蛋白质翻译后修饰ppt课件

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第六章蛋白质翻译后修饰的鉴定

第六章蛋白质翻译后修饰的鉴定

04
抗体法在蛋白质翻译后修饰鉴定中的应用
抗体法原理及技术流程
原理
抗体法利用特异性抗体与蛋白质翻译 后修饰位点结合的原理,通过免疫学 方法进行检测和鉴定。
技术流程
包括抗原制备、抗体生产、抗体纯化 和特异性验证等步骤。
抗体法鉴定蛋白质翻译后修饰的优势与局限性
优势
高特异性、高灵敏度、可定量分析等。
局限性
化学方法
质谱分析
通过质谱技术检测蛋白质分子的质量和化学 性质,从而鉴定蛋白质的翻译后修饰类型和 位点。
荧光标记
利用荧光标记技术标记特定的修饰位点,通过荧光 信号的强度和分布来鉴定蛋白质的翻译后修饰。
蛋白质芯片技术
将蛋白质固定在芯片表面,利用特定的抗体 或配体检测蛋白质的翻译后修饰类型和位点 。
实例分析
第六章蛋白质翻译后 修饰的鉴定
汇报人:XX
目录
• 蛋白质翻译后修饰概述 • 蛋白质翻译后修饰的鉴定方法 • 质谱法在蛋白质翻译后修饰鉴定中的应用 • 抗体法在蛋白质翻译后修饰鉴定中的应用 • 其他方法在蛋白质翻译后修饰鉴定中的应
用 • 蛋白质翻译后修饰鉴定的挑战与未来发展
01
蛋白质翻译后修饰概述
数据准备
收集已知的蛋白质乙酰化修饰位点数据,包括蛋白质序列、修饰位点 的位置和化学性质等。
特征提取
从蛋白质序列中提取与乙酰化修饰相关的特征,如氨基酸组成、序列 模体、结构域等。
模型训练
利用机器学习或深度学习算法,如支持向量机、神经网络等,训练预 测模型。
预测与验证
将新的蛋白质序列输入到训练好的模型中,预测潜在的乙酰化修饰位 点,并通过实验验证预测结果的准确性。
其他方法
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蛋白质泛素化修饰的技术路线PPT课件

蛋白质泛素化修饰的技术路线PPT课件
感染性疾病治疗中的泛素化修饰研究
针对感染性疾病的治疗,一些研究关注利用泛素化系统来抑制病毒或细菌的复制。通过 调节泛素化修饰相关信号通路,可以抑制感染进程并改善疾病预后。
04
泛素化修饰的干预手段
药物干预
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03
靶向药物
针对特定蛋白质的泛素化 修饰,开发靶向药物,以 调节蛋白质的稳定性、定 位或功能。
开发泛素化修饰相关药物
基于对泛素化修饰机制的理解,开发能够调节泛素化修饰的药物,用于治疗相关疾病。
THANK YOU
抑制酶活性
通过抑制泛素化修饰相关 酶的活性,调控蛋白质的 泛素化水平,进而影响其 生物学功能。
激活酶活性
激活泛素化修饰相关酶的 活性,增加特定蛋白质的 泛素化修饰,以调节其生 物学行为。
基因治疗
基因敲除
通过基因敲除技术,消除 与泛素化修饰相关的基因, 从而调控蛋白质的泛素化 状态。
基因过表达
过表达与泛素化修饰相关 的基因,增加特定蛋白质 的泛素化修饰,以调节其 生物学功能。
泛素化修饰在神经退行性疾病中的作用
泛素化修饰可以调控神经元的生长、突起和凋亡等过程。在神经退行性疾病中,异常的泛 素化修饰可能导致神经元功能障碍和死亡。
神经退行性疾病治疗中的泛素化修饰研究
针对神经退行性疾病的治疗,一些研究关注调节泛素化修饰相关信号通路。通过抑制某些 泛素化酶的活性或调节相关信号通路,可以延缓神经元死亡和疾病进展。
蛋白质泛素化修饰的技术路线ppt 课件
目录
• 泛素化修饰概述 • 泛素化修饰的检测技术 • 泛素化修饰相关疾病研究 • 泛素化修饰的干预手段 • 展望与未来研究方向
01
泛素化修饰概述
泛素化修饰的定义

蛋白组学翻译后修饰

蛋白组学翻译后修饰


先用糖苷内切酶消化,再用蛋白酶消化,通过 分析糖苷酶作用前后MS发生位移的肽段,即 可确定含糖基化的肽段 结合串联质谱,可进一步分析糖基化肽段的氨 基酸序列,从而发现糖基化位点
核糖核酸酶B中糖基化位点的分析
糖苷键酶F作用前
糖苷键酶F作用后 剩一个GlcNAc
氨基酸序列的测定
m/z=4792.23

翻译后化学修饰的生物学效应





泛素化对于细胞分化与凋亡、DNA 修复、免疫应 答和应激反应等生理过程起着重要作用; 磷酸化涉及细胞信号转导、神经活动、肌肉收缩 以及细胞的增殖、发育和分化等生理病理过程; 糖基化在许多生物过程中如免疫保护、病毒的复 制、细胞生长、炎症的产生等起着重要的作用; 脂基化对于生物体内的信号转导过程起着非常关 键的作用; 组蛋白上的甲基化和乙酰化与转录调节有关。
TSAASSSNYCNQM

RQHMDSSTSAASSSNYCNQ MMKSRNLTKDRCKPVNTF VHE
糖基化类型的分析

糖蛋白进行蛋白酶切,得到含糖肽段,对肽段直接 进行ESI-MS/MS,以及MALDI-TOF-MS的PSD, 可以直接得到单糖碎片,从而确定糖链结构。
凝集素在糖蛋白研究中的作用

真核生物的Ser,Thr,Tyr 残基. 原核生物的His,Asp,Glu
蛋白质组学在磷酸化分析中的困难




磷酸化蛋白质在细胞内的蛋白质中是相对较 低丰度的; 即使我们找到一种磷酸化蛋白质,也不能排 除有该蛋白质的其他磷酸化形式存在; 细胞内有很多磷酸酯酶,在样品处理时,这 些酶很容易将磷酸基团脱掉; 磷酸化蛋白质酶解后的磷酸化肽段,因为其 化学性质的负电性,在质谱技术中面临着难 以质子化的困难。

蛋白质翻译后修饰

蛋白质翻译后修饰

细胞应激反应
在应激条件下,如氧化应激和DNA损伤, 蛋白质翻译后修饰可以调控应激反应相关蛋 白的活性和功能,从而影响细胞的生存和凋
亡。
THANK YOU
泛素化作用
泛素化可以影响靶蛋白的稳定性、定位、活性以及与其他蛋白质的相互作用,从 而调控细胞内的多种生物学过程,如细胞周期、信号转导和自噬等。
泛素化可以标记受损或不需要的蛋白质,引导其被蛋白酶体降解,从而维持细胞 内蛋白质的平衡。
泛素化调控
泛素化过程受到严格的调控,涉及多种酶的协同作用。这些酶包括E1(泛素活化酶)、 E2(泛素结合酶)和E3(泛素连接酶)。
E3酶在泛素化过程中起着关键作用,它能够识别并结合特定的靶蛋白,将泛素分子准 确地连接到靶蛋白上。
此外,去泛素化酶能够逆转泛素化过程,去除已经结合在靶蛋白上的泛素分子,从而对 泛素化进行动态调控。
05
其他翻译后修饰
乙酰化
总结词
乙酰化是一种常见的蛋白质翻译后修饰,通过将乙酰基团连接到蛋白质的特定氨基酸残基上,可以调节蛋白质的 活性和功能。
翻译后修饰可以影响蛋白质的稳定性 ,通过增加或减少蛋白质的降解速率 ,从而影响细胞内蛋白质的水平和功 能。
蛋白质降解
某些翻译后修饰,如泛素化,可以标 记蛋白质进行降解,通过蛋白酶体途 径降解蛋白质,维持细胞内蛋白质的 动态平衡。
蛋白质功能调控
酶活性调节
亚细胞定位
许多蛋白质在翻译后被修饰以改变其酶活性, 例如,磷酸化可以激活或抑制酶的活性,从 而调控代谢过程和信号转导。
03
疾病与磷酸化
许多人类疾病与蛋白质磷酸化的异常有关。例如,一些癌症和神经退行
性疾病的发生与特定蛋白质的异常磷酸化有关。因此,对蛋白质磷酸化

蛋白质翻译及翻译后修饰课件.ppt

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1.3 核糖体(ribosome)与核糖体rRNA
核糖体是rRNA 与几十种蛋白质的复合体,有大、小两个亚基构成。含有 合成蛋白质多肽链所必需的酶、起始因子(IF)、延伸因子(EF)、释放 因子(RF)等。
原核的核糖体(70S)= 30S小亚基 + 50S大亚基 30S小亚基: 16S rRNA + 21种蛋白质 50S大亚基: 23S,5SrRNA + 34种蛋白质
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tRNA的结构—“四环一臂”
倒L形的三级结构
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tRNA的功能是解读mRNA上的密码子和搬运氨基酸。 tRNA上至少有4 个位点与多肽链合成有关:即3’CCA氨基酸接受位
点、氨基酰-tRNA合成酶识别位点、核糖体识别位点和反密码子位点。 每一个氨基酸有其相应的tRNA携带, 氨基酸的羧基与tRNA的 3’
反应如下:
A A t R N A A T P 氨 酰 基 - t R N A 合 成 酶 A A - t R N A A M P P P i
氨基酸的羧基与tRNA 的3’端CCA-OH 以酯键相连,因此其氨基是自 由的。
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tRNAfmet fMet-tRNA合成酶
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分泌型蛋白质在翻译过程中通过信号肽协助转入内质网的机制
信号肽(signal peptide)是在新生的多肽链中,可被细胞识别系统识别的 特征性氨基酸序列,在蛋白质翻译过程中或翻译后的定位发挥引导的作用。
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本章结束
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氨酰基tRNA进入A位
新的氨基酸-tRNA的进位依赖Tu-Ts因子和GTP的协助

《蛋白质的翻译》PPT课件

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胰蛋白酶原 胰蛋白酶
胰蛋白酶原的激活示意图
信号肽
能引导蛋白质靶向运输的特殊信号序列,即多肽链分子N端 的一段被细胞转运系统识别的保守性氨基酸序列,称为“信号 肽”。
序列组成: 16 ~30氨基酸残基 N端含1到几个碱性氨基酸残基 中部4 ~15疏水性中性氨基酸(Leu、Ile) C端含极性、小侧链的Gly、Ala、Ser 紧接信号肽酶裂解位点
大肠杆菌的分子伴侣
胰岛素原的加工
间插序列(C肽区)
HS SH
HS SH HS
C A链区
B链区
SH
核糖体上合成出无规 则卷曲的前胰岛素原
切除信号肽后
折叠成稳定构
信号肽
象的胰岛素原
N
N
S-S C
S
S
S
S
胰岛素原
切除C肽后,形成 成熟的胰岛素分子
N
S S N
A链 C
S
C B链
S
胰岛素
六肽
肠 激 酶
活性中心
这就是翻译!
一、模板与遗传密码
(一) 遗传密码
遗传密码的几个重要特性
连续性 简并性 通用性 摆动性
摆 动 理 论
(二)开放阅读框(ORF)
真核细胞几乎只有一个ORF,原核细胞经常有2个或多个 ORF

氨基酸受体臂
D臂 反密码子臂
tRNA的L形三级结构 反映了其生物学功能,因为它上所运载的氨
4. 氨酰-tRNA合成酶将氨基酸连到tRNA上 tRNA的氨酰化(负载)由氨酰-tRNA合成酶的一组酶
催化完成。生物体有20种氨酰-tRNA合成酶,每个对应 一种氨基酸,这意味着一组同工tRNA被一个酶酰氨化。

蛋白质翻译后修饰与加工

蛋白质翻译后修饰与加工

VS
信号转导
在信号转导过程中,蛋白质的翻译后修饰 可以影响蛋白质与其他信号分子或受体的 结合,从而调控信号转导通路的激活或抑 制。
蛋白质构象变化
构象变化
某些蛋白质在翻译后经过特定的化学修饰, 如磷酸化、乙酰化等,这些修饰可以改变蛋 白质的构象,从而影响蛋白质的功能。
结构域运动
蛋白质的结构域之间可以发生相对运动,这 种运动可以影响蛋白质与其他分子的结合或 构象变化,从而调控蛋白质的功能。
糖基化
总结词
糖基化是一种在蛋白质翻译后发生的修饰,通过将糖链连接到蛋白质的特定氨基酸残基上,影响蛋白质的结构和 功能。
详细描述
糖基化分为两种类型:N-糖基化和O-糖基化。N-糖基化发生在新生蛋白的N-端,而O-糖基化发生在丝氨酸或苏 氨酸残基上。糖基化可以影响蛋白质的稳定性、分泌和细胞间的相互作用,参与多种生物学过程,如细胞识别、 信号转导和免疫应答等。溶酶体途径Fra bibliotek溶酶体
是一种细胞器,内部含有多种水解酶,能够分解各种生物大分子。
溶酶体途径
是指通过溶酶体降解细胞内物质的过程。
04
蛋白质定位与转运
核定位信号
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04
核定位信号(NLS)
是一种特殊的氨基酸序列,能 够引导蛋白质进入细胞核。
核输出信号(NES)
存在于某些蛋白质中,能够将 蛋白质从细胞核输出到细胞质 。
酶的激活
某些蛋白质在翻译后经过特定的化学 修饰,如磷酸化、乙酰化或甲基化等, 这些修饰可以改变酶的构象或电荷分 布,从而激活酶的活性。
酶的失活
某些蛋白质经过特定的化学修饰后, 如泛素化或糖基化等,会导致酶的活 性降低或完全失活,从而调控蛋白质 的降解或功能。

蛋白翻译后修饰

蛋白翻译后修饰

凋亡,从而最终发展成为癌细胞 .
2.5 磷酸化
DNA新陈代谢的研究中:细胞中DNA损伤可导致人的复制蛋 白 A(RPA)32 kD 亚基 N 端的过度磷酸化, 这有助于调控 DNA 的新陈代谢, 促进DNA 修复. 有数据显示, 过度磷酸化会 导致 RPA 构象改变 , 降低 DNA 复制的活性 , 但不会影响
泛素-蛋白酶系统是存在于所有真核生物细胞的调控
系统。降解过程中需要三种酶的参与: 泛素激活酶(E1)、
泛素结合酶(E2)和泛素蛋白质连接酶(E3)。泛素化降解
蛋白的过程中对蛋白的特异性识别依赖 E3. 由 E2s 和 E3s 介导的泛素化过程可以被去泛素化酶(DUBs)逆转.。
2.4 泛素化
目前发现的 DUBs 可分为两大类 : 泛素碳端水解酶 (ubiquitin C-terminal hydrolases,UCHs)和泛素特异性
DNA 的修复。
2.6 SUMO 化
SUMO为小泛素相关修饰物 (small ubiquitin- related modifier,SUMO)分子,是一种近年发现的泛素样分子,也参与 蛋白质翻译后修饰,但是不介导靶蛋白的蛋白酶体降解, 而 是可逆性修饰靶蛋白,参与靶蛋白的定位及功能调节过程。
3 研究方法及关键技术
蛋白酶 (ubiquitin-spicific processing proteases,
UBPs) ,两者都是半胱氨酸水解酶。泛素化降解蛋白 的过程中对蛋白的特异性识别依赖E3. 由E2s 和E3s 介导的泛素化过程可以被去泛素化酶 (DUBs)逆转通常 情况下, UCHs 主要水解羰基端的酯和泛素的氨基键,
2.3 糖基化
发生在高尔基体上:起始于丝氨酸和苏氨酸羟基 上连接N-乙酰半乳糖胺、N-乙酰葡萄糖胺、甘露糖及
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4.磷酸化 ➢ 蛋白质的磷酸化是指通过酶促反应将磷酸基团转移到目
的蛋白特定的氨基酸残基上的过程,是可逆的。这是生 物体内存在的一种普遍的调节方式,在细胞信号的传递 过程中占有极其重要的地位。 ➢ 近年来,已经发现由蛋白激酶和蛋白磷酸化酶催化的蛋 白质磷酸化/去磷酸化在原核生物中十分普遍。磷酸化/ 去磷酸化的意义还不太清楚。目前只知在细菌趋化性和 氮代谢调空中有瞬间的磷酸化作用。
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5.乙酰化 乙酰化修饰首先是在真核生物中发现的,发生乙酰化的 位点是结合在DNA 上组蛋白的赖氨酸残基着-NH2,对基 因转录起到重要的调节作用。随着研究的深入,近些年 在原核生物中也发现了蛋白质乙酰化修饰。 DNA结合蛋白的乙酰化修饰 乙酰辅酶A合成酶(ACS)的乙酰化修饰 核糖体蛋白的乙酰化修饰
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3.甲基化 ➢ 蛋白质的甲基化是指在甲基转移酶催化下,甲基基团由S- 腺
苷基甲硫氨酸转移至相应蛋白质的过程,既可以形成可逆的 甲基化修饰,如羧基端的甲基化修饰;也可以形成不可逆的 甲基化修饰,如氨基端的甲基化修饰。在原核生物中也普遍 存在蛋白质的甲基化。 ➢ 在大肠杆菌和有关细菌中发现的一种甲基转移酶能甲基化膜 结合的化学受体蛋白的谷氨酸残基。这种甲基转移酶和另外 一种甲基酯酶催化的甲基化/去甲基化过程在细菌趋化性的信 号转导中起重要作用。
1.切除加工 2.糖基化 3.甲基化 4.磷酸化 5.乙酰化 6.泛素化
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1.切除加工 ➢ 包括去掉N端的甲酰甲硫氨酸和信号肽序列。 ➢ 信 号 肽 ( Signal peptide ) , 也 叫 引 导 肽 ( leader
peptide),是决定多肽最终去向的一段序列,通常较短, 典型情况下位于N端。在细菌中的一个例子就是多肽要插 入细胞质膜必须借助信号肽序列。 2.糖基化 曾经一度认为糖基化只存在于真核细胞中,但研究表明, 原核生物中也存在蛋白质的糖基化修饰,而且由于在糖 基的单糖结构和组成上的不同而显得比真核生物中的更 加丰富多样。
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包含信号肽的胰岛素前体称 为 前 胰 岛 素 原 ( preproinsulin)。
去掉信号肽的胰岛素的前体 称为胰岛素原(proinsulin)。
进一步切除称为C链的肽段后 才能形成活性形式的胰岛素 (insulin)
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➢ 蜂毒素能溶解动物细胞,也能溶解蜜蜂自身 的细胞,在细胞内合成没有活性的前毒素, 分泌进入刺吸器后,N端的22个氨基酸残基被 蛋白酶水解生成毒素。
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第二节 真核生物的翻译后加工
➢ 许多真核生物的新生肽都要经过翻译后加工或修饰,这种加工 修饰可以发生在延伸着的肽链中和翻译后。
➢ 一般情况下,翻译后修饰一是为了功能上的需要,另一种情况 是折叠成天然构象的需要。
1.切除加工 2.糖基化 3.羟基化 4.磷酸化 5.脂酰化 6.甲基化 7.乙酰化 8.泛素化 9.二硫键形成
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蛋白质内含子 90年代初,发现了两类新的内含子。 一类是蛋白质内含子,其DNA序列与外显子一起转录和 翻译,产生一条多肽链,然后从肽链中切除与内含子对 应的氨基酸序列,再把与外显子对应的氨基酸序列连接 起来,成为有功能的蛋白质。 另一类是翻译内含子,mRNA中存在与内含子对应的核苷 酸序列,在翻译过程中这一序列被“跳跃”过去,因此 产生的多肽链不含有内含子对应的氨基酸序列。
➢ 蛋白质翻译后修饰几乎参与了细胞所有的正常生命活动过程, 并发挥十分重要的调控作用,目前已经成为国际上蛋白质研 究的一个极其重要的领域。
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第三章 蛋白质翻译后修饰
第一节 原核生物的翻译后修饰 第二节 真核生物的翻译后修饰
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第一节 原核生物的翻译后加工
一些新生肽链从核糖体上释放下来后可以直接折叠成 最终的三维结构。但多数情况下是新生肽要经过一系列的 加工修饰,才具有功能。
➢现代生物医学进展 2008 Vol.8 1729
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➢ 很长时间里,蛋白质翻译后修饰并未引起足够重视,直到 2004 年泛素介导蛋白质降解的发现获得诺贝尔奖之后,这一 情形才有明显改观。迄今,人们已发现多达200 多种的蛋白 质修饰。蛋白质翻译后修饰是调节蛋白质生物学功能的关键 步骤之一,是蛋白质动态反应和相互作用的一个重要分子基 础,同时,它也是细胞信号网络调控的重要靶点。
.1.切除加工源自➢ 典型的情况包括切除N-端甲硫氨酸、信号肽序列 和切除部分肽段将无活性的前体转变成活性形式。
➢ 一些酶的前体(称为前体酶proenzyme,或酶原 zymegen)或无活性的多肽前体(称为前体蛋白, proprotein)只有切除特定的肽段后才能从无活 性形式转变成活性形式。下图是胰岛素的翻译后 加工。
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2.糖基化
➢ 真核生物中糖基化修饰很普遍。 ➢ 通常情况下,分泌蛋白的寡糖链较复杂,而内质网膜蛋白含有
较高的甘露糖。 下图是细胞中涉及糖基化的蛋白
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3.羟基化
在结缔组织的胶原蛋白和弹性蛋白中pro和lys是经过羟基化的。 此外,在乙酰胆碱酯酶(降解神经递质乙酰胆碱)和补体系统(参 与免疫反应的一系列血清蛋白)都发现有4-羟辅氨酸。 位 于 粗 糙 内 质 网 ( RER ) 上 的 三 种 氧 化 酶 ( 脯 氨 酰 -4- 羟 化 酶 , prolyl-4-hydroxylase , 脯 氨 酰 -3- 羟 化 酶 和 赖 氨 酰 羟 化 酶 , lysylhydroxylase)负责特定pro和lys残基的羟化。 脯氨酰-4-羟化酶只羟化-Gly-x-pro-,脯氨酰-3-羟化酶羟化Glypro-4-Hyp(Hyp: hydroxyproline),赖氨酸羟化酶只作用于Gly-X-lys-。 胶原蛋白的脯氨酸残基和赖氨酸残基羟化需要Vc,饮食中Vc不足时 就易患坏血症(血管脆弱,伤口难愈),原因就是胶原纤维的结构 不力(weak collagen fiber structure)。
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6.类泛素化 ➢ 2008 年之前在原核生物中只发现了蛋白酶体,却从未发
现泛素或类泛素的蛋白质的修饰,因此一度认为蛋白酶 体对原核生物蛋白质的降解完全依赖于蛋白质自身的组 成和结构。 ➢ 2008年,Pearce等在结核分枝杆菌中发现了与泛素功能相 似 的 蛋 白 质 , 命 名 为 原 核 类 泛 素 蛋 白 (prokaryotic ubiquitin-like protein,Pup)。Pup可以在辅助因子的 作用下标记多种功能蛋白,并介导被标记蛋白质通过蛋白 酶体降解。Pup-蛋白酶体通路的发现揭示了原核生物中 一个崭新的蛋白质降解机制。
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