41. ACMG全外显子测序指南.
全外显子测序的技术要点
全外显子测序的技术要点全外显子测序是一种高通量测序技术，可以同时测定一个生物体的所有外显子区域的DNA序列。
全外显子测序技术的出现，极大地促进了人类基因组学的发展和疾病研究的进展。
下面将介绍全外显子测序技术的要点。
1. 序列捕获：全外显子测序的第一步是捕获外显子区域的DNA序列。
这一步骤使用特定的引物或探针，使外显子区域的DNA片段与其结合，然后通过化学方法将其他DNA片段去除。
这样可以高效地富集外显子区域的DNA序列。
2. 高通量测序：全外显子测序使用高通量测序技术，如Illumina测序平台。
这种测序技术可以同时测定大量的DNA序列，从而提高测序的速度和效率。
高通量测序技术的出现，使得全外显子测序成为可能。
3. 数据分析：全外显子测序产生的数据量庞大，需要进行复杂的数据分析。
数据分析的主要步骤包括测序质量评估、序列比对、变异检测等。
这些分析可以帮助研究人员鉴定外显子中的遗传变异，从而进一步研究其与疾病的关联。
4. 疾病研究应用：全外显子测序技术在疾病研究中具有广泛的应用价值。
通过对疾病样本和正常样本进行比较，可以发现与疾病相关的遗传变异。
这些变异可能是疾病的致病原因，也可以作为疾病的标志物进行诊断和预后的判断。
5. 个体化医疗：全外显子测序技术为个体化医疗提供了基础。
通过分析患者的外显子序列，可以了解其个体差异和易感基因型。
这对于制定个性化的治疗方案和预防策略非常重要。
6. 遗传咨询：全外显子测序技术的应用还使得遗传咨询工作更加准确和全面。
通过对患者及家族成员的全外显子测序，可以准确地识别携带疾病相关基因突变的个体，为其提供个性化的遗传咨询和风险评估。
7. 数据存储和共享：全外显子测序产生的数据量巨大，对于数据的存储和共享提出了挑战。
科研机构和数据库需要建立完善的数据管理系统，确保数据的安全性和可访问性，以促进全外显子测序数据的广泛应用。
8. 未来发展：随着测序技术的不断发展，全外显子测序技术也将不断改进。
全外显子测序检验的临床意义与样本要求
全外显子测序检验的临床意义与样本要求在当今医学领域，全外显子测序检验正逐渐成为临床诊断和治疗中不可或缺的重要工具。
全外显子测序是一种高通量的基因组测序技术，能够对所有外显子区域进行全面的检测和分析，从而帮助医生发现患者潜在的遗传变异和突变，为疾病的诊断和治疗提供更精准的信息。
针对全外显子测序检验的临床意义和样本要求，本文将从多个角度进行探讨，并共享个人观点和理解。
一、全外显子测序检验的临床意义1. 诊断和治疗指导：全外显子测序能够为医生提供全面的遗传变异信息，帮助精准诊断疾病类型和确定治疗方案。
尤其对于罕见遗传病、癌症等复杂疾病的诊断和治疗指导具有重要意义。
2. 遗传沟通和家族风险评估：通过全外显子测序检验，可以帮助患者进行遗传沟通，评估患病风险，并为家族成员提供相关遗传信息，帮助他们进行风险评估和健康管理。
3. 个性化医学：全外显子测序检验为个性化医学提供了重要的基础数据，可以根据个体的基因组信息，制定个性化的预防、诊断和治疗方案，实现精准医疗。
二、全外显子测序检验的样本要求1. 样本类型：全外显子测序通常需要采集患者的血液样本，获取其中的DNA进行测序分析。
对于一些特定疾病或研究项目，还可能需要获取肿瘤组织样本等特定样本。
2. 样本质量：样本的质量直接影响着全外显子测序的准确性和可靠性。
在采集和保存样本时，需要注意避免血液凝块和样本污染等情况，保证样本的纯度和完整性。
3. 样本数量：通常情况下，全外显子测序需要一定数量的DNA样本才能进行测序分析。
对于不同的实验项目和测序评台，样本数量的要求可能会有所不同，需要根据具体情况进行调整。
三、个人观点和理解全外显子测序作为一种新型的基因组测序技术，对于临床诊断和治疗具有重要意义。
通过对个体基因组的全面检测，我们能够更好地了解疾病的遗传基础，为精准医学提供数据支持。
然而，在进行全外显子测序检验时，我们也需要考虑样本的要求和质量，以确保测序结果的准确性和可靠性。
【小工具】ACMG评级指南
【⼩⼯具】ACMG评级指南简介2015年，美国权威机构——美国医学遗传学与基因组学学会（ACMG）编写和发布了《ACMG 遗传变异分类标准与指南》。
该指南将变异位点的致病、良性证据列为具体的28条评判标准。
⾸先将证据按类型分类（如⼈群数据、计算预测数据、功能数据等），并将证据的⽀持度分为⼏类（⽀持，中等，强，⾮常强以及独⽴）；然后使⽤“标准组合”的形式来评估致病性。
不同组合将产⽣五个类别的致病性分类：致病，可能致病，临床意义不明，可能良性，良性。
该指南是多学科专家基于⼤量临床案例和丰富经验建⽴的，主要⽤处在于⼤体思路指导，具体案例还需具体分析,新的证据出现时，其评级可上下调整。
变异的命名HGVS命名为标准命名，临床报告应该包含参考序列以确保该变异在DNA⽔平上的明确命名，并提供编码和蛋⽩质命名法来协助功能注释(如“g”为基因组序列，“c”为编码DNA序列，“p”为蛋⽩质，“m”为线粒体)。
编码命名应该使⽤翻译起始密码⼦ATG中的“A”作为位置编号1来描述。
基因组坐标应根据标准基因组版本(如hg19)或覆盖整个基因(包括5'和3'⾮翻译区以及启动⼦)的基因组参考序列来界定。
当描述编码变异时，应该在报告中使⽤和提供每个基因的⼀个参考转录本。
该转录本应该是最长的已知转录本或者是最具临床相关性的转录本。
展开剩余95%ACMG⽀持HGVS命名规则之外的三种特殊例外:►除了当今HGVS推荐的“*”和“Ter”，“X”仍然被认为⽤于报告⽆义变异;►建议根据指定变异选择的参考转录本对外显⼦进⾏编号;►通常因为临床解释直接评估致病性，所以推荐使⽤术语“致病性”⽽不是“影响功能”。
数据库的使⽤基因组数据库收录不断被发现的变异，当我们需要对某⼀变异分类并报告，可在已有的数据库中找到有价值的信息。
⼈群数据库适⽤于获取某变异在⼤规模⼈群中发⽣频率的相关信息。
需要注意的是，⼈群数据库中的信息不仅来源于健康个体，也包含致病性的变异。
全外显子测序报告解读原则与技巧
全外显子测序报告解读原则与技巧全外显子测序是利用高通量测序技术对生物体全基因组外显子区域进行测序，从而揭示人类个体及群体基因组中与疾病相关的基因变异，是现代个性化医学的重要技术手段之一。
下面我们将介绍全外显子测序报告的解读原则和技巧。
解读原则：1.全面性：全外显子测序提供了全面、高通量的大量数据，必须对其进行全面、深入的解读。
同时需要结合临床资料，以全面、系统性的方式进行解读。
2.多参考性：全外显子测序可能会检测到一些变异，但并不一定与致病性相关。
因此，需要根据多个参考数据库、文献资料以及基于家系检测的疾病遗传性等多方面的数据进行判断和筛选。
3.个体化：全外显子测序报告需要与具体个体相关的临床资料、家族病史等进行结合，重点考虑与之相关的变异是否致病、临床意义何在等方面。
4.实用性：全外显子测序报告应当具有实用性，得出的结论应当能指导个体的诊断、治疗与遗传咨询。
解读技巧：1.对阳性结果进行验证：全外显子测序可能会检测到大量的单核苷酸多态性（SNP）、小的结构变异等，为了保证结果的精确性，最好对阳性结果进行验证，可以使用参考文献、数据库或其他现代检验技术进行检验。
2.避免过度解读：全外显子测序结果的解读需要考虑基因本身的复杂性，并非所有的变异都与疾病相关。
因此不应过度解读，需要根据科学方法进行分析和评价。
3.结合病史、家族史等临床资料：全外显子测序结果需要结合实际临床背景进行解读，包括基因检测的目的、临床表现、影响家庭、遗传风险等因素。
4.遵循实践指南：目前许多学会和机构都制定了全外显子测序报告解读的指南，如美国基因组医学协会（ACMG）和全球基因组联盟（GA4GH）等，解读应该遵循指南的原则和标准。
总之，全外显子测序是一项高复杂性的技术，其结果的解读需要谨慎，需要全面、深入地理解和分析，以确保结果的准确性和实用性。
同时，我们需要结合个体的临床信息和基因组数据来指导临床医生的决策和个体的诊断治疗方案，为个性化医学做出贡献。
全外显子测序遗传咨询要点
全外显子测序遗传咨询要点
全外显子测序遗传咨询要点主要包括以下几点：
理解检测结果：全外显子测序能检测出一些遗传病的易感基因，但并不能直接给出诊断结论。
因此，对于检测结果，需要咨询专业医生或遗传咨询师，进行深入分析和解读。
确认家族遗传病史：了解家族中是否有遗传病患者，以及这些患者的疾病表现和基因突变情况，有助于更准确地解读检测结果。
关注健康生活方式：即使检测出有遗传病易感基因，健康的生活方式和饮食习惯也有助于降低疾病风险。
因此，在遗传咨询中，医生或咨询师会强调这些方面的重要性。
考虑生育建议：对于检测出携带遗传病易感基因的人，医生或咨询师会提供生育建议。
例如，是否需要进行产前诊断或胚胎筛选等。
心理支持：全外显子测序可能会带来一定的心理压力。
因此，遗传咨询中还需要关注个人的心理状态，提供必要的心理支持和辅导。
持续监测和复查：即使检测结果为阴性，也不能保证未来不会出现相关疾病。
因此，需要保持对自身健康的关注，定期进行体检和复查。
尊重个人隐私：全外显子测序涉及个人基因信息，因此需要确保个人信息的安全和隐私。
遗传咨询中，医生或咨询师会强调这一点，并告知相关法律法规和伦理规范。
综上所述，全外显子测序遗传咨询需要综合考虑多个方面，包括检测结果的解读、家族遗传病史的了解、健康生活方式的关注、生育建议的提供、心理支持的给予、持续监测和复查的建议以及个人隐私的保护等。
外显子测序 生物学重复-概述说明以及解释
外显子测序生物学重复-概述说明以及解释1.引言1.1 概述外显子测序（exome sequencing）是一种基于高通量测序技术的生物学研究方法，其目的是对生物体中的外显子区域进行快速、准确地测序和分析。
外显子是基因组中编码蛋白质的片段，它们占据了整个基因组的仅0.5至1.5的区域，但却承载着80以上的已知致病突变。
因此，外显子测序被广泛应用于寻找蛋白质编码基因的突变，以及与遗传性疾病、肿瘤和其他复杂疾病相关的致病突变的鉴定和研究。
外显子测序的基本原理是使用高通量测序技术对DNA样本进行测序，然后利用生物信息学方法将测序结果与参考基因组进行比对和分析，从而确定样本中外显子的序列和存在突变的位置。
与全基因组测序相比，外显子测序具有较低的成本和更高的效率，因为外显子相对较小且具有较高的功能重要性，可以更准确地筛选和鉴定潜在致病突变。
外显子测序在生物学研究中的应用广泛而重要。
它不仅可以用于研究人类遗传性疾病和肿瘤突变，还可应用于农业、畜牧业和其他生物领域的基因组学研究。
通过对不同个体的外显子进行测序，我们可以了解个体间的遗传差异、突变积累和遗传进化规律，为人类进化和适应性研究提供重要依据。
然而，外显子测序也面临一些挑战。
首先，由于外显子区域相对较小，它只能提供关于外显子的信息，对非编码区域的突变鉴定有限。
其次，外显子测序在处理复杂疾病和疾病相关基因组变异时可能会遇到困难，因为这些变异可能位于基因的调控区域或与功能相关的非编码RNA中。
此外，外显子测序对测序深度和准确性要求较高，因此需要高质量的测序平台和数据分析方法的支持。
总之，外显子测序作为一种高效、准确的测序技术，在生物学研究和临床诊断中发挥着重要作用。
随着技术的不断发展和应用的不断扩大，外显子测序将为我们揭示生物体的基因组变异与功能之间的关系，为疾病的早期诊断和个性化治疗提供更多可能性。
同时，对于生物学重复的研究也为我们提供了全新的视角和理解，有助于揭示生命的奥秘和进化的规律。
41. ACMG全外显子测序指南.
ACMG全外显子测序指南摘要：美国医学遗传学与基因组学学会（ACMG）以前为序列突变的解释提供了指导.1在过去十年中，随着高通量测序的出现，测序技术迅速发展。
通过采用和利用下一代测序，临床实验室正在进行基因分型，单基因，基因组，外显子，基因组，转录组和遗传疾病表观遗传学检测的不断增加的遗传检测目录。
由于复杂性增加，基因检测的这种转变伴随着序列解释的新挑战。
在这方面，ACMG于2013年召集了一个由ACMG，分子病理学协会（AMP）和美国病理学家学会的代表组成的工作组，重新审视和修订了序列突变解释的标准和准则。
该组由临床实验室主任和临床医生组成。
本报告代表ACMG，AMP和美国病理学家利益相关者联盟组成的工作组的专家意见。
这些建议主要适用于临床实验室使用的遗传检测的范围，包括基因分型，单基因，panel，外显子和基因组。
本报告建议使用具体的标准术语- “致病性”，“可能致病性”，“不确定性意义”，“可能良性”和“良性”来描述在导致孟德尔病症的基因中鉴定的突变。
此外，该建议描述了基于使用典型类型的突变证据（例如，群体数据，计算数据，功能数据，分离数据）的标准将突变分类为这五个类别的过程。
由于本报告中描述的临床基因检测的分析和解释的复杂性增加，ACMG强烈建议临床分子遗传学检测应在经过临床实验室改进修订批准的实验室进行，结果由相关职业认证的临床分子遗传学家或分子遗传病理学家或同等学科专家进行解释。
关键词：ACMG实验室指导; 临床遗传检测; 解释；报告; 序列变异术语；突变报告前言临床分子实验室正在不断增加检测的新的序列突变，因为在检测患者标本时不断发现大量与基因疾病相关的基因。
虽然一些表型与单个基因相关，但许多与多个基因相关。
我们对任何给定序列突变的临床意义的理解是循序渐进的，其范围从那些几乎肯定是疾病致病性突变到几乎肯定是良性的突变。
虽然以前的美国医学遗传学和基因组学会（ACMG）的建议提供了序列突变的解释类别和解释算法，但是这些建议没有提供定义的术语或详细的突变分类指南.1。
人外显子测序
人外显子测序药明康德基因中心，陆桂1. 什么是外显子测序（whole exon sequencing）？外显子组测序是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。
外显子测序相对于基因组重测序成本较低，对研究基因的SNP、Indel 等具有较大的优势，但无法研究基因组结构变异如染色体断裂重组等。
2. 外显子捕获试剂盒有哪些？目前主要有Roche、Illumina和Agilent三家的外显子捕获试剂。
Nimblegen和Illumina的捕获试剂盒中的探针是DNA探针，化学性质稳；Agilent的捕获试剂盒是RNA探针，有可能RNA 不是很稳定。
3. 外显子捕获效率是什么？外显子测序过程中要用到杂交过程。
在人的染色体上有许多与外显子有同源性的部分，这些有同源性的部分很可能在杂交过程中也被捕获下来。
所以，测到的序列中，有一部分不是外显子序列。
我们把测序得是外显子的部分占全部测序序列的比列称为捕获效率。
Nimblegen大约是70%Agilent大约是60%Illumina大约是50%4. 外显子测序一般建议做多少倍的覆盖？一般做100X或者150X。
较高的覆盖倍数，对于测异质性的遗传变质，可以发现小比例的突变。
另外，外显子测序的覆盖不是很均匀，这样较高的平均覆盖率有利于保证大部分的区域有足够的覆盖倍数。
5. 外显子测序能够测出多大的片段缺失？大致能测出50bp的片段缺失。
目前的测序主要还是用Hiseq 2000,单侧的测长就是100bp。
由于外显子测序的覆盖很不平均，所以如果有大段的缺失，无法判断是因为杂交没有捕获到，还是因为缺失。
目前能够测到的，就是在一个read中发现的缺失。
一个read的长度也就是100bp，所以大到50bp以下的片段缺失可以从外显子测序中测出来。
6. 外显子捕获可以做CNV吗？外显子测序因为有一个杂交捕获的过程，这样就会有一个杂交捕获效率的问题。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性，平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。
ACMG全外显子测序指南摘要：美国医学遗传学与基因组学学会（ACMG）以前为序列突变的解释提供了指导.1在过去十年中，随着高通量测序的出现，测序技术迅速发展。
通过采用和利用下一代测序，临床实验室正在进行基因分型，单基因，基因组，外显子，基因组，转录组和遗传疾病表观遗传学检测的不断增加的遗传检测目录。
由于复杂性增加，基因检测的这种转变伴随着序列解释的新挑战。
在这方面，ACMG于2013年召集了一个由ACMG，分子病理学协会（AMP）和美国病理学家学会的代表组成的工作组，重新审视和修订了序列突变解释的标准和准则。
该组由临床实验室主任和临床医生组成。
本报告代表ACMG，AMP和美国病理学家利益相关者联盟组成的工作组的专家意见。
这些建议主要适用于临床实验室使用的遗传检测的范围，包括基因分型，单基因，panel，外显子和基因组。
本报告建议使用具体的标准术语- “致病性”，“可能致病性”，“不确定性意义”，“可能良性”和“良性”来描述在导致孟德尔病症的基因中鉴定的突变。
此外，该建议描述了基于使用典型类型的突变证据（例如，群体数据，计算数据，功能数据，分离数据）的标准将突变分类为这五个类别的过程。
由于本报告中描述的临床基因检测的分析和解释的复杂性增加，ACMG强烈建议临床分子遗传学检测应在经过临床实验室改进修订批准的实验室进行，结果由相关职业认证的临床分子遗传学家或分子遗传病理学家或同等学科专家进行解释。
关键词：ACMG实验室指导; 临床遗传检测; 解释；报告; 序列变异术语；突变报告前言临床分子实验室正在不断增加检测的新的序列突变，因为在检测患者标本时不断发现大量与基因疾病相关的基因。
虽然一些表型与单个基因相关，但许多与多个基因相关。
我们对任何给定序列突变的临床意义的理解是循序渐进的，其范围从那些几乎肯定是疾病致病性突变到几乎肯定是良性的突变。
虽然以前的美国医学遗传学和基因组学会（ACMG）的建议提供了序列突变的解释类别和解释算法，但是这些建议没有提供定义的术语或详细的突变分类指南.1。
本报告描述了关于序列变异分类的更新的标准和指南，由专家意见和经验数据确定的标准。
方法在2013年，由ACMG，分子病理学协会（AMP）和美国病理学家学会成员组成的工作组成立，代表临床实验室主任和临床医生，目的是制定使用标准术语的建议，以使用根据通过专家意见，工作组共识和社会投入制定的制度对现有证据加权。
为了评估临床实验室的意见，调查发送到中列出的美国和加拿大的100多个测序实验室，要求输入术语偏好和评估变异分类的证据。
实验室检测经验包括罕见疾病以及药物基因组学和体细胞癌检测。
旨在评估术语偏好的第一项调查于2013年2月发布，结果在2013年ACMG年度会议的公开论坛上发布，其中包括75位与会者。
调查对象在北美代表了超过45个实验室。
调查结果和公开论坛表明，（i）使用“致病性”，“可能致病性”，“不确定性意义”，“可能良性”和“良性”这五个术语系统是首选的，已经在大多数实验室使用，以及（ii）工作组的首次努力应着重于孟德尔病和线粒体突变。
在第一次调查中，实验室也被要求提供突变评估方案，11个人分享了他们的方法。
通过分析所有提交的协议，工作组制定了一套标准来加权突变证据和一套组合标准以达到五个分类层之一的规则。
工作组成员使用已知类别的突变在其实验室和/或更广泛的范围检测了该方案数周。
此外，对具有最常见类型证据的突变的典型示例进行了分类分配，以确保系统根据工作组成员当前应用的方法对这些突变进行分类。
第二次调查于2013年8月发送给那些相同的通过GeneTests确认的实验室，以及通过AMP的约2,000个成员，以及提出的分类方案和详细的补充描述如何使用每个标准的实验室。
实验室被要求使用该方案，并就每个标准的适用性和相对权重，分类系统的易用性以及是否在本国实验室采用这种系统提供反馈。
超过33个实验室的回应表明多数支持拟议的方法，反馈意见进一步指导了拟议标准和准则的制定。
2013年11月，工作组在AMP会议上与50多名与会者举行了研讨会，介绍了修订的分类标准和两个潜在的评分系统。
一个系统与这里提出的方法一致，另一个系统是一个点系统，其中每个标准给出了一些点，为病原标准指定积极点和良性标准的负点，从而对所以突变的分类进行了定义。
通过观众回应系统，参与者被问及如何在评估突变证据时对每个标准（强，中等或支持或不使用）进行加权。
同样，这些答复也纳入了这里介绍的分类系统。
应该指出的是，虽然大多数答复者都赞成一个积分制，但工作组认为，为每个标准指定具体要点意味着对目前不支持科学评估的每个标准的定量水平的理解，并没有考虑到解释遗传证据的复杂性。
工作组还对来自其他专业社会和工作组的建议进行了评估，其中已经制定了乳腺癌，结肠癌和囊性纤维化中良好基因的变异分类指南，以及用于定量评估选择性疾病变异的统计分析程序.2-5。
虽然这些突变分析指南在特定环境中是有用的，但是很难将其提出的标准应用于所有基因和不同的实验室设置。
本文中描述的突变分类方法适用于所有孟德尔基因的突变，无论是通过单基因检测，多基因定位，外显子测序还是基因组测序鉴定。
我们期望随着技术和知识的改进，这种突变分类方法将会发展。
我们还应该注意，在特定疾病组中工作的那些人应该继续制定关于特定基因中突变分类的更集中的指导，因为赋予某些标准的适用性和重量可能因基因和疾病而异。
一般考虑术语突变被定义为核苷酸序列的永久变化，而多态性定义为频率高于1％的突变。
然而，广泛使用的术语“突变”和“多态性”通常分别导致由于不良假定的致病性和良性效应而引起的混淆。
因此，建议将两个术语用术语“突变”替换为以下修饰物：（i）致病性，（ii）可能的致病性，（iii）不确定的意义，（iv）可能良性或（v）良性。
虽然这些修饰剂可能不涉及所有人类表型，但是它们包括与本指南中所述的与孟德尔病有关的突变的五级分类系统。
建议所有的致病的诊断（包括“可能致病”的报道）是相对于条件和遗传模式（例如，c.1521_1523delctt（p.phe508del），致病性，囊性纤维化，常染色体隐性遗传）。
应该指出的是，一些实验室可能会选择拥有额外的分类层级（例如，对具有不确定意义的突变进行分类，特别是内部使用），这种做法不被认为与这些建议不一致。
还应该指出，这里推荐的术语与目前用于分类细胞遗传学微阵列检测的拷贝数变异的建议有所不同.6。
推荐用于拷贝数突变的模式，同时包括五个层次，使用“不确定的临床意义- 可能致病性“和”不确定的临床意义- 可能良性“。
大多数工作组不支持使用“不确定的意义“术语修改为”可能致病”或“可能是良性”，因为认为这里提出的标准将突变分类为“可能”类别包括比拷贝数突变指南中概述的更强的证据，并且组合这两个类别将为接受临床报告的卫生保健提供者和个体造成混乱。
然而，有人认为，使用术语“可能”应该限于数据支持很可能是致病性或很有可能是良性的突变。
虽然术语“可能”没有定量定义，但在某些突变分类设置中已经提出了指导。
然而，在ACMG公开论坛期间对协会的调查显示，“可能”一词的用途范围更广泛。
认认识到这一点，我们建议将“可能致病性”和“可能良性”这一术语用于表示大于一个突变的90％的确定性是致病的或良性的，为实验室提供一个具有共同的，虽然是规定的定义，是疾病或良性的。
同样，国际癌症研究机构准则2支持95％的致病性确定性，但工作组（通过ACMG公开论坛的反馈确认）认为，临床医生和患者愿意容忍稍高一些的错误机率到90％的决定。
还应该指出，目前，大多数疾病具有异质性，大多数突变没有数据来支持对五个类别中的任何一个的突变确定性的定量分配。
希望随着时间的推移，将会开发客观地将变异的致病性信心的实验和统计学方法开发出来，并且采用更加严格的方法来定义临床协会在信心方面的期望，将更充分地说明术语和可能性。
使用新术语可能需要协会的教育。
鼓励专业协会对所有实验室和保健提供者进行教育，使用这些术语，并鼓励实验室直接教育其对应医师。
命名方法推荐通过一组标准化标准通知的统一命名法，以确保明确指定突变，并能够有效共享和下游使用基因组信息。
标准基因变异命名法（/mutnomen）由人类基因组变异学会（HGVS）7维护和版本化，其使用被推荐作为确定变异命名法的主要准则，除非另有说明。
6 实验室应注意检测中使用的版本。
工具软件可用于提供正确的HGVS术语，用于描述突变（https://mutalyzer.nl）.8。
临床报告应包括序列参考，以确保在DNA水平上对突变进行明确的命名，以及提供编码蛋白质命名法以协助功能性解释（例如，“g.”，用于基因组序列，“c.”，用于编码DNA序列，“p.”用于蛋白质，“m.”用于线粒体）。
应使用ATG翻译起始密码子的“A”作为位置号1来描述编码术语。
如果使用历史替代命名法，则应使用当前命名法以及历史命名的附加符号。
参考序列应该是完整的，并且来自国家生物技术信息中心RefSeq数据库（/RefSeq/)9，其版本号或Locus参考基因组数据库（http：// ）.10。
基因组坐标或一个涵盖整个基因的基因组参考序列(包括5'和3'未翻译的区域和启动子)应该根据标准的基因组构建来使用和定义(例如:hg19) 。
在描述编码突变时，应在报告中使用并提供每个基因的参考文献。
转录应代表最长的已知记录和/或最临床相关的记录。
学会支持的参考文献通常可以通过Locus Reference Genomic10，Consensus CDS数据库，11人基因突变数据库（http：//www.hgmd。
），ClinVar（http：//www.ncbi。
/clinvar）或轨迹特异性数据库查询。
然而，实验室应该评估突变对所有临床相关转录物的影响，包括在这些区域中已知的突变在临床上可解释时含有额外的外显子或扩展的非翻译区的替代转录物。
并非所有类型的突变（例如，复杂突变）都被HGVS建议所涵盖，但可能可以被已经报告了复杂突变所描述.7,12。
此外，该ACMG建议支持HGVS命名规则的三个具体例外：（i）除了目前的HGVS“*”和“Ter”建议之外，“X”仍然被认为可以用于报告无义突变。
（ii）建议根据用于指定突变的选定参考文献编号外显子; 和（iii）推荐使用术语“致病性”而不是“影响功能”，因为临床解释通常直接评估致病性。
文献资料库的使用大量数据库包含在人类基因组中不断发现的越来越多的突变。
在分类和报告突变时，临床实验室可能会在数据库以及已发表的文献中找到有价值的信息。
如上所述，序列数据库也可用于鉴定适当的参考序列。
数据库可用于收集信息，但应谨慎使用。
人类数据库（表1）可用于获取大群体变异频率。