丙型肝炎病毒基因分型ppt课件
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丙型病毒性肝炎课件
丙型病毒性肝炎课件一、介绍丙型病毒性肝炎，是一种由丙型肝炎病毒（HCV）引起的全球性传染病。
丙肝是一种严重的公共卫生问题，其发病率在全球范围内均较高，且近年来呈现出不断上升的趋势。
作为一种病毒性肝炎，丙肝对患者健康的危害极大，可引起肝脏的炎症、坏死和纤维化，甚至可能发展为肝硬化和肝癌。
对丙肝的认识、预防和治疗至关重要。
丙肝的传播途径主要包括血液传播、母婴传播和性传播。
在日常生活中，接触感染者的血液、共用注射器、输入未经过严格消毒的血液制品等行为都是丙肝传播的重要途径。
随着纹身、穿刺等行为的普及，丙肝的传播风险也在逐渐增加。
普及丙肝的预防措施，提高公众的健康意识至关重要。
丙肝的临床表现包括乏力、食欲减退、恶心、腹胀等症状，严重者可出现黄疸和出血现象。
由于丙肝感染后症状常不明显，很多患者可能长时间内并未意识到自己已被感染，这使得早期发现和治疗变得更加困难。
对于高危人群来说，定期进行丙肝筛查，及早发现并治疗感染是至关重要的。
在治疗方面，随着医学的不断发展，针对丙肝的治疗方法也在不断进步。
直接抗病毒药物（DAAs）的应用大大提高了丙肝治疗的成功率，为丙肝患者带来了福音。
由于丙肝的特殊性，治疗过程仍需个体化，根据患者的具体情况制定合适的治疗方案。
预防丙肝的发生仍是最佳策略，通过普及健康教育，提高公众的健康意识，减少感染风险，是预防丙肝的关键。
在接下来的课件中，我们将详细介绍丙肝的流行病学特征、临床表现、诊断方法、治疗方法以及预防措施等方面的内容。
1. 丙型病毒性肝炎的定义丙型病毒性肝炎（也称为丙肝）是一种由丙型肝炎病毒（HCV）引起的肝脏感染病。
它是一种严重的公共卫生问题，在全球范围内广泛存在，且感染者数量众多。
丙肝是一种能够通过血液传播、母婴传播以及性接触传播的传染病。
它的感染过程可能悄无声息，许多人在不知不觉中受到感染，了解丙肝的定义和传播方式至关重要。
丙型病毒性肝炎的定义是一种由丙型肝炎病毒引起的肝脏炎症性疾病。
丙肝的病原学和流行病学及丙肝的诊断.pptx课件
《中国丙肝防治指南》
持续性应答
方法 筛选 确诊 疗程 疗效的评估 的预测 ALT/AST X 酶免疫测定 X
(EIA)重组免疫印迹测定 X
(RIBA*)HCV RNA 定性检测 X X
HCV RNA 定量检测 X X
HCV 基因分型 X
病 原 学
HCV 的特性
黄病毒科1有包膜2 单股正链 RNA (9.6 kb)1,33000 氨基酸组成的多聚蛋白3 RNA 聚合酶缺乏校正功能4 —— 准种4T½: 2.7 小时2每日复制量：10 兆 (1012) 病毒颗粒2
1. Purcell RH. NIH Consensus Conference on Hepatitis C. 1997. 2. Neumann AU et al. Science. 1998;282:103-107. 3. Rosenberg S. J Mol Biol. 2001;313:451-464.
急性丙肝的诊断
·流行病学史：有输血史、应用血液制品史或明确的HCV暴露史。·临床表现：全身乏力、食欲减退、恶心和肝区疼痛等，其他可有低热，轻度肝肿大，脾肿大，黄疸。部分患者无明显症状。·实验室检查：ALT多呈轻度和中度升高，抗-HCV和HCV RNA阳性。有上述1+2+3或2+3者可诊断
《中国丙肝防治指南》
WHO. Wkly Epidemiol Rec. 2000;75:18-19.
丙肝病毒感染全球流行概况
·我国是丙型肝炎的高发区，抗-HCV阳性率为3.2%， 近年来有上升趋势
抗-HCV阳性率（％）
国内流行病学调查
《中国丙肝防治ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ南》
·抗-HCV阳性率随年龄增长而逐渐上升，由1岁组的2.0%至50～59岁组的3.9%，无明显性别差异（1） 。·HCV 1b和2a基因型较为常见，其中以1b型为主；6型主要见于香港、澳门和南方边境省份（1）。 ·近年，我国丙肝发病数有明显的上升（2）
持续性应答
方法 筛选 确诊 疗程 疗效的评估 的预测 ALT/AST X 酶免疫测定 X
(EIA)重组免疫印迹测定 X
(RIBA*)HCV RNA 定性检测 X X
HCV RNA 定量检测 X X
HCV 基因分型 X
病 原 学
HCV 的特性
黄病毒科1有包膜2 单股正链 RNA (9.6 kb)1,33000 氨基酸组成的多聚蛋白3 RNA 聚合酶缺乏校正功能4 —— 准种4T½: 2.7 小时2每日复制量：10 兆 (1012) 病毒颗粒2
1. Purcell RH. NIH Consensus Conference on Hepatitis C. 1997. 2. Neumann AU et al. Science. 1998;282:103-107. 3. Rosenberg S. J Mol Biol. 2001;313:451-464.
急性丙肝的诊断
·流行病学史：有输血史、应用血液制品史或明确的HCV暴露史。·临床表现：全身乏力、食欲减退、恶心和肝区疼痛等，其他可有低热，轻度肝肿大，脾肿大，黄疸。部分患者无明显症状。·实验室检查：ALT多呈轻度和中度升高，抗-HCV和HCV RNA阳性。有上述1+2+3或2+3者可诊断
《中国丙肝防治指南》
WHO. Wkly Epidemiol Rec. 2000;75:18-19.
丙肝病毒感染全球流行概况
·我国是丙型肝炎的高发区，抗-HCV阳性率为3.2%， 近年来有上升趋势
抗-HCV阳性率（％）
国内流行病学调查
《中国丙肝防治ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ南》
·抗-HCV阳性率随年龄增长而逐渐上升，由1岁组的2.0%至50～59岁组的3.9%，无明显性别差异（1） 。·HCV 1b和2a基因型较为常见，其中以1b型为主；6型主要见于香港、澳门和南方边境省份（1）。 ·近年，我国丙肝发病数有明显的上升（2）
丙型肝炎病毒ppt课件
-7.95 -3.13 11.54 -42.86
艾滋病
20450 9224 15982 7743
27.37
资料来源：卫生部法定传染病报告系统
18.58
一是作为领导干部一定要树立正确的 权力观 和科学 的发展 观，权 力必须 为职工 群众谋 利益， 绝不能 为个人 或少数 人谋取 私利
HCV感染的自然史
1989
Delineation of HCV genome organization and polyprotein processing
Identification of
hepatitis C virus
1975
Description of non-A, non-B hepatitis
Courtesy of Charlie Rice
一是作为领导干部一定要树立正确的 权力观 和科学 的发展 观，权 力必须 为职工 群众谋 利益， 绝不能 为个人 或少数 人谋取 私利
北京大学医学部
Peking University Health Science Center
丙型肝炎病毒
Hepatitis C Virus
鲁凤民 北京大学感染病中心 北京大学医学部病原生物学系
1
一是作为领导干部一定要树立正确的 权力观 和科学 的发展 观，权 力必须 为职工 群众谋 利益， 绝不能 为个人 或少数 人谋取 私利
病毒性肝炎
viral hepatitis：
由病毒感染引起的肝脏炎症病变
HAV
HDV
风疹病毒（RV）
巨细胞病毒（CMV）
单纯疱疹病毒（HSV） HEV
GBV-C（HGV）
Undiagnosed patients (%)
艾滋病
20450 9224 15982 7743
27.37
资料来源：卫生部法定传染病报告系统
18.58
一是作为领导干部一定要树立正确的 权力观 和科学 的发展 观，权 力必须 为职工 群众谋 利益， 绝不能 为个人 或少数 人谋取 私利
HCV感染的自然史
1989
Delineation of HCV genome organization and polyprotein processing
Identification of
hepatitis C virus
1975
Description of non-A, non-B hepatitis
Courtesy of Charlie Rice
一是作为领导干部一定要树立正确的 权力观 和科学 的发展 观，权 力必须 为职工 群众谋 利益， 绝不能 为个人 或少数 人谋取 私利
北京大学医学部
Peking University Health Science Center
丙型肝炎病毒
Hepatitis C Virus
鲁凤民 北京大学感染病中心 北京大学医学部病原生物学系
1
一是作为领导干部一定要树立正确的 权力观 和科学 的发展 观，权 力必须 为职工 群众谋 利益， 绝不能 为个人 或少数 人谋取 私利
病毒性肝炎
viral hepatitis：
由病毒感染引起的肝脏炎症病变
HAV
HDV
风疹病毒（RV）
巨细胞病毒（CMV）
单纯疱疹病毒（HSV） HEV
GBV-C（HGV）
Undiagnosed patients (%)
丙肝治疗PPT精品医学课件PPT专业课件
死和纤维化的改善情况，可采用国内外 通用的肝组织分级(炎症坏死程度)、分期 (纤维化程度)或半定量计分系统来评价。
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12
病毒学应答
早期病毒学应答(EVR)：指治疗12周时血清HCV RNA
定性检测阴性(或定量检测小于最低检测限)，或定量检测降 低2个对数级(Log)以上。有早期EVR者易获得SVR，无 EVR者不易获得SVR，因此EVR可作为预测SVR的指标。
➢ 转氨酶升高发生在暴露后的2–8 周 ➢ 20–30% 患者出现症状，重型肝炎少见 ➢ 20–50% 可以自发清除病毒，多发生在感染后12周内，
女性或有症状者自发清除率较高
➢ 丙型肝炎慢性化率为50％～85％。 ➢ 40岁以下人群及女性感染HCV后自发清除病毒率较高
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7
丙型肝炎的自然史－慢性丙肝
不会传播丙肝的行为
接吻、拥抱、喷嚏、咳嗽、食物、 饮水、共用餐具和水杯、无皮肤破 损及其他无血液暴露的接触、哺乳、 剖宫产。
备注：部分HCV感染者的传播途径不明。
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6
丙型肝炎的自然史－急性丙肝
➢ 暴露后1–2周血清中能够检测到HCV RNA ，病毒先于 ALT增高和临床症状出现；
➢ 在急性HCV感染者出现临床症状时，仅50％～70％抗HCV阳性，3个月后约90％抗-HCV阳转；
✓ 病变程度判定：病变程度判断可参考中华医学 会传染病与寄生虫病学分会、肝病学分会联合 修订的《病毒性肝炎防治方案》(2000年，西 安)中关于肝脏炎症和纤维化分级、分期的诊断 标准。
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11
抗病毒治疗应答的类型
➢ 生化学应答：ALT和AST恢复正常最。重要！ ➢ 病毒学应答：？？？ ➢ 组织学应答：是指肝组织病理学炎症坏
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病毒学应答
早期病毒学应答(EVR)：指治疗12周时血清HCV RNA
定性检测阴性(或定量检测小于最低检测限)，或定量检测降 低2个对数级(Log)以上。有早期EVR者易获得SVR，无 EVR者不易获得SVR，因此EVR可作为预测SVR的指标。
➢ 转氨酶升高发生在暴露后的2–8 周 ➢ 20–30% 患者出现症状，重型肝炎少见 ➢ 20–50% 可以自发清除病毒，多发生在感染后12周内，
女性或有症状者自发清除率较高
➢ 丙型肝炎慢性化率为50％～85％。 ➢ 40岁以下人群及女性感染HCV后自发清除病毒率较高
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丙型肝炎的自然史－慢性丙肝
不会传播丙肝的行为
接吻、拥抱、喷嚏、咳嗽、食物、 饮水、共用餐具和水杯、无皮肤破 损及其他无血液暴露的接触、哺乳、 剖宫产。
备注：部分HCV感染者的传播途径不明。
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6
丙型肝炎的自然史－急性丙肝
➢ 暴露后1–2周血清中能够检测到HCV RNA ，病毒先于 ALT增高和临床症状出现；
➢ 在急性HCV感染者出现临床症状时，仅50％～70％抗HCV阳性，3个月后约90％抗-HCV阳转；
✓ 病变程度判定：病变程度判断可参考中华医学 会传染病与寄生虫病学分会、肝病学分会联合 修订的《病毒性肝炎防治方案》(2000年，西 安)中关于肝脏炎症和纤维化分级、分期的诊断 标准。
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11
抗病毒治疗应答的类型
➢ 生化学应答：ALT和AST恢复正常最。重要！ ➢ 病毒学应答：？？？ ➢ 组织学应答：是指肝组织病理学炎症坏
丙肝诊断及报告标准ppt课件
病毒
-
隐匿杀手首次现形
• 1989年，由Michael Houghton领导 的研究组首次克隆、鉴定丙肝病毒基 因序列
• （单股正链RNA,NS3有强免疫原性）
RNA基因组
衣壳
丙肝病毒模式图
病毒颗粒 （核心）蛋白
-
HCV 的特性
黄病毒科 有包膜 单股正链 RNA (9.6 kb) 3000 氨基酸组成的多聚蛋白 RNA 聚合酶缺乏校正功能 － 准种（quasi-S） T½ : 2.7 小时 每日复制量：10 兆 (1012) 病毒颗粒 抗HCV不是保护性抗体，是HCV感染的标志。
万)
2006年 2007年 2008年 2009年 2010年 2011年 2012年
13.42 18.03 21.16 24.96 29.16 35.80 43.94
12589 16934 19802 23534 27667 33661 41317
44.86 34.34 17.34 17.98 16.84 22.75 22.74
必须引起重视的丙肝传播 途径
医源性感染 (牙科器械、 内窥镜、介入性操作、外 科手术)
不洁注射
生活方式相关 (文身、美 容、美甲、修脚)
-
J Viral Hepat. 2006 Nov;13(11):775
创伤性操作可能导致丙肝感染率明显上升
患者比例 (%)
100 90 80 70 60 50 40 30 20 10 0
• 基因1-3型呈全球性分布，其中1a和1b占所有HCV感染 的60%以上。
• 欧洲、美洲和亚洲的流行株以1型和2型为主；3型主要流 行于东南亚地区；4型主要流行于中东地区；南非以5型 和6型为主。
• 我国以1b和2a基因型较为常见，但以1b型为主；某些地 区有1a、2b、3b和6a型的报道。
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隐匿杀手首次现形
• 1989年，由Michael Houghton领导 的研究组首次克隆、鉴定丙肝病毒基 因序列
• （单股正链RNA,NS3有强免疫原性）
RNA基因组
衣壳
丙肝病毒模式图
病毒颗粒 （核心）蛋白
-
HCV 的特性
黄病毒科 有包膜 单股正链 RNA (9.6 kb) 3000 氨基酸组成的多聚蛋白 RNA 聚合酶缺乏校正功能 － 准种（quasi-S） T½ : 2.7 小时 每日复制量：10 兆 (1012) 病毒颗粒 抗HCV不是保护性抗体，是HCV感染的标志。
万)
2006年 2007年 2008年 2009年 2010年 2011年 2012年
13.42 18.03 21.16 24.96 29.16 35.80 43.94
12589 16934 19802 23534 27667 33661 41317
44.86 34.34 17.34 17.98 16.84 22.75 22.74
必须引起重视的丙肝传播 途径
医源性感染 (牙科器械、 内窥镜、介入性操作、外 科手术)
不洁注射
生活方式相关 (文身、美 容、美甲、修脚)
-
J Viral Hepat. 2006 Nov;13(11):775
创伤性操作可能导致丙肝感染率明显上升
患者比例 (%)
100 90 80 70 60 50 40 30 20 10 0
• 基因1-3型呈全球性分布，其中1a和1b占所有HCV感染 的60%以上。
• 欧洲、美洲和亚洲的流行株以1型和2型为主；3型主要流 行于东南亚地区；4型主要流行于中东地区；南非以5型 和6型为主。
• 我国以1b和2a基因型较为常见，但以1b型为主；某些地 区有1a、2b、3b和6a型的报道。
《丙肝防治指南》PPT课件
(3)病毒学检查：在治疗过程中采用敏感、 准确的HCV RNA检测方法监测疗效。在基 线、治疗4周、12周、24周、48周以及治疗 结束后24周，检测精血选课H件ppCt V RNA水平有助于 36
②普通IFNa联合利巴韦林治疗方案：IFN-α 3MU每周3次肌肉或精选皮课件p下pt 注射。联合应用利35
监测和随访
(l)治疗前监测：治疗前应检测肝肾功能、 血常规、甲状腺功能、自身抗体、血糖、 尿常规、眼底，可检测IL-28B基因分型。
(2)生化学检测：治疗期间每个月检查ALT ，治疗结束后6个月内每2月检测1次。即使 患者HCV未能清除，也应定期复查ALT。
精选课件ppt
24
聚乙二醇干扰素治疗的绝对禁忌 证
妊娠或短期内有妊娠计划、精神病史 (具有精神分裂症或严 重抑郁症等病史)、未能控制的癫痫、失代偿期肝硬化、 未控制的自身免疫性疾病、伴有严重感染，视网膜疾病， 心衰，慢性阻塞性肺部等基础疾病,未能控制的高血压、 糖尿病，除肝移植外的实体器官移植，对干扰素不良反应 高度不耐受。
失代偿期肝硬化患者HCV的清除有可能降低
肝移植的需求，对该部分患者中长期生存
率的影响需进一步研究；肝移植患者移植
前抗病毒治疗可改善移植前的肝功能及预
防移植后再感染，移植后抗病毒治疗可提
高生存率45。
精选课件ppt
23
抗病毒治疗
DAAs上市之前，PR方案仍是我国现阶段 HCV感染者接受抗病毒治疗的主要方案，可 应用于所有基因型HCV现症感染，同时无治 疗禁忌证的患者48。该方案的治疗禁忌证包 括绝对禁忌证和相对禁忌证(表3)。如患者 具有绝对禁忌证，应考虑使用以直接抗病 毒药物(DAAs)为基础的方案。Βιβλιοθήκη 精选课件ppt29
②普通IFNa联合利巴韦林治疗方案：IFN-α 3MU每周3次肌肉或精选皮课件p下pt 注射。联合应用利35
监测和随访
(l)治疗前监测：治疗前应检测肝肾功能、 血常规、甲状腺功能、自身抗体、血糖、 尿常规、眼底，可检测IL-28B基因分型。
(2)生化学检测：治疗期间每个月检查ALT ，治疗结束后6个月内每2月检测1次。即使 患者HCV未能清除，也应定期复查ALT。
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24
聚乙二醇干扰素治疗的绝对禁忌 证
妊娠或短期内有妊娠计划、精神病史 (具有精神分裂症或严 重抑郁症等病史)、未能控制的癫痫、失代偿期肝硬化、 未控制的自身免疫性疾病、伴有严重感染，视网膜疾病， 心衰，慢性阻塞性肺部等基础疾病,未能控制的高血压、 糖尿病，除肝移植外的实体器官移植，对干扰素不良反应 高度不耐受。
失代偿期肝硬化患者HCV的清除有可能降低
肝移植的需求，对该部分患者中长期生存
率的影响需进一步研究；肝移植患者移植
前抗病毒治疗可改善移植前的肝功能及预
防移植后再感染，移植后抗病毒治疗可提
高生存率45。
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23
抗病毒治疗
DAAs上市之前，PR方案仍是我国现阶段 HCV感染者接受抗病毒治疗的主要方案，可 应用于所有基因型HCV现症感染，同时无治 疗禁忌证的患者48。该方案的治疗禁忌证包 括绝对禁忌证和相对禁忌证(表3)。如患者 具有绝对禁忌证，应考虑使用以直接抗病 毒药物(DAAs)为基础的方案。Βιβλιοθήκη 精选课件ppt29
丙型肝炎病毒Hepatitis C virus.ppt
TT型肝炎病毒，1997年发现，病口途 径传播。
丙型肝炎病毒 （Hepatitis C virus)
生物学性状
包膜病毒 血液中含量少 单正链RNA 至少有6个基因型，90多种亚型
predominant cause of non A non B hepatitis
生物学性状
黄病毒属成员 球形40～60nm,spherical 有包膜an enveloped virion 基因: (+)ss RNA
持续感染者转为慢性 15%病情严重很快发生肝硬化 免疫力：不牢固 急性肝炎诱发肝外损伤：肾小球肾炎
诊断：ELISA法检测抗体，快速筛选输血员
检查病毒RNA
预防：严格筛选输血员，对血制品进行检测，
以防HCV污染。 目前尚无可用疫苗。
丁型肝炎病毒 Hepatitis D virus
生物学性状
丙型肝炎的特点
我国丙肝病毒携带者的比例在2%-5% 随着年龄的增长，丙肝病毒携带率亦增高 易感人群感染HCV后，慢性化的比例高达
50%以上 乙肝患者容易重叠HCV感染
致病性和免疫性
潜伏期： 4-8周 传染源：HCV病毒感染者 传播途径：输血为主 所致疾病：
15%急性肝炎（可完全恢复） 无症状HCV携带者和慢性丙肝者多见,70%
+ssRNA
粪-口
偶尔严重 亚临床,慢 需HBV 孕妇重 性多见 协助
有
无
HBsAg-Ab HBcAb
HBeAg-Ab
疫苗
抗HCV 抗HDV 抗HEV
HCV-RNA IgM
IgM
无
同HBV 预防为主
其他肝炎病毒
庚型肝炎病毒HGV：是1995年发现的并归入 黄病毒科，但尚未在电镜下观察到该病毒 颗粒。它的传播途径类似于丙肝病毒。主 要经肠道外途径或性途径传播。
丙型肝炎病毒 （Hepatitis C virus)
生物学性状
包膜病毒 血液中含量少 单正链RNA 至少有6个基因型，90多种亚型
predominant cause of non A non B hepatitis
生物学性状
黄病毒属成员 球形40～60nm,spherical 有包膜an enveloped virion 基因: (+)ss RNA
持续感染者转为慢性 15%病情严重很快发生肝硬化 免疫力：不牢固 急性肝炎诱发肝外损伤：肾小球肾炎
诊断：ELISA法检测抗体，快速筛选输血员
检查病毒RNA
预防：严格筛选输血员，对血制品进行检测，
以防HCV污染。 目前尚无可用疫苗。
丁型肝炎病毒 Hepatitis D virus
生物学性状
丙型肝炎的特点
我国丙肝病毒携带者的比例在2%-5% 随着年龄的增长，丙肝病毒携带率亦增高 易感人群感染HCV后，慢性化的比例高达
50%以上 乙肝患者容易重叠HCV感染
致病性和免疫性
潜伏期： 4-8周 传染源：HCV病毒感染者 传播途径：输血为主 所致疾病：
15%急性肝炎（可完全恢复） 无症状HCV携带者和慢性丙肝者多见,70%
+ssRNA
粪-口
偶尔严重 亚临床,慢 需HBV 孕妇重 性多见 协助
有
无
HBsAg-Ab HBcAb
HBeAg-Ab
疫苗
抗HCV 抗HDV 抗HEV
HCV-RNA IgM
IgM
无
同HBV 预防为主
其他肝炎病毒
庚型肝炎病毒HGV：是1995年发现的并归入 黄病毒科，但尚未在电镜下观察到该病毒 颗粒。它的传播途径类似于丙肝病毒。主 要经肠道外途径或性途径传播。
慢性丙型肝炎的诊断与治疗ppt课件
医务工作者
性传播可能
暴露于HCV阳性患者体液污染的针头/锐器
性伙伴有HCV感染
诊断流程
检查结果的解释
HCV抗体
阳性
HCV RNA
阳性
解释
急性或慢性HCV感染
阳性
阴性
曾HCV感染缓解；或急性HCV感染期病毒 血症低
早期HCV感染；免疫缺陷患者慢性HCV感 染； HCV RNA假阳性
阴性
阳性
阴性
阴性
• 同样的治疗进程，基因型2、3感染患者对干扰素的持续病 毒学应答率是基因型1感染患者的2-3倍 ，与基因型1感染 患者相比，低剂量的利巴韦林联合聚乙二醇干扰素-α治 疗对感染基因型2、3的慢性丙型肝炎患者疗效较好
丙型肝炎（HCV）的疾病转归
急性丙型肝炎 60%～85% 慢性丙型肝炎 20% ～ 50% 肝硬化 ～ 20% 肝功能 衰竭
～ 20%
肝癌 等待肝移植
Adapted from Brown RS. Epidemiology and Natural History of Hepatitis C. Presented at: ACG Clinical Implications meeting; April 6, 2000; Dallas, TX. NIH Consensus Development Conference Statement. Hepatology. 2002;36(suppl. 1):S3. Davis GL et al. Gastroenterol Clin North Am. 1994;23:603. Koretz RL et al. Ann Intern Med. 1993;119:110. Takahashi M et al. Am J Gastroenterol. 1993;88:240.
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- 3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。
Scheme B Cleavage with BstUⅠ 257bp 6a 227bp 197bp
Scheme C Cleavage with HaeⅢ 234bp
104,74bp 160,74bp 160,74bp
1a
1b
2a
2b
3b
4a and 5a
183,74bp 257bp 4a 5a
Cleavage with ApoⅠ
---/content/hcv-db/index
HCV基因分型方法
测序 型特异性引物PCR分型法
线性探针杂交（InnoLipa)
限制性片段长度多态性分析（RFLP） TRUGENE HCV 5’NC Genotyping Assay
型特异性引物分型法比较(Ohno法和Okamoto法)
TRUGENE HCV 5’NC Kit
HCV基因分型常选用的区域
5’UTR (5’Non-Coding Region)
高度保守 HCV RNA诊断实验的常用区域 有一套良好的多态性特征，因此可用于基因 分型 许多HCV分型商业试剂盒都采用该区进行分 型 TRUGENE HCV 5’NC Genotyping Assay VERSANT HCV Genotyping Assay (LiPA)
Ohno O ,et al. J Clin Microbiol,1997,35:201-207.
线性探针杂交（InnoLipa)
InnoLipa商业试剂盒是欧洲Innogenetics公司(Zwijndre, Belgium) 的产品，其原理为建立在5’UTR基础上的型特异性的探针杂交。 尽管最初该方法的灵敏度比较低，但现在其第2代产品InnoLipaⅡ可 区别1a, 1b, 2a-2c, 3a-3c, 4a-4h, 5a和6a型。
临床工作
常只需将1型和4型与其它基因型相区别，以 决定抗病毒治疗的疗程和利巴韦林的剂量， 因此上述的任何一种方法均可以采用。
NIH Consensus Statement on Management of Hepatitis C: 2002.
临床工作
• 目前常用的基因型检测方法（RFLP, Inno-LiPA, Trugene) 通常建立在5’非编码区，因为该区序 列保守，检测灵敏度高，是HCV RNA诊断实验 的常用区域。
1-21 304-324 28-48 264-284 8,220-8,240 8,657-8,675 8,236-8,258 8,596-8,616
+ + + +
Outer
Inner
NS5BOuterIner中国11个城市258例样品的HCV基因分型结果
城市
1a 克拉玛依 长春 延边 沈阳 辽宁朝阳 北京 常州 上海 西安 1 5 1 1 3 1b 7 10 12 24 10 20 5 15 24 4 8 3 1 1 1 1 10 1 1 3 2 2 1 2 2 1 17 2a 2b 基因型 3a 3b 6a 1b/1a 1 1 1 2 3 3 1b/2a 11(4.3) 16 (6.2) 43(16.7) 33 (12.8) 17(6.5) 26 (10.1) 8 (3.1) 17 (6.5) 39 (15.1)
Scheme A Cleavage with BsrBⅠ,HinfⅠand HaeⅡ 166/169 and 91bp Genotype 1a, 1b and 6a 257bp 127 and 91bp Genotype 3b,4a and 5a 93 and 91bp Genotype 3a
Genotype 2a and 2b
HCV NS5B区 各亚型间基因差异较大 扩增效率较低 若成功扩增，序列分析可区别 HCV各亚型。
应选择HCV基因组中的哪个区进行分型?
应选择何种分型方法?
在HCV分型中应采用何种方法，主要取决于实验 室的现有条件以及分型的目的。
如果需要区分所有亚型，或者鉴别新亚型的存在， 那么就必须进行测序以及进化树分析。
5’UTR
P1 R1 P2 R2 SF2 NS5-2 NS5-1 NS5-4
GGCGACACTCCACCATAGATC GGTGCACGGTCTACGAGACCT CTGTGAGGAACTACTGTCTTC CCCTATCAGGCAGTACCACCA CCCTATGGGCTTCTCATATGA GATGTTATCAGCTCCAGGT TATGACACCCGCTGTTTTGACTC CCTGGTCATAGCCTCCGTGAA
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丙型肝炎病毒基因分型
丙型肝炎病毒基因分型概况
HCV的基因型/亚型
6个型，68个亚型
HCV的基因型/亚型
• • • • • • 1a, b, c, d, e, f, g, h, i, j, k, l, m 2a, b, c, d, e, f, g, h, i, k, l, m 3a, b, c, d, e, f, g, h, i, k 4a, c, d, e, f, g, h, k, l, m, n, o, p, q, r, s, t 5a 6a, b, d, f, g, h, i, j, k, l, m, n
HCV不同基因型5’非编码区酶切位点分析
HCV不同基因型5’非编码区酶切位点分析
HCV不同基因型5’非编码区酶切位点分析
HCV 5’非编码区ABC程序分型法电泳模式图
5’UTR和NS5B区扩增引物
Set Name Primer sequence (5’–3’) Positiona Sense Usage
流行病学调查（需确定亚型）：
扩增，测序：
core/E1区(nt869-1292之间≥90％的序列,H77,AF009606) NS5B区(nt8276-8615之间≥ 90％的序列,H77,AF009606)
进化树分析：
多种替代模式计算的邻近连接法(neighbor-joining)和不加 权配对组算法 (UPGMA)； 最大简约法(parsimony)； 最大可能性法(maximum likelihood)； 中任一种方法进行进化树分析以确定基因型。
• 在临床工作中，对5’UTR进行分型的RFLP, Inno-LiPA, Trugene分型都可以满足分型的需要， 为制定治疗方案和判断预后提供指导。
丙型肝炎病毒5’非编码区ABC程序
复合酶切分型法
HCV 5’非编码区ABC程序复合酶切分型法流程图
HCV 5’UTR gene
Second PCR product=257bp