琼脂糖核酸电泳的步骤

合集下载

DNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和操作步骤

DNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和操作步骤

DNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和操作步骤DNA的琼脂糖凝胶电泳是一种常用的分子生物学技术,用于分析DNA 的大小和纯度,以及进行DNA分子的分离和纯化。

凝胶电泳实验可以帮助我们确定DNA样本的大小和获得纯化的DNA片段供进一步研究使用。

下面是DNA琼脂糖凝胶电泳实验的原理和操作步骤。

【原理】DNA琼脂糖凝胶电泳是根据DNA分子在电场中的不同迁移速率来分离大小不同的DNA片段。

琼脂糖凝胶是一种凝胶状物质,其孔隙大小能够将DNA分子限制在一定范围内,较大的DNA分子迁移速率较慢,而较小的DNA分子迁移速率较快。

琼脂糖凝胶通常是在平均浓度为1%至2%之间的范围内制备,以便在不同大小的DNA分子之间提供适当的分辨率。

实验中,DNA样品通过切割酶或PCR等方法获得,样品经过核酸电泳缓冲液稀释,并在琼脂糖凝胶板上进行电泳。

凝胶板两侧连接电源,DNA 的带电粒子将在电场的作用下从负极迁移到正极,迁移过程中形成DNA的“条带”,条带的位置和长度反映了DNA的大小。

通常,DNA条带由荧光染料或核酸染料标记,以便在电泳结束后进行可视化。

【操作步骤】以下是DNA琼脂糖凝胶电泳实验的一般操作步骤:1.制备琼脂糖凝胶板:a.准备琼脂糖粉末和核酸电泳缓冲液(通常为TAE或TBE缓冲液)。

b.按照说明书将琼脂糖粉末溶解于核酸电泳缓冲液中。

c.将溶液加热至沸腾并搅拌,使琼脂糖完全溶解。

d.将溶液倒入预先准备好的电泳仓中,插入梳子或制备好的孔板,使其凝固。

2.样品制备:a.提取DNA样品并测定其浓度。

b. 将DNA样品稀释到适当浓度,通常为10-50 ng/μL。

c. 添加适当的加载缓冲液,通常是一些染料和甘胺酸(glycine)或其他添加剂。

3.DNA加载和电泳:a.打开琼脂糖凝胶仓盖,将DNA样品负载于凝胶孔内。

b.将DNA负载区域和样品标注在电泳仓中,以便在电泳结束后可以准确识别DNA带。

c.关闭盖子,将电泳仓放入电泳设备中。

琼脂糖凝胶电泳详细过程与步骤分析

琼脂糖凝胶电泳详细过程与步骤分析

琼脂糖凝胶电泳详细过程与步骤分析琼脂糖凝胶电泳(agarose gel electrophoresis)是一种常见的分离和鉴定DNA和RNA分子的实验技术。

它基于DNA和RNA分子在电场中对琼脂糖凝胶的移动速率的差异来进行分离。

以下是琼脂糖凝胶电泳的详细过程与步骤分析:1.准备琼脂糖凝胶:-准备琼脂糖溶液:按照规定比例在缓冲液中加入适量的琼脂糖并混匀。

-加热琼脂糖溶液:将琼脂糖溶液加热至完全溶解,通常在微波炉或水浴中进行。

-倒入模具:在凝胶电泳槽中设置模具,倒入热琼脂糖溶液并待其凝固。

2.准备样品:-提取DNA或RNA:采用适当的提取方法从待测样品中提取所需的DNA 或RNA。

-混合DNA或RNA与加载缓冲液:将提取的DNA或RNA与适量的加载缓冲液混合,以增加样品密度并提供电泳所需的离子浓度。

3.加载样品:-打开模具和样品孔:在琼脂糖凝胶上方打开模具,使用注射器或微量吸管在样品孔中加入适量的样品。

-加载DNA或RNA标记物:如果需要对DNA或RNA进行标记,则需要在样品中加入适量的荧光标记物,并在加载完样品后用紫外灯进行可视化检测。

4.进行电泳:-连接电极:将电泳槽连接到电源,将阳极和阴极电极分别插入缓冲液中的两端。

-调节电流:将所需电流值设置在电源上,并进行预运行电流以使电流通过样品和凝胶。

-进行电泳:打开电源,开始电泳过程,直到样品达到适当的分离位置。

5.可视化与分析结果:-停止电泳:当DNA或RNA样品达到预期位置时,关闭电源并断开电极。

-可视化:用染料(如乙溴橙)染色凝胶电泳的凝胶,或使用紫外灯照射凝胶以可视化DNA或RNA标记物的荧光。

-分析结果:使用图像捕捉设备(如凝胶图像系统)记录凝胶的图像,并根据DNA或RNA标记物的迁移距离和大小进行结果分析。

生物化学经典实验DNA琼脂糖凝胶电泳的原理、步骤、试剂配制、结果分析分析

生物化学经典实验DNA琼脂糖凝胶电泳的原理、步骤、试剂配制、结果分析分析

凝胶冷却至50°C,加EB至终浓度0.5μg/ml


凝胶凝固后取出梳子
加电泳缓冲液
准备样品




注意观察溴酚蓝染液的迁移
紫外灯下观察电泳结果


DNA琼脂糖凝胶电泳
实验原理
琼脂糖为链状多糖 →绳状琼脂糖束→大网孔型凝
胶 ——分离、鉴定、纯化DNA
在 pH 值为 8.0~8.3 时,核酸分子碱基几乎不解
离,磷酸全部解离,核酸分子带负电,在电泳时 向正极移动。
采用适当浓度的凝胶介质作为电泳支持物,在分
子筛的作用下,使分子大小和构象不同的核酸分
子泳动率出现较大的差异,从而达到分离核酸片 段检测其大小的目的。
实验原理
当用低浓度的荧光嵌入染料溴化乙啶(Ethidium
bromide, EB)染色, 在紫外光下至少可以检出110ng的DNA条带, 从而可以确定DNA片段在凝胶 中的位置。
此外, 还可以从电泳后的凝胶中回收特定的DNA
条带, 用于以后的克隆操作。
状DNA>开环DNA
DNA片段越长,泳动速度越慢
在低电压时,泳动速度与电场强度成正比
不同浓度琼脂糖分离DNA分子的范围
琼脂糖浓度(W/V,%) 分离范围(kb)
0.3
0.6 0.7 0.9 1.2
5-60
1-20 0.8-10 0.5-7 0.4-6
1.5
2.0
0.2-4
0.1-3
DNA电泳迁移率的对数与凝胶浓度成线性关系。
胶浓(%) 0.6 溴酚蓝 b 0.15kb
2kb
1.6kb
操作步骤
琼脂糖凝胶的制备:溶化,冷却,EB 凝胶板的制备:加梳子,倒胶 样品的制备:样品+1/5体积溴酚蓝

琼脂糖凝胶电泳步骤

琼脂糖凝胶电泳步骤

琼脂糖凝胶电泳步骤实验前准备及注意事项:将所要用到的制胶锥形瓶、胶槽、梳齿等物品清理干净,如有残胶,需将残胶尽量去除。

注意:所有用来跑核酸胶的物品,只要接触过核酸染料,一定要专门放置,专物专用,不要再将污染过的物品随意放置,以免污染其他物品。

接触过核酸染料的手套不要再碰非污染区的物品。

制胶和拿取核酸胶时佩戴一次性PE手套,再操作其他地方时将一次性手套丢弃。

实验步骤:1.按每100ml 1×TAE/TBE缓冲液中加入1g琼脂糖(1%的胶,根据核酸大小选择制胶的浓度,一般情况用1%-2%的胶)的比例,称取琼脂糖,加入专门制琼脂糖凝胶的250ml-500ml的锥形瓶中。

2.按比例量取适量的1×TAE/TBE缓冲液,加入到锥形瓶中的琼脂糖一起,适当摇晃锥形瓶初步混匀。

3.将混合液放入微波炉中,用中高火加热,加热总时间可根据制胶总量调整,一般40ml左右的胶量加热90s左右。

如果制胶量大,记得每加热1min左右将瓶从微波炉中取出,轻轻晃匀后,再继续加热,以免局部过热导致胶溢出。

注意:取出加热后的瓶时,记得垫上纸,防止烫手!4.待胶加热好,完全溶解后,稍晾凉至45-55℃左右(以基本不太烫手为宜)按照1:10000的比例加入核酸染料(如100ml胶加10ul染料),迅速摇匀。

5.将胶槽和梳齿准备好,梳齿可以预先插好,将上一步摇匀的胶倒入胶槽中,一般厚度以60mm左右为宜,具体要根据梳齿的厚度以及样品量来定。

6.待胶变白,基本表示胶已凝好,此时可以将梳齿拔出,一定要竖着往上拔梳齿,不要摇晃,以免样品孔被破坏。

7.在电泳槽中倒入1×TAE/TBE缓冲液,将制好的胶放入缓冲液,以缓冲液没过样品孔为宜。

8.点样:根据样品孔的大小决定上样量,每一排样品孔至少有一个孔用来点DNA Marker。

(上样前确定每个样品和Marker里都已经加了Loading buffer,Loading buffer 的终浓度为1×)9.确定样品孔的方向,核酸带负电,样品孔要在负极,通电后在胶孔中向正极移动。

核酸电泳方法

核酸电泳方法

核酸电泳是一种分离核酸的方法,主要包括琼脂糖凝胶电泳和聚丙烯酰胺凝胶电泳。

以下是两种核酸电泳方法的介绍:
1.琼脂糖凝胶电泳:
(1)将琼脂糖在所需缓冲液中加热熔化成清澈、透明的溶胶,然后倒入胶模中,凝固后将形成一种固体基质,其密度取决于琼脂糖的浓度。

(2)将凝胶置电场中,在中性pH值下带电荷的核酸通过凝胶网孔向阳极迁移,迁移速率受到核酸的分子大小、构象、琼脂糖浓度、所加电压、电场、电泳缓冲液、嵌入染料的量等因素影响。

(3)在不同条件下电泳适当时间后,大小、构象不同的核酸片段将处在凝胶不同位置上,从而达到分离的目的。

(4)凝胶的制备和电泳操作方法包括以下步骤:选择琼脂糖、配制缓冲液、加热熔化琼脂糖、灌制凝胶、电泳、染色和观察。

2.聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE):
(1)聚丙烯酰胺凝胶是由丙烯酰胺和交联剂聚乙烯吡咯烷酮(PVP)在催化剂作用下形成的三维网状结构。

该凝胶具有孔径大小适合核酸分离,且与样品间无反应的特点。

可通过改变基质的百分比来调整孔径大小,从而有效分离不同大小的核酸。

(2)凝胶电泳常用于分离蛋白质,例如SDS-PAGE技术是常用的蛋白表达分析技术之一。

它根据检体中蛋白质分子量大小的不同,使其在电泳胶中分离。

在大肠杆菌表达纯化外源蛋白的实验中,SDS-PAGE 是必不可少的操作步骤。

(3)聚丙烯酰胺凝胶电泳适用于分离同工酶及其亚型、大分子核酸等。

琼脂糖凝胶电泳进行核酸检测的基本流程

琼脂糖凝胶电泳进行核酸检测的基本流程

琼脂糖凝胶电泳进行核酸检测的基本流程下载温馨提示:该文档是我店铺精心编制而成,希望大家下载以后,能够帮助大家解决实际的问题。

文档下载后可定制随意修改,请根据实际需要进行相应的调整和使用,谢谢!并且,本店铺为大家提供各种各样类型的实用资料,如教育随笔、日记赏析、句子摘抄、古诗大全、经典美文、话题作文、工作总结、词语解析、文案摘录、其他资料等等,如想了解不同资料格式和写法,敬请关注!Download tips: This document is carefully compiled by theeditor.I hope that after you download them,they can help yousolve practical problems. The document can be customized andmodified after downloading,please adjust and use it according toactual needs, thank you!In addition, our shop provides you with various types ofpractical materials,such as educational essays, diaryappreciation,sentence excerpts,ancient poems,classic articles,topic composition,work summary,word parsing,copy excerpts,other materials and so on,want to know different data formats andwriting methods,please pay attention!琼脂糖凝胶电泳在核酸检测中的基本流程核酸检测是一种广泛应用于生物医学研究和临床诊断的技术,其中琼脂糖凝胶电泳是其重要步骤之一。

琼脂糖电泳操作步骤

琼脂糖电泳操作步骤
一、电泳前准备
准备内容
作用
1.刷干净电泳制胶的梳子,板子,槽子,蒸馏水洗净晾干
防止不必要的重复污染,减少外来的污染。梳子干净有利于梳孔的形成。
2.检查电泳槽,根据情况更换buffer
排除电泳槽的电极接触不良,确保buffer的缓冲能力,减少污染。
3.根据DNA的分离范围选择合适的胶浓度并记录
Loading buffer浓度不宜过低,点样时样品不能很好的沉在胶孔里;不宜过高,电泳时容易形成带形的变形。注意混匀。
2.点样
沿着胶孔的边缘匀速加入。尽量避免碰坏胶孔。枪头不要吸过多的气泡,拔起时不要过猛带出样品。每点一个样完,吸取buffer洗枪头,避免样品混杂。如果是有特殊要求,例如回收,强烈建议每点一个样换一次枪头。加样的速度当然是越快越好,注意保证质量。点样的量不要太大,一方面是体积不要太大,溢出污染邻位样品;一方面两不要太大,容易导致脱尾和模糊不清。
3.接通电源,选择合适的电压和时间电泳。
胶孔与电极成水平状态,防止样品跑歪。跑胶期间不时回来看看,防止样品跑出胶等意外发生。
四、染色成像
步骤
注意事项
1.染色
如果胶中没有加入EB,用0.5ug/ml的EB溶液浸染30分钟。
2.调整镜头的拍摄范围和焦距,中不要碰到梳子,尽量保持胶的位置不移动。时间不宜过久,导致胶干燥变形;不宜过短,影响胶内部孔径形成。
5.拔梳子,放入电泳槽。
缓缓地将梳子垂直从梳孔拔出,尽可能使梳子是同时从各个胶孔拔出的。暂时不用的胶最好放入电泳槽电泳液中浸泡。电泳液要浸没胶1mm。
三、上样电泳
步骤
注意事项
1.样品中加入loading buffer使其终浓度为1 X,混匀

琼脂糖凝胶电泳的操作步骤

琼脂糖凝胶电泳的操作步骤如下:1。

制备1%琼脂糖凝胶(大胶用70ml,小胶用50ml):称取0。

7 g(0。

5 g)琼脂糖置于锥形瓶中,加入70 ml(50ml)1×TAE,瓶口倒扣小烧杯.微波炉加热煮沸3次至琼脂糖全部融化,摇匀,即成1。

0%琼脂糖凝胶液.2。

胶板制备:取电泳槽内的有机玻璃内槽(制胶槽)洗干净,晾干,放入制胶玻璃板。

取透明胶带将玻璃板与内槽两端边缘封好,形成模子。

将内槽置于水平位置,并在固定位置放好梳子.将冷却到65℃左右的琼脂糖凝胶液混匀小心地倒入内槽玻璃板上,使胶液缓慢展开,直到整个玻璃板表面形成均匀胶层。

室温下静置直至凝胶完全凝固,垂直轻拔梳子,取下胶带,将凝胶及内槽放入电泳槽中.添加1×TAE电泳缓冲液至没过胶板为止.3。

加样:在点样板或parafilm上混合DNA样品和上样缓冲液,上样缓冲液的最终稀释倍数应不小于1X.用10 ul微量移液器分别将样品加入胶板的样品小槽内,每加完一个样品,应更换一个加样头,以防污染,加样时勿碰坏样品孔周围的凝胶面.(注意:加样前要先记下加样的顺序)。

4. 电泳:加样后的凝胶板立即通电进行电泳,电压60—100V,样品由负极(黑色)向正极(红色)方向移动。

电压升高,琼脂糖凝胶的有效分离范围降低.当溴酚蓝移动到距离胶板下沿约1cm处时,停止电泳。

(5)电泳完毕后,取出凝胶,用含有0。

5 ug/ml的溴化乙锭1×TAE溶液染色约20 min,再用清水漂洗10 min.(6)观察照相:在紫外灯下观察,DNA存在则显示出红色荧光条带,采用凝胶成像系统拍照保存实验原理闭合环状质粒、线性质粒和开环质粒DNA由于构形不同,在加溴化乙锭的琼脂糖凝胶电泳上呈现不同的迁移率,因而在紫外灯下观察,能区别闭合环状质粒DNA(cccDNA)、线性质粒DNA(L-DNA)和开环质粒DNA(ocDNA)。

实验材料和试剂(一)实验样品质粒pUC118(二)试剂1.l DNA/HindIII分子量标准2.溴酚蓝指示剂点样缓冲液0。

琼脂糖凝胶电泳的关键操作

琼脂糖凝胶电泳的关键操作
琼脂糖凝胶电泳是一种常用的生物分子分离和分析方法,其关键操作包括以下几个步骤:
1. 制备琼脂糖凝胶:将适量的琼脂糖粉末加入缓冲溶液中,充分溶解后通过加热使其完全溶解,然后倒入凝胶模具中,等待凝胶固化。

2. 样品准备与加载:将待测样品与一定量的负载缓冲溶液混合均匀,然后用微量移液管将混合液滴加到已经形成的琼脂糖凝胶槽中,确保不产生气泡。

3. 进行电泳:将琼脂糖凝胶槽放入电泳槽中,加入适量的电泳缓冲液,确保液位高过琼脂糖凝胶,然后连接电源,设定适当的电场强度和时间,进行电泳。

4. 染色与可视化:电泳结束后,将琼脂糖凝胶取出,用染色剂进行染色,例如利用乙溴蓝染色DNA,然后用透明胶纸或透明薄膜包裹琼脂糖凝胶,用紫外光透射或背光观察结果。

5. 结果分析:根据琼脂糖凝胶电泳结果,通过与已知标准品比较或使用图像分析软件,对待测样品中的生物分子进行定性和定量分析。

琼脂糖凝胶电泳的操作步骤

琼脂糖凝胶电泳的操作步骤琼脂糖凝胶电泳是一种常用的蛋白质和核酸分析方法。

本文将介绍琼脂糖凝胶电泳的具体操作步骤,帮助读者更好地理解和掌握这一实验技术。

材料准备1.琼脂糖凝胶:根据需要选择合适的琼脂糖凝胶,通常有0.8%、1%和1.5%等不同浓度的琼脂糖凝胶可供选择。

2.海藻酸缓冲液:配制1×TAE缓冲液,将适量的氨基乙酸和琼脂糖溶解在去离子水中,并调整pH值至7.5。

样品制备1.样品处理:将待分析的蛋白质或核酸样品按照实验要求进行处理,例如进行裂解、消化等。

2.加载缓冲液:将样品与适量的样品加载缓冲液混合均匀,通常加载缓冲液中含有甘氨酸、溴酚蓝等成分,有利于负载样品。

凝胶制备1.琼脂糖溶液的制备:将适量的琼脂糖粉末加入到海藻酸缓冲液中,用力搅拌使其充分溶解。

2.加入染色剂:在溶解的琼脂糖溶液中加入适量的染色剂,如溴酚蓝,以便观察凝胶的迁移情况和样品带。

3.准备载玻片:在凝胶电泳槽的两侧放置两块玻璃板,用胶条固定,形成一个长方形的凝胶槽。

4.倒制凝胶:将制备好的琼脂糖溶液倒入凝胶槽中,并用打孔器在凝胶上打孔,用来加载样品。

电泳过程1.样品加载:将经过处理的样品加载到凝胶孔洞中,注意不要溢出或漏掉。

2.正常电泳:将凝胶槽放入电泳槽中,使凝胶完全浸泡在TAE缓冲液中,注意缓冲液的量要覆盖凝胶槽。

3.开启电源:将凝胶槽连接到电源上,并设定合适的电流和电压,开始电泳过程。

4.电泳时间:根据实验需要设定合适的电泳时间,通常为30分钟到数小时不等。

5.关闭电源:在电泳结束后,关闭电源,取出凝胶槽。

凝胶染色和成像1.染色凝胶:将电泳结束的凝胶浸泡在适量的染色液中,常用的染色剂有共染剂、Coomassie蓝等。

2.染色时间:根据染色剂的要求和实验需要,将凝胶浸泡在染色液中一定时间,以达到理想的染色效果。

3.洗涤凝胶:将染色液倒掉,用去离子水洗涤凝胶,去除多余的染色剂。

4.成像和分析:将凝胶放入凝胶成像系统中进行成像,根据需要可进行图像分析和数据提取。

  1. 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
  2. 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
  3. 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。

琼脂糖核酸电泳的步骤
1.用蒸馏水将制胶模具和梳子冲洗干净,放在制胶平板上,封闭模具边缘,架好梳子;
2.根据欲分离DNA片段大小用凝胶缓冲液配制适宜浓度的琼脂糖凝胶:准确称量琼脂糖干粉,加入到配胶
用的三角烧瓶内,定量加入电泳缓冲液(一般20~30 ml);
3.放入到微波炉内加热熔化。

冷却片刻,加入一滴荧光染料,轻轻旋转以充分混匀凝胶溶液,倒入电泳槽
中,待其凝固;
4.室温下30~45分钟后凝胶完全凝结,小心拔出梳子,将凝胶安放在电泳槽内;
5.向电泳槽中倒入电泳缓冲液,其量以没过胶面1mm为宜,如样品孔内有气泡,应设法除去;
6.在DNA样品中加入10×体积的载样缓冲液(loading buffer),混匀后,用枪将样品混合液缓慢加入被
浸没的凝胶加样孔内;
7.接通电源,红色为正极,黑色为负极,切记DNA样品由负极往正极泳动 (靠近加样孔的一端为负)。

一般
60~100V电压,电泳20~40min即可;
8. 根据指示剂泳动的位置,判断是否终止电泳;
9.电泳完毕,关上电源,在凝胶成像仪上观察电泳带及其位置,并与核酸分子量标准Marker比较被扩增产
物的大小。

相关文档
最新文档