灰度分析Gel-pro使用步骤

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IGOR Pro 6.2使用方法详细介绍-睿驰整理

IGOR Pro 6.2使用方法详细介绍-睿驰整理

1IGOR Pro - OverviewIGOR Pro is an interactive software environment for experimentation with scientific and engineering data and for the production of publication-quality graphs and page layouts. IGOR has been used by tens of thousands of technical professionals since its introduction in 1989. Here are a few highlights.IGOR Pro是为科学人员和数据工程师提供交互式软件实验环境,以及制作符合出版要求质量的图形和页面布局。

从1989年IGOR开发以来,已经有数万名专业科技人员使用。

IGOR Pro produces journal-quality scientific graphs and exports high-resolution graphics formats such as Encapsulated PostScript (EPS) and PDF.IGOR Pro可以生成符合学术期刊要求的高质量科学图像和高分辨率的图像格式,类似有EPS格式跟PDF格式。

IGOR Pro handles large data sets very quickly.IGOR Pro可以快速处理大数据集。

IGOR Pro includes a wide range of capabilities for scientific and engineering analysis and graphing.IGOR Pro可以为科研、工程分析和绘图需求提供大范围能处理能力。

IGOR Pro has special support for time-series or other evenly-spaced data.IGOR Pro特别支持符合时间序列数据以及平均分割数据。

JY04S-3C调试使用指南

JY04S-3C调试使用指南

JY04S-3C使用指南北京君意东方电泳设备有限公司一、连接计算机显示器和主机For personal use only in study and research; not for commercial use计算机必须有USB2.0接口,将分析软件加密器、数字CCD的USB线、控制线插在计算机后面接口上。

并将计算机显示器的分辨率设置为1024×768。

二、安装分析软件及CCD驱动程序安装分析软件1、For personal use only in study and research; not for commercial use2、3、将光盘放入光驱中,点击安装程序,根据提示操作,不需更改任何设置,直接点击“NEXT”即可完成安装。

4、点击光盘中的“汉化”,根据提示操作,不需更改任何设置,直接点击“NEXT”即可完成安装。

三、安装CCD驱动程序1、用USB连接线,将摄像机组与计算机连接,此时,计算机会显示“发现新硬件”。

2、选择“仅这一次”点击“下一步”。

3、选择“从列表或指定位置安装”点击“下一步”。

4、选择“在搜索中包括这个位置”,点击“浏览”,在光盘中选择“君意东方摄像头驱动程序”中的“driver”点击“确定”;点击“下一步”。

此时计算机开始安装。

最后点击“完成”。

5、安装拍摄软件,打开光盘中的“君意东方”点击直接安装,点击“下一步”这样拍摄软件安装完毕。

四、实时预览及“凝胶”照片的采集操作实时预览1、接通紫外暗箱电源,将凝胶放置在照胶台上的透紫玻璃上,如果是聚丙烯酰胺凝胶,需在照胶台上加放白光板。

打开“312”紫外光源。

2、打开“GEL-PRO”分析软件,点击顶部工具栏中的“”进入实时预览软件界面。

5、点击“预览”,此时出现一个览窗口。

如图1所示,图16、根据凝胶图像的大小及明暗度调整的摄像机罩上的焦距、光圈、聚焦按扭,此时观察计算机显示器。

将凝胶图像调至所需的大小。

图2光圈调节(Aperture):可以改变拍摄图像的明暗度,如按“+”键可使图像变亮;按“-”键可使图像变暗。

Gel pro中文说明书

Gel pro中文说明书

第一部分 软件介绍及本使用手册的一些定义欢迎使用Gel-Pro凝胶分析软件,这是一个功能强大,且非常容易学习操作的专业级科学软件,作为科学图像分析系统,该系统的先进与品质在全球数以万计的实验室得到了认可。

使用本软件,可以做以下一些工作:●可以精确的处理一些实验-DNA、RNA以及蛋白质电泳凝胶-Southern、Northern 和western Blots-Dot和 Slot Blots-微孔板-菌落计数-膜杂交●把实验结果发表●打印图像、分析结果以及注解●把图像或结果存储起来在使用本软件之前,有一些必要的计算机知识需要掌握:●会激活应用程序●会使用鼠标●会使用下拉式菜单●会选择及编辑文本●会保存和打印工作如果对Microsoft Windows的操作比较生疏,建议先熟练Microsoft windows的基本操作。

定义:●双击连续快速双击鼠标左键●单击单击鼠标左键●选中单击一个目标后,此目标反显●选择用鼠标单击一个目标后,按住鼠标左键不放,然后移动鼠标将全部目标覆盖●拖动用鼠标选择一个目标后,按住鼠标左键不放,然后移动鼠标到预定位置●组合键用手按住指定按键后,再单击鼠标左键●在本文中出现的此标记是下—步的意思第二部分 图像技术概述什么是图像处理?一幅图像就是一个物体或一组物体的视觉描述。

图像处理就是对一幅图像所含信息根据特定的用途进行处理。

数字图像处理是一种计算机操作的特殊的图像处理方式。

你可能比较熟悉照片图像,但是照片并不能用计算机进行分析,这是因为计算机是以数字方式而不是以图形方式工作的。

为了使用计算机处理一幅相片,图像必须转换成数字方式。

这个过程就是图像数字化。

图像数字化数字化过程把一幅图像划分成平行的格点或阵列,这些格点或阵列被称为图像元素或像素。

在计算机中图像就是以这些数字格点或位图描述的。

位图中的每一个像素由它在格点中的位置表示,如行(x)和列(Y)。

方便起见,通常把位图左上角位置点设为参考点(0,0)。

Igor Pro中文操作手册 - 1

Igor Pro中文操作手册 - 1
• 图片的展示与处理 • 结合了图形界面与命令行界面 • 集成于编程环境中的自动化与数据处理 • 使用 C 和 C++语言写入扩展模块 人们使用 Igor 简单的制作出高质量的,精确的科学图形。另有人们使用 Igor 作为分析的通用工具,并利用其内 置的编程环境。我们试着在整本手册中写下 Igor 使用者整体范围 的使用需求。
i8chapteri2iigorpro概览iigorpro概览9概观11术语11关于概观11概观1常用部分11启动igorpro11输入数据11绘制图形13润饰图片13附加一个注释15附加一个标签15使用偏好16制作一个页面布局pagelayout17保存你的工作18载入数据18添加到图像20补偿轨迹trace20取消补偿轨迹trace20在图形中绘制21生成一个重新编辑宏macro窗口22重新编辑图片23保存你的工作23使用igor文档23图形化编辑数据24生成一个categoryplot可选的25categoryplot选项可选的26控制窗口commandwindow27浏览waves28使用数据浏览器databrowser29合成数据29缩放与平移30制作多个坐标轴的图片30保存你的工作31使用游标32删除轨迹与坐标轴32创建一个堆叠坐标轴的图形32index9添加一个页面布局34保存你的工作34创建控件controls34创建一个关联规则dependency36保存你的工作36常用部分结束37概观2数据分析37启动igorpro37创建合成数据37对高斯分布进行快速曲线拟合38多曲线的高斯拟合38数据排序39对数据子范围进行拟合39在拟合完成后进行拟合推算40添加一个拟合41概观3直方图和曲线拟合41启动igorpro41创建合成数据42白噪音的直方图histogram42高斯噪音的直方图histogram43直方图数据的曲线拟合43曲线拟合残差可选的45编程可选47保存程序文件可选49载入编程文件可选50进一步探索50index10概观本章节我们通过典型的操作逐步介绍igor的主要功能

Gel pro中文说明书

Gel pro中文说明书

第一部分 软件介绍及本使用手册的一些定义欢迎使用Gel-Pro凝胶分析软件,这是一个功能强大,且非常容易学习操作的专业级科学软件,作为科学图像分析系统,该系统的先进与品质在全球数以万计的实验室得到了认可。

使用本软件,可以做以下一些工作:●可以精确的处理一些实验-DNA、RNA以及蛋白质电泳凝胶-Southern、Northern 和western Blots-Dot和 Slot Blots-微孔板-菌落计数-膜杂交●把实验结果发表●打印图像、分析结果以及注解●把图像或结果存储起来在使用本软件之前,有一些必要的计算机知识需要掌握:●会激活应用程序●会使用鼠标●会使用下拉式菜单●会选择及编辑文本●会保存和打印工作如果对Microsoft Windows的操作比较生疏,建议先熟练Microsoft windows的基本操作。

定义:●双击连续快速双击鼠标左键●单击单击鼠标左键●选中单击一个目标后,此目标反显●选择用鼠标单击一个目标后,按住鼠标左键不放,然后移动鼠标将全部目标覆盖●拖动用鼠标选择一个目标后,按住鼠标左键不放,然后移动鼠标到预定位置●组合键用手按住指定按键后,再单击鼠标左键●在本文中出现的此标记是下—步的意思第二部分 图像技术概述什么是图像处理?一幅图像就是一个物体或一组物体的视觉描述。

图像处理就是对一幅图像所含信息根据特定的用途进行处理。

数字图像处理是一种计算机操作的特殊的图像处理方式。

你可能比较熟悉照片图像,但是照片并不能用计算机进行分析,这是因为计算机是以数字方式而不是以图形方式工作的。

为了使用计算机处理一幅相片,图像必须转换成数字方式。

这个过程就是图像数字化。

图像数字化数字化过程把一幅图像划分成平行的格点或阵列,这些格点或阵列被称为图像元素或像素。

在计算机中图像就是以这些数字格点或位图描述的。

位图中的每一个像素由它在格点中的位置表示,如行(x)和列(Y)。

方便起见,通常把位图左上角位置点设为参考点(0,0)。

IGORPro6.2使用方法详细介绍-睿驰整理

IGORPro6.2使用方法详细介绍-睿驰整理

IGORPro6.2使⽤⽅法详细介绍-睿驰整理1IGOR Pro - OverviewIGOR Pro is an interactive software environment for experimentation with scientific and engineering data and for the production of publication-quality graphs and page layouts. IGOR has been used by tens of thousands of technical professionals since its introduction in 1989. Here are a few highlights.IGOR Pro是为科学⼈员和数据⼯程师提供交互式软件实验环境,以及制作符合出版要求质量的图形和页⾯布局。

从1989年IGOR开发以来,已经有数万名专业科技⼈员使⽤。

IGOR Pro produces journal-quality scientific graphs and exports high-resolution graphics formats such as Encapsulated PostScript (EPS) and PDF.IGOR Pro可以⽣成符合学术期刊要求的⾼质量科学图像和⾼分辨率的图像格式,类似有EPS格式跟PDF格式。

IGOR Pro handles large data sets very quickly.IGOR Pro可以快速处理⼤数据集。

IGOR Pro includes a wide range of capabilities for scientific and engineering analysis and graphing.IGOR Pro可以为科研、⼯程分析和绘图需求提供⼤范围能处理能⼒。

电泳图的数字化处理(亮度和大小)

电泳图的数字化处理(亮度和大小)

Gel-Pro analyzer的使用流程安装软件后打开,在对话框选择DNA analysis或者protein analysis等
OK
File open 打开一张电泳图
如下图打开工具栏
打开后为如下工具条
点击lanes OK 自带寻找泳道
泳道工具栏添加、移动、查找或者删除泳道等功能
点击OK后
点击bands OK 打开条带工具栏如下
条带工具栏添加、查找或者删除条带等功能去掉不需要的带,加上漏掉的带
OK之后,选择M.W.standard
选择或者新建marker(如DL2000)再点击Reset
再点击elect/Unsel…
选择marker泳道OK
再点击auto locate
结果如图
然后选择results 得到
打开或者新建并打开一个Excel
再在以下窗口
先选择
再File DDE to Excel
分别有分子大小(根据marker大小计算)、条带亮度相对值
对数据进行整理
根据亮度及分子大小就可以做柱状图啦分子量大小柱状图
亮度大小柱状图
至此,作图完毕
Gel-Pro analyzer还可以对蛋白胶上的蛋白点(带)进行分析,也还可以对基因芯片点的亮度进行分析,同时还可以对平板上的菌斑进行计数及对菌斑根据大小进行分类统计。

这些功能大致也差不多,在此不赘述。

image pro图像分析软件教程

image pro图像分析软件教程

分析测量图象软件Imagepro-Plus教程入门Image pro-plus(IPP)的主要用途是分析测量图像。

本人使用该程序进行生物图象分析有一段时间,写此帖的主要目的还是与大家交流使用心得,并总结一下使用方法。

如果你是刚接触IPP,最好先从本帖看起,并同时打开电脑上的IPP程序照着操作。

学会一个软件需要花一段时间的,两分钟不可能学会。

两小时也太短。

但我相信,照着我这几个帖子作下来,至少是可以用IPP干一点事情了。

既然是处理图片,当然是先要打开一张要处理的图片嘛这张照片中的黄色部分是免疫组化染色的阳性表达成分。

处理目标是通过测量图片中黄色部分的"黄"度来反映相应蛋白表达的“量”。

对图片进行观察,可以看到图片中主要有三种主要颜色,一是染成蓝色的细胞核,二是呈现出黄色的胞浆,三是细胞间的空隙区域,呈现出浅蓝色,是为背景。

所以首先要把图片中呈现黄色的区域给挑选出来,这部分区域是我们最感兴趣的地方,叫做AOI(area of interest)。

AOI是IPP中最有用最重要的概念。

如何能够准确地选取AOI就是使用IPP的关键操作。

一旦准确地选取了AOI,下面的测量分析就好办了。

对不同的图片,需灵活地使用各种适当的AOI工具,就这张图片来说,AOI是黄色区域,因此用颜色分类的AOI工具是最有效的。

点击measure---count/size,弹出分类测量窗口,在窗口中选中manual,再点击select color,弹出颜色选择窗口segmentation,这个工具是IPP最有特色的颜色选取工具之一。

用好这个工具是使用IPP的要点。

对于目标颜色鲜明的图片,用吸管工具是最简单的。

点一下吸管图标,在目标区域点一下,就可以选中该点的颜色,当然一下是不可能完全选中所需要指定的全部区域,可以在未选中的地方接着再点,这样多次选取,直到把想选中的区域全部选中为止。

在这张示例图中,选中的蓝色细胞核部分被标上了红色。

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