临床药理学知识模型构建研究

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药物药理动力学的模型与仿真

药物药理动力学的模型与仿真

药物药理动力学的模型与仿真药物药理动力学是药物在体内的吸收、分布、代谢和排泄过程的研究,它是药物临床应用和治疗效果评估的基础。

为了更好地理解和预测药物的药理学特性,研究人员开发了各种模型和仿真方法,以模拟和预测药物在体内的行为。

本文将介绍药物药理动力学的模型和仿真方法,并探讨其在药物研发和治疗优化中的应用。

一、药物药理动力学模型药物药理动力学模型是一种定量描述药物在体内的行为和效应的数学模型。

常见的药物药理动力学模型包括生理药动模型、药物药理模型和药效学模型。

1. 生理药动模型生理药动模型描述了药物在体内吸收、分布、代谢和排泄的生理过程。

它基于生理学的基本原理,通过数学方程组和参数估计方法,模拟和预测药物在不同组织和器官中的浓度变化。

常用的生理药动模型包括均衡模型、单室模型和多室模型。

2. 药物药理模型药物药理模型描述了药物与体内靶点之间的相互作用和效应。

它通过建立药物与受体或酶的结合方程,研究药物与靶点之间的关系。

常见的药物药理模型包括剂量-反应模型、浓度-效应模型和药物相互作用模型。

3. 药效学模型药效学模型描述了药物的治疗效果和药物-受体系统的动力学过程。

它通过建立药物剂量与疗效之间的关系方程,预测药物的治疗效果并优化剂量方案。

常用的药效学模型包括药物剂量-疗效模型、剂量-时间-疗效模型和药物组合模型。

二、药物药理动力学仿真药物药理动力学仿真是运用计算机技术模拟和预测药物在体内行为的过程。

它基于药物药理动力学模型和数据,通过数值计算和模拟方法,模拟药物在体内的动力学过程,预测药物的药效和疗效。

药物药理动力学仿真可以分为基于系统的仿真和基于个体的仿真。

1. 基于系统的仿真基于系统的仿真是通过建立整体的药动学模型,模拟和预测药物在整个人体系统中的行为。

这种仿真方法可以考虑多个器官和组织之间的相互作用,预测药物在人体内的浓度分布和效应变化。

常用的基于系统的仿真软件包包括Simcyp、GastroPlus等。

临床药理学研究内容

临床药理学研究内容

临床药理学研究内容临床药理学是研究药物在人体内的作用机制、药效、药代动力学和药物相互作用等内容的学科。

随着现代医学的发展,临床药理学已成为一个重要的研究领域,对于指导临床用药、提高治疗效果具有重要意义。

下面将介绍一些常见的临床药理学研究内容。

一、药物的药效学研究药物的药效学研究是临床药理学的重要内容之一。

它主要研究药物在体内的作用机制和药理效应。

通过实验室药理学和临床药理学的研究,可以全面了解药物的药效学特性,包括药理作用机制、药理反应、药物与受体的作用关系等。

这些研究成果对于指导合理用药、改进药物疗效具有积极的意义。

二、药物的药代动力学研究药代动力学是研究药物在体内的吸收、分布、代谢和排泄过程的学科。

该研究内容对于掌握药物在体内的动态过程、调节用药剂量、预防药物副作用等方面具有重要意义。

通过药代动力学研究,可以及时发现和解决药物的代谢失调、药物相互作用和个体差异等问题,为临床治疗提供可靠的依据。

三、药物的药物相互作用研究药物相互作用是指两种或多种药物在联合使用时,因相互作用而改变各自的药效和毒性反应的现象。

药物相互作用研究是临床药理学的重要内容之一。

通过该研究,可以了解不同药物之间的相互作用机制,有效预防和识别不良的药物相互作用,制定个性化用药方案,避免临床用药中出现不良反应或者不良事件。

四、药物的临床评价研究药物的临床评价研究是通过对药物在人体内的临床应用效果、安全性、用药剂量和剂型等因素进行全面评估,从而为临床用药提供理论依据。

通过该研究,可以全面了解药物在临床应用过程中的表现和特点,促进临床用药的合理应用,提高临床治疗效果。

临床药理学的研究内容涵盖了药物的药效学、药代动力学、药物相互作用和临床评价等多个方面。

这些研究内容对于指导临床用药、提高治疗效果具有重要的意义,为现代医学的发展和临床治疗的改进提供了重要的理论和实践依据。

临床药理学研究内容

临床药理学研究内容

临床药理学研究内容临床药理学是研究药物在人体内作用机制、药物相互作用、药物代谢和排泄、药物剂量和药效关系、药物不良反应等方面的学科。

它旨在帮助医师和临床医生更好地理解各种药物的作用和使用,从而提高治疗效果,减少不良反应。

本文将介绍临床药理学的研究内容,包括研究方法、临床应用和未来发展方向等方面。

一、临床药理学研究内容1.药物在人体内的作用机制:研究不同药物在人体内的具体作用机制,包括药物与受体的结合、信号转导途径、细胞内信号传导等,从而理解药物的作用方式和效果。

2.药物代谢和排泄:研究药物在人体内的代谢途径和排泄途径,包括肝脏、肾脏等器官参与的代谢和排泄过程,从而了解药物的代谢动力学和药代动力学特征。

3.药物相互作用:研究不同药物之间的相互作用,包括药物之间的药代动力学和药效动力学相互影响,从而指导临床合理用药。

4.药物剂量和药效关系:研究药物剂量与药效之间的关系,包括药效曲线、最大耐受剂量、最小有效剂量等参数,从而确定合适的药物剂量和使用方法。

5.药物不良反应:研究药物的不良反应类型、发生机制和预防措施,从而减少不良反应的发生和影响,确保患者用药的安全性和可控性。

6.新药临床试验:研究新药在人体内的药效和安全性,包括药代动力学和药效动力学参数的测定,从而为新药的上市提供科学依据。

二、临床药理学研究方法1.体外实验:利用细胞培养、体外器官模型等方法,研究药物与受体的结合、信号通路的激活和抑制等机制。

2.动物实验:通过动物实验,研究药物在动物体内的药代动力学和药效动力学特征,从而为临床应用提供实验依据。

3.临床试验:通过临床试验,研究药物在人体内的药效和安全性,包括单剂量试验、多剂量试验、交叉试验等方法。

4.药物代谢动力学研究:利用体内外标记技术,研究药物在人体内的代谢动力学过程,包括药物的代谢途径、代谢产物形成、代谢动力学参数测定等。

5.流行病学方法:利用流行病学调查方法,研究药物使用和不良反应的相关因素,从而为药物安全性评价提供数据支持。

药物在体内药动学和药效学模型构建与应用

药物在体内药动学和药效学模型构建与应用

药物在体内药动学和药效学模型构建与应用药物在体内的药动学和药效学模型构建与应用药物作为一种治疗疾病的手段,在人类历史上已有数千年的应用。

药物的有效性和安全性是治疗疾病的关键因素之一。

药物在体内的作用和运转过程,是药物设计和临床应用的重要考量因素。

药物的药动学和药效学模型的构建和应用,可以帮助人们更好地了解药物在体内的运转过程和规律,从而提高药物的疗效和安全性。

一、药物的药动学药物的药动学是研究药物在体内吸收、分布、代谢和排泄动力学过程的科学。

药物在体内的药动学参数包括最大浓度、最小浓度、时间、半衰期等。

药物的药动学过程受到多方面因素的影响,包括药物的性质、个体差异、肝功能、肾功能等。

药物的吸收过程是指药物从给药途径进入体内的过程。

药物吸收的速度和程度受多种因素影响,如药物性质、药物形式、给药方式等。

药物在胃部和小肠部分别可能发生两种不同的吸收过程:passive diffusion和carrier-mediated transport。

药物被呈现在血浆中的最大浓度称作Cmax,Cmax越高,颠峰时间越短,说明药物的吸收速度越快。

药物的分布过程是指药物在体内组织和器官间扩散的过程。

药物的分布过程同样受多种因素影响,如药物性质、靶组织可及性、血浆蛋白结合率等。

药物的分布过程最终会形成药物浓度平衡,在药物的分布范围内,组织和器官的药物浓度基本相同。

药物的代谢过程是指药物在体内代谢成代谢产物的过程。

药物代谢的主要场所在肝脏,也可在肾脏、肠道等地发生。

药物代谢的目的是加速药物的排泄,以便维持药物的稳态血药浓度。

药物代谢可以分为两个阶段,第一阶段药物经过氧化、还原和水解等反应,第二阶段则是各种代谢产物的结合、脱离和排泄。

药物的排泄过程是指药物从体内排出的过程。

药物的排泄可以经过尿液、汗液、呼吸等多种排泄方式。

其中,药物在肾脏中的排泄是最为重要的排泄途径。

药物的半衰期是药物排泄过程中最为重要的药动学参数,半衰期越短,说明药物排泄的速度越快。

基于大数据的药理学模型研究

基于大数据的药理学模型研究

基于大数据的药理学模型研究近年来,随着科技的飞速发展,大数据逐渐成为了药理学研究的重要手段之一。

大数据药理学,简称PharmacoBigData学,指基于大数据平台,运用数据科学技术、计算生物学及系统生物学等辅助手段,对疾病和药物的作用机制进行研究。

通过对大量的医学数据进行分析和挖掘,从而实现对药物的快速筛选和精准治疗,以期达到药物的安全、有效、稳定、便携等目标。

大数据药理学模型主要的应用领域包括:药物设计、药效预测、剂量优化、个体化用药、药物不良反应监测以及药物再评价等。

其中,药物再评价是大数据药理学的重点方向之一。

传统的药物再评价方法有许多局限性:样本数量有限、数据质量低、实验耗时长等。

而基于大数据的药理学模型则可以深度挖掘,从而可识别一些潜在的不良反应。

在大数据平台下,药物不良反应研究可以立足于巨量的数据样本和数据特征,在此基础上探寻药物不良反应与基因、表型、环境等因素之间的相互关系,并利用机器学习算法进行药理学大数据挖掘,从而更快速准确地发现新的药物不良反应。

基于大数据的药理学模型研究可以极大地提高药物再评价效率。

下面简单介绍一下这个模型的研究流程:首先,大规模的医学数据需要被收集。

这个过程涉及到现有的各种医学数据,其中包括临床试验、电子医疗记忆、医学文献等等。

这些数据需要被整合到一个开放的大型数据库中。

其次,需要对数据进行标准化和处理。

因为这些数据是不同来源、不同格式、不同性质的,而且存在着噪声和错误。

最后,是研究药品不良反应的预测和挖掘。

大数据平台可以辅助药理学家快速筛选并确定潜在的药品不良反应。

通过对数据进行深入分析,并利用机器学习算法对药理学大数据进行挖掘,从而发现新的药品不良反应。

药理学大数据挖掘的重要工具包括:基于机器学习的数据挖掘分析方法、深度学习、自然语言处理、人工智能等。

尽管大数据药理学模型是一种可能的有效方法,但是也存在一些问题。

其中一个显著的问题是数据的来源和准确性。

临床前药理学研究主要药效学研究方法

临床前药理学研究主要药效学研究方法

临床前药理学研究主要药效学研究方法临床前药理学研究是新药开发过程中的重要环节,它描述了药物在体内的药效学特征,为药物疗效和安全性的评估提供了重要依据。

在这篇文章中,我将全面评估临床前药理学研究的主要药效学研究方法,并分享我对这个主题的个人观点和理解。

1. 总论临床前药理学研究的主要目的是评估药物在动物体内的药效学特征,包括药物代谢、药物动力学特性和药物的药物相互作用等。

药效学研究方法可以帮助我们全面了解药物在体内的活性和药效,为进一步的临床研究提供依据。

2. 体内活性评估方法2.1 体外实验体外实验是最常用的初步筛选药效学特性的方法之一。

通过体外实验,我们可以研究药物与靶标的相互作用,例如药物与酶的结合情况。

可以使用细胞模型评估药物对细胞活性的影响,例如细胞增殖、细胞凋亡等。

2.2 动物模型动物模型是临床前药理学研究中常用的工具。

通过在动物体内进行实验,可以评估药物在体内的代谢状况、药物动力学特性以及药物的效果和副作用。

常用的动物模型包括小鼠、大鼠、猴子等。

3. 药物代谢研究方法药物代谢研究是临床前药理学研究中重要的一部分。

药物代谢的研究可以帮助我们了解药物在体内的代谢机制、代谢产物的生成过程以及药物的代谢途径。

常用的药物代谢研究方法包括体外代谢实验、体内代谢实验以及药物代谢产物的鉴定和确定。

4. 药物动力学研究方法药物动力学是临床前药理学研究中的重要内容。

药物动力学研究可以帮助我们了解药物在体内的吸收、分布、代谢和排泄的过程。

常用的药物动力学研究方法包括药物的血药浓度测定、药物的药物动力学参数计算以及药物的体内外动力学特性比较。

5. 药物相互作用研究方法药物相互作用是临床前药理学研究中的重要内容。

药物相互作用研究可以帮助我们了解药物之间的相互作用机制以及药物之间的协同作用或拮抗作用。

常用的药物相互作用研究方法包括药物的相互作用筛选实验、药物的相互作用机制研究以及药物相互作用的影响评估。

总结回顾:临床前药理学研究的主要药效学研究方法涵盖了体内活性评估、药物代谢研究、药物动力学研究和药物相互作用研究。

“结构模型”在药理学教学中的应用初探

“结构模型”在药理学教学中的应用初探

“结构模型”在药理学教学中的应用初探结构模型是一种通过模拟、构建药物分子结构的教学模型。

它可以以三维形式展现出药物分子的立体结构,让学生充分了解和理解药物分子的空间构型和功能组成。

这对于在药理学教学中帮助学生理解药物分子与生物体内受体的相互作用和作用机制至关重要。

目前,在国内外一些高校的药学专业中,结构模型已经成为了药理学教学的重要教学手段。

教师们会使用各种形式的结构模型,例如分子模型、球棍模型、立体模型等,来辅助教学。

学生可以通过观察和操作结构模型,更加直观地了解药物的结构特征、作用机理等内容,提高学习效率和理解深度。

二、结构模型对药理学教学的意义1. 提高学生的学习兴趣2. 帮助加深学生对药物分子结构的理解结构模型可以将药物分子的立体结构形象地展现出来,从而帮助学生更加深入地理解药物的分子结构特征。

这有利于学生加深对药物物质的认识,有助于他们将理论知识与实际应用相结合,提高他们的药物设计和研发能力。

3. 拓展学生的思维空间通过观察和操作结构模型,学生可以在空间中模拟药物分子的结构,从而拓展了他们的思维空间。

这有助于学生理解药物分子和生物体内受体的相互作用方式,提高他们的科学研究能力和解决问题的能力。

结构模型在药理学教学中的应用已经取得了初步成果,但是仍然存在一些问题和挑战,未来有待进一步探索和应用。

1. 完善结构模型的应用范围目前,结构模型主要用于教学实验室中的药理学实验教学,应用范围相对有限。

未来可以进一步拓展结构模型的应用范围,例如在药物设计和研发领域,利用结构模型模拟和分析药物分子的结构特征,为新药研发提供理论指导和实践支持。

2. 加强结构模型的教学研究目前对结构模型在药理学教学中的应用研究还比较薄弱,未来可以加强结构模型的研究,探索其更加深层次的应用价值和未来发展方向。

在国内一些高校的药学专业中,结构模型的应用还不够普及,师资力量和教学条件也存在一定压力。

未来可以通过在教学大纲中加入结构模型应用的教学内容,提高教师的教学水平,优化教学环境,从而推广结构模型在药理学教学中的应用实践。

临床药理学研究内容

临床药理学研究内容

临床药理学研究内容临床药理学是药理学的一个重要分支,它主要研究药物在人体内的作用机制、药效学、药物动力学和临床应用等内容。

随着临床药理学的发展,人们对于药物的使用和管理也有了更深入的了解,为药物治疗的安全性和有效性提供了更多的科学依据。

下面我将针对临床药理学的研究内容,从药物的作用机制、药效学、药物代谢与动力学、药物不良反应、药物相互作用等方面进行详细阐述,希望能对您有所启发。

一、药物的作用机制药物的作用机制是指药物与生物体内所产生的生物效应的关联。

临床药理学通过研究药物的分子结构和生物活性,探讨药物与受体、酶、离子通道等的相互作用,从而揭示药物的作用机制。

抗生素通过抑制细菌的生长来发挥抗菌作用,抗肿瘤药物则通过干扰肿瘤细胞的增殖来达到治疗目的。

了解药物的作用机制有助于合理使用药物,并在临床上减少不良反应的发生。

二、药效学药效学是研究药物在人体内所产生的生物效应的科学。

临床药理学通过研究药物的剂量-效应关系,确定药物的最小有效剂量和最大耐受剂量,评价药物的疗效和毒性,为临床用药提供合理的参考依据。

药物的药效学研究对于明确治疗方案和优化用药方案都具有重要意义。

三、药物代谢与动力学药物代谢是指药物在人体内受到生物转化作用的过程,而药物动力学则是研究药物在体内吸收、分布、代谢和排泄的规律。

通过研究药物的代谢途径、影响因素和药物动力学参数,可以了解药物在人体内的命运和清除过程,预测药物的代谢和排泄速率,为临床用药提供科学依据,并有效避免药物在体内的积累导致的不良反应。

四、药物不良反应药物不良反应是指在正常用药剂量下,药物对机体产生的各种不良反应。

临床药理学通过研究药物不良反应的发生机制、特点、预防和处理策略,可以减少药物的不良反应发生率,提高患者的用药安全性。

五、药物相互作用药物相互作用是指两种或多种药物共同应用时,由于相互影响而产生的药物效应的改变。

临床药理学通过研究不同药物之间的相互作用机制和影响规律,为临床用药方案的制定和用药管理提供科学依据。

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临床药理学知识模型构建研-!沈柳侯丽康宏宇吴萌郑思李姣(中国医学科学院/北京协和医学院医学信息研究所北京100020)〔摘要〕分析临床药理学知识表示与模型研究现状,阐述临床药理学知识模型构建技术路线、知识来源、模型框架和具体方法,以非小细胞肺癌为例介绍模型应用并对可行性进行验证,最后提出不足并展望未来 发展方向。

〔关键词〕临床药理学;知识模型;非小细胞肺癌;精准医学〔中图分类号〕0- 056 〔文献标识码〕A〔DOI〕10. 3969/j.issn. 1673 -6036. 2018. 04. 012Study on Building of Clinical Pharmacology Knowledge Model SHENLiu,HOULi,KANG Hong -y u,WUMeng,ZHENG Si! LI Jiao^ 1,591116 of @6='<11 Information,(Mnese #€0=01? of @€='〇! 8以€02€$/卩€[1-@€='〇1 College, Beiji,- D000C0,(Mua 〔Abstract〕The paper analyzes the current status of knowledge representation and knowledge models in clinical pharmacology,andexpatiates the technical r oute,knowledge source,model framework and building methods of the clinical pharmacology knowledge model. Taking the non - small cell lung cancer as an example,it introduces that knowledge model applica points out the shortage and discusses future trends of the study.〔Keywords〕Clinical pharmacology; Knowledge model; Non - small cell lung cancer; Precision medicine1引言临床用药中同一药物作用于不同个体产生的反 应可能有明显差异,其中一些患者可以有良好的治 疗效果而另一些患者可能疗效甚微,甚至出现严重 不良反应。

患者的基因、生活环境、生活习惯、社 会环境等因素的差异都可能是这些药物反应个体差 异产生的原因,基因因素通常是这些个体差异的主 要原因。

研究药物基因组学和临床药理学对于提高〔修回日期〕2018 -03 -30〔作者简介〕沈柳,硕士研究生;通讯作者:李姣,副研究员。

〔基金项目〕国家重点研发计划“精准医学本体和语义网络构建” $项目编号+2016YFC0901901)。

治疗效果、减少患者不良反应的出现有十分重要的 意义。

以2003年美国批准上市的吉非替尼(Ge-fitinib)为例,该药对表皮生长因子受体(Epider­mal Growth Factor Receptor,EGFR)基因突变患者 的疗效更好,而针对无EGFR突变的患者,进行化 疗的效果则会更优。

当前有许多药物基因组学、药学相关的知识库 或知识组织系统,如药物银行(DrugBank)、药物 基因组学知识库(The Pharmacogenomics Knowledge­base,PharmGKB)和 一■体化医学语言系统(TheU-nified Medical Language System,UMLS)中的一■些本体资源等。

目前的知识组织系统如UMLS虽整合多 个生物医学领域的词表或词典,但它是包括生物医 学这个大领域的概念与关系,不是针对临床药理学 领域的知识进行表示,相关概念关系过于宽泛,缺 乏针对性,通常该类非针对性的知识组织系统十分• 62 •庞大,直接应用会降低机器分析和用户使用的效率。

目前基于语义网、本体等知识模型的知识组织 方式,针对临床医生、临床药师用药参考的临床药 理学领域的知识表示或知识模型的研究十分有限,因此构建临床药理学知识模型研究具有现实意义。

本研究将探讨临床药理学知识模型的构建背景与目 标、构建方法和系统体系并且以非小细胞肺癌治疗 药物作为示例说明知识模型的概念关系,以期作为 海量数据整合、管理的参考,促进疾病的精准预防、诊断与治疗。

2相关研究现状2.1临床药理学知识表示临床药理学是以人体为对象,研究药物与机体 相互作用规律的科学。

它以药理学和临床医学为基 础,阐述人体对药物的代谢规律、药物与人体及药 物之间的相互作用规律,对药物的安全性、有效性 进行研究与评价[1]。

临床药理学为指导临床的合理 用药奠定基础,随着发展其研究内容越来越丰富,包括药物安全性、临床药物代谢动力学及临床药效 学、遗传药理学、药物相互作用等[2_3]。

国际上药 学相关的知识表示与知识组织已经有比较成功的探 索,如RxNorm是药品标准的“知识图谱”,它是临 床药物标准命名表,以规范化形式(活性成分+剂 量+剂型以及商品名称)来表示临床药物,用于共 享数据,支持临床药物系统间的语义互操作[;]。

此 外《药事管理的标准医学术语集》(厘'-=〇,0.- ary Regulatory Activities,MedDRA)主要适用于编码与药品、生物制品和其他医疗产品(如医疗设 备和疫苗)相关的不良反应[5],推动各国卫生当局 和制药行业之间的产品安全性信息交流及监测。

目前现有的药学相关知识表示主要围绕药物或其不良 反应的规范化进行,对于药物和其他实体(如疾 病、药物)间的关系表示研究较少,但这类研究是 构建支持查询、推理的医学知识图谱的基础,对于 临床用药过程中药物安全、疗效控制具有十分重要 的意义。

医学知识库如Dru g Bank主要涉及药物相关 特征和药物靶标等信息,ClinVar主要包括人类基因变异和疾病关系信息,SIDER主要涉及药物化学成 分和药物不良反应及药物适应症,这几类知识库都广泛应用于基础和临床研究中。

如果可以综合患者的疾病、遗传特征和药物相互作用等关键信息,可能对患者疾病的精准诊治提供更多数据支持。

因此临床药理学知识模型的建立可以作为整合这些数据的工具,为药物的有效、安全应用和及时监测提供更全面的参考。

2.2临床药理学知识模型临床药理学知识模型应包含生物医学多学科、多维度、多领域的知识结构框架,利用本体间的相互映射、语义关系组织来构建相互关联的知识体系,形成多层次、可推理的知识模型。

目前已有学者对该类整合多学科本体信息的知识模型进行一些探索并取得一定成效,使某些领域的医学知识的表 亦更加规范与全面。

Michel Dumontiei•等人[3]对药学 领域和遗传学领域的知识整合进行探索并构建药物 基因组学本体。

对于多学科领域的知识整合是精准 医学发展的基础。

该研究对于药物、基因、疾病等 数据设计整合方案,以药物治疗为中心,包含药物 基因相互作用、药物导致的不良反应。

SiraratSam-tivijai等[7]将药物不良反应、解剖部位、基因相关本体进行关联,构建新的知识网络。

其首先利用数据挖掘方法从美国食品药品监督管理局不良事件报告系统提取与络氨酸激酶抑制剂相关的不良反应信 息,这些信息已经过国际学用语词典(M e diC alDic-rionary For Regulatory Activities,MedDRA)的标准 化表示。

在临床医生审编后将这些经MedDRA标准 化的信息放入药物不良事件本体(Ontology of Ad­verse Events,0AE)的合适层级结构中,建立与 MedDRA和解剖部位本体的语义关联,解剖部位知 识组织由Ubei•解剖学本体(Uber Anatomy Ontolo­gy)提供。

在完成上述步骤后 ,再与 X0 进行语义 关联,描述该不良事件可能发生的分子机制。

该类 知识模型构建的思路、本体选取、本体间的语义关 联情况都十分值得借鉴。

Richard D.Boyce[8]构建药 物基因组学的语义模型,利用FDA提供的包含药物 基因组信息的药物标签提取药物一生物标记物关• 63 •系,用以指导概念间语义关系的构建。

领域专家根 据标签的描述,设大系:描述类、引用关和行为指 。

其中描述类包括药物的药代动力学和药效动力学的改变;引用 包括药物的效成分、用情况、患者患病情况、遗传变异信息及与一些药物基因组数据库的&行为指包括药物剂量调整、身 查推荐、监测推荐和药物种类的推荐。

国际上的临床药理学知识表示针 与侧不尽相同,本研究旨在辅助临床医生用 ,设定临床学知识模,在知识模型指 整学、药物基因组学、遗传学、学等数据,从而在药物治疗过程中有更加综合全面地考虑。

本研究参照现有领域本体、专 著、药物相关数据库,设 3大概念,包括化学成分与药物、分子机制、疾病与表型。

将DmgBank 、ClinVar 和SIDER 中关于非小细胞肺癌的数据应用于该模型中,进而在数据填充方面验证模型的可行性。

3临床药理学知识模型构建3. 1概述知识模型(Knowledge Model ,KM )是将知识 进行形式化和结构化的 表示,以算机理与[9]。

比较有代表性的知识模语I络、概念图、资源描述框架(Resource DescriptionFramework ,RDF )、CommonKADS 知识模型框架、EXPECT 系统模型等[1$]。

本研究 建知识模型。

是享概念模型明确的、形式化规范说明[11_12]。

生物医学本体定义生物医学领域的 概念及属性,描述了概念之间的关系,明确表示医 学领域的知识[13]。

根据该知识模型的构建目的和覆 范概念和语系。

临床学知识模型应包含临床中药物治疗和学的概念与关系,同时应包括疾病发生、发展、治疗等过程中分子机制 的概念与关系。

相关概念的获取需要遵循以下原 则:概念清晰、复用专业词表概念、有领域专家 指。

3. 2技术路线与知识来源本研究技术路线,见图1,首先确定研究的领 域范畴,据领域本体、领域数据库和专著等资源对其中的概念术语进行提取。

提取的概念与术 语可能存在语义交叉或重复的现象,因此需要进一 步对概念进行归并去重处理。

再根据领域知识设定 概念层级,包括概念的层级关系和概念间关系的层系、 在明 概念和概念系 ,概念和关系的3兀组进彳了定乂,如药物-治疗-疾病,基因-是…的诊断标记物-疾病等。

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