寻找基因外显子、内含子的几种方法

寻找基因外显子、内含子的几种方法

以人类的wnt3a基因为例

一、/entrez/query.fcgi?CMD=search&DB=gene

1、进入ncbi的gene数据库【网址：

/entrez/query.fcgi?CMD=search&DB=gene】

2、在for栏输入wnt3a，点击limits

3、在All fields 栏选择Gene Name，在Homo sapiens前打勾，点击go

4、出现下图，点击wnt3a

5、鼠标左键点击NC-000001.9，选择Genbank

或在Genomic栏下点击Genbank【图中圈出的部分】

6、出现下图，图中画线部分就是外显子的位点【注意不是图中圆圈的部分】外显子分别为1～149

15617～15858

43606～43871

51936～54210

二、/

1、进入/的网页

2、点击Gene Sorter

3、在genome栏输入human，在search栏输入wnt3a，点击go

4、出现下图，点击图中圈出来的部分：

5、出现下图，点击sequence

6、出现下图，点击Genomic

7、出现下图，点击submit

8、出现序列，其中外显子用大写字母，内含字用小写字母。

9、将其拷贝到word中，鼠标定位到大小写接头的位点，进行定位统计。

疑问：奇怪的是得出的结果与方法一、方法三不符，不知是什么原因？请大家指点，看看是哪里错了。

这种方法的介绍见：/bbs/actions/archive/post/6145797_1.html

三、/

1、进入/网页

2、在search栏中选择homo sapiens，在for 栏输入wnt3a，点击go

3、出现下图，点击图中圈出的部分。

4、出现下图，点击exon information

5、出现下图。从图中我们得知wnt3a基因位于1号染色体上，从226261375～226315584结束。共有4个外显子，三个内含子。

外显子1 长149

内含子1-2 长15467

外显子2 长242

内含子2-3 长27747

外显子3 长266

内含子3-4 长8064

外显子4 长2275

从外显子、内含子的长度，我们可以推出各外显子的序列位置，即

1～149

15617～15858

43606～43871

51936～54210