生物的界级分类(classification.
微生物的分类
型（Type）：亚种以下的细分。当同种或同亚
种不同菌株之间的性状差异，不足以分为新的亚 种时，可细分为不同的型。如血清型、噬菌型、 致病型、生物型、形态型等。
菌株（Strain）：从自然界中分离得到的任何
一种微生物的纯培养物。又叫品系。 菌株是微生物分类和研究工作中最基础的操作实体
培养物：一定时间一定空间内微生物的细胞群或生长物，如 微生物的斜面培养物、摇瓶培养物。
群（Group）：
指微生物的一个种在生长繁殖过程中，可 能变异形成另外的种及一些过渡类型的变 种，把这些亲缘关系比较近的菌种，统称 为群。如大肠菌群。
属（Genus）：
具有某些共同特征或密切相关的种归为一 个高一级的分类单元，称之属。以此类推 归为科、目、纲、门、界。
由于微生物分类单元的划分缺乏一个易于操作的统一
GC% 、核酸分子杂交、 rRNA序列相似 DNA遗传特征 性、微生物全基因组序列
（1） GC含量分析
DNA碱基对的序列、数量和比例是稳定的。 (G+C) mol% = （G+C）/（A+T+ G+C ）× 100% 分类学上，用G+C占全部碱基的克分子百分数来表 示各类生物的DNA碱基组成特征。
Staphylococcus aureus Rosenbach 1884
葡萄球菌属 金黄色 人名 时间
（3）三名法
有亚种或变种时，学名由“三名法”构成 学名=属名 + 种名加词 + subsp. 或 var. + 亚种或变种的加词 斜 体 正体（可省略） 斜体（不可省略）
Alcaligenes
属名
denitrificans
标准，为了减少因采用不同标准界定分类单元所造成 的混乱，微生物系统分类也采用“模式概念”
classify的名词形式
classify的名词形式首先我们需要理解“classify”这个单词的基本含义。
根据英语词典的解释，“classify”是一个动词，意为分类或归类。
而其名词形式则是“classification”，表示分类或分类系统。
本文将针对这个名词形式进行更详细的解释。
步骤1：分类的作用分类系统是我们日常生活中无处不在的。
比如，我们会把图书馆的书籍按照专业领域或书籍类型进行分类；商家也会把商品按照种类或价格进行分类；在科学领域，分类系统也是必不可少的，例如生物学家把动植物按照生理特征进行分类。
分类系统可以帮助人们更好地组织事物，方便了我们的学习、工作和生活。
步骤2：分类的种类如果我们深入研究“classification”这个名词形式，可以发现它还有许多子分类。
其中的一些例子包括：- Hierarchical classification（分层分类）：这种分类方式包括了多个不同等级的分类元素。
例如，在一个图书馆中进行分类，可以将书籍分为大分类和小分类两个层级，进一步细分至具体的书籍。
- Faceted classification（分面分类）：这种分类方式基于一个事物的不同特征，将其划分成多个部分。
例如，在一个网上商店中，商品可以被划分成多个类别，如颜色、尺寸、材料等。
- Library classification（图书分类）：对于图书馆或学术机构而言，使用特定的分类系统可以帮助其更好地组织、维护书籍。
Dewey decimal分类法和Library of Congress分类法都是广泛采用的图书分类系统。
- Artificial intelligence classification（人工智能分类）：在计算机科学领域，分类技术被广泛应用于机器学习和数据挖掘。
虽然这种分类方式是基于人工智慧设计的，但技术的进步已经使得计算机具备了智能分类数据的能力。
步骤3：分类的局限虽然分类非常有用，但我们必须认识到，分类也有其局限性。
神奇的蓝细菌
间步骤，直接使用简单的糖或者杂草生成链烷烃。到
目前为止，研究人员使用一个1000升的示范发酵罐，
获得了10升链烷烃。
/ny/2010/08-03/2442252.shtml
目前，最有希望的火 星拓展细菌是蓝细菌，现 已证实蓝细菌能幸存于欧 洲“BIOPAN”平台和国际 空间站“EXPOSE”平台的 真空环境中。英国开放大学地理微生物学家查尔斯
和二氨基庚二酸，革兰氏染色阴性。
细胞核无核膜，也不进行有丝分裂，细胞壁含胞壁酸
6）分泌粘液层、荚膜或形成鞘衣，因此具有
强的抗干旱能力。
7）无鞭毛，但能在固体表面滑行，进行光趋
避运动。
8）许多种类细胞质中有气泡，使菌体漂浮，
保持在光线最充足的地方，以利光合作用。
3. 构 造
蓝细菌构造与G－细菌相似：细胞壁双层，含肽聚糖。 水生种类在其壁外还有粘质糖被或鞘 细胞质周围有复杂的光合色素层类囊体 叶绿素a 藻胆素 一类辅助光合色素
赤潮
水华
绿潮
绿潮引起水质恶化，严重时耗尽水中氧气而造成
鱼类的死亡。更为严重的是，蓝藻中有些种类（如微
囊藻）还会产生毒素（简称MC），大约50%的绿潮
中含有大量MC。MC除了直接对鱼类、人畜产生毒害
之外，也是肝癌的重要诱因。MC耐热，不易被沸水
分解，但可被活性碳吸收，所以可以用活性碳净水器
对被污染水源进行净化。天敌蓝藻等藻类是鲢鱼的食
科（Family） (Familia)
属（Genus） (Genus)
种（Species） (Species)
二、生物的界级分类学说
两界系统
三界系统
四界系统
五界系统
六界系统
蓝细菌（Cyanobacteria）
微生物的分类与鉴定
23
➢ 《伯杰氏系统细菌学手册》1984-1989（第一版） ➢ 1986年第一卷 :一般医学上或工业的重要的革兰
氏阴性菌 ➢ 1988年第二卷:除了放线菌之外的革兰氏阳性菌 ➢ 1989年第三卷:古细菌、蓝细菌和第一卷以外的
其余的G-菌 ➢ 1989年第四卷:放线菌
生物分类的传统指标
形态学特征、 生理学特征、 生态学特征
从不同层次(细胞的、分子的)，用不同学科(化学、物理学、遗传 学、免疫学、分子生物学等)的技术方法来研究和比较不同微生 物的细胞、细胞组分或代谢产物，从中发现的反映微生物类群特征 的资料。
在现代微生物分类中，任何能稳定地反映微生物种类特征的资料， 都有分类学意义，都可以作为分类鉴定的依据。
生物分类学上种以下的分类单位。但其基本特征仍未超脱原种范 围的一群个体。
种内某一个体可能由于突变而发生变异，在自然选择和人工选择 下，这种变异会在种内不断扩散，最后形成某些遗传性不同于原 种的一个群体。
变种仍能和原种进行基因交流。 变种和亚种没有本质差别，有时常混用。
指某一明显而稳定的特征与模式种不同的种，有时称 小种。
一、分类单元及其等级
界 （Kingdom） (Regnum) 门 （Phylum） (Phylum) 纲（Class） (Classis) 目（Order） (Ordo) 科（Family） (Familia)
属（Genus） (Genus) 种（Species） (Species)
微生物的分类单位
种和亚种指定模式菌株（type strain）； 亚属和属指定模式种（type species）； 属以上至目级分类单元指定模式属（type genus）； 模式菌株应送交菌种保藏机构保藏，以便备查考和索取。
微生物的分类
Bacillus subtilis（Ehrenberg）Cohn 1872
由于细菌分类单元的划分缺乏一个易于操作的统一标准， 为了减少因采用不同标准界定分类单元所造成的混乱，
细菌系统分类也像其他生物分类一样采用“模式概念”
种和亚种指定模式菌株（type strain）； 亚属和属指定模式种（type species）； 属以上至目级分类单元指定模式属（type genus）； 模式菌株应送交菌种保藏机构保藏，以便备查考和索取。
第二节 微生物在生物界的地位
一、生物的界级分类学说
两界系统
三界系统
四界系统
五界系统
六界系统
二、三域学说及其发展
选用16SrRNA进行研究的主要原因是：
1.16SrRNA普遍存在于原核生物和真核生物细胞中， 故可用以比较它们在进化上的相互联系； 2.16SrRNA有重要且恒定的生理功能； 3.在细胞中含有较大量的易于提取的rRNA； 4.rRNA的基因在细胞中不像质粒DNA那样会转移，而 是稳定的；
微生物分类学（microbial taxonomy） 是一门按微生物的亲缘关系把它们安排 成条理清楚的各种分类单元或分类群（ taxon）的科学
它的具体任务有三即 分类（classification） 鉴定（ification） 命名（nomenclature）
生物分类的二种基本原则：
a）根据表型(phenetic)特征的相似程度分群归类，这种
古细菌(archaebacteria) 真细菌(Eubacteria) 真核生物(Eukaryotes)
系统分类单元、种的概念、学名、亚种
第二节 微生物在生物界的地位
生物界级分类学说、五界系统、三域学说及其发展、 ※微生物的进化
细菌的分类与命名-微生物命名规则
细菌的分类与命名-微生物命名规则细菌的分类与命名细菌分类学细菌分类学 (taxonomy)就是指对细菌进行分类、命名与判定的一门学科。
它的任务就是在全面认识细菌的生物学特色的基础上,研究它们的种类 ,探究其发源、演化以及与其她类群之间的亲缘关系,从而提出能反应自然发展的分类系统,并将细菌加以分门别类。
它包含三个方面:分类 (classification)、命名 (nomenclature)与鉴定 (identification) 。
一、基本观点1、细菌分类就是依据每种细菌各自的特色,并依照它们的亲缘关系分门别类 ,以不一样样级编排成系统。
分类有两种 :①以细菌的形态与生理生化特征为依照的表型特色分类法 ,包含有传统分类法 (classical classification)与数值分类法(numerical classification);②用化学剖析与核酸剖析,以细菌大分子物质 (核酸、蛋白质 )构造的同源程度进行分类称种系分类 (phylogenetic classification)或自然分类(natural classfication)。
2、细菌命名在分类基础上 ,赐予每种细菌一个科学名称,使之在生产实践、临床实践与科学研究工作中互相沟通成为可能。
依照细菌命名的法例,能保证全部的科研工作者以相同方式赐予细菌命名。
3、细菌判定将未知细菌按分类原则放入系统中某一适合地点与已知细菌比较其相像性 ,用对照剖析方法确立细菌的分类地位。
若与已知细菌相同即采纳已知菌的名称 ,不一样者则按命名原则确立一个新名称。
二、分类等级细菌的分类等级与其她生物相同,挨次为界 (kingdom)、门(division) 、纲 (class)、目(order)、科 (family) 、属 (genus)、种 (species)。
细菌属于原核生物界 (procaryotae),包含有细菌、放线菌、支原体、衣原体、立克次体与螺旋体。
classification英文的缩写
一、 classification的定义classification是classify的名词形式，指的是将事物或者概念按照一定的标准或者特征进行分类和归类的行为。
在各个领域，classification都有着重要的应用，例如在生物学中对动植物的分类，图书馆中对图书的分类，电子产品中对设备的分类等等。
二、classification的英文缩写1. 在计算机科学中，classification常常被用作机器学习、数据挖掘等领域中的重要概念。
在这些领域中，classification通常被表示为"class."或者"cls."的缩写形式。
在Python语言的机器学习库scikit-learn中，classification模块就被命名为"sklearn.classification"。
2. 在图书馆学中，classification系统也有着特定的英文缩写形式。
我们熟知的图书馆分类系统中的Dewey Decimal Classification就常被简写为"DDC"。
3. 在医学领域，classification的英文缩写通常是"ICD"，全称为"International Classification of Diseases"，即国际疾病分类。
ICD 被世界卫生组织用于统计、分析和比较全球范围内的疾病数据，在国际上具有重要的影响力。
4. 在商业和市场营销领域，classification常常被简写为"class."或者"cls."。
对用户进行分类分析，以便进行精准营销的方法就被称为"consumer classification"。
5. 在法律领域，classification的英文缩写为"class."或者"cls."，主要用于法律文件或者文件分类系统中。
常见生物分类系统
常见生物分类系统生物分类是将不同的生物进行归类和命名的系统。
它使用一系列的层次结构和术语来描述和区分不同的生物群体。
生物分类的基本原则生物分类的基本原则是根据生物的形态特征、遗传关系和进化历史来分类。
以下是常见的生物分类系统：1. 形态分类：根据生物的形态特征（如外形、大小、颜色等）来进行分类。
这种分类方法在早期广泛使用，但由于形态特征受到环境和发育影响较大，因此现在不再是主要的分类方法。
2. 进化分类：根据生物的进化关系来进行分类。
这种分类方法基于生物的共同祖先和进化历史，将生物分为不同的类群。
进化分类是现代生物分类学的主要方法，它使用系统发生学和分子生物学等技术来研究生物的进化关系。
3. 分子分类：根据生物的分子遗传信息（如DNA序列）来进行分类。
分子分类是一种基于分子生物学的分类方法，它通过比较生物的基因组和蛋白质组，确定它们之间的相似性和差异性。
常见的分类系统1. 五界分类系统：生物界被分为动物界、植物界、真菌界、原生生物界和细菌界。
这是最常见的分类系统，它根据生物的基本特征和生活方式将生物进行分类。
2. 树状图分类系统：根据生物的进化关系，用树状图的形式展示不同类群之间的演化关系。
这种分类系统可以清晰地展示生物的进化历史和亲缘关系。
3. 分支分类系统：将生物分为不同的分支，每个分支代表一个类群。
这种分类系统中，每个分支都代表一条进化的路径，而且类群之间的关系更加清晰。
生物分类的意义生物分类系统不仅有助于科学家研究和了解生物多样性，还对教育、保护和利用生物资源等方面具有重要意义。
通过生物分类系统，我们可以更好地认识和保护自然界中的各种生物，促进生物研究和保护工作的开展。
总结起来，生物分类是通过将生物进行归类和命名，帮助科学家了解生物多样性和进化关系的系统。
它是现代生物学的基础，对于生物研究和保护具有重要意义。
参考文献：- Smith, J., & Johnson, A. (2019). Biological classification: structure and function. Cambridge University Press.- Zhang, S., & Li, J. (2020). Molecular classification of organisms. Nature Reviews Genetics, 21(8), 432-438.。
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生物的界级分类（classification of kingdoms oforganisms）
根据生物的基本结构特点、特别是根据生物的演化概况所进行的各种“界”级分类系统。
随着科学的发展，历史上曾先后出现过多种生物界级分类系统，主要有以下几种：（1）林奈的两界系统（1735），包括植物界和动物界；（2）海克尔的三界系统（1866年），包括原生生物界（Kingdom protista）、植物界和动物界；（3）李代尔（G.F.Leedale）的四界系统（1974），包括原核界（Kingdom Monera）（细菌、蓝藻）真菌界（Kingdom Fungi）、植物界和动物界；（4）魏泰克（R.H.Whittaker）的五界（1969），包括原核界、原生生物界、真菌界、植物界和动物界；（5）胡先骕的二总界系统（1965），包括始生和胞生两个总界，始生总界（Suprastatus Protobiota）只有病毒界，胞生总界（Suprastatus Cytobiota）包括细菌界（Status Bacteriobion－ta）、粘菌界（Status Myxobionta）、真菌界（Status Myco－bionta）、植物界（Status Phytobionta）和动物界（StatusZoobionta）；（6）陈世骧等的三总界六界分类系统（1979），即：
Ⅰ.非细胞总界（Superkingdom Acytonia） 1.病毒界（包括类病毒）
Ⅱ.原核总界（SuperkingdomProcaryota） 2.细菌界（Kingdom Mycomonera）
3.蓝藻界（Kingdom Phycomonera）
Ⅲ.真核总界（Superkingdom Eucaryota） 4.植物界（Kingdom Plantae）
5.真菌界（Kingdom Fungi）
6.动物界（Kingdom Animalia）
生物的分界
面对着众多的生物，科学家为了便于研究起见，逐将生物分门别类。
凡是形态功能相近的生物，即归为一类。
显微镜未发明之前，传统上将生物划分为动物与植物王国，这是瑞典生物学家林奈(Carl von Linne)(图4.1)提出的二界分类法(two kingdom classification)。
到了18世纪显微镜发明以后，科学家发现尚有许多低等的微生物兼具有动植物的特征，例如细菌、眼虫等等，
于是他认为以往的分类法不够恰当。
1866年海克
(Haeckel)(图4.2)提出了三界分类法(three kingdom
classification)，将生物界分成微生物界、植物界和动物界。
注：近代又有五界分类法的观念，将生物分为原核生物界
(Monera)、原生生物界(Protista)、真菌界(Fungi)、植物
界(Plantae)和动物界(Animalia)。
(此观念将在高中课文涉
及)
植物界的分类与特征
绿色植物都含叶绿素，它们对绿化环境非常重要。
真菌则不含叶绿素。
植物可分为非种子植物(Non-seed plant)及种子植物(seed plant)。
A. 非种子植物(Non-seed plants)：
种类特征例子
1．藻菌植物门(Thallophyta)
a．藻类(Algae) b．真菌(Fungi) c．地衣(Lichens)含叶绿素，可自制养料，多生活
于水中，无根、茎、叶的区分
不含叶绿素，寄生或腐生，也无
根、茎、叶的分别
藻类与真菌共同组成
水绵(Spirogyra)、紫菜
(Porphyra)、昆布(海
带)(Laminaria)
微小的真菌包括霉属于微生物，
较大的真菌包括蕈如草菇
(Volvariella)、香菇
(Lentinus)、蘑菇(Agaricus)
壳状地衣(Crustose lichen)
2．苔藓植物门(Bryophyta)
a．苔纲(Hepaticae) b．藓纲(Musci)茎叶的区别不明显，有假根
茎叶的区别明显，有假根
叶苔(Riccia)、地钱
(Ma-rchantia)
土马骔(Polytrichum)、泥炭藓
(Sphagnum)
3．蕨类植物门(Pteridophyta)有根、茎、叶，能产生孢子芒萁(Gleichenia)、石松
(Lycopodium)、树蕨(tree
fern)、鸟巢蕨(bird’s nest
fern)
B. 种子植物(Seed plants)
种类特征例子种子植物门(Spermatophyta)
a．裸子植物纲(Gymnospermae) b．被子植物纲（Angiospermae）
i．单子叶植物(Monocotyledonous plant)
ii．双子叶植物(Dicotyledonous plant)有根、茎、叶的分化，种子裸露
有根、茎、叶的分化，产生花朵
的高等植物，有些花会结果并产
生种子，种子存于果实内
种子只含一片子叶
种子含有二片子叶
银杏(Ginkgo)、苏铁(Cyc_as)、
南洋杉(Araucaria)、马尾松
(masson pine)
茅草(Imperata)、稻、麦、甘蔗
等
凤仙花(balsam plant)、木瓜、
榴梿
动物界的分类与特征
动物界无脊椎动物
原生动物门
多孔动物门
腔肠动物门
扁形动物门
线形动物门
环节动物门
软体动物门
棘皮动物门
节肢动物门脊椎动物
鱼纲
两栖纲
爬行纲
鸟纲
哺乳纲
由低等至高等动物界可分为十二个门：即原生动物门、多孔动物门、腔肠动物门、扁形动物门、园形动物门、环形动物门、节肢动物门、软体动物门、拟软体动物门、毛腭动物门、棘皮动物门、脊索动物门。
例如，蛇属于脊索动物门，蛔虫属于园形动物门，蚯蚓属于环形动物门，蜗牛属于软体动物门，吸血虫属于扁形动物门，昆虫、蜘蛛、蜈蚣则属于节肢动物门。