第三章 基因克隆的载体
第三章 克隆载体的特征及类型

质粒
质粒DNA的分离纯化
氯化铯密度梯度离心法: 用含有EDTA的缓冲液悬浮菌体 加溶菌酶裂解细菌细胞壁 加CsCl和溴乙锭 超速离心过夜 在紫外灯下吸取cccDNA 稀释沉淀cccDNA RNAs ocDNA L-DNA proteins
质粒
重要的大肠杆菌质粒载体
pGEM-3Z: 多拷贝 装有多克隆位点(MCS) 正选择颜色标记 lacZ’ 装有两个噬菌体的强启动子 用于外源基因的高效表达
ori Apr
pGEM-3E 2743 bp lacZ’
PT7
MCS
PSP6
注意:T7和SP6启动子特异性地由噬菌体DNA编码的RNA聚合 酶所识别,因此相应的受体菌必须表达噬菌体RNA聚合酶,如: E.coli BL21(DE3)等
质粒
质粒的基本特征
质粒的自主复制性:拷贝数的控制机制 – 质粒DNA复制启动控制 控制复制引物与模板的结合
RNA II
3’ 5’
复制方向
5’ 3’
ori
RNA I
rop
(+) Rop
E.coli ColE1 plasmid
RNAII是复制的正向调节分子,RNAI是复制的负调节物
质粒
质粒的基本特征
在重组的 pGEM3Z载体中 加入相应的RNA 聚合酶,可以 发生外源基因 转录。
质粒
质粒DNA的分离纯化
实验室一般使用下列三种方法制备质粒DNA: 氯化铯密度梯度离心法
质粒DNA纯度高、周期长、设备要求高、溴乙锭污染
沸水浴法
质粒DNA纯度底、快速、操作简便
碱溶法 质粒DNA纯度、操作周期介于氯化铯法和碱溶法之间
拷贝数控制系统的干扰,致使两种质粒的最终拷贝数不同,
第三章基因工程载体

大肠杆菌的β-半乳糖苷酶基因lacZ系统
i
PO
lacZ
调控蛋白P
β-半乳糖苷酶 分解半乳糖
17
β-半乳糖苷酶基因lacZ突变体M15
a-互补显色反应(蓝白斑筛选)
i
PO
lacZ -
调控蛋白P
诱导剂IPTG α-肽段
β-半乳糖苷酶-
分解半乳糖
分解X-gal
产物呈现蓝色
18
互补显色反应
19
(四)带有尽可能多的单一限制性酶切位点 单一的限制性酶切位点可供外源DNA定点插入; 较多不同的单一限制酿酶切位点,可有选择地供
6
单链切割 连接
线性DNA (L型)
开环DNA
(oc型)
单链切割 连接
共价闭合环形DNA (SC型)
环形双链的质粒DNA分子具有三种不同构型
7
(三)质粒DNA的理化性质 质数DNA具有一般核酸分子的理化特性。
能溶于水,不溶于乙醇等有机溶剂, 在一定pH下可解离而带电荷 能吸收紫外线,可嵌入某些染料,如溴化乙锭。 比较能抗切割和抗变性。
9
(6)传递性:有些质粒在细菌间能够传递,具有传递性的 质粒带有一套与传递有关的基因。
(7)消除性:存在于宿主细胞中的质粒,可用某些办法将 其去除。
(8)复制类型:严紧型质粒的复制受到宿主细胞蛋白质合 成的严格控制,松弛型质粒的复制不受宿主细胞蛋白质 合成的严格控制。
(9)表现型:不同的质粒有不同的表型。如对抗生素的抗 性等。
个细菌细胞中所含有的质粒DNA分子的数目。
12
根据宿主细胞所含的拷贝数多少,可将质粒分成:
严紧型
低拷贝数的质粒,每个宿主细胞中仅含有 1-3份的拷贝,称这类质粒为“严紧型”复 制控制的质粒(stringent plasmid);
第三章 基因克隆载体

(2)中间质粒克隆载体 T-DNA的部分序列插入大肠杆菌质粒载体而构建。 共整合克隆载体系统(T-DNA同源序列、bom 位点) 双元克隆载体系统——微型Ti质粒
(四)乳酸杆菌质粒克隆载体(略)
乳酸杆菌:G+,非致病,益菌生,用于食品和饮料。 质粒宿主范围广泛:可用于其它G+菌及大肠杆菌。 构建: 乳酸杆菌本身对km、Ap抗性较强。 标记基因: 选用lacZ,如有pLJ1复制启始位点的
一、质粒适于载体构建的性质
1、组成与构型 质粒(plasmid)是染色体外裸 露的双链DNA分子(细菌、真 菌、蓝藻、绿藻)
l-DNA 构型: oc-DNA
2、分子大小: 100~102 kb
3、复制 特点:在宿主细胞内进行单向复制。 质粒和宿主细胞双重遗传系统控制复制强度: 拷贝数(细胞内质粒与染色体数量之比值) (1)每种质粒在其宿主细胞内的拷贝数相对稳 定。
BR:两位主要构建者 322:实验编号
ColE1 松驰型 ,筛选系统复杂。衍生的pMB1 为出发质粒(松弛型复制起始位点,但缺较好 的选择标记基因和克隆位点)。
pSC101(最早用于DNA克隆的载体),严紧 型,含有Tcr 基因。
构建过程(出发质粒:pMB1)
R1(沙门氏菌中分离) 变异 R1drd19
这是Ti质粒用于遗传转化的理论依据。
用野生型Ti质粒获得的转基因植物细胞 只能分裂,不能分化为植株,故不能直接选 育转基因植物。
(2)Vir区
位于T-DNA区上游,其表达产物可激活TDNA的转移,显示致瘤性。
(3)Con区
含有农杆菌之间接合转移有关的基因(tra), 可受宿主产生的冠瘿碱活化,使Ti质粒在细菌 间转移,也即接合转移基因编码区。
《基因工程》第三章 载体2

Such as ultraviolet light
Cell division
Assembled or packaged Lysis of cell and release of mature phage particles
2.λ噬菌体作为克隆载体的依据
①λ噬菌体温和噬菌体,感染性高,易操作。
β—半乳糖苷酶基因(lacZ 和lacZα) β—半乳糖苷酶基因有1021 AAs,基因产物不具酶活性,装配 为四聚体后才有酶活。该蛋白质可分为两部分:α链和β链。前 者负责四聚体装配,后者具β—半乳糖苷酶活性;只有当两者都 存在时,才会表现出酶活性,该作用称之为α-互补作用。这两个 部分可独立存在, 分别由两个基因编码。为α链编码的基因称之 为lacZα(编码145 AAs)。这两个基因(LacZ和LacZα)均可作为 标记基因。 β—半乳糖苷酶基因的优点: a. 酶催化X-Gal水解为兰色产物,检测直观 b. lacZα编码5'-端可容许很大的变化而不影响酶活性 c. lacZα和β链基因的分别表达可使载体小而容量大
荧光素酶基因 荧光素酶或由萤火虫产生的可催化蜜蜂荧光素氧化的酶,并 产生荧光,若在反应中加入CoA,可使灵敏度提高10倍;或由发 光细菌(Photobacterium fischeri)产生的荧光素酶,它与 FMN-氧化还原酶联用,通过NAD(P)H的变化测定酶活。
发光蛋白质基因 发光蛋白是由水母产生的一种可发光的蛋白质,该蛋白质可 使大肠杆菌菌落呈蓝色。
Polylinker or multiple cloning site [MCS]
pUC family
pUCm-T载体(pUCm-T Vector): 1 线性化的载体, 2 载体每条链的3’端带有 一个突出的T。
三四章分子克隆载体---答案_完_

三四章分⼦克隆载体---答案_完_第三章分⼦克隆载体(Molecular cloning vectors)⼀、名词解析1.质粒:质粒是染⾊体外的遗传因⼦,能进⾏⾃我复制(但依赖于宿主编码的酶和蛋⽩质);⼤多数为超螺旋的双链共价闭合环状DNA分⼦(covalently closed circle , cccDNA),少数为线性;⼤⼩⼀般为1~200Kb,有的更⼤。
2.质粒拷贝数:质粒拷贝数(plasmid copy numbers)是指细胞中单⼀质粒的份数同染⾊体数之⽐值,常⽤质粒数/每染⾊体来表⽰。
不同的质粒在宿主细胞中的拷贝数不同。
3.质粒的不相容性:两个质粒在同⼀宿主中不能共存的现象称质粒的不相容性,它是指在第⼆个质粒导⼊后,在不涉及DNA 限制系统时出现的现象。
不相容的质粒⼀般都利⽤同⼀复制系统,从⽽导致不能共存于同⼀宿主中。
4.质粒的转移性:质粒具转移性。
它是指在⾃然条件下,很多质粒可以通过称为细菌接合的作⽤转移到新宿主内。
它需要移动基因 mob ,转移基因 tra ,顺式因⼦ bom 及其内部的转移缺⼝位点 nic。
5.穿梭质粒:既能在真核细胞中繁殖⼜能在原核细胞中繁殖的载体。
这类载体必须既有细菌的复制原点或质粒的复制原点,⼜含有真核⽣物的复制原点,还具备酶切位点和合适的筛选指标。
它⽤来转化细菌,⼜可以⽤于转化真核细胞。
6.α-互补:α-互补是指 lacZ 基因上缺失近操纵基因区段的突变体与带有完整的近操纵基因区段的β-半乳糖苷酶(β -galactosidase ,由 1024 个氨基酸组成)阴性的突变体之间实现互补。
α-互补是基于在两个不同的缺陷β-半乳糖苷酶之间可实现功能互补⽽建⽴的7.温和噬菌体:既能进⼊溶菌⽣命周期⼜能进⼊溶源⽣命周期的噬菌体。
8.溶源性细菌:具有⼀套完整的噬菌体基因组的细菌叫溶源性细菌。
9.整合:如果噬菌体的DNA是被包容在寄主细菌染⾊体DNA中,便叫做已整合的噬菌体DNA。
基因工程-3.1载体

非整合型质粒
所有的质粒都至少含有一段可作为复制起点 的DNA序列, 因此能够在细胞内独立于宿主细胞本身的复 制周期而实现扩增[图2-3(a)]。
小一些的质粒可以利用宿主细胞本身的DNA 复制酶来对自身进行拷贝,而一些较大的 质粒本身携带有能够编码自身质粒复制所 需的专一性酶的基因。
整合型质粒或游离型质粒(episome)
前噬菌体被从宿主细胞切除后,大量新λ 噬菌体DNA 分子通过滚环复制模式被复制出来。形成一个包含 一系列线形基因组的连环体,由COS位点连接在一起。 该内切核酸酶是λ DNA中基因A的表达产物,能够切开 双链DNA分子并形成单链的黏末端,并与其他一些蛋 白相耦联,在将每个λ 基因组包裹入一个噬菌体头 部的过程中发挥作用。
1. 基因组小于10kb:
对一个载体来说恰好处于令人满意的范围。 2. M13基因组的复制型: 非常像质粒,实验时也能够像质粒一样被处理。 3. M13基因组容易从大肠杆菌培养中获得,也能够 通过转染而重新引入。
4. 最重要的是,以M13为载体克隆基因,能够得 到单链形式的DNA。 单链形式的克隆基因在一些技术中能够发挥作 用,尤其是DNA测序和体外突变。
分类:基于质粒的主要特征 本质是质粒的基因
质粒分为以下5种:
(1)致育(fertility)质粒或称F质粒 仅携带转移基因,能促进质粒间有性接合转移; 不再具备其他的特征。 如:大肠杆菌中的F质粒
(2)耐药性(resistance)质粒或称“R”质粒 携带有能够赋予宿主细菌对一种或多种抗菌药的耐 药性的基因,如抗氯霉素、氨苄青霉素或水银。 R质粒通过正常的繁殖而传播, 对细菌感染的治疗产 生深远的影响,如RP4,通常在假单胞菌中被发现, 但也能够在其他细菌中出现
基因工程第三章基因工程的载体

基因工程载体的种类
质粒载体
质粒是一种裸露的、独立于细菌 拟核DNA之外的DNA分子,具有 自我复制能力,可携带外源DNA 片段。
病毒载体
病毒载体是指能够将外源DNA片 段插入到病毒基因组中,并利用 病毒的复制机制将外源DNA片段 导入到受体细胞中的媒介。
基因工程载体的作用
基因转移
基因工程载体能够将外源DNA片 段导入到受体细胞中,实现基因 的转移和表达。
通过优化载体结构,提高其在宿主细胞内的稳定性,降低丢失和突变 的风险。
开发NA的载体,提高基因工 程的效率和安全性。
拓展载体功能
通过基因工程技术对载体进行改造,赋予其新的功能,如表达调控、 靶向输送等。
智能化载体
利用合成生物学和纳米技术,开发具有智能响应能力的基因工程载体, 实现基因治疗的精准化和个性化。
利用基因工程载体生产食品添加剂、 酶制剂等,提高生产效率和产品质量。
THANKS FOR WATCHING
感谢您的观看
此外,噬菌体载体还可以用于疫苗研 发和生物治疗等领域。
04 人工染色体载体
人工染色体的概念与特性
人工染色体是一种通过基因工程技术 构建的染色体,具有与天然染色体相 似的结构和功能。
人工染色体具有高容量、可定制和可 调控等特性,能够承载和表达大量的 外源基因,为基因治疗、生物制药等 领域提供了新的工具。
质粒载体的应用
总结词
质粒载体在基因工程中广泛应用于基因克隆、表达和基因治疗等领域。
详细描述
质粒载体此外,质粒载体还可以用于基因治疗和疫苗研制等领域, 为疾病治疗和预防提供了新的手段。
03 噬菌体载体
噬菌体的生物学特性
基因克隆
基因工程载体可作为基因克隆的 工具,将外源DNA片段插入到载 体中,通过复制和扩增实现基因 克隆。
第三章 基因克隆载体

基因克隆载体(gene cloning vector): 能承 载外源基因,将其带 入受体细胞得以稳定 维持的DNA 分子。
克隆载体的功能
运送外源基因高效转入受体细胞。 为外源基因提供复制能力或整合能力。 为外源基因的扩增或表达提供必要的条件。
克隆载体具备的条件:
载体越小越好。 >10kb的DNA在纯化过程中容易断裂。
② 双抗菌素抗性选择标记
插入失活,分两次先后选择:
没有获得载体的寄主细胞 在Amp或Tet中都死亡。
获得载体的寄主细胞 在Amp或Tet其中之一中死亡。
插入失活筛选法
pBR322质粒载体的筛选
③ 高拷贝数
氯霉素扩增之后,每个细胞可达 1000~3000copy
OC
SC
L
1.1.2 质粒的分类
1)根据质粒自身传递的性质分为: 接合型质粒 能自我转移
非接合型质粒 不能自我转移
接合型质粒
又叫自我转移型质粒。
除了带有自我复制所必需的遗传信息外还带有
一套控制细菌配对和质粒接合转移的基因。 如:F质粒(性质粒、或F因子): 能使寄主染色体上的基因随其一道转移到原先 不存在该质粒的受体菌中。
简称phage 。
蛋白质外壳内包裹着 DNA(双链、单链、 线性、环状等)。
2 噬菌体载体
2.1 噬菌体的一般特性 2.2 λ噬菌体载体的构建 2.3 λ噬菌体载体的类型
2.1 噬菌体的一般特性
类型:
大多数呈带尾部的20面型,相当一部分为线
状体型。
核酸:
核酸多数为DNA,少量为RNA,如烟草花
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
没有获得载体的寄主细胞 在Amp或Tet中都死亡。
获得载体的寄主细胞 在Amp或Tet其中之一中死亡。
外源基因BamH I Amp中存活 但在Tet中死亡
外源基因Pst I Tet中存活 但在Amp中死亡
② 分子小,克隆能力大 载体越小越好。 >10kb的DNA在纯化过程中容易断裂。
③ 高拷贝数
2. 质粒载体相关知识介绍
(4)pBluescript SK
pBluescript SK is similar to the pGEM vectors except that it also carries an origin of replication for a filamentous phage, f1. f1 uses a single stranded DNA molecule as a genome and pBluescript KS
表达型质粒载体
装有强化外源基因表达的转录、翻译、纯 化的元件,主要用来使外源基因表达出 蛋白质产物。
注意启动子的性质,终止子、起始 密码、终止密码的阅读正确。 如果在大肠杆菌里表达,必须把所克隆 的真核生物的基因臵于大肠杆菌的转 录—翻译信号控制之下。
① 表达载体的结构
1)普通载体元件 复制起始点ORI、 选择标记、 多克隆位点MCS
1.质粒的生物学特性
(4)质粒的复制类型 一种质粒在宿主细胞中存
在的数目称为该质粒的拷贝数。据拷贝数将质粒分为 两种复制型:“严紧型”质粒(stigent plasmid), 拷贝数为1-3;“松弛型”质粒(relaxed plasmid), 拷贝数为10-60。不过,即使是同一质粒,其拷贝数在 不同的寄主细胞间也可能有很大的变化。
基因工程
华中师范大学生命科学学院 陈明清
《基因工程原理》
第一章 导 论
第二章 基因操作的工具酶
第三章 基因克隆的载体
第四章 基因克隆的策略
第五章 克隆基因的表达
第六章 基因工程的基本技术
第三章
引
基因克隆的载体
言(introduction)
第一节 质粒载体(plasimid vectors) 第二节 噬菌体载体(phage vectors)
can be used to generate ssDNA. If a host cell carrying such a plasmid, superinfection with phage f1 leads to production of phage containing plasmid DNA.
氯霉素扩增之后,每个细胞可达 1000~3000copy
④ 安全
失去了转移蛋白基因mob(mobilization)。 不能通过接合转移。
pBR322的缺点 保留了转移蛋白(mob)的作用位点。
能够被ColK质粒编码的mob蛋白识别, 如果再有F质粒的参与,就有可能转移!
PBR322的改进 ① 删除mob识别位点 (如质粒pBR327、pAT153等)。 pAT153: 从pBR322上切去HaeII片断,既除 去了mob识别位点,又增加质粒的 拷贝数。
1.质粒的生物学特性
(2)质粒的大小差异很大,最小的只有1kb,只能
编码中等大小的2-3种蛋白质分子,最大的达到 200kb。
(3)质粒的生存 在寄主细胞中“友好”地“借
居”,离开了寄主它本身无法复制,它可以赋 予 寄主一些非染色体控制的遗传性状,以 利于寄 主的生存。比如,对抗菌素的抗性,对重金属 的抗性等。
第三章
基因克隆的载体
引 言(introduction) 第一节 质粒载体(plasimid vectors) 第二节 噬菌体载体(phage vectors)
第三节 柯斯质粒载体(cosmid vectors)
② 改造EcoR I 位点 pBR325:
使EcoRI 也成为插入失活型位点。 在pBR322位点上接入一段来自噬菌 体PICm的HaeII酶切片断(带有氯霉 素抗性基因cmlr)。 cmlr上也带一个EcoRI位点。
2. 质粒载体相关知识介绍
(2)pUC
University of California的J. Messing和J. Vieria于 1978年,在pBR322 的基础上改造而成。 属正选择载体。 pUC7、pUC8、 pUC9、pUC10、 pUC11、pUC18、 pUC19
(5)质粒的不亲和性两种亲缘关系密切的不同
质粒不能在同一宿主细胞中稳定共存。已鉴别出25个 以上大肠杆菌质粒的不亲和群,它们之间是相容的。
1.质粒的生物学特性
(6)质粒的存在形式有超螺旋、开环双螺旋和
线状双螺旋三种,
双螺旋共价闭合 环线状双螺旋 (两个裂口)
质粒空间构型与电泳速率
第三节 柯斯质粒载体(cosmid vectors)
第四节 人工染色体载体(B/Y/HAC)
第一节 质粒载体
(plasimid vectors)
1、质粒的生物学特性
2、质粒载体相关知识介绍
1.质粒的生物学特性
(1)质粒是一种广泛从在于细菌细胞中染色体以
外的能自主的复制
的裸露的环状双链 DNA分子,比病毒更 简单。在霉菌、蓝 藻、酵母和一些动 植物细胞中也发现 了质粒,目前对细 菌的质粒研究得比 较深入,特别是大 肠杆菌的质粒。
(2)长度
4363bp
(3)选择标记 氨苄青霉素和四环素抗性。
(4)克隆位点
24个克隆位点。
其中9个会导致Tetr基因失活(如 BamH I、Hind Ⅲ、Sal I); 3个会导致Ampr基因失活(Sca I、 PvuI、Pst I)。
pBR322的优点 ① 双抗菌素抗性选择标记 插入失活,分两次先后选择:
选择标记基因:在基
因工程中的一类用于选择 转化细胞(菌)的抗性基 因,通常是一些抗生素抗 性基因,比如对氨苄青霉 素、四环素、氯霉素、卡 那霉素以及潮霉素等具有 抗性的基因。这样,通过 在培养基中加入特定的抗 生素就可以选自得到转化 的细胞(菌)。
2. 质粒载体相关知识介绍
(1)PBR322
加反应液
C. 具备多克隆位点(MCS),而且可携带外源DNA片段的长 度范围较宽。
D. 自身分子量较小,在寄主细胞中的拷贝数高,易于操作和 DNA的制备。
Characteristics of vectors for gene cloning
Foreign gene
MCS
Marker
第三章
基因克隆的载体
引 言(introduction) 第一节 质粒载体(plasimid vectors) 第二节 噬菌体载体(phage vectors)
连接
pBR322 4363
Tet or Amp
Tet + Amp
CK+
pBR322: F. Bolivar和R.L. Rodriguez人工构建载体。 (1)元件来源
① 复制起点 ori pMB1系列(来源于ColE1) 的高拷贝型复制起点 ② Ampr基因 pSP2124质粒的Ampr基因 ③ Tetr基因 pSC101的Tetr 基因。
所以含有这类载体的菌落就很容易在含有底物 XGal和诱导物IPTG的平板上分辨出来。因为这类菌落中
释放出的蓝 色物质可以 将整个菌落 染成蓝色, 非常容易辨 别。
However, Cloning of DNA inserts into one of the unique sites in the polylinker can inactivates the lacZ gene and leads to colourless colonies on XGal/IPTG plates, allowing for ready detection of colonies carrying cloned DNA.
2)大肠杆菌操纵子元件
阻遏基因 I 操纵基因O 启动基因P 核糖体结合位点序列(SD) 转录终止信号区。
2. 质粒载体相关知识介绍
( 4 ) pET
pET vectors are designed to allow the expression of cloned genes to proteins. pET-5 has a region encoding an eleven amino acid stretch of protein before EcoRI and BamHI restriction sites. Cloning into these sites results in expression of the cloned insert as a fusion protein. Use of NdeI enzyme in cutting vector and insert allows existed codon to be replaced by the initiation codon of the insert, resulting in expression of the insert with no fusion.
同一质粒尽管分子量相同,不同的构 型电泳迁移率不同:
scDNA最快、l DNA次之、ocDNA最慢。
OC L
SC
1.质粒的生物学特性
质粒的可转移性
革兰氏阴性菌的质粒可分成两大类:
• 接合型质粒 能在天然条件下自发地从一个细 胞转移到另一个细胞(接合作用),如F、Col、R质粒 等 非接合型质粒 不能在天然条件下独立地发生
(1)元件来源 ① 复制起点 ② Ampr 基因 pBR322的 ori pBR322的Ampr基因
但其上失去了克隆位点。 ③ lacZ的启动子 ④ lacZ’基因
大肠杆菌lacZ的-肽链序列, 是LacZ 的氨基端片断。