毕赤酵母表达手册(详细)

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毕赤酵母分泌表达报告

毕赤酵母分泌表达报告

实验报告毕赤酵母分泌表达报告订单号:«订单号»客户:«客__户»日期:«日__期»目录1 材料与方法 (1)1.1 菌株的保存与培养 (1)1.2 载体构建 (1)1.3 质粒电转毕赤酵母 (1)1.4 转化子筛选 (2)1.5 转化子表达小试 (4)1.6 最优转化子扩大表达 (6)1.7 蛋白鉴定与纯化 (7)2 结果与分析 (9)2.1 转化子筛选 (9)2.2 转化子表达小试 (9)2.3 最优转化子扩大表达 (10)2.4 蛋白纯化与浓度测定 (10)1.材料与方法1.1 菌株的保存与培养大肠杆菌(Eschrichia coli)菌株TOP10于LB培养液摇菌后保存成20%的甘油菌于-80℃冷冻保存。

大肠杆菌于37℃培养箱中培养。

毕赤酵母(Pichia pastoris)菌株X-33于YPD培养液摇菌后保存成25%的甘油菌于-80℃冷冻保存。

毕赤酵母于28℃培养箱中培养。

1.2 载体构建1)目的基因信号肽预测,采用SignalP 4.0和5.1预测,去除信号肽序列;2)根据毕赤酵母表达系统进行密码子优化,避开SacI酶切位点;3)基因合成至pPICZαA,目的基因紧挨着载体α-factor,C端带上6×His。

1.3 质粒电转毕赤酵母1.3.1 目的载体线性化1)按下表配制载体酶切体系:组分体积(ul)质粒(5-10 ug)6 ug10×buffer 5SacI 1 ulddH2O 补到502)37℃酶切过夜;3)琼脂糖凝胶电泳检测,以未酶切的质粒作为对照;4)检测酶切成功后,65℃ 20 min灭活。

1.3.2 线性化载体纯化回收1)按下表配置载体纯化体系:组分体积(ul)酶切产物50核酸助沉剂103 M NaAc,pH=5.2 6无水乙醇1652)-20℃静置35 min以上;3)4℃ 12000 rpm离心15 min,弃上清,此时可以观察到壁上有白色沉淀;4)加入400 ul预冷的80%乙醇重悬沉淀;5)4℃ 12000 rpm离心10 min,弃上清,开盖干燥;6)加入10 ul ddH2O溶解沉淀。

毕赤酵母手册

毕赤酵母手册

毕赤酵母表达实验手册作者:Jnuxz 来源:丁香园时间:2007-9-5大肠杆菌表达系统最突出的优点是工艺简单、产量高、周期短、生产成本低。

然而,许多蛋白质在翻译后,需经过翻译后的修饰加工,如磷酸化、糖基化、酰胺化及蛋白酶水解等过程才能转化成活性形式。

大肠杆菌缺少上述加工机制,不适合用于表达结构复杂的蛋白质。

另外,蛋白质的活性还依赖于形成正确的二硫键并折叠成高级结构,在大肠杆菌中表达的蛋白质往往不能进行正确的折叠,是以包含体状态存在。

包含体的形成虽然简化了产物的纯化,但不利于产物的活性,为了得到有活性的蛋白,就需要进行变性溶解及复性等操作,这一过程比较繁琐,同时增加了成本。

大肠杆菌是用得最多、研究最成熟的基因工程表达系统,当前已商业化的基因工程产品大多是通过大肠杆菌表达的,其主要优点是成本低、产量高、易于操作。

但大肠杆菌是原核生物,不具有真核生物的基因表达调控机制和蛋白质的加工修饰能力,其产物往住形成没有活性的包涵体,需要经过变性、复性等处理,才能应用。

近年来,以酵母作为工程菌表达外源蛋白日益引起重视,原因是与大肠杆菌相比,酵母是低等真核生物,除了具有细胞生长快,易于培养,遗传操作简单等原核生物的特点外,又具有真核生物时表达的蛋白质进行正确加工,修饰,合理的空间折叠等功能,非常有利于真核基因的表达,能有效克服大肠杆菌系统缺乏蛋白翻译后加工、修饰的不足。

因此酵母表达系统受到越来越多的重视和利用。

[1]。

同时与大肠杆菌相比,作为单细胞真核生物的酵母菌具有比较完备的基因表达调控机制和对表达产物的加工修饰能力。

酿酒酵母(Saccharomyces.Cerevisiae)在分子遗传学方面被人们的认识最早,也是最先作为外源基因表达的酵母宿主。

1981年酿酒酵母表达了第一个外源基因----干扰素基因[2],随后又有一系列外源基因在该系统得到表达[3、4、5、6]。

干扰素和胰岛素虽然已经利用酿酒酵母大量生产并被广泛应用,当利用酿酒酵母制备时,实验室的结果很令人鼓舞,但由实验室扩展到工业规模时,其产量迅速下降。

毕赤酵母实验操作手册

毕赤酵母实验操作手册

毕赤酵母表达实验手册大肠杆菌表达系统最突出的优点是工艺简单、产量高、生产成本低。

然而,许多蛋白质在翻译的修饰加工,如磷酸化、糖基化、酰胺化及蛋白酶水解等过程才能转化成活性形式。

大肠杆菌缺少适合用于表达结构复杂的蛋白质。

另外,蛋白质的活性还依赖于形成正确的二硫键并折叠成高级结表达的蛋白质往往不能进行正确的折叠,是以包含体状态存在。

包含体的形成虽然简化了产物的纯的活性,为了得到有活性的蛋白,就需要进行变性溶解及复性等操作,这一过程比较繁琐,同时增与大肠杆菌相比,酵母是低等真核生物,具有细胞生长快,易于培养,遗传操作简单等原核生物的生物时表达的蛋白质进行正确加工,修饰,合理的空间折叠等功能,非常有利于真核基因的表达,菌系统缺乏蛋白翻泽后加工、修饰的不足。

因此酵母表达系统受到越来越多的重视和利用。

大肠杆菌是用得最多、研究最成熟的基因工程表达系统,当前已商业化的基因工程产品大多是通过其主要优点是成本低、产量高、易于操作。

但大肠杆菌是原核生物,不具有真核生物的基因表达调加工修饰能力,其产物往住形成没有活性的包涵体,需要经过变性、复性等处理,才能应用。

近年程菌表达外源蛋白日益引起重视,主更是因为酵母是单细胞真核生物,不但具有大肠杆菌易操作、化生产的特点,还具有真核生物表达系统基因表达调控和蛋白修饰功能,避免了产物活性低,包涵间题[1]。

与大肠杆菌相比,酵母是单细胞真核生物,具有比较完备的基因表达调控机制和对表达产物的们对酿酒酵母(Saccharomyces.Cerevisiae)分子遗传学方面的认识最早,酿酒酵母也最先作为外宿主.1981年酿酒酵母表达了第一个外源基因一干扰素基因,随后又有一系列外源基因在该系统得素和胰岛素已大量生产并在人群中广泛应用,但很大部分表达由实验室扩展到工业规模时,培养基数的选择压力消失,质粒变得不稳定,拷贝数下降,而大多数外源基因的高效表达需要高拷贝数的量下降。

同时,实验室用培养基复杂而昂贵,采用工业规模能够接受的培养基时,往往导致产量的酵母的局限,人们发展了以甲基营养型酵母(methylotrophic yeast)为代表的第二代酵母表达系甲基营养型酵母包括:Pichia、Candida等.以Pichia.pastoris(毕赤巴斯德酵母)为宿主的外源来发展最为迅速,应用也最为广泛,已利用此系统表达了一系列有重要生物学活性的蛋自质。

毕赤酵母表达知识

毕赤酵母表达知识

很好,需要好好研究一下原文地址:毕赤酵母表达知识01转载于丁香作者:思时尔非a.配制500×BIOTIN stock solution(0.02%)有这么3种方案:1、懒人是将Biotin直接溶在去离子水中,放过夜,基本就能溶;2、急性子是将溶液配成0.02N的NaOH,就很容易溶解了;3、水浴加热,温度不能高于50度。

D-生物素是具有生物活性的生物素,也就是vitaminH。

在毕赤酵母代谢过程中,作为多种酶的辅基起作用。

天然培养基中一般可以不单独添加,因为YNB中、酵母粉、蛋白胨中均含有一定量的生物素,但是做高密度发酵还是必须要添加的。

b.有几个比较迷惑的问题请教大家:(很典型的小问题)1、制感受态细胞,OD多少比较好?pyrimidine 战友的方法:取1mlGS115过夜培养物(OD约6-10) 分装到1.5ml EP 管中。

说明书还有一些文献是说在1.3左右效率高,再高了效率会很低2、关于高效转化法,文献说用(LiAc),而invitrogen的说明书说转化毕赤酵母用(LiAc)没用,要用LiCl。

Lithium acetate does not work with Pichia pastoris. Use only lithium chloride.3、YNB到底能高温灭么?有的说能有的说不能。

过滤灭菌的怎么操作?我是把滤器装好膜绑到瓶口用纱布盖上,报纸包上,瓶盖放烧杯里单灭。

然后把配好的溶液用注射器一点点推进去。

4、葡萄糖为什么在YPD里一起灭颜色很深,单灭则不会。

该115度还是121度灭?网上搜了下,都有人用!5、电转化参数用400欧还是200欧?有的用400,有的还专门说不是用400。

都是从园里看到的!电击参数:1.5KV,25uF,200欧姆(不是400)6、电转后,在MD平板上长的应该就是整合了目的基因的重组子了吧?如果不想筛高拷贝的,是否PCR验证一下即可?网友的回答:ynb最好不灭菌,我是0.22um过滤处理的。

毕赤酵母表达系统资料整理

毕赤酵母表达系统资料整理

毕赤酵母表达零碎之相礼和热创作Mut+和Muts毕赤酵母中有两个基因编码醇氧化酶——AOX1及AOX2,细胞中大多数的醇氧化酶是AOX1基因产品,甲醇可紧密调理、诱导AOX1基因的高程度表达,较典型的是占可溶性蛋白的30%以上.AOX1基因调控分两步:抑制/往抑制机制加诱导机制.简单来说,在含葡萄糖的培育基中,即便加入诱导物甲醇转录仍受抑制.为此,用甲醇进行优化诱导时,引荐在甘油培育基中培育.留意即便在甘油中生长(往抑制)时,仍缺乏以使AOX1基因达到最低程度的表达,诱导物甲醇是AOX1基因可辨表达程度所必须的.AOX1基因已被分离,含AOX1启动子的质粒可用来促进编码外源蛋白的目的基因的表达.AOX2基因与AOX1基因有97%的同源性,但在甲醇中带AOX2基因的菌株比带AOX1基因菌株慢得多,经过这种甲醇利用缓慢表型可分离Muts菌株.在YPD(酵母膏、蛋白胨、葡萄糖)培育基中,不管是Mut+还是Muts其在对数期增殖一倍的工夫大约为2h.Mut+和Muts菌株在没有甲醇存在的状况下生长速率是一样的,存在甲醇的状况下,Mut+在对数期增殖一倍的工夫大约为4至6个小时,Muts在对数期增殖一倍的工夫大约为18个小时.菌株GS115、X-33、KM71和SMD1168的区别GS115、KM71和SMD1168等是用于表达外源蛋白的毕赤酵母受体菌,与酿酒酵母相比,毕赤酵母不会使蛋白过糖基化,糖基化后有利于蛋白的溶解或构成正确的折叠结构.GS115、KM71、SMD1168在组氨酸脱氢酶位点(His4)有渐变,是组氨酸缺陷型,假如表达载体上携带有组氨酸基因,可抵偿宿主菌的组氨酸缺陷,因而可以在不含组氨酸的培育基上挑选转化子.这些受体菌自发渐变成组氨酸野生型的概率一样平常低于10-8.GS115表型为Mut+,重组表达载体转化GS115后,长出的转化子可能是Mut+,也可能是Muts(载体取代AXO1基因),可以在MM和MD培育基上鉴定表型.SMD1168和GS115类似,但SMD1168基因组中的Pep4基因发生渐变,是蛋白酶缺陷型,可降低蛋白酶对外源蛋白的降解作用.其中X-33由于是野生型,因而耐受性比较好,假如担心转化率的话可以考虑这种酵母菌,而X33与GS115一样都是属于MUT+表示型,也就是说可以在含甲醇的培育基中快速生长,但是听说会对外源基因表达有影响,KM71的亲本菌在精氨酸琥珀酸裂解酶基因(arg4)有渐变,在不含精氨酸的培育基中不克不及生长.用野生型ARG4基因(约2kb)拔出到克隆的野生型AOX1基因的BamHI(AOX1基因15/16密码子)及SalI(AOX1基因227/228密码子)位点,取代了AOX1基因16-227密码子,此结构转化至KM71亲本菌(arg4his4)中,分离发生KM71 MutsArg+His-菌株,Arg+转化子遗传分析表现野生型AOX1被aox1::ARG4结构所取代,以是KM71全部转化子都是Muts表型.AOX1位点没有被完全缺失,理论上可用你的目的结构经过基因取代方法更换aox1::ARG4结构,这样重组菌株的表型是His+MutsArg-,这意味偏重组菌株生长时需精氨酸.但仅添加精氨酸其实不克不及完全缓和arg4渐变的影响,arg4菌株在含精氨酸的最小培育基中不克不及很好地生长.因而不引荐在KM71中经过取代aox1::ARG4结构来获得His+转化子.一样平常来说,假如是胞内表达,应尽量用Muts细胞,这样得到的蛋白产品中醇氧化酶蛋白量较少而目的蛋白量绝对较多,使卑鄙纯化更易进行.而对于分泌蛋白的表达,无论是甲醇利用慢(Muts)还是甲醇利用快(Mut+)的细胞都可运用.基因重组Pichia.pastoris酵母菌体内无自然质粒,以是表达载体需与宿主染色体发生同源重组,将外源基因表达框架整合于染色体中以完成外源基因的表达,包含启动子、外源基因克隆位点、停止序列、挑选标识表记标帜等.细菌内同源重组被以为是重组质粒构建过程的难点,由于未线性化的环状质粒之间发生同源重组的几率非常低,以是重组转移载体必须用特定的限定性内切酶进行线性化处理.这种处理的目的是防止随机拔出重组时质粒在功能区断开,形成目的基因表达失活,让同源重组以指定的方式发生.表达载体次要分为以下几类:(1)胞内表达载体次要有pHIL-D2、pA0815、pPIC3K、pPICZ、pHWO10,pGAPZ、pGAPZa(Invitrogen)等.该类载体可以将目的基因表达在胞内,可以防止毕赤酵母的糖基化,次要得当于那些不克不及被糖基化相关基因的表达;(2)分泌型表达载体次要有pPIC9、pHIL-S1、pPICZα、pYAM75P等.由于毕赤酵母本人的泌内源蛋白非常少,将外源蛋白分泌到胞外,非常有利于目的蛋白质的纯化及积存.经常运用的分泌的信号序列次要是由89个氨基酸组成的α交配因子(α-factor)的引导;(3)多拷贝拔出表达载体如pPIC9K,pPIC3.5K.在某些状况下,毕赤酵母中重组基因多拷贝整合可添加所需蛋白的表达量.该载体均可用于在体内(pPIC3.5K, pPIC9K)或体外(pAO815)发生并分离多拷贝拔出,同时可检测添加重组基因的拷贝数能否添加蛋白表达量.体内整合可经过高遗传霉素抗性挑选可能的多拷贝拔出,而体外整合可经过连接发生外源基因的串联拔出.在GS115中挑选His+Mut+转化子:用SalI或StuI线性化质粒转化GS115后,大多在His4位点上发生重组,大多数转化子是Mut+表型;但是由于质粒含有AOX1基因序列,有可能在AOX1位点发生重组,毁坏野生型AOX1基因,发生His+Muts转化子,则必要在MD及MM平板上检测可证明His+ Mut+转化子.毕赤酵母表达经常运用培育基10×YNB(13.4%的无氨基酸酵母氮源),134gYNB固体溶于1L蒸馏水,过滤灭菌,4℃保管.YPD完全培育基:酵母提取物10 g/L,蛋白胨20 g/L,葡萄糖20 g/L(固体培育基含1.5%琼脂).转化培育基RDB:每100mL加入山梨醇18g(186 g/L),琼脂糖2g(20g/L)121℃灭菌20分钟,然后待温度降至60℃当前在超净台上加入10×YNB 10mL(13.4 g/L),10×葡萄糖10mL(20 g/L),500×生物素0.2mL(4×10-4g/L),100×AA 1mL.混匀,倒平板(灭菌时只加入80ml水即可).选择培育基MD(最小葡萄糖):配100mL,向80mL水中加入琼脂糖2g(20 g/L)121℃灭菌20分钟,待温度降至60℃当前在超净台上加入10×YNB 10mL(13.4 g/L),10×葡萄糖10mL(20 g/L),500×生物素0.2mL(4×10-4g/L).选择培育基MM(最小甲醇):配100mL,向90mL水中加入琼脂糖2g(20 g/L)121℃灭菌20分钟,待温度降至60℃当前在超净台上加入10×YNB 10mL(13.4 g/L),500×生物素0.2mL(4×10-4g/L),0.5mL甲醇(0.5%).诱导表达培育基BMGY:配1L,酵母提取物10 g/L,蛋白胨20 g/L,3g/L K2HPO4,11.8g/L KH2PO4,加水至890mL,121℃灭菌20分钟,然后待温度降至60℃当前在超净台上加入10×YNB 100mL(13.4 g/L),500×生物素1mL(4×10-4g/L),甘油10mL.诱导表达培育基BMMY:酵母提取物10g/L,蛋白胨20 g/L,3g/LK2HPO4,11.8g/L KH2PO4,加水至895mL,121℃灭菌20分钟,然后待温度降至60℃当前在超净台上加入100×YNB 100mL(13.4 g/L),500×生物素1mL(4×10-4g/L),甲醇5mL.BMGY/BMMY含酵母浸出物及蛋白胨,可波动分泌蛋白,制止或减少分泌蛋白的分解.假如目的蛋白对中性PH蛋白酶敏感的话,可在无缓冲培育基(MGY、MM)中表达.假如没有证据证明你的分泌蛋白对中性PH值蛋白酶敏感,建议开始表达时用BMMY.假如表达蛋白降解了,测验考试在无缓冲培育基中进行表达.假如以上条件仍不克不及无效防止蛋白降解,可将基因转入SMD1168中,该菌株表型是his4pep4,缺失了蛋白酶,转化与表达程序与GS115相反,也可用于大规模发酵.用考马斯亮蓝G-250测蛋白含量。

毕赤酵母发酵工艺手册

毕赤酵母发酵工艺手册

毕赤酵母发酵工艺手册1. 引言欢迎使用毕赤酵母发酵工艺手册。

本手册旨在介绍毕赤酵母发酵的基本原理、工艺步骤以及相关注意事项。

通过遵循本手册,您可以更好地理解和掌握毕赤酵母的发酵过程,从而在生产中取得更好的效果。

2. 毕赤酵母发酵基本原理- 毕赤酵母是一种常见的酵母菌,其发酵能力强,适用于多种发酵产品的生产。

- 发酵是指通过酵母菌对底物中的糖类进行代谢,产生酒精和二氧化碳的过程。

- 毕赤酵母在发酵过程中需要适宜的温度、pH值和营养物质等条件。

3. 毕赤酵母发酵工艺步骤1. 发酵前准备:- 准备好所需的发酵基质,包括糖类、氮源和维生素等。

- 对基质进行消毒处理,确保无害菌的存在。

2. 接种毕赤酵母:- 选择合适的毕赤酵母培养液进行接种,注意接种量的控制。

- 将毕赤酵母培养液均匀加入发酵基质中。

3. 发酵条件控制:- 控制发酵温度在合适的范围内,一般为25-30摄氏度。

- 监测发酵基质的pH值,保持在适宜的范围内。

- 提供足够的氧气供给,促进酵母的生长和代谢。

4. 发酵过程监测:- 定期对发酵过程中的温度、pH值和酵母数量等进行监测和记录。

- 根据监测结果及时调整发酵条件,确保发酵过程稳定进行。

5. 发酵结束:- 当发酵基质中的糖类被完全代谢,产物达到预期时,发酵过程结束。

- 将发酵产物经过处理和提取,得到最终的产品。

4. 注意事项- 在发酵过程中,应注意卫生和消毒,以防止杂菌的污染。

- 严格控制发酵条件,避免过高或过低的温度、pH值对发酵效果产生不利影响。

- 根据不同的发酵产品,可能需要调整发酵步骤和条件,建议根据具体要求进行调整。

- 在使用本工艺手册时,请参考其他文献和专业意见,确保准确性和可靠性。

以上是关于毕赤酵母发酵工艺手册的简要介绍。

希望本手册能对您在毕赤酵母的发酵工艺中提供帮助和指导。

如有任何问题,请随时与我们联系。

谢谢!。

GS115毕赤酵母表达菌使用说明

GS115毕赤酵母表达菌使用说明
GS115 毕赤酵母表达菌
编号
名称
北京华越洋生物 NRR01030 GS115 毕赤酵母表达菌
基 本 信 息 :
名称:GS115 毕赤酵母表达菌
规格:300ul 甘油菌
储 存 温 度 : -­‐80℃
发突变为组氨酸野生型的概率一般低于 10-­‐8。GS115 毕赤酵母可以在 YPD
培养基中生长,或者在补充有组氨酸的 minimal media 中生长,但是无法
在单独的 minimal media 中生长。GS115 毕赤酵母在做质粒转化的时候,
可 采 用 电 转 化 的 方 式 将 质 粒 转 入 。
基 因 组 :
His4( 基 因 5 是毕赤酵母菌株,是巴斯德毕赤酵母的一种,属于真核细胞。
一般的针对原核生物的抗生素例如卡那和氨苄对酵母是无效的,因此为了
操作说明:
1,本品包含一份甘油菌,使用本甘油菌时可以不用完全融解,在甘油菌表
面蘸取少量涂板或进行液体培养即可。也可以完全融解后使用,但随着冻融次数
的增加,细菌的活力会逐渐下降。
2,为保证菌种纯正,避免其它细菌污染,尽量先划平板,然后再挑单克隆
菌落进行后续操作。
毕赤酵母适宜的生长温度是 28 至 30 度,温度超过 32 度对蛋白的表
达是有害的,并可能导致细胞的死亡。GS115 毕赤酵母是是组氨酸缺陷型
(His4 基因型),如果表达载体上携带有组氨酸基因,可补偿宿主菌的组
氨酸缺陷,因此可以在不含组氨酸的培养基上筛选转化子。这些受体菌自
养。细菌在 30-­‐35℃培养箱中培养 24-­‐48h,真菌在 23-­‐28℃培养箱中培养 24-­‐72h
(必要时,可适当延长培养时间)。

毕赤酵母表达(pichia pastoris expression )实验手册(3)

毕赤酵母表达(pichia pastoris expression )实验手册(3)

毕赤酵母表达(pichia pastoris expression )实验手册(3)液体YPD培养基可常温保存;琼脂YPD平板在4℃可保存几个月。

加入Ze ocin 100ug / ml,成为YPDZ培养基,可以4℃条件下保存1~2周。

2.4 YPDS + Zeocin 培养基(Yeast Extract Peptone Dextrose Medi um):yeast extract 1%peptone 2%dextrose (glucose) 2%sorbitol 1 M+agar 2%+ Zeocin 100 μg/ml不管是液体 YPDS培养基,还是YPDS + Zeocin 培养基,都必须存放4℃条件下,有效期1~2周。

2.5 MGYMinimal Glycerol Medium (最小甘油培养基)(34%YNB;1%甘油;4*10-5%生物素)。

将800ml灭菌水、100ml的 10* YNB母液、2ml的500*B母液和100ml的10*GY母液混匀即可,4℃保存,保存期为2个月。

2.6 MGYHMinimal Glycerol Medium + Histidine (最小甘油培养基 + 0.004%组氨酸)在1000ml的MGY培养基中加入 10ml的100*H母液混匀,4℃保存,保存期为2个月。

2.7 RDRegeneration Dextrose Medium (葡萄糖再生培养基)(含有:1mol/L的山梨醇;2%葡萄糖;1.34%YNB;4*10-5%生物素;0. 005%氨基酸)1. 将186g的山梨醇定容至700ml,高压灭菌;2. 冷却后于45℃水浴;3. 将100ml的10*D、100ml的10*YNB;2ml的500*B;10ml的100*AA等母液和88ml无菌水混匀,预热至45℃后,与步骤2 的山梨醇溶液混合。

4℃保存。

2.8 RDHRegeneration Dextrose Medium + Histidine (葡萄糖再生培养基 + 0.004%组氨酸)在RD培养基配制的第三步中,在加入10ml的100*H母液,同时无菌水的体积减少至78ml即可,其余配制方法与RD相同。

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毕赤酵母表达(pichia pastoris expression )实验手册2010-07-15 10:54:56| 分类:毕赤酵母| 标签:|字号大中小订阅一.毕赤酵母表达常用溶液及缓冲液的配制二.毕赤酵母表达的培养基配制三.主要试验环节的操作 3.1 酵母菌株的分离纯化 3.2 pPICZαA原核宿主菌TOP10F’的活化培养 3.3毕赤酵母表达的试验方法 3.4 毕赤酵母电转化方法 3.5 Pichia酵母表达直接PCR鉴定重组子的方法 3.6 毕赤酵母基因组提取方法 3.7 Mut+表型重组酵母的诱导表达实验关键词:酵母实验毕赤酵母表达 pichia pastoris expression 毕赤酵母酵母菌株大肠杆菌表达系统最突出的优点是工艺简单、产量高、周期短、生产成本低。

然而,许多蛋白质在翻译后,需经过翻译后的修饰加工,如磷酸化、糖基化、酰胺化及蛋白酶水解等过程才能转化成活性形式。

大肠杆菌缺少上述加工机制,不适合用于表达结构复杂的蛋白质。

另外,蛋白质的活性还依赖于形成正确的二硫键并折叠成高级结构,在大肠杆菌中表达的蛋白质往往不能进行正确的折叠,是以包含体状态存在。

包含体的形成虽然简化了产物的纯化,但不利于产物的活性,为了得到有活性的蛋白,就需要进行变性溶解及复性等操作,这一过程比较繁琐,同时增加了成本。

大肠杆菌是用得最多、研究最成熟的基因工程表达系统,当前已商业化的基因工程产品大多是通过大肠杆菌表达的,其主要优点是成本低、产量高、易于操作。

但大肠杆菌是原核生物,不具有真核生物的基因表达调控机制和蛋白质的加工修饰能力,其产物往住形成没有活性的包涵体,需要经过变性、复性等处理,才能应用。

近年来,以酵母作为工程菌表达外源蛋白日益引起重视,原因是与大肠杆菌相比,酵母是低等真核生物,除了具有细胞生长快,易于培养,遗传操作简单等原核生物的特点外,又具有真核生物时表达的蛋白质进行正确加工,修饰,合理的空间折叠等功能,非常有利于真核基因的表达,能有效克服大肠杆菌系统缺乏蛋白翻译后加工、修饰的不足。

因此酵母表达系统受到越来越多的重视和利用。

[1]。

同时与大肠杆菌相比,作为单细胞真核生物的酵母菌具有比较完备的基因表达调控机制和对表达产物的加工修饰能力。

酿酒酵母(Saccharomyces.Cerevisiae)在分子遗传学方面被人们的认识最早,也是最先作为外源基因表达的酵母宿主。

1981年酿酒酵母表达了第一个外源基因----干扰素基因[2],随后又有一系列外源基因在该系统得到表达[3、4、5、6]。

干扰素和胰岛素虽然已经利用酿酒酵母大量生产并被广泛应用,当利用酿酒酵母制备时,实验室的结果很令人鼓舞,但由实验室扩展到工业规模时,其产量迅速下降。

原因是培养基中维特质粒高拷贝数的选择压力消失[7、8],质粒变得不稳定,拷贝数下降。

拷贝数是高效表达的必备因素,因此拷贝数下降,也直接导致外源基因表达量的下降。

同时,实验室用培养基成分复杂且昂贵,当采用工业规模能够接受的培养基时,导致了产量的下降[9]。

为克服酿酒酵母的局限,1983年美国Wegner等人最先发展了以甲基营养型酵母(methylotrophic yeast)为代表的第二代酵母表达系统[10]。

甲基营养型酵母包括:Pichia、Candida等.以Pichia.pastoris(毕赤巴斯德酵母)为宿主的外源基因表达系统近年来发展最为迅速,应用也最为广泛。

毕赤酵母系统的广泛应用,原因在于该系统除了具有一般酵母所具有的特点外,还有以下几个优点[1、9、11];⑴具有醇氧化酶AOX1基因启动子,这是目前最强,调控机理最严格的启动子之一。

⑵表达质粒能在基因组的特定位点以单拷贝或多拷贝的形式稳定整合。

⑶菌株易于进行高密度发酵,外源蛋白表达量高。

⑷毕赤酵母中存在过氧化物酶体,表达的蛋白贮存其中,可免受蛋白酶的降解,而且减少对细胞的毒害作用。

Pichia.pastoris基因表达系统经过近十年发展,已基本成为较完善的外源基因表达系统,具有易于高密度发酵,表达基因稳定整合在宿主基因组中,能使产物有效分泌并适当糖基化,培养方便经济等特点。

利用强效可调控启动子AOX1,已高效表达了HBsAg、TNF、EGF、破伤风毒素C片段、基因工程抗体等多种外源基因[11、12、13],证实该系统为高效、实用、简便,以提高表达量并保持产物生物学活性为突出特征的外源基因表达系统,而且非常适宜扩大为工业规模[14]。

目前美国FDA已能评价来自该系统的基因工程产品,最近来自该系统的Cephelon制剂已获得FDA批准,所以该系统被认为是安全的.Pichia.pastoris表达系统在生物工程领域将发挥越来越重要的作用,促进更多外源基因在该系统的高效表达,提供更为广泛的基因工程产品[9、11]。

近年来,Invitrogon公司开发了毕赤酵母表达系统的系列产品,短短几年已经有300多种外源蛋自在该系统得到有效表达,被认为是目前最有效的酵母表达系统。

毕赤酵母宿主菌常用的有GS115和KM71两种,都具有HIS4营养缺陷标记。

其中,GS115茵株具有AOX1基因,是Mut+,即甲醇利用正常型;而KM71菌株的AOX1位点彼ARG4基因插入,表型为Muts,即甲醇利用缓慢型,两种菌株都适用于一般的酵母转化方法。

Pichia.pastoris酵母菌体内无天然质粒,所以表达载体需与宿主染色体发生同源重组,将外源基因表达框架整合于染色体中以实现外源基因的表达[15],包括启动子、外源基因克隆位点、终止序列、筛选标记等。

表达载体都是穿梭质粒,先在大肠杆菌复制扩增,然后被导入宿主酵母细胞。

为使产物分泌胞外,表达载体还需带有信号肽序列。

毕赤酵母表达系统有多种分泌型表达质粒,有许多蛋白在毕赤酵母得到了高效分泌表达。

胞外表达需要在外源蛋白的N 末端加上一段信号肽序列,引导重组蛋白进入分泌途径,可使蛋白蛋白质在分泌到胞外之后获得准确的构型。

毕赤酵母对外源蛋白自身的信号序列识别能力差,在本试验中所使用pPICZαA质粒,其信号肽来自酿酒酵母的α-交配因子(α-factor),能很好的达到以上的要求。

并且作为新一代的毕赤酵母分泌表达质粒,它还拥有一个特点是其具有Zeocin 抗性标记基因,给我们筛选转化子的工作带来很大的便利[1、9]。

pPICZαA质粒是作为新一代的毕赤酵母分泌表达质粒,它的主要特点简介如下:⑴具有强效可调控启动子AOX1(alcohol oxidase,醇氧化酶);⑵具有Zeocin抗性筛选标记基因,重组转化子可直接用Zeocin进行筛选,即在YPDZ平板上生长的转化子中,100%都有外源基因的整合,大大简化了重组转化酵母的筛选过程[15]。

在操作过程中,Zeocin也可用来筛选含表达载体pPICZαA的大肠杆菌转化子,不必另外使用Amp,经济而又简便;。

⑶在表达载体A0X1 5’端启动子序列下游,有供外源基因插入的多克隆位点,多克隆位点下游有A0X1 3’端终止序列;⑷分泌效率强的信号肽α-factor.Invitrogen公司开发的毕赤酵母表达系统的系列产品作为目前被应用为最为广泛的酵母表达系统,其主要的优点有:醇氧化酶可调控的强启动子,能高密度发酵,重组蛋白表达量高。

外源基因整合在酵母基因组上,可以稳定存在。

同时,高效分泌表达质粒能将外源蛋白表达后,进行翻译后加工处理,将外源蛋白分泌到细胞外,不但提高表达蛋白的活性,而且.有利于产物的纯化一.毕赤酵母表达常用溶液及缓冲液的配制1.1 各种母液的配制10*YNB (含有硫酸铵、无氨基酸的13.4%酵母基础氮源培养基)4℃保存。

34g酵母基础氮源培养基(无硫酸铵)+100g 硫酸铵,溶于1000ml水中,过滤除菌。

500*B (0.02%生物素Biotin)4℃保存保存期为1年。

20mg的生物素溶于100ml水中,过滤除菌。

100*H (0.4%Histidine 组氨酸)4℃保存保存期为1年。

400mg的L-组氨酸溶于100ml水中,(加热至50℃以促进溶解),过滤除菌。

10*D (20%Dextrose 葡萄糖)保存期为1年。

200g葡萄糖溶于1000ml水中,灭菌15min或过滤除菌。

10*M (5%Methanol 甲醇)保存期为2个月。

将5ml的甲醇与95ml水混匀,过滤除菌。

10*GY (10%Glycerol 甘油)保存期为1年以上。

将100ml甘油和900ml水混匀后,高压灭菌或过滤除菌。

100*AA (0.5% of each Amino Acid,各种氨基酸)4℃保存保存期为1年。

分别将500mg的L-谷氨酸、L-蛋氨酸、L-赖氨酸、L-亮氨酸和L-异亮氨酸溶于100ml水中,过滤除菌。

1M 磷酸钾溶液(potassium phosphate buffer,pH6.0),将1mol/L的K2HPO4溶液132ml与1mol/L的KH2PO4溶液868ml混匀,其pH为6.0,如需调节pH,则使用磷酸和氢氧化钾调节pH。

1.2 常用溶液及缓冲夜1.2.1 碱裂解法抽提质粒DNA所用溶液:溶液Ⅰ:50mmol / L glucose,100mmol / L EDTA,25mmol / L Tris-HCI (pH 8.0)溶液Ⅱ:0.2mol/L NaOH,1%SDS(临用时配制)溶液Ⅲ:29.44g KAc,11.5ml Acetic acid,加ddH2O 至100 ml。

4℃保存。

1.2.2 10% 甘油(Glycerol):将100ml甘油和900ml水混匀后,高压灭菌或过滤除菌。

保存期为1年以上。

1.2.3 Rnase-H2O:1ul Rnase 加入1ml 灭菌dd H2O。

4℃保存。

1.2.4 TE缓冲液:10mmol / Tris-CI(pH 8.0),lmmol / L EDTA(pH 8.0)1.2.5 STE缓冲液:0.1mol / L, 10mmol / L Tris-HCl (pH 8.0), 1mmol / L EDTA (pH 8.0)1.2.6 SCE缓冲液:1mol / L Sorbitol (山梨醇), 10mmol / L 柠檬酸钠,10mmol / L EDTA1.2.7 1M potassium phosphate buffer (pH 6.0):132 ml 1M K2HPO4868 ml 1M KH2PO41.2.8 50X TAE 琼脂糖凝胶电泳缓冲液,pH 8.0(1L):242 g Tris57.1 ml Acetic Acid37.2 g EDTA二.毕赤酵母表达的培养基配制[5]2.1 LB(Luria-Bertani)培养基:Trypton l%Yeast Extract 0.5%NaCl l%PH 7.0制作平板时加入2%琼脂粉。

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