分子克隆实验流程

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分子克隆的五个步骤

分子克隆的五个步骤

分子克隆的五个步骤1 选择载体:在分子克隆的过程中,首先需要选择一种合适的载体来实现这一过程。

载体是要被克隆的DNA片段,生物体中的某种大分子结构,可以为克隆提供容器。

一般来说,载体选择最好是含有可重复使用的重组信息,如使用多种重组酶克隆更为容易和可靠,能在实验室之间转移。

该步骤需要考虑选择对于试验类型最合理、在实验中表现最佳的载体,与之相符的必要条件是有可操作和稳定的复制介质,以及品质可靠、价格相对划算的供应商。

2 将载体与要克隆的DNA片段连接:接下来需要将载体与要克隆的DNA片段连接。

这样一来,DNA片段就会受到载体中的重组酶以及其余细菌特有的信息影响,从而生存,复制,得以分离,克隆出多个相同的DNA断片。

连接DNA片段和载体的技术有各种方法,最常见的方法为用复制酶切割载体的方法,这种技术利用重组酶将DNA片段片段插入载体结构中,实现载体与DNA片段的融合。

3 转化:经过第二步的操作,则可以将融合的载体片段转入细菌,进行转化,实现将载体片段覆盖到细菌细胞中,形成细菌外源DNA的转基因,从而使细菌体系内发生变化,从而开始转化过程。

4 筛选:经过第三步的转化,载体就可以移植到细菌体内,从而形成转基因细菌,这时候就可以采用测试细胞以及一些标记物质来进行筛选,将转基因细菌与其他细菌相区分开来,根据一些指定条件进行筛选,从而得到被克隆的特异性DNA片段,实现分子克隆的目的。

5 收集:经过第四步的筛选,就可以将特异性的DNA断片收集起来,被收集的DNA断裂片段就是分子克隆的结果,可以得到被克隆的特异性DNA 断片,将其用于进一步的研究。

最后,分子克隆是一种复杂的实验过程,需要经过以上5个步骤,才能实现分子克隆的目的,如正确选择载体、把该DNA片段片段插入载体结构、将融合的载体片段转入细菌、用测试细胞以及一些标记物质对转基因细菌进行筛选,从而得到被克隆DNA片段,最终收集被克隆的DNA断片,这样就可以实现分子克隆的目的,得出满意的实验结果。

分子克隆实验标准步骤

分子克隆实验标准步骤

分⼦克隆实验标准步骤分⼦克隆实验标准步骤⼀、常规分⼦克隆实验流程:⼆、分⼦克隆实验标准步骤(含实验编号):1. PCR 扩增⽬的基因(编号Clone SOP-1)以本实验室常⽤酶KOD-Plus-Neo (TOYOBO )为例体系(50ul ):10×KOD buf 5uldNTP(2mM) 5ulMg 2+ 3ulPrimer1 1ulPrimer2 1ulTemplate50-200ngKOD0.5ulddH 2O up to 50ul程序:95℃2min98℃10s58℃30s 35cycle68℃2kb/min68℃7min12℃∞2.PCR产物的琼脂糖凝胶电泳琼脂糖凝胶的制备(编号Clone SOP-2)琼脂糖溶液的制备:称取琼脂糖,置于三⾓瓶中,按1%-1.5%的浓度加⼊相应体积的TBE或TAE缓液,将该三⾓瓶置于微波炉加热⾄琼脂糖溶解。

胶板的制备:①取有机玻璃内槽,洗净、晾⼲;②将有机玻璃内槽置于⼀⽔平位置模具上,安好挡板,放好梳⼦。

在距离底板上放置梳⼦,以便加⼊琼脂糖后可以形成完好的加样孔。

③将温热琼脂糖溶液倒⼊胶膜中,使胶液缓慢地展开,直到在整个有机玻璃板表⾯形成均匀的胶层。

④室温下静置30min左右,待凝固完全后,轻轻拔出梳⼦,在胶板上即形成相互隔开的上样孔。

制好胶后将铺胶的有机玻璃内槽放在含有0.5~1×TAE(Tris-⼄酸)或TBE(Tris-硼酸)⼯作液的电泳槽中使⽤,没过胶⾯1mm以上。

3.试剂盒回收DNA⽚段(编号Clone SOP-3)以本实验室常⽤DNA凝胶回收试剂盒(天根)为例使⽤前请先在漂洗液PW中加⼊⽆⽔⼄醇,加⼊体积请参照瓶上的标签。

①柱平衡步骤:向吸附柱CA2中(吸附柱放⼊收集管中)加⼊500µl平衡液BL,12,000rpm(~13,400×g)离⼼1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。

(请使⽤当天处理过的柱⼦)②将单⼀的⽬的DNA条带从琼脂糖凝胶中切下(尽量切除多余部分)放⼊⼲净的离⼼管中,称取重量。

分子克隆(亚克隆)实验总体流程详解

分子克隆(亚克隆)实验总体流程详解

一、扩增1、LB培养基5ml;2、抗生素:1000X,即1:1000比例。

种类根据细菌抗性决定;3、菌体:看浑浊度,1%-5%,取500ul于其中;4、37℃摇床220转,过夜,12-16h。

二、纯化质粒DNA1、1.5ml离心管,编号一定要写清楚;2、加满离心管,离心12000xg. 1min,弃上清。

取三次;3、加Buffer S1 200ul,溶解沉淀,5min;4、加S2(用完立刻盖紧瓶盖,以免CO2中和Buffer中的NaOH)200ul,不能剧烈(以免基因组DNA的污染),上下翻转4-6次,直至形成透亮的溶液,时间少于5min。

目的是使蛋白包裹基因组DNA,游离质粒;5、加S3 280ul,温和充分翻转混合6-8次,12000xg,10min(此步呈白色絮状);*备注:S1:S2:S3=5:5:76、取上清加入制备管(置于2ml离心管),12000xg,1min,去滤液;7、加Buffer W1 500ul,12000xg,1min,弃滤液;8、加Buffer W2 700ul,12000xg,1min,弃滤液。

重复一遍;9、空管离心12000xg,1min;10、制备管移入新的1.5ml离心管,管膜中加60-80ul去离子水,静置1min,12000xg,1min。

(将去离子水加热至65度,将提高洗脱效率)四、跑胶回收:sost回收失败1、2%浓度胶,Loading Buffer如是6X,则加10ul到样品,全部加样到胶孔中。

插入:配胶方法大块胶60ml;小块胶25ml;需要配置大块胶、大孔胶;Agarose 0.6g,TAE60ml,微波中火2min;趁热但不烫手时加入gold view 0.5ul/25ml;倒入槽里。

2、跑胶:单位厘米/5-10v。

所以大槽25cm,150v即可。

小槽100v即可。

3、紫外灯下切胶,纸巾吸进液体,计算凝胶重量(1mg=1ul);4、加3个凝胶体积的凝胶结合液DB(0.1ul视为100ul;如凝胶浓度大于2%,则加入6倍体积溶胶液;凝胶块最大不能超过400ul,超过可多个离心柱);5、56℃水浴放置10分钟,至完全溶解;6、每100mg最初的凝胶重量加入150ul的异丙醇,震荡混匀,回收大于4Kb的片段可不加异丙醇,加入反而降低回收效率;7、将上一步所得溶液加入吸附柱AC中(吸附柱放入收集管中),12000rpm,30-60s,弃液体;8、加700ul漂洗液WB,12000rpm,1min,弃废液;9、加500ul漂洗液WB,12000rpm,1min,弃废液;10、空离心2min,弃废液;11、晾干乙醇,以免抑制下游反应;12、将吸附柱放入新的1.5ml离心管,加入50ul(最少30ul)洗脱缓冲液EB或者去离子水(65-70水浴加热效果更好,或将得到的溶液重新加入离心柱可增加洗脱量);五、连接体系:六、转化1、加感受肽:连接产物=10:1,冰浴30min;2、激活:42℃,90s,不能震动;3、加500ul LB培养基;4、37℃,150转摇床,45min;5、铺板子七、检测1、细菌长势良好,对照组不长;2、酶切检测:(1)1ml LB体系:1ml LB培养基+1ul抗生素于1.5mlEP管中;(2)15ul Pcr体系:7.5ul Mix(2X)5.5ul water1ul上游引物1ul下游引物(3)用枪头挑培养皿中的菌体,吹打于1ml LB体系中,再吹打于15ul Pcr体系中;(4)1ml LB体系放入37℃摇床,150rpm;显示4°/4°时,结束。

分子克隆基本流程及技术原理

分子克隆基本流程及技术原理

分子克隆基本流程及技术原理分子克隆是一种重要的实验技术,可用于制备大量的DNA和蛋白质,探索基因功能,研究生物学过程等。

其基本流程包括DNA片段选择、PCR 扩增、限制性内切酶切割、连接、转化和筛选等步骤。

以下将详细介绍分子克隆的基本流程及技术原理。

PCR扩增:接下来,使用聚合酶链反应(PCR)技术扩增DNA片段。

PCR是一种有效的DNA扩增方法,它通过反复复制DNA模板,生成大量的DNA片段。

PCR反应基本包括三个步骤:变性、引物结合和扩增。

-变性:将DNA模板加热至95°C,使其两个链分离,得到单链DNA。

-引物结合:将反应体系温度下调到适宜的引物结合温度,引物与DNA模板的互补序列结合,形成DNA-DNA复合物。

-扩增:在一定的温度下,聚合酶通过DNA-DNA复合物进行扩增。

扩增过程包括DNA链合成、DNA链延长、DNA链分离和DNA链结合。

多次循环后,可以得到大量的目标DNA片段。

限制性内切酶切割:在PCR扩增后,可选用特定的限制性内切酶切割目标DNA片段。

内切酶是一种具有特异性的酶,它能够在特定的DNA序列上切割产生特定的片段。

通过切割,可以克隆所需的片段,并在连接过程中提供黏性末端。

连接:将目标DNA片段与载体DNA(如质粒)连接起来。

连接可采用多种方法,如T4DNA连接酶方法、PCR重叠延伸法等。

连接时,需要确保目标DNA片段与载体DNA能够互补配对,并生成稳定的连接。

转化:将连接后的混合物转化到宿主细胞中。

转化可通过化学方法(如钙离子转化法)或生物方法(如细菌电穿孔法)实现。

转化后,将细胞培养在含有适当选择压力(如抗生素)的培养基中,这样只有转化成功的细胞才能存活。

筛选:根据实验目的选择合适的筛选方法。

通常,使用抗生素抗性标记和荧光蛋白等进行筛选,以识别并纯化所需克隆产物。

技术原理:-PCR技术:PCR技术是通过DNA聚合酶的模板依赖性合成,将DNA片段按特定序列进行扩增。

分子克隆技术操作手册

分子克隆技术操作手册

分子克隆技术操作手册【最新版】目录1.分子克隆技术的概念2.分子克隆技术的操作步骤3.分子克隆技术的应用4.分子克隆技术的优缺点正文一、分子克隆技术的概念分子克隆技术是一种生物技术方法,用于在体外将各种来源的 DNA 片段进行拼接组合,形成新的 DNA 分子。

这种技术可以在短时间内大量复制特定 DNA 序列,为基因工程、生物制药等领域提供重要的研究手段。

二、分子克隆技术的操作步骤分子克隆技术主要包括以下几个操作步骤:1.提取 DNA:从实验材料中提取 DNA,并通过特定方法进行纯化。

2.切割 DNA:使用限制性内切酶将 DNA 切割成特定大小的片段。

3.链接 DNA:将切割好的 DNA 片段通过 DNA 连接酶进行拼接组合。

4.转化细胞:将拼接好的 DNA 分子转化到受体细胞中,让细胞表达新的 DNA 序列。

5.筛选克隆:通过特定筛选方法,选出含有目标 DNA 序列的克隆细胞。

三、分子克隆技术的应用分子克隆技术在生物领域有广泛的应用,主要包括:1.基因工程:通过分子克隆技术,可以对特定基因进行拼接组合,研究基因的功能和调控关系。

2.生物制药:利用分子克隆技术,可以大量生产具有特定功能的蛋白质,用于药物研发和生产。

3.基因诊断:通过分子克隆技术,可以制备特定基因片段作为诊断试剂,用于疾病的早期诊断。

4.基因治疗:将正常或功能性基因通过分子克隆技术导入患者细胞,以治疗遗传性疾病。

四、分子克隆技术的优缺点分子克隆技术的优点包括:操作简便、效率高、可大量制备特定 DNA 序列。

但其缺点是:可能产生非特异性拼接、克隆产物可能不稳定、需要使用有毒的化学试剂等。

总之,分子克隆技术是一种重要的生物技术手段,广泛应用于基因工程、生物制药等领域。

分子克隆法

分子克隆法

分子克隆法
分子克隆法是一种分子生物学技术,用于在体外制备和复制DNA 分子,包括基因、DNA片段和整个染色体。

这种技术允许科学家复制和操纵DNA,以进行各种研究和应用,包括基因工程、药物开发和基因治疗。

下面是分子克隆法的主要步骤:
1.DNA提取:首先,需要从源材料(通常是细胞或组织样本)中
提取DNA。

这可以通过细胞裂解和蛋白质分离等方法来完成。

2.DNA切割:提取的DNA通常是大片段,需要将其切割成较小
的片段,以便后续克隆。

这一步通常使用限制性内切酶来实现,
这些酶可以在特定DNA序列上切割。

3.DNA连接:切割后的DNA片段可以通过DNA连接酶与载体
DNA(如质粒或病毒DNA)连接在一起,形成重组DNA分子。

这个过程称为DNA重组。

4.DNA转化:重组DNA可以被引入宿主细胞中,这个过程称为
DNA转化。

这可以通过热激冷却法、电穿孔法、化学法等方法
来实现。

5.宿主细胞培养:转化后的细胞被培养,以允许它们繁殖并扩增
重组DNA。

6.筛选与识别:在宿主细胞中,可以筛选出携带重组DNA的细
胞,通常使用抗生素抗性标记或荧光标记等方法来进行筛选。

7.DNA提取与纯化:从筛选出的细胞中提取和纯化重组DNA,
以便进一步的研究或应用。

8.分析与验证:最后,分析和验证克隆的DNA,确保它是所需的
目标DNA,并不包含错误或突变。

分子克隆法有许多应用,包括基因表达、基因编辑、蛋白质生产、疾病研究等。

它在生物学研究和生物工程领域发挥着关键作用,允许科学家操纵和研究DNA,以深入了解生命的分子机制。

分子克隆主要步骤

分子克隆主要步骤

分子克隆主要步骤分子克隆是一种常用的分子生物学技术,用于复制DNA分子。

下面是分子克隆的主要步骤:1.DNA提取:首先需要从一个已知的DNA源(例如细菌、动物组织等)中提取所需的DNA。

这可以通过使用不同的提取方法(如酚/氯仿提取、自动提取仪等)来实现。

2.限制性内切酶切割:将目标DNA切割成片段。

此步骤可以通过使用限制性内切酶来实现,这些酶可以识别特定的DNA序列,并在这些序列中切割DNA,形成切割产物。

3.DNA修饰:如果需要,在第2步切割的DNA片段末端添加修饰,以便后续步骤的操作。

例如,可以在DNA片段的末端添加磷酸基团(通过激酶酶和ATP)或羟基(通过糖转移酶和dTTP)。

4.连接DNA片段:将目标DNA片段与载体DNA(通常是质粒)连接起来。

这可以通过使用DNA连接酶,如DNA连接酶I或T4DNA连接酶,将DNA片段与载体DNA的末端连接。

5.转化:将连接好的DNA导入到宿主细胞中。

这可以通过转化(常见的转化宿主细胞包括大肠杆菌和酵母)来实现。

转化可以通过热冲击法、电转化或使用化学方法来进行。

6.筛选:在经过转化的细胞中筛选出带有目标DNA的细胞。

这可以通过将转化后的细胞接种到含有适当选择标记的培养基上来实现。

只有带有目标DNA的细胞才能生长并形成克隆。

7.复制:选取带有目标DNA的细胞进行培养,并使其进行大量复制。

这可以通过将细胞培养在含有适当培养基和条件的培养皿中来实现。

8.提取:从大量复制的细胞中提取含有目标DNA的质粒。

这可以通过使用质粒提取试剂盒来实现,其中包含了一系列的化学试剂和步骤,用于纯化和提取目标DNA。

9.鉴定:验证提取的DNA是否为目标DNA。

这可以通过进行限制性内切酶切割、PCR扩增或测序等方法来实现。

分子克隆是一种重要的实验技术,可用于构建重组DNA分子、研究基因功能、制备蛋白质等。

虽然上述步骤描述了分子克隆的基本过程,但具体操作可能会因实验目的和需求而略有不同。

分子克隆详细步骤

分子克隆详细步骤

分子克隆详细步骤分子克隆是通过重组DNA分子来产生大量完全相同的DNA序列的技术。

在分子克隆工作中,我们主要进行克隆载体的构建、目标DNA的扩增、将目标DNA插入克隆载体中、转化和筛选等步骤。

下面将详细介绍这些步骤:1.克隆载体的构建:克隆载体是用于插入目标DNA的DNA分子。

常用的克隆载体包括质粒、噬菌体和人工染色体等。

在构建克隆载体时,我们首先需要选择适合的载体,并提取载体的DNA。

然后,利用酶切酶对载体进行酶切,生成线性的载体DNA。

接下来,将目标DNA插入克隆载体的相应位点上,形成重组的载体。

2.目标DNA的扩增:目标DNA可以通过PCR(聚合酶链反应)来扩增。

首先,设计引物,使其与目标DNA的两端末端相互互补。

然后,在PCR反应中,通过DNA聚合酶的扩增作用,使目标DNA得以扩增。

PCR反应通常包括模板DNA、引物、核苷酸和聚合酶等成分。

3.目标DNA的插入:将扩增后的目标DNA与酶切后的载体进行连接,利用DNA连接酶催化目标DNA与载体之间的连接反应,生成重组的克隆载体。

连接后的载体含有目标DNA的序列。

4.转化:将克隆载体引入宿主细胞中进行复制。

这一步骤通常称为转化。

转化可以通过电击、热激、化学方法等方式进行。

宿主细胞通常是大肠杆菌等细菌。

5.筛选:利用筛选方法来选择包含目标DNA的克隆。

常用的筛选方法包括抗生素筛选、报告基因筛选和限制性内切酶酶切筛选等。

抗生素筛选是将带有选择性抗生素耐受基因的克隆引入含有相应抗生素的培养基中,只有带有目标DNA的克隆才能生长。

报告基因筛选是通过将报告基因插入克隆载体中,使之与目标DNA一起被转录和翻译,从而表达报告基因的蛋白质,以此来筛选包含目标DNA的克隆。

限制性内切酶酶切筛选是通过限制性内切酶对重组载体和目标DNA进行酶切,并通过凝胶电泳的方法来分离并检测含有目标DNA的克隆。

以上就是分子克隆的详细步骤。

通过这些步骤,我们可以获得大量完全相同的DNA序列,并用于各类分子生物学研究和应用中。

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分子克隆实验流程
一、引物的稀释
1、引物干粉冻存于-20℃,用前12000rpm离心1min;
2、按引物管上的nmol数稀释,nmol=4.92,加49.2µL ddH2O至100µM;
3、稀释至10µM(5µL引物F+5µL引物R+40µL ddH2O)
二、目的基因的扩增
实验前准备:生物安全柜紫外照射30min,模板DNA、水、引物、buffer,dNTP提前10min拿出解冻,用75%酒精擦拭移液器及台面。

扩增体系:
Reagent 25µL 50µL
10xbuffer (含Mg2+) 2.5µL 5µL
dNTP (10mM) 0.5µL 1µL
rT aq酶0.25μL0.5μL
primer (10μM) 1.25μL 2.5μL
Template DNA 2μL4μL
ddH2O 18.5µL 37µL
反应程序:(延伸时间按目的片段大小进行调整)
95℃预变性3min
(95℃变性30 s,60℃退火30s,72℃延伸45s)x35
72℃后延伸7min
4℃保持
电泳:120V,加2µLloading buffer,上样5µL,1000bp marker 5µL
小胶:2%,0.6g琼脂糖,30ml 1xTAE
中胶:2%,1g琼脂糖,50ml 1xTAE
大胶:2%,2g琼脂糖,100ml 1xTAE
三、目的产物切胶回收(试剂盒)
四、连接
实验前准备:SolutionI在冰上融化
连接体系:
Reagent 10µL
胶回收DNA(50ng/μL)4µL
PDM-18T载体1µL
Solution I 5µL
反应条件:16℃,4h(PCR仪,热盖105℃)/ 4℃过夜
五、转化
实验前准备:开启42℃水浴锅
实验步骤:样品+阴性对照(无质粒)+阳性对照(感受态带的质粒)
1、把感受态细胞TOP10从-80℃冰箱拿出并放置于冰上解冻;
2、每管分装30 - 50μL感受态细胞(冰浴);
3、向感受态细胞中加入5μL连接产物,冰浴30min。

4、42℃热激90S(时间不能太长,也不能太短)后静置于冰浴3min,加入750μL无抗生素的LB液体培养基,37℃ 200rpm恒温震荡培养1h。

5、4000 rpm离心2min,弃上清同时保留50μL混匀菌体沉淀后均匀涂布于抗性平板上。

6、37℃恒温培养过夜。

(16小时以上)
LB(amp)抗性平板的制备
配方:
胰蛋白胨3g 5g
酵母提取物 1.5g 2.5g
氯化钠3g 5g
琼脂 4.5g 7.5g
ddH2O 300mL 500mL
121℃高压灭菌20min,降温加入氨苄(amp)抗生素(amp:LB=1:1000)
六、摇菌
实验前准备:生物安全柜紫外照射30min
实验步骤:
1、取出过夜培养的LB固体培养基平皿,观察是否有菌落长出。

2、取3ml LB液体培养基于15ml管中,已经加入抗生素(氨苄),氨苄:LB培养基=1:1000(即:3μL amp+3ml LB)。

3、在15ml管上做好标记,分别加入从LB培养基上挑取的单个菌落,37℃250rpm恒温震荡培养过夜(8小时以上)。

七、菌液PCR(目的基因引物+载体引物)
实验前准备:生物安全柜紫外照射30min,模板DNA、水、引物、buffer,dNTP提前10min拿出解冻,用75%酒精擦拭移液器及台面。

反应体系:
Reagent 20µL
10xbuffer (含Mg2+) 2µL
dNTP (10mM) 0.25µL
primer (10μM)0.5μL
Template DNA 2μL
rTaq酶0.25μL
ddH2O 15µL
反应程序:
95℃预变性3min,
(95℃变性30s,60℃退火45s,72℃延伸45s)运行35个循环72℃后延伸7min,
4℃保持
九、测序PCR
实验前准备:生物安全柜紫外照射30min,模板DNA、水、引物、(BD+5xbuffer)Mix提前10min拿出解冻,用75%酒精擦拭移液器及台面。

反应体系:
Reagent 10µL
(BD+5xbuffer)Mix 2.1µL
模板DNA(纯化产物) 3.5µL
primer (10μM)0.75μL
ddH2O 3.65µL
反应程序:
96℃ 1min,
(96℃ 10s, 50℃10s, 60℃ 3min) x30
4℃ --
十、质粒提取、菌种保存、浓度测定:。

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