GoPubMed简介与使用指南
认识MH，我该了解哪些内容
MH哪些国家、哪些作者做的比较成熟，做了什么？？ 发表的文章主要分布在哪些杂志？？ MH的发展趋势，最近做了哪些研究？？ MH包括了哪些研究方向，研究热点在哪里？？ MH相关的高分文章如何快速定位查找？？
一份关于MH研究的文献分析报告
统计分析
功能菜单
一份关于MH研究的文献分析报告
读者可以根据这些分类快速找到自己需要的文献，而不需 要将检索到所有文献进行阅读！
利用GoPubMed了解以下四个“W”
W
W
W
W
What Who Where When
/
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案例分析
H1N1流感的研究进展
时间分析
国家分析
城市分析
刊物分析
地区分布图
作者分析
主题分析
研究人员关系网
线条越多， 线形越多， 地位越重要
课题发展趋势
高频词列表
按研究领域分类
了解专家们的研究
了解研究的分布
用稿期刊分析
按时间分析
找寻最新文献， 了解研究进展
了解由甲流引起病毒性肺炎 的文章
Pneumonia, Viral [36]
挑选文献并添加至剪贴板
获取全文
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中南大学湘雅医院老年病医学科
MH研究现状
动物实验
哮喘
COPD
囊性肺纤 维化+支 扩
MH研究现状
细胞实验
哮喘
IL-13/TNFa/IL-1/IL-4
HNE
PMA/ATP/E GF
COPD
MH分子生物学机制
MH分子生物学机制
MH分子生物学机制
MH分子生物学机制
ROS
?
MAPKs
MH研究方向与研究靶点的探索
我的Ideas
气道黏液高分泌(Mucus Hypersecretion,MH )指黏 蛋白基因调节、生物合成、分泌释放等全过程， 细菌成分、细胞因子、炎症介质等引起气道MH的 本质是黏蛋白基因过度表达和黏液分泌细胞的增 生。
气道黏液高分泌:病理生理特征
气道黏液高分泌是支气管哮喘、慢性阻塞性肺疾病（ C0PD)、肺囊性纤维化、支气管扩张症等慢性炎症气 道疾病共有的症状和病理生理特征，表现为痰量增多 、腔内粘液潴留、粘膜下腺体肥大和杯状细胞增生等 ，因此导致气道上皮纤毛运动受到抑制，容易诱发继 发性感染，导致通气功能下降，增加相关疾病的发病 率和死亡率。
期刊信息
摘要 相关的Mesh词
链接到维基百科
自动同步生成检索式， 点击“Find it”检索即 可
查找中国内地对HIN1流感
进行疫苗接种研究的文章
点击知识点选择框 +表示逻辑与AND -表示逻辑非NOT 空白表示无限制
检索结果处理
显示文摘 显示文摘 输出文件（ 输出文件（Endnote…… Endnote……） ） 显示统计数据 显示统计数据
GoPubmed—GO+MeSH 知识挖掘工具
GoPubMed是德 国 Transinsight 公 司 和德国德累斯顿大学 合作，利用生物信息学相关知识开发的一个可以对PubMed
检索结果进行探索、分析的工具。
09年初推出的4.0版速度提高了10倍，可在几秒钟内处理数 以百万计的文档。智能搜索保证用户绝不会错失任何一个 文档。凭借新的交互式筛选过程，用户只需几次点击就可 找出少数重要论文。
检索式：mucus hypersecretion[title/abstract]
852篇
长沙 0篇
一份关于MH研究的文献分析报告
检索式：mucus hypersecretion[title/abstract]
852篇
一份关于MH研究文献分析报告
检索式：mucus hypersecretion[title/abstract]
中南大学湘雅医院老干科读书报告会（2014年11月）
GoPubMed数据库
汇 报 人: 邹 勇 指导老师：陈 琼 教授 教授
气道黏液高分泌(Mucus Hypersecretion,MH )
1
MH简介 2 MH研究现状
3
一份关于MH研究的文献分析报告 4 GoPubMed的简介及使用指南
气道黏液高分泌:概念
852篇
一份关于MH研究的文献分析报告
检索式：mucus hypersecretion[title/abstract]
852篇
一份关于MH研究的文献分析报告
高频词列表 按研究领域分类
检索式：mucus hypersecretion[title/abstract] AND Asthma[mesh] 324篇
一份关于MH研究的文献分析报告
检索式：mucus hypersecretion[title/abstract] AND Asthma[mesh] 324篇
一份关于MH研究的文献分析报告
LOGO
科学研究在于不断探索，不断学习，紧跟前 沿
Pubmed的 海量数据相关 但无序，即使 进行主题词检 索后还有大量 的需要阅读后 筛选，怎么办？
利用GoPubMed查找相关文献，并了解以下四 个“W”：What ，Who，Where，When； 了解涉及由H1N1流感引起病毒性肺炎的文章； 查找中国（不含省港澳）对HIN1流感进行疫苗 接种研究的文章
自动显示备选主 题词 鼠标移动至主题 词可显示注解
最近检索 历史
分析功能
四个“W”
气道黏液高分泌:黏液的组成
气道黏液主要由上皮杯状细胞、粘膜下腺体分泌物及组织漏出 液构成，其粘弹性主要由杯状细胞和粘膜下腺体合成分泌的粘 蛋白（mucin,MUC）所决定。迄今为止已发现有21种黏蛋白， 在呼吸道表达的黏蛋白有MUC2、MUCl、MUC4、MUC5AC、MUC5B 、MUC7、MUC8、MUCll和MUCl3共9种，分为膜结合型和分泌型 ，其中MUC2、MUC5AC、MUC5B是气道主要的分泌型黏蛋白， MUC2呈基础性表达，MUC5AC、MUC5B为刺激诱导性表达，以 MUC5AC尤为明显，常作为黏液高分泌模型建立成功与否的标志 。
PubMed与GOPubMed
GO 基因本体 MeSH主题词表 PRO 蛋白质本体
这些本体包 括生物医学 所有概念及 其语义关系
利用GoPubMed了解以下四个“W”
W WW W What Who Where When
案例分析
与：AND，或：OR，非：NOT。当一个检索表达式中
含有两个运以上算符时，顺序为从左至右，括号可以改变运
算顺序。
2.截词符：*，一个词或字拼写出部分字母后面加上一个截词符， 如：chem*表示用词根进行检索。
3.双引号：“”，表示对引号中的短语进行强迫词组检索。
4.检索字段标识符：[]，[]内为字段名称，如：[ti]，[au]，[so]， [la]，[pt]。
找寻最新文献， 了解研究进展
了解抗病毒药物应用于甲流 的情况
Antiviral Agents [382]
期刊信息 摘要
链接到维基百科
相关的Mesh词
自动同步生成检索式， 点击“Find it”检索即
可
查找中国内地使用达菲
治疗甲流的研究文章
点击知识点选择框 +表示逻辑与AND -表示逻辑非NOT 空白表示无限制
PubMed与GoPubMed
Contents
1 PubMed的简要介绍 2 PubMed的使用 (简介)
3 GoPubMed的简要介绍 4 GoPubMed的使用指南
PubMed是什么？特点？
➢ 美国国立医学图书馆（National Library of Medicine，NLM）下属的美国国立生物技术信息中 心(National Center for Biotechnology Information ， NCBI)开发研制的网络数据库。
➢收录文献范围广：医学、药学、生物、保健、护理、 牙科、中医药、医史
pubmed使用教程
检索语法
• 1.自然语言检索 （topics)
在检索栏中输入一个或多个检索词 (系统默认空格为AND 检索） 如：placenta growth oxygen
布尔逻辑运算式：AND OR NOT (运算符须大写） 如：common cold AND vitamin C 将检索出同时包含感冒和维生素C两个检索词的文献。
检索语法
• 自动扩展检索 系统自动对主题词、副主题词进行扩展检索 输入 “hypertension therapy（高血压治疗）
("hypertension"[MeSH Terms] OR "hypertension"[All Fields]) AND ("therapy"[Subheading] OR "therapy"[All Fields] OR "therapeutics"[MeSH Terms] OR "therapeutics"[All Fields])
检索语法
• 2.著者检索(authors)： 著者姓名,姓在前,名首字母在后 限定加字段符 如: genbacev o[AU] smith ab [AU]
检索语法
• 3.期刊检索(NLM Catlog)： 刊名输全称 new england journal of medicine Medline认可的标准缩写形式 如：clin exp immunol[so] 国际标准期刊号 如：1059-1524
▫ 来源于全世界70多个国家和地区的近5000种生物医学期刊， 这些期刊大都经美国卫生健康研究院的文献选择技术评估委 员会Literature Selection Technical Review Committee (LSTRC)评估挑选, 以及美国国立医学图书馆和数据协作采集 专家 （各专业协会）推荐。 ▫ 近年数据涉及37种语种，回溯至1950年的数据涉及60种语种。 数据库47%为美国本土出版的文献， 90%为英文文献，79% 的文献有著者撰写的英文文摘。（以上数据根据2007年11月 数据库提供）。
PubMed使用手册
PubMed使用手册【基本查询方法】•一个检索词：一个单词：在文本框中输入检索词，按GO查询。
含两个单词以上的检索词：需要加双引号，注意是英文输入状态下的双引号。
如："ultrasonic diagnosis"是正确的，“ultrasonic diagnosis”是错误的•两个以上的检索词：可使用AND、OR 连接各检索词。
如："three dimensional ultrasound" AND thyroid •可以在“limit”菜单下限制文献出版的时间、语种等等。
【完全手册】PubMed 系统的主要特点1.词汇自动转换功能（Automatic Term Mapping）在PubMed主页的检索提问框中键入检索词，系统将按顺序使用如下4种表或索引，对检索词进行转换后再检索。
（1）MeSH转换表（MeSH Translation Table），包括MeSH词、参见词、副主题词等。
如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词，就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord词（题名词和文摘词）进行检索。
例如：键入"Vitamin h"，系统将其转换成"Biotin [MeSH Tems] OR Vitamin h [Textword]"后进行检索。
（2）刊名转换表（Journal Tanslation Table），包括刊名全称、MEDLINE 形式的缩写和ISSN号。
该转换表能把键入的刊名全称转换为"MEDLINE缩写[Journal Name]"后进行检索。
如：在检索提问框中键入："new england journal of medicine", PubMed将其转换为"N Engl J Med [Journal Name]"后进行检索。
（3）短语表（Phrase list）。
PubMed的使用
Affiliation [AD] Article Identifier [AID] All Fields [ALL] Author [AU] Comment CorrectionsCorporate Author [CN] Create Date [CRDT] EC/RN Number [RN] Entrez Date [EDAT] Filter [FILTER] First Author Name [1AU] Full Author Name [FAU] Full Investigator Name [FIR] Grant Number [GR] Investigator [IR] Issue [IP] Journal Title [TA] Language [LA] Last Author [LASTAU] Location ID [LID] MeSH Date [MHDA] MeSH Major Topic [MAJR] MeSH Subheadings [SH] MeSH Terms [MH] NLM Unique ID [JID] Other Term [OT] OwnerPagination [PG] Personal Name as Subject [PS] Pharmacological Action MeSH Terms [PA] Place of Publication [PL] PMCID & MIDPublication Date [DP] Publication Type [PT] Secondary Source ID [SI] Subset [SB] Substance Name [NM] Text Words [TW] Title [TI] Title/Abstract [TIAB] Transliterated Title [TT] UID [PMID]Volume [VI]
gopubmed
Gopubmed1. IntroductionGopubmed is a web-based application that provides a convenient interface to access PubMed, a comprehensive database of scientific publications in the field of biomedicine. Developed using the Go programming language, Gopubmed aims to simplify the search and retrieval of scientific articles by leveraging the extensive capabilities of the PubMed database.2. FeaturesGopubmed offers several key features that enhance the user experience and make it easier to access relevant scientific publications:2.1 Search FunctionalityGopubmed allows users to perform advanced searches across the PubMed database based on various criteria such as author, title, keyword, and publication date. The search results are displayed in a user-friendly format, providing essential details about each publication, including the title, authors, abstract, and publication date.2.2 Article DetailsUpon selecting a specific publication from the search results, Gopubmed retrieves and displays detailed information about the article. This includes the abstract, keywords, MeSH terms (Medical Subject Headings), publication type, and other relevant metadata. This feature helps users gather comprehensive information about an article before deciding to further explore its content.2.3 Saved SearchesGopubmed allows users to save their frequently used searches for future reference. This feature enables users to quickly repeat a search without having tore-enter the search criteria. Saved searches can be easily managed and edited, providing flexibility and convenience to the users.2.4 Export and SharingGopubmed provides the ability to export search results and individual articles in various formats including plain text, CSV, and BibTeX. This feature enables users to save, share, and cite articles according to their requirements. The export function further enhances the utility of Gopubmed as a research tool.2.5 User ManagementGopubmed offers user management capabilities, allowing users to create accounts, log in, and personalize their experience. The user accounts enable features such as saving searches, managing preferences, and organizing collections of articles. This functionality adds a level of customization and personalization to the Gopubmed experience.3. BenefitsGopubmed offers several benefits to users in the scientific community:3.1 Easy Access to PubMedPubMed is a vast and well-respected repository of scientific articles, but navigating and searching through the database can be challenging. Gopubmed simplifies the process by providing a user-friendly interface and advanced search options, making it easier for researchers to access the information they need.3.2 Efficient Retrieval of Relevant ArticlesBy leveraging the advanced search capabilities of the PubMed database, Gopubmed enables users to retrieve the most relevant scientific articles based on their specific criteria. This saves time and effort by filtering out irrelevant publications and delivering focused results.3.3 Enhanced Organization and CollaborationWith features such as saved searches, export options, and user accounts, Gopubmed allows users to efficiently organize their research, collaborate with colleagues, and share findings. This promotes knowledge sharing and facilitates collaboration within the scientific community.3.4 Customization and PersonalizationThrough user accounts, Gopubmed enables users to personalize their search experience, save preferences, and create collections of articles. This customization feature enhances usability and tailors the application to the specific needs and interests of individual users.4. ConclusionGopubmed is a powerful web application designed to simplify access to the PubMed database, offering advanced search options, article details, and export capabilities. With its user-friendly interface and personalized features, Gopubmed aims to enhance the research workflow, enabling users to efficiently find and retrieve relevant scientific publications. Whether you are an academic researcher,medical professional, or science enthusiast, Gopubmed can be a valuable tool in your journey for knowledge discovery.Note: This document is a fictional representation and does not describe an actual product or service.。
科研必备工具GoPubMed使用方法详解
GoPubmed
GO+MeSH 知识挖掘工具
GoPubmed
❖ GoPubMed是德国Transinsight公司和德国德累斯顿大学 合作，利用生物信息学相关知识开发的一个可以对 PubMed检索结果进行探索、分析的工具。
小结
GoPubMed是一个对PubMed进行智能检索、分类导 航的理想工具。
检索者可以快速了解检索到的文献概貌和本研究 领域的研究态势,如作者的研究轨迹、论文的年度 分布、全球核心作者及核心期刊、合著者可视化 关系网络图等。
Gopubmed的功能还有许多，等待大家去 挖掘和探索……
PreMedline
未加工、标引(尚 未规范化处理） 的新收文献，这 部分每日更新一 次。
OLDMEDLINE
PubMed
1951-1965年 生物医学文献， 无文摘、未经 主题词标引。
Publisher Supplied Citations
由出版商直接 传输的电子型 文献，每日都 有新加入文献
利用Mesh主题检索，将大量不相关文献剔除
发生频率 哪一天 发生格式 每次发生条目数
PubMed的困惑
Pubmed的海量数据相关但 无序，需要大量阅读后筛选， 怎么办？
PubMed检索缺点
❖为PubMed以布尔逻辑为基础、基于关键词 的检索模型以及检索结果输出的线性排序 机制有两个缺点：
❖（1）要想选择能够产生较好的检索结果的 关键词，用户需要非常熟知检索策略“W”
W WW W What Who Where When
Gopubmed界面
GoPubMed简介与使用指南
用户反馈机制不完 善
目前gopubmed缺乏有效的用户 反馈机制，使得用户在遇到问题 时难以寻求帮助或提出建议。建 议设立专门的用户支持渠道，如 在线客服、用户论坛等，以便更 好地收集用户意见和改进服务。
07
CATALOGUE
总结与展望
对gopubmed的总结评价
学术资源集成
gopubmed成功地将多个学术数据库和资源集成在一个平台上，为用 户提供了便捷的一站式学术搜索体验。
年份等信息。
筛选与排序
用户可以根据需要选择筛选条件（如 发表年份、研究领域等）对检索结果
进行进一步筛选和排序。
高级检索技巧
布尔运算符
使用AND、OR、NOT等布尔运算符可以组合多个关键词进行更精 确的检索。
通配符与短语检索
使用通配符（*）可以进行模糊匹配，而使用双引号（" "）可以进 行短语检索。
药物研发与设计
gopubmed的药物研发与设计功能可以帮助研究者了解药物的作 用机制、靶点预测和药物设计原理，为新药研发提供有力支持。
其他领域应用
01 02
科技项目查新与立项
科研人员和项目管理人员可以利用gopubmed进行科技项目查新和立 项分析，了解相关领域的研究现状和发展趋势，为项目申请和决策提供 重要参考。
个性化设置
用户可以根据自己的需求对导出格式、排序 方式等进行个性化设置，提高使用效率。
05
CATALOGUE
gopubmed应用场景
学术研究与论文写作
文献检索与筛选
gopubmed提供强大的文献检索功能，支持关键词、作者、期刊等多种检索方式，帮助研究者快速找 到相关领域的学术文献。
学术趋势分析
通过gopubmed的学术趋势分析功能，研究者可以了解某一研究领域的发展趋势、研究热点和前沿动 态。
pubmed检索教程
三、PubMed 基本检索规则
著者检索：姓全称在前，名首字母在后，[au]。 如: smith ab[au] “paulsen e”[au]
思考题：中国学者的名字该如何转换呢？ 如： 闻玉梅 卢正宏
17 大家好
三、PubMed 基本检索规则
刊名检索：全称或MEDLINE认可的标准缩写, [so] 如：Journal of investigative dermatology[so] J invest dermatol[so]
11 大家好
（三） PubMed收录数据
MEDLINE Indexed
1966 to prensent 的MEDLINE已标引数据，有MeSH字段和 摘要，每条记录标有： [PubMed-indexed for MEDLINE]
OldMEDLINE
1949-1965年间的MEDLINE数据，无MeSH字段和摘要，每 条记录标有： [PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966]
促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件 的使用。
促进全世界范围内生物技术信息收集的合作。
8
大家好
NCBI网站
9
大家好
NCBI提供的数据库
检索大分子生物学数据 获取GenBank, EMBL等数据库的核酸序列； 获 取 Swiss-port,PIR,PRF,PDB 等 蛋 白 质 序 列 ，
13 大家好
二、PubMed的检索功能
高级检索 检索指南
基本检索输入框
检索工具： 特定文献检索
临床查询 专题查询
个人空间
其他资源： 规范词数据库
期刊数据库 临床试验等
14 大家好
三、PubMed 基本检索规则
pubmed使用指南
4、布尔逻辑检索：系统允许使用布尔逻辑检索，布尔逻 辑运算符要大写（AND、OR或NOT）。 5、剪贴板：使用“send to Clipboard”,可把检索结果存入 剪贴板，剪贴板最多可存放500条记录。只要剪贴板中有 记录，就可点击Clipboard查看其中的记录（记录为 summary格式），粘贴板按记录存放的先后顺序显示记录 题录。 6、当前页显示篇数默认为20篇，如果需要可调整当前页 的篇数“5、10、20、50、100、200、500”篇。检索结果 默认summary格式（题录格式），可以选择display下拉菜 单中的Abstract（文摘），以文摘格式显示。 练习题： 1、检索AIDS（2008年）英文综述文献 2、查找PUBMED收录我院的论文数量
PubMed简介与使用
3.1.2-Citation Matcher
★ Batch Citation Matcher 批量引文匹配
“ ▫ 输入格式： journal_title|year|volume|first_page|author_name|your_ key|
▫ 例： proc natl acad sci u s a|1991|88|3248|mann bj|P320221| proc natl acad sci u s a|1999|89|3271|gould se|P262611| res microbiol|1992|143|467|ivey dm|P259661| science|1987|235|182|palmenberg ac|P122962| eschatology|1993|12|22|public jq|C122332| virology|1993|193|492|hardy me|Q029451|
通配符 *
Examples-使用检索技巧
精确检索 “”
2.2-特定检索 （单一检索条件）
作者检索 期刊检索 日期检索
1 2 3
2.2.1-作者检索
2002年以后收 录的文章可以 作者全名检索
在基本检索框 直接输入： 姓（全称） □ 名（首字母）
使用Tags： “作者姓 名”[au]
使用高级检 索下拉菜单
Info
Retrieval
PubMed简介与使用
认识PubMed PubMed检索 PubMed辅助
1
认识PubMed
1.1-什么是PubMed
Public 面向公众的，免费的
Medline 联机医学文献分析和 检索系统
1.1-什么是PubMed