基因多态性研究及其应用
探讨基因多态性对甲氨蝶呤代谢及临床的影响及意义
目录引言 (1)研究对象与材料 (3)1研究对象 (3)2治疗方案 (3)3不良反应监测 (3)4仪器与材料 (5)4.1主要实验仪器 (5)4.2主要实验试剂 (6)方法 (7)1PCR法检测基因的分型 (7)1.1基因组的提取 (7)1.2引物设计与合成 (7)1.3PCR扩增 (8)2限制性内切酶片断长度多态性（RFLP）分析和测序 (9)3高效液相色谱法测定MTX动态血药浓度 (10)4统计学处理 (9)结果 (11)1.MTHFR基因型与等位基因分布情况 (11)2.MTHFR基因型与HD-MTX化疗后动态MTX浓度的关系 (11)3.MTHFR基因多态性与MTX毒副作用之间的关联性 (12)讨论 (15)结论 (19)参考文献 (20)综述 (20)综述参考文献 (20)攻读学位期间的研究成果 (31)附录 (32)致谢 (34)学位论文独创性声明、学位论文知识产权权属声明 (35)引言引言白血病是临床上常见的一类造血干细胞恶性克隆疾病，因细胞增殖失控、分化障碍和凋亡受阻等因素所致在骨髓和造血器官和组织内大量增殖，浸润其他组织和器官，影响正常造血功能。
其中急性淋巴细胞白血病（Acute lymphoblastic leukemia，ALL）儿童和青少年中最常见的恶性肿瘤之一，占儿童白血病发病率的一半以上，且以每年1%的速度在增长[1-3]。
急性淋巴白血病的主要临床症状为发热、出血、关节疼痛或贫血为主[4]。
该病发生迅速，恶性程度较高，但对化学药物敏感，癌细胞易杀灭[5]。
临床治疗上以甲氨蝶呤鞘内或者静脉注射为主要化疗方式。
1岁以内白血病患儿的生存率40~50%，1岁以上患儿5年生存率超过90%。
因此，ALL的及时发现和诊断对疾病的治疗具有重要意义。
随着分子生物学水平的快速发展，人们不断地从分子水平探寻疾病的发病机理，多年的临床研究表明，ALL的易感性与ALL基因多态性密切相关[6-8]。
生物学中的遗传多态性研究
生物学中的遗传多态性研究遗传多态性作为一种遗传变异形式，是指基因在种群中存在多种等位基因的现象。
它在生物学中是一个非常重要的研究方向，因为遗传多态性不仅是生物种群进化的基础，也是生物学各个领域中的重要研究对象。
本文将介绍遗传多态性的概念、发生机制以及在生物学中的应用。
一、遗传多态性的概念遗传多态性（genetic polymorphism）是指在种群中的某一基因有两种或两种以上的等位基因，在一定条件下每种等位基因的频度都大于0.01。
这个概念最初是由英国的遗传学家弗雷德里克·格里菲斯提出的。
遗传多态性是基因水平上的表型变异，通过不同等位基因的组合而表现出来。
在人类学、动物学和植物学等领域中，遗传多态性都是一个非常重要的指标。
在人类学中，遗传多态性可以用来进行人类种群进化和迁徙的研究；在动植物学中，遗传多态性可以用来研究物种的起源、退化、适应性以及遗传资源等方面问题。
二、遗传多态性的发生机制遗传多态性在种群进化中的产生有多种机制。
其中，常见的机制有自然选择、基因漂变、基因流和突变等。
自然选择是指环境对不同等位基因的选择作用，使得一些等位基因被淘汰而另一些等位基因得以保留和扩散。
基因漂变是指由于随机的繁殖和变异过程，等位基因的频率发生了漂移的现象。
基因流是指不同种群之间等位基因的转移，这个过程会导致物种群体的基因组成发生改变。
突变是指基因产生的随机变异，这种变异可以导致等位基因的增加或丢失，从而增加遗传多样性。
三、遗传多态性在生物学中的应用1. 遗传多态性与人类疾病遗传多态性在医学中有着广泛的应用。
通过研究人类基因的多态性，可以发现一些跟疾病相关的基因，从而提高人们对疾病的认识和防治能力。
例如，某些人群中有一个名为APOE的基因，它与阿尔茨海默病有一定的关联，人们可以通过检测APOE基因的多态性来判断是否有患上阿尔茨海默病的风险。
2. 遗传多态性与生态保护遗传多态性也被广泛应用于生态保护领域，尤其是对于野生动物和植物。
基因多态位点
基因多态位点1. 引言基因多态位点（Polymorphic Loci）是指在人类或其他生物个体中存在两个或更多的等位基因，其频率大于1%。
这些位点上的多态性是由于基因突变和遗传漂变的结果，可以导致个体间的遗传变异。
基因多态位点对于研究遗传学、人类进化以及个体差异具有重要意义。
本文将介绍基因多态位点的概念、分类、检测方法以及其在医学和生物学领域中的应用。
2. 概念和分类2.1 概念基因多态位点是指在某一特定位置上存在两个或更多等位基因，并且这些等位基因在群体中的频率大于1%。
这些等位基因可以通过单核苷酸多态性（SNP）、插入/缺失（Indel）和串联重复序列（STR）等方式引起。
2.2 分类根据不同的特征和检测方法，基因多态位点可以分为以下几类：•SNP（Single Nucleotide Polymorphism，单核苷酸多态性）：是最常见的一种基因多态位点，指在DNA序列中单个碱基发生变异的现象。
SNP可以导致基因型差异，进而影响个体的表型特征。
•Indel（Insertion/Deletion，插入/缺失）：指在DNA序列中插入或缺失一段碱基的现象。
Indel多态位点可以导致DNA序列长度的变化，从而影响蛋白质的结构和功能。
•STR（Short Tandem Repeat，短串联重复序列）：指在DNA序列中连续重复出现的短片段碱基序列。
STR多态位点是由于不同个体之间重复序列数量和长度的差异所导致。
3. 检测方法为了检测基因多态位点，科学家们开发了多种方法和技术。
下面介绍几种常见的检测方法：3.1 PCR-RFLPPCR-RFLP（Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism）是一种常用的基因分型技术。
它通过先进行PCR扩增目标位点，然后使用限制性内切酶对PCR产物进行酶切，最后通过凝胶电泳分离切割后的DNA片段来确定等位基因。
人类基因组中单核苷酸多态性(SNPs)的研究与应用
起 的多态性 ， 正是这种极小 的被称 为 Ｓ Ｐ 的差异 ， Ｎｓ 才导致 了生命 的多样性——不 同的种族 、 色 、 ， 肤 相貌 对各类疾病不 同 的敏感性 ， 以及对药物 的不 同反应等 等。
家估计人体 中可能有 １０ ０ ２ ０多种不 同的蛋 白质 。一个人 自己的基 因组 和其他 人相 比至少 有 ９ ．％是 一致 的 ， 与 ０ ９９ 如果 有亲缘关系的人的基因组相 比， 这个数字会更高。０ １ 的差异看 上去微不 足道 ， ．％ 但它 意味着 ， 我们的遗 传密码 中， 在 包 含有大约 ３０万个 差异。由于这种差异导致 了人类基因组 中存在 广泛 的多态性 ， ０ 由此形成 了世 界上没 有两个完 全一模
人类基 因组 是人类 的全 套 Ｄ Ａ 包含 了所有 的基因序 列及非 基因序 列 ， Ｎ ， 大约有 ３ 亿 ｂ ， 中蛋 白编码序 列仅 占 ２ ｐ其
１５ ， ． ％ 基因的蛋 白编码序列平均为 １ ｏ 一２００ｂ ， ｏ ０ ｐ 目前 认为人类 基因的数 目大约 为 ３ ｏ —４ ０ Ｏ ＯＯ ０ Ｏ０ ０个 。而一 些科 学
性染色体上的差异更小 ， 色体之问的差异大约是每 １万个碱基有 ４ ６ ｘ染 ．９个 。 Ｙ染 色体 的差 异更小 ， 是每 １ 万个碱基有
１５ 个 。总 的来说 ， 于编码区内的 Ｓ Ｐ 比较少 ， ．１ ］ 位 Ｎｓ 因为在外 显子内其 变异 率只有周围序列 的 １５但它在遗传性疾病 ／。 研究 中却具有重要意义 。 因此 ｃＮ ｓ Ｓ Ｐ 的研究更受关 注。
《蒙古羊和乌珠穆沁羊BMP15基因多态性及其与产羔数的关联性分析》范文
《蒙古羊和乌珠穆沁羊BMP15基因多态性及其与产羔数的关联性分析》篇一蒙古羊与乌珠穆沁羊BMP15基因多态性及其与产羔数关联性分析一、引言随着畜牧业的快速发展，对动物遗传资源的深入研究显得尤为重要。
蒙古羊和乌珠穆沁羊作为我国特有的畜禽品种，其遗传特性的研究对于提高其生产性能和育种工作具有重要意义。
BMP15基因作为影响动物繁殖性能的关键基因之一，其多态性对羊的产羔数有着重要影响。
本文旨在分析蒙古羊和乌珠穆沁羊BMP15基因的多态性及其与产羔数的关联性，为进一步优化育种方案提供理论依据。
二、研究方法本研究采用PCR-RFLP（聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性）技术，对蒙古羊和乌珠穆沁羊的BMP15基因进行多态性分析。
通过统计各基因型个体的产羔数，探讨BMP15基因多态性与产羔数之间的关联性。
三、结果与分析1. BMP15基因多态性分析通过对蒙古羊和乌珠穆沁羊的BMP15基因进行PCR-RFLP 分析，我们发现该基因存在多种基因型。
其中，蒙古羊的BMP15基因型主要为A、B、C三种，而乌珠穆沁羊的BMP15基因型主要为A、D两种。
各基因型在两个品种中的分布存在显著差异。
2. BMP15基因多态性与产羔数的关联性分析统计各基因型个体的产羔数发现，蒙古羊和乌珠穆沁羊中，不同BMP15基因型的个体产羔数存在显著差异。
具体来说，某些基因型的个体产羔数较高，而另一些基因型的个体产羔数较低。
进一步分析表明，BMP15基因多态性与产羔数之间存在显著关联性。
四、讨论本研究表明，蒙古羊和乌珠穆沁羊的BMP15基因存在多种基因型，且各基因型在两个品种中的分布存在显著差异。
此外，BMP15基因多态性与产羔数之间存在显著关联性。
这表明BMP15基因可能是影响蒙古羊和乌珠穆沁羊产羔数的重要遗传因素之一。
在育种工作中，可以通过对BMP15基因的多态性进行检测，选育出产羔数较高的优良个体，进一步提高畜牧业的生產效益。
同时，本研究结果还表明，不同品种的羊在BMP15基因型分布和产羔数方面存在差异，这为进一步开展品种改良和育种工作提供了重要的理论依据。
药物与基因多态性对药物副作用的关联
药物与基因多态性对药物副作用的关联药物的发展与应用是现代医学的重要组成部分，它们可以治疗疾病和改善生活质量。
然而，许多药物应用过程中会出现一些副作用，有时甚至可能对患者产生严重的风险和不适。
不同的个体对同一种药物的反应也有很大的差异，这部分是由基因的多态性所决定。
本文旨在探讨药物和基因多态性对药物副作用之间的关联，以及其对个体化医疗的潜在影响。
一、药物代谢与基因多态性的关系药物在体内的代谢和消除是由一系列的酶催化反应所控制的。
在这一过程中，酶的功能和表达可能受到基因多态性的影响。
例如，细胞色素P450酶（CYP450）是一类常见的药物代谢酶，它们负责氧化和降解许多药物。
在人群中，CYP450基因存在丰富的多态性，导致个体间药物代谢能力的差异。
这些差异可能导致某些患者对特定药物代谢缓慢，从而增加药物在体内的暴露时间，并可能导致副作用的发生。
二、药物靶点与基因多态性的关系药物的疗效通常通过与特定的分子靶点相互作用来产生。
而这些分子靶点的表达和功能可能受到基因多态性的影响。
举例来说，药物靶向特定的受体来调节细胞信号传导通路。
然而，受体的表达和功能可能受到基因多态性的影响，导致不同个体对药物的反应不同。
有些患者可能表达一种变种受体，使得药物无法有效地结合受体，从而降低了疗效。
此外，一些基因变异还可以导致受体抑制或增强的功能改变，从而增加患者出现药物副作用的风险。
三、药物与基因检测在个体化医疗中的应用随着对药物与基因关联研究的深入，个体化医疗逐渐成为可能的现实。
药物与基因检测可以帮助医生了解患者的基因组特征，从而预测患者对药物的反应和副作用风险。
在某些情况下，基于患者基因多态性的药物剂量调整和药物选择已经得到了临床实践的应用。
例如，针对孟鲁斯酶基因的变异可以预测华法林（一种抗凝药物）剂量的个体化调整，以降低出血和血栓的风险。
因此，药物与基因检测的应用将有助于减少药物副作用和提高治疗效果。
四、药物与基因多态性研究的挑战与机遇药物与基因多态性研究面临一些挑战，例如患者基因组数据的获取和分析，药物与基因的复杂关联等。
LMP基因多态性与疾病相关性的研究现状
【综 述】L MP基因多态性与疾病相关性的研究现状王丹妹,莫燕娜,吉丽敏,何佟【摘 要】 低分子量多肽(LMP)基因定位于MHC2Ⅱ类基因区域内的一个基因组,是内源性抗原加工与呈递颇为重要的一种基因。
LMP基因编码的蛋白L M P2与LMP7组成的二聚体,对于抗原肽的降解有着重要的作用,其酶解产物有着严格的空间模式。
由于L M P基因具有多态性,因此酶解产生的抗原肽具有数量或者空间构相的不同,并具有对抗原肽选择性转运的现象。
体内外多种因素可以调节LMP基因的表达和生物活性,从而影响者病毒的感染过程以及肿瘤的发生。
目前LMPP基因与疾病的相关性,以及其多态性与疾病的遗传易感关联日益受到广泛的关注。
本文就这一领域的研究成果做一综述。
【关键词】 L M P;多态性;相关性【中图分类号】 R349.6 【文献标识码】 A 【文章编号】 167424152(2010)0821033203Advance m en t of Correl a ti on between L ow M olecul ar W e i ght Polypepti de Gene Poly m orph is m and D isea ses WAN GD an2m ei,MO Yan2na,J I L i2m in,et al.Hum an B ody Functional L aboratory,Hainan M edical College,Haikou571101,Hainan,Chi2na【Abstract】 Low molecular weight polypep tide(LMP)gene l ocated in the MHC2Ⅱgenes in the regi on of a gene gr oup is en2 dogenous antigen p r ocessing and p resentati on of a very i m portant gene.L M P gene encodes a p r otein di m er composed of LMP2andLMP7,the pep tide has an i m portant r ole in the degradati on of its hydr olyzate has a strict s patial patterns.A s the LMP gene haspoly mor phis m,the pep tide p r oduced by enzy matic or s pace has a number of different confor mati on and on pep tides with selective transfer phenomenon.M any fact ors can regulate in vivo exp ressi on of LMP genes and bi ol ogical activity,thus affecting the p r ocessof those infected with the virus and tu mor occurrence.Currently LMPP genes ass ociated with diseases and their genetic poly mor2phis m and suscep tibility t o diseases are paid increasingly wides p read attenti on.I n this paper,results of research in this field are reviewed.【Key words】 Low molecular weight polypep tide;Poly mor phis m;Correlati on 内源性抗原的处理与提呈在免疫性疾病的发病过程中起着很重要的作用,而与MHC2Ⅰ类分子相关性抗原的处理、提呈途径十分复杂。
遗传多态性与药物代谢的关系研究及其在临床应用中的意义
遗传多态性与药物代谢的关系研究及其在临床应用中的意义近年来，随着个性化医疗的发展，药物代谢动力学研究越来越受到重视。
药物代谢动力学主要研究人体对药物的代谢过程，包括吸收、分布、代谢和排泄等环节。
其中，药物代谢过程中一个重要的因素是人类遗传多态性。
遗传多态性是指人类基因组中存在不同的序列变异，这些序列变异可能导致人类对药物的代谢能力不同，从而导致药物效果和副作用不同。
遗传多态性对药物代谢的影响主要包括基因型对药物代谢酶的表达水平和活性的影响。
药物代谢酶主要包括细胞色素P450酶、醇脱氢酶、芳香族氧化酶等，它们在人体内参与多种药物的代谢和清除。
基因型的不同可能导致药物代谢酶的表达水平和活性的变化，从而影响药物在体内的代谢过程。
例如，细胞色素P450酶CYP2D6基因的多态性常常会影响华法林等药物的治疗效果。
近年来，癌症治疗中遗传多态性的研究尤为引人关注。
由于肿瘤细胞的异质性，不同肿瘤细胞对同一药物的敏感性存在较大差异，因此选择有效的治疗方案对于治疗癌症至关重要。
由于基因型的差异可能导致药物代谢酶表达水平和活性的变化，从而在癌症治疗中引起个体之间的药物代谢动力学变异，因此基因型与药物代谢动力学的相关性在个性化治疗中具有重要的价值。
当前，许多基因和单核苷酸多态性已被发现，据美国食品药品监督管理局统计，目前已经被批准药物标签备案的有药物166种，涉及98个基因的多态性。
这些研究对于药物的个性化治疗方案的开发和制定具有重要的意义。
例如，根据细胞色素P450酶基因多态性选择用药方案，能够减少患者不良反应和治疗失败的风险，同时提高治疗效果。
同时，药物代谢酶基因多态性也被广泛应用于药物开发领域。
事实上，药物的研发过程中，药物代谢动力学研究已成为不可或缺的环节。
通过了解药物的代谢途径和代谢动力学特征，可以应用基因型和代谢动力学试验为药物开发提供指导。
近年来，人类遗传多态性研究取得了重要的进展，也为药物治疗提供了更为有效的策略。
人类遗传学中多态性位点鉴定方法
人类遗传学中多态性位点鉴定方法人类遗传学是研究人类基因组中的遗传变异并探索其对个体表型和疾病形成的影响的学科。
其中，多态性位点（polymorphic loci）鉴定方法是人类遗传学研究中的重要工具之一。
本文将介绍多态性位点的概念及其在人类遗传学中的应用，包括多态性位点的鉴定方法、应用领域和意义。
多态性位点是指基因组中存在的具有多种等位基因（alleles）的位点。
这些位点上的等位基因频率在人群中存在显著差异，即具有多态性。
多态性位点的发现和鉴定可以用于遗传多样性的研究、群体遗传结构的分析、人类进化的推断以及疾病易感性的评估等方面。
多态性位点的鉴定方法主要有遗传标记法、DNA测序法和基因芯片技术。
遗传标记法是通过利用已知的多态性位点进行间接鉴定，常用的方法包括限制性片段长度多态性（Restriction Fragment Length Polymorphism，RFLP）、微卫星标记法（Microsatellite Marker）和单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism，SNP）等。
这些方法通过PCR扩增等技术手段，测定位点上等位基因的特定序列或长度，从而实现位点的鉴定。
DNA测序法是直接测定多态性位点的等位基因序列，其中Sanger测序法和下一代测序技术是最常用的方法。
Sanger测序法是通过链终止法将DNA片段逐个碱基测序，并最终确定等位基因序列。
下一代测序技术包括Illumina测序、Ion Torrent 测序和454测序等，具有高通量、高灵敏度和低成本等优点，广泛应用于多态性位点的鉴定与研究。
基因芯片技术是通过将大量特异性探针固定在芯片表面，检测样品中目标序列的方法。
其中，DNA芯片和SNP芯片是最常用的两种类型。
DNA芯片通过比较样品与探针之间的杂交情况，从而确定目标序列的等位基因分布情况。
SNP芯片利用探针固定在芯片上的SNP位点，通过鉴定样品中SNP位点上的等位基因，实现多态性位点的鉴定。
福建汉族人群D1S1656基因座遗传多态性及其在亲权鉴定中的应用
福建汉族人群D1S1656基因座遗传多态性及其在亲权鉴定中的应用目的研究福建汉族人群D1S1656的遗传多态性及其在亲权鉴定中的应用价值。
方法应用荧光标记复合扩增系统对日常检案中收集的521名福建汉族无关个体血样DNA进行PCR扩增，用ABI 3130基因分析仪对扩增产物进行毛细管电泳，用GeneMapper v3.1软件进行基因分型，统计分析D1S1656 基因座的多态信息，并与其他5个群体进行比较。
结果在D1S1656 基因座发现17个等位基因，在福建汉族人群中的个体识别能力为0.948，非父排除率为0.665。
结论D1S1656 基因座在福建汉族人群具有高度多态性，在亲权鉴定中具有重要应用价值。
标签：福建；汉族；D1S1656；短串联重复序列；亲权鉴定短串联重复序列（STR）是基因组中广泛分布、高度多态性的一类分子标记，是群体遗传学和法医血液遗传学高信息基因座的丰富来源。
随着DNA检验在法庭科学领域的广泛应用，新的STR遗传标记被相继发现，该研究即对福建汉族人群D1S1656基因座进行群体遗传学调查并探讨其法医学应用价值。
该研究采用荧光标记复合扩增技术，对521名汉族无关个体进行了D1S1656基因座的分型检测，分析其多态性，计算其个体识别能力和非父排除能力，验证其应用价值。
1 资料与方法1.1 一般资料日常检案中收集的521名汉族无关个体血样、PowerPlex 21TM。
1.2 方法Chelex-100 法提取血液DNA[1]。
采用10 uL体系进行PCR扩增，扩增条件严格按照使用说明书操作，扩增产物在3130基因分析仪上进行毛细管电泳，用Data Collection v2.1软件收集电泳信息，GeneMapper ID v3.1软件分析基因型。
1.3 统计方法用χ2检验判断D1S1656的基因型分布是否符合Hardy-Weinberg平衡定律，采用PowerStatsV12软件计算杂合度H（heterozygosity，H）、个体识别力DP（power of discrimination，DP）、非父排除率EP（Power of Exclusion，EP）和多态信息总量PIC（polymorphism information content，PIC），采用Arlequin v3.5软件比较不同群体间等位基因频率差异。