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知道基因和位点,如何查SNP的rs号码,得到PCR产物序列!丁香园论坛

知道基因和位点,如何查SNP的rs号码,得到PCR 产物序列! [转自丁香园论坛]老板让查SNP的东西。
我有如下SNP的信息,但不知道怎么查SNP的rs号码,没rs号,没序列,没法设计引物,请同志们教我两招啊,插三根鸡毛:基因:血管紧张素原(angiotensinogen, AGT)基因M235T文章:血管紧张素原H"$’I基因多态性与原发性高血压的相关研究;浙江大学学报;2004年33卷,02期。
引物: P1 CCGTTTGTGCAGGGCCTGGCTCTCTP2 CAGGGTGCTGTCCACACTGGACCCC基因:G蛋白β3亚单位(GNB3)C825T文章:G蛋白β3亚单位C825T等位基因多态性与原发性高血压的关系陈肖俊; 汪大望; 吴建波; 熊术道;王春香; 临床内科杂志, Journal of Clinical Internal Medicine, 2007年 05期基因:E-选择素G98TE-选择素基因G98T多态性对原发性高血压患者血压及心脏结构功能的影响中国医学影像技术, Chinese Journal of Medical Imaging Technology, 2007年 05期基因:β2-BKR基因-58T/C和AGT基因M235T文章:缓激肽β2受体(β2-bradyk in in receptor,β2-BKR)基因β_2-BKR基因和AGT基因多态性与原发性高血压的相关性研究第三军医大学学报, Acta Academiae Medicinae Militaris Tertiae, 2006年 11期基因:化生长因子β1(TGF-β1)基因第1外显子+869T/C及+915G/C文章:转化生长因子β_1基因多态性与原发性高血压关系的研究中国老年学杂志, Chinese Journal of Gerontology,2007年 10期最好是多查些文献,找到位点附件的序列(如测序图谱和TaqMan探针等的序列),然后在到NCBI上作BLAST,这样就可以找到该位点在基因序列中的位置。
倾向匹配(PSM)分析:观察性研究的统计学利器 - 预防医学讨论版 -丁香园论坛

rinyxa科室保密何为PSM分析呢?这个问题需要先从临床研究的类型说起。
众所周知,临床研究分为干预性研究和观察性研究。
干预性研究的论证强度是高于观察性研究的,原因就在于干预性研究可以通过“随机分配”的方式平衡混杂因素。
比如研究一种药物治疗抑郁症的疗效,研究者在招募了一些抑郁症患者后,将其随机分为实验组和对照组,实验组接受药物治疗,对照组接受安慰剂治疗。
经过治疗一段时间后,如果两组患者的预后不同,则我们可以认为这种“预后”上的差异完全是有治疗措施的差异引起的(实际上,我认为这句话值得商榷!),因为从理论上讲,实验组和对照组的临床特征是相同的,或者说具有可比性的。
正因我的丁香客精品栏目找人随便看看更多版内搜索此时,如果贫血组和非贫血组患者在三年缺血时间发生风险上存在差异,则就可以将原因归结为贫血,因为两组患者其他特征都是相同的。
关于PSM的统计学原理,笔者在此以JTD这篇文章为例进行一简要介绍。
其基本流程为:首先将患者分为贫血患者非贫血患者,然后采用logistic回归,以贫血与否作为应变量(Y),以其他所有已知的临床特征(比如BMI、NYHA分级、高血压等)作为自变量(X),计算出每个患者的“贫血概率”。
这个贫血概率实际上就是PSM最核心的内容之一。
然后,根据贫血概率,将实验组和对照组进行匹配。
比如,贫血组一个患者的贫血概率为0.361,那么就在非贫血患者sunnymilanhuang入门站友黄春雨入门站友htelyon 入门站友影灯麻醉科李珂薇ake 入门站友。
MeSH词专帖

若干小类,小类之下又再细分,最多可以细分成十一个阶层,愈下层代表愈狭义。tree number由代表该类的字母与数字 组成,每个阶层的数字以小数点隔开,tree number愈长表示阶层愈低也愈狭义。例如:C为Diseases;C11为Eye Diseases;C11.187为Conjunctival Diseases;C11.187.183为Conjunctivitis;C11.187.183.220为Conjunctivitis, Bacterial;C11.187.183.220.889为Trachoma。 .tw/ML2/tools/tools02.htm
二、 Qualifiers:与Descriptors配合使用的副标目(subheadings),MeSH的副标目只有一种,即主题副标目(topical qualifiers)。一般而言,同一个主标目所连用的主题副标目不会超过三个,若超过三个主题副标目,则采用单独的主标 目即可。或者可参考 Topical Subheading Hierarchies以减少主题副标目的数量,例如:讨论某个疾病 的diagnosis、therapy、epidemiology、 mortality的数据,可以用该疾病的主标目 与diagnosis、therapy、epidemiology三个主题副标目连用,但不适合与 mortality连用,因为在Topical Subheading Hierarchies中mortality属于epidemiology的次阶层主题副标目。
二、MeSH-Annotated Alphabetic List、MeSH Tree Structures、Permuted MeSH:
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丁香园论坛一、概述色素内镜也称染色内镜,是通过口服、喷洒或注射等方式,将色素/染料导入黏膜,使病灶与正常黏膜对比更加明显,有助于病变的辨认及靶向活检。
色素/染料分类:——吸收性染料:亚甲蓝、甲苯胺蓝、结晶紫——反应性染料:卢戈氏碘液、刚果红、酚红、醋酸、肾上腺素——对比性染料:靛胭脂常用于胃的色素包括:亚甲蓝、醋酸、肾上腺素、靛胭脂、结晶紫二、染色内镜检查的优点——有助于判断病变的良恶性;——能显示普通内镜检查不易发现的病灶,有助于准确活检;——能观察肿瘤浸润范围及深度,从而有助于术前决定采用何种手术方式;——对于早癌病例,可以确定边界,辅助治疗。
三、常用的一些染色方法:(1)卢戈氏碘液:适用范围:食管粘膜病变主要作用:筛查和定性病变、辅助确定病变边界操作手法:喷洒碘溶液前宜应用链霉蛋白酶冲洗食管,去掉表面的黏液,须使用喷洒管均匀地进行全食道染色,建议从肛侧到口侧,边喷洒边吸引,床头抬高避免呛咳窒息,染色完毕后应用2.5%硫代硫酸钠溶液喷洒脱碘或西甲硅油溶液冲洗食管,以将黏液和多余的碘洗去便于观察,观察完毕后注意将胃腔内碘液吸出以减轻患者的痛苦。
原理:利用食管鳞状上皮细胞中含有糖原,糖原遇碘则呈棕色的着色反应。
若粘膜鳞状上皮因各种原因,如肿瘤、炎症、瘢痕及基底细胞增生等造成粘膜细胞的缺失或损伤,使糖原丢失或减少,遇碘则不出现正常着色反应,而呈不染或染色不良,与正常食管粘膜的着色象形成鲜明对比,肉眼极易识别。
相反,当食管粘膜的鳞状上皮增生,如食管棘皮症,因细胞内糖原含量丰富,遇碘着色则深,呈深棕色染色象。
正常食管粘膜对碘则呈棕色绸布样均匀着色象。
碘染色模式分为4级:Ⅰ级为浓染区,比正常食管黏膜染色深,多见于糖原棘皮症;Ⅱ级为正常表现,呈棕褐色;Ⅲ级为淡染区,多见于LGIN低级别上皮内瘤变或急慢性炎症;Ⅳ级为不染区,多见于浸润癌、原位癌和HGIN高级别上皮内瘤变。
“粉色征”:即在喷洒碘溶液后病变部位呈不染或者淡黄色,2~3 min后,HGIN和癌变部位可变为粉红色。
倾向匹配(PSM)分析:观察性研究的统计学利器 - 预防医学讨论版 -丁香园论坛

rinyxa科室保密何为PSM分析呢?这个问题需要先从临床研究的类型说起。
众所周知,临床研究分为干预性研究和观察性研究。
干预性研究的论证强度是高于观察性研究的,原因就在于干预性研究可以通过“随机分配”的方式平衡混杂因素。
比如研究一种药物治疗抑郁症的疗效,研究者在招募了一些抑郁症患者后,将其随机分为实验组和对照组,实验组接受药物治疗,对照组接受安慰剂治疗。
经过治疗一段时间后,如果两组患者的预后不同,则我们可以认为这种“预后”上的差异完全是有治疗措施的差异引起的(实际上,我认为这句话值得商榷!),因为从理论上讲,实验组和对照组的临床特征是相同的,或者说具有可比性的。
正因我的丁香客精品栏目找人随便看看更多版内搜索此时,如果贫血组和非贫血组患者在三年缺血时间发生风险上存在差异,则就可以将原因归结为贫血,因为两组患者其他特征都是相同的。
关于PSM的统计学原理,笔者在此以JTD这篇文章为例进行一简要介绍。
其基本流程为:首先将患者分为贫血患者非贫血患者,然后采用logistic回归,以贫血与否作为应变量(Y),以其他所有已知的临床特征(比如BMI、NYHA分级、高血压等)作为自变量(X),计算出每个患者的“贫血概率”。
这个贫血概率实际上就是PSM最核心的内容之一。
然后,根据贫血概率,将实验组和对照组进行匹配。
比如,贫血组一个患者的贫血概率为0.361,那么就在非贫血患者sunnymilanhuang入门站友黄春雨入门站友htelyon 入门站友影灯麻醉科李珂薇ake 入门站友。
膝关节疼痛的诊断与鉴别诊断

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* 交叉韧带
– 前交叉韧带 :前抽屉试验、Lachman试验、Jerk试验、Pivot-shift试验
– 后交叉韧带 :后抽屉试验、Lachman试验、胫骨后沉征 (posterior sag sign)
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只看楼主
内容来自冯建民教授的讲座,虽然基础,但是临床还是比较常见的,希望大家有所收获
膝关节疼痛的诊断与鉴别诊断
膝关节疼痛的评估 1、病史 2、体检 3、影像学检查 4、实验室检查
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发新话题 回复话题 12...78 【专题讲座】膝关节疼痛的诊断与鉴别诊断 [精华]
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实验室检查
* 如果膝关节有发热、明显压痛、积液、因疼痛活动受限,提示感染或急性炎症性关节病
1、ESR 2、CRP 3、关节穿刺,关节液检查 包括:(细胞分类计数、葡萄糖定量 、蛋白定量、细菌培养、药敏、结晶体)
– 急性损伤:伤后是否能继续活动或负重,还是因疼痛不得不停止活动
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膝关节MRI诊断之正常解剖
【骨肌小组每月活动之一】【专题】膝关节MRI诊断之正常解剖 - 影像医学和核医学讨论版 -丁香园论坛
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ctjieruxulin
• 【期刊导读】IJN(浦东):神经胶质细胞源性神经营养因子
2005-12-05 19:17
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过去用X造影非常不便,而且是间接征象。
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ctjieruxulin
• 【原创】驿站人气旺,有人乐意一起做这样的杂志吗?
2005-12-05 18:57 内侧半月板类型
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ctjieruxulin
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• 【信息】哈医大一院 我的研三同学 就这样白白死了
/bbs/thread/4939063[2012-3-28 21:01:57]
【骨肌小组每月活动之一】【专题】膝关节MRI诊断之正常解剖 - 影像医学和核医学讨论版 -丁香园论坛 运动时半月板的位置移动
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ctjieruxulin
2005-12-05 19:02 外侧半月板类型
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• 【原创】王浩同学事件,我们还要学习什么?
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ctjieruxulin
2005-12-05 19:04
丁香园 无处安放的纯学术灵魂
2022年8月10日,有网友表示曾掀起权健事件、质疑连花清瘟的知名医疗健康科普平台丁香园旗下媒体矩阵被“全网禁言”。
笔者查询发现,包括丁香园、丁香医生、丁香妈妈、丁香生活研究所在内的微博账号均显示“因违反相关法律法规,该用户目前处于禁言状态”。
此外,丁香园相关微信公众号、今日头条号、百家号等账号也被禁言或暂停更新,看来丁香园被“全网禁言”已是事实。
丁香园本是一个医学知识专业分享平台,曾因2018年底掀起权健事件而在自媒体圈顺利出圈。
声名鹊起的同时,也引来更多国内外资本的青睐。
2020年8月,丁香园以70亿元市值位列《苏州高新区·2020胡润全球独角兽榜》第351位,已成长为中国医疗健康领域的头部独角兽企业。
丁香园在普及医学健康知识、惠及大众之时,也遭受不少诟病,其中指责得最多的就是作为一个强势的医疗健康网络自媒丁香园无处安放的纯学术灵魂能力越大,责任越大。
当走在流量掌声和资本鲜花夹道欢迎的喧嚣红毯上,丁香园曾引以为傲的“纯学术交流”灵魂该何处安放?文 / 陈晓东体,丁香园一边揭露着医学健康相关产业的内幕,一边又借着医学科普平台的流量在整合打造自家的医学健康产业,既要当裁判,又要做运动员,有借助自身自媒体平台影响力的优势打击市场异己之嫌。
全网禁言根据对相关信息的梳理,丁香园被禁言一事最初发酵于一条微博。
8月9日11:33分,博主“一路为医”转发网友“催人老舍不得”的评论并回复:“通知丁某园全网禁言了?喜大普奔啊。
”“催人老舍不得”的回应是,“听说DXY要被封号了,陆老师的春天来了”,“已经看到通知了,全网禁言。
微博还没执行”。
“DXY”和“丁某园”暗指丁香园。
当天15:39分,“一路为医”转发的另一条帖子显示,有ID为“芋头微波”的网友称,“据说为祸日久的丁香系列要被全网禁言了,不知真假,如是,大快人心!”当天晚上,这个消息被证实。
“丁香园”在微博上的“丁香园”(粉丝217.4万)、“丁香医生”(粉丝598.4万)、“丁香妈妈”(粉丝11.4万)、“丁香生活研究所”(粉丝38.5万)、“丁香园用药助手”(粉丝3.3万)等至少5个账号被禁言,禁言账号粉丝总数高达869万。
膝关节MRI之正常解剖
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内侧半月板:矢状位梯度回波图像示:B-呈蝴蝶结状的体部
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• 【原创】执业医师考试的老前辈教小朋友们经验
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2005-12-27 20:15 [Hidden Post:1]
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冠状位解剖:T1WI 示两侧半月板的体部呈低信号、略呈等边三角形;注意箭示内侧半月板附着于内侧副韧带的深部纤维。
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【讲座】膝关节MRI之正常解剖(外文综述) [精华]
hll0411
2005-12-27 19:57
/bbs/thread/5215833[2012-3-28 20:59:58]
【讲座】膝关节MRI之正常解剖(外文综述) - 影像医学和核医学讨论版 -丁香园论坛
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6.注意灰阶调整观察图像的重要性。
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• 【期刊导读】IJN(浦东):神经胶质细胞源性神经营养因子
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• 【原创】如果有一天,你是中国医生,你会杀死你的病人吗?
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/bbs/thread/5215833[2012-3-28 20:59:58]
【讲座】膝关节MRI之正常解剖(外文综述) - 影像医学和核医学讨论版 -丁香园论坛
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冠脉造影可评估冠脉血管的狭窄程度,目前作为冠心病诊断“金标准”的地位仍无可替代。
那么当冠脉造影检查显示冠脉正常,而患者又出现典型胸痛症状时,到底是何原因?如何才能通过其他检查手段揪出“元凶”?首先让我们来看一则案例。
病历简介
患者,刘某,男,61岁,2015年5月25日初诊。
主诉:心前区疼痛间断发作1个月余。
现病史:患者1个月前重体力活动后出现心前区疼痛,每次发作持续30min左右,舌下含服硝酸甘油3min后缓解。
曾就诊于当地医院,查心电图示:V1-V6导联ST段下移0.1~0.5mV,运动平板试验阳性,超声心动图未见心脏结构异常,冠状造影提示:未见冠脉明显狭窄。
入院后给予核素心肌灌注显像(SPECT)检查,结果显示前壁心肌存在灌注缺损,提示前壁心肌处于缺血状态,静脉推注腺苷后患者心前区疼痛症状缓解,前壁心肌恢复正常。
诊断:心脏X综合征。
何谓心脏X综合征?
心脏X综合征是指具有心绞痛或类似心绞痛症状,运动平板试验出现ST段下移,心电图或运动平板实验阳性,而冠状动脉造影无异常表现,并可排除冠状动脉痉挛的一组临床症候群[1]。
临床上,具有典型心绞痛的患者有10%~30%在行冠脉造影时未发现血管有明显狭窄[2]。
这一现象最早于1967年由Likoff等[3]首先报告,1973年被Kemp HG正式命名为心脏X综合征(Cardiac Syndrome X,心脏X综合征)[4],属于冠状动脉微血管疾病(Coronary Microvascular Disease,CMVD)的一种类型。
何谓冠状动脉微血管疾病(CMVD)?
CMVD是指在多种致病因素的作用下,冠状前小动脉和小动脉的结构和(或)功能异常所致的劳力性心绞痛或心肌缺血客观证据的临
床综合征[5]。
冠状动脉包括三个节段:
(1)心外膜下冠状动脉:血管内径0.5~5mm,主要担负血流传导的作用。
(2)前小动脉:血管内径约0.1 ~0.5mm,主要功能是当心外膜冠状动脉灌注压或血流量发生改变时,通过血管舒缩稳定冠状小动脉的压力,其中近端前小动脉对于压力的变化敏感而远端前小动脉对于流量的变化敏感。
(3)小动脉:血管内径<>
回到刚才的病例,患者具有典型的心绞痛症状,而冠脉造影却显示正常,那么我们是否就束手无策了呢?核素心肌灌注显像(SPECT)检查在诊断中又具有怎样的地位呢?别急,我们慢慢道来。
CMVD有哪些诊断方法?
CMVD可通过药物(冠状动脉舒张剂)、无创性检查、创伤性技术三大类方法来进行诊断[5]。
首先我们要知晓一个概念:冠状动脉血流储备(Coronary Flow Reserve,CFR)。
1.药物诊断(冠状动脉舒张剂)
2. 无创性检查
3. 创伤性技术
专家建议
1.在临床疑诊CMVD的患者,在排除心外膜下冠状动脉狭窄和痉挛病变后,应首先采用静脉注射腺苷或双嘧达莫的方法并选用TTDE、CMR或PET等无创性影像技术测量CFR,目前PET是测量CFR的无创性技术金标准。
2.在上述患者中,如无创性技术测量的CFR≥2.0,可在冠状动脉注射腺苷前后,采用冠状动脉内多普勒血流导丝技术测量CFR和CMR,目前冠状动脉内多普勒血流导丝是测量CFR的创伤性技术金标准[5]。
3.如临床疑诊CMVD但冠状动脉内多普勒血流测量的CFR≥2.0,应选择冠状动脉内注射乙酰胆碱的方法,如心外膜下冠状动脉无痉挛但出现心绞痛症状和缺血型ST-T改变,可诊断为CMVD,同时应立即冠状动脉内注射硝酸甘油或尼可地尔对抗冠状动脉微血管的痉挛。
上述可见,临床上遇到具有典型心绞痛症状而冠脉造影正常时,我们还可以有N种有力“武器“进行诊断,大家要紧紧牢记、了然于胸,切勿漏诊。
参考文献:
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