实习九 近交系数与亲缘系数的计算课件

? RSD ?
[( 1)N ] 2
6
示例：现在289 号公羊的横式系谱如下，可先将其改制 成箭头式系谱，然后计算135 号和181 号间的亲缘系数。
135
90
289
108
16
181
49
???
? ?108 ?
289
??135 ? ?? ?
?
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wenku.baidu.com
90
? ?16 ? ?
? ? ??181 ? ??
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?108 ?
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?
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49
?16 ? ?
7
从上面系谱可看出， 135号和181 号之间，有 108 号和16 号两个共同祖先，其通径路线为：
135 ← 108→ 181
135
90
135 ← 90 → 16 → 49 → 181 代入公式后则得：
289
108
16
181 49
p(135)
(181)
1
? ? ? 181 ? ?
2? 2?1??
?
?
? 108 ?
?
?
?
? ??
49
? 16 ? ?
1 1?1?1
2
2
181 49
4
2、亲缘系数的计算：
（1 ）旁系亲属间的亲缘系数，计算公式为：
? RSD ?
[( 1 ) N ·(1 ?
2
F A)]
(1 ? FS )(1 ? FD )
5
N=n1+n2 ，FS 为父亲的近接系数，FD 为母亲的近接系数， 如果个体S 、D 和A 都不是近交个体，则公式可简化为：
实习九 近交系数与亲缘系 数的计算
一、实验目的
掌握近交系数与亲缘系数的计算方法。
1
二、实习内容
1、近交系数的计算：
? Fx ?
(1 )n1?n2?1·(1 ? 2
FA)
（1）
? Fx
?
1 2
( 1 ) N ·(1 ? 2
FA)
（2）
Fx ? ?
1 n1 ? n 2 ? 1
(
)
2
（3）
（n1 为父亲到祖先的代数，n2 为母亲到祖先的代数， FA 为祖先的近接系数）2。
从系谱可看出， 135 号和181 号之间，有 108 号和16 号
两个共同祖先，其通径路线为：
?
?
?
?
? 108 ?
135 ← 108 → 181 135 ← 90 → 16 → 49 → 191
289
? ?
135
?
?? ?
?
?
?
? ??
90
? 16 ? ?
289
135
90
108
16
F ? {( ) ? ( ) }? (1? 0) (289)
从上例系谱可看出，289号与16号之间的亲
缘关系，有两条通径路线，每条通径的代数
都是3，即：
135
90
289← 135← 90← 16
289
108
16
289← 181← 49← 16
181
49
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另外，289 号公羊还是近交后代，其近交系 数是15.63% ，代入公式后则得：
R(289)(16)
?
上列（1）式和（2）式，算法结果完全相 同，均可运用。（1）式中的n1+n2，也就等 于（2）式中的N；（1）式括号左上方的1， 也就等（2）式括号前的。计算时，首先通过 系谱，把所给系谱划为箭头式系谱，然后通过 此系谱找出父、母到祖先的代数，然后代入公 式，即可计算。
3
示例：现在 289号公羊的横式系谱如下，可 先将其改制成箭头式系谱，然后计算 135 号和 181 号间的亲缘系数。
?
12 (2)
?
(
1 2
)4
?
0.25?
0.0625?
0.3125?
31.25%
8
(2)直系亲缘间的亲缘系数，计算公式为：
? RxA ?
(1)N 1? FA 2 1?F x
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如果共同祖先A和个体X都不是近交所 生，则公式可简化成：
? RxA ?
(1)N 2
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示例：仍用上例系谱，计算289号公与 其祖先16号之间的亲缘系数。
[(1)3
2
?
(1)3] 2
1? 0 ? 1 1? 0.156 4
1 ? 23.25% 1.156
即289 号公羊与祖先 16 号公羊之间的亲缘系 数是23.25% 。
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? 育种学实验考试 ? 选择指数的制订
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