单雌蓖麻ISSR—PCR反应体系的建立和优化
一种适于PCR扩增的蓖麻基因组DNA提取方法

一种适于PCR扩增的蓖麻基因组DNA提取方法
黄文霞;何觉民;朱宏波
【期刊名称】《中国农学通报》
【年(卷),期】2007(23)11
【摘要】报道了一种从蓖麻叶片中提取DNA的改良SDS方法,该方法提取的DNA经琼脂糖凝胶电泳检测,获得的DNA条带较亮且无明显拖尾现象。
利用ISSR 引物对提取的蓖麻基因组DNA进行PCR检测,能够获得清晰稳定的条带。
说明该方法提取的蓖麻基因组DNA能够满足PCR反应的需要。
【总页数】3页(P61-63)
【关键词】蓖麻;DNA提取;PCR;ISSR
【作者】黄文霞;何觉民;朱宏波
【作者单位】广东海洋大学农学院
【正文语种】中文
【中图分类】Q341
【相关文献】
1.一种适于PCR扩增的植物基因组快速提取新方法 [J], 李筱婷;陈卓君;许文涛;元延芳;王一南;黄昆仑
2.一种适于PCR扩增的荞麦DNA大量提取及纯化方法 [J], 刘明勤;张正英;赵丽娟;;;
3.一种适于PCR扩增的茶树基因组DNA快速提取方法 [J], 申超峰;周玲红;彭丁
文;刘跃荣;周闰
4.一种适于PCR扩增的小麦基因组DNA快速提取法 [J], 柴建芳;刘旭;贾继增
5.一种适于PCR扩增的快速提取猪基因组DNA的碱裂解法 [J], 赵金艳;刘榜;王文君;张宇;张庆德
因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
墨兰ISSR—PCR反应体系建立及优化

墨兰ISSR—PCR反应体系建立及优化作者:张睿等来源:《绿色科技》2014年第03期摘要:为建立墨兰的ISSR-PCR反应体系,采用正交试验分析了5个因素1引言墨兰(Cymbidium sinense)花瓣香气浓郁、花色多变、叶形独特,是国兰中株型最大,花茎最长的种类。
目前对于墨兰的研究主要集中在形态学、生理学及孢粉学上,而在分子DNA 水平上研究很少[1,2]。
ISSR是1994年由Zietkiewiczetal提出的一种新型分子标记技术[3],该技术在SSR(即简单序列重复)技术的基础上有所发展,使实验操作简便且迅速,稳定性好,多态性高,现今在基因定位、遗传作图、遗传多样性、进化以及系统发育等研究中被广泛应用[4]。
不同植物对ISSR-PCR反应体系要求不同,因此在利用ISSR标记之前,必须建立该种植物最适ISSR-PCR反应体系。
本研究旨在通过正交试验分析模板DNA、TagDNA聚合酶、Primer、Mg2+和dNTPs 5个因子在4个水平上对墨兰ISSR-PCR反应影响,并据此建立墨兰最适ISSR-PCR反应体系,为利用ISSR标记对其进行后续研究奠定基础。
2材料与方法试验材料墨兰来源于国家林业局保育重点实验室。
试验方法包括以下3种。
(1)墨兰基因组DNA提取。
采用改良CTAB法[5]提取墨兰基因组DNA。
4结语采用正交试验分析5个因素(Tag酶浓度、Mg2+浓度、模板DNA浓度、引物浓度、dNTP浓度)在4个水平上对ISSR-PCR反应的影响,结果表明:Tag酶浓度为16U/25μL、Mg2+浓度为24mmol/L、dNTP浓度096 mmol/L、Primer浓度为064μmol/L、DNA浓度32ng/25μL是墨兰ISSR-PCR最优反应体系。
Tag酶用量直接影响扩增反应成功与否,浓度过高造成浪费,但如果Tag酶浓度过低,会导致产物合成效率下降。
Mg2+ 浓度主要是通过影响Tag酶活性从而影响PCR反应。
阔叶十大功劳ISSR—PCR反应体系的建立与优化

扩 增 程 序 中退 火 对 其 实 验 体 系 进 行 优 化 . 研 究 采 用 正 交 试 本
1 2 1 基 因组 D .. NA 的 提 取 采 用 改 良 的 C AB T
2 L 应 体 系 中 , . l lLJ物 、 . Ta 0 反 0 5/ / i mo I 0 5U q酶 、 0 ̄ lL d P 和 2 g模 板 D 1 5 mo/ NT s 0n NA.
在最 佳 反应 条件 下 , 8 从 O条 引 物 中 筛 选 出 1 扩 增 稳 定 、 态 性 丰 富 的 IS 引 物 , 经 5条 多 SR 并
冰箱 冷冻保 存 .S R引 物根 据 加 拿 大 哥 伦 比亚 大 IS 学 ( C) 供 的 序 列 , 上 海 生 物 工 程 公 司 合 UB 提 由
成 , 初 步 筛 选 , 定 UB 8 6( 物 序 列 5, 经 确 C 3 引 -
AG AG AG G A G A AG AGA G - ’ 为 此 次 实 YA 3 )
实验材料 采集 于武 汉植物 园 , 料 由中南 民族 材 大学万 定荣教 授鉴 定. 摘幼嫩 叶 片后 迅 速置于 盛 采 有硅 胶 的密封塑 封袋 , 叶片 干燥后 置于 一2 ℃低 温 O
治疗痢疾 、 炎 、 冒、 嗽 、 肝 感 咳 目赤 肿 痛 和 烧 烫 伤
等 症 状 [ .目前 , 阔 叶 十 大 功 劳 组 织 形 态 ] 7 ] 对 、
分析 .
关 键 词 : 叶 十 大 功 劳 ; S R P R;正 交设 计 ;单 因 素 实 验 ; 传 多 样 性 阔 IS —C 遗
中 图 分 类 号 :R 8 . 227 文献标识码 : A
马蔺ISSR-PCR反应体系的建立与优化

马蔺ISSR-PCR反应体系的建立与优化王育青;王晓晶;王建光【期刊名称】《中国草地学报》【年(卷),期】2010(032)002【摘要】以内蒙古呼和浩特市近郊野生马蔺DNA为模板,采用均匀设计,通过5因素5水平和5因素3水平两轮均匀优化试验,对影响ISSR-PCR扩增结果的一些因素(Mg2+、dNTP、引物、TaqDNA聚合酶和模板DNA浓度等)进行优化筛选,建立了适合马蔺的最佳ISSR-PCR反映体系:在25μl反应体系中,包括2.5μl 10×PCR Buffer、2.0mmol/L Mg2+、2.5μmol/L dNTP、1μmol/L引物、1.5U TaqDNA 聚合酶、50ng模板DNA.在此基础上对扩增程序中的循环次数、退火温度进行筛选,获得的扩增程序为:94℃预变性3min;然后进行40个循环(94℃变性45s,52.3~60.5℃退火30s,72℃延伸1.5 min);循环结束后,72℃延伸5min.【总页数】6页(P80-85)【作者】王育青;王晓晶;王建光【作者单位】中国农业科学院研究生院,北京,100081;中国农业科学院草原研究所/农业部草原资源与生态重点开放实验室,内蒙古,呼和浩特,010019;内蒙古农业大学生态环境学院,内蒙古,呼和浩特,010019;内蒙古农业大学生态环境学院,内蒙古,呼和浩特,010019【正文语种】中文【中图分类】S688.4【相关文献】1.马蔺ISSR-PCR反应体系的建立与优化 [J], 王康;董宽虎;孙彦;康俊梅;董洁;孟林2.长蛸ISSR-PCR优化反应体系的建立及优化研究 [J], 汤永磊;周超;祁鹏志;吴常文;郭宝英3.桑树ISSR-PCR反应体系建立及优化 [J], 刘玲; 唐仕成; 郑丹; 柯皓天; 吕银4.黑老虎ISSR-PCR反应体系的建立与优化 [J], 唐健民;漆小雪;蒋运生;熊忠臣;邹蓉5.龙头鱼ISSR-PCR反应体系的建立与优化 [J], 褚梦洁;王铮;林彦均;朱兰倩;胡静雯因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
蓖麻种子cDNA_AFLP反应体系的优化

华北农学报·2014,29(3):74-80收稿日期:2014-03-12基金项目:国家自然科学基金项目(30760123;31160290;31060194);内蒙古自然科学基金项目(2010BS0511);内蒙古人才基金项目;内蒙古民族大学市校合作项目(SXZD2012018);内蒙古民族大学教育教学研究项目(No.2009053)作者简介:陈晓凤(1990-),女,内蒙古赤峰人,在读硕士,主要从事蓖麻分子育种研究。
通讯作者:黄凤兰(1973-),女,山东菏泽人,教授,博士,主要从事蓖麻分子育种研究。
蓖麻种子cDNA-AFLP 反应体系的优化陈晓凤1,2,黄凤兰1,2,李国瑞1,2,王文跃1,2,张智勇3,4,包春光3,4,吴春桃1,张现世1(1.内蒙古民族大学生命科学学院,内蒙古通辽028000;2.内蒙古高校蓖麻产业工程技术研究中心,内蒙古通辽028000;3.内蒙古民族大学农学院,内蒙古通辽028000;4.内蒙古通辽市农业科学研究院,内蒙古通辽028015)摘要:以蓖麻种子为研究对象,优化其cDNA-AFLP 反应体系,为研究不同蓖麻材料或不同发育阶段的蓖麻种子内脂肪酸基因表达差异奠定理论基础。
试验结果表明:提取蓖麻种子总RNA ;将RNA 逆转录为cDNA ,用高频限制性内切酶Eco RⅠ和Mse Ⅰ进行酶切,并与Eco RⅠ、Mse Ⅰ接头连接,得到连接产物;连接产物稀释40倍作为预扩增模板,进行预扩增;优化选择性扩增反应体系,得到最佳反应体系为:10ˑPCRBuffer 2.0μL 、dNTPs (10mmol /L )1.4μL 、Mg 2+(25mmol /L )1.4μL 、模板稀释80倍1.0μL 、E x 扩增引物(50pmol /μL )1.2μL 、M y 扩增引物(50pmol /μL )1.2μL 、LA Taq (5U /μL )0.2μL 、ddH 2O 11.6μL 。
红楠ISSR-PCR反应体系的建立和优化

s se ,Ta n y y tm q e z me,0. 5 U ・ L一 , 0 M
2. 0 mmo l・L~ t mp ae DNA g ‘L ~ , NTP . e lt 1n d s0 3 mm o l・L ~ , rm— pi
e (3 )0 5pnl L r 85 . jo ・ ~, n P R bf r T eetbi m n o ebt r eet it ads blyIS -C s ad1× C u e. h s lh e t fh e e rp a bly n t it S R P R f a s t t a i a i
JA og b ING rn — n , I NG R n —o ,JA gmi i
J n ,C E u H N — i,L A Q - U u - n t U N i u ,Y E H a eg a f f
( . eerhIstt o Sbrpcl oet , hns cdmyo oet ,Fyn 3 10 Z ei g hn ; 1R sac tu f ut ia F r r C ieeA a e f rsy uag 140, hj n ,C ia ni e o sy F r a 2 a l naR sa hadDeeom n C ne, t eFrsyA miirtn, hn zo 4 0 0 ,H ’a , hn ) .P uo i eer n vl e t etr Sa oet d nsai Z eghu 5 0 3 e n n C ia w c p t r t o
建 的一 种新 型 的 微卫 星类 分 子 标 记 技 术 , 已在 遗 现
13 1 红楠 基 因组 D A提 取 .. N
以 CA T B法 为基
克氏针茅ISSR-PCR反应体系的建立与优化
禾本科 针 茅属 ( t a 植 物是 我 国北 方草 地上 最重 要 的 饲用 植 物 之 一 , 年 为各 种 家 畜所 喜食 , 营养 价值 Si ) p 常 是
较高 、 口性强 、 布广 、 适 分 耐干 旱 、 耐践 踏 的优 良牧 草 。以针 茅 属植 物 为 建群 种 所组 成 的地 带性 针茅 草 原 群 落 , 是 欧亚 大陆草 原 区最典 型 的地带 性植 物 群落 , 也是 内蒙古 高原 地带 性草 原植 被 的 主体口 。克 氏针 茅 ( t ak yo — ] S i r lv p i) 针茅 属 的一种 多年 生密 丛禾 草 , 亚 洲 中部 草 原 亚 区所 特 有 的草 原 群 系 , 的分 布 区主 要是 内蒙 古 高原 的 i为 是 它
隋 晓青 , 垄 王
( 国农 业 大 学 动 物 科 技 学 院草 地 研 究 所 ,北 京 1 0 9 ) 中 0 0 4
摘 要 : 用 正 交 试 验 与 单 因 素 设 计 相 结 合 的方 法 , 克 氏针 茅 Is 采 对 s R— P R反 应 体 系 中 的 5 主 要 因 素 ( 板 D C 种 模 NA、 Mg 、 a NA 聚 合 酶 、NT T qD d P及 引 物 ) 行 优 化 筛 选 , 立 了 适 合 克 氏针 茅 IS 分 析 的 优 化 反 应 体 系 。在 2 L 进 确 SR 5 反 应体 系 中 各 反 应 成 分 为 : 板 D 0n , 。 1 5mmo/ d TP 0 2mmo/ 引 物 0 8 ̄ lI, a N 模 NA 5 g Mg . lI N . , lI, . mo/ T qD A 聚 合 酶 lu ,o ufr2 5 L。这 一 体 系 的建 立 为 今 后 利 用 IS 技 术 进 行 克 氏 针 茅 遗 传 多 样 性 分 析 、 传 图 谱 l ×b f . e SR 遗
伊贝母植物ISSR-PCR反应体系的建立与优化
伊贝母植物ISSR-PCR反应体系的建立与优化
赵鑫;凯撒·苏莱曼;朱国强;阿依别克·热和木都拉
【期刊名称】《江苏农业科学》
【年(卷),期】2011(039)002
【摘要】采用CTAB法提取叶片DNA,通过单因素试验,研究了Taq DNA聚合酶用量、dNTP、引物和Mg(2+)浓度4种因素对伊贝母ISsR-PCR扩增的影响.结果表明,适于伊贝母ISSR-PCR的反应体系为25μL总体积中含1 x PCR反应缓冲液(无Mg(2+)1.0 U Taq DNA聚合酶、0.6 mmol/L dNTPs、0.4μmol/L引物、1.5 mmol/L MgCl2.
【总页数】2页(P78-79)
【作者】赵鑫;凯撒·苏莱曼;朱国强;阿依别克·热和木都拉
【作者单位】沈阳农业大学,辽宁,沈阳,110161;新疆中药民族药研究所,新疆乌鲁木齐,830002;新疆中药民族药研究所,新疆乌鲁木齐,830002;新疆中药民族药研究所,新疆乌鲁木齐,830002
【正文语种】中文
【中图分类】S567.23+1
【相关文献】
1.珍稀濒危植物银缕梅ISSR-PCR反应体系建立及优化 [J], 陈云霞;路志远;肖卓恒
2.入侵植物牛膝菊ISSR-PCR反应体系的建立与优化 [J], 齐淑艳;孔令群;冯典兴;杨彩霞
3.珍稀濒危植物宝华玉兰ISSR-PCR反应体系建立及优化 [J], 陈云霞;葛乐乐;王雪薇
4.珍稀濒危植物五小叶槭ISSR-PCR反应体系的建立和优化 [J], 郝云庆;罗晓波;王晓玲
5.素馨属植物ISSR-PCR反应体系的建立和优化 [J], 荆玲侠;卜朝阳;崔学强;狄清琳;卢家仕
因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
澳洲坚果ISSR-PCR反应体系的建立与优化
澳洲坚果ISSR-PCR反应体系的建立与优化郭凌飞;邹明宏;曾辉;杜丽清;陆超忠【期刊名称】《林业科学》【年(卷),期】2008(44)5【摘要】澳洲坚果(Macadamia spp.)属山龙眼科(Proteaceae)澳洲坚果属(Macadamia)常绿乔木。
原产于澳大利亚昆士兰州东南部和新南威尔士州北部、南纬25°-31°之间的沿海亚热带雨林。
其种仁富含不饱和脂肪酸、蛋白质、糖等,营养价值高,风味十分独特,有“干果皇后”之称;其副产品也有多种用途,【总页数】5页(P160-164)【作者】郭凌飞;邹明宏;曾辉;杜丽清;陆超忠【作者单位】中国热带农业科学院南亚热带作物研究所,湛江,524091;华南热带农业大学园艺学院,儋州,571737;中国热带农业科学院南亚热带作物研究所,湛江,524091;中国热带农业科学院南亚热带作物研究所,湛江,524091;中国热带农业科学院南亚热带作物研究所,湛江,524091;中国热带农业科学院南亚热带作物研究所,湛江,524091【正文语种】中文【中图分类】S718.46;Q943.2【相关文献】1.澳洲坚果SSR-PCR反应体系优化及其应用 [J], 唐莹莹;杨祥燕;蔡元保;李穆;曾黎明;郑文武;邱文武;李季东;叶维雁2.长蛸ISSR-PCR优化反应体系的建立及优化研究 [J], 汤永磊;周超;祁鹏志;吴常文;郭宝英3.澳洲坚果SCoT反应体系的建立及应用 [J], 蔡元保;杨祥燕;陈显国;曾黎明;郭凌飞;林玉虹;崔明勇4.桑树ISSR-PCR反应体系建立及优化 [J], 刘玲; 唐仕成; 郑丹; 柯皓天; 吕银5.均匀设计优化澳洲坚果SRAP反应体系 [J], 郭凌飞;邹明宏;杜丽清;曾辉;陆超忠因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
金荞麦ISSR-PCR反应体系的建立与优化
金荞麦ISSR-PCR反应体系的建立与优化王安娜;邓蓉;张定红【摘要】为金荞麦品种ISSR指纹图谱建立、新品种选育、数量性状基因定位等工作提供科学依据,以金荞麦为材料,通过单因素试验和正交试验对影响ISSR-PCR反应体系的主要成分进行了优化,建立了稳定、可重复的金养麦ISSR-PCR扩增反应体系.在20μL的反应体系中10×PCR buffer(不含Mg2+)2.0μL,2U Taq DNA 聚合酶0.1μL,0.25mmol/L dNTPs 2.5μL,20 ng/μL 基因组 DNA 1.0μL,2.5 mmol/L Mg2+ 1.2μL,100 μmol/L引物0.6μL,去离子水12.6,uL.%In order to provide scientific basis for ISSR fingerprint establishment, new variety breeding and mapping quantitative trait loci of F. cymosum, taking F. cymosum as material, ISSR-PCR reaction system was optimized through the single factor and orthogonal design. A stable and repeatable ISSR-PCR amplificaion reaction system for F. cymosum was established. The optimal 20 μL reaction system parameters were as follows: 2. 0 μL 10XPCR buffer, 2.0 U Ta q DNA polymerase, 0. 25 mmol/L dNTPs 2. 5 μL, 20 ng/μL DNA templates 1. 0 μL, 2. 5 mmol/L Mg2+ 1. 2 μL, 100 μmol/L primer 0. 6 μL, dd H2O 12.6 μL.【期刊名称】《贵州农业科学》【年(卷),期】2012(040)006【总页数】5页(P14-18)【关键词】金荞麦;ISSR-PCR;反应体系【作者】王安娜;邓蓉;张定红【作者单位】贵州省畜牧兽医研究所,贵州贵阳 550005;贵州省畜牧兽医研究所,贵州贵阳 550005;贵州省畜牧兽医研究所,贵州贵阳 550005【正文语种】中文【中图分类】S517金荞麦〔Fagopyrum cymosum(Trev.)Meisn〕,亦称野荞麦、苦荞菜、万年荞、天荞麦,系蓼目蓼科荞麦属多年生宿根草本植物,适宜在肥沃疏松的砂质壤土中生长,在我国西南地区资源比较丰富。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
单雌 蓖 麻 IS — CR反应 体 系的建 立和 优 化 S R P
王 亚 , 志 强 1 , 宏 伟 。王 宙 郭 ,王 2 ,
(. I 山西大学生物工程学 院, 山西 太原 00 0 ; . 3 06 2山西省农业科学院经济作物研究所 , 山西 汾阳 0 2 0 ) 32 0
摘
要: 以单雌蓖麻提取 的基 因组 D A为材料 , N 采用单因子试 验方法 , 分别研究 了 M 浓度 、N P浓度 、 dT 引
物 浓 度 、o N 聚合 酶 以及 模 板 D A 用 量 5种 因 素 对 IS — C TqD A N S R P R反 应 的影 响 ;建立 了适 合 单 雌 蓖 麻 I— S S—C R P R扩 增 的 反 应 体 系 , 即在 2 L反 应 体 系 中 ,0×P Rb f r . IL Mg f e , 板 D A2 g 2 0 1 C u e 25X ( 2 r )模 +e N 0n ,. 0
m l C2引物浓度 1 m l ,N P04m o L moLMg 1 / , . 0 o L d T . m l , / / 关键词 : 单雌蓖麻 ; S — C 优化 I R P R; S
中 图分 类 号 :5 56 ¥6 . 文 献 标 识 码 : A
D A聚合酶 1 。 N .U 0
蓖 麻 ( i n scmm nsL 俗 称 草 麻 、 麻 Rc u o u i ) i 大 子 、 麻 子 等 , 于 大 戟 科 ( u h ri ee 蓖 麻 老 属 E p oba a ) e 属 ( cn s 一年或 多年 生草 本植 物 。 麻栽 培历 Ri u ) i 蓖 史悠 久 , 是一 种重 要 的能源 植物 。蓖麻 油被誉 为
cs r ee s bi e , ai2 La l ct n eci s ytm cna i 0× C u e . L ( 2r )2 g e at r et lhd t ts 0 i ao at n s tnn 1 P Rb fr 5 ow a s h mp f i r o s e o i g i 2 Mg f e , 0n m— +e t
2nutaCo e a h nt t,hni c e yf gi h r c ne,eyn 320C i ) .ds i r Rs r steSaxA a m A ruu l i c Fnag 20 ,h a I rl p e c I i u d o c a Se s 0 n
Ab ta t Ba e n t eg n mi A x rce o p s l t a t r t eif e c S R— CR w r p i z d a d te e- sr c : s do e o c DN e ta td f m it l e c so ,h l n s oI S P e eo t h r ia nu t mi n f e h -
文章 编 号 : 0 2 2 8 ( 0 0 0 — 0 5 0 10 — 4 12 1 )1 0 1 —4
Es a ls e n Optm i a i n o S t b ihm nta d i z to fI SR-PCR a to S s e o sil t s o Re c i n y t m f r Pitl e Ca t r a
碱基 ) R P 比 A D的 引物 ( 0碱 基 ) , 以使用 更 1 长 可
高 的退火 温 度 ( 5~6 4 0℃ )所 以 , S 比 R P , I R S AD
W A NG GUO i qin 1 , ANG o g Ya . Zh — a g ' W 2 H n —we2 W ANG o i, Zh u
(.i ni ei oee S ax nvri ,a un00 0 ,hn ; 1 o gn r gC lg ,h ni i sy Ti a 3 0 6 C i Be e n l U e t y a
山西农业科学 ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ 1 ,8 1 :5~l 003 ()1 8
di 03 66i n10 — 4 1 0 0O . o: . 9 .s.0 2 2 8 . 1.1 4 1 9 s 2 0
Jun/fS ax A r u ua S i cs ora o h ni gi l rl c ne ct e
fc o 5f t s u ha d cnet t n d T s ocnr i , r e net t n vq D Ap l eaed s ea dD A et f co c sg ocnr i , N P net t n p m r o cn a o, o N o m rs oa n N a rs ao c ao i c ri y g
tm paesdo a eo SS e lt s g n I R—PCR mp i c to r e t d u ig sn l a tre p rme . A e c in s se s tb efrpitlae a lf ain wee tse sn ige fco x e i i nt ra to y tm ui l o si t a l
plt aeDNA, 0 mmo/ g 2 . mo/ prme , 4 mmo] dNTPs . U a 2. lL M C1,10 lL i r 0. ]L ,10 T q DNA oy r s p lme a e.
Ke r s P s l t & t r I S P R; t z t n y wo d : it l ec s ; S R— C Op i ai ia o mi o