质粒DNA的提取分析

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质粒dna的提取实验报告

质粒dna的提取实验报告

质粒dna的提取实验报告质粒DNA的提取实验报告引言:DNA提取是分子生物学研究中的基础实验之一,通过提取DNA可以进一步进行PCR扩增、基因克隆等实验。

本实验旨在提取质粒DNA,质粒DNA是存在于细菌细胞质中的环状DNA分子,具有重要的研究价值。

本文将详细介绍实验的步骤、原理以及结果分析。

材料与方法:1. 细菌培养液:选择含有目标质粒的细菌进行培养,如大肠杆菌。

2. 细菌培养基:选择适宜的培养基,如LB培养基。

3. 细菌培养器具:如培养皿、离心管等。

4. DNA提取试剂盒:选择适合的DNA提取试剂盒,如酚/氯仿法或硅胶柱法。

5. 离心机:用于离心细菌培养液以获取细菌沉淀。

6. 紫外可见分光光度计:用于检测DNA的纯度和浓度。

实验步骤:1. 细菌培养:将含有目标质粒的细菌接种于LB培养基中,培养过夜,使细菌充分繁殖。

2. 收集细菌:将培养液离心,以12000转/分钟离心10分钟,将细菌沉淀收集。

3. 细胞裂解:加入适量的细胞裂解缓冲液,使细菌细胞裂解,释放DNA。

4. 蛋白质沉淀:加入酚/氯仿混合液,离心分离上层的DNA溶液和下层的蛋白质。

5. DNA沉淀:将DNA溶液转移至新的离心管中,加入等体积的冷乙醇,轻轻倒置离心管,使DNA沉淀出来。

6. DNA洗涤:用70%的乙醇洗涤DNA沉淀,去除残余的盐和杂质。

7. DNA溶解:用适量的去离子水溶解DNA沉淀,得到纯净的DNA溶液。

8. DNA浓度检测:用紫外可见分光光度计检测DNA的浓度和纯度。

结果与分析:通过实验,成功提取了质粒DNA,并进行了浓度检测。

根据实验结果,我们可以得到DNA的浓度和纯度信息,这对于后续的实验设计和操作非常重要。

此外,实验中还可以通过凝胶电泳等方法对提取的DNA进行进一步的分析,如确定DNA的大小和完整性。

结论:本实验成功提取了质粒DNA,并获得了纯净的DNA溶液。

通过浓度检测和进一步的分析,我们可以进一步了解DNA的特性和应用。

质粒dna提取实验报告

质粒dna提取实验报告

质粒dna提取实验报告实验目的:本实验旨在通过提取细菌质粒DNA,了解细菌质粒的结构、基因组成和使用纯度较高的质粒DNA的重要性,为后续分子生物学实验打下基础。

实验器材:- 细菌- LB液体培养基- 1.5mL微量离心管- 离心机- 动态温度水浴仪- 恒温振荡器- 超声波清洗器- 洁净平台和无菌技术用品- 始终细切割刀和取样刷- 蒸馏水、2% SDS、醋酸铵、90%乙醇、异丙醇和干燥机实验步骤:1. 制备细菌:在LB液体培养基中培养要提取质粒DNA的细菌,由于质粒DNA在对数生长期达到最高含量,因此在显微镜下观察到对数生长期的细菌时进行取样。

2. 细胞打破和溶解质粒:离心细胞,倒去培养基,加入10mL蒸馏水,用振荡器在4℃下以300rpm摇晃3小时。

然后沉淀细胞,在70℃下干燥30分钟。

随后加入150μL1%SDS和其他化学试剂混合物,使用至少15次的起始细切割刀切成绒毛状的颗粒,浸泡在低盐度醋酸铵中2小时以上。

3. 质粒DNA纯化:将浸泡了细菌绒毛颗粒的混合物离心,抽取上清液,将其加入2x体积的异丙醇与等体积的75%,然后用再生明胶抑制蛋白质在异丙醇中凝聚。

离心,除去异丙醇上清液,加入70%乙醇洗涤。

最后用干燥机吸干。

4. 质量分析:分析提取到的质粒DNA的浓度和纯度,使用分光光度计对其进行光谱分析,以检测质粒DNA的A260/A280比例和A260/A230比例。

通过比较纯度,然后将质粒DNA冻保存至-20℃或-80℃。

实验结论:本实验成功提取了细菌的质粒DNA,并进行了纯化和分析。

质粒DNA的提取和纯化是基于一系列物理和化学方法和技术的,实际操作中需要仔细操作,耐心等待,严格注意洁净操作,才能达到最佳的提取和纯化效果。

通过本实验,我进一步了解了在分子生物学和遗传学中质粒DNA的重要性,它可适用于多种研究项目和应用,例如质粒克隆、基因编辑、基因表达、和质粒蛋白质互作等。

提取质粒dna的方法

提取质粒dna的方法

提取质粒dna的方法提取质粒DNA的方法是一种从生物样品中提取DNA的方法,用于分析基因组学、遗传学或其他基因相关的研究。

它是所有DNA技术的基础。

提取质粒DNA的方法主要包括三个步骤:破解细胞壁、提取DNA片段和提取DNA片段。

第一步,破解细胞壁。

为了提取细胞内的DNA,必须先破坏细胞壁。

这一步可以通过使用植物激素、酶和其他破坏细胞壁的物质来完成。

第二步,提取DNA片段。

在破坏细胞壁之后,生物样品中的DNA就可以从细胞内被提取出来。

这一步通常是将样品加入一定的溶液,如洗涤溶液,然后用放大器去提取DNA片段。

第三步,提取DNA片段。

在提取DNA片段之后,必须对其进行纯化处理,以便提取的DNA片段不会受到其他物质的干扰。

一般情况下,这一步是通过使用离心机将DNA 片段从溶液中分离出来,然后用水冲洗去除其他物质,最后得到纯净的DNA片段。

提取质粒DNA的方法也可以用来提取植物细胞内的DNA。

与提取动物细胞中的DNA不同,植物细胞内的DNA要更加困难,因为植物细胞周围可能有多层细胞壁,而这些细胞壁很难被破坏。

因此,植物细胞内的DNA提取一般都是采用化学方法,即使用碱性有机溶液,以破坏细胞壁,然后再用放大器提取DNA片段。

此外,还有一些无细胞DNA提取的方法,如PCR法、小RNA测序、质粒提取等。

PCR法是用来检测和检验DNA的一种技术,可以扩增微量DNA,从而获取充足的DNA材料进行检测。

小RNA测序是一种新型的基因测序技术,可以检测植物和动物体内特定的RNA,检测特定靶基因的表达。

最后,质粒提取是一种从生物样品中提取DNA质粒的技术,可以用于分子生物学研究,如基因克隆、DNA测序等。

总之,提取质粒DNA的方法是一种常用的DNA提取技术,也是所有DNA技术的基础。

它可以用于从动物和植物样品中提取DNA片段,以及从无细胞DNA中提取DNA质粒,以用于各种基因组学、遗传学和分子生物学研究。

实验一、质粒DNA的提取及检测实验报告

实验一、质粒DNA的提取及检测实验报告

实验一、质粒DNA的提取及检测【实验目的】1、掌握碱裂解法提取质粒的原理和步骤2、掌握琼脂糖凝胶电泳检测DNA的方法和技术3、学会PCR操作的基本技术第一部分质粒DNA的提取一、实验原理:碱裂解法提取质粒是根据共价闭合环状质粒DNA与线性染色体DNA在拓扑学上的差异来分离它们。

在pH值介于~这个狭窄的范围内,线性的DNA双螺旋结构解开而被变性,尽管在这样的条件下,共价闭环质粒DNA的氢键会被断裂,但两条互补链彼此相互盘绕,仍会紧密地结合在一起。

当加入的乙酸钾高盐缓冲液恢复pH至中性时,共价闭合环状的质粒DNA的两条互补链仍保持在一起,因此复性迅速而准确,而线性的染色体DNA的两条互补链彼此已完全分开,复性就不会那么迅速而准确,它们缠绕形成网状结构,通过离心,染色体DNA与不稳定的大分子RNA,蛋白质-SDS复合物等一起沉淀下来而被除去。

二、仪器与试剂1、仪器恒温摇床、台式离心机2、试剂溶液I、溶液Ⅱ、溶液Ⅲ、无水乙醇、TE缓冲液、胰RNA酶、酚、氯仿三、实验步骤1、将2mL含相应抗生素(Amp:50μg/mL)的LB液体培养基加入到试管中,接入含pUC19质粒的大肠杆菌,37℃振荡培养过夜。

2、取培养物倒入微量离心管中,4000r/min离心2min。

3、吸去培养液,使细胞沉淀尽可能干燥。

4、将细菌沉淀悬浮于100μL溶液I中,充分混匀,室温放置10 min。

5、加200μL溶液Ⅱ(新鲜配制),盖紧管皿,混匀内容物,将离心管放冰上5min。

6、加入150μL溶液Ⅲ(冰上预冷),盖紧管口,颠倒数次使混匀。

冰上放置15min。

7、12000r/min,离心15min,将上清转至另一离心管中。

8、向上清中加入等体积酚:氯仿(1:1)(去蛋白),反复混匀,12000r/min,离心5min,将上清转移到另一离心管中。

9、向上清加入2倍体积无水乙醇,混匀后,室温放置5~10min。

12000r/min,离心5min。

质粒DNA的提取实验报告

质粒DNA的提取实验报告

质粒DNA的提取一、实验方法碱裂解法抽提质粒DNA二、实验原理基于质粒DNA与染色体DNA变性与复性的差异。

三、实验步骤1)质粒提取1. 10,000g,1min离心收集1.5-5ml菌液沉淀于1.5ml离心管中。

2. 加入100μl溶液1,振荡至彻底悬浮。

3. 加入200μl溶液2,立即轻柔颠倒离心管6次,使菌体充分裂解,随后将离心管冰上放置3分钟4. 加入150μl溶液3,立即温和颠倒离心管数次,冰上放置3分钟,10,000g离心10min。

5. 将步骤4的上清转移至新的离心管(尽量去除杂质),加入等体积的苯酚/氯仿/异戊醇混合均匀10,000g离心5min。

6. 将步骤5的上清转移至新的离心管,加入2倍体积的无水乙醇,室温放置5-10min,沉降DNA7. 10,000g离心10分钟,弃乙醇,保留沉淀,加入1ml 70%的乙醇洗涤沉淀,10,000g离心5分钟8. 倒掉乙醇溶液,用吸水纸吸净管壁上的水珠,室温蒸发痕量乙醇9. 加入适量含RNase的TE或灭菌双蒸水溶解质粒DNA2)质粒鉴定→琼脂糖凝胶电泳灌胶:胶中加入荧光染料(SYBR Green I)加样:质粒+上样缓冲液→混匀电泳结果观察:UV灯下四、实验结果五、实验分析裂解细胞中除含有质粒DNA外,还含有基因组DNA、各种RNA、蛋白质和脂类等物质,因此用碱裂解法除去杂质1、防止DNA裂解:Solution 11)、所含糖增加溶液黏度,维持渗透压,防止DNA受机械剪切作用降解2)、所含EDTA抑制酶活性2、溶解与变性:Solution21)强碱使质粒DNA和染色体DNA变性2)离子型表面活性剂SDS可溶解膜蛋白3、沉降与复性:Solution31)质粒DNA复性2)在钾盐中,染色体DNA形成缠连的不溶性网状结构,和不稳定的大分子RNA以及变性的蛋白质和细菌碎片等一起沉淀预期结果为剩余质粒DNA4、琼脂糖凝胶电泳1)荧光染色染料分子可嵌入双链DNA分子配对碱基之间2)琼脂糖可起到电泳和分子筛的作用,因所带电荷、分子量大小和构型不同,泳动速度不同六、误差分析实验失败,本组实验出现4条带,3明1暗,明亮处应为DNA分子数最多的,为质粒DNA,质粒DNA前有较暗的两条带,推测其中一条为未复性质粒DNA,可能Solution2处变性过长,不易复性,或Solution3处时间过短,复性不充分。

生物学实验 质粒DNA的提取

生物学实验   质粒DNA的提取

实验8 质粒DNA的提取(碱裂解法)一、实验目的了解碱裂解法提取质粒的基本原理和主要应用,掌握碱裂解法提取质粒的实验方法和各种试剂在提取过程中的作用。

二、实验原理碱裂解法是利用细菌染色体DNA与质粒DNA结构的大小差异来分离质粒DNA的。

碱性(pH 12.0~12.5)条件可以破坏碱基配对,宿主和质粒DNA的碱基之间的氢键被破坏。

当条件恢复正常时(加入酸性试剂中和),共价闭合环状的质粒DNA会迅速准确地恢复配对,重新形成完全天然的超螺旋分子;而较大的细菌染色体DNA分子则难以复性,会交联形成不溶于水的线团结构,缠绕附着在细胞壁碎片上,离心时易被沉淀下来,而质粒DNA则留在上清液中,用异丙醇沉淀、70 %乙醇洗涤即可获得质粒DNA。

三、仪器设备微量取液器(2 μL;20 μL;200 μL;1 000 μL),tip头,手掌型离心机,1.5 mL离心管, 恒温水浴,制冰机,超净工作台,恒温培养箱。

振荡器,离心机,金属浴,电泳仪,凝胶成像仪。

四、实验试剂(1)溶液Ⅰ:50 mmol/L葡萄糖;20 mmol/L Tris·HCl(pH = 8.0);10 mmol/L EDTA(pH=8.0),高压蒸汽灭菌(121 ℃,0.105 Mpa)20 min。

4 ℃贮存。

(2)溶液Ⅱ(现用现配):0.2 mol/L NaOH;1 g / L SDS。

(3)溶液Ⅲ(pH 4.8):每100 mL溶液中含5 mol/L乙酸钾60 mL;冰乙酸11.5 mL;H2O 28.5 mL。

(4)RNase(10 mg / mL),LB液体培养基,氨苄青霉素,异丙醇,70 %(V / V)乙醇,无菌水。

五、实验方法(1)分装3 mL LB液体培养基和3 μL氨苄青霉素(50 mg/mL)于15 mL玻璃试管中。

(2)用灭菌牙签挑取一白色单克隆,放入玻璃管内,置37 ℃恒温摇床中以200转/min培养,至OD600=2.0。

质粒dna提取实验报告

质粒dna提取实验报告

质粒dna提取实验报告引言DNA的提取是生物学实验中非常重要的一步,它可以用于后续的分子生物学研究,比如克隆、PCR、基因测序等。

而本次实验的目的是从细菌中提取质粒DNA,并对提取的结果进行分析,评估提取效果。

材料与方法1. 实验材料- 大肠杆菌菌液- 细胞裂解液- RNase A- 莱文斯坦缓冲液- 高盐裂解液- 乙酰盐- 氯仿- 异丙醇- TE液- 离心管等实验仪器和耗材。

2. 实验步骤- 调制莱文斯坦缓冲液,用于细胞裂解和质粒DNA的稳定。

- 预处理大肠杆菌菌液,用高盐裂解液处理使其细胞壁破裂,释放出质粒DNA。

- 添加异丙醇与氯仿,用于分离DNA和其他细胞组分。

- 加入乙酸盐处理DNA上的蛋白质,使其沉淀。

- 用异丙醇洗涤DNA沉淀,去除杂质。

- 用TE液溶解提取得到的DNA。

结果与讨论经实验,我们成功地从大肠杆菌中提取到了质粒DNA。

通过紫外光照射,我们观察到了明亮的DNA带,证明提取得到的DNA具有较高的纯度。

另外,我们还使用琼脂糖凝胶电泳对提取的DNA进行了分析。

从琼脂糖凝胶电泳的结果中,我们观察到细长而连续的DNA 条带,说明提取得到的质粒DNA具有较好的完整性。

此外,我们还注意到,在琼脂糖凝胶中,质粒DNA的迁移速率要快于细菌染色体DNA,这是因为质粒DNA的分子量较小。

在实验的过程中,我们注意到了一些实验技巧和注意事项。

首先,在进行细胞裂解和DNA提取过程中,必须保持材料的无菌状态,以免外源性DNA的污染。

其次,避免在提取过程中显著提高DNA样本的温度,以防止DNA的降解。

最后,注意避免DNA溶液与金属物质接触,因为金属离子可能对DNA具有毒性。

结论通过本次实验,我们成功地从大肠杆菌中提取到了高质量的质粒DNA,并在琼脂糖凝胶上观察到清晰的DNA带。

实验过程中,我们掌握了DNA提取的基本操作技巧和注意事项,这对我们今后的分子生物学研究将产生积极的影响。

然而,本次实验还有一些改进的空间。

实验一 质粒DNA的提取及定量分析

实验一  质粒DNA的提取及定量分析

实验一质粒DNA的提取及定量分析一、实验原理与步骤1.实验原理:碱裂解法抽提质粒DNA质粒的分离是利用质粒DNA与染色体DNA在变性与复性中的差异来达到的目的。

当菌体在NaOH和SDS溶液中裂解时,蛋白质与DNA发生变性,由于染色体DNA与质粒DNA拓朴构型不同,染色体DNA双螺旋结构解开,而共价闭环质粒DNA 的氢键虽被断裂,但两条互补链彼此相互盘绕仍会紧密地结合在一起。

当加入中和液后, 溶液pH调恢复至中性,在高盐浓度的情况下,染色体DNA之间交联形成不溶性网状结构并与蛋白质-SDS复合物等形成沉淀;不同的是,质粒DNA复性迅速而准确,保持可溶状态而留在上清中。

这样,通过离心可沉淀大部分细胞碎片、染色体DNA、RNA及蛋白质。

除去沉淀后上清中的质粒可用酚氯仿抽提进一步纯化质粒DNA。

2.质粒DNA提取的方法步骤①收集菌体:取1.5ml培养液至Ep管中,12000rpm离心1min,弃上清,取沉淀。

②溶解菌体:将细菌沉淀悬浮于100μl预冷溶液Ⅰ中,强裂振荡混匀。

③变性:加入200μl溶液Ⅱ,盖严管盖轻柔颠倒5-6次以混匀内容物,冰上放置5分钟。

④复性:加入150μl溶液Ⅲ,温和振荡数次,冰上放置5分钟。

⑤12000rpm 离心5分钟,取上清移到1个新的Ep管中。

⑥取上清(≈ 420ul),分别加入1/2体积酚(210ul),和1/2体积氯仿/异戊醇(24:1) (210ul) ,涡旋震荡混匀溶液。

⑦12000rpm、离心5分钟。

小心移取上清液(≈ 400μl)至另一个新1.5mlEp 管中。

⑧上清液加入2倍体积(≈ 800ul )预冷无水乙醇,混匀,于 -20℃中静置0.5h。

⑨12000rpm, 离心5分钟。

弃上清,加入1ml 70%乙醇漂洗沉淀,盖严管盖颠倒数次,12000rpm 离心10分钟。

10.干燥DNA:用移液器小心吸走上清液,然后瞬时离心,再将残余的少量液体移走,用温和的电吹风吹干DNA沉淀(以看不到液滴为准)。

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质粒DNA的提取一、原理采用碱变性法抽提取质粒DNA。

该法是基于染色体DNA与质粒DNA的变性预复性的差异而达到分离目的的。

在PH大于12的碱性条件下,染色体DNA的氢键断裂,双螺旋结构解开变性。

质粒DNA的大部分氢键也断裂,但超螺旋共价闭合环状结构的两条互补链不会完全分离,当以pH5.2的乙酸钠高盐缓冲液调节其pH至中性时,变性的质粒DNA又恢复到原来的构型,保存在溶液中。

而染色体DNA不能复性而形成缠连的网状结构。

通过离心,染色体DNA与不稳定的大分子RNA,蛋白质-SDS复合物等一起沉淀下来而被除去。

二、方法1.挑取一环在LB固体培养基平板上生长的含PUC57质粒的大肠杆菌,接在含有100μg/ml氨苄青霉素(Amp)的LB液体培养基(5ml/15ml试管)中,37℃震摇培养过夜。

2.将1.5ml菌液加入微离心管中,14000r/min,离心10秒,其取上清液。

反复数次,收集全部菌体。

3.倾去上清,滤纸吸干。

4.加30μlTE缓冲液(10mmol/L Tris—HCl,1mmol/L EDTA,pH8.0),振荡起菌体。

5.加30μlTENS溶液(10mmol/L Tris—HCl, pH8.0,1mmol/L EDTA,0.1mol/LNaOH,0.5%SDS),震荡10秒至溶液变粘稠。

6.加150μl 3.0mol/LnaAC,震荡3—5S,14000r/min,离心3分钟,沉淀细胞碎片及染色体DNA。

7.上清液转移至另一微离心管中,加等体积胞和酚,混匀,12000r/min,离心2分钟。

8.上层水相转移至另一位离心管,加2倍量冷水乙醇,14000r/min,离心20分钟。

9.倾去乙醇,加入7o%冷乙醇淋洗。

10.倾去乙醇,滤纸吸于,真空抽吸2~3分钟。

lI.加人50μlTE缓冲液,溶解DNA。

12,加入1μl核糖核酸酶(10mg/m1),14000r/min,离心2s,使核糖核酸酶与管底液体混匀。

13.37℃水浴30min。

14.样品放一20℃冰箱保存备用。

三、试剂1.TE缓冲液(10mmol/L Tris—HCl,1mmol/L EDTA,pH8.0)配制方法:Tris 1.211gEDTA.Na 0.037g用800ml重蒸水溶解,用分析纯盐酸调整pH至8.0,加重蒸水定容至1000ml。

2.TENS溶液:(10mmol/L Tris—HCl, pH8.0,1mmol/L EDTA,0.1mol/L NaOH,0.5%SDS)配制方法:NaOH O.4 gSDS 0.5 g加80mlTE缓冲液溶解。

加TE缓冲液定容至lOOml.3.3.0mol/1醋酸钠溶液(pH5.2)配制方法:醋酸钠 24.6g用70ml重蒸水溶解,再用冰乙酸大约调pH至5.2,加重蒸水定容至100ml。

纯净的酚使用时不需要重蒸。

市售的酚一般为红色或黄色结晶体,使用之前必须重蒸,除去能引起DNA和RNA断裂和聚合的杂质。

将苯酚置于65℃水浴中溶解,重新进行蒸馏,当温度升至183℃时,开始收集在若干个棕色瓶中。

纯酚和重蒸酚都应贮存在-20℃使用前取一瓶重蒸酚于分液漏斗中,加入等体积的lmol/L Tris-HCI(pH8.0)缓冲液,立即加盖,激烈振荡,并加入固体Tris摇匀调pH(一般100ml苯酚约加l克固体Tris)分层后测上层水相pH至7.6一8.0。

从分液漏斗中放出下层酚相于棕色瓶中,并加一定体积0.1mol/L Tris-HCI(pH8.o)覆盖在酚相上,置4℃冰箱贮存备用。

酚是一种强腐蚀剂,能引起腐蚀性损伤,操作时应戴上眼镜和手套。

如果皮肤上溅上了酚,应用大量水冲洗或用肥皂水冲洗。

酚在空气极易氧化变红,要随时加盖,也可加入抗氧化剂o.1%8一羟基喹啉及o.2%β—巯基乙醇。

5.无水乙醇置-20℃冰箱中保存备用6.70%乙醇置-20℃冰箱中保存备用7.核糖核酸酶(10mg/ml)配制方法:称取l0mg核糖核酸酶A(RNaseA,美国SIGMA或中科院上海生物化学研究所东风试剂厂)。

于灭菌的微离心管内,加1 ml 100mmol/pH5.0的NaAC溶液(完全溶解),即为10mg/ml RNase,为了破坏脱氧核糖核酸酶(DNase,置80℃水浴中10min或100℃水浴2 min,然后置一20℃(或家用冰箱的冰格内)保存。

四、材料1.菌种:大肠杆菌(pUC57)2.培养基LB液体培养基精解蛋白胨 3g酵母浸出粉 1.5g氯化钠 3 g葡萄糖 0.6g按上述配方用重蒸水(ddH2O或dH2O表示,下同)溶解至300ml。

用10mol/LnaOH 调pH至7.2~7.4。

分装于15ml试管中,每支5ml。

然后置高压蒸汽消毒锅以1.1kg/cm2灭菌20min.l抗菌素:氨苄青霉素(Amp)临用时用无菌水配制在无菌有盖试管中,浓度为100mg/m1。

五、仪器:恒温振荡器。

低温冰箱-20℃真空泵。

台式高速离心机六、说明1.质粒DNA提取的方法很多,有碱变性法、羟基磷灰石柱层析法、溴化乙锭一氯化铯梯度超离心法等。

本次实验是一种小量快速提取法。

小量快速提取法也有多种,但基本原理和步骤是一致的.包括下述步骤:(1)裂解菌体细胞;(2)质粒和染色体DNA的分离;(3)除去蛋白质。

RNA及其他影响限制性酶活性的细胞成分;(4)除去提玑过程中使用的去垢剂、盐等。

2.在基因操作实验中.保存或提取DNA过程中,一般都采用TE缓冲液,而不选用其它的缓冲液。

虽然很多缓冲系统.如磷酸盐缓冲系统,硼酸系统都符合细胞内环境的生理范围,可以作为DNA的保存液,但在某些实验中,这些缓冲对会影响实验。

如在转化实验中,要用到Ca+,如果川磷酸盐缓冲液,磷酸根将与Ca2+产生Ca(PO4+沉淀;在各种工具酶反应时,不同的酶对辅助因子的种类及数量要求不同,有的要求高盐离子浓度,有的则要求低盐浓度,采用Tris—HCI缓冲系统,不存在金属离子的干扰作用;作中的EDTA是二价离子Mg2+、Ca2+等的螯合剂,可降低系统中的这些离子浓度,而这些离产是脱氧核糖核酸酶的辅助因子,所以EDTA可以抑制脱氧核糖核酸酶对DNA的降解作用。

3、TENS中NaOH:核酸在pH大于5,小于9的溶液中稳定,怛当pH大于12或小于3 时,就会引起DNA两条链之间氢键的解离而变性。

TENS中有NaOH使其pH大于12,因而使染色体DNA与质粒DNA变性。

TENS中的SDS:SDS是离子型表面活性剂。

它主要功能有:(1)溶解细胞膜上的脂肪与蛋白质,因而溶解膜蛋白而破坏细胞膜;(2)解聚细胞中的核蛋白;(3)SDS能与蛋白质结合成为R1一O一SO3…R2+一蛋白质的复合物,使蛋白质变性而沉淀下来。

但是SDS能抑制核糖核酸酶的作用,所以在以后的提取过程中,必须把它去干净,防止在下一步操作中(用Rnase去除RNA时)受干扰。

4、3.0mol/L NaAC(pH5.2)使pH大于12的DNA抽提液回到中性,使变性的质粒DNA能够复性,并能稳定存在。

染色体DNA不能复性(染色体DNA不存在超螺旋共价闭合环结构) 而高盐的3mol/L NaAC有利于变性的大分子染色体DNA、RNA、以及SDS—蛋白质复合物凝聚沉淀。

pH5.2也能中和核酸上的电荷,减少相互斥力而互相聚合。

同时,钠盐能与SDS一蛋白质复合物作用后,形成溶解度较小的钠盐形式复合物,使沉淀更完全。

5.饱和酚:酚是一种表面变性剂,属非极性分子。

水是极性分子。

当蛋白质溶液与酚混合合时,蛋白质分子之间的水分子被酚挤走,使蛋白质失去水合状态而变性。

经过离心。

变性蛋白质的密度比水的密度大,因而与水相分离,沉淀在水相下面,酚比重更大,保留在最下层。

酚作为变性剂.也有一些缺点:(1)酚与水有一定程度的互溶,酚相中水的溶解可达大约10%~15%,溶解在这部分水相中有DNA会损失,(2)酚很容易氧化,变成粉红色,氧化的酚容易降解DNA,解决酚氧化和带水的办法是将酚重蒸,除去氧化的部分,再用Tris —HCl缓冲液饱和,使酚不至于夺去DNA中的水,带走部分DNA。

饱和酚中加上8一羟基硅啉及巯基乙醇,防止酚氧化,还是弱的螫合剂.可抑制DNase。

由于有颜色.溶解在酚中后,使酚带上颜色,便于酚相与水相的分肉,酚饱和后,表面盖上一层Tris水溶液,隔绝空气,阻止酚氧化。

6.关于无水乙醇沉淀DNA的说明:用无水乙醇沉淀DNA,是实验中最常用的沉淀DNA的方法。

乙醇的优点是具有极性,可以以任意比例和水相混溶,乙醇与核酸不会起化学反应,对DNA很安全,因此是理想的沉淀剂。

乙醇之所以能沉淀DNA,是由于DNA溶液是以水合状态稳定存在的DNA,当加入乙醇.乙醇会夺去DNA周围的水分子,使DNA失水而易于聚合沉淀,一般实验中,用2倍体积的无水乙醇与DNA相混合。

使乙醇的最终含量占67%左右。

由此可预见,也可用95%乙醇沉淀DNA,但是用95%乙醇使总体积增大.而DNA在醇溶液中总有一定程度的溶解。

因而DNA损失也增大,影响收率。

乙醇沉淀DNA溶液时,DNA溶液中应该有一定的盐浓度,中和DNA表面电荷。

如果溶液中盐浓度太低,要加NaAC或NaCl至最终浓度O.1一O.25mol/l在pH 8左右的DNA 溶液中,DNA分子带负电荷,加一定浓度的NaAC或NaCl使Na+中和DNA分子上的负电荷,减少DNA分子之间的同性电荷相斥力,易于互相聚合而形成DNA钠盐沉淀。

当加入的盐溶液浓度太低时。

只有部分DNA形成DNA钠盐而聚合,这样就造成DNA沉淀不完全。

但当加入的盐溶液浓度太高时,其效果也不好,在沉淀的DNA中,由于过多的盐杂质存在,影响DNA的酶切等反应,必须进行洗涤或重沉淀。

乙醇沉淀DNA.一般采用低温条件,这是由于在低温条件下.分子运动大大减少,DNA 易于聚合而沉淀。

为了使质粒DNA能充分沉淀,一般保存时间总是过长的,同时也要视样品的体积而异,在微量离心管中的样品要比40毫升离心管中DNA样品的量少,冷却就较迅速。

大量提取DNA时,目前习惯上常采用如下几种方法:保存在家用冰箱结冰盒内过夜保存在-2℃亡冰箱内过夜保存在-70℃冰箱内 30mm~2h放置干冰中(约-20℃) 30min放置干冰加酒精中(约-70℃) 16mm放置在液氮缸中液氮的气相内,不可以浸在液氮中(温度在-198℃左右)5~15min。

除了用乙醇外还可用1倍体积丙醇(相当于2倍体积乙醇)使DNA沉淀。

用异丙醇的好处是要求离心的液体体积小,但异丙醇挥发性不如乙醇,最终除区其残留部分的难度更大。

此外,异丙醇能促使蔗糖、氯化钠等溶质与DNA一起沉淀,在-70℃时,更易发生,所以一般以乙醇沉淀为宜,除非要求液体体积很小。

7.影响质粒DNA提纯质量和产率因素的说明。

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