illumina设备及芯片介绍及临床应用课件
免疫荧光试剂盒临床应用PPT课件
妊娠期
甲硝唑500mg，口服，2次/d，共7d
甲硝唑250mg，口服，3次/d，共7d
氯洁霉素300mg，口服，2次/d，共7d
哺乳期
选择局部用药，尽量避免全身用药
奈瑟氏淋球菌
1.临床意义
造成淋病的病原微生物，引发以泌尿生殖道化脓性炎症为
主要临床症状的性传播疾病 淋病是常见的性传播疾病之一，且发病率呈上升趋势，已 构成威胁公众健康的重大疾病 妊娠期感染淋病对母婴危害极大，宫内感染易致自然流产、 早产及胎儿宫内发育迟缓 分娩时母婴垂直传播，可致新生儿淋病性结膜炎，治疗若 不及时彻底，新生儿有致盲的危险 淋病孕妇产后易发生散播性淋病
背景复杂易漏检需要实验者具备丰富的实践经验寻找足够数量的线索细胞不具备特异性阴道加德纳菌免疫荧光法94539751操作简便检测时间短可直接检测出主要致病菌标本需要量少特异性强结果判断直观灵敏度高等优点直接检测病原微生物检测意义清晰2019121616阴道加德纳菌阳性图片2019121617治疗方案非孕期推荐方案甲硝唑500mg口服2次d共7d075甲硝唑膏5g阴道上药2次d共5d2克林霉素膏5g阴道上药1次晚共7d替代方案克林霉素300mg口服2次d共7d克林霉素栓300g阴道上药1次晚共3d2019121618妊娠期氯洁霉素300mg口服2次d共7d哺乳期选择局部用药尽量避免全身用药2019121619奈瑟氏淋球菌造成淋病的病原微生物引发以泌尿生殖道化脓性炎症为主要临床症状的性传播疾病淋病是常见的性传播疾病之一且发病率呈上升趋势已构成威胁公众健康的重大疾病妊娠期感染淋病对母婴危害极大宫内感染易致自然流产早产及胎儿宫内发育迟缓分娩时母婴垂直传播可致新生儿淋病性结膜炎治疗若不及时彻底新生儿有致盲的危险淋病孕妇产后易发生散播性淋病1
二代测序原理及应用
二代测序原理及应用二代测序技术是指第二代测序技术，也称为高通量测序技术。
它是指通过并行测序技术，能够在较短的时间内完成大规模DNA或RNA的测序。
二代测序技术具有高通量、高效率、低成本等特点，因此在基因组学、转录组学、表观基因组学等领域有着广泛的应用。
本文将对二代测序的原理及其应用进行介绍。
首先，我们来了解一下二代测序的原理。
二代测序技术主要包括Illumina、Ion Torrent、454等多种技术平台。
这些技术平台都是基于不同的原理进行测序的。
以Illumina为例，其原理是将DNA样品切割成短片段，然后通过桥式PCR扩增得到cluster，再通过测序芯片上的碱基逐一加入，通过荧光信号检测得到序列信息。
而Ion Torrent则是通过检测DNA合成过程中释放的氢离子来进行测序。
454则是通过测定DNA合成过程中释放的焦磷酸来进行测序。
这些原理都是基于不同的信号检测方式，但都能够实现高通量测序。
其次，我们来看一下二代测序技术的应用。
在基因组学研究中，二代测序技术可以用于揭示物种的基因组结构、功能基因的鉴定、基因组变异的分析等。
在转录组学研究中，可以通过RNA测序技术对转录本进行定量和定性分析，揭示基因的表达模式、剪接变异等信息。
在表观基因组学研究中，可以通过甲基化测序技术对DNA甲基化进行分析，揭示基因组的表观遗传信息。
此外，二代测序技术还可以用于微生物组学研究、癌症基因组学研究、个体化医疗等领域。
总之，二代测序技术作为一种高通量测序技术，具有高效、快速、低成本等优点，已经在基因组学、转录组学、表观基因组学等领域得到了广泛的应用。
随着技术的不断进步，相信二代测序技术在生命科学领域的应用将会更加广泛，为我们揭示更多生命科学的奥秘。
二代测序illumina原理
二代测序illumina原理
二代测序illumina原理是一种革命性的高通量测序技术，被广泛应用于基因组学、转录组学和表观遗传学等领域。
这种技术基于DNA复制、DNA片段连接和扩增、DNA文库构建以及高通量测序等步骤。
二代测序illumina原理的核心是通过将DNA样品切割成短小的片段，然后将
这些片段连接到DNA芯片上的固定位置。
随后，DNA聚合酶从片段的末端开始扩增，生成数百万个从同一初始片段派生的DNA复制品。
这些复制品被通过荧光标
记的核酸碱基识别方式进行测序。
在测序过程中，DNA复制品会被依次合成，其中每个碱基都用一种特定的荧
光染料标记。
通过不断照射荧光，检测不同碱基的发光信号，并记录下它们的相对位置，从而确定DNA序列。
通过识别不同的荧光标记和记录信号，我们可以得到
原始DNA序列的高质量编码。
二代测序illumina原理具有高通量、高效、高精度和低成本等优点。
能够同时
测序数百万个片段，从而大大提高了测序速度和效率。
该技术还具有较低的错误率，能够检测到极低水平的DNA序列变异。
此外，二代测序illumina原理还能够在较
短的时间内获得大量的DNA序列信息，从而加快了基因组学、转录组学和表观遗
传学等研究的进展。
总结而言，二代测序illumina原理是一种先进的高通量测序技术，通过将DNA 样品切割、连接、扩增和测序，以高效、高精度和低成本的方式获得大量DNA序
列信息。
这项技术在基因组学研究、临床诊断和生物学领域的进展中发挥着重要作用。
Illumina测序平台介绍
Illumina测序平台介绍简介博奥生物基于Genome AnalyzerIIx，采用最新的TruSeq试剂，推出了小RNA测序（small RNA sequencing）、转录组测序（tanscriptome sequencing）、基于测序的基因表达研究（gene expression profiling based on sequencing）、全外显子组测序（exome sequencing）、目标区域深度测序（targeted sequence deep sequencing）、DNA甲基化测序（DNA methylation sequencing）和染色质免疫共沉淀测序（chromatin immunoprecipitation sequencing）高通量测序服务。
博奥生物具有近10年的高通量技术服务经验，实验室通过标准化认证并具备严格的质量控制管理系统，服务内容涵盖基因组、转录组、表观遗传组、蛋白质组各个层次和环节，同时拥有高通量测序平台、多种芯片检测平台、验证平台、高性能计算平台及专业的实验技术和生物信息团队，致力于为客户提供高质量的技术服务。
平台设备cBot Paired-endmodualGenome Analyzer IIx技术原理Illumina测序技术结合了微阵列技术和专有的可逆终止子技术进行大规模平行的边合成边测序，通过接头序列将基因组DNA或cDNA的随机片断附着到光学透明的流动槽（flow cell）表面，然后通过桥式扩增，形成数以亿计的DNA 簇（clusters），每个cluster约有1000~6000拷贝的相同DNA模板，然后用4种末端被封闭的不同荧光标记的碱基进行边合成边测序。
对读测序时，可在单端测序完成后进行原位反应，生成对读测序所需的模板，然后应用第二个测序引物对同一cluster进行测序，生成相应的数据。
Illumina测序技术一定程度上确保了高精确度和单碱基逐个测序，可有效减少同聚物和重复序列的测序错误。
二代测序技术-illumina测序原理
二代测序技术-illumina测序原理
Illumina测序技术是一种常用的二代测序技术，也被称为高通量测序技术。
其原理主要包括以下几个步骤：
1. DNA片段制备：首先，将待测的DNA样本进行特定处理，如剪切、连接接头等，生成适合测序的DNA片段。
2.聚合酶链反应（PCR）扩增：将DNA片段进行PCR扩增，以产生大量的DNA模板，供后续测序反应使用。
3.测序芯片制备：将PCR扩增得到的DNA模板固定在测序芯片的表面上，使得每个DNA模板都与芯片上的一个特定位置对应。
4.引物结合与扩增：在测序芯片上，加入带有特定序列的引物，并进行碱基扩增反应。
这种扩增反应是逐个碱基进行的，每次只加入一种碱基。
5.碱基荧光标记：每种碱基都与特定的荧光染料结合，不同的碱基配对会产生不同的荧光信号。
6.成像和信号检测：使用激光或其他光源对测序芯片上的DNA模板进行扫描，并检测每个位置的荧光信号。
7.数据处理和碱基识别：通过分析得到的荧光信号，识别每个位置的碱基。
8.重复扩增和成像：重复以上步骤，直到获得足够的测序数据。
通过以上步骤，Illumina测序技术可以高效地获得大量的测序数据，具有高通量、高准确性和较低的成本等优点，被广泛应用于基因组学、转录组学和表观遗传学等领域的研究。
illumina测序技术原理
illumina测序技术原理Illumina测序技术原理Illumina测序技术是一种高通量测序技术，被广泛应用于基因组学、转录组学、表观基因组学等领域。
它基于DNA的合成和检测原理，能够以极高的精度和速度对DNA进行测序。
本文将介绍Illumina测序技术的原理及其在基因组研究中的应用。
Illumina测序技术的原理主要包括文库构建、芯片测序、图像分析和序列拼接。
首先，需要将待测序的DNA样本进行文库构建。
文库构建过程中，将DNA样本进行断裂、末端修复、连接接头、PCR扩增等步骤，最终得到具有适配子的文库。
接下来，文库中的DNA片段会被固定在Illumina测序芯片上。
Illumina测序芯片是一种高密度的玻璃芯片，表面覆盖着数百万个微小反应室，每个反应室都含有一个适配子。
将文库加到芯片上，使DNA片段与芯片表面的适配子相结合。
适配子上的DNA片段会被桥式扩增成一个簇，每个簇都包含数千个相同的DNA片段。
在芯片上形成的DNA簇之后，进行图像分析。
Illumina测序仪会对芯片进行激光扫描，记录每个DNA簇的荧光强度。
每个适配子上的DNA片段都会通过反复的化学反应，逐个加入荧光标记的核苷酸，每个核苷酸都有一个特定的荧光信号。
通过扫描荧光信号，可以确定每个适配子上的DNA片段的序列。
根据图像分析得到的荧光信号，进行序列拼接。
Illumina测序技术使用的是并行测序方法，即同时测序数百万个DNA片段。
通过比对荧光信号，可以确定每个适配子上的DNA片段的序列。
将这些序列进行拼接，就可以得到整个文库的测序结果。
Illumina测序技术具有高通量、高准确性和高灵敏度的特点，被广泛应用于基因组学研究。
利用这种测序技术，可以对整个基因组进行快速测序，揭示基因组的结构和功能。
同时，Illumina测序技术还可以用于RNA测序，即转录组学研究，帮助研究人员了解基因的表达模式和调控机制。
此外，Illumina测序技术还可以用于表观基因组学研究，揭示DNA甲基化等表观遗传修饰的模式和功能。
illumina二代测序原理
illumina二代测序原理Illumina二代测序原理。
Illumina二代测序技术是一种高通量测序技术，被广泛应用于基因组学、转录组学、表观基因组学等领域。
它的原理主要包括文库构建、测序芯片制备、测序反应和数据分析等步骤。
首先，文库构建是整个测序过程的第一步。
在这一步骤中，DNA样本会被切割成较小的片段，然后通过末端修复、加入接头、PCR扩增等步骤构建成文库。
文库构建的质量直接影响后续的测序结果，因此需要严格控制各个步骤的操作。
接着是测序芯片制备，文库构建完成后，需要将文库片段固定在测序芯片上。
Illumina二代测序技术采用的是flow cell作为测序芯片，文库片段会被固定在flow cell表面的小孔中。
这一步骤的关键是确保文库片段能够均匀地分布在flow cell上，以提高测序的覆盖度和准确性。
随后是测序反应，一旦文库片段固定在flow cell上，就可以进行测序反应了。
Illumina二代测序技术采用的是桥式扩增和碱基延伸的方法进行测序。
在桥式扩增中，每个文库片段会被固定在flow cell上的小孔中，然后通过引物和酶的作用，形成桥式结构。
接着，通过碱基延伸的方式，测序仪会记录下每个文库片段的碱基序列。
最后是数据分析，测序仪会生成海量的原始数据，这些数据需要经过严格的数据处理和分析才能得到最终的测序结果。
数据分析的步骤包括去除低质量序列、去除接头序列、比对到参考基因组、变异检测等。
通过这些步骤，可以得到样本的基因型、基因表达水平、基因组结构等信息。
总的来说，Illumina二代测序技术通过高通量、高准确度、低成本的特点，已经成为目前最主流的测序技术之一。
它在基因组学、转录组学、表观基因组学等领域的应用将为我们提供更多关于生命科学的重要信息，推动科学研究的发展。
【平台介绍】lllumina高通量测序平台
【平台介绍】lllumina⾼通量测序平台美吉⽣物拥有两台Illumina公司⽣产的新⼀代DNA⾼通量测序仪Genome Analyzer。
该测序仪的核⼼专利技术是“DNA簇”和“可逆性末端终⽌（reversible terminator）”，每次实验可以产⽣⼏⼗Gb到⼏百Gb的数据量，具有⾼准确性、⾼通量、⾼灵敏度和低运⾏成本等突出优势。
Illumina Solexa GA IIX测序仪技术原理1. ⽂库制备将基因组DNA打成⼏百个碱基（或更短）的⼩⽚段，并在两个末端加上接头（adapter）。
2. 桥式PCR产⽣DNA簇Illumina⾼通量测序芯⽚表⾯连接有⼀层单链引物，两端连接测序接头的单链DNA⽚段通过与芯⽚表⾯的引物碱基互补结合，引物扩增成为双链后，使双链变性成为单链，该单链DNA的⼀端就被“固定”在芯⽚上，⽽单链DNA的另⼀端随机和附近的另外⼀个引物互补，也被“固定”住，形成“桥（bridge）”。
经过反复30轮扩增后，每个单分⼦得到了约1000倍扩增，成为单克隆“DNA簇”。
3.利⽤可逆化学阻断技术测序利⽤边合成边测序（Sequencing by synthesis）的原理，加⼊改造过的DNA聚合酶和带有4种荧光标记的dNTP。
这些核苷酸是“可逆终⽌⼦”，其3’羟基末端带有可化学切割的部分，每个循环只容许掺⼊单个碱基。
去除其他多余的dNTP后，⽤激光扫描反应板表⾯，读取每条模板序列第⼀轮反应所聚合上去的核苷酸种类。
随后将这些基团化学切割，恢复3’端粘性，继续聚合第⼆个核苷酸。
如此循环，直到每条模板序列都完全被聚合为双链。
统计每轮收集到的荧光信号，就可得知每个模板DNA⽚段的序列。
4. 数据分析⾃动读取碱基，数据被转移到⾃动分析通道进⾏⼆次分析。
技术优势1. 新颖的测序化学技术Genome Analyzer利⽤新颖的可逆荧光标记终⽌⼦，可以在DNA链延伸的过程中检测单个碱基掺⼊。
由于四个可逆终⽌⼦dNTP在每个测序循环都存在，⾃然竞争减少了掺⼊的误差。