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Ⅰ型干扰素应答基因与类风湿关节炎生物制剂疗效

Ⅰ型干扰素应答基因与类风湿关节炎生物制剂疗效①吕明华王宁胡志芳张典郭娜(西安医学院免疫学教研室,西安710021)中图分类号R392文献标志码A文章编号1000-484X(2022)07-0883-05[摘要]类风湿关节炎(RA)发生发展与TNF-α、IL-6、B细胞和T细胞密切相关。
基于TNF-α、IL-6和T、B细胞表面标志分子的生物制剂治疗RA取得了显著成效,但仍有部分RA患者不应答。
近年研究发现,Ⅰ型干扰素及其信号通路在RA患者生物制剂治疗应答中发挥作用。
本文综述不同生物制剂治疗RA患者的应答情况以及Ⅰ型干扰素应答基因与生物制剂疗效的关系,探讨浆细胞样树突状细胞(pDC)对Ⅰ型干扰素应答基因表达的影响,为改善RA患者对生物制剂不敏感提供新思路。
[关键词]类风湿关节炎;生物制剂;Ⅰ型干扰素应答基因;浆细胞样树突状细胞Type I interferon response genes and efficacy of biological agents for rheumatoid arthritisLYU Minghua,WANG Ning,HU Zhifang,ZHANG Dian,GUO Na.Department of Immunology,Xi'an Medical University,Xi'an710021,China[Abstract]Occurance and development of rheumatoid arthritis(RA)is closely related to TNF-α,IL-6,B cells and T cells. Biological agents based on TNF-α,IL-6,T and B cell surface markers have achieved remarkable results in treatment of RA,but there are still some patients with RA who do not respond.Recent studies have found that typeⅠinterferon and its signaling pathway play a role in response of patients with RA to biologic agents.This paper reviews response of RA patients to different biologic agents and rela‐tionship between typeⅠinterferon response gene and the efficacy of biologic agents.Effect of plasmacytoid dendritic cells(pDC)on expression of typeⅠinterferon response genes was discussed,so as to provide a new idea for improving sensitivity of RA patients to biological agents.[Key words]Rheumatoid arthritis;Biological agents;TypeⅠinterferon response genes;Plasmacytoid dendritic cells类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)是以慢性炎症性多关节炎为特征的一种自身免疫性疾病。
【浙江省自然科学基金】_ifn-γ_期刊发文热词逐年推荐_20140812

2011年 序号 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40
53 cd20 54 cd137l 55 b细胞表位
1 1 1
2008年 序号 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28
科研热词 推荐指数 ifn-γ 3 白介素-10 2 树突状细胞 2 咪唑克生 2 三氧化二砷 2 mrl/lpr狼疮鼠 2 il-4 2 脑脊髓炎,自身免疫性,实验性 1 胸腺基质淋巴生成素受体 1 胸腺基质淋巴生成素 1 胍丁胺 1 肝纤维化 1 白细胞介素10 1 活血渗湿方 1 星形胶质细胞 1 干扰素ⅱ型 1 干扰素-γ 1 干扰素 1 尖锐湿疣 1 小胶质细胞 1 实验研究 1 实验性脑脊髓炎 1 实验性变态反应性脑脊髓炎 1 复方鳖甲软肝片 1 哮喘 1 γ -干扰素 1 th1/th2应答 1 il-12 1
2011年 科研热词 推荐指数 t细胞 2 颈动脉粥样硬化 1 调节/辅助蛋白 1 融合抗原 1 艾滋病病毒 1 舌鳞癌 1 脑梗 1 细胞因子类 1 细胞 1 系统性红斑狼疮 1 磷酸化erk 1 砒霜 1 白细胞介素18 1 白细胞介素17 1 疫苗 1 树突状细胞 1 支气管肺泡灌洗液 1 干扰素γ 1 干扰素-γ 1 小鼠 1 增殖 1 喉癌 1 哮喘/病理学 1 哮喘/治疗 1 哮喘 1 凋亡 1 免疫学效应 1 儿童 1 丙型肝炎病毒 1 th细胞 1 th1 1 il-10 1 ifn-γ 1 ifi16基因 1 hep-2细胞 1 ctl表位 1 cd4+cd28null 1 cd4 cd25 foxp3 调节性t细胞 1 cd158j 1 akt信号通路 1
生物信息联合免疫分析鉴定幼年皮肌炎相关基因

生物信息联合免疫分析鉴定幼年皮肌炎相关基因赵威1魏广友21安徽理工大学医学院安徽淮南232000;2亳州市人民医院儿科[摘要]目的在幼年皮肌炎(J D M)患者通过生物信息联合免疫分析筛选幼年皮肌炎基因,构建预测模型㊁绘制列线图并验证,旨在探索其在J D M诊断中的潜在价值㊂方法通过基因表达综合数据库(G E O)下载的G S E11083和G S E11971数据集为基因表达阵列进行合并,利用R语言筛选差异表达基因㊂通过s s G S E A计算数据集的免疫评分,随后分别进行疾病组与正常组之间免疫的差异分析㊂作P P I网络并筛选H u b基因,通过H u b基因与免疫分析选出最相关基因㊂利用筛选基因构建预测模型㊁绘制列线图及选取独立G S E100152数据集验证㊂结果两个数据集合并共获得29个差异表达的基因㊂免疫细胞差异分析显示J D M患者的激活树突状细胞表达水平较高,免疫功能差异分析显示J D M 患者的树突状细胞的抗原提呈细胞㊁非经典炎症㊁I型干扰素反应这三种免疫功能表达水平较高㊂通过P P I网络选出10个H u b基因,再次筛选出5个与免疫最为相关的基因,分别为G B P1㊁I F I T3㊁I F I T1㊁O A S2㊁MX2㊂利用5个基因构建模型及独立数据集验证,发现O A S2基因与J D M具有较高的预测诊断价值㊂结论本研究认为的O A S2基因可能成为J D M诊断的生物标记物及潜在的治疗靶点,并提出I型干扰素的反应可能是调节J D M的潜在分子途径㊂[关键词]皮肌炎生物信息学免疫分析儿童 G E O[中图分类号] R725.9[文献标识码] A [文章编号]2095-2694(2023)04-253-08[D O I]10.19539/j.c n k i.2095-2694.2023.04.001T o i d e n t i f y t h e r e l a t e d g e n e s o f j u v e n i l e d e r m a t o m y o s i t i s b y b i o l o g i c a l i n f o r m a t i o n c o m b i n e d w i t h i m m u-n o a s s a y Z h a o W e i,W e i G u a n g y o u(C o l l e g e o f M e d i c i n e,A n h u i U n i v e r s i t y o f S c i e n c e a n d T e c h n o l-o g y,H u a i n a n232000,C h i n a)[A B S T R A C T]O b j e c t i v e T h i s s t u d y a i m e d t o e x p l o r e t h e p o t e n t i a l v a l u e o f r e l a t e d g e n e s i n t h e d i-a g n o s i s o f j u v e n i l e d e r m a t o m y o s i t i s(J D M)b y u s i n g b i o l o g i c a l i n f o r m a t i o n c o m b i n e d w i t h i mm u n o-a s s a y t o s c r e e n g e n e s,c o n s t r u c t p r e d i c t i o n m o d e l s,d r a w n o m o g r a m a n d v a l i d a t e t h e m.M e t h o d s T h e G S E11083a n d G S E11971d a t a s e t s d o w n l o a d e d f r o m G E O w e r e m e r g e d i n t o g e n e e x p r e s s i o n a r-r a y s,a n d R w a s u s e d t o s c r e e n d i f f e r e n t i a l l y e x p r e s s e d g e n e s.T h e i mm u n i t y s c o r e o f t h e d a t a s e t w a s c a l c u l a t e d b y s s G S E A,a n d t h e n t h e d i f f e r e n c e o f i mm u n i t y b e t w e e n t h e d i s e a s e g r o u p a n d t h e n o r m a l g r o u p w a s a n a l y z e d.P P I n e t w o r k a n d H u b g e n e s c r e e n i n g,H u b g e n e a n d i mm u n o a s s a y t o i d e n t i f y t h e m o s t r e l e v a n t g e n e s.P r e d i c t i o n m o d e l w a s c o n s t r u c t e d b y s c r e e n i n g g e n e s,n o m o g r a m w a s d r a w n,a n d i n d e p e n d e n t G S E100152d a t a s e t w a s s e l e c t e d f o r v e r i f i c a t i o n.R e s u l t s T w e n t y-n i n e g e n e s 352华北理工大学学报(医学版)2023年7月第25卷第4期J o u r n a l o f N o r t h C h i n a U n i v e r s i t y o f S c i e n c e a n d T e c h n o l o g y(H e a l t h S c i e n c e s E d i t i o n),J u l.2023,V o l.25,N o.4ʌ基金项目ɔ国家卫生计生委医药卫生科技发展研究课题(编号:WA2020HK60);白求恩医学科学研究基金支持项目(编号:S C E159E N)㊂ʌ作者简介ɔ赵威(1991-),男,在读硕士研究生㊂研究方向:儿科学㊂ʌ通讯作者ɔ魏广友,E m a i l:135********@163.c o mCopyright©博看网. All Rights Reserved.w e r e d i f f e r e n t i a l l y e x p r e s s e d i n t h e t w o d a t a s e t s.T h e d i f f e r e n c e a n a l y s i s o f i mm u n e c e l l s s h o w e d t h a t J D M p a t i e n t s h a d h i g h e r l e v e l s o f a c t i v a t e d d e n d r i t i c c e l l s,a n d t h e d i f f e r e n c e o f i mm u n e f u n c t i o n s h o w e d t h a t J D M p a t i e n t s h a d h i g h e r l e v e l s o f d e n d r i t i c c e l l s a n t i g e n p r e s e n t i n g c e l l s,n o n-c l a s s i c a l i n f l a mm a t i o n,a n d t y p e1i n t e r f e r o n r e s p o n s e.T e n H u b g e n e s w e r e s e l e c t e d t h r o u g h P P I n e t w o r k, a n d f i v e g e n e s m o s t r e l a t e d t o i mm u n i t y w e r e s c r e e n e d o u t a g a i n,w h i c h w e r e G B P1,I F I T3,I F I T1, O A S2a n d M X2.T h e O A S2g e n e a n d J D M h a v e h i g h p r e d i c t i v e a n d d i a g n o s t i c v a l u e b y u s i n g f i v e g e n e m o d e l s a n d i n d e p e n d e n t d a t a s e t s.C o n c l u s i o n T h e O A S2g e n e i d e n t i f i e d i n t h i s s t u d y m a y b e a b i o m a r k e r f o r t h e d i a g n o s i s o f J D M a n d a p o t e n t i a l t h e r a p e u t i c t a r g e t,a n d t h e t y p e I i n t e r f e r o n r e-s p o n s e m a y b e a p o t e n t i a l m o l e c u l a r p a t h w a y t o r e g u l a t e J D M.[K E Y W O R D S] D e r m a t o m y o s i t i s.B i o i n f o r m a t i c s.I mm u n o a s s a y.C h i l d r e n.G E O幼年皮肌炎(j u v e n i l e d e r m a t o m y o s i t i s, J D M)是一种罕见的慢性自身免疫性疾病,是特发性炎症性肌病之一㊂本病发病于儿童期,又称为儿童皮肌炎,发病率约为2.5/100万,患病率为2.5/10万[1],平均发病年龄为81.97个月,以女童为主[2]㊂J D M特征是对称性近端肌肉无力,血清肌酶浓度升高,以及病理性皮疹[1]㊂J D M皮肤病表现出更大的活动性,比肌肉病更难治疗,并且儿童钙质沉着症和溃疡的风险较高[3]㊂J D M可导致严重的后遗症,包括营养不良性钙化㊁持续性皮肤炎症和功能受限的器官受累[4]㊂有研究表明,皮肌炎诊断后5年内发生肿瘤的风险很高,26%~70%的患儿在诊断皮肌炎后1年内发生肿瘤[5]㊂然而, J D M发病机制在很大程度上仍然是未解之谜,包括易感基因㊁环境应激源㊁免疫和非免疫介导机制在内的一系列因素,被认为可能与J D M的发病机制有关[6]㊂近几年,随生物信息学发展,探索基因表达谱在疾病发病机制中的作用是一种有效的方法㊂J D M队列的基因表达谱和临床信息从N C B I基因表达综合数据库[7]下载(G E O;h t-t p s://w w w.n c b i.n l m.n i h.g o v/g e o/)㊂此外,为了确定与J D M相关的中枢基因,对患者和健康对照样本中的差异表达基因(d i f f e r e n t i a l l y e x p r e s s e d g e n e,D E G)进行了比较㊂免疫系统参与疾病发展已为人所知多年,J D M由自身免疫结缔组织病变引起的,因此,本研究试图通过生物信息与免疫分析鉴定J D M的相关基因,把免疫系统分为免疫细胞和免疫功能两部分,并使D E G与其进行免疫评分及相关性分析,随后运用P P I网络选出h u b基因,最后筛选出与免疫最为相关的基因㊂运用选出的基因做风险列线图㊁预测模型及验证,从而探索相关基因在诊断及治疗J D M的潜在价值[8]㊂1对象与方法1.1研究对象 G E O是目前全球最大最全面的公开可用的基因表达数据库,保存着世界各国研究机构上传的高通量测序数据㊂在本研究中,通过替代变量分析方法将两个数据集(G S E11083和G S E11971)合并为一个集成数据集,来消除批次差异㊂G S E11083使用G P L570平台(基于:A f f y m e t r i x H u m a n G e-n o m e U133P l u s2.0A r r a y)生成,G S E11971使用G P L96平台(基于:A f f y m e t r i x H u m a n G e n o m e U133A A r r a y)生成㊂另外一组数据集G S E100152使用G P L6884平台(基于:I l l u-m i n a H u m a n WG-6v3.0e x p r e s s i o n b e a d c h i p)生成,用来进行预测模型的验证㊂G S E11083数据集包括28例健康对照儿童血液样本和27例J D M患者血液样本㊂G S E11971数据集包括4例健康对照儿童肌肉组织样本和19例J D M患者肌肉组织样本㊂G S E100152数据集包括9例健康对照儿童血液样本和40例J D M 患者血液样本㊂所有数据集样本年龄均<18岁,且符合1975年B o h a n/P e t e r提出的多发性肌炎㊁皮肌炎诊断标准[9]㊂1.2研究方法452华北理工大学学报(医学版)2023年7月第25卷第4期J o u r n a l o f N o r t h C h i n a U n i v e r s i t y o f S c i e n c e a n d T e c h n o l o g y(H e a l t h S c i e n c e s E d i t i o n),J u l.2023,V o l.25,N o.4Copyright©博看网. All Rights Reserved.1.2.1差异基因的筛选数据集G S E11083和G S E11971在R软件中进行预处理,包括背景校准㊁归一化和l o g2转换㊂如果预处理多个探针对应于共同基因,则使用平均值当做相应的表示值㊂此外,B i o c o n d u c t o r的替代变量分析(S V A)软件包用于消除批次效应㊂然后,运用L i mm a软件包选择筛选J D M和健康对照儿童之间的D E G,并设置D E G s的倍数变化| l o g2F o l d c h a n g e(F C)|>1和P值<0.05为筛选条件㊂最后,分别使用R语言p h e a t m a p软件包和g g l o t软件包绘制热图和火山图㊂1.2.2s s G S E A计算免疫评分单样本基因集富集分析(s i n g l e s a m p l e g e n e s e t e n r i c h m e n t a n a l y s i s,s s G S E A)㊂首先对上述所得D E G进行秩次标准化,然后利用经验累积分布函数计算富集分数(E S)㊂运用R语言G S V A包实现s s G S E A分析,即可得到每个样本基于s s G-S E A算法的基因集㊂结合免疫细胞与免疫功能的数据分析,使用R语言p h e a t m a p软件包绘制数据集与免疫细胞及免疫功能的热图㊂1.2.3疾病组与正常组之间免疫评分的差异分析首先对疾病组样本与对照组样本进行免疫细胞之间的差异性分析,然后再进行免疫功能之间的差异性分析㊂P<0.05表明差异有统计学意义,使用g g p u b r软件包比较和可视化J D M和对照样本之间14个免疫细胞的水平, 13个免疫功能的水平㊂1.2.4 P P I网络及筛选H u b基因使用检索相互作用基因数据库(S t r i n g)的搜索工具(版本11.5;w w w.S t r i n g-d b.o r g)[10]和最小相互作用分数构建D E G的P P I相互作用网络,ȡ0.4定义为截止值㊂通过C y t o s c a p e可视化P P I网络,最后运用c y t o H u b b a插件中的M C C 算法来筛选10个H u b基因[11]㊂1.2.5筛选免疫最相关基因上述方法选出10个H u b基因,运用g g c o r r p l o t软件包,使其与免疫细胞及免疫功能进行相关性热图分析,最后筛选出5个与免疫最为相关的基因㊂1.2.6构建预测模型与模型验证利用上述步骤选出的5个与免疫最相关基因构建预测模型,使用r m s软件包建立疾病与5个基因的列线图来预测发病风险,并利用校准曲线评估列线图的可靠性㊂使用R O C R软件包分别绘制出整体和单独5个基因与J D M的R O C曲线图来预测诊断价值,并计算出R O C曲线下面积(A r e a u n d e r t h e R O C,A U C)及其95%可信区间㊂选取另外一组独立数据集G S E100152用于预测模型的验证㊂再次使用上述5个基因,通过R O C R软件包绘制整体和单独5个基因R O C曲线,并计算出A U C及其95%可信区间㊂A U C越大,说明预测性能越好㊂1.3统计学方法所有数据均以(xʃs)表示㊂使用R S t u d i o(版本4.2.1)进行统计分析㊂P<0.05对于筛选D E G s㊁免疫评分㊁差异分析㊁预测模型及验证具有重要意义㊂2结果2.1 D E G s的筛选鉴定将G S E11083和G S E11971两个数据集结合起来,以消除批量效应,共获得29个基因差异表达,其中22个基因上调,7个基因下调㊂前5位上调基因为I S G15㊁I F I T5㊁I F I44L㊁O A S2和L G A L S3B P,前5位下调基因是(E I F1A Y)㊁D D X3Y, U S P9Y,K D M5D,R P S4Y1㊂D E G s的热图和火山图见图1㊂552华北理工大学学报(医学版)2023年7月第25卷第4期J o u r n a l o f N o r t h C h i n a U n i v e r s i t y o f S c i e n c e a n d T e c h n o l o g y(H e a l t h S c i e n c e s E d i t i o n),J u l.2023,V o l.25,N o.4Copyright©博看网. All Rights Reserved.图1 D E G s 的热图和火山图注:A 为D E G s 的热图,B 为D E G s 的火山图2.2 s s G S E A 算法计算免疫评分 使用s s G -S E A 来评估免疫与基因之间的关联,计算出的29个D E G 与14种免疫细胞以及13种免疫功能的相关性热图,见图2㊂图2 D E G 与免疫细胞及免疫功能分析热图2.3 免疫评分的差异分析 免疫细胞的差异分析箱型图显示,与对照组相比,J D M 患者的激活树突状细胞(a c t i v a t e d e n d r i t i c c e l l s,a D C S)表达水平较高,见图3㊂免疫功能的差异分析箱型图显示,与对照组相比,J D M 患者的树突状细胞的抗原提呈细胞(a n t i g e n p r e -s e n t i n gc e l l ,A P C )㊁非经典炎症(P a r a i n f l a mm a -t i o n )㊁I 型干扰素反应(T 1-I F N ),这三种免疫功能表达水平较高,见图4㊂图3 J D M 与对照组的免疫细胞差异分析图4 J D M 与对照组的免疫功能差异分析652华北理工大学学报(医学版) 2023年7月第25卷第4期J o u r n a l o f N o r t h C h i n a U n i v e r s i t y o f S c i e n c e a n d T e c h n o l o g y(H e a l t h S c i e n c e s E d i t i o n ),J u l .2023,V o l .25,N o .4Copyright ©博看网. All Rights Reserved.2.4 P P I 网络及筛选H u b 基因 去除孤立节点后,构建了由25个节点和84条边组成的P P I 网络,由C y t o s c a p e 可视化P P I 网络,见图5㊂P P I 网络中通过M C C 算法得到的10个D E G 被定义为h u b 基因,分别为I F I 27㊁I F I T 3㊁I F I 44L ㊁I S G 15㊁I F I T 1㊁M X 1㊁M X 2㊁O A S 2㊁O A S 1㊁G B P 1,见图6㊂图5 D E G 的P P I 网络图6 P P I 网络的H u b 基因2.5 筛选免疫最相关基因 由上述选出的10个H u b 基因,根据与免疫相关性,最终筛选出5个最为相关的基因,分别为G B P 1㊁I F I T 1㊁I F -I T 3㊁O A S 2㊁M X 2,见图7㊂图7 10个H u b 基因与免疫细胞及免疫功能的相关性2.6 构建预测模型与验证 队列中基因的列线图表明模型具有较高的发病率,见图8A ;列线图校准曲线在该队列中显示出良好的一致性,见图8B ㊂R O C 曲线整体预测模型的A U C为0.825(95%C I :0.730~0.920)㊂各基因A U C 分别为:G B P 1为0.783(95%C I :0.677~0.889)㊁I F I T 1为0.757(95%C I :0.648~0.866)㊁I F I T 3为0.733(95%C I :0.621~0.845)㊁O A S 2为0.790(95%C I :0.692~0.888)㊁M X 2为0.773(95%C I :0.671~0.874),见图8C ㊂通过另一组样本验证整体模型的A U C 为0.889(95%C I :0.758~1.000),单各基因的A U C 分别为:G B P 1为0.622(95%C I :0.471~0.773)㊁I F I T 1为0.467(95%C I :0.296~0.638)㊁I F I T 3为0.486(95%C I :0.314~0.658)㊁O A S 2为0.828(95%C I :0.659~0.996)㊁M X 2为0.535(95%C I :0.347~0.722),见图8D ㊂最终得出O A S 2基因可能具有较高的预测诊断价值㊂752华北理工大学学报(医学版) 2023年7月第25卷第4期J o u r n a l o f N o r t h C h i n a U n i v e r s i t y o f S c i e n c e a n d T e c h n o l o g y(H e a l t h S c i e n c e s E d i t i o n ),J u l .2023,V o l .25,N o .4Copyright ©博看网. All Rights Reserved.图8预测模型与验证图注:A:根据筛选基因绘制预测模型列线图;B:检验模型的校准图;C:模型整体及5个基因的R O C曲线;D:验证数据集整体及5个基因的R O C曲线㊂3讨论J D M由自身免疫结缔组织病变引起,通常包括自身抗体阳性和免疫异常等疾病,其特征是皮肤损伤㊁肌痛或及进行性肌肉无力,导致严重的皮疹,其并发症甚至可能危及生命㊂然而, J D M的确切发病机制尚未明确描述㊂在本研究中我们通过2个数据集进行整合后,得到J D M的差异基因㊂运用D E G s与免疫细胞及免疫功能做相关性分析,得出D C S㊁A P C㊁T1-I F N及非典型炎症有较强的差异性㊂通过P P I 网络选出10个h u b基因,运用h u b基因再次筛选出与免疫最相关的5个关键基因:G B P1㊁I F I T1㊁I F I T3㊁O A S2㊁M X2,所绘制列线图表明模型具有较高的发病率㊂且校准图显示具有良好的一致性㊂通过预测模型及验证分析,最后认为O A S2基因可能具有较高诊断J D M的潜在价值㊂J D M是一种具有干扰素(I F N)特征的系统性自身免疫性疾病,发病机制及其干扰素特征的病因尚不清楚[12]㊂有研究表明该机制可能通过干扰素途径引起信号转导的上调[13]㊂B r i-a n等[1]研究学者发现,肌肉和外周血中I型干扰素(α)诱导的D C S基因上调似乎是疾病发病的核心㊂抗-M D A5抗体阳性的J D M在血清和受损皮肤中表现出高T1-I F N特征㊂M D A5抗体阳性D M患者血清和血管中的高T1-I F N特征表明,T1-I F N可能在这些患者的血管病变中起重要作用[14]㊂E m i l y等[15]发现J D M的外周血单核细胞中I型干扰素信号增加;R o b e r-s o n等[16]研究发现,临床上J D M患者的外周血单核细胞具有持续的免疫激活作用,并富含I L-1信号,J D M皮肤和肌肉都显示了I型干扰素激活的证据,以及与抗原提呈和细胞呼吸基因表达降低相关的基因㊂血液中的I型干扰素途径标志性生物标记物与J D M患者的皮肤皮肌炎病区和严重程度指数评分高度相关[17]㊂结合我们所得到的免疫功能分析显示,J D M样本与健康组样本中I型干扰素差异有统计学意义㊂综上表明T1-I F N可能是J D M的潜在特异性分子途径㊂852华北理工大学学报(医学版)2023年7月第25卷第4期J o u r n a l o f N o r t h C h i n a U n i v e r s i t y o f S c i e n c e a n d T e c h n o l o g y(H e a l t h S c i e n c e s E d i t i o n),J u l.2023,V o l.25,N o.4Copyright©博看网. All Rights Reserved.O A S2即寡腺苷酸合成酶2,其属于O A S 基因家族㊂O A S2是一个核苷酸结合的寡聚结构域,包含蛋白质2(N O D2)结合伙伴,导致R N A s e-L活性增强,提示O A S2和其他先天免疫信号通路之间可能存在必要相关性[18]㊂干扰素诱导的双链R N A激活酶是O A S蛋白㊂O A S基因家族的表达在J D M中受到高度调节,类似于对d s R N A病毒感染的免疫反应,有研究报道发现J D M肌肉活检增加了O A S家族基因的表达,特别是O A S1㊁O A S2㊁O A S3和O A S4[19]㊂较早有研究表明过度角化的细胞可能是皮肌炎患者皮损形成的原因,其中O A S 基因可能激活一种凋亡细胞死亡机制[20]㊂同时,O u y a n g等[21]研究发现,J D M的所有O A S 基因都受到调节,并且99%的O A S基因家族网络显著上调㊂因此,筛选的O A S2基因可能为J D M的一个重要发病基因㊂综上所述,本研究通过生物信息联合免疫分析鉴定了O A S2基因可能成为J D M诊断的生物标记物及潜在的治疗靶点,并提出T1-I F N 可能是调节J D M的潜在分子途径㊂此次研究为J D M发病机制的探索提供新的思路,并且可能挖掘出相关基因在诊断及治疗J D M的潜在价值㊂然而,该研究存在一些局限性㊂首先,我们只关注了免疫分析相关的基因,可能忽略了其他与J D M相关的潜在基因㊂此外,本研究是基于生物信息分析与解读,还需体内外实验来进一步验证㊂参考文献[1]B r i a n M F e l d m a n,L i s a G R i d e r,A n n M R e e d,e t a l.J u v e n i l e d e r m a t o m y o s i t i s a n d o t h e r i d i o-p a t h i c i n f l a mm a t o r y m y o p a t h i e s o f c h i l d h o o d[J].L a n c e t(L o n d o n,E n g l a n d),2008,371(1):2201-2212.[2]S u n C,L e e J H,Y a n g Y H,e t a l.J u v e n i l e d e r-m a t o m y o s i t i s:a20-y e a r r e t r o s p e c t i v e a n a l y s i so f t r e a t m e n t a n d c l i n i c a l o u t c o m e s[J].P e d i a t rN e o n a t o l,2015,56(1):31-39.[3]P a t i l A,L u J,K a s s i r M,e t a l.A d u l t a n d j u-v e n i l e d e r m a t o m y o s i t i s t r e a t m e n t[J].J C o s-m e t D e r m a t o l,2022:1-7.[4]W u Q,W e d d e r b u r n L R,M c C a n n L J.J u v e n i l ed e r m a t o m y o s i t i s:l a t e s t a d v a n c e s[J].B e s tP r a c t R e s C l i n R h e u m a t o l,2017,31(4):535-557.[5]C a l l e n J P,W o r t m a n n R L.D e r m a t o m y o s i t i s[J].C l i n D e r m a t o l,2006,24(5):363-373.[6]B a t t h i s h M,F e l d m a n B M.J u v e n i l e d e r m a t o-m y o s i t i s[J].C u r r R h e u m a t o l R e p,2011,13(3):216-224.[7]C l o u g h E,B a r r e t t T.T h e G e n e E x p r e s s i o nO m n i b u s D a t a b a s e[M].S t a t i s t i c a l G e n o m i c s.2016:93-110.[8]S z k l a r c z y k D,G a b l e A L,L y o n D,e t a l.S T R I N G v11:p r o t e i n-p r o t e i n a s s o c i a t i o n n e t-w o r k s w i t h i n c r e a s e d c o v e r a g e,s u p p o r t i n gf u n c t i o n a l d i s c o v e r y i ng e n o m e-w i d e e x p e r i-m e n t a l d a t a s e t s[J].N u c l e i c A c i d s R e s,2019, 47(D1):D607-D613.[9]B o h a n A,J B.P.P o l y m y o s i t i s a n d d e r m a t o-m y o s i t i s(f i r s t o f t w o p a r t s)[J].N E n g l JM e d,1975,292(7):344-347. 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大肠杆菌翻译起始因子IF1的生物信息学分析、表达载体构建及蛋白纯化

基因组学与应用生物学,2020年,第39卷,第12期,第5606-5616页研宄报告Research Report大肠杆菌翻译起始因子IF1的生物信息学分析、表达载体构建及蛋白纯化徐本锦刘玲山西医科大学汾阳学院医学检验系.汾阳,032200•通信作者,***************.cn摘要为了解大肠杆菌IF1在pET22b载体上的表达特性,优化蛋白表达条件并建立纯化策略,进一步揭 示其在细胞生命活动中的功能机制。
本研究构建了大肠杆菌in/4基因的原核表达载体pET22b-h//l,优化表 达条件并纯化出1F1蛋白,通过生物信息学手段对IF1进行了系统分析。
结果表明,过表达载体构建正确,IF1主要在裂解后的上清液中表达,镍柱初步纯化后IF1主要分布于50 mmol/L、100 mmol/L和200 mmol/L 的咪唑洗脱液中。
分子筛二次纯化后发现,IF丨蛋白纯度高,无降解。
IF1是一个由72个氨基酸组成的碱性蛋 白,等电点为9.22,不稳定指数为37.35,半衰期大于10 h,含有一个S1样RNA结合结构域,13个rRNA结合 位点,6个可能的磷酸化位点,是一种无跨膜螺旋的亲水性蛋白。
多序列比对和进化分析显示,沙门氏菌与大 肠杆菌IF1的序列一致性最高,并且亲缘关系最近;其次是假结核耶尔森菌。
本研宄为细菌翻译起始因子的 表达和纯化摸清了条件,为后续的翻译相关功能实验和三维结构分析提供了材料准备,同时有助于揭示1F1的确切功能及翻译起始机制。
关键词大肠杆菌co/〇,丨F1,蛋白表达,生物彳g息学分析Bioinformatic Analysis, Expression Vector Construction and Protein Purification of E. coli Translation Initiation Factor 1Xu Benjin*Liu LingDepartment of Medical Laboratory Science, Fenyang College, Shanxi Medical University, Fenyang, 032200*Correspondingauthor,***************.cnDOI: 10.13417/j.gab.039.005606Abstract In order to investigate the expression characteristics of Escherichia coli IF1on pET22b vector,optimize the expression conditions and establish purification strategy,and further reveal its functional mechanism in cell life activities.In this work,the expression vector pET22b-m/4 was generated,expression conditions were optimized and IF1protein was purified,and many characteristics of IF1was systematically analyzed by bioinformatics tools.The results showed that the overexpression vector was constructed correctly,the protein was mainly expressed in the supernatant of bacterial lysate,and distributed in 50 mmol/L, 100 mmol/L and 200 mmol/L imidazole eluents after preliminary purification with nickel column.After secondary purification with molecular sieve, the results showed that IF1protein had high purity and no degradation.IF1was a basic protein composed of72 amino acids,the isoelectric point was 9.22, the instability index was 37.35, and the half-life was more than 10 hours.It is a hydrophilic protein containing a SI like RNA binding domain, 13 rRNA binding sites, 6 possible基金项目:本研究由山西省高等学校科技创新项目(2020L0749)、山西省高等学校大学生创新创业训练计划重点项目(2020777)、吕梁市科技计划项目(2020SHFZ29)和山西医科大学汾阳学院引进人才启动基金项目(2020A01)共同资助引用格式:X u B.J.,and Liu L.,2020, Bioinformatic analysis, expression vector construction and protein purification of c o// transla- tion i n i t i a t i o n factor 1,Jiyinzuxue Y u Yingyong Shengwuxue (Genomics and Applied Biology), 39(12): 5606-5616 (徐本锦,刘玲,2020,大肠杆菌翻译起始因子IF1的生物信息学分析、表达载体构建及蛋白纯化,基因组学与应用生物学,39(12): 5606-5616)大肠杆菌翻译起始因子IF1的生物信息学分析、表达载体构建及蛋白纯化5607phosphorylation sites and without transmembrane helix.Multiple sequence alignment and evolutionary analysis showed that Salmonella typhi IF1had the highest sequence identity and the closest genetic relationship with that of E. coli,followed by Yersinia pseudotuberculosis.This study established the optimal conditions for the expression and purification of bacterial translation initiation factors,provided material preparation for the following translation-related functional experiments and three-dimensional structure analysis,and helped to clarify the exact function of IF1and the mechanism of translation initiation.Keywords E. coli,Translation initiation factor1,Protein expression,Bioinformatic analysisD N A携带的遗传信息经过转录形成mRNA,mRNA再被翻译成蛋白质来执行生物学功能,即为 著名的中心法则(Vigarand Wieden,2017)。
IFIH1基因突变致Aicardi

基金项目㊀1中国医学科学院医学与健康科技创新工程项目:2016⁃12M⁃1⁃008;2首都卫生发展科研专项:2016⁃2⁃40114;3国家卫生健康委员会公益性行业科研专项:201401012;4中央级公益性科研院所基本科研业务经费:2016ZX310182⁃1作者单位㊀中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院儿科㊀北京,100730通讯作者㊀宋红梅,email:songhm1021@hotmail.com㊃论著㊃DOI:10.3969/j.issn.1673⁃5501.2021.01.005IFIH1基因突变致Aicardi⁃Goutières综合征7型1例并文献复习王㊀伟㊀全美盈㊀王㊀薇㊀王长燕㊀马明圣㊀宋红梅㊀㊀摘要㊀目的㊀报道1例Aicardi⁃Goutières综合征(AGS)7型患儿的临床特点,总结国外既往报道病例特点㊂方法㊀回顾分析1例AGS7型患儿的临床表现㊁Ⅰ型干扰素刺激基因表达和全外显子(WES)测序结果㊂检索PubMed数据库㊁万方数据库及中国知网数据库中IFIH1或MDA5基因突变导致AGS7的病例,总结临床特征和基因突变谱㊂结果㊀3岁男孩,因 反复皮疹2年余 就诊,6月龄起病,临床特点包括生长发育落后㊁肝功能异常㊁WBC减低㊁ESR升高㊁颅内钙化㊁脑白质病变㊁肺间质病变㊁亚临床甲减,干扰素下游分子表达增加,WES测序:IFIH1基因c.1016C>A(p.Ala339Asp),新生杂合突变,诊断AGS7㊂文献复习共检索到15篇(与本文病例合并后共31例AGS7患儿)㊂AGS7可表现为肌张力异常㊁肢体瘫痪㊁生长发育落后㊁皮损等,以及血细胞减少㊁肝酶异常㊁甲状腺功能异常㊁颅内钙化㊁脑白质病变和脑萎缩等辅助检查异常㊂31例共检出IFIH1基因17个致病突变,其中16个错义突变,1个无义突变,未发现明确的基因型⁃临床表型相关性㊂该疾病无自限性㊂5例(16.1%)死亡,原因为心肺并发症㊁嗜血细胞综合征㊁肝衰竭和胰腺炎㊂结论㊀AGS7型是Ⅰ型干扰素相关疾病,以生长发育落后以及神经系统㊁血液系统㊁甲状腺㊁肝㊁脾等多系统和器官受累为特点㊂关键词㊀Aicardi⁃Goutières综合征7型;㊀Ⅰ型干扰素相关疾病;㊀临床特点AcaseofAicardi⁃Goutièressyndrometype7inChinaandliteraturereviewWANGWei,QUANMeiying,WANGWei,WANGChangyan,MAMingsheng,SONGHongmei(DepartmentofPediatrics,PekingUnionMedicalCollegeHospital,PekingUnionMedicalCollege,ChineseAcademyofMedicalSciences,Beijing100730,China)CorrespondingAuthor:SONGHongmei,email:songhm1021@hotmail.comAbstractObjectiveToreportacaseofAicardi⁃Goutièressyndrometype7(AGS7)inChinaandsummarizetheclinicalcharacteristicsofcasespreviouslyreportedinothercountries.MethodsTheclinicalmanifestations,theexpressionoftypeIinterferonstimulatedgenesandresultsofwhole⁃exomesequencing(WES)wereretrospectivelyanalyzed.WesearchedAGS7causedbythemutationofIFIH1orMDA5inthedatabasesofPubMed,WanfangandCNKI.Clinicalfeaturesandgenemutationspectrumweresummarized.ResultsA3⁃year⁃oldboyexperiencedrecurrentrashformorethan2yearssinceageof6months.Furtherassessmentidentifiedgrowthretardation,abnormalliverfunction,decreasedwhitebloodcells,increasederythrocytesedimentationrate,basalgangliacalcification,leukodystrophy,pulmonaryinterstitialdisease,subclinicalhypothyroidism,andincreasedexpressionofinterferonstimulatedgenes.WESrevealedadenovo,heterozygousmutationintheIFIH1gene(c.1016C>A,p.Ala339Asp).ThediagnosisofAGS7wasmade.Ourliteraturereviewincluded15publications.Atotalof31patients,includingourcase,werereported.AGS7couldbecharacterizedbymyodystonia,paralysis,developmentalbackwardness,skinlesions,aswellasabnormalauxiliaryexaminationresults,suchascytopenia,hypohepatia,thyroiddysfunction,intracranialcalcification,leukoencephalopathyandencephalatrophy.Atotalof17pathogenicvariantswerereportedin31cases,including16missensemutationsand1nonsensemutation.Butawelltargetedrelationshipbetweengenotypeandphenotypewasnotfound.Itisnotaself⁃limiteddisease.Fivepatients(15%.1)diedofascardiopulmonarycomplications,hemophagocyticsyndrome,cirrhosisorpancreatitis.ConclusionAGS7isatypeIinterferonopathiescharacterizedbyregressionofdevelopment,andinvolvementofmultipleorgans,suchasnervoussystem,blood,thyroidgland,liver,spleenandsoon.Keywords㊀Aicardi⁃Goutièressyndrometype7;㊀TypeⅠinterferon⁃relateddisease;㊀Clinicalfeatures1㊀病例资料㊀㊀男,3岁,因 反复皮疹2年余 入北京协和医院(我院)儿科㊂患儿6月龄以面部红色斑疹(图1A㊁B)起病,病程中每月发热1次,发热与皮疹无时间关联,亦无明显规律,体温37.3 38ħ,可自行恢复正常体温㊂患儿主要临床信息时间轴见图2㊂㊀㊀既往史:生后因 胎粪吸入 于NICU住院1周㊂3月龄诊断 重症肺炎 ㊂无反复感染史,否认重大手术㊁外伤史㊂个人史和家族史:生后混合喂养,6月龄前规律体检,家长诉生长发育稍落后,4月龄会抬头,10月龄会坐,2岁会走㊁开始说话㊂目前会模仿大人说话,口齿不清㊂已接种第1针乙肝疫苗,余疫苗均未接种㊂家族史未诉异常㊂入院查体:体重11kg(<P3),身高86cm(<P3),头围46cm(<P1),面部㊁四肢大量陈旧棕色皮疹(图1C㊁D),可见陈旧破溃处结痂,可触及皮下硬结,局部干燥脱屑,面部可见窦道,有少量黄色分泌物排出,左上肢破溃处可见脓性分泌物㊂躯干散在浅棕色皮疹㊂心㊁肺㊁腹查体无殊㊂四肢关节未见明显异常㊂四肢肌张力和肌力正常㊂图1㊀患儿皮疹表现注㊀A:6月龄;B:1岁;C㊁D:3岁㊀㊀实验室检查:血常规WBC3.34ˑ109㊃L-1,N1.40ˑ109㊃L-1,Hb和PLT正常㊂尿㊁粪常规均未见异常㊂血生化:ALT52U㊃L-1,AST72U㊃L-1,CK正常,LDH624U㊃L-1,肾功能正常,总胆固醇(TC)4.73mmol㊃L-1,甘油三酯(TG)5.47mmol㊃L-1㊂血涂片:RBC大小不等,可见大RBC,WBC和PLT形态大致正常㊂真菌㊁结核㊁TORCH㊁EB病毒㊁细小病毒㊁布氏杆菌和莱姆病毒均阴性㊂CRP4.0mg㊃L-1,ESR44mm㊃h-1,铁蛋白(Fer)417ng㊃mL-1㊂免疫指标:补体正常,IgG24.27g㊃L-1,IgA4.73g㊃L-1,IgM0.56g㊃L-1㊂TB细胞亚群:T细胞百分比80.0%,CD4+T细胞百分比31.8%,CD8+T细胞百分比45.5%,NK细胞百分比15.2%,B细胞百分比1.7%,B细胞35个/μL㊂ANA㊁抗ds⁃DNA抗体㊁ENA11项均为阴性,自身免疫肝炎相关抗体阴性㊂甲状腺功能:TSH37.8(参考值范围:0.38 4.34)μU㊃mL-1,T443.9(参考值范围:4.3 12.5)nmol㊃L-1,抗甲状腺过氧化酶抗体(A⁃TPO)37(参考值范围:<34)IU㊃mL-1,FT4正常㊂㊀㊀影像学检查:头颅CT平扫(图3A):双侧额顶叶及基底节区钙化,遗传或代谢性疾病可能㊂头颅MR(图3B㊁C):双侧额叶㊁侧脑室旁白质多发斑片状长T2信号影,T1W1显示不清,FLAIR像呈高信号㊂胸部高分辨CT:双肺间质纹理增多并弥漫斑片影,考虑双肺间质改变㊂肝㊁胆㊁胰㊁脾㊁图2㊀患儿主要临床信息时间轴图图3㊀头颅影像学表现注㊀A:头颅CT;B㊁C:头颅MR双肾超声:肝实质回声稍增强㊂超声心动图:心脏结构及功能未见明显异常,肺动脉压正常㊂㊀㊀qPCR由中国医学科学院基础医学研究所报告,与健康人相比,患儿IFI127㊁IFI44L㊁IFIT1㊁ISG15㊁RSAD2表达均增加㊂图4㊀患儿ISG表达水平㊀㊀基因检测:征得患儿父母同意后行全外显子组测序(由上海药明康德医药检验所完成),再对可疑致病位点行Sanger测序验证㊂结果显示,患儿携带IFIH1基因(NM_022168)新生杂合突变c.1016C>A(p.Ala339Asp),未见gnomAD人群等位基因频率数据库和文献报道,PROVEAN软件预测为 有害 (预测-5.808),Polyphen2预测为 可能有害 (预测1分)㊂㊀㊀诊疗经过:自发病后,外院用甲泼尼龙片(4 8mg㊃d-1)及人免疫球蛋白定期输注治疗,皮疹无好转,且逐渐出现血液㊁肝脏等系统受累的情况㊂2019年4月就诊我院,明确诊断后加用Jak抑制剂托法替布(2.5mg,bid),同时加用左甲状腺素钠片对症治疗㊂随诊至2020年3月,患儿皮疹未再反复出现,且血细胞及肝酶均恢复正常,ESR25mm㊃h-1㊂2㊀文献复习㊀㊀以 Aicardi⁃GoutièressyndromeORIFIH1ORMDA5 为检索式在PubMed数据库检索,以 主题=Aicardi⁃Goutières综合征或者主题=IFIH1或者主题词=MDA5 为检索式在万方数据库和中国知网数据库检索,检索时间均从2014年1月1日至2020年3月1日㊂共检索到15篇(其中2篇报道病例为既往报道病例)Aicardi⁃Goutières综合征7型相关文献,英文14篇,中文1篇,与本文病例合并后共31例患儿㊂㊀㊀男24例(77%),女7例;生后起病10例,1 12月龄起病13例,1 3岁起病7例,1例13岁起病;首发症状主要表现为:易怒,喂养困难,肌张力异常,发育落后,冻疮样皮疹,肝脾肿大㊁肝酶升高㊁血小板减少,肺动脉高压,小头畸形;19例报告了生长发育情况,14例(74%)落后;18例报告了是否小头畸形,13例(72%)为小头畸形;16例报告了智力发育,6例(38%)落后;21例报告了皮疹情况,17例(81%)出现皮损,5例(24%)表现为冻疮样皮疹,少见皮疹包括荨麻疹㊁面部红斑㊁雀斑样㊁丘疹㊁水泡㊁皮肤干燥㊁弥漫性银屑病㊁肘部及膝盖过度角化㊁蓝莓松饼斑㊁溃疡性和光敏性血管疹㊁网状青斑等,3例未具体描述,1例无皮疹;26例报告了肌张力,23例(88%)肌张力异常;17例报告了四肢,10例(59%)四肢瘫痪;10例报告了是否有癫发作,5例(50%)有癫发作;22例报告了运动发育状况,19例(86%)运动发育落后;其他神经系统表现还有:失语,构音障碍,语言发育落后,眼球震颤㊁眼球运动异常,吞咽能力障碍,尿储留,神经系统发育迟缓等㊂13例报告了血细胞,11例(85%)减少;9例行肝功能检查,7例(78%)肝酶升高;3例(100%)行甲状腺功能检测,均异常;7例行IFN检查,5例(71%)升高;17例(100%)行干扰素刺激基因(ISG)检测,均升高㊂头颅影像学中,19例报告是否存在脑萎缩,11例(58%)脑萎缩;26例报告是否存在颅内钙化,24例(92%)颅内钙化;24例报告是否存在脑白质病变,21例(88%)脑白质病变㊂死亡6例,其中3例死于心肺并发症,1例死于心脏骤停,1例死于噬血细胞综合征,1例死于反复胰腺炎和肝硬化㊂㊀㊀28例同时检测了患儿及其父母的基因,19例(68%)为新生突变,目前共报道IFIH1基因17个突变点,16个为错义突变,1个为无义突变,突变发生在Hel(解旋酶结构域)2㊁Hel1㊁P(钳子结构域)㊁CTD(C端结构域)分别为14㊁12㊁4和1例㊂31例患儿中,一家系中父子2例,子为先证者;一家系父子3例,哥为先证者;一家系父子叔父3例,叔父为先证者;一家系兄弟2例,哥为先证者,突变来自于父亲,父亲无症状;1例突变来自于母亲,母亲无症状㊂3㊀讨论㊀㊀Aicardi⁃Goutières综合征(AGS,OMIM225750)于1984年由Aicardi和Goutières首先提出[15],是一种罕见的以脑白质受累为主的遗传性脑病,其典型的临床表现包括严重的智力运动发育落后或倒退㊁锥体束及锥体外系症状和体征㊁癫㊁小头畸形及冻疮样皮疹,还可出现血细胞减少㊁肝酶升高㊁甲状腺功能异常等多种临床表现㊂㊀㊀AGS多为常染色体隐性遗传,根据其致病基因不同,分为7型,目前已报道的相关致病基因包括TREX1(AGS1)㊁RNASEH2B(AGS2)㊁RNASEH2A(AGS3)㊁RNASEH2C(AGS4)㊁SAMHD1(AGS5)㊁ADAR1(AGS6)㊁IFIH1(AGS7),多为常染色体隐性遗传,但IFIH1㊁部分ADAR及TREX1所致为常染色体显性遗传[16]㊂AGS7型是Rice等2014年提出的一种新类型[2],其致病基因为IFIH1,功能获得性突变可导致AGS7,目前发现的突变点多位于Hel1和Hel2结构域㊂㊀㊀MDA5的N端负责下游传递信号,DExDbox解旋酶区域为调节结构域,负责识别dsRNA㊂当MDA5感知病毒dsRNA,可通过一系列信号传递,诱导Ⅰ型IFN的产生,Ⅰ型IFN与干扰素受体(IFNAR)结合,活化的IFNAR结合Janus激酶1(JAK1),激活STAT信号通路正反馈调节Ⅰ型IFN的产生,从而导致全身炎症反应[17]㊂目前国外文献报道的ISGs共有6个,即IFI27㊁IFI44L㊁IFIT1㊁ISG15㊁RSAD2㊁SIGLEC1[18]㊂因检测方法不同,本研究共检测了5个(不包括SIGLEC1),患儿血中ISGs水平较健康人明显升高,与既往文献报道一致㊂㊀㊀文献复习可见AGS7型多在婴幼儿期起病,可累及神经㊁皮肤㊁血液㊁甲状腺和肝脏等多个系统或脏器㊂以神经系统症状较突出,如肌张力异常㊁四肢瘫痪㊁运动发育落后等;皮肤表现,特别是冻疮样皮疹,发生率不高㊂本文患儿婴儿期起病,以冻疮样皮疹首发,神经系统症状不明显,与文献报道不同㊂本文患儿的突变既往未见相关报道,不除外与基因型相关,但目前临床已报道病例较少,尚未发现明确的基因型⁃表型关系㊂根据文献复习,神经系统症状随年龄增加逐渐加重,当患儿无明显神经系统症状时,头颅影像学已可见明显钙化及脑白质病变,考虑影像学改变早于临床症状,因此对于一些没有神经系统症状的患儿,也应积极行头颅影像学检查㊂㊀㊀除AGS外,IFIH1还与许多炎症状态有关[19,20],如皮肌炎㊁慢性盘状狼疮㊁扁平苔藓㊁系统性红斑狼疮㊁银屑病和慢性牙周炎等多种疾病㊂Oda等[3]报道了AGS7型患儿有狼疮样综合征表现,本文患儿皮肤活检病理曾提示符合狼疮样皮疹,病程中ANA抗体阳性,外院曾怀疑系统性红斑狼疮㊂但SLE多发生于青春期女孩,AGS发病年龄较早,因此对于早发病的类狼疮样表现的患儿,需警惕AGS的可能㊂还有报道IFIH1与遗传性痉挛性截瘫相关,Liu等[21]报道了1例成年男性,表现为步态异常㊁双下肢痉挛,基因检测提示IFIH1杂合突变c.1093A>G(p.K365E),患者头颅MR正常,无皮疹,炎症指标㊁自身免疫抗体等均为阴性,生长发育正常,不符合AGS临床特点,诊断为遗传性痉挛性截瘫㊂此外IFIH1功能获得性突变还可导致Singleton⁃Merten综合征(SMS)[6,22],其临床特征包括主动脉瓣钙化㊁牙萌出延迟㊁恒牙早期脱落㊁骨质减少和骨溶解,部分报道也提出银屑病和青光眼,同时也表现出明显的Ⅰ型IFN信号增强㊂2015年,Rutsch等[23]报道了c.2465G>A(p.Arg822Gln)导致SMS,Insa等[6]于2018年提出该突变点可同时出现典型AGS7型的临床表现;Takeichi等[7]报道了1例IFIH1突变点为c.2561T>A(p.Met854Ly)患儿具有生长发育落后㊁颅内钙化等AGS的特点,同时伴有牙齿发育不良㊁骨质疏松等SMS的特征,考虑为AGS7型重叠SMS㊂Bursztejn等[4]报道了父子3人均为AGS7型患者,具有相同突变点,其中父亲同时具有牙根发育不良㊁主动脉钙化等SMS特点㊂本文患儿目前牙齿发育正常,超声心动图正常,眼部检查不配合,尚需随诊㊂AGS7与SMS均可导致Ⅰ型IFN素信号增强,因此有学者认为可能为同一种疾病的不同临床表现㊂㊀㊀多数AGS7型患儿基因检测为新生突变,既往报道部分遗传于父母,但具有相同突变的患者,临床表现可能具有异质性㊂Hacochen等[24]报道了一对AGS7型父女,具有相同突变,Ⅰ型IFN水平均升高,女儿具有典型的颅内钙化㊁脑白质病变等影像学特点,但父亲的头颅影像学正常㊂Rice等[2]报道9例患者中1例具有典型AGS临床表现的男孩,突变来源于母亲,其祖母也携带该突变点,但母亲及祖母均无临床症状㊂这些表型差异可能与基因外显率有关,还可能受环境㊁表观遗传学等多种因素影响㊂㊀㊀目前关于AGS7治疗的研究较少,个别病例报道中应用糖皮质激素㊁吗替麦考酚酯㊁利妥昔单抗等药物治疗,病情并不能完全缓解[2,24]㊂该病为Ⅰ型相关疾病,根据其发病机制,国外学者建议应用JAK抑制剂治疗,目前已应用于临床的药物包括鲁索利替尼㊁托法替尼㊁巴瑞克替尼[17]㊂也有少数AGS7应用鲁索利替尼治疗有效的报道[25,26]㊂参考文献1 王栋吴永涛刘迎龙等.左冠状动脉异位窦起源致猝死l例.心肺血管病杂志2017 36 1 51⁃52.2 李进嵩崔锦钢钱杰等.冠状动脉左主干走行异常导致运动性晕厥和心肌梗死一例.中华心血管病杂志2017 4510 893⁃894.3 MaronBJ DoererJJ HaasTS etal.Suddendeathsinyoungcompetitiveathletes analysisof1866deathsintheUnitedStates 1980⁃2006.Circulation 2009 119 8 1085⁃1092.4 KiyokuniM GodaM OkiyamaM etal.Acaseofcardio⁃pulmonaryarrestcausedbyanomalousoriginofleftmaincoronaryarteryfromrightsinusofvalsalva.IntJCardiol2015 184 4 296⁃298.5 HauserM.Congenitalanomaliesofthecoronaryarteries.Heart 2005 91 9 1240⁃1245.6 ZwadloC MeyerGP SchiefferB etal.Anomalousintramuralcourseofcoronaryarteriesincongenitalheartdisease⁃threecasereportsandreviewoftheliterature.CongenitHeartDis 2012 7 2 139⁃144.7 KaushalS BackerCL PopescuAR etal.Intramuralcoronarylengthcorrelateswithsymptomsinpatientswithanomalousaorticoriginofthecoronaryartery.AnnThoracSurg 2011 92 3 986⁃992.8 TaylorAJ ByersJP CheitlinMD etal.Anomalousrightorleftcoronaryarteryfromthecontralateralcoronarysinus "high⁃risk"abnormalitiesintheinitialcoronaryarterycourseandheterogeneousclinicaloutcomes.AmHeartJ 1997 1334 428⁃435.9 FrommeltPC FrommeltMA TweddellJS etal.Prospectiveechocardiographicdiagnosisandsurgicalrepairofanomalousoriginofacoronaryarteryfromtheoppositesinuswithaninterarterialcourse.JAmCollCardiol 2003 42 1 148⁃154.10 WangSS ChenJM ZengGH etal.The'coronaryarterysandwichanomaly'.IntJCardiol 2014 172 1 e196⁃e198.11 AngeliniP WalmsleyRP LibrerosA etal.Symptomaticanomalousoriginationoftheleftcoronaryarteryfromtheoppositesinusofvalsalva.Clinicalpresentations diagnosisandsurgicalrepair.TexHeartInstJ 2006 33 2 171⁃179.12 LeeSE YuCW ParkK etal.Physiologicalandclinicalrelevanceofanomalousrightcoronaryarteryoriginatingfromleftsinusofvalsalvainadults.Heart 2016 102 2 114⁃119.13 NasisA MachadoC CameronJD etal.Anatomiccharacteristicsandoutcomeofadultswithcoronaryarteriesarisingfromananomalouslocationdetectedwithcoronarycomputedtomographyangiography.IntJCardiovascImaging 2015 31 1 181⁃191.14 KimSY SeoJB DoKH etal.Coronaryarteryanomalies classificationandECG⁃gatedmulti⁃detectorrowCTfindingswithangiographiccorrelation.Radiographics 2006 26 2 317⁃333.15 ThankavelPP BrownPS CarronHD etal.Imagingthecoronaryartery isitreallynormal Howtoavoidcommonechocardiographicpitfalls.CircCardiovascImaging.2012 53 415⁃418.16 刘燕蒋桔泉马昌榕等.163例运动性晕厥的临床特征及危险因素分析.华南国防医学杂志2019 33 4 268⁃271.17 韩咏王树水陈寄梅等.儿童及青少年冠状动脉异常起源于对侧冠状窦的诊断与治疗.中华实用儿科临床杂志2018 33 1 42⁃45.18 RaoA PimpalwarY YaduN etal.Astudyofcoronaryarteryvariantsandanomaliesobservedatatertiarycarearmedforceshospitalusing64⁃sliceMDCT.IndianHeartJ 2017 691 81⁃86.19 CheezumMK GhoshhajraB BittencourtMS etal.Anomalousoriginofthecoronaryarteryarisingfromtheoppositesinus prevalenceandoutcomesinpatie⁃ntsundergoingcoronaryCTA.EurHeartJCardiovascImaging 2017 18 2 224⁃235.20 UnzuéL GarcíaE López⁃MelgarB etal.Percutaneoustreatmentofananomalousleftmainarisingfromtheoppositesinuswithsubpulmoniccourse.CardiovascRevascMed 2018 19 5PtB 632⁃637.21 YounissMA GhoshhajraB BernardS etal.Familialanomalousoriginofrightcoronaryarteryfromtheleftcoronarysinus.AmJCardiol 2018 122 10 1800⁃1802.22 WarnesCA WilliamsRG BashoreTM etal.ACC/AHA2008GuidelinesfortheManagementofAdultswithCongenitalHeartDisease areportoftheAmericanCollegeofCardiology/AmericanHeartAssociationTaskForceonPracticeGuidelineswritingcommitteetodevelopguidelinesonthemanagementofadultswithcongenitalheartdisease .Circulation 2008 11823 e714⁃833.23 MainwaringRD ReddyVM ReinhartzO etal.Surgicalrepairofanomalousaorticoriginofacoronaryartery.EurJCardiothoracSurg 2014 46 1 20⁃26.24 WangSS ChenXX ChenJM etal.Echocardiographicfindingsofananomalousoriginoftheleftcoronaryarteryinchildrenandadolescents realorfake JUltrasoundMed 2016 35 8 1783⁃1790.25 ThankavelPP BalakrishnanPL LemlerMS etal.Anomalousleftmaincoron⁃aryarteryoriginfromtherightsinusofValsalva anovelechocardiographicscreen⁃ingmethod.PediatrCardiol 2013 34 4 842⁃846.(收稿日期:2020⁃03⁃05㊀修回日期:2020⁃09⁃13)(本文编辑:张萍)。
ifi44l基因

ifi44l基因
IFI44L基因是人类基因组中的一个重要成员,它编码了一种称为IFI44L蛋白的蛋白质。
IFI44L蛋白参与了人类免疫系统的调节和抗病毒反应。
研究表明,IFI44L基因在感染性疾病的发展和治疗中起着重要作用。
IFI44L基因参与了人类免疫系统的调节,可以调节多种干扰素相关基因的表达,影响免疫细胞的发育、分化和活化,从而增强机体的抵抗力。
此外,IFI44L基因的表达水平与患者的疾病状态密切相关,如病毒感染、恶性肿瘤和自身免疫疾病等。
IFI44L基因的异常表达可能与这些疾病的发生和发展有关。
因此,IFI44L基因在疾病诊断和治疗中具有重要的应用价值。
北京协和医学院内分泌博士课程02潘慧生长激素缺乏性矮小症

双胎之一是GHD
IGHD 垂体柄断裂MRI冠状位图
Clinical Features of Patients with/without MRI-Identified Pituitary Stalk Transection
Transection of stalk
Yes
Possible
No
Age at 1st visit
(%) (%) (%)
88
86
95
79
67
82
72
85
73
70
70
85
93
83
44
75
95
60
96
97
95
GH测试评价
筛查试验: 运动试验 容易做、可靠性低 L-dopa 特异性低 可乐定 敏感性低
确诊试验: 精氨酸 ITT glucagon
GHD诊断思路
正常
IGF-1, IGFBP-3
低
不是GHD
0, 20, 30,60, 90, 120
Glucago 0.5mg/m2 n
癫痫
血糖 2~3倍 0, 30, 60, 90,120, 150,
180
精氨酸 0.5g/kg
0, 30, 60, 90,120, 150, 180
可乐定
0.15mg/m2 p.o.
注意BP 同上
L-Dopa
10mg/kg p.o. <14kg 125mg 14-23kg 250mg >32kg 500mg
(Pit-1)
PROP-1 多发性垂体激素缺乏
GHRH
生长激素缺乏
GHRH受体 家族性单纯性生长激素缺乏
真菌治疗指南

[4]. Slavin MA. J Antimicrob Chemother. 2002; 49 S1: 3-9. [5]. Kauffman CA.. Proc Am Thorac Soc. 2006;3(1):35-40
一,重症患者IFI的流行病学
(三)ICU患者侵袭性真菌感染的病死率 ICU患者IFI的病死率很高,仅次于血液病和肿瘤患者[6]。侵袭性念珠菌感染的病死率达30%~60%[3,7],而念珠菌血症的粗病死率甚至高达40%~75%[2],其中光滑念珠菌和热带念珠菌感染的病死率明显高于白念珠菌等其它念珠菌。 侵袭性曲霉感染病死率高达58%~90%,明显高于念珠菌感染[6-8],是血液系统肿瘤和骨髓移植受者等免疫抑制患者死亡的主要原因。
(一)确诊IFI
1、深部组织感染 2、真菌血症 3、导管相关性真菌血症
(二)临床诊断IFI (三)拟诊IFI
(四)诊断IFI的参照标准
1、危险(宿主)因素:
(1)无免疫功能抑制的基础疾病的患者 (2)存在免疫功能抑制的基础疾病的患者
四、重症患者IFI的诊断
四、重症患者IFI的诊断
重症患者IFI的诊断
[6]. Tortorano AM. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2004 Apr; 23(4): 317-22. [7]. Meersseman W. Am J Respir Crit Care Med. 2004; 170: 621–625. [8]. Denning DW. Am J Respir Crit Care Med. 2004; 170: 580-581.
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ifi44l基因-回复
什么是ifi44l基因?
ifi44l基因是人类基因组中的一种编码蛋白质的基因。
ifi44l基因位于长臂染色体12上,编码一种名为“干扰素-诱导蛋白44-样基因”的蛋白质。
ifi44l基因的表达会受到干扰素信号通路的调控,同时也与人体免疫系统的调节和反应过程密切相关。
ifi44l基因在免疫应答中的作用
ifi44l基因是干扰素信号通路的重要组成部分,它在免疫应答中发挥着重要的作用。
研究表明,当人体感染病原体时,免疫系统会启动干扰素信号通路来对抗病原体的入侵。
在这个过程中,ifi44l基因的表达会被激活,进而产生干扰素-诱导蛋白44-样基因的蛋白质。
ifi44l基因编码的蛋白质在抗病原体过程中发挥重要的免疫调节作用。
它可以调节多种干扰素相关基因的表达,影响免疫细胞的发育、分化和活化,从而增强机体的抵抗力。
研究还发现,ifi44l基因的表达水平与患者的疾病状态密切相关,如病毒感染、恶性肿瘤和自身免疫疾病等。
ifi44l基因的异常表达可能与这些疾病的发生和发展有关。
ifi44l基因在疾病诊断和治疗中的应用
由于ifi44l基因在多种疾病过程中的重要作用,科研人员开始探索其在疾病诊断和治疗中的应用前景。
一方面,ifi44l基因的表达水平可以作为某些疾病的标志物,辅助临床医生进行早期诊断和疾病监测。
另一方面,研究人员尝试通过调节ifi44l基因的表达来干预疾病过程,以达到治疗的目的。
例如,一些研究表明,ifi44l基因的过度表达可以增强抗病毒能力,因此在治疗病毒感染方面具有潜在价值。
通过干扰素的刺激或利用基因工程技术调控ifi44l基因的表达,可能可以增强机体的抗病毒免疫力。
此外,ifi44l 基因还被发现可以影响肿瘤细胞的增殖和侵袭能力,因此有望成为肿瘤治疗的新靶标。
尽管ifi44l基因在疾病治疗中的应用前景仍然需要进一步研究和实践验证,但其作为免疫调节因子的重要性已经得到广泛认可。
通过深入研究ifi44l 基因的分子机制和功能,可以为新治疗策略的开发提供有力的科学依据。
希望未来能有更多的研究将ifi44l基因与临床实践结合起来,为疾病的防治做出更加有益的贡献。