毕赤酵母从入门到提高
毕赤酵母表达知识归纳

毕赤酵母表达知识归纳1a.配制500×BIOTIN stock solution(0.02%)有这么3种方案:1、懒人是将Biotin直接溶在去离子水中,放过夜,基本就能溶;2、急性子是将溶液配成0.02N的NaOH,就很容易溶解了;3、水浴加热,温度不能高于50度。
D-生物素是具有生物活性的生物素,也就是vitaminH。
在毕赤酵母代谢过程中,作为多种酶的辅基起作用。
天然培养基中一般可以不单独添加,因为YNB中、酵母粉、蛋白胨中均含有一定量的生物素,但是做高密度发酵还是必须要添加的。
b.有几个比较迷惑的问题请教大家:(很典型的小问题)1、制感受态细胞,OD多少比较好?pyrimidine 战友的方法:取1mlGS115过夜培养物(OD约6-10) 分装到1.5ml EP管中。
说明书还有一些文献是说在1.3左右效率高,再高了效率会很低2、关于高效转化法,文献说用(LiAc),而invitrogen的说明书说转化毕赤酵母用(LiAc)没用,要用LiCl。
Lithium acetate does not work with Pichia pastoris. Use only lithium chloride.3、YNB到底能高温灭么?有的说能有的说不能。
过滤灭菌的怎么操作?我是把滤器装好膜绑到瓶口用纱布盖上,报纸包上,瓶盖放烧杯里单灭。
然后把配好的溶液用注射器一点点推进去。
4、葡萄糖为什么在YPD里一起灭颜色很深,单灭则不会。
该115度还是121度灭?网上搜了下,都有人用!5、电转化参数用400欧还是200欧?有的用400,有的还专门说不是用400。
都是从园里看到的!电击参数:1.5KV,25uF,200欧姆(不是400)6、电转后,在MD平板上长的应该就是整合了目的基因的重组子了吧?如果不想筛高拷贝的,是否PCR验证一下即可?网友的回答:ynb最好不灭菌,我是0.22um过滤处理的。
invitrogen手册上可以灭菌的。
毕赤酵母高效表达策略-1

1.基因的内在特性主要包括mRNA 5’端非翻译区(5’2 U TR)、基因的A +T 组成和密码子的使用频率3 个方面。
由于巴斯德毕赤酵母中乙醇氧化酶的表达量极高(占胞内可溶蛋白的30% 以上) 因此为了有高的蛋白表达量,维持外源基因mRNA 5’-U TR。
尽可能和AOXlmRNA 5’-U TR 相似是必需的, 最好是保持两者一致。
A + T 含量高的基因在巴斯德毕赤酵母中表达时偶尔会造成转录提前终止,这是因为A T 丰富区可能存在转录提前终止信号。
因此对A T 含量丰富的基因最好是重新设计序列, 使其A + T 含量在30%~55% 范围内。
巴斯德毕赤酵母也有特殊的密码子偏好趋向。
(赵翔,霍克克,李育阳. 毕赤酵母的密码子用法分析[J ] . 生物工程学报,2000 ,16(3) :308 - 311.)外源蛋白自身的理化特点也影响其表达和分泌。
外源蛋白的加工修饰都会影响蛋白的表达量。
2.选择强启动子启动子在转录水平上调控基因的表达最常用的启动子是AOXI 启动子。
PGAG(三磷酸甘油醛脱氢酶启动子) 是最近在巴斯德毕赤酵母中克隆到的一个组成型启动子,在它的控制下β- LabZ 基因表达率比甲醇诱导下的PAOX驱动的产量更高,由于该组成型启动子不需要甲醇诱导,发酵工艺应该更简单,同时其产量更高,所以成为代替PAOX1 最有潜力的启动子。
通过分离选择恢复利用甲醇能力的自发突变体, 从AOX1 基因缺陷菌株中分离M ut+ 的自发突变体,从中筛选提高表达量的突变体。
(戴秀玉, 王恂, 周坚1 毕赤氏酵母PAOX2 突变化序列分析〔J 〕1微生物学报, 1999, 39 (6) : 559~5611)3.增加外源基因整合拷贝数(1)Invitrogen 公司最新发展的质粒pPIC9K上带有G418 的抗性基因,可以通过转化子对G418抗性水平快速筛选高拷贝转化子(配合电激法转化的效果更好)。
(2)在体外载体上多次插入目的基因片段。
毕赤酵母表达操作手册(精译版)

毕赤酵母多拷贝表达载体试剂盒用于在含多拷贝基因的毕赤酵母菌中表达并分离重组蛋白综述:基本特征:作为真核生物,毕赤酵母具有高等真核表达系统的许多优点:如蛋白加工、折叠、翻译后修饰等。
不仅如此,操作时与E.coli及酿酒酵母同样简单。
它比杆状病毒或哺乳动物组织培养等其它真核表达系统更快捷、简单、廉价,且表达水平更高。
同为酵母,毕赤酵母具有与酿酒酵母相似的分子及遗传操作优点,且它的外源蛋白表达水平是后者的十倍以至百倍。
这些使得毕赤酵母成为非常有用的蛋白表达系统。
与酿酒酵母相似技术:许多技术可以通用:互补转化基因置换基因破坏另外,在酿酒酵母中应用的术语也可用于毕赤酵母。
例如:HIS4基因都编码组氨酸脱氢酶;两者中基因产物有交叉互补;酿酒酵母中的一些野生型基因与毕赤酵母中的突变基因相互补,如HIS4、LEU2、ARG4、TR11、URA3等基因在毕赤酵母中都有各自相互补的突变基因。
毕赤酵母是甲醇营养型酵母:毕赤酵母是甲醇营养型酵母,可利用甲醇作为其唯一碳源。
甲醇代谢的第一步是:醇氧化酶利用氧分子将甲醇氧化为甲醛,还有过氧化氢。
为避免过氧化氢的毒性,甲醛代谢主要在一个特殊的细胞器-过氧化物酶体-里进行,使得有毒的副产物远离细胞其余组分。
由于醇氧化酶与O2的结合率较低,因而毕赤酵母代偿性地产生大量的酶。
而调控产生醇过氧化物酶的启动子也正是驱动外源基因在毕赤酵母中表达的启动子。
两种醇氧化酶蛋白:毕赤酵母中有两个基因编码醇氧化酶-AOX1及AOX2。
细胞中大多数的醇氧化酶是AOX1基因产物。
甲醇可紧密调节、诱导AOX1基因的高水平表达,较典型的是占可溶性蛋白的30%以上。
AOX1基因已被分离,含AOX1启动子的质粒可用来促进编码的目的基因的表达。
AOX2基因与AOX1基因有97%的同源性,但在甲醇中带的菌株比带AOX1基因菌株慢得多,通过这种甲醇利用缓慢表型可分离Muts菌株表达:AOX1基因的表达在转录水平受调控。
毕赤酵母表达蛋白步骤

毕赤酵母表达蛋白步骤一、引言毕赤酵母(Pichia pastoris)是一种常用的真菌表达系统,被广泛应用于蛋白质的表达和生物技术研究中。
其优势包括高表达水平、易于培养和操作、能够正确折叠复杂蛋白等。
本文将介绍毕赤酵母表达蛋白的步骤。
二、构建表达载体毕赤酵母表达系统的关键是表达载体的构建。
首先,需要选择适合的表达载体,常用的有pPIC6、pPICZα等。
然后,在载体上选择合适的启动子和信号序列,以确保蛋白质能够被正确表达和分泌。
同时,还需要在表达载体上加入选择标记,如His标签、FLAG标签等,以便后续的蛋白质纯化和检测。
三、转化毕赤酵母将构建好的表达载体转化入毕赤酵母中,使其成为表达宿主。
转化方法包括电击转化、化学转化等。
其中,电击转化是常用的方法,通过电击脉冲使毕赤酵母细胞膜发生破裂,使表达载体进入细胞内。
转化后,将细胞培养在选择性培养基上,筛选出带有表达载体的毕赤酵母克隆。
四、表达蛋白经过转化筛选后,得到含有目标蛋白表达载体的毕赤酵母克隆。
接下来,需要将克隆进行培养,在适当的条件下诱导蛋白的表达。
常用的诱导剂包括甲醇、巯基乙醇等,通过加入适量的诱导剂,可以使目标蛋白得到高效表达。
五、蛋白纯化在蛋白表达后,需要进行蛋白纯化,以获得纯度较高的目标蛋白。
常用的纯化方法包括亲和层析、离子交换层析、凝胶过滤层析等。
在选择纯化方法时,需要根据目标蛋白的性质和需求进行合理选择。
同时,可以利用加入的选择标记,如His标签,通过亲和层析纯化进行快速高效的纯化。
六、蛋白鉴定和功能分析蛋白纯化后,需要进行蛋白的鉴定和功能分析。
常用的鉴定方法包括SDS-PAGE、Western blot等,可以确定蛋白的分子量和纯度。
功能分析则可以通过生物学实验来进行,如酶活测定、结合实验等,以验证目标蛋白的功能。
七、应用和展望毕赤酵母表达系统在生物技术和蛋白质研究领域有着广泛的应用。
通过该系统,可以高效表达各种蛋白,包括抗体、酶和重组蛋白等。
毕赤酵母转化方法

毕赤酵母转化方法
实验概要
本实验介绍了毕赤酵母电转化方法。
该方法无需产生去壁细胞,是产生毕赤酵母重组子的简便方法。
与去壁细胞效率相似。
实验步骤
1. 细胞准备:
1) 在含5mlYPD 的50ml 离心管中,培养毕赤酵母,30 度过夜。
2) 取0.1-0.5ml 过夜培养物,接种含500ml 新鲜培养基的2L 摇瓶,过夜生长至OD600=1.3-1.5。
3) 在4 度,1500g离心5min收集细胞,用500ml预冷的灭菌水悬浮细胞。
4) 如上离心,用250 ml预冷的灭菌水悬浮细胞。
5) 如上离心,用20ml预冷的1M山梨醇悬浮细胞。
6) 如上离心,用1 ml 预冷的1M山梨醇悬浮细胞,至终体积约1.5ml。
注意:可冻存80ul 等量的电感受态细胞,但转化效率会下降很多。
2. 转化:
1) 取80ul上述细胞与5-20ug线性化DNA(溶于5-10ulTE)混合,转入预冷的0.2cm 电转杯中。
2) 在冰上放置5min。
3) 根据所使用装置推荐的酿酒酵母参数进行电击。
4) 立即加入1ml 预冷的1M山梨醇至杯中,将内容物转移至灭菌离心管中。
5) 分成200-600ul等份,涂于MD 或RDB平板上。
6) 在30 度孵育平板至克隆产生,筛选Mut /Muts表型。
毕赤酵母表达经验总结

毕赤酵母表达经验总结甲醇酵母表达系统有不少优点,其中以Invitrogen公司的Pichia酵母表达系统最为人熟知,并广泛应用于外源蛋白的表达。
虽然说酵母表达操作简单表达量高,但是在实际操作中,并不是每个外源基因都能顺利得到高表达的。
不少人在操作中会遇到这样那样的问题,生物通编者特地收集了部分用户在使用EasySelect Pichia Expression System这个被誉为最简单的毕赤酵母表达的经典试剂盒过程中的心得体会。
其中Xiang Yang是来自美国乔治城大学(Georgetown University)Lombardi癌症中心(Lombardi Cancer Center),部分用户来自国内。
甲基酵母部分优点与其他真核表达系统比较与原核表达系统比较1.属于真核表达系统,具有一定的蛋白质翻译后加工,有利于真核蛋白的表达优点-+2.AOX强效启动子,外源基因产物表达量高,可以达到每升数克表达产物的水平++++3.酵母培养、转化、高密度发酵等操作接近原核生物,远较真核系统简单,非常适合大规模工业化生产。
+++=4.可以诱导表达,也可以分泌表达,便于产物纯化。
=+5.可以甲醇代替IPTG作为诱导物,部分甲醇酵母更可以甲醇等工业产物替代葡萄糖作为碳源,生产成本低+++++ 表示优胜于;- 表示不如;= 表示差不多EasySelect Pichia Expression System产品性能:优点——使用简单,表达量高,His-tag便于纯化缺点——酵母表达蛋白有时会出现蛋白切割问题全面产品报告及心得体会:巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)是一种能高效表达重组蛋白的酵母品种,一方面由于其是属于真核生物,因此表达出来的蛋白可以进行糖基化修饰,另一方面毕赤酵母生长速度快,可以将表达的蛋白分泌到培养基中,方便蛋白纯化。
毕赤酵母表达载体pPICZ在多克隆位点(MCR)3'端带有his-tag和c-myc epitopes,这些tag有利于常规检测和纯化,而且在MCR5'端引入了alpha factor(α-factor)用以增加表达,并且在表达后α-factor 可以自动被切除。
毕赤酵母表达系统

毕赤酵母表达系统前言:所用表达质粒有pPIC3.5K,pAO815用于胞内表达,而pPIC9K用于分泌表达,所有载体均利用AOX1启动子来诱导高水平表达。
抗性选择:最有效的筛选遗传霉素抗性及高抗性克隆的程序需要先对HIS+转化子进行选择,再进行不同水平遗传霉素抗性筛选。
毕赤菌株表型:毕赤酵母菌GS115 及KM71 在组氨酸脱氢酶位点(His4)有突变,因而不能合成组氨酸,所有表达质粒都有HIS4 基因可与宿主进行互补,通过不含组氨酸的培养基来选择转化子。
GS115 及KM71都可在复合培养基如YPD(YEPD)及含组氨酸的最小培养基中生长。
转化之前,GS115 及KM71 都不能在最小培养基中生长,因为它们是His-。
培养温度:毕赤酵母生长温度为28-30度(液体、平板、斜面)。
在32 度以上诱导生长时,对蛋白表达有害,甚至会导致细胞死亡。
贮存:贮存细胞几周或几月,用YPD培养基或YPD 琼脂斜面1 挑取所需菌株单克隆在YPD 平板上划线生长;2 挑取单克隆转移至YPD进行穿刺培养,30 度2 天;3 细胞在4 度可放几周几月或几年,存于-80度1 挑取所需菌株单克隆在YPD 中过夜培养;2 收集细胞,在含15%甘油的YPD 中悬浮至终OD600 为50-100(大约2.5-5.0×109细胞/ml);3 细胞先用液氮或干冰/酒精浴中冰冻再贮存于-80 度。
注意:在4 度或-80 度长期保存后,用之前建议在MM、MD 或MGY 平板上划线培养以检测His+转化子的表型是否正确及其活力。
以质粒pPIC9K,酵母Pichia pastoris GS115为例说明做法。
载体pPIC9K酶切为点线性化质粒DNA:建议使用下列方法线性化载体以获得Mut+及Muts重组子,可能其中一个会比另一个更利于表达多拷贝重组子。
如果只想得到Muts重组子,使用KM71 菌株。
单个十字交换事件可比双重十字交换更容易、更有效地获得Muts重组菌(例如:插入AOX1或his4 而不是取代AOX1)。
毕赤酵母表达操作手册(精译版)

毕赤酵母多拷贝表达载体试剂盒用于在含多拷贝基因的毕赤酵母菌中表达并分离重组蛋白综述:基本特征:作为真核生物,毕赤酵母具有高等真核表达系统的许多优点:如蛋白加工、折叠、翻译后修饰等。
不仅如此,操作时与E.coli及酿酒酵母同样简单。
它比杆状病毒或哺乳动物组织培养等其它真核表达系统更快捷、简单、廉价,且表达水平更高。
同为酵母,毕赤酵母具有与酿酒酵母相似的分子及遗传操作优点,且它的外源蛋白表达水平是后者的十倍以至百倍。
这些使得毕赤酵母成为非常有用的蛋白表达系统。
与酿酒酵母相似技术:许多技术可以通用:互补转化基因置换基因破坏另外,在酿酒酵母中应用的术语也可用于毕赤酵母。
例如:HIS4基因都编码组氨酸脱氢酶;两者中基因产物有交叉互补;酿酒酵母中的一些野生型基因与毕赤酵母中的突变基因相互补,如HIS4、LEU2、ARG4、TR11、URA3等基因在毕赤酵母中都有各自相互补的突变基因。
毕赤酵母是甲醇营养型酵母:毕赤酵母是甲醇营养型酵母,可利用甲醇作为其唯一碳源。
甲醇代谢的第一步是:醇氧化酶利用氧分子将甲醇氧化为甲醛,还有过氧化氢。
为避免过氧化氢的毒性,甲醛代谢主要在一个特殊的细胞器-过氧化物酶体-里进行,使得有毒的副产物远离细胞其余组分。
由于醇氧化酶与O2的结合率较低,因而毕赤酵母代偿性地产生大量的酶。
而调控产生醇过氧化物酶的启动子也正是驱动外源基因在毕赤酵母中表达的启动子。
两种醇氧化酶蛋白:毕赤酵母中有两个基因编码醇氧化酶-AOX1及AOX2。
细胞中大多数的醇氧化酶是AOX1基因产物。
甲醇可紧密调节、诱导AOX1基因的高水平表达,较典型的是占可溶性蛋白的30%以上。
AOX1基因已被分离,含AOX1启动子的质粒可用来促进编码外源蛋白的目的基因的表达。
AOX2基因与AOX1基因有97%的同源性,但在甲醇中带AOX2基因的菌株比带AOX1基因菌株慢得多,通过这种甲醇利用缓慢表型可分离Muts菌株。
表达:AOX1基因的表达在转录水平受调控。
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此外,由于学识、经验有限,本文难免会存在一些错误或缺陷,敬请不吝赐教,联系方式:kaosy@ 同时因存在环境、试剂、仪器以及人为等原因,不能保证实验100%的成功,仅供参考。
写在前面,因为酵母里用到了很多遗传学的命名方法,所以建议大家首先看一下这个资料,可以让大家理解一些不常见的符号及意义。
下载地址如下: /bbs/thread-19215-1-1.htmL一、 甲醇营养型毕赤酵母表达系统介绍巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)是近几年发展起来的较为完善的、被广泛用来表达外源蛋白的甲醇营养型酵母表达系统。
目前通过毕赤酵母表达了很多种性质不同的蛋白,越来越多的实验室及公司开始搭建毕赤酵母表达系统的平台,相信随着对毕赤酵母表达系统的研究越来越深入,会有更多成功表达并进行商业化应用的案例出现。
1.主要优点1)具有强有力的乙醇氧化酶(Alochol Oxidase ,AOX1)基因启动子,可严格调控外源蛋白的表达; 2)作为真核表达系统,可对表达的蛋白进行翻译后的加工与修饰,从而使表达出的蛋白具有生物活性; 3)营养要求低、生长快、培养基廉价,便于工业化生产; 4)可高密度发酵培养,在发酵罐中细胞干重甚至可达120g/L 以上; 5)表达量高,许多蛋白可达到g/L 以上水平; 6)在P . pastoris 中表达的蛋白既可存在于细胞内,又可分泌到胞外,自身分泌的蛋白非常少,十分有利于纯化; 7) 糖基化程度低,与S. cerevisiae 相比,P . pastoris 不产生过度的糖基化。
P . pastoris 表达的糖蛋白的糖链长度为8-14个甘露糖,而S. cerevisiae 糖链中甘露糖多达50-150个;S. cerevisiae 分泌的糖蛋白的核心寡聚糖具有终端α-1,3糖苷连接,使分泌的糖蛋白的抗原性明显增强,而P.pastoris的糖基化位点与哺乳类细胞的相同,其所分泌的糖蛋白的免疫原性较低,更利于临床应用。
2. 毕赤酵母常用的菌株类型2.1Mut+和Mut s在毕赤酵母基因组中有2个醇氧化物酶编码基因,即AOX1基因和AOX2基因。
菌株利用甲醇的速度主要是依靠AOX1基因表达的AOX1蛋白,其醇氧化物酶的活性非常高以至于在有AOX1酶蛋白存在的情况下可以忽略AOX2酶蛋白,这就是甲醇营养型毕赤酵母的两种表型Mut+和Mut s产生的原理。
当菌株基因组中既有AOX1基因,也有AOX2基因时,菌株的表型为Mut+该菌株有甲醇的培养基中仍可以正常生长。
当菌株基因组中仅有AOX2基因时,菌株的表型为Mut s,该菌株在有甲醇的培养基中生长缓慢。
2.2 菌株GS115、KM71和SMD1168的区别GS115、KM71和SMD1168等是用于表达外源蛋白的酵母受体菌。
GS115、KM71、SMD1168 是组氨酸缺陷型,如果表达载体上携带有组氨酸基因,可补偿宿主菌的组氨酸缺陷,因此可以在不含组氨酸的培养基上筛选转化子。
这些受体菌自发突变为组氨酸野生型的概率一般低于10-8。
GS115 表型为Mut+。
重组表达载体转化GS115 后,长出的转化子可能是Mut+,也可能是Mut s,可以在MM 和MD 培养基上鉴定表型。
SMD1168 和GS115 类似,但SMD1168 是蛋白酶缺陷型,可降低蛋白酶对外源蛋白的降解作用。
KM71 没有AOX1 基因,本身就是Mut s。
因此转化后所有的转化子都是Mut s,不必鉴定表型。
3. 毕赤酵母菌株的生长毕赤酵母适宜的生长温度是28至30度,温度超过32度对蛋白的表达是有害的,并可能导致细胞的死亡。
关于毕赤酵母的生长速度:在YPD培养基中,不论是Mut+还是Mut s其在对数期增殖一倍的时间大约为2hMut+和Mut s菌株在没有甲醇存在的情况下生长速率是一样的存在甲醇的情况下,Mut+在对数期增殖一倍的时间大约为4至6个小时存在甲醇的情况下,Mut s在对数期增殖一倍的时间大约为18个小时二、 毕赤酵母同源重组的原理及目的基因整合方式通过转化DNA与毕赤酵母基因组中同源序列的同源重组,毕赤酵母与酿酒酵母一样可产生稳定的阳性转化子。
这些重组的菌株在无选择压力条件下,即使其携带的基因是多拷贝的,也表现出极度稳定性。
常用的表达载体都含有HIS4基因,编码组氨酸脱氢酶基因,这些载体经限制性内切线性化以后,可在AOX1或his4位点进行同源重组,从而产生HIS+重组子。
单交换插入比双交换(替换)要更容易发生,多拷贝事件自发发生的几率只有单交换几率的1-10%。
1. 基因插入AOX1或aox1::AGR4位点GS115 的AOX1或KM71 的aox1::AGR4 位点可以与载体上AOX1位点(AOX1 启动子,AOX1 转录终止子TT或下游3’AOX1三个位点发生同源重组,这样就在AOX1 或aox1::AGR4 基因的上游或下游插入一个或多个基因拷贝。
因为插入的表达盒没有破坏原有基因组中的AOX1,所以转化子在GS115 中为HIS+ Mut+表型,在KM71 中为HIS+ Mut s表型。
图1重组质粒插入3’AOX12. 基因替换AOX1位点在his4 菌株如GS115 中,载体及基因组中AOX1启动子及3’AOX1 区的双交换事件(取代),结果AOX1 编码区全部被取代,产生HIS+Mut s表型。
以AOX1 位点由基因替代而产生的Muts表型作为指示,可很容易地筛选出HIS+转化子的Mut 表型。
基因取代的结果是缺失了AOX1 位点(Muts),增加了含有pAOX1、目的基因、HIS4 的表达盒。
基因取代(双交换事件)不如基因插入(单交换事件)发生得多。
图2AOX1 位点的基因被取代3. 基因插入His4位点GS115(Mut+)或KM71(Mut s)中,载体上HIS4 基因与染色体上his4 位点之间发生单交换事件,结果在his4位点插入一个或多个基因拷贝。
由于基因组上AOX1 或aox1::AGR4 位点未发生重组,这些His+转化子的表型均与亲本菌株相同。
图3 质粒插入形成双拷贝HIS4/his4 基因4. 多拷贝插入尽管多拷贝事件自发发生的概率很低,但是通过在培养基中加入选择性标记,还是很容易在转化子中筛选到插入多拷贝的表达核的转化子。
其插入示意图如下:三、 毕赤酵母表达重组载体的构建1.表达载体的选择根据基因的表达定位及目的可以简单的将毕赤酵母的表达载体主要分为以下几类:(1) 胞内表达载体主要有pHIL-D2、pA0815、pPIC3K、pPICZ、pHWO10,pGAPZ、pGAPZa(Invitrogen),等。
该类载体可以将目的基因表达在胞内,可以避免毕赤酵母的糖基化,主要适合于那些不能被糖基化相关基因的表达。
(2) 分泌型表达载体主要有pPIC9、pHIL-S1、pPICZα、pYAM75P等。
由于毕赤酵母本身的泌内源蛋白非常少,将外源蛋白分泌到胞外,非常有利于目的蛋白质的纯化及积累。
常用的分泌的信号序列主要是由89个氨基酸组成的α交配因子(α- factor)的引导。
(3) 多拷贝插入表达载体如pPIC9K,pPIC3.5K。
在某些情况下,毕赤酵母中重组基因多拷贝整合可增加所需蛋白的表达量。
该载体均可用于在体内(pPIC3.5K, pPIC9K)或体外(pAO815)产生并分离多拷贝插入,同时可检测增加重组基因的拷贝数是否增加蛋白表达量。
体内整合可通过高遗传霉素抗性,筛选可能的多拷贝插入;而体外整合可通过连接产生外源基因的串联插入。
2.如果想要表达的重组蛋白具有天然的N端,应该将克隆的基因直接连接在Kex2蛋白酶的切点后Kex2蛋白酶切割的位置在信号肽序列中精氨酸和谷氨酸连接处:Glu-Lys-Arg*Glu-Ala-Glu-Ala “*”位置为Kex2蛋白酶切割位点。
Ste13蛋白酶切割的位置在信号肽序列中谷氨酸和丙氨酸重复处:Glu-Ala*-Glu-Ala* “*”位置为Ste13蛋白酶切割位点。
酸(1193-1195),以保证重组蛋白被有效切割。
在成功表达重组蛋白以后需要对其进行N端测序来最后确定其是否正确切割。
四、 几种酵母转化方法的比较1. 线性化酵母转化的第一步是做线性化,不同的酶可以产生不能的效果,常用的酶主要有以下四个,产生的表型如下:限制酶插入事件 GS115表型 KM71表型Sal I或StuI 插入his4 His+Mut+ His+MutsSac I 插入5’AOX1 His+Mut+ His+MutsBgl II 取代AOX1 His+Muts His+Muts(不推荐)2. 转化方法几种酵母转化方法的比较转化方法转化效率(per μg) 方便因素多拷贝整合原生质体法105低可以电击转化105高可以PEG1000 103高无LiCl 102高无附英文原版以防我翻译的可能不准(Pichia Protocols 28页)3. 毕赤酵母的电击感受态的制备及电击转化(1) 感受态的制备:a) 挑取酵母受体菌的单菌落接种于10mLYPD培养基中,30℃摇床过夜。
b) 以1 %接种量转接100mLYPD液体培养基,30℃摇床过夜至OD=1.3-1.5。
c) 4℃离心5000rpm,5min,弃上清。
d) 用100mL冰预冷无均水将菌体重悬。
e) 4℃离心5000rpm,10min,弃上清。
f) 用50mL冰预冷无均水将菌体重悬。
g) 4℃离心5000rpm,10min,弃上清。
h) 再用20mL 1 mol/L的山梨醇洗涤1次i) 溶于200uL 1mol/L的冰预冷的山梨醇,以备转化很多朋友问,感受态做好了可以在-80度放么?在这里我给出我自己的一点实验心得,酵母感受态尽量要现用现做,因为转化的效率有很大的影响,我现做的感受态的转化效率最高阳性率约为20%左右,以前不是使用现做的感受态一般的阳性率在1%-2%。
很多朋友说自己的阳性率比较低,可以考虑一下是不是感受态的问题。
(2) 毕赤酵母的转化在80μl酵母感受态细胞中加入用合适酶切位点线性化的质粒1-5μg冰上放置15分钟,迅速加入0.2cm电击杯中(冰预冷),电击,迅速加入山梨醇,涂板。