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奥鹏南开20春学期-《药物设计学》在线作业

南开20秋学期《药物设计学》在线作业答案01200

南开20秋学期《药物设计学》在线作业答案01200(单选题)1:下列哪条与前体药物设计的目的不符：A:延长药物的作用时间B:提高药物的活性C:提高药物的脂溶性D:降低药物的毒副作用E:提高药物的组织选择性正确答案: B(单选题)2:下列抗病毒药物中，哪种属于碳环核苷类似物？A:XXXB:XXXC:西多福韦D:去羟肌苷E:阿昔洛韦正确答案: A(单选题)3:匹氨西林是广谱半合成抗生素氨苄西林的双酯前药，其设计的主要目的是：A:降低氨苄西林的胃肠道刺激性B:消除氨苄西林的不适气味C:增加氨苄西林的水溶性，改善药物吸收D:增加氨苄西林的脂溶性，促进氨苄西林的吸收E:提高氨苄西林的稳定性，延长作用时间正确谜底: D(单选题)4: 125D是哪类核受体的拮抗剂？A: PRB: ARC: RXRD: PPAR(gamma)E: VDR正确答案: E(单选题)5:药物作用的靶标可以是A:酶、受体、核酸和离子通道B:细胞膜和线粒体C:溶酶体和核酸D:染色体和染色质正确谜底: A(单项选择题)6:下列抗病毒药物中，哪种属于碱基修饰的核苷类似物？A:XXXB:XXXC:去羟肌苷D:利巴韦林E:阿昔洛韦正确答案: D(单项选择题)7:下列哪种技术不能用于新药靶标的发现？A:蛋白质组学技术B:化学信息学C:生物芯片D:化学遗传学E:生物信息学正确答案: B(单选题)8:应用比较力场分析法进行3D-QSAR研究时，主要计算哪几种非共价相互作用力？A:静电场和氢键场B:平面场和静电场C:疏水场和立体场D:静电场和疏水场正确答案: B(单选题)9:药物与靶标之间发生共价键的结合，这种结合属于：A:可逆结合B:不可逆结合正确答案: B(单选题)10:母体药物中可用于前药设计的功能基不包括：A: -O-B: -COOHC: -OHD: -NH2E:上述所有功能基正确答案: A(单项选择题)11:两个不异或分歧的药物经##连接，拼合成新的分子，成为孪药（twin drugs）。

兰大《药物设计学》18春平时作业2

兰大《药物设计学》18春平时作业2------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ (单选题) 1: 1A: AB: BC: CD: D正确答案:(单选题) 2: 1A: AB: BC: CD: D正确答案:(单选题) 3: 关于逐步生长的分子连接法，下面说法错误的是：A: 逐步生长法以一个片段为起点，逐步生长得到一个完整的配体分子的方法B: 在生长的过程中，新加入的片段一般会进行构象分析来确定最佳构象C: 这种的局限性在于难于让分子的生长跨越活性口袋中那些对配体贡献不大的结合区域D: 这种方法可以避免组合膨胀问题正确答案:(单选题) 4: 下列的哪种说法与前药的概念不相符?A: 在体内经简单代谢而失活的药物B: 经酯化后得到的药物C: 经酰胺化后得到的药物D: 经结构改造降低了毒性的药物正确答案:(单选题) 5: 药物作用的靶点可以是：A: 酶、受体、核酸和离子通道B: 细胞膜和线粒体C: 溶酶体和核酸D: 染色体和染色质正确答案:(单选题) 6: 药物的口服吸收率低，应该选用哪种药物设计方法进行改进：A: 分子对接B: 前药设计C: 药效团模型D: 直接药物设计正确答案:(单选题) 7: 药物的极性表面积大于多少，可以认为药物很能被吸收？A: 120 ?2B: 100?2C: 70 ?2D: 60 ?2正确答案:(单选题) 8: 药物与受体相互作用的主要化学本质是：------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ A: 分子间的共价键结合B: 分子间的非共价键结合C: 分子间的离子键结合D: 分子间的静电引力E: 分子间的立体识别正确答案:(单选题) 9: 1A: AB: BC: CD: D正确答案:(单选题) 10: 下列结构中不属于电子等排体的是:A: N2与COB: N3-与NCO -C: 苯与噻吩D: F- 与—O—正确答案:(多选题) 1: 1A: AB: BC: CD: D正确答案:(多选题) 2: 1A: AB: BC: CD: D正确答案:(多选题) 3: 关于基于靶点的药效团模型，下面说法正确的是：A: 这种方法的基本原理是通过分析受体的活性位点及其空间关系，构建出反相的结构，从而得出药效团B: 构建出的反相结构一般包含很多特征C: 通过负片映射的方式构建出的药效团模型可直接用于数据库搜寻D: 通过负片映射的方式构建的药效团模型包含很多特征，必须通过活性配体进一步验证最终获得合理的药效团模型正确答案:(多选题) 4: 要延长药物给药时间，减少给药次数，可用下面哪种药物设计思路：A: 做成前药，使得前药可以缓慢释放B: 软药设计C: 做成前药，降低前药转化成母药的速度D: 硬药设计------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 正确答案: (多选题) 5: 1A: AB: BC: CD: D正确答案:(多选题) 6: 关于全新药物设计方法，下面说法正确的是：A: 全新药物设计方法是一种基于受体的药物设计方法B: 设计根据靶标分子结合位点的几何特征和化学性质，设计出与其相匹配的化合物C: 药物设计过程中只考虑了受体和配体的作用D: 全新药物设计方法设计的化合物可能无法合成正确答案:(多选题) 7: 下列哪些基团可作为氢键供体：A: 羟基B: 氨基C: 羰基D: 甲基正确答案:(多选题) 8: 关于受体活化的两状态模型下面说法正确的是：A: 受体有两种构象，一种活性构象，一种非活性构象，两种构象是动态平衡的B: 激动剂与活性构象结合，将受体稳定在活性构象，使得平衡朝活性构象移动C: 拮抗剂与非活性构象结合，将受体稳定在非活性构象，使得平衡朝非活性构象方向移动D: 激动剂与受体结合后将受体由非活性构象转变成活性构象正确答案:(多选题) 9: 可以与受体形成氢键的基团有：A: 卤素B: 氨基C: 硫醚D: 酰胺E: 酰基正确答案:(多选题) 10: 获得小分子的三维结构可用下面哪些方法：A: 核磁共振B: X-射线晶体衍射C: 同源模建D: 分子结构优化正确答案:(判断题) 1: 酶是目前已知的最为主要的药物作用靶点。

17秋学期《药物设计学》在线作业满分答案

17秋学期《药物设计学》在线作业试卷总分:100 得分:100一、单选题1.药物结构修饰的目的不包括：A.减低药物的毒副作用B.延长药物的作用时间C.提高药物的稳定性D.发现新结构类型的药物E.开发新药正确答案:D2.下列结构中的电子等排体取代是属于：A.一价原子和基团B.二价原子和基团C.三价原子和基团D.四取代的原子E.环系等价体正确答案:A3.##是药物治疗最常见、也是最方便的方式。

A. 口服给药B. 静脉注射C. 肌肉注射D. 皮下注射正确答案:A4. Ca2+信使的靶分子或受体是：A. G蛋白耦联受体B. 离子通道受体C. 钙结合蛋白D. 核受体E. DNA正确答案:C5. 比卡鲁胺是哪类核受体的拮抗剂？A. PRB. ARC. RXRD. PPAR(gamma)E. VDR满分：2 分正确答案:B6. 下列哪种氨基酸衍生物是苯丙氨酸的类似物？A. 四氢异喹啉-3-羧酸B. 2-哌啶酸C. 二苯丙氨酸D. 焦谷氨酸E. 1-氮杂环丁烷-2-羧酸满分：2 分正确答案:A7. 被誉为生命“登月计划”的国际人类基因组计划，我国作为绘制人类基因图谱的六个国家之一，承担了多少测序任务？A. 2%B. 10%C. 1%D. 5%E. 20%满分：2 分正确答案:C8. 药物开发失败率较高的原因中，药物的吸收、分布、代谢、排泄(ADME)性质不佳占：A. 11%B. 39%C. 5%D. 30%E. 10%满分：2 分正确答案:B9. 人类睾丸ACE与躯体ACE的C区相同，三维结构主要部分为alpha-螺旋，与Zn(2+)、两个Cl(-)通道相结合。

与羧肽酶A结构相同的是：A. Zn(2+)结合区域B. Cl(-)结合区域C. 质子化的精氨酸D. alpha-螺旋E. 疏水空腔满分：2 分正确答案:A10. 根据Lipinski规则，可旋转键的个数应为：A. 小于5B. 小于10C. 小于15D. 大于15E. 大于10满分：2 分正确答案:B11. 维系肽的二级结构稳定的主要建和方式是：A. 离子键B. 氢键C. 酰胺键D. 二硫键E. 共价键满分：2 分正确答案:B12. 下列说法错误的是：A. 狭义的电子等排体是指原子数、电子总数以及电子排列状态都相同的不同分子或基团。

计算机辅助药物设计结课作业 DUO

计算机辅助药物设计结课作业学院：生物工程专业：生物制药学号：10045116姓名：冯倩一、利用chemdraw 做5个分子结构或反应式，展示分子至少5种不同显示元素或显示方式NN NH 2H 3CNSCH 3OH ClC 6H 17OO3H COOHOHH 3COHH 3CCH 3CHCHNHCCNCHCH 2N(CH 3)2CH 3二、从RCSB protein data bank 下载蛋白文件，利用chimera 显示其结构，至少包含ribbons ，化学键，原子，表面和文字标记等显示元素三、利用chem3d 做至少2个分子3d图像，包含不同显示方式并标记个别原子或键参数四、利用Arguslab对接至少2个分子，列出对接结果（对接输出结果文件里的内容，如能量等）(1)************************************************* ** ArgusLab (tm) ** ** Version 4.0 ** ** Copyright (c) 1996-2004 ** ** Planaria Software LLC ** ALL RIGHTS RESERVED ** ** info@ ** ** ************************************************************************************************************************WARNING -- ArgusLab may not be used in any manner that competes with the business of Planaria Software LLC or will provide assistance to any competitor of Planaria Software LLC. The licensee of this programis prohibited from giving any competitor of Planaria Software LLC. access to this program. By using this program, the user acknowledges that Planaria Software LLC. is engaged in the business of creatingandlicensing software in the field of computational chemistry and r epresents and warrants to Planaria Software LLC that it is not a competitor of Planaria Software LLC. and that it will not use this program in any manner prohibited above. ***********************************************************************Calculation start time: Tue Jun 18 00:19:58 2013***********************************************Docking ligand: Unnamed***********************************************Ligand atom type information *****************************1. (3768) C : Hydrophobic2. (3769) C : Polar3. (3770) C : Hydrophobic4. (3771) C : Hydrophobic5. (3772) C : Hydrophobic6. (3773) C : Hydrophobic7. (3774) N : Polar8. (3775) C : Polar9. (3776) C : Polar10. (3777) N : Polar11. (3778) C : Polar12. (3779) C : Hydrophobic13. (3780) O : H-bond acceptor14. (3781) O : H-bond acceptor15. (3782) C : Polar16. (3783) C : Hydrophobic17. (3784) C : Polar18. (3785) C : Hydrophobic19. (3786) C : Hydrophobic20. (3787) C : Hydrophobic21. (3788) C : Hydrophobic22. (3789) C : Hydrophobic23. (3790) Cl : Hydrophobic24. (3791) C : Hydrophobic25. (3792) C : Hydrophobic26. (3793) C : Hydrophobic27. (3794) C : Hydrophobic28. (3795) C : Hydrophobic29. (3796) Cl : Hydrophobic30. (3797) I : Hydrophobic31. (3798) C : Polar32. (3799) C : Polar33. (3800) N : Polar34. (3801) C : Polar35. (3802) C : Polar36. (3803) O : H-bond acceptor37. (3804) C : Polar38. (3805) C : Polar39. (3806) O : H-bond acceptor40. (3807) N : Polar41. (3808) H : atom type none42. (3809) H : atom type none43. (3810) H : atom type none44. (3811) H : atom type none45. (3812) H : atom type none46. (3813) H : atom type none47. (3814) H : atom type none48. (3815) H : atom type none49. (3816) H : atom type none50. (3817) H : atom type none51. (3818) H : atom type none52. (3819) H : atom type none53. (3820) H : atom type none54. (3821) H : atom type none55. (3822) H : atom type none56. (3823) H : atom type none57. (3824) H : atom type none58. (3825) H : atom type none59. (3826) H : atom type none60. (3827) H : atom type none61. (3828) H : atom type none62. (3829) H : atom type none63. (3830) H : atom type none64. (3831) H : atom type none65. (3832) H : atom type none66. (3833) H : atom type none67. (3834) H : atom type none***************************************************ArgusDock Search Engine***************************************************Settings for the docking run****************************Number of Ligand torsions = 5Number of Target torsions = 0Precision = Regular PrecisionAugment root node with inner torsions = falseMaximum number of poses = 150Start the dockingLigand extended root node radii: primary = 5.02069, secondary =3.10689, tertiary =2.24397search points from a total of 232 grid pointsRoot node configuration 0Number of candidate poses found = 01 sec. to complete the initial search.No acceptable ligand poses were foundDocking run: elapsed time = 1 seconds(2)************************************************* ** ArgusLab (tm) ** ** Version 4.0 ** ** Copyright (c) 1996-2004 ** ** Planaria Software LLC ** ALL RIGHTS RESERVED ** ** info@ ** ** ************************************************************************************************************************WARNING -- ArgusLab may not be used in any manner that competes with the business of Planaria Software LLC or will provide assistance to any competitor of Planaria Software LLC. 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(3777) C : Polar11. (3778) N : H-bond acceptor12. (3779) C : Polar13. (3780) C : Polar14. (3781) C : Hydrophobic15. (3782) C : Hydrophobic16. (3783) C : Hydrophobic17. (3784) C : Hydrophobic18. (3785) C : Hydrophobic19. (3786) C : Hydrophobic20. (3787) C : Hydrophobic21. (3788) C : Polar22. (3789) O : H-bond acceptor charged23. (3790) O : Polar24. (3791) H : atom type none25. (3792) H : atom type none26. (3793) H : atom type none27. (3794) H : atom type none28. (3795) H : atom type none29. (3796) H : atom type none30. (3797) H : atom type none31. (3798) H : atom type none32. (3799) H : atom type none33. (3800) H : atom type none34. (3801) H : atom type none35. (3802) H : atom type none36. (3803) H : atom type none37. (3804) H : atom type none38. (3805) H : atom type none39. (3806) H : atom type none40. (3807) H : atom type none41. (3808) H : atom type none***************************************************ArgusDock Search Engine***************************************************Settings for the docking run****************************Number of Ligand torsions = 6Number of Target torsions = 0Precision = Regular PrecisionAugment root node with inner torsions = falseMaximum number of poses = 150Start the dockingLigand extended root node radii: primary = 2.72634, secondary =2.48889, tertiary = 0.02378871 search points from a total of 219 grid pointsRoot node configuration 0Number of candidate poses found = 1501 sec. to complete the initial search.pose 0 fitness = -11.0079pose 1 fitness = -11.0077pose 2 fitness = -11.0049pose 3 fitness = -10.9749pose 4 fitness = -10.9615pose 5 fitness = -10.9551pose 6 fitness = -10.8503pose 7 fitness = -10.85pose 8 fitness = -10.8167 pose 9 fitness = -10.8032 pose 10 fitness = -10.7961 pose 11 fitness = -10.7767 pose 12 fitness = -10.7765 pose 13 fitness = -10.7463 pose 14 fitness = -10.7442 pose 15 fitness = -10.7307 pose 16 fitness = -10.6191 pose 17 fitness = -10.6189 pose 18 fitness = -10.586 pose 19 fitness = -10.5725 pose 20 fitness = -10.5166 pose 21 fitness = -10.488 pose 22 fitness = -10.4668 pose 23 fitness = -10.4668 pose 24 fitness = -10.4666 pose 25 fitness = -10.4382 pose 26 fitness = -10.4161 pose 27 fitness = -10.416 pose 28 fitness = -10.3894 pose 29 fitness = -10.3894 pose 30 fitness = -10.3869 pose 31 fitness = -10.352 pose 32 fitness = -10.352 pose 33 fitness = -10.3474 pose 34 fitness = -10.3071 pose 35 fitness = -10.3047 pose 36 fitness = -10.2884 pose 37 fitness = -10.2687 pose 38 fitness = -10.2487 pose 39 fitness = -10.2458 pose 40 fitness = -10.225 pose 41 fitness = -10.2063pose 43 fitness = -10.1952 pose 44 fitness = -10.1702 pose 45 fitness = -10.166 pose 46 fitness = -10.1461 pose 47 fitness = -10.1421 pose 48 fitness = -10.1406 pose 49 fitness = -10.1166 pose 50 fitness = -10.0838 pose 51 fitness = -10.0769 pose 52 fitness = -10.069 pose 53 fitness = -10.0188 pose 54 fitness = -10.0058 pose 55 fitness = -10.0008 pose 56 fitness = -9.97695 pose 57 fitness = -9.97689 pose 58 fitness = -9.97517 pose 59 fitness = -9.94081 pose 60 fitness = -9.93779 pose 61 fitness = -9.93042 pose 62 fitness = -9.92628 pose 63 fitness = -9.92628 pose 64 fitness = -9.90153 pose 65 fitness = -9.90093 pose 66 fitness = -9.89019 pose 67 fitness = -9.88712 pose 68 fitness = -9.87681 pose 69 fitness = -9.85249 pose 70 fitness = -9.84514 pose 71 fitness = -9.84514 pose 72 fitness = -9.81921 pose 73 fitness = -9.80355 pose 74 fitness = -9.77883 pose 75 fitness = -9.76205 pose 76 fitness = -9.67817pose 78 fitness = -9.67231 pose 79 fitness = -9.67153 pose 80 fitness = -9.67153 pose 81 fitness = -9.65614 pose 82 fitness = -9.62655 pose 83 fitness = -9.58561 pose 84 fitness = -9.54429 pose 85 fitness = -9.54393 pose 86 fitness = -9.53493 pose 87 fitness = -9.50018 pose 88 fitness = -9.44296 pose 89 fitness = -9.34436 pose 90 fitness = -9.3299 pose 91 fitness = -9.30555 pose 92 fitness = -9.21655 pose 93 fitness = -9.21076 pose 94 fitness = -9.209pose 95 fitness = -9.19646 pose 96 fitness = -9.19646 pose 97 fitness = -9.19592 pose 98 fitness = -9.19497 pose 99 fitness = -9.19497 pose 100 fitness = -9.17656 pose 101 fitness = -9.16527 pose 102 fitness = -9.14475 pose 103 fitness = -9.13173 pose 104 fitness = -9.12821 pose 105 fitness = -9.11231 pose 106 fitness = -9.08747 pose 107 fitness = -9.07248 pose 108 fitness = -9.04632 pose 109 fitness = -9.04494 pose 110 fitness = -9.019 pose 111 fitness = -9.00933pose 113 fitness = -8.97839 pose 114 fitness = -8.94656 pose 115 fitness = -8.92365 pose 116 fitness = -8.92299 pose 117 fitness = -8.90715 pose 118 fitness = -8.89089 pose 119 fitness = -8.83352 pose 120 fitness = -8.75698 pose 121 fitness = -8.73645 pose 122 fitness = -8.73645 pose 123 fitness = -8.72547 pose 124 fitness = -8.72481 pose 125 fitness = -8.69273 pose 126 fitness = -8.6354 pose 127 fitness = -8.58608 pose 128 fitness = -8.57846 pose 129 fitness = -8.55023 pose 130 fitness = -8.53207 pose 131 fitness = -8.51903 pose 132 fitness = -8.51903 pose 133 fitness = -8.49692 pose 134 fitness = -8.47748 pose 135 fitness = -8.43734 pose 136 fitness = -8.38644 pose 137 fitness = -8.38456 pose 138 fitness = -8.36856 pose 139 fitness = -8.35883 pose 140 fitness = -8.33803 pose 141 fitness = -8.30041 pose 142 fitness = -8.2905 pose 143 fitness = -8.2728 pose 144 fitness = -8.26632 pose 145 fitness = -7.82514 pose 146 fitness = -7.6486pose 148 fitness = -7.06118pose 149 fitness = -7.05466Refining candidate posesClustering the final poses : 71 final unique configurations Number of local searches that succeeded in locating new minima = 3 Re-clustering the final poses : 71 final unique configurationsBest Ligand Pose : energy = -12.893 kcal/molDocking run: elapsed time = 4 seconds五、通过文献检索得到某个靶点小分子药物活性（或毒性）与结构数据，并对其QSAR关系式构建过程进行介绍。

【药物设计学】习题集

《药物设计学》习题集是非题1.利用运算机作化合物的生物活性测定数据的统计分析，称为运算机辅助药物挑选_____2.用三维结构搜寻法设计出的药物，必然是化学结构已知的化合物_____3.当药物作用靶点结构未知时，能够用分子碎片法来设计新的药物分子_____4.分子动力学在运算机辅助药物设计中要紧用于计算药物分子与靶点间彼此作用的结合速度_____5.利用运算机分子模型技术，能够直观地观看药物与靶点之间的彼此作用_____6.当药物受体蛋白的三维空间结构不明白时，能够用已知三维结构，有着相似氨基酸序列、相似来源和相似功能的蛋白质为样板来设计新的药物_____7.用三维结构搜寻法设计出的药物，必然是新化学实体（NCE）_____8.当药物作用靶点结构不明白时，能够用原子生长法来设计新的药物分子_____9.核磁共振技术比X-射线晶体学测得的药物分子三维结构更接近于生物条件下体液中的分子状态_____10.分子力学要紧用于计算化学反映中分子的反映能力_____11.运算机辅助药物设计的软件必需含有数据库、参数运算、数据转换、解析、预测、显示和操作等7个系统_____12.进行比较分子力场分析（CoMFA）的大体条件是已知一系列药物分子的生物活性数据，即便这些分子的三维结构测定数据不明白也无关系_____13.5-羟色胺只能从食物中摄取吸收，不能在体内合成_____14.5-羟色胺在体内发挥神经递质作用后一部份被重摄取，一部份被降解_____15.5-HT3受体为G蛋白偶联受体_____16.甾体类激素的受体为胞内受体_____17.配基门控离子通道的结构为跨膜蛋白质_____18.5-HT3受体抑制剂的要紧临床应用是作为镇痛剂_____19.5-HT3受体的三维结构已经说明，能够用直接药物设计方式进行设计_____20.网上检索专业文献的缺点是难以查找相关的论文_____21.网上检索专业文献有着方便地查找相关的论文的特点_____22.量子力学、分子力学、分子动力学用于计算分子的能量和低能构象_____23.Monte Carlo方式抽样处置的方式是选取最典型的构象式_____24.分子模型方式除能表示出分子的三维结构，还能表示出分子的性质____25.用探针计算网格中分子的性质，探针的步长减小1倍，那么计算量比原先增加1倍_____26.以ChemDraw等分子结构画图软件画出的分子图形可方便地粘贴至Word等文字处置文件中_____27.通过度子碎片法能够计算分子的各类构象的能量_____FA方式属于3D-QSAR方式_____29.用三维结构搜寻方式设计出的药物是化学结构全新的未知化合物_____30.X－射线晶体学比核磁共振技术测定取得的药物分子三维结构更接近于生物条件下体液中的分子状态_____31.分子动力学可用于计算分子的运动轨迹_____32.靶点三维结构已知时可考虑采纳原子生长法来设计新的药物分子_____33.用三维结构搜寻法设计出的药物必然是化学结构已知的化合物_____34.当药物作用靶点未知时，能够采纳分子碎片法来设计新的药物分子_____35.分子动力学要紧用于计算分子间反映的反映速度_____36.利用运算机分子模型技术，能够模拟药物与受体之间的彼此作用_____37.若是设计出的药物分子是新化学实体（NCEs），该进程就称为全新药物设计_____选择填空题（单项选择题）1.由实验方式，能够求得药物分子的三维结构，并与生物条件下体液中的分子状态较为接近。

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浙江大学远程教育学院《药物设计》课程作业姓名：学号：年级：学习中心：—————————————————————————————导论一、简答题1. 药物分子设计过程可大致分为哪两个阶段？简述药物分子设计在新药研发中的重要性。

2．简述先导化合物的发现有哪些途径。

3．发明专利被授权的基本条件有哪些？4．简述药物作用的体内过程。

5．试解释何谓基于靶点的药物设计、基于性质的药物设计和基于结构的药物设计？6．何谓外消旋转换？其优点有哪些？第一章基于筛选途径的药物发现一、名词解释1. 组合化学2. 平行合成和组合合成3. 多组分反应4. 高通量筛选二、简答题1. 固相和液相合成化合物库有哪些优缺点？2. 简述高通量筛选技术的组成。

第二章基于性质的药物设计一、名词解释1. 分布2. 代谢3. 排泄4. 转运5. 消除6. 处置7. 虚拟筛选二、简答题1. 何谓基于性质的药物设计？2. 什么是主动转运？其特点有哪些？3. 什么是细胞旁路转运？第三章基于结构的药物设计一、名词解释1. 药效团2. 药动团3. 毒性基团4. 全新药物设计二、简答题1. 基于结构的药物设计策略中，常用的方法各有什么特点？2. 计算机辅助药物设计中，对于受体的三维结构尚未发现的情况下，常用的三维研究方法有哪些？简述其概况。

第四章先导物的优化一、简答题1. 举例说明孪药设计的目的和方式有哪些？2. 何谓前要原理？前药应具备哪些特征？制备前药一般的方法有哪些？3. 举例说明前药修饰可以达到哪些目的？4. 软药和前药有何区别？软药和硬药有何区别？第五章酶抑制剂和肽拟似物一、名词解释1. 类肽2. 假肽3. β-折叠4. β-转角5. γ-转角6. 肽拟似物7. 竞争性抑制剂8. 非竞争性抑制剂9. 反竞争性抑制剂10. 过渡态类似物可逆抑制剂11. 基于机制的酶失活剂二、简答题1. 天然生物活性肽作为药物使用有哪些缺点，通过化学修饰或改造而获得的理想肽类应具备哪些基本条件？2. 列举通过构象限制设计肽拟似物的具体方法。

南开19秋学期(1709、1803、1809、1903、1909)《药物设计学》在线作业满分答案1

南开19秋学期(1709、1803、1809、1903、1909)《药物设计学》在线作业满分答案1本次《药物设计学》在线作业共有25道单选题，总分100分，本人得分为100分。

以下为部分试题及答案解析。

1.哪个药物是选择性磷酸二酯酶V(PDE-5)抑制剂？正确答案：A 西地那非解析：选择性磷酸二酯酶V(PDE-5)抑制剂是治疗勃起功能障碍的药物，常见的有西地那非、他达拉非、XXX等。

2.根据化合物库的来源不同，发现先导化合物的方法主要分为几类？正确答案：B 4类解析：根据化合物库的来源不同，发现先导化合物的方法主要分为外部先导化合物、内部先导化合物、生物活性类似物、基于靶点的设计等4类。

3.高通量药物筛选发现先导化合物的有效性取决于化合物样品库中化合物的哪些因素？正确答案：D 数量和质量解析：高通量药物筛选发现先导化合物的有效性取决于化合物样品库中化合物的数量和质量。

4.siRNA的单链长度一般为多少个核苷酸？正确答案：A 21～23解析：siRNA是一种短小的RNA分子，由21～23个核苷酸组成，具有特异性的基因沉默作用。

5.药物在完成治疗作用后，可按预先设定的代谢途径和可以控制的代谢速率，转化为无活性和无毒性的药物，这种设计方法称为：正确答案：B 软药设计解析：软药设计是一种药物设计方法，其目的是将药物在治疗作用后转化为无活性和无毒性的药物，以减少药物的不良反应和副作用。

6.下列关于全新药物设计的描述中哪些是错误的？正确答案：B 设计的化合物亲和力要高于已有的配体解析：全新药物设计是一种从头开始设计新的化合物来治疗疾病的方法，其目的是寻找新的药物靶点和化合物结构。

设计的化合物不一定要比已有的配体亲和力更高。

7.胞内信使cAMP和cGMP是由哪种酶分解灭活的？正确答案：B 磷酸二酯酶解析：胞内信使cAMP和cGMP是由磷酸二酯酶分解灭活的。

8.哪种药物是钙拮抗剂？正确答案：C XXX解析：钙拮抗剂是一种治疗心血管疾病的药物，常见的有硝苯地平、维拉帕米等。

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1药物作用的靶点可以是B A. 细胞膜和线粒体B.酶、受体、核酸和离子通道C. 染色体和染色质D. 三者均是2靶点存在于生物体的 C A. 细胞膜上B. 细胞内 C. 细胞膜上或细胞内 D. 各种组织和器官3有关高内涵筛选的特点描述不正确的是AA单独检测样品对细胞生长的影响 B.从单一实验中获得多种相关信息C.及早获得4活性化合物对细胞多重效应的数保持细胞结构和功能的完整性4各国对新专利的保护年限为 D A. 5年B. 5-10年C. 10年D. 15-20年5“反应停”事件的主要原因是A A. 不同对映体活性和毒性的差异B. 不同几何异构活性和毒性的差异C. 不同差向异构活性和毒性的差异D. 不同构象异构活性和毒性的差异6 新药研发过程不包括下列哪一项DA. 制定研究计划，设计实验方案并实施之，获得新化学实体B. 临床前研究，获得研究中的化合物C. 临床实验（或临床验证），获得新药物D. 上市后研究，临床药理和市场推广1. 发明专利被授权的基本条件有ACD A. 新颖性B. 专属性 C. 创造性 D. 实用性2. 广义的“药物发现”的内容包括A BCD A. 非临床开发B. 可行性分析C. 基础研究D. 项目研究3. 临床研究包含ABCD A. I期临床试验B. II临床试验C. III临床试验D. IV临床试验4. 新药研究与开发的经济学特点主要体现在ABD A. 产品的经济性B. 产品风险估算C. 产品的营销D. 产品开发成本核算5. 高通量筛选的特点有ACD A. 专一性和高敏性B. 专属性C. 自动化D. 适用于分析大量化合物6. 下列有关筛选模型的描述是正确的ABCD A. 分为体内和体外模型B. 整体动物模型C. 细胞分子水平D. 可为组织器官7. 下列有关虚拟筛选的描述是正确的ABC A. 其目的是为了提高命中率B. 宜在真实组合合成和高通量筛选之前C. 在化合物类药性的虚拟判断基础上挑选化合物进行合成D. 属于先导物衍生的一种手段8. 立体异构包括A BD A. 几何异构B. 构象异构C. 差向异构D. 光学异构9. 立体异构作用的差异表现在ABCD A. 无治疗作用或弱治疗作用B. 有相反的作用C. 作用相同或具互补性D. 有毒副作1.药物分子设计过程可大致分为哪两个阶段？简述药物分子设计在新药研发中的重要性。

药物设计过程可大致分为先导物的发现和先导物的优化两个阶段，这两个阶段是有机地交互联系在一起的。

在一定意义上，药物的基本属性（安全性、有效性、可控性）是由其化学结构决定的。

因此，构建化学结构就成为创制新药的基础和起始点。

而药物分子设计正是实现构建新药化学结构的主要手段2．简述先导化合物的发现有哪些途径。

发现先导化合物的途径是多种多样的，可归并为筛选途径和合理药物设计两条。

现代筛选途径涉及组合化学、组合库和高通量高内涵筛选；合理药物设计又可分成基于靶点、性质和结构的药物设计三大类3．发明专利被授权的基本条件有哪些？发明专利被授权的基本条件有三：新颖性是所有发明的必要条件，即新化学实体、新合成方法、新治疗作用等；创造性是对新颖性衡量标准的补充；实用性是专利存在的理由，指发明能够制造或使用，并且能产生积极的效果4．简述药物作用的体内过程。

药物作用的体内过程涉及三个方面：药剂相、药动相和药效相。

药剂相需考虑药物理化性质，选择适当的给药系统，获得最佳药物释放度和达到改善药动学性质的目的；药动相决定药物的生物利用度，保证药物能富集于靶点，进入药效相；药效相涉及药物与靶点相互作用的选择性、互补性和结合强度，达到作用专一，避免毒性的目的5试解释何谓基于靶点的药物设计、基于性质的药物设计和基于结构的药物设计？基于靶点的药物设计：以生命科学为基础，根据疾病特异的功能、症状和机制，发现和研究药物作用靶点以及与预防相关的调控过程，据此设计药物的方法；基于性质的药物设计：应用计算机辅助设计的软件，根据配体的理化性质预测吸收、分布、代谢、排泄和毒性，估计药物在体内的释放度和生物利用度，判断类药性，是候选药物取舍的决策依据；基于结构的药物设计：以计算机辅助药物设计为手段，采用直接和间接的药物设计方法，运用受体学说和分子识别原理来设计化合物分子。

6．何谓外消旋转换？其优点有哪些？外消旋转换：将已上市的外消旋药物再开发成单一对映体药物。

其优点有：剂量可减半；使专利期延长；可节约时间降低成本；易于开发成OTC药品。

1. 对先导化合物的描述，不正确的是CA. 具有某种生物活性的化学结构，可作为结构修饰和改造的化合物B. 先导化合物的优化方法一般常利用电子等排原理、前药原理、软药设计原理及结构拼合原理进行C. 新药开发属于药物的化学研究范畴，主要是指先导化合物的发现研究D. 先导化合物的发现在研究开发新药中，优先于剂型研究、设计新化合物、构效关系研究和药物动力学研究2. 通过下列哪个库可以从大量可能具有活性的分子结构中找到能够被预测具有所需理化性质和生物活性的结构 D A. 天然组合化学库B.合成组合化学库C.定向库D.虚拟组合化学库3. 高通量筛选发现先导物的有效性取决于化合物样品库中化合物的哪些因素AA. 数量和质量B. 性质和结构C. 类型和性质D. 理化性质4. 组合化学是利用一些基本的小分子单元，通过化学合成等方法，反复以什么键合方式装配成不同的组合？ BA. 离子键B. 共价键C. 氢键D. 水合作用5. 下列途径哪一个不是天然产物的来源D A.动物群B.植物群C.人体生物化学D.组合化学二、多选题1. 药物发现过程中发现先导物的途径有BC A. 虚拟筛选B. 合理药物设计C. 筛选途径D. 计算机辅助设计2. 分子水平的药物筛选模型可分为A BCD A. 酶筛选模型B. 受体筛选模型 C. 核酸筛选模型D. 离子通道筛选模型3. 化合物可来源于ABCD A. 借助计算机辅助设计手段的合理药物设计B. 组合化学与高通量筛选相互配合的研究C. 天然生物活性物质的合成中间体D. 具有多重作用的临床现有药物4. 组合化学方法所合成的化合物应具有哪些特性？AD A.多样性B.独特性C.氢键D.在亲脂性、电性及空间延展性等有差异5. 化合物库按化合物类型的不同可分为ABD A. 核酸库B. 多肽库C. 糖库D. 有机小分子库6. 固相上进行的组合合成反应需要的条件有ABCD A.载体B.反应底物的连接基团C树脂D.相应的从载体上解离产物的方法7. 用于固相合成反应的载体需要满足的条件有ABD A. 对合成过程中的化学和物理条件稳定B. 有可使目标化合物连接的反应活性位点C. 有强的还原性D. 对所用的溶剂有足够的溶胀性，但不会溶解载体8. 筛选主要包含以下内容BD A. RNA干扰技术B. 药物靶点的选择和确认C. 高通量筛选D. 筛选模型和方法三、名词解释1. 组合化学：利用一些基本的小分子单元，通过化学或生物合成的方法，系统地反复以共价键装配成不同的组合，构建具有结构多样性的化合物库。

2. 平行合成和组合合成平行合成：具有相同功能的多个构件分子与单一构件同时进行同种成键反应。

组合合成：具有相同功能的多个构件分子间同时反应。

二者均为一步生成多种产物，是组合化学的一个基本特点。

3. 多组分反应：指三种或三种以上的反应物同时进行反应。

4. 高通量筛选：又称大规模集群式筛选，将计算机自动化操作、高灵敏度检测、数据结果自动采集等融为一体的新型药物筛选技术。

四、简答题1. 固相和液相合成化合物库有哪些优缺点？固相合成化合物库的优点：1）产物纯化容易，一般只需过滤；2）由于使用过量反应试剂，产物的产率和纯度较高；3）容易实现现代化操作。

固相合成化合物库的缺点：1）需要寻找高效、简便的反应；2）需要比较合适的固相载体、连接分子和将产物从固相上切割断裂的试剂；3）反应过程的监控不如液相的方便、及时。

液相合成化合物库的优点：1）不受反应类型的限制；2）无需设计连接分子和考虑裂解条件的影响；3）反应过程便于跟踪；4）无需切割裂解即可得到最终产物，适合工业化生产。

液相合成化合物库的缺点：1）反应的后处理比较麻烦，产物纯化困难；2）一次合成目标化合物的数量受限制；反应收率要求80%以上。

2. 简述高通量筛选技术的组成。

高通量筛选由5部分组成：即化合物样品库、高特异性的筛选模型、高灵敏度检测系统、自动化操作系统和高效率数据处理系统。

（1）化合物样品库：来源主要有天然产物、组合化学合成的化合物库和各研究机构合成的化合物库；（2）高特异性的筛选模型：常用的筛选模型一般都属于基于分子水平和基于细胞水平的筛选模型；（3）检测系统：灵敏度越高、检测所需样品的量越少越好。

检测一般通过化学发光、荧光、显色反应以及放射性核素检测技术表征生化反应终点；（4）操作系统：高通量筛选的优势在于筛选药物的效率高，只有采用自动化操作系统，通过计算机操作软件控制整个实验过程才能达到目标；（5）数据处理系统：主要承担样品库的管理、生物活性信息的管理、对高通量药物筛选的服务和药物设计与药物发现功能。

一、最佳选择题1. 下述哪个说法不正确D A.阿司匹林在胃中容易被吸收B.可待因在肠中吸收很好C.季铵盐在胃肠道均不易吸收D.布洛芬在肠道吸收很好2. 以下哪个是药物解离度与生物活性间最合理的关系AA. 合适的解离度，有最大的活性B. 增加解离度，离子浓度增加，活性增强C. 增加解离度，不利于吸收，活性下降D. 增加解离度，有利于吸收，活性增强3. 判断化合物具有类药性的最常用规则是B A. 药效团模型 B. Lipinski规则 C. 分子场分析 D. 遗传算法4. 下列有关膜转运蛋白的描述是不正确的是A A. 在细胞核内B. 在生物膜上C. 可为离子通道蛋白 D. 可为膜蛋5. 下列有关分布的描述是不正确的是D A. 一般而言，在血液循环速度较快的组织中，药物的分布速度也较快B. 一般脂溶性的化合物更易透过生物膜 C. 通常碱性强的化合物组织分布更为广泛D. 通常酸性强的化合物组织分布更为广泛6. 下列哪一组参数不属于药动学范畴CA. 速率常数、生物半衰期、清除率B. 生物利用度、血浆蛋白结合率C. lg P、速率常数、清除率D. 速率常数、生物利用度二、多选题1. 以下哪些说法是正确的ADA. 弱酸性药物在胃中容易被吸收B. 弱碱性药物在胃中容易被吸收C. 离子状态的药物容易透过生物膜D. 口服药物的吸收情况与所处的介质的pH有关2. 药物制剂给药后在体内过程中的药动相主要包括ABD A. 吸收B. 代谢C. 处置D. 分布3. 下列哪些因素可能影响药效ABCD A.药物的脂水分配系数B.药物的解离度C.药物的电子密度分布D.药物与受体的亲和力4. 用于预测物质吸收的基本理化参数有A BCD A. 分子的氢键数目B. 解离度C. 分子极性D. 相对分子质量5. 药物透过生物膜的方式有ABCD A. 主动转运B. 促进扩散C. 被动转运D. 胞饮作用6. 就被动转运而言，具有哪些性质的药物分子易于通过生物膜？BCA. 有载体参与的转运B. 具有适宜脂溶性和水溶性C. 相对分子质量不能太大D. 脂溶性大7. 下列有关膜动转运是正确的？AD A. 与生物膜的流动性特征有关B. 有载体参与C. 逆浓度梯度D. 存在部位特异性8. 药物小肠吸收的机制有ABCD A. 主动转运B. 膜动转运C. 被动转运D. 细胞旁路转运9. 下列有关药物代谢的描述是正确的ABC A. 反应的是机体对外来物的处理能力B. 通常代谢产物的极性增大C. 药物代谢主要有I相和II相代谢D. 通常代谢产物的水溶性降低10. 药物排泄的途径有ABCD A. 经肾脏B. 呼吸系统C. 汗腺 D. 唾液腺11. 性质估计测量的方法有ACD A. 简易定性方法B. 最小二乘法C. 高通量筛选法D. 虚拟计算机法12. 体外药动学性质高通量测量法包括ABCD A. 代谢稳定性B. 血浆蛋白结合C. 透膜性D. 代谢的诱导作用13. 通过结构修饰改善药动学主要表现在ABCA. 改善血浆蛋白结合B. 调节与转运体的亲和力C. 降低代谢清除率D. 增加类药性三、名词解释1. 分布：指药物在血液、组织和器官间的可逆转运过程。