基因克隆实验手册
基因克隆鉴定实验报告
一、实验目的本研究旨在克隆、鉴定某一生物X基因，并对其功能进行初步分析。
通过实验，了解基因克隆鉴定的基本原理和方法，为后续研究奠定基础。
二、实验材料1. 生物X样本：新鲜组织或细胞2. 总RNA提取试剂3. 反转录试剂盒4. PCR引物5. DNA分子量标准6. DNA回收试剂盒7. 载体DNA8. 连接酶9. 转化试剂10. 抗生素筛选培养基11. PCR仪、电泳仪、凝胶成像系统等三、实验方法1. 提取生物X样本的总RNA（1）将生物X样本进行研磨，加入适量裂解液，充分裂解细胞。
（2）加入适量RNA酶抑制剂，防止RNA降解。
（3）按照试剂盒说明书进行总RNA提取。
2. 反转录（1）按照反转录试剂盒说明书进行操作，将总RNA反转录为cDNA。
（2）设置反应体系：cDNA模板2μl，Oligo(dT)18引物1μl，5×反转录缓冲液4μl，dNTPs 2μl，M-MLV逆转录酶1μl，加ddH2O至20μl。
（3）反应条件：37℃ 60min，85℃ 5min。
3. PCR扩增（1）根据生物X基因的保守序列设计引物，并进行PCR扩增。
（2）设置反应体系：cDNA模板2μl，上下游引物各1μl，10×PCR缓冲液5μl，dNTPs 2μl，Taq酶1μl，加ddH2O至25μl。
（3）反应条件：95℃预变性5min，95℃变性30s，60℃退火30s，72℃延伸30s，共35个循环。
4. DNA回收与连接（1）将PCR产物进行电泳检测，切取目的片段。
（2）按照DNA回收试剂盒说明书进行回收。
（3）将回收的DNA片段与载体DNA进行连接。
（4）连接体系：连接酶1μl，连接缓冲液2μl，载体DNA 1μl，DNA片段2μl，加ddH2O至20μl。
（5）16℃连接过夜。
5. 转化与筛选（1）将连接产物转化大肠杆菌DH5α感受态细胞。
（2）涂布于含抗生素的琼脂平板，37℃培养过夜。
（3）挑取单克隆菌落进行PCR鉴定。
基因克隆具体实验报告
一、实验目的1. 学习基因克隆的基本原理和方法。
2. 掌握PCR扩增、酶切、连接等基因克隆实验技术。
3. 验证目的基因的克隆是否成功。
二、实验原理基因克隆是指将目的基因片段从基因组中分离出来，并插入到载体中，使其在宿主细胞中复制、表达的过程。
实验过程中，主要涉及PCR扩增、酶切、连接、转化、筛选等步骤。
三、实验材料1. 模板DNA：含有目的基因的基因组DNA。
2. 引物：根据目的基因序列设计的上下游引物。
3. Taq DNA聚合酶：用于PCR扩增。
4. 酶切体系：限制性内切酶、缓冲液、连接酶等。
5. 连接载体：线性化载体。
6. 转化宿主菌：大肠杆菌DH5α。
7. 筛选培养基：含抗生素的LB培养基。
8. PCR扩增试剂：10×PCR缓冲液、dNTPs、MgCl2等。
四、实验方法1. PCR扩增（1）设计引物：根据目的基因序列设计上下游引物，长度约为20-30bp，分别位于目的基因的上下游。
（2）PCR反应体系：取模板DNA 1μl，上下游引物各1μl，10×PCR缓冲液5μl，dNTPs 4μl，MgCl2 2μl，Taq DNA聚合酶0.5μl，加ddH2O至50μl。
（3）PCR反应程序：95℃预变性5min，95℃变性30s，55℃退火30s，72℃延伸1min，共35个循环，最后延伸10min。
2. 酶切连接（1）酶切：取PCR产物5μl，加限制性内切酶（如EcoRI）1μl，10×酶切缓冲液2μl，ddH2O 2μl，混匀后置于37℃水浴酶切2h。
（2）连接：取线性化载体5μl，酶切产物5μl，10×连接缓冲液2μl，T4 DNA 连接酶1μl，混匀后置于16℃连接过夜。
3. 转化（1）制备感受态细胞：将大肠杆菌DH5α在LB培养基中培养至对数生长期，按照1:100的比例加入CaCl2，混匀后冰浴30min。
（2）热激转化：将连接产物加入感受态细胞中，混匀后置于42℃水浴45s，迅速转移至冰浴中。
基因工程实验手册
总论基因是遗传的基本单位，所以基因工程有时称遗传工程(genetic engineering),有时还称为基因克隆(gene cloning)、分子克隆(molecular cloning)。
基因工程的基本技术是DNA 重组技术(recombinant DNA technigue)，其定义是在分子水平上，用人工方法提取(或合成)不同生物的遗传物质，在体外切割、拼接和重新组合，然后将体外重组的DNA分子引入受体细胞，使外源DNA在受体细胞中进行复制与表达。
按人们的需要生产不同的产物或定向地创造生物的新性状，并使之稳定地遗传给后代。
了解这个概念要注意两个问题，第一就是必须有体外DNA的切割、连接、重组过程。
第二，DNA重组必须是有目的的，按事先设计的过程进行，随意的切割、连接、重组过程不是基因工程。
一、DNA体外重组的主要步骤DNA体外重组可分五个步骤。
(一)目的基因和载体基因的制备制备带有目的基因的DNA片段和载体基因。
1．带有目的基因的DNA片段的获得带有目的基因的DNA片段的获得，主要有两个途径：一是从已有的生物基因组中分离；二是用酶学或化学的方法合成。
从生物基因组中分离DNA片段主要是提取基因组DNA，对其进行酶切，获得特定的酶切片段。
酶学合成目的基因DNA片段通常是以mRNA为模板，用反转录酶合成其cDNA作为克隆的片段。
化学合成是对目的基因DNA片段在体外进行设计，并用化学方法进行合成，较大的基因一般分多段进行合成，并在体外连接成目的基因的片段。
目前，用聚合酶链反应(PCR)对目的基因进行扩增或对目的基因转录产物RNA进行RT-PCR扩增，也是获得带有目的基因DNA片段的最常用方法之一。
2．载体的选择DNA体外重组所用的载体是可以克隆DNA片段的DNA分子。
目前常用的载体类型有质粒、噬菌体和动物病毒等。
其中以质粒载体最常用。
质粒(plasmid)是某些细菌中独立于染色体外的DNA，它有自主复制的能力，在细菌分裂时可伴随染色体分配到子细胞。
整个基因克隆实验流程(完整)
一、组织总RNA的提取相关试剂：T rizol；氯仿；苯酚；异丙醇；75%乙醇；RNase-free水相关仪器：制冰机；液氮&研钵/生物样品研磨仪；高速离心机；移液器（1ml、200μl、100μl/50μl）；涡旋振荡仪；恒温金属浴。
相关耗材：解剖工具，冰盒，离心管，离心管架，吸头（1ml，200μl/300μl），一次性手套，实验手套。
实验步骤1.取暂养草鱼，冰上放置一段时间，然后解剖，剪取肠道50~100mg，放入研钵中，加入液氮迅速研磨，然后加入1ml 预冷TRIzol试剂，充分研磨至无颗粒物存在。
2.转移到离心管中，室温放置5min，使细胞充分裂解；3.按1ml Trizol加入200μl氯仿，盖上盖子，迅速充分摇匀15s，然后室温放置3min；4.4℃，,12000g 离心15min；此时混合物分为三层，下层红色的苯酚氯仿层，中间层和上层无色水相；RNA存在于无色水相中；5.小心吸取上清液，千万不要吸取中间界面，否则有DNA污染；转移至一个新的离心管，加入等体积的异丙醇，轻轻混匀；6.室温放置10min；4℃，,12000g 离心10min；7.弃上清，加入1ml 75%乙醇洗涤；涡旋，悬浮沉淀；4℃，,12000g 离心5min；8.弃上清；可以再次用75%乙醇洗涤沉淀；9.弃上清；用移液器轻轻吸取管壁或管底的残余乙醇，注意不要吸取沉淀；室温放置5min晾干沉淀；（RNA样品不要过于干燥，否则极难溶解）10.沉淀中加入30μl RNase-free水，轻弹管壁，使RNA溶解。
RNA质量检测相关试剂：溴酚蓝， TEB/TAE电泳缓冲液，溴乙锭（EB）相关仪器：（超微量分光光度计，移液器（2.5μl 或2μl 规格，10μl规格），电子天平，电泳仪，电泳槽，凝胶成像仪，微波炉，制冰机）相关耗材：（无菌无绒纸，吸头，离心管架，PCR管，PCR管架，锥形瓶，烧杯，一次性手套，实验手套，冰盒）（1）RNA纯度的检测：测定其OD260和OD280的值，根据其OD260/ OD280的比值，当其比值在1.9~2.1之间，说明提取的总RNA纯度比较高，没有蛋白质和基因组的污染。
基因克隆(包括DNA提取技术步骤)
基因克隆DNA克隆是指在体外将目的基因或DNA片段同能够自我复制的载体DNA 连接，然后将其转入宿主细胞或受体生物进行表达或进一步研究的分子操作的过程，又称为重组DNA技术。
DNA克隆涉及一系列的分子生物学技术，如目的DNA片段的获得、载体的选择、各种工具酶的选用、体外重组、导入宿主细胞技术和重组子筛选技术等。
一 DNA的提取二目的DNA片段的获得（酶切）三体外重组1 LB培养基的配制2大肠杆菌感受态细胞的制备3载体的选择四导入受体细胞五重组子的筛选1插入失活法实验一DNA提取取0.5克以下的鱼类组织或20ul血液：1 准备1.5ml离心管，加入500ul裂解液，取组织放入离心管，破碎。
（常温操作）2 恒温箱裂解，55℃。
30min。
3 加等体积Tris饱和酚(酚：氯仿：异戊醇25：24：1)，先颠倒混匀后静置抽提10分钟，离心4度12000g 10分钟。
（注意酚在油层下面）4 取上清（把枪头去掉部分，注意液面。
蛋白质凝胶停留在水相及氯仿相中间，而DNA位于上层水相中），加入等体积CI(氯仿：异戊醇24：1)，先颠倒混匀后静置抽提10分钟，离心4度12000g 10分钟。
5 汇集上清，加2倍无水乙醇(-30度保存)，颠倒混匀可观察到絮状DNA。
在-30度冰箱沉淀30min。
离心4度12000g 10分钟。
6 弃去上清，75%乙醇洗涤，7500g离心5分钟。
7 重复一次上述操作。
7 在无菌台干燥半小时，乙醇挥发。
8 溶解于200ulddwater。
9 定量DNA。
裂解液的配制1ml体系200ul 0.5M EDTA（PH=8.0高压灭菌。
作用抑制酶的活性。
）螯合DNA酶发挥作用需要的金属离子。
50ul 10%SDS（蛋白质变性剂）10ul 1MTris-cl（PH=8.0高压灭菌）缓冲溶液5ul PK（消化）735ul 灭菌超纯水EDTA（0.5 M，pH8.0）将186.1 g 二水乙二胺四乙酸二钠（EDTA-Na.2H2O）加入800ml水中，在磁力搅拌器上剧烈搅拌。
基因克隆实验报告
基因克隆实验报告摘要：本实验旨在通过基因克隆技术，将特定基因从一个细胞中复制并插入到另一个细胞中，以实现基因的传递和表达。
实验采用了大肠杆菌作为模型生物，利用质粒载体和限制酶切技术完成了基因的克隆和转移。
通过本实验的操作，成功地将目标基因从一个细胞复制并转移到另一个细胞中，验证了基因克隆技术的有效性。
一、实验材料和方法1. 实验材料：- 大肠杆菌菌种- 目标基因DNA样本- 质粒载体- 限制酶- DNA连接酶- 抗生素培养基2. 实验步骤：步骤一：菌液制备1. 取一支滤漏筒，加入适量的LB培养基，用移液管取一小部分大肠杆菌菌种，接种于LB培养基中，静置在37℃恒温摇床中培养过夜。
步骤二：DNA提取1. 取LB培养基中的大肠杆菌菌液，用离心机进行离心分离，将上清液去除，留取沉淀。
步骤三：DNA酶切1. 取目标基因DNA样本和质粒载体，分别加入限制酶，按照限制酶切反应的条件进行反应。
步骤四：DNA连接1. 取等体积的酶切后的目标基因DNA和质粒载体，加入DNA连接酶，按照连接酶反应条件进行反应。
步骤五：转化1. 将连接后的DNA溶液加入已经制备好的培养基中，用恒温摇床静置培养。
步骤六：筛选1. 取一块含有抗生素的琼脂平板，将转化后的菌液均匀涂布在平板上，放入恒温箱培养。
步骤七：分离1. 从琼脂平板上挑选抗生素抵抗的单个菌落，进行培养。
二、实验结果与分析通过本实验的操作，成功地将目标基因从一个细胞复制并转移到另一个细胞中。
在转化后的琼脂平板上，观察到一些菌落的形成，这些菌落对抗生素具有抗性。
说明转化后的细胞成功地表达了目标基因，并能产生相应的蛋白质。
三、讨论与总结基因克隆技术是现代生物学研究中常用的实验手段之一。
通过限制酶切和DNA连接，可以实现基因的克隆和转移。
本实验结果表明，大肠杆菌是一个有效的模型生物，可用于基因克隆实验。
通过对转化菌落的筛选和培养，可以得到具有抗生素抵抗能力的菌落，进一步验证了实验结果的有效性。
分子生物学实验技术-2-基因的克隆
分子生物学实验技术二、基因的克隆（一）DNA片断与载体的连接本实验做PCR回收产物与pMD-18T载体的连接，应用TaKaRa公司的试剂盒进行。
TA克隆原理：利用Taq酶能够在PCR产物的3’末端加上一个非模板依赖的A，而T载体是一种带有3’T突出端的载体，在连接酶作用下，可以快速地、一步到位地把PCR产物直接插入到质粒载体的多克隆位点（MCS）中，主要用于PCR产物的克隆和测序。
实验安排：每人做一管。
反应体系（10μl）：Ligation Solution I 5 μLPCR回收产物 4.5 μLpMD-18T vector 0.5 μL总体积10 μL反应条件：16℃ 4 h以上（二）感受态细胞的制备实验安排：每人做一管。
试剂配制：1、LB液体培养基（Luria-Bertani）：称取蛋白胨（Tryptone）10 g，酵母提取物（Yeast extract）5 g，NaCl 10 g，溶于800mL去离子水中，用NaOH调pH至7.5, 加去离子水至总体积1 L，高压下蒸气灭菌20 min。
2、0.1 mol/L CaCl2溶液：称取1.11 g CaCl2（无水，分析纯），溶于超纯水中，定容至100 mL，高压灭菌或0.22 μm滤膜过滤除菌。
3、无菌甘油：取甘油100 mL，高压灭菌即可。
操作步骤（无菌操作）：1、从生长有大肠杆菌DH5α的平板上挑取一个单菌落，接种于2 mL LB液体培养基中，37℃200 r/min振荡培养过夜，作为一级种子。
2、将一级种子按1:50比例无菌转接到5 mL LB液体培养基中，37℃200 r/min振荡培养约2-3 h，至细菌的OD600达到0.5左右。
3、在无菌条件下将细菌转移到一个无菌的1.5mL Ep管中，冰浴30 min。
4、4℃4000 r/min离心10 min，弃上清。
5、加入1 mL冰预冷的0.1 mol/L CaCl2重悬沉淀，继续冰浴15-30 min。
基因克隆基本实验方法
重组质粒的连接、转化及筛选第一节概述质粒具有稳定可靠和操作简便的优点。
如果要克隆较小的DNA片段(＜10kb)且结构简单,质粒要比其它任何载体都要好。
在质粒载体上进行克隆,从原理上说是很简单的，先用限制性内切酶切割质粒DNA和目的DNA片段, 然后体外使两者相连接, 再用所得到重组质粒转化细菌,即可完成。
但在实际工作中, 如何区分插入有外源DNA的重组质粒和无插入而自身环化的载体分子是较为困难的。
通过调整连接反应中外源DNA片段和载体DNA的浓度比例,可以将载体的自身环化限制在一定程度之下,也可以进一步采取一些特殊的克隆策略,如载体去磷酸化等来最大限度的降低载体的自身环化,还可以利用遗传学手段如α互补现象等来鉴别重组子和非重组子。
外源DNA片段和质粒载体的连接反应策略有以下几种：1、带有非互补突出端的片段用两种不同的限制性内切酶进行消化可以产生带有非互补的粘性末端,这也是最容易克隆的DNA片段，一般情况下,常用质粒载体均带有多个不同限制酶的识别序列组成的多克隆位点，因而几乎总能找到与外源DNA片段末端匹配的限制酶切位点的载体，从而将外源片段定向地克隆到载体上。
也可在PCR扩增时，在DNA片段两端人为加上不同酶切位点以便与载体相连。
2、带有相同的粘性末端用相同的酶或同尾酶处理可得到这样的末端。
由于质粒载体也必须用同一种酶消化，亦得到同样的两个相同粘性末端，因此在连接反应中外源片段和质粒载体DNA均可能发生自身环化或几个分子串连形成寡聚物, 而且正反两种连接方向都可能有。
所以，必须仔细调整连接反应中两种DNA的浓度, 以便使正确的连接产物的数量达到最高水平。
还可将载体DNA的5'磷酸基团用碱性磷酸酯酶去掉, 最大限度地抑制质粒DNA的自身环化。
带5'端磷酸的外源DNA片段可以有效地与去磷酸化的载体相连, 产生一个带有两个缺口的开环分子,在转入E. coli受体菌后的扩增过程中缺口可自动修复。
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插入片段 线性化载体
推荐使用的试剂盒
产品信息
DNA Ligation Kit <Mighty Mix> P4
Blunting Kination Ligation (BKL) Kit
P6
TaKaRa DNA Ligation Kit LONG P4
Mighty TA-cloning Kit
P6
Mighty TA-cloning Reagent Set for PrimeSTAR®
↓ ③42℃反应45秒后，在冰中放置1～2分钟
↓ ④加入已预先37℃保温的SOC培养基，使终体积为1 ml。
↓ ⑤37℃振荡培养1小时（160～225 rpm）
↓ ⑥取适量涂布于LB选择培养基、37℃过夜静置培养
5. PCR扩增确认插入片段DNA 6. 培养、纯化质粒
PCR扩增确认插入片段DNA请参考第5页
TCGA 5’ Hin d Ⅲ
线性化载体 ※
C TAG A G C T
※ 利用限制性内切酶酶将环状载体DNA切断后，切胶 回收、或必要时进行去磷酸化反应
转化
·感受态细胞
形成菌落
进行菌落PCR 确认插入片段
·EmeraldAmp® MAX PCR Master Mix等
·电泳相关制品
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基因克隆实验手册
※ PCR扩增产物是平滑末端时进行dA加尾反应。
【目的DNA片段】 带有限制性内切酶的
酶切末端
In-Fusion克隆
5×In-Fusion® HD In-Fusion酶使 Enzyme Premix 末端15个相同
碱基无缝融合
TA克隆
3’ A
A 3’
T载体
T T
限制性内切酶/连接
Bam H Ⅰ
5’ GATC
纯化切胶回收的DNA（切胶回收DNA的操作方法请参考第10页）
↓ ⑥回收液作为插入DNA片段溶液［A］。
(b) PCR反应扩增DNA片段
利用与载体连接的限制性内切酶酶切位点的5’端附加 的引物进行 插入DNA片段的PCR扩增。 ※ 限制性内切酶酶切位点＋5’端3个以上碱基
Tks Gflex® DNA Polymerase使用例 ①PCR
将目的DNA片段插入到目的载体质粒的基因克隆操作是基因工程实验的基本操作方法。 这里对使用限制性内切酶和T4 DNA连接酶（DNA Ligation Kit）的基因克隆操作进行说明。
操作方法概要
1. 准备插入DNA片段（制备目的DNA片段） (a) 使用限制性内切酶切割DNA片段
首先确认目的DNA片段的限制性内切酶的酶切位点，然后根据载体 质粒的克隆位点选择限制性内切酶。
利用市面上销售的3’末端附加有 dT的载体。
In-Fusion克隆
利用在引物末端附加与载体末端相同的15个碱基 序列进行目的基因的扩增。
可使用任意载体。仅需限制性内切 酶处理或PCR扩增使载体线性化。
■ 根据使用目的推荐的克隆用试剂盒
实验目的
想进行连接反应
Bam H Ⅰ
Hin d Ⅲ 插入片段
线性化 载体
【Q2】长链DNA克隆时的注意点有哪些？
【A2】 DNA链越长，连接效率越低。 TaKaRa DNA Ligation Kit LONG（Code No. 6024）最适用 于长链DNA片段的连接，对10 kb以上的长片段DNA的连接特 别有效。 另外，连接有插入DNA片段的较大质粒（特别是10 kb以上的 质粒）使用大肠杆菌转化时，转化效率低且 质粒在大肠杆菌内的稳定性低，产生有缺失克隆的可能性高。 建议使用 E. coli HST08 Premium Competent Cells（Code No. 9128）可提高大片段DNA的转化效率。
2 × Gflex PCR Buffer (Mg2+, dNTP plus)
25 μl
Forward Primer
0.2～0.3 μM (final conc.)
Reverse Primer
0.2～0.3 μM (final conc.)
模板DNA
< 500 ng
Tks Gflex DNA Polymerase
使用Takara Cut-Site Navigator（ 下一页）非常方便。
例：使用限制性内切酶 Hind Ⅲ和 BamHⅠ进行双酶切
①配制反应液
底物DNA Hin d Ⅲ Bam H Ⅰ 10 × K Buffer 灭菌水
(≤1 μg) 1 μl 1 μl 2 μl
up to 20 μl (轻弹混合)
载体制备
需要在DNA片段的两端形成限制性内切酶识位点。 利用不同的限制性内切使用3’端附加“dA”的PCR酶进行PCR反应、或 需要在平滑末端的扩增产物中进行 “dA”加尾反 应 。不能决定插入片段的插入方向。
根据DNA片段的两末端进行相应的 限制性内切酶处理。酶切后必要时 进行纯化及去磷酸化处理。
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基因克隆实验手册
3. 插入DNA片段与线性化质粒的连接 使用DNA Ligation Kit〈Mighty Mix〉时
插入DNA片段溶液 [ A ] 质粒DNA溶液 [ B ] Ligation Mix 灭菌水
25～250 fmol 50 ng (25 fmol)
7.5 μl up to 15 μl
基因克隆操作的基本流程
total RNA mRNA
基因组DNA等
反转录反应 c理、DNA修饰
（附加接头、末端平滑化、定向等）
琼脂糖凝胶电泳确认
【目的DNA片段】 使用In-Fusion引物获得的
PCR扩增产物
【目的DNA片段】 扩增产物末端附加
有“dA”※
10,000 U 10,000 U
↓ ②37℃反应1小时
↓ ③取一半反应液（10 μl左右）加入Loading Buffer后进行琼脂糖凝胶
电泳，确认酶切反应。
↓ ④切胶回收目的DNA片段。 为避免DNA的损伤，减少UV照射时间。
↓ ⑤使用TaKaRa MiniBEST Agarose Gel DNA Extraction Kit Ver.4.0
快速·高效率地连接
平滑末端的连接
大片段插入片段（＞10 kb） 的连接
想进行TA克隆
3’A 插入片段
A 3’
T T
T载体
插入片段的3’端附加有“dA” 碱基
插入片段为平滑末端需要附加 dA碱基
想快速、高效地进行基因克隆 想一次克隆多个DNA片段 想进行定性克隆 想在没有酶切位点的位置插入DNA片段 因为是表达载体，不想附加多余碱基序列
纯化回收（参考第10页）。
↓ ⑥回收液作为插入DNA片段溶液［A］。
2. 准备载体质粒
①使用限制性内切酶在目的载体质粒（环状）的克隆位点进行酶切反应 【载体的线性化】
载体质粒DNA Hin d Ⅲ Bam H Ⅰ 10 × K Buffer 灭菌水
(≤1 μg) 1 μl 1 μl 2 μl
up to 20 μl(轻弹混合)
! 常见问题
【Q1】难以连接，转化效率低时的注意点有哪些？
【A1】
·请延长连接反应时间。 ·DNA溶液的盐浓度偏高会导致连接效率下降。
特别是乙醇沉淀时使用的醋酸铵对连接反应有抑制作用，乙醇 沉淀时要充分清洗，进行除盐处理。 ·使用DNA提取试剂盒时，对提取液进行乙醇沉淀后交换缓冲 液可提高连接效率。 ·进行突出末端的连接时，将DNA溶液（载体+插入片段DNA） 在60～65℃加热2～3分钟后冰中急冷，再加入Ligation Kit中 的各试剂进行连接反应。确保突出末端的连接可提高转化效率 。 以上操作不能改善连接效率时建议进重新纯化DNA。
↓ ②37℃反应1小时
↓ ③使用TaKaRa MiniBEST DNA Fragment Purification Kit Ver.4.0等
纯化反应液（参考第10页）。
↓ ④回收液作为质粒DNA溶液［B］。
使用一种限制性内切酶制备插入DNA片段和载体质粒的 线性化时，为避免载体的自连应进行下面的载体的去磷 酸化处理。
↓ 氯仿/异戊醇（24：1）提取（1次）
↓ 乙醇沉淀
↓ 溶解于TE Buffer（20 μl以下），作为质粒DNA溶液［B］。
5'-端突出末端的去磷酸化处理使用CIAP（Calf Intestinal Alkaline Phosphatase）即可，平滑末端及3’-端突出末端的去磷酸化处理 建议使用BAP（Bacterial Alkaline Phosphatase）。
去磷酸化处理（防止自连）
限制性内切酶处理后的载体
1～20 pmol
Alkaline Phosphatase (BAP)
0.3～0.6 U
10 × Alkaline Phosphatase Buffer
5 μl
灭菌水
up to 50 μl (轻弹混合)
↓ 37～65℃反应30分钟
↓ 苯酚/氯仿/异戊醇（25：24：1）提取（2次）
↓
③利用限制性内切酶酶切反应对PCR扩增产物的两端进行酶切处理 （必要时可增加反应体积）
上述纯化后的PCR产物 Hin d Ⅲ Bam H Ⅰ 10 × K Buffer 灭菌水
≤2 μl 1 μl 1 μl 2 μl
up to 20 μl(轻弹混合)
↓ ④37℃反应1小时
↓ ⑤使用TaKaRa MiniBEST Agarose Gel DNA Extraction Kit Ver.4.0等
1.25 U
灭菌水
up to 50 μl (轻弹混合)
94℃ 1 min. ↓ 98℃ 10 sec. 60℃ 15 sec. 68℃ 30 sec./kb