽,三分子氨 基酸缩合则形成三肽……
* 由十个以内氨基酸相连而成的肽称为寡 肽(oligopeptide),由更多的氨基酸相连 形成的肽称多肽(polypeptide)。(分界..)
亮氨酸 leucine Leu L 5.98
异亮氨酸 isoleucine Ile I 6.02
苯丙氨酸 phenylalanine Phe F 5.48
脯氨酸 proline
Pro P 6.30
目录
2. 极性中性氨基酸
色氨酸 tryptophan Trp W 5.89
丝氨酸 serine
Ser S 5.68
高级 结构
一、蛋白质的一级结构
★定义(primary structure) 蛋白质的一级结构指在蛋白质分子中,从N端
至C端的氨基酸的排列顺序。
主要的化学键 肽键,有些蛋白质还包括二硫键。
氨基酸与多肽
(一)肽(peptide)
* 肽键(peptide bond)是由一个氨基酸的羧基与另一个氨基酸的-氨基脱水缩合 而形成的化学键。
细胞的各个部分都含有蛋白质。 含量高:蛋白质是细胞内最丰富的有机
分子,占人体干重的45%,某些组织含量更 高,例如脾、肺及横纹肌等高达80%。
2. 蛋白质具有重要的生物学功能
1)作为生物催化剂(酶) 2)代谢调节作用(TRH) 3)免疫保护作用:IgA,IgM, IgM, IgG; 4)物质的转运和存储(Hb) 5)运动与支持作用 6)参与细胞间信息传递

第二章 蛋白质的结构与功能

第二章 蛋白质的结构与功能

无规则卷曲( random coil )
定义:没有明确规律性的那部分肽段的结构。
但这些“无规则卷曲”也象其他二级结构那样是 明确而稳定的结构。即蛋白质在其多肽链的不同 区段可形成不同的二级结构。
作用:赋予蛋白质较大的构象柔性,常构成蛋
白质的特定功能部位。
(三)超二级结构(supersecondary structure)和 结构域(domain)
H3N
C C R1
+
O C
H
H
+
H
C C R2
O O-
N
O-
H -H2O
H
+
H N C C
O O-
H3N
C
H R2 R1 peptide bone
Features of peptide bond
键长为0.132nm ,介于单键(键长为
0.147nm)与双键(键长为0.128nm) 之间。 具双键的性质,即不能旋转。
β-折叠的要点:
多肽链较伸展, 遇Cα发生折叠, R侧链交错 位于锯齿状(hackle)结构上下方; 两条或多条肽链片段平行排列,靠链间氢 键稳定构象(-CO和-NH) ; 两条肽链的走向可以是顺向平行或反向平 行(残基间距离前者为0.65nm,后者为 0.70nm)或混合排列。
-转角 ( -turn)
α-螺旋的要点:
一般为右手螺旋; 每个螺旋圈含3.6个氨基酸残基,螺距为 0.54nm; 螺旋圈之间通过氢键(aa1的C=O和aa4 的-NH之间)维持结构稳定; R侧链位于螺旋外侧,其大小、形状及 电荷等是影响此结构形成的主要因素。
例1
Hair α-keratin is an elongated aα-helix with somewhat thicker domains near the amino and carboxy termini. Pairs of these helices are interwound, probably in a lefthanded sense, to form two-chain coiled coils.

第二章 蛋白质的结构与功能

第二章  蛋白质的结构与功能

第二节

蛋白质的分子结构
蛋白质是由许多氨基酸单位通过肽键连接起 来的,具有特定分子结构的高分子化合物。

蛋白质的分子结构可人为划分为一、二、三、 四级结构。除一级结构外,蛋白质的二、三、 四级结构均属于空间结构,即构象。
构象是由于有机分子中单键的旋转所形成的。 蛋白质的构象通常由非共价键(次级键)来维 系。
人胰岛素的一级结构
测定蛋白质的一级结构的主要意义: 一级结构是研究高级结构的基础。
可以从分子水平阐明蛋白质的结构与功 能的关系。 可以为人工合成蛋白质提供参考顺序。
二、蛋白质的空间结构
空间结构:指Pr分子内各原子围绕某些 共价键的旋转而形成的各种空间排布及 相互关系,称为Pr的构象。 主链构象 侧链构象
手性C原子:与α-C原子相连的四个 原子或基团各不相同。
L-α -氨基酸的结构通式
(三)氨基酸的分类 自然界存在的aa有300种,但作为 蛋白质基本单位的aa有20种,且 都有特异的遗传密码,为编码aa。
根据R侧链基团解离性质的不同,可将 氨基酸进行分类: 1.酸性侧链氨基酸——Glu,Asp;侧 链基团在中性溶液中解离后带负电荷 的氨基酸。
一、蛋白质的一级结构
1、概念: 蛋白质的一级结构是指蛋白质多肽链中通过肽 键连接起来的氨基酸的排列顺序,即多肽链的 线状结构。 2、 维系蛋白质一级结构的主要化学键为肽键 3、胰岛素(Insulin)由51个氨基酸残基组成, 分为A、B两条链。A链21个氨基酸残基,B链30 个氨基酸残基。A、B两条链之间通过两个二硫 键联结在一起,A链另有一个链内二硫键。
2、两性解离与等电点
A、aa是两性电解质:有碱性的-NH2 和酸性的-COOH B、等电点(PI): aa处于两性离子时溶液的PH值

第二节蛋白质的结构与功能

第二节蛋白质的结构与功能

第二章蛋白质的结构与功能蛋白质(protein)是生命的物质基础。

种类繁多,人体含蛋白质种类在10万种以上。

是生物体含量最丰硕的生物大分子,约占人体固体成份的45%,细胞干重的70%。

几乎所有的器官都含有蛋白质,并各自具有其特殊的结构,因此决定了蛋白质功能的多样性。

第一节蛋白质的分子组成(protein composition and construction )一、蛋白质的元素组成蛋白质的元素要紧有碳(50%~55%)、氢(6%~7%)、氧(19%~24%)、氮(13%~19%)。

大部份蛋白质还含有硫,有的还含有少量的磷或铁、锰、锌、铜、钴、钼,个别还含有碘。

蛋白质元素组成特点:含氮量很接近,平均为16%。

1g氮相当于6.25g蛋白质。

测定诞生物样品的含氮量可按下式计算出其蛋白质大致含量:100g样品中蛋白质含量(g%)=每克样品中含氮克数××100二、蛋白质的大体组成单位——氨基酸(the basic unit of protein composition——amino acid)氨基酸(amino acid)是组成蛋白质的大体单位。

(一)氨基酸的命名(略)(二)氨基酸的结构特点自然界中的氨基酸有300余种,组成人体蛋白质的氨基酸仅有20种。

都有相应的遗传密码,故又称为编码氨基酸。

氨基酸的结构通式可用下式表示(R为氨基酸侧链):尽管各类氨基酸结构各不相同,但都具有如下特点:1.组成蛋白质的氨基酸都是α-氨基酸。

即氨基均连在α-碳原子上。

脯氨酸为α-亚氨基酸。

2.除甘氨酸外,其余氨基酸的α-碳原子是不对称碳原子,有两种不同的构型,即L型和D型。

组成人体蛋白质的氨基酸都是L型,即L-α-氨基酸。

L-α-氨基酸 D-α-氨基酸(三)氨基酸的分类氨基酸的按侧链的结构和理化性质可分为4类:非极性侧链氨基酸:甘氨酸(Gly),丙氨酸(Ala),缬氨酸,亮氨酸,异亮氨酸,丙氨酸,脯氨酸(Pro);侧链为烃基、吲哚环或甲硫基等非极性疏水集团。

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+OH-
R CH COOH
NH3+
+H+
R CH COO- +OH-
NH3+
+H+
R CH COONH2
pH<pI
pH=pI
pH>pI
阳离子
兼性离子
阴离子
2. 紫外吸收
色氨酸、酪氨酸的最大吸收峰在 280 nm 附近。
大多数蛋白质含有这两种氨基酸残基, 所以测定蛋白质溶液280nm的光吸收值是分析 溶液中蛋白质含量的快速简便的方法。
O +
NH2-CH-C
H OH
甘氨酸
O NH-CH-C
H H OH
甘氨酸
O
O
-HOH
NH2-CH-C-N-CH-C
H HH OH
肽键
甘氨酰甘氨酸
➢ 两分子氨基酸缩合形成二肽,三分子氨基酸缩合则形成三肽……
➢ 由十个以内氨基酸相连而成的肽称为寡肽(oligopeptide),由更多的氨基酸相连形 成的肽称多肽(polypeptide)。
(一)氨基酸的一般结构
中心一个α 碳原子--- -- Cα 连接一个氨基基团 --- --- NH2
一个羧基基团--- --- COOH 一个氢原子------ --- H 一个不同的R基团--- 侧链
COOH
NH2

H
R
L-氨基酸和D-氨基酸 蛋白质中只存在L-氨基酸
(二)氨基酸的分类
1. 非极性疏水性氨基酸 2. 极性中性氨基酸 3. 酸性氨基酸 4. 碱性氨基酸
中文名
非极性疏水性氨基酸 甘氨酸
丙氨酸 脯氨酸 缬氨酸 亮氨酸 异亮氨酸 蛋氨酸 苯丙氨酸 极性中性氨基酸 酪氨酸 色氨酸 丝氨酸 苏氨酸 半胱氨酸 天冬酰胺 谷氨酰胺
带正电的碱性氨基酸 赖氨酸 组氨酸 精氨酸
带负电的酸性氨基酸
天冬氨酸
表2-1 氨基酸的分类
缩写
pKa
英文名
三字符
一字 符
CpOKO1(H)- pK2(-NH3+) pKR(R基)
1.含量大:占人体固体成分的45% 2.分布广:遍及全身各组织细胞。 3.种类多:人体内有10万余种。自然界有100万之多。 4.功能繁(复)杂:每种蛋白质都有其特异功能。
第一节 蛋白质的分子组成
组成蛋白质的元素
主要有C、H、O、N和S。 有些蛋白质含有少量磷或金属元素铁、铜、锌、锰、钴、钼,个别蛋白质还含有 碘。
(三)氨基酸的理化性质 1. 两性解离及等电点 氨基酸是两性电解质,其解离程度取决于所处溶液的酸碱度。
等电点(isoelectric point, pI)
在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成 为兼性离子,呈电中性。此时溶液的pH值称为该氨基酸的等电点。
R CH COOH NH2
M
2.28
9.21
5.74
pheninyelalan Phe
F
1.83
9.13
5.48
tyrosine Tyr
Y
2.20
tryptophan Trp
W
2.38
serine Ser
S
2.21
threonine Thr
T
Hale Waihona Puke 2.11cysteine Cys
C
1.96
asparagine Asn
N
2.02
glutamine Gln
芳香族氨基酸的紫外吸收
3. 茚三酮反应
氨基酸与茚三酮水合物共热,可生成蓝紫色化合物,其最大吸收峰在 570nm处。由于此吸收峰值与氨基酸的含量存在正比关系,因此可作为氨基酸定量 分析方法。
二、肽
(一)肽(peptide) 氨基酸通过肽键缩合而成的化合物称为肽。
* 肽键(peptide bond)是由一个氨基酸的-羧基与另一个氨基酸的-氨基脱水缩合 而形成的化学键。
Q
2.17
9.11 9.39 9.15 9.62 10.28
8.80
9.13
10.07
5.66
5.89 5.68
5.87
8.18
5.07
5.41
5.65
lysine Lys
K
2.18
8.95
histidine His
H
1.82
9.17
arginine Arg
R
2.17
9.04
aspartic acid
+ N H 3
+ N H 3
二硫键
胱氨酸
记忆口诀
甘、丙、缬、亮、异,三、四碳烃基。 丙、丁羟丝、苏。(半)胱、蛋含有硫。 酸有天冬、谷;碱有精、赖、组。 苯、酪、色、脯环;中性天、谷胺。
要点:
1.组成蛋白质的编码氨基酸只有20种。 2.除G外,其他编码氨基酸均为L-型。 3.P为环状亚氨基酸。 4.含羟基氨基酸有:S、T、Y。 5.含硫氨基酸有:C、M。 6.芳香族氨基酸有:F、Y、W。 7.支链氨基酸有:V、L、I。 8.酸性氨基酸有:D、E。 9.碱性氨基酸有:R、K、H。
Asp
D
1.88
9.60
10.53 6.00 12.48
3.65
9.74 7.59 10.76
2.77
1. 非极性疏水性氨基酸
2.极性中性氨基酸
3.带正电荷的碱性氨基酸
4.带负电荷的酸性氨基酸
二硫键的形成
-OOC-CH-CH2-SH +
+NH3
-HH
HS-CH2-CH-COO+NH3
-O O C -C H -C H 2-SS-C H 2-C H -C O O -
各种蛋白质的含氮量很接近,平均为16%。 测定生物样品中的含氮量,就可以根据以下公式推算出蛋白质的大致含量:
100克样品中蛋白质的含量 ( g % ) = 每克样品含氮克数× 6.25×100
1/16%
一、氨基酸(amino acid)
氨基酸是蛋白质的基本组成单位。 存在自然界中的氨基酸有300余种,但组成人体蛋白质的氨基酸仅有20种,除 甘氨酸外,均属 L-α-氨基酸 。
第二章蛋白质结构与功能
第二章 蛋白质结构与功能
第一节 蛋白质的分子组成 第二节 蛋白质的分子结构 第三节 蛋白质结构与功能的关系 第四节 蛋白质的理化性质及其分离纯化
概述
蛋白质(protein)是生命的物质基础。 蛋白质是由DNA编码的氨基酸组成的。
蛋白质的重要性: 蛋白质是生命的物质基础,一切生命现象都离不开蛋白质。
pI
glycine Gly
G
2.34
9.60
5.97
alanine Ala
A
2.34
9.69
6.01
proline Pro
P
1.99
10.96
6.48
valine Val
V
2.32
9.62
5.97
leucine Leu
L
2.36
9.60
5.98
isoleucine Ile
I
2.36
9.68
6.02
methionine Met
➢ 多肽链(polypeptide chain)是指许多氨基酸之间以肽键连接而成的一种结构。 ➢ 肽链中的氨基酸分子因为脱水缩合而基团不全,被称为氨基酸残基(residue)。
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