土壤微生物数量的测定方法
土壤微生物量碳测定方式

土壤微生物量碳测定方式及应用土壤微生物量碳(Soil microbial biomass)不仅对土壤有机质和养分的循环起着主要作用,同时是一个重要活性养分库,直接调控着土壤养分(如氮、磷和硫等)的维持和释放及其植物有效性。
近40年来,土壤微生物生物量的研究已成为土壤学研究热点之一。
由于土壤微生物的碳含量一般是恒定的,因此采用土壤微生物碳(Microbial biomass carbon, Bc)来表示土壤微生物生物量的大小。
测定土壤微生物碳的主要方式为熏蒸培育法(Fumigation-incubation, FI)和熏蒸提取法(Fumigation-extraction, FE)。
熏蒸提取法(FE法)由于熏蒸培育法测定土壤微生物量碳不仅需要较长的时间而且不适合于强酸性土壤、加入新鲜有机底物的土壤和水田土壤。
Voroney (1983)发现熏蒸土壤用0.5mol·L-1K2SO4提取液提取的碳量与生物微生物量有很好的相关性。
Vance等(1987)成立了熏蒸提取法测定土壤微生物碳的大体方式:该方式用0.5mol·L-1K2SO4提取剂(水土比1:4)直接提取熏蒸和不熏蒸土壤,提取液中有机碳含量用重铬酸钾氧化法测定;以熏蒸与不熏蒸土壤提取的有机碳增加量除以转换系数K EC(取值0.38)来计算土壤微生物碳。
Wu等(1990)通过采用熏蒸培育法和熏蒸提取法比较研究,成立了熏蒸提取——碳自动一路法测定土壤微生物碳。
该方式大幅度提高提取液中有机碳的测定速度和测定结果的准确度。
林启美等(1999)对熏蒸提取-重铬酸钾氧化法中提取液的水土比和氧化剂进行了改良,以提高该方式的测定结果的重复性和准确性。
对于熏蒸提取法测定土壤微生物生物碳的转换系数K EC的取值,有很多研究进行了大量的研究。
测定K EC值的实验方式有:直接法(加入培育微生物、用14C底物标记土壤微生物)和间接法(与熏蒸培育法、显微镜观测法、ATP法及底物诱导呼吸法比较)。
土壤微生物量碳测定方法

土壤微生物量碳测定方法:1、试剂配制:1、0.5M K2SO4溶液:称取K2SO4 87.165g溶液于蒸馏水中,搅拌溶解,(可加热)定容至1 L。
2、去乙醇氯仿的配制:在通风柜中,量取100毫升氯仿至500毫升的分液漏斗中,加入200毫升的蒸馏水,加塞,上下振荡10下,打开塞子放气,而后加塞再振荡10下,反复3次,将分液漏斗置于铁架台上,静止溶液分层,打开分液漏斗下端的阀,将下层溶液(氯仿)放入200毫升的烧杯中,将剩余的溶液倒入水槽,用自来水冲洗。
再将烧杯中的氯仿倒入分液漏斗中,反复3次,将精制后的氯仿倒入棕色瓶中,加入无水分析纯的CaCl2 10g,置于暗处保存。
3、0.8000 mol.L-1 1/6 K2Cr2O7 标准溶液;称取39.2245g重铬酸钾(K2Cr2O7分纯)加400 ml蒸馏水加热溶解,冷却定容1L4、02 mol.L-1 FeSO4 溶液,56.0g硫酸亚铁【FeSO1.7H2O】溶解蒸馏水中,加15ml浓硫酸,用蒸馏水定容至1L5、邻啡罗啉指示剂:1.485g邻啡罗啉(C2H8N2.H2O)及0.695g硫酸亚铁(FeSO4.7H2O)溶于100ml 蒸馏水,形成红棕色络合物【(FeC12H8.N2)8 2+】,贮存于棕色瓶中2、试验步骤:1、制样:称取新鲜土壤(30.0g)于放置烧杯中,加约等于田间持水量60%的水在25℃下培养7~15d【day】,取15.0g土于烧杯,置于真空干燥器中,同时内放一装有用100ml精制氯仿的小烧杯,密封真空干燥器,密封好的真空干燥器连到真空泵上,抽真空至氯仿沸腾5分钟,精制5分钟,再抽滤5分钟,同样操作重复三次。
干燥器放入25℃培养箱中24小时后,抽真空15-30分钟以除尽土壤吸附的氯仿。
按照土:0.5M K2SO4=1:4(烘干土算,一般就是湿土;0.5M K2SO4=1:2),加入0.5M K2SO4溶液(空白直接称取15.0g土,加同样比例0.5M K2SO4溶液)震荡30分钟,过滤。
土壤微生物群落在生态系统中的样品分析与测定

土壤微生物群落在生态系统中的样品分析与测定土壤是生态系统中非常重要的组成部分,同时也是最为丰富复杂的环境之一。
土壤环境中存在着大量的微生物,这些微生物与土壤之间相互作用,对土壤的物质转化、有机质分解和植物生长等方面具有重要的作用。
如何准确地了解土壤微生物群落的数量和多样性,对于揭示土壤生物学的功能和作用,以及发展生态农业,提高土壤质量和农产品产量等都具有重要意义。
一、土壤微生物群落的样品分析方法为了测定土壤微生物群落,必须进行样品的分析和测定。
在对土壤进行样品分析时,需要注意:1.土壤样品的收集在进行样品分析之前,必须进行土壤样品的收集。
土壤样品应该收集大约20-30厘米深度的土壤。
由于土壤菌群、真菌群和放线菌群在不同土层中的数量和种类也不相同,因此,收集的土壤深度需要根据研究的目的而定。
2.土壤样品的处理一般来说,土壤样品要进行粗碎,去杂质、去石头等处理。
此外,还需去除土壤中的植物残渣、动物排泄物等有机物。
在进行处理时,应该注意不破坏土壤结构和微生物活性。
3.土壤样品的储存土壤样品储存的温度和湿度等条件应根据微生物的生长需求而定。
如果储存时间长,应该对样品进行冷冻或低温干燥处理,以防止微生物的生长。
二、土壤微生物群落测定的方法以下是常用的样品测定方法:1.培养计数法该方法是通过使用培养基和适宜环境条件来促进微生物产生可见的生长。
然后通过计数方法确定细菌的数量。
虽然该方法能够对所有培养细菌进行计数,但是只适用于对可培养细菌群的测定,并且样品测定时间较长。
2.生物分子测定法该方法使用了PCR(多聚酶链式反应)等方法,通过分析土壤中微生物的核酸以及基因来测定微生物数量和多样性。
该方法可以对所有微生物进行分析,但精确度受到PCR扩增的准确度和反应的复杂性影响。
3.牢固偏最小二乘回归分析法(PLS-DA)该方法是通过采集土壤样品,并进行数据处理、筛选,最终运用牢固偏最小二乘回归分析法(PLS-DA)来测定微生物数量和多样性。
土壤微生物量碳氮测定方法

1.23.1土壤微生物碳的测定——T O C-V C P H有机碳分析仪一、方法原理土壤有机碳的测量方法主要有两种,即氯仿熏蒸培养法和氯仿熏蒸—直接浸提法。
1.氯仿熏蒸培养法[1]:土壤经氯仿熏蒸后再进行培养,测定培养时间内熏蒸与未熏蒸处理所释放CO2之差来计算土壤生物量碳。
2.氯仿熏蒸直接浸提法[2]:土壤经氯仿熏蒸后直接浸提进行,测定浸提液中的碳含量,以熏蒸和不熏蒸土壤中总碳的差值为基础计算土壤微生物含碳量。
直接提取法与氯仿熏蒸培养法相比,直接提取法具有简单、快速、测定结果的重复性较好等优点。
直接提取法测定土壤微生物量的碳的方法日趋成熟。
现在氯仿熏蒸—K2SO4提取法已成为国内外最常用的测定土壤微生物碳的方法。
本实验以氯仿熏蒸直接浸提法为例介绍土壤微生物量碳氮的浸提与测定。
二、主要仪器振荡机、真空干燥器、真空泵、TOC-V CPH有机碳分析仪。
二、试剂1.氯仿(去乙醇):普通氯仿一般含有乙醇作为稳定剂,使用前要去除乙醇。
将氯仿按照1︰2(v/v)的比例与蒸馏水一起放入分液漏斗中,充分振动,慢慢放出底部氯仿,重复3次。
得到的无乙醇氯仿加入无水CaCl2,以除去氯仿中的水分。
2.0.5 mol·L-1 K2SO4浸提液:43.57 g分析纯K2SO4 定溶至1 L。
四、操作步骤称取过2 mm筛的新鲜土样12.5 g六份,置于小烧杯中。
将其中三份小烧杯放入真空干燥器中,干燥器底部放3个烧杯,其中一个放氯仿,烧杯内放少许玻璃珠(防爆),另一个放水(保持湿度),再放一杯稀NaOH。
抽真空时,使氯仿剧烈沸腾3-5 min,关掉真空干燥器阀门,在暗室放置24 h。
熏蒸结束后,打开干燥器阀门,取出氯仿,在通风厨中使氯仿全部散尽。
另三份土壤放入另一干燥器中,但不放氯仿。
将熏蒸的土样全部转移至150 mL三角瓶中,加入50 mL 0.5 mol·L-1 K2SO4 (土水比为1:4),振荡30 min,过滤。
测定微生物总数的方法

测定微生物总数的方法测定微生物总数是微生物学研究中的一项重要任务,它可以帮助我们了解微生物在环境中的分布和数量。
本文将介绍几种常用的测定微生物总数的方法。
一、直接计数法直接计数法是最直接、最常用的测定微生物总数的方法之一。
它通过使用显微镜观察样品中的微生物细胞数目来进行测定。
具体操作步骤如下:1. 取一定量的样品,如水样、土壤样等,制备适当的稀释液。
2. 取适量的稀释液滴于玻璃片上,用显微镜观察。
3. 在显微镜下,使用目镜和物镜进行放大观察,并使用计数室或计数网格进行计数。
4. 统计不同视野中的微生物数量,并计算平均值,从而得到微生物总数。
二、培养法培养法是一种常用的测定微生物总数的方法,它通过将微生物样品在培养基上培养并生长,然后观察和计数生长的菌落数来进行测定。
具体操作步骤如下:1. 取适量的样品,如空气、食品、药品等,制备适当的稀释液。
2. 取一定量的稀释液接种于含有富营养物的培养基上。
3. 将培养基培养在适当的温度和湿度条件下,使微生物生长繁殖。
4. 观察培养基上生长的菌落,并进行计数。
5. 根据计数结果,计算微生物总数。
三、膜过滤法膜过滤法是一种常用的测定微生物总数的方法,它通过将微生物样品过滤到膜上,然后将膜放置在培养基上进行培养和生长,最后观察和计数生长的菌落数来进行测定。
具体操作步骤如下:1. 取一定量的样品,如水样、食品样等,制备适当的稀释液。
2. 将稀释液通过膜过滤装置过滤到膜上。
3. 将膜放置在含有富营养物的培养基上进行培养和生长。
4. 观察培养基上生长的菌落,并进行计数。
5. 根据计数结果,计算微生物总数。
四、荧光显微镜法荧光显微镜法是一种高级的测定微生物总数的方法,它通过将微生物样品染色,并利用荧光显微镜观察和计数荧光染色的微生物细胞来进行测定。
具体操作步骤如下:1. 取一定量的样品,如水样、食品样等,制备适当的稀释液。
2. 取适量的稀释液滴于载玻片上,进行定性或定量染色。
微生物数量的测定方法

微生物数量的测定方法微生物数量的测定方法微生物是一类微小的生物体,包括细菌、真菌、病毒等。
它们广泛存在于自然界中的土壤、水体、空气中,也存在于人体内外。
了解微生物的数量对于环境监测、食品安全、医学诊断等领域具有重要意义。
本文将介绍几种常用的微生物数量测定方法。
1. 直接计数法直接计数法是最直接、最常用的微生物数量测定方法之一。
它通过显微镜观察和计数来确定微生物的数量。
首先,将待测样品制备成适当的悬浮液,然后在显微镜下观察,并使用计数器进行计数。
这种方法适用于细菌和酵母等较大的微生物。
但是,由于显微镜观察需要较高的技术水平和时间,所以无法快速测量大量样品。
2. 培养法培养法是一种常用的微生物数量测定方法,它通过培养微生物并计数生长的菌落来确定数量。
首先,将待测样品制备成适当的培养基,然后在恰当的温度和湿度条件下培养一段时间。
培养基中的微生物会形成可见的菌落,通过计数菌落的数量来确定微生物的数量。
这种方法适用于大部分微生物,但是它需要一定的培养时间,并且某些微生物可能无法在常规培养基上生长。
3. 膜过滤法膜过滤法是一种常用的微生物数量测定方法,它通过将待测样品过滤到膜上,并将膜培养在适当的培养基上来确定数量。
首先,将待测样品通过特定孔径的过滤器过滤,然后将过滤后的膜放置在培养基上培养。
培养基中的微生物会在膜上形成可见的菌落,通过计数菌落的数量来确定微生物的数量。
这种方法适用于水样、空气样等液态和气态样品。
4. 分子生物学方法分子生物学方法是一种新兴且快速发展的微生物数量测定方法。
它通过检测和分析微生物DNA或RNA来确定数量。
常用的分子生物学方法包括聚合酶链反应(PCR)、实时荧光定量PCR(qPCR)等。
这些方法可以快速、准确地测定微生物的数量,并且可以检测到少量微生物。
但是,分子生物学方法需要一定的实验设备和技术,并且对样品预处理要求较高。
总结起来,微生物数量的测定方法有直接计数法、培养法、膜过滤法和分子生物学方法等。
土壤微生物测定取样方法

土壤微生物测定取样方法
确定土壤微生物的测定取样方法需要考虑以下几个步骤:
1. 确定取样点:根据研究目的和土壤类型选择取样点。
通常应选择代表性地带土壤、若干个深度(如0-10厘米,10-20厘米,20-30厘米等)的土壤样品。
2. 准备工具:取样时需要准备洁净的工具和容器,如无菌铲子、无菌采样袋或无菌容器等,以避免样品受到外界微生物的污染。
3. 取样方法:将土壤取样器或无菌铲子插入土壤中,以尽量保持样品的代表性。
每次采样之前都应彻底清洗工具,以防止交叉污染。
4. 样品处理:将采样的土壤样品放入无菌容器中,并尽快送至实验室进行分析。
如果不能立即送达实验室,样品应存储在低温环境中,以减缓微生物代谢。
在实验室中,测定土壤微生物的方法可以包括土壤微生物生物量、多样性和功能等方面的分析。
需要注意的是,不同类型的土壤微生物所需的取样方法和处理方式可能有所不同,具体的步骤和要求应根据具体研究的需求和方法的要求进行调整。
土壤微生物量的测定方法

土壤微生物量的测定方法:现状和展望何振立(浙江农业大学土化系.3 10029)摘要本文综述了土壤微生物量包括微生物量碳.微生物量氮、微生物量礴和缴生物量硫的测定方法的发展和现状,对现存各种方{击的特点和局限性作了简要的评述,指出了应用这些方法须注意的阀题和今后的研究方向.一、土壤微生物量及其研究意义土壤微生物量指土壤中体积小于5×10 m 的生物总量,但活的植物体如植物根系等不包括在内.它是活的土壤有机质部分.众所周知,土壤生物是植物养料转化.有机碳代谢及污染物降解的驱动力.在土壤肥力和生态系统中具有重要的作用.土壤微生物量作为土壤中植物有效养料的储备库或源,取决于土壤环境条件及养分耗竭状况“”。
70年代中期以来,薰蒸法的出现大大提高了人们对土壤微生物量研究的兴趣.虽然现存的定量测定方法仍有不尽人意之处.但它们在土壤生物与环境的研究中,对人们更好了解土壤微生物一植物一环境相互作用方面已显示出了它的重要作用.二、土壤微生物量的测定(一)平板计数法平板计数法比较原始,但仍不失为最直接的土壤微生物量测定方法.土壤样品加水制成悬液,在显微镜下计数,并测定各类微生物体的大小。
根据一定观察面积上微生物的数目、体积及微生物的比重(一般采用1.18克cm- )计算出每克干土所含的微生物量.或根据微生物体的干物质含量(一般采用25%)及干物质含碳量(通常为47%),进一步换算成每克土壤微生物体的碳含量.微生物的比重、干物质含量及含碳量等参数一般通过纯培养试验获得.直接计数法技术难度大.计数和体积测量都可能发生较大误差,因此不太适宜用作常规分析.读者若有兴趣.可参阅文献[】、3、4].(二)成份分析法根据土壤中某种特定的生物代谢成份的含量嘧定土壤微生物量.这种标记成份理论上必须满足下列条件: 1,该成份存在于生物体各部分.其浓度不随时问和其它条件而变定浸提液中的这种标记成份。
目前比较常用的成份分析法是根据测定土壤中ATP含量来估算土壤微生物量.ATP的测定步骤包括破坏微生物的细胞,使其所含的ATP释放出来,并被提取到适当的溶液中。
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土壤微生物数量的测定方法
土壤微生物数量的测定方法是指用来确定土壤中微生物的数量的一系列方法。
微生物在土壤中的数量是影响土壤肥力、健康状态以及生物多样性的主要因素,所以对土壤微生物数量的测定十分重要。
目前,有几种常用的测定土壤微生物数量的方法,包括计数法、分子生物学方法和非分子生物学方法。
一、计数法
计数法是目前最常用的测定土壤微生物数量的方法。
该方法通过对样本中的细胞进行数目和形态的观察,来获得关于微生物数量的信息,然后通过计算微生物数量来估计土壤微生物总数。
1. 总体计数法总体计数法是使用显微镜观察和计数样品中的微生物,把检测到的微生物总数乘以一定的系数,就可以估算出土壤中的总微生物数量。
该方法是实时性强,耗时少,易于操作,但是由于细胞大小不一,活性差异大,难以检测到的微生物会影响准确性,因此不能精确测定土壤中的微生物数量。
2. 半定量计数法半定量计数法是通过将土壤样品进行细胞悬液制备,然后用显微镜观察和计数,来估算土壤中的微生物总数。
该方法也是实时性强,耗时少,易于操
作,但是由于细胞大小不一,活性差异大,难以检测到的微生物会影响准确性,因此也不能精确测定土壤中的微生物数量。
二、分子生物学方法
分子生物学方法是指使用基于DNA或RNA的技术来测定土壤中的微生物数量的方法。
目前,常用的分子生物学方法有PCR方法、qPCR方法、FISH方法、DGGE方法和pyrosequencing方法。
1. PCR方法 PCR方法是使用聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction, PCR)技术来检测土壤中的微生物数量的方法。
PCR方法可以快速检测出土壤中的微生物,但它不能检测出细菌的种类。
2. qPCR方法 qPCR方法是使用定量聚合酶链反应(Quantitative Polymerase Chain Reaction, qPCR)技术来检测土壤中的微生物数量的方法。
qPCR技术可以检测出微生物的种类,并且可以准确测定土壤中的微生物数量。
3. FISH方法 FISH方法是使用荧光原位杂交技术(Fluorescence in situ hybridization, FISH)来检测土壤中的微生物数量的方法。
FISH技术可以准确测定土壤中的微生物种类,并能准确测定土壤中的微生物数量。
4. DGGE方法 DGGE方法是使用多孔性凝胶电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis, DGGE)技术来检测土壤中的微生物数量的方法。
DGGE技术可以准确测定土壤中的微生物种类,并能准确测定土壤中的微生物数量。
5. Pyrosequencing方法 Pyrosequencing方法是使用热峰定量PCR(Pyrosequencing, PQ-PCR)技术来检测土壤中的微生物数量的方法。
PQ-PCR技术可以准确测定土壤中的微生物种类,并能准确测定土壤中的微生物数量。
三、非分子生物学方法
非分子生物学方法是指使用非分子生物学技术来检测土壤中的微生物数量的方法。
目前,常用的非分子生物学方法有活性染色法、营养培养法、生物技术技术和ELISA 法。
1. 活性染色法活性染色法是使用活性染料染色土壤样品,然后通过显微镜观察和计数,来估算土壤中的活性微生物总数。
该方法是实时性强,耗时少,易于操作,但是由于染色液的种类不同,染色效果也不同,因此难以准确测定土壤中的活性微生物数量。
2. 营养培养法营养培养法是将土壤样品放置在特殊培养基中,然后放置在特定条件下培养,通过观察和计数,来估算土壤中的菌落总数。
该方法可以准确测定土壤
中的微生物数量,但耗时较长,不适用于实时土壤微生物数量测定。
3. 生物技术技术生物技术技术是指使用DNA杂交技术、RNA杂交技术、cDNA杂交技术等技术来检测土壤中的微生物数量的方法。
该方法可以准确测定土壤中的微生物数量,但耗时较长,不适用于实时土壤微生物数量测定。
4. ELISA法 ELISA法是指使用免疫测定技术(Enzyme-Linked Immunosorbent Assay, ELISA)来检测土壤中的微生物数量的方法。
ELISA技术可以准确测定土壤中的微生物数量,但耗时较长,不适用于实时土壤微生物数量测定。
综上所述,土壤微生物数量的测定方法包括计数法、分子生物学方法和非分子生物学方法,各种方法有其优缺点,需要根据实际情况选择合适的方法来测定土壤中的微生物数量。